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Cirilo, PDRINTRODUÇÃO28Os resultados são puramente baseados em análises de bioinformática, portanto, osdados são obtidos de acordo com a aplicação de algoritmos empregados no estudo. Por seruma estratégia relativamente nova, não existe um protocolo estabelecendo o algoritmo goldstandard para a aplicação em análises integrada de dados genômicos e transcriptômicos. Naverdade, existem alguns métodos estatísticos mais robustos empregados na maioria dosestudos, como por exemplo, testes de correlação de Pearson e Spearman (Meza-Zepeda et al.,2006; Vincent-Salomon et al., 2008). Algoritmos que utilizam outros princípios matemáticostambém têm sido desenvolvidos, como o CONEXIC (baseado em modelos Bayesianos) (Akaviaet al., 2010) e o GISTIC (baseado no Q value) (Green et al., 2011). Na tentativa de facilitar ouso destes métodos estatísticos, vários programas têm sido desenvolvidos com o objetivo depermitir a realização de análises integradas, como o CHESS, (Lee e Kim, 2009) ICPS (Zhang etal., 2010) e CNAmet (Louhimo e Hautaniemi, 2011).Em uma busca realizada no banco de dados públicos PubMed usando os termosintegrative genomic and transcriptome o resultado gerou mais de 400 estudos(www.pubmed.com-acesso em 29/03/2011). Contudo, para o nosso conhecimento, ainda nãoexistem relatos utilizando esta abordagem em Leiomiomas Uterinos. O primeiro estudo queassociou “indiretamente” (ou seja, sem a aplicação de algoritmos) CNVs e níveis de expressãogênica em LU foi realizado em 2004. Neste estudo, entre sete amostras de LU avaliadas porcitogenética clássica, cinco apresentaram cariótipo normal, uma apresentava adel(7)(q22q32) e a outra a t(12;14)(q15;q24). A amostra com a deleção em 7q nãoapresentou nenhum gene com alteração de expressão mapeado na região, já a amostra comt(12;14) apresentou expressão aumentada do gene HMGA2 (fold-change 55 vezes mais altodo que as amostras com cariótipos normais) (Quade et al., 2004).Os outros dois estudos de análise integrada indireta basearam-se em amostras de LUcom deleções em 7q evidenciadas por CGH array e FISH e que foram avaliadas por expressãogênica global (já apresentados acima). Independentemente, os estudos não revelaram fortesgenes candidatos com expressão alterada mapeados nesta região (Vanharanta et al., 2005;