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Visualizar Tese - Instituto de Biociências - Unesp

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Cirilo, PDRMATERIAL E MÉTODOS40ferramentas <strong>de</strong> predição <strong>de</strong> alvos biológicos <strong>de</strong> miRNAs: Target Scan(http://www.targetscan.org/) e PicTar (http://pictar.mdc-berlin.<strong>de</strong>/).3.8 Análise funcional - IPAOs genes significantes obtidos a partir das análises <strong>de</strong> CGH array, aquelesdiferencialmente expressos em relação ao miométrio adjacente e os resultantes da análiseintegrada, foram submetidos à análises funcionais utilizando o Ingenuity PathwaysAnalysis (IPA) (Ingenuity Systems, http://www.ingenuity.com). Abaixo, está apresentada a<strong>de</strong>scrição <strong>de</strong> cada etapa das análises funcionais:1) Geração <strong>de</strong> re<strong>de</strong>s: uma lista <strong>de</strong> genes e o status correspon<strong>de</strong>nte (valores <strong>de</strong>expressão ou ganhos e perdas genômicos) foi importada ao sistema. O IPAi<strong>de</strong>ntifica cada gene e seu status e associa-os com as informações <strong>de</strong>positadasnos bancos <strong>de</strong> dados. A maioria dos genes é classificada como “moléculaselegíveis para re<strong>de</strong>”. Utilizando algoritmos próprios do IPA, as re<strong>de</strong>s dasmoléculas elegíveis foram geradas baseadas em suas conexões. Os dados foramrepresentados em valores <strong>de</strong> scores obtidos á partir da presença dos genesimportados em relação aos genes do IPA.2) Funções biológicas: esta análise i<strong>de</strong>ntificou as funções biológicas e doençasque foram mais significativamente observadas. O teste exato <strong>de</strong> Fisher foiutilizado para calcular o P valor que <strong>de</strong>terminou a probabilida<strong>de</strong> <strong>de</strong> que cadafunção biológica e ou doença atribuídos a esse conjunto <strong>de</strong> dados fosseresultante do acaso ou que apresentasse algum significado estatístico. Os dadosforam convertidos em –log(P valor).

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