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Cirilo, PDRRESULTADOS1194.5.1 CGH arrayA análise dos dados genômicos foi dividida em duas etapas: a segmentação e aobtenção das regiões com alterações significativas. A primeira envolveu a identificação dealterações no número de cópias ou de pontos de quebra. Para isso foi utilizado o métodonão-paramétrico DNA Copy (Olshen et al., 2004). Os perfis genômicos de cada caso foigerado. A Figura 31 é um exemplo que ilustra o perfil da amostra 759T. A segunda etapafoi a utilização do algoritmo JISTIC (Beroukhim et al., 2007) para as 51 amostrassegmentadas. Nesta análise, foi utilizado um limiar de sensibilidade de 0,3 (q-valor). Osgenes mapeados em regiões significativamente alteradas foram escolhidos como genescandidatos a moduladores. Com esse algoritmo, foi possível identificar 1192 genesmapeados em regiões com G-score significativo (picos de alterações) para ganhos e perdasgenômicas.Figura 31. Análise de segmentação realizada pelo DNA Copy. No eixo x, os valores de 0 a40.000 representam o número de marcadores do algoritmo que representam todos oscromossomos. As cores alternativas representam os cromossomos (1 a 22, X e Y), no qualo primeiro grupo de pontos verdes indica o cromossomo 1. No eixo y, os valores de log2mostram as variações abaixo de zero (linha vermelha no eixo central), indicando regiõesenvolvidas em perdas e as variações acima de zero, indicam as regiões envolvidas emganhos genômicos. Regiões sem oscilação do eixo central não apresentam alterações nonúmero de cópias de DNA (DNA Copy).