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10.07.2015 Views

Cirilo, PDRRESULTADOS133Perda (1) NFE2L1, NFE2L1, TNFAIP8L3, TNFAIP8L3, F13A1 +hsa-mir-616 16q13 56,199,212-56,199,309 Ganho (3) SERPINB5, SCGB1D2, GPR126, GPR126, CHAC2, TXK, ERO1L, HSD17B7,NUDT21, HSD17B7, ADPGK-Perda (1) KLHL4, THBS2, THSD7A, PDE8B, RGS5, STON1, RGS5 +hsa-mir-328 16q22.1 65,793,724-65,793,799 Ganho (6) GABPB2, EDARADD, H2AFX, ACSS2 -Perda (0) HIC1, MAN1C1, NEXN, SFRP1, SYNPO2, LMOD1, PGM5, SYNPO2 +hsa-mir-642 19q13.32 50,870,025-50,870,122 Ganho (9) SMC2, GCET2, FAM83H, INA, STEAP3, AK2, AK2, NCBP2, FAM103A1,TMEM183A,-Perda (1) C10orf54, MSRB2 +hsa-mir-330 19q13.32 50,834,091-50,834,185 Ganho (9) IRX2, DLX1, KRT80, SCG3, ONECUT2, RNF43, C3orf57, TMEM48, LRP8, LRP8,RNF182, CD247, TMEM48, CD47, MRRF, TDRKH, TACC3, WNT7B, MYPN, SEZ6,SLC2A1, TMEM48, ADK, FAM110A, TRIM14, NRAS, TOMM34, CCDC21, FGD3,RMI1, GFM2, TDRKH, C22orf29, C1QBP, CCDC86, LDHB, ARPC5L, GRPEL2,-TIMM13, DNM1L, TOMM34, CCDC86, DOLPP1, GFM2, PDXK, AUP1, ASB1,POLE3, XRCC5Perda (1) SPRYD3, PPP2R5B, TOM1L2, VAMP2, SMO, ATP8B2, ITPK1, ZNF706, KLF9,EPHB3, ENAH, FGFR1, EGFLAM, CDKL1, PDE1A, FGFR1, PARVA, CDKL1,SYNPO, SLC9A9, PALM, PRIMA1, FOXO1, TES, RNF150, HEYL, CTTNBP2, +ACVRL1, CCDC8, TES, FOXO1, COL6A3, PDE1A, LONRF2, MYL9, GPRASP1, RAI2,GIMAP8, RASL12, GIMAP8, PRND, CD93hsa-miR-769-5p 19q13.32 51,214,029-51,214,147 Ganho (9) TPD52, PACSIN1, -Perda (1) FAM53B, CBX7, MFAP4 +hsa-mir-220c 19q13.32 53,755,340-53,755,423 Ganho (9) MAL, YKT6Perda (1)-hsa-mir-150 19q13.33 54,695,853-54,695,937 Ganho (8) EREG, MYB, IGF2BP1, NEK2, C13orf34, IGF2BP1, GINS1, EREG, AICDA,MAPK13, C16orf63, AIFM2, CTH, PTP4A1, METTL2A, MPZL1, EIF5, MPZL1, -SUV39H2, VTA1, NSUN4, FADS1, TBC1D20, C17orf39, IPO9, FOXK2Perda (1) FTO, TEAD1, FBXL5, CEP68, ZNF25FZD4, DDAH2, ZBTB4, ZEB1, PDCD4,GTF2IRD2, MYADM, MAMDC2, PRRT2, SLC8A1, PIK3R1, PTPRB, SLC8A1, +MASP1, SLC8A1, ENTPD1, PRICKLE2, ITIH5, SCN2B, AOC3hsa-mir-647 20q13.33 62,044,427-62,044,523 Ganho (4) STIL, LCP1, HSPC159 -Perda (1) C6orf89, FAM109B, XAF1, ZNF521, RHOJ, +*Sinais positivos indicam expressão gênica aumentada e sinais negativos, indicam expressão diminuída (log2ratio, cut-off de 1.0). Nesta tabela, osmiRNAs envolvidos em ganhos foram dispostos a frente dos genes preditos com diminuição de expressão e os miRNAs envolvidos em perdas, a frentedos genes com aumento de expressão. Esta ordem de apresentação representa o mecanismo mais provável de regulação de miRNA (correlaçãoinversa), porém, mecanismos de regulação com correlação positiva e/ou negativa dos miRNAs e genes preditos já foram relatados.

Cirilo, PDRRESULTADOS1344.5.3.3 Agrupamento hierárquicoPara verificar se os 75 genes moduladores estavam associados a casos específicos,foi realizado um teste de agrupamento hierárquico não supervisionado (teste de 1000permutações aleatórias e correlação de Pearson), considerando o perfil genômico etranscritptômico das amostras (Figura 33A e B, respectivamente). Após a realização doteste, as amostras foram categorizadas de acordo com a fase do ciclo, número de amostrasavaliadas e diagnóstico de tumores múltiplos ou únicos. De forma geral, tanto o perfilgenômico quanto transcritptômico dos 75 genes moduladores não foram estaticamenteassociados com o agrupamento das amostras de acordo com as categorias selecionadas. Defato, houve uma tendência de agrupamento entre as amostras de tumores múltiplosavaliados da mesma paciente em relação aos casos que tiveram apenas uma amostraavaliada. Entre os casos com diagnóstico de tumores múltiplos, apenas as amostras300T_A e B e 301T_B e C apresentaram maior similaridade de ganhos e perdas genômicase de expressão gênica. Além disso, foi gerado um heatmap dos genes, para observação doperfil de ganhos e perdas e o padrão de expressão gênica dos mesmos genes distribuídosentre as mesmas amostras (Figura 34).

Cirilo, PDRRESULTADOS133Perda (1) NFE2L1, NFE2L1, TNFAIP8L3, TNFAIP8L3, F13A1 +hsa-mir-616 16q13 56,199,212-56,199,309 Ganho (3) SERPINB5, SCGB1D2, GPR126, GPR126, CHAC2, TXK, ERO1L, HSD17B7,NUDT21, HSD17B7, ADPGK-Perda (1) KLHL4, THBS2, THSD7A, PDE8B, RGS5, STON1, RGS5 +hsa-mir-328 16q22.1 65,793,724-65,793,799 Ganho (6) GABPB2, EDARADD, H2AFX, ACSS2 -Perda (0) HIC1, MAN1C1, NEXN, SFRP1, SYNPO2, LMOD1, PGM5, SYNPO2 +hsa-mir-642 19q13.32 50,870,025-50,870,122 Ganho (9) SMC2, GCET2, FAM83H, INA, STEAP3, AK2, AK2, NCBP2, FAM103A1,TMEM183A,-Perda (1) C10orf54, MSRB2 +hsa-mir-330 19q13.32 50,834,091-50,834,185 Ganho (9) IRX2, DLX1, KRT80, SCG3, ONECUT2, RNF43, C3orf57, TMEM48, LRP8, LRP8,RNF182, CD247, TMEM48, CD47, MRRF, TDRKH, TACC3, WNT7B, MYPN, SEZ6,SLC2A1, TMEM48, ADK, FAM110A, TRIM14, NRAS, TOMM34, CCDC21, FGD3,RMI1, GFM2, TDRKH, C22orf29, C1QBP, CCDC86, LDHB, ARPC5L, GRPEL2,-TIMM13, DNM1L, TOMM34, CCDC86, DOLPP1, GFM2, PDXK, AUP1, ASB1,POLE3, XRCC5Perda (1) SPRYD3, PPP2R5B, TOM1L2, VAMP2, SMO, ATP8B2, ITPK1, ZNF706, KLF9,EPHB3, ENAH, FGFR1, EGFLAM, CDKL1, PDE1A, FGFR1, PARVA, CDKL1,SYNPO, SLC9A9, PALM, PRIMA1, FOXO1, TES, RNF150, HEYL, CTTNBP2, +ACVRL1, CCDC8, TES, FOXO1, COL6A3, PDE1A, LONRF2, MYL9, GPRASP1, RAI2,GIMAP8, RASL12, GIMAP8, PRND, CD93hsa-miR-769-5p 19q13.32 51,214,029-51,214,147 Ganho (9) TPD52, PACSIN1, -Perda (1) FAM53B, CBX7, MFAP4 +hsa-mir-220c 19q13.32 53,755,340-53,755,423 Ganho (9) MAL, YKT6Perda (1)-hsa-mir-150 19q13.33 54,695,853-54,695,937 Ganho (8) EREG, MYB, IGF2BP1, NEK2, C13orf34, IGF2BP1, GINS1, EREG, AICDA,MAPK13, C16orf63, AIFM2, CTH, PTP4A1, METTL2A, MPZL1, EIF5, MPZL1, -SUV39H2, VTA1, NSUN4, FADS1, TBC1D20, C17orf39, IPO9, FOXK2Perda (1) FTO, TEAD1, FBXL5, CEP68, ZNF25FZD4, DDAH2, ZBTB4, ZEB1, PDCD4,GTF2IRD2, MYADM, MAMDC2, PRRT2, SLC8A1, PIK3R1, PTPRB, SLC8A1, +MASP1, SLC8A1, ENTPD1, PRICKLE2, ITIH5, SCN2B, AOC3hsa-mir-647 20q13.33 62,044,427-62,044,523 Ganho (4) STIL, LCP1, HSPC159 -Perda (1) C6orf89, FAM109B, XAF1, ZNF521, RHOJ, +*Sinais positivos indicam expressão gênica aumentada e sinais negativos, indicam expressão diminuída (log2ratio, cut-off <strong>de</strong> 1.0). Nesta tabela, osmiRNAs envolvidos em ganhos foram dispostos a frente dos genes preditos com diminuição <strong>de</strong> expressão e os miRNAs envolvidos em perdas, a frentedos genes com aumento <strong>de</strong> expressão. Esta or<strong>de</strong>m <strong>de</strong> apresentação representa o mecanismo mais provável <strong>de</strong> regulação <strong>de</strong> miRNA (correlaçãoinversa), porém, mecanismos <strong>de</strong> regulação com correlação positiva e/ou negativa dos miRNAs e genes preditos já foram relatados.

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