Visualizar Tese - Instituto de Biociências - Unesp

Cirilo, PDRRESULTADOS1224.5.3 Integração dos dados – CONEXICApós a obtenção das regiões genômicas e genes significantes, o algoritmo CONEXIC(Akavia et al., 2010) foi utilizado na integração dos dados. Este algoritmo é baseado napremissa de que genes moduladores (ou drivers) são diferencialmente expressos devido adiferentes mecanismos biológicos, como ganhos e perdas genômicas, fornecendo umavantagem adaptativa para o desenvolvimento do tumor. Para a obtenção destes genes,foram realizadas três etapas fundamentais: 1) seleção dos genes candidatos amoduladores (JISTIC); 2) associação entre os genes candidatos a moduladores e osmódulos gênicos (análise de expressão gênica) e 3) utilização de redes de aprendizagemque aumentam o poder de seleção dos genes candidatos. Após estas etapas, foramidentificados 75 genes moduladores que explicam o comportamento de expressão dos3325 genes identificados na análise de expressão gênica. O Anexo 5 mostra a distribuiçãodos 75 genes identificados separados de acordo com o padrão de ganhos e perdasgenômicas e expressão aumentada ou diminuída entre as amostras. As regiões genômicasdos 75 genes moduladores foram anotadas e estavam distribuídos nas seguintes regiõesgenômicas, 1p36.13, 1q41, 2q32.1, 2q32.2, 2q35, 4p14, 5q31.2, 5q35.3, 7q22.1, 8p12,8q24.3, 10p15.3, 10q21.3, 11p15.5, 11q13.2, 12p11.21, 12p13.31, 14q13.2, 16p11.2,16q24.3, 17q21.31, 19q13.32, 19q13.33, 20p11.2 e 20p13. A Tabela 10 mostra os valoresdo JISTIC e CONEXIC e informações adicionais de cada gene.