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$PolinÃ´mios fracionÃ¡rios em modelos de regressÃ£o - Instituto de ...$

Cirilo, PDRRESULTADOS1274.5.3.1 Predição de regulação gênica por miRNAEntre os 75 genes moduladores identificados, 26 apresentaram correlação positiva(ganho genômico/aumento expressão) e três apresentaram correlação negativa (perdagenômica/diminuição expressão) e 46 deles apresentaram correlação inversa (45apresentaram ganho genômico e expressão diminuída e um gene teve perda genômica eexpressão aumentada). Sendo assim, foi realizada uma análise de predição de regulaçãogênica por miRNA com o objetivo de verificar se o comportamento de correlação inversapoderia ser explicado por este mecanismo. Foi realizada uma busca nos bancos de dadosTargetScan (http://www.targetscan.org/) e PicTar (http://pictar.mdc-berlin.de/cgibin/PicTar_vertebrate.cgi)que são ferramentas de predição de regulação gênica pormiRNAs, para os 46 genes que apresentaram correlação inversa (Tabela 11). Os genesATP5J2, AZGP1, CD19, CORO1A, CYC1, ELMO3, GDPD3, NFKBIL2, PKP3, PYCRL, RASSF7,RECQL4, SNRPD2, STAG3 e TALDO1 não apresentaram predição por miRNA. Os genesFANCA e TBC1D20, que tiveram expressão gênica diminuída, são regulados pelos miRNAshsa-miR-26b e hsa-miR-150, ambos identificados em regiões envolvidas em ganhosgenômicos neste estudo (2q35 e 19q13.33, respectivamente).
Cirilo, PDRRESULTADOS128Tabela 11. Genes identificados na análise integrada baseada nos achados de correlaçãoinversa (ganho genômico/diminuição de expressão e perda genômica/ aumento deexpressão gênica) e seus miRNAs preditos.SímbologeneTargetScanPicTarAICDA hsa-miR-155 hsa-miR-155AP2S1 - hsa-miR-34b, hsa-miR-34c, hsa-miR-34aATP5J2 - -AZGP1 - -BAZ1A hsa-miR-137 -C8orf51 ND NDBRCA1 hsa-miR-218 hsa-miR-197, hsa-miR-143, hsa-miR-205, hsa-miR-132, hsamiR-370,hsa-miR-30a-3p, hsa-miR-140, hsa-miR-185, hsamiR-154CD19 - -CDC25C hsa-miR-767-3p -CD93 hsa-miR-216a -CALM3 hsa-miR-22 hsa-miR-122a, hsa-miR-22, hsa-miR-27b, hsa-miR-27a, hsamiR-196b,hsa-miR-196a, hsa-miR-29c, hsa-miR-29b, hsamiR-29a,hsa-miR-320,CHKAhsa-miR-30e, hsa-miR-30a, hsamiR-30d,hsa-miR-30b, hsa-miR-30c-CORO1A - -CPSF4 hsa-miR-214 hsa-miR-214, hsa-miR-23a, hsa-miR-23b, hsa-let-7c, hsa-let-7g, hsa-let-7b, hsa-let-7f, hsa-let-7i, hsa-let-7a, hsa-miR-98,hsa-let-7e, hsa-let-7dCYC1 - -DDX21 hsa-miR-607 -EIF4EBP1 hsa-miR-125b, hsa-miR-125a-5p hsa-miR-125b, hsa-miR-125aELMO3 - -F12 hsa-miR-330-3p -FANCA - hsa-miR-26a, hsa-miR-26bGDPD3 - -HKDC1 hsa-miR-876-5p, hsa-miR-1243 -HRAS hsa-miR-892a -IDI1 hsa-miR-570 -KIF20A hsa-miR-153 hsa-miR-369, hsa-miR-374LRRC14 - hsa-miR-370, hsa-miR-28, hsa-miR-122aMCM7hsa-miR-519b-3p, hsa-miR-519a,hsa-miR-519c-3p, hsa-miR-548p-MYPN hsa-miR-214 -NFKBIL2 - -
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+ + CCDC8 0 51 37 14+ - CALM3 51 0
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REFERENCES[1] Baird DD, Dunson DB (
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[37] Luo X, Ding L, Xu J et al. (20
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AArray CGHExpression arrayBtumoral
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ABDiseases and Disorders P value Mo
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Table S5. Ingenuity Pathways Analys
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