EKSAMENSOPPGAVE i: Bi2014 ... - Institutt for biologi

Norges teknisk-naturvitenskapelige universitet
Institutt for Biologi
Norwegian University of Science and Technology
Department of Biology
EKSAMENSOPPGAVE i:
EXAMINATION in:
Bi2014 - Molekylærbiologi
Bi2014 - Molecular biology
-
Faglig kontakt under eksamen/Contact person/Subject teacher during exam:
Professor Atle M. Bones
Tlf.: 91897237
Eksamensdato/Date: 12. desember 2011
Eksamenstid/Number of hours: 4t/4h
Studiepoeng/Credits: 7.5
Tillatte hjelpemidler/Permitted aids: Ingen/None
Språkform/Languages:
Antall sider totalt/Total number of pages: 4
Cover page/ Bokmål (1 page) / engelsk (1 page)/nynorsk (1 page)
Sensurdato/Grades to be announced on: 13. Januar 2012
NB! Start answering each question on a new sheet.
NB! Start å svare på hver oppgave på et nytt ark!
NB! Start å svare på kvar oppgåve på eit nytt ark!
___________________________________________________________________________________________
Merk! Studentene må primært gjøre seg kjent med sensur ved å bruke Studentweb. Eventuelle telefoner om
sensur må rettes til instituttet. Eksamenskontoret vil ikke kunne svare på slike telefoner.

BOKMÅL:
Oppgave 1.
Genmodifiserte organismer (GMO) (maks 3 sider)
a. Forklar hva som kjennetegner genmodifiserte organismer.
b. Beskriv én av metodene som brukes til å fremstille eukaryote genmodifiserte
organismer.
c. Gi eksempler på hva genmodifiserte organismer brukes til/kan brukes til.
Oppgave 2.
Regulering av genekspresjon på RNA nivå (maks 4 sider)
a. Beskriv i detalj mekanismene som regulerer ekspresjonen på RNA nivå
b. Beskriv prinsippet og den detaljerte mekanismen bak RNA interferens (RNAi)
Oppgave 3.
Sekvensering og genomanalyse (maks 3 sider)
Millioner av sekvenser har blitt fremstilt ved hjelp av “high throughput sequencing” av
DNA fra en marin alge. Ingen sekvensinformasjon er kjent fra før fra denne algen.
Beskriv hvordan slik sekvensinformasjon kan brukes for å bestemme genetisk
slektskap med andre arter og algens egenskaper.
(Noen stikkord: plastide, mitokondrion, kjerne, alignment, genmodeller, variasjon,
fylogeni, homolog, paralog, ortolog, protein evolusjon, molekylær klokke, kodende vs
ikke-kodende DNA).
Oppgave 4.
Molekylærbiologiske metoder (maks 5 sider/en side per delspørsmål)
Beskriv prinsippene bak de følgene teknikkene og gi eksempler på hva de brukes til:
a. qPCR
b. Immunocytokjemisk lokalisering
c. Vektor (i molekylærgenetikk)
d. Bruk av markørgener som GUS og GFP
e. DNA mikromatriser
Side 2 av 4
error! number cannot be represented in specified format.

ENGLISH:
Question 1.
Gene modified organisms (GMO) (max 3 pages)
a. What characterizes gene modified organisms
b. Describe one of the methods used to produce/develop eukaryotic gene modified
organisms.
c. Give examples of what gene modified organisms are used for /can be used for.
Question 2. Regulation of gene expression at RNA level (max 4 pages)
a. Describe in some detail the mechanisms regulating expression at RNA level.
b. Describe the principle and the detailed mechanism behind RNA interference
(RNAi).
Question 3.
Sequencing and genome analysis (max 3 pages)
Millions of sequences have been produced by “high throughput sequencing” of DNA
from a marine alga. No sequence information is previously available for this specific
alga. Describe how such sequence data might be used to determine genetically
relationship with other species and traits/properties of the alga.
(Some key words: plastid, mitochondrion, nucleus, alignment, gene models, variation,
phylogeny, homolog, paralog, ortholog, protein evolution, molecular clock, coding vs
non-coding DNA).
Question 4.
Molecular biology methods (max 5 pages/one page per sub question)
Describe the principles behind the following techniques and give examples of their
use.
a. qPCR
b. Immunocytochemical localization
c. Vector (in molecular genetics)
d. Use of reporter genes like GUS and GFP
e. DNA microarrays
Side 3 av 4
error! number cannot be represented in specified format.

NYNORSK:
Oppgåve 1.
Genmodifiserte organismar (GMO) (maks 3 sider)
a. Forklar kva som kjenneteiknar genmodifiserte organismar.
b. Beskriv ei av metodane som brukas til å framstille eukaryote genmodifiserte
organismar.
c. Gi døme på kva genmodifiserte organismar nyttas til/kan brukas til.
Oppgåve 2.
Regulering av genekspresjon på RNA nivå (maks 4 sider)
a. Beskriv i detalj mekanismane som regulerer ekspresjonen på RNA nivå
b. Beskriv prinsippet og den detaljerte mekanismen bak RNA interferens (RNAi)
Oppgåve 3.
Sekvensering og genomanalyse (maks 3 sider)
Millionar av sekvensar har blitt framstilt ved hjelp av “high throughput sequencing” av
DNA frå en marin alge. Ingen sekvensinformasjon er kjent frå før frå denne algen.
Beskriv korleis slik sekvensinformasjon kan brukas for å bestemme genetisk slektskap
med andre arter og algens eigenskapar.
(Noen stikkord: plastide, mitokondrion, kjerne, alignment, genmodeller, variasjon,
fylogeni, homolog, paralog, ortolog, protein evolusjon, molekylær klokke, kodande vs
ikke-kodande DNA).
Oppgåve 4.
Molekylærbiologiske metodar (maks 5 sider/en side per delspørsmål)
Beskriv prinsippa bak desse teknikkane og gi eksemplar på kva dei brukast til:
a. qPCR
b. Immunocytokjemisk lokalisering
c. Vektor (i molekylærgenetikk)
d. Bruk av markør genar som GUS og GFP
e. DNA mikromatrisar
Side 4 av 4
error! number cannot be represented in specified format.