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$PolinÃ´mios fracionÃ¡rios em modelos de regressÃ£o - Instituto de ...$

Cirilo, PDRRESULTADOS121Figura 32. Funções biológicas dos 3325 genes identificados pela análise de microarray. Acategorização dos transcritos foi baseada em log 2ratio com o fold-change ≤ -1.0 e ≥ 1.0, indicandodiminuição ou aumento de expressão, respectivamente. Quase metade dos genes com expressãoaumentada (44,9%) possuem funções associadas com processos celulares e aproximadamente38% dos genes com expressão diminuída, apresentam esta mesma categorial funcional. 74,4%dos genes com expressão diminuída estão relacionados a funções associadas com ciclo celular(FUNNET).
Cirilo, PDRRESULTADOS1224.5.3 Integração dos dados – CONEXICApós a obtenção das regiões genômicas e genes significantes, o algoritmo CONEXIC(Akavia et al., 2010) foi utilizado na integração dos dados. Este algoritmo é baseado napremissa de que genes moduladores (ou drivers) são diferencialmente expressos devido adiferentes mecanismos biológicos, como ganhos e perdas genômicas, fornecendo umavantagem adaptativa para o desenvolvimento do tumor. Para a obtenção destes genes,foram realizadas três etapas fundamentais: 1) seleção dos genes candidatos amoduladores (JISTIC); 2) associação entre os genes candidatos a moduladores e osmódulos gênicos (análise de expressão gênica) e 3) utilização de redes de aprendizagemque aumentam o poder de seleção dos genes candidatos. Após estas etapas, foramidentificados 75 genes moduladores que explicam o comportamento de expressão dos3325 genes identificados na análise de expressão gênica. O Anexo 5 mostra a distribuiçãodos 75 genes identificados separados de acordo com o padrão de ganhos e perdasgenômicas e expressão aumentada ou diminuída entre as amostras. As regiões genômicasdos 75 genes moduladores foram anotadas e estavam distribuídos nas seguintes regiõesgenômicas, 1p36.13, 1q41, 2q32.1, 2q32.2, 2q35, 4p14, 5q31.2, 5q35.3, 7q22.1, 8p12,8q24.3, 10p15.3, 10q21.3, 11p15.5, 11q13.2, 12p11.21, 12p13.31, 14q13.2, 16p11.2,16q24.3, 17q21.31, 19q13.32, 19q13.33, 20p11.2 e 20p13. A Tabela 10 mostra os valoresdo JISTIC e CONEXIC e informações adicionais de cada gene.
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AGRADECIMENTOSÀ minha orientadora
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Figura 33 Agrupamento hierárquico
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LISTA DE SIGLAS E ABREVIATURASANG A
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Anexo 5. Genes identificados na an
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+ + CCDC8 0 51 37 14+ - CALM3 51 0
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REFERENCES[1] Baird DD, Dunson DB (
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[37] Luo X, Ding L, Xu J et al. (20
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AArray CGHExpression arrayBtumoral
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Table S5. Ingenuity Pathways Analys
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