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$PolinÃ´mios fracionÃ¡rios em modelos de regressÃ£o - Instituto de ...$

Cirilo, PDRRESULTADOS1414.5.3.6 Análise de enriquecimento de genes - GSEAApós a obtenção dos 75 genes moduladores, foi realizada a análise deenriquecimento para estes genes (GSEA - Gene Set Enrichment Analysis -http://www.broadinstitute.org/gsea/index.jsp) (Subramanian et al., 2005), baseada novalores de expressão gênica. Esta análise permite avaliar se cada um dos módulosassociados a estes genes são enriquecidos com genes diferencialmente expressosidentificados no estudo. Os resultados revelaram que entre os 75 genes moduladores, 32foram enriquecidos entre 26 módulos e 43 genes não foram enriquecidos em qualquer umdos módulos (Tabela 14). Os genes CORO1A, FGFR1, DDX21 e DBN1 foram os maisfrequentemente identificados entre os módulos e apenas FGFR1 e DBN1 apresentaramcorrelação positiva (ganho/aumento expressão). Outros genes também apresentaramcorrelação positiva como NUPR1, COL3A1, AOC3, IFITM1, CALCRL, NOVA2, MVP, MFAP5,DIP2C e correlação negativa como CENPF e BICD1. A Tabela 15 mostra os valores deenriquecimento para os 26 módulos que foram significativamente associados para os 32genes. O módulo 8 apresentou o maior número de genes sobrepostos, com os nove genesincluindo CORO1A, MCM7, SLC1A5, DDX21, NUPR1, DBN1, EIF4EBP1, VIL1, CHKA (P valor
Cirilo, PDRRESULTADOS142Tabela 14. Genes identificados nos módulos de enriquecimento gênico.GeneN° de módulosenriquecidosCGH array Microarray RegiãoCORO1A 8 + - 16p11.2FGFR1 8 + + 8p12DDX21 8 + - 10q21.3DBN1 8 + + 5q35.3CENPF 7 - - 1q41EIF4EBP1 7 + - 8p12NUPR1 6 + + 16p11.2COL3A1 5 + + 2q32.2AOC3 4 + + 17q21.31HRAS 4 + - 11p15.5MCM7 3 + - 7q22.1IFITM1 3 + + 11p15.5SPIB 3 + - 19q13.33CD19 3 + - 16p11.2SLC1A5 2 + - 19q13.32VIL1 2 + - 2q35CHKA 2 + - 11q13.2IDI1 2 + - 10p15.3TUBB3 2 + - 16q24.3CALCRL 2 + + 2q32.1STAG3 2 + - 7q22.1RECQL4 2 + - 8q24.3RHOH 2 - - 4p14NOVA2 2 + + 19q13.32CDC25C 2 + - 5q31.2AP2S1 1 + - 19q13.32SNRPD2 1 + - 19q13.32MVP 1 + + 16p11.2MFAP5 1 + + 12p13.31BICD1 1 - - 12p11.21DIP2C 1 + + 10p15.3FANCA 1 + - 16q24.3Em negrito, genes que apresentaram correlação positiva ounegativa. Os sinais positivos (+) e negativos (-) representamo status dos genes em relação ao padrão de ganhos (+) eperdas (-) e ao aumento (+) e diminuição (-) de expressãogênica.
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AGRADECIMENTOSÀ minha orientadora
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+ + CCDC8 0 51 37 14+ - CALM3 51 0
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ABSTRACTBackground: Uterine leiomyo
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genetic disorder showed the higher
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egulation of cell cycle. Chegini an
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REFERENCES[1] Baird DD, Dunson DB (
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[37] Luo X, Ding L, Xu J et al. (20
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AArray CGHExpression arrayBtumoral
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ABDiseases and Disorders P value Mo
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Table S5. Ingenuity Pathways Analys
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