Prosedyrebok for NoPSC biobank 2013-2017 - Ous-research.no
Prosedyrebok for NoPSC biobank 2013-2017 - Ous-research.no
Prosedyrebok for NoPSC biobank 2013-2017 - Ous-research.no
Create successful ePaper yourself
Turn your PDF publications into a flip-book with our unique Google optimized e-Paper software.
<strong>Prosedyrebok</strong> <strong>for</strong> <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong><br />
<strong>2013</strong>-<strong>2017</strong><br />
Hege Dahlen Sollid, Mette Vesterhus, Liv Wenche<br />
Thorbjørnsen, Mona Bjørnstad, Johannes R. Hov,<br />
Kirsten Muri Boberg og Tom H. Karlsen<br />
Oslo Universitetssykehus HF Rikshospitalet<br />
Haukeland Universitetssykehus<br />
Versjon 03<br />
Juni <strong>2013</strong>
Innholds<strong>for</strong>tegnelse<br />
Innledning ............................................................................................................................................ 3<br />
Kapittel 1 – Inkludering av pasienter ..................................................................................................... 3<br />
Overordnede rutiner ved <strong>for</strong>espørsel om samtykke .......................................................................... 3<br />
Pasientgrupper som inkluderes i studiene og den praktiske gjen<strong>no</strong>mføringen .................................. 4<br />
Materialkategorier som samles inn fra pasienter og friske kontroller ............................................... 7<br />
Kapittel 2 – <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong>ing i andre sammenhenger ......................................................................... 7<br />
IBSEN20 ............................................................................................................................................ 7<br />
Biobankprosjekt Tarm ....................................................................................................................... 8<br />
Kapittel 3 – Kvalitetskontroll av langtidslagret materiale ved <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong> ....................................... 9<br />
Kapittel 4 – Registrering av kliniske og biologiske data ....................................................................... 10<br />
Kapittel 5 – Prøvetaking av blodprøver ............................................................................................... 12<br />
Rutiner ved blodprøvetaking........................................................................................................... 12<br />
Prepareringsprosedyrer og registrering i Medinsightdatabasen ...................................................... 14<br />
Kapittel 6 – Prøvetaking av urinprøver ................................................................................................ 17<br />
Kapittel 7 – Prøvetaking av fecesprøver .............................................................................................. 18<br />
Kapittel 8 – Ultralyd lever og galleveier og shear wave elastografi av lever og milt ............................. 19<br />
Kapittel 9 – Prøvetaking ved ERCP undersøkelse ................................................................................. 20<br />
Rutiner ved prøvetaking ................................................................................................................. 20<br />
Prøvetaking, preparering og registrering i Medinsightdatabasen .................................................... 20<br />
Kapittel 10 – Prøvetaking ved levertransplantasjon ............................................................................ 22<br />
Utstyr til prøvetakingen .................................................................................................................. 22<br />
Prøvetakingsprosedyre ................................................................................................................... 23<br />
Registreringsprosedyre i Medinsight og etterarbeid ....................................................................... 24<br />
Kapittel 11 – Isolation of human Biliary Epithelial Cells (Cholangiocytes) ............................................ 26<br />
Kapittel 12 – Uttak av biologisk- og klinisk materiale fra <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong>............................................. 31<br />
Kapittel 13 – Forsendelse og mottak av biologisk- og klinisk materiale ............................................... 32<br />
Kapittel 14 – Føring av <strong>for</strong>skningsprotokoll ......................................................................................... 32<br />
Kapittel 15 – Lagring av data underveis og ved avslutning av prosjekt ................................................ 33<br />
Vedlegg<br />
Vedlegg 1: Forespørsel om deltakelse i <strong>for</strong>skning “Lever- og gallegangssykdommer” ......................... 34<br />
Vedlegg 2: Forespørsel om samtykke til <strong>for</strong>sknings<strong>biobank</strong> <strong>for</strong> mage-tarmsykdommer ...................... 39<br />
Vedlegg 3: Databaseskjema – Prosjekt “Lever- og gallegangssykdommer”.......................................... 44<br />
Vedlegg 4: Invitasjon til deltakelse i PSC kohort .................................................................................. 46<br />
Vedlegg 5: PSC-40 skjema (PBC-40 adaptert <strong>for</strong> PSC) .......................................................................... 48<br />
Vedlegg 6: IPSCSG pruritus skjema...................................................................................................... 52<br />
Vedlegg 7: Forespørsel om å gi nye blodprøver til <strong>for</strong>skningsprosjekt ................................................. 56<br />
Vedlegg 8: Forespørsel om deltakelse i <strong>for</strong>skning “Tarmsykdommer” ................................................. 57<br />
Vedlegg 9: Skjemaer ved prøvetaking til Biobankprosjekt Tarm .......................................................... 62<br />
Vedlegg 10: Prøvetaking av biopsier ved Biobankprosjekt Tarm ......................................................... 81<br />
Vedlegg 11: Prøvetaking til <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong> - Blodprøver .................................................................... 82<br />
Vedlegg 12: Prøvetaking ved <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong> - blodprøvetaking til DNA ekstraksjon ........................... 83<br />
Vedlegg 13: Prøvetaking av urinprøve til prosjekt – brev til deltaker................................................... 84<br />
Vedlegg 14: Prøvetaking av avføringsprøver til prosjekt – brev til deltaker ......................................... 85<br />
Vedlegg 15: Kartleggingsspørsmål ved prøvetaking av avføringsprøver til prosjekt ............................. 87<br />
Vedlegg 16: Prøvetaking til <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong> – Børstecytologi- og galleprøver tatt ved ERCP ................ 88<br />
Vedlegg 17: Prøvetaking til <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong> – Biopsier- og galleprøver fra eksplantert lever ............... 89<br />
Vedlegg 18: Registreringsskjema <strong>for</strong> endringer i prosedyrene ved <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong> ............................. 91<br />
Vedlegg 19: Avviksskjema <strong>for</strong> prøvetaking ved <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong> ........................................................... 92<br />
Vedlegg 20: Registreringsskjema <strong>for</strong> uttak fra <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong> ............................................................ 93<br />
Vedlegg 21: Agreement on Human Biological Material Transfer (MTA) ............................................... 94<br />
Vedlegg 22: Skjema <strong>for</strong> føring av <strong>for</strong>skningsprotokoll ved <strong>NoPSC</strong>........................................................ 96<br />
<strong>Prosedyrebok</strong> ved <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong>_Versjon 03.docx Org.enhet: Norsk senter <strong>for</strong> PSC, Avd. <strong>for</strong> transplantasjonsmedisin Nivå:4<br />
Dokumentversjon: 1 Utarbeidet av: Hege Dahlen Sollid Godkj. av: Tom Hemming Karlsen Dato: 18.06.13 Side 2 av 96
Innledning<br />
Norsk senter <strong>for</strong> PSC (<strong>NoPSC</strong>) ble <strong>for</strong>melt etablert 19. mai 2008 ved Medisinsk klinikk,<br />
Rikshospitalet, og er i dag et <strong>for</strong>skningssenter under Avdeling <strong>for</strong> transplantasjonsmedisin,<br />
Kreft-, kirurgi- og transplantasjonsklinikken, Oslo Universitetssykehus (OUS) HF<br />
Rikshospitalet. Senteret jobber tett sammen med Seksjon <strong>for</strong> <strong>for</strong>døyelsessykdommer og<br />
Institutt <strong>for</strong> indremedisinsk <strong>for</strong>skning ved OUS Rikshospitalet, Institutt <strong>for</strong> klinisk medisin ved<br />
Universitet i Oslo og Seksjon <strong>for</strong> gastroenterologi, Medisinsk avdeling ved Haukeland<br />
Universitetssykehus. <strong>NoPSC</strong> <strong>for</strong>sker på den kroniske sykdommen primær skleroserende<br />
cholangitt (PSC), og andre leverrelaterte sykdommer.<br />
<strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong> ble etablert høsten 2008 jfr. prosjektbeskrivelse <strong>for</strong> <strong>biobank</strong> ved Norsk<br />
senter <strong>for</strong> PSC, og er en fellesressurs <strong>for</strong> alle prosjekter som støttes av <strong>NoPSC</strong>. Biobanken er<br />
etablert på en slik måte at lagring og uthenting er pålitelig og personuavhengig. Det samles<br />
inn og lagres biologisk materiale og kliniske data fra pasienter og kontroller. De første fem<br />
årene har <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong> inkludert og samlet inn materiale fra et bredt utvalg av pasienter<br />
med lever- og gallegangssykdommer. Fokuset de neste årene dreies mot prospektiv<br />
oppfølging av en mindre gruppe PSC pasienter. Det er i den <strong>for</strong>bindelse etablert en<br />
«satelitt<strong>biobank</strong>» ved Haukeland Universitetssykehus, hvor inkludering og prøvetaking<br />
utføres etter den samme protokollen. I tillegg til PSC kohorten vil det fremdeles inkluderes<br />
andre PSC pasienter, samt pasienter som kommer til utredning eller kontroll <strong>for</strong><br />
levertransplantasjon.<br />
<strong>Prosedyrebok</strong> <strong>for</strong> <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong> <strong>2013</strong>-<strong>2017</strong> (v03) er en oppdatering av de to <strong>for</strong>egående<br />
prosedyrebøkene utgitt i 2009, v01 (19.04.09) og v02 (30.09.09). <strong>Prosedyrebok</strong>en gjør rede<br />
<strong>for</strong> rutiner og ansvar knyttet til pasientinkludering og prøvetaking, samt beskriver hva som<br />
skjer med det innsamlede materialet. Det biologiske materialet lagres i rør med unike 2D<br />
barkoder (Matrix, Thermo Scientific), registreres i en elektronisk database- og<br />
sporingsløsning (Medinsight) og prøvene identifiseres deretter vha en 2D skanner. Til hver<br />
enkelt prøvealikvot blir det i Medinsight registrert hvilken prepareringsprotokoll som er<br />
benyttet, hvor prøvene er lagret og hva de er benyttet til. Prepareringsprotokollene er<br />
beskrevet i dette dokument og tjener som <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong>ens «standard operating<br />
procedures» (SOP).<br />
Kapittel 1 – Inkludering av pasienter<br />
I dette kapittelet beskrives gjeldende rutiner <strong>for</strong> pasientinkludering og materialinnsamling,<br />
både til PSC kohorten og <strong>for</strong> andre pasienter. Inkludering og innsamling <strong>for</strong>egår parallelt ved<br />
<strong>NoPSC</strong>, Oslo Universitetssykehus HF Rikshospitalet (OUS Rikshospitalet) og satelitt<strong>biobank</strong>en<br />
ved Seksjon <strong>for</strong> gastroenterologi, Medisinsk avdeling, Haukeland Universitetssykehus<br />
(Haukeland).<br />
Overordnede rutiner ved <strong>for</strong>espørsel om samtykke<br />
Samtykkedokumentet som benyttes ved OUS Rikshospitalet heter «Forespørsel om<br />
deltakelse i <strong>for</strong>skning. Lever- og gallegangssykdommer» (vedlegg 1), og ved Haukeland;<br />
«Forespørsel om samtykke til <strong>for</strong>sknings<strong>biobank</strong> <strong>for</strong> mage-tarmsykdommer» (vedlegg 2).<br />
Samtykkedokumentet gis/sendes pasienten <strong>for</strong> gjen<strong>no</strong>mlesning. Det redegjøres i<br />
dokumentet <strong>for</strong> hensikten med studiene, risiko knyttet til deltakelse og eventuelle gevinster<br />
både generelt og <strong>for</strong> deltaker. Deltakelse har ingen direkte betydning <strong>for</strong> behandling av<br />
pasienten, men <strong>for</strong>skningen som gjøres ved <strong>NoPSC</strong> danner grunnlaget <strong>for</strong> bedre<br />
behandlingstilbud <strong>for</strong> pasienter med lever- og gallegangssykdommer i fremtiden.<br />
<strong>Prosedyrebok</strong> ved <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong>_Versjon 03.docx Org.enhet: Norsk senter <strong>for</strong> PSC, Avd. <strong>for</strong> transplantasjonsmedisin Nivå:4<br />
Dokumentversjon: 1 Utarbeidet av: Hege Dahlen Sollid Godkj. av: Tom Hemming Karlsen Dato: 18.06.13 Side 3 av 96
Frivilligheten understrekes, både i <strong>for</strong>hold til deltakelse, og i <strong>for</strong>hold til muligheten til å<br />
kunne trekke seg fra studiene til enhver tid uten begrunnelse og be om at gjenværende<br />
biologisk materiale i <strong>for</strong>sknings<strong>biobank</strong>en destrueres.<br />
Ved OUS Rikshospitalet er det studiesykepleier ved <strong>NoPSC</strong> eller leger ved Avdeling <strong>for</strong><br />
transplantasjonsmedisin som gjen<strong>no</strong>mfører in<strong>for</strong>masjonssamtalen med pasientene. Ved<br />
Haukeland er det prosjektlege som er ansvarlig <strong>for</strong> samtalen.<br />
Pasienten skal gis tid til å lese igjen<strong>no</strong>m før han/hun <strong>for</strong>espørres om deltakelse i studiene.<br />
Hvis pasienten svarer ja signeres samtykkeskjemaet av både pasient og den som in<strong>for</strong>merer.<br />
Signert samtykke registreres i «Samtykkedatabasen» / annen egnet database slik at det til<br />
enhver tid eksisterer en oppdatert oversikt over personer som deltar i studiene. Ved OUS<br />
Rikshospitalet ligger Samtykkedatabasen på et sikkert og beskyttet område på OUS-nett.<br />
Ved inkludering av nydiag<strong>no</strong>stiserte PSC pasienter, eller PSC pasienter som ikke tidligere har<br />
vært inkludert, fylles det ut «Databaseskjema, Lever- og gallegangssykdommer» i samtale<br />
med pasienten (vedlegg 3). In<strong>for</strong>masjonen benyttes til de kliniske skjemaene i<br />
Medinsightdatabasen / annet egnet database. Kun personale med lege- eller<br />
sykepleieutdannelse ved <strong>NoPSC</strong> har denne funksjonen, p.t. studiesykepleier ved OUS / post<br />
doc ved Haukeland. Evt. manglende in<strong>for</strong>masjon hentes inn fra pasientens journal ved lokalt<br />
sykehus.<br />
Pasientgrupper som inkluderes i studiene og den praktiske gjen<strong>no</strong>mføringen<br />
PSC pasienter til den prospektive PSC kohorten<br />
I <strong>2013</strong> startet arbeidet med å etablere en prospektiv kohort av ikke-transplanterte PSC<br />
pasienter. Disse skal følges med årlige innkallinger hvor blodprøvetaking og innhenting av<br />
kliniske parametre gjen<strong>no</strong>mføres. Hensikten er å undersøke om vi kan finne nye markører<br />
<strong>for</strong> sykdomsaktivitet og sykdomsprogresjon. Dette vil være viktig både <strong>for</strong> vurdering av<br />
prog<strong>no</strong>se hos den enkelte, og <strong>for</strong> å fremskaffe kunnskap som kan gi utgangspunkt <strong>for</strong><br />
utvikling av målrettet behandling. Målet er å inkludere ca 50 pasienter ved Haukeland (42<br />
ble inkludert januar og februar <strong>2013</strong>), og tilsvarende antall ved OUS Rikshospitalet.<br />
Ved etablering av PSC kohorten ved Haukeland ble det etter godkjenning i regional Etisk<br />
Komite Vest sendt ut et in<strong>for</strong>masjonsbrev til deltakerne (vedlegg 4). Tilsvarende vil sendes ut<br />
til en utvalgt gruppe av allerede inkluderte PSC pasienter i Oslo-regionen. Signert svarbrev<br />
og evt. nytt samtykkeskjema returneres til hhv. <strong>NoPSC</strong> eller Haukeland, der det registreres i<br />
Samtykkedatabasen / annen database. Deltakelse i PSC kohorten har ingen direkte<br />
betydning <strong>for</strong> behandling av pasienten, og erstatter ikke vanlig klinisk oppfølging eller<br />
vanlige kliniske kontroller hos egen lege eller ved eget sykehus.<br />
Deltakerne vil bli kalt inn på årlig basis <strong>for</strong> innsamling av kliniske parametere og prøvetaking,<br />
se under. Ved OUS Rikshospitalet er det studiesykepleier, i samarbeid med <strong>biobank</strong>ansvarlig<br />
bioingeniør, som planlegger tidspunktene <strong>for</strong> de årlige besøkene, og lokalene til<br />
Forskningsposten (C1.3003) vil bli benyttet. Ved Haukeland er post doc ansvarlig og lokalene<br />
til medisinisk undersøkelse benyttes. Det settes av ca 1 time pr pasient <strong>for</strong> innhenting av<br />
kliniske data og gjen<strong>no</strong>mføring av prøvetakingen. Ved OUS Rikshospitalet er studiesykepleier<br />
ansvarlig <strong>for</strong> gjen<strong>no</strong>mføringen av den årlige kontrollen, mens det er prosjektansvarlig lege<br />
som er ansvarlig <strong>for</strong> denne kontrollen ved Haukeland.<br />
For hjelp i registreringen av kliniske variabler (inkl. livskvalitet) benyttes følgende skjemaer:<br />
PSC-40 (PBC-40 adaptert <strong>for</strong> PSC) (se vedlegg 5)<br />
IPSCSG pruritusskjema (kartlegging av kløe ved PSC) (se vedlegg 6)<br />
The gastrointestinal symptom rating scale (GSRS) (se vedlegg 9, del D)<br />
<strong>Prosedyrebok</strong> ved <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong>_Versjon 03.docx Org.enhet: Norsk senter <strong>for</strong> PSC, Avd. <strong>for</strong> transplantasjonsmedisin Nivå:4<br />
Dokumentversjon: 1 Utarbeidet av: Hege Dahlen Sollid Godkj. av: Tom Hemming Karlsen Dato: 18.06.13 Side 4 av 96
Skjemaene registreres i PSC-kohort databasen som ligger på et sikkert/beskyttet område på<br />
OUS-nett. Studiesykepleier ved <strong>NoPSC</strong> er ansvarlig <strong>for</strong> registrering av alle skjema samlet inn<br />
både ved OUS og Haukeland.<br />
I tillegg til de kliniske dataene samles det inn følgende materialer:<br />
Blodprøver i hht. <strong>Prosedyrebok</strong> <strong>for</strong> <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong> v03 (kapittel 5). Ved OUS<br />
gjen<strong>no</strong>mføres prøvetakingen av <strong>biobank</strong>ansvarlig bioingeniør, mens ved Haukeland<br />
er det p.t. tilknyttet bioingeniør ved Gastroavdelingen. Det tas også ett sett<br />
blodprøver til umiddelbar analyse hos Avd. <strong>for</strong> medisinsk biokjemi. Følgende<br />
parametre måles: B-Hemoglobin, E-MCV, B-LPK m/diff, B-TPK, S-Ferritin, S-Løselig<br />
transferrin-reseptor, S-CRP, S-Kreatinin, S-Natrium, S-Kalium, S-ASAT, S-ALAT, S-ALP,<br />
S-Gamma-GT, S-Bilirubin, S-Albumin, P-PT-INR, S-CEA, S-AFP og S-CA 19-9.<br />
o Alle blodprøver gjen<strong>no</strong>mgås av lege før overføring til <strong>for</strong>skningsdatabasen<br />
<strong>for</strong> å fange opp eventuelle avvik som tiltrenger konsekvens. Dette gjøres ved<br />
OUS Rikshospitalet av <strong>NoPSC</strong> ansatte leger ved Gastromedisinsk sengepost,<br />
ved Haukeland Universitetssykehus ved prosjektansvarlig lege. Det merkes<br />
samtidig av i databasen <strong>for</strong> prospektiv oppfølging at blodprøvegjen<strong>no</strong>msyn<br />
ved lege er utført (eget punkt).<br />
Urinprøver til nedfrysning (kapittel 6): pasienten får tilsendt prøvetakingsutstyr i<br />
<strong>for</strong>kant av kontroll, og tar med seg prøven til kontrollen.<br />
Fecesprøver (kapittel 7): pasienten får med seg prøvetakingsutstyr hjem. Prøvene<br />
sendes til <strong>NoPSC</strong>/Haukeland via post.<br />
Ultralyd av lever og galleveier, samt shear wave elastrografi av lever og milt (kapittel<br />
8).<br />
Andre pasientgrupper ved Seksjon <strong>for</strong> <strong>for</strong>døyelsessykdommer, OUS Rikshospitalet<br />
PSC pasienter ved sengepost og dagenhet<br />
Det er i tillegg ønskelig at samtlige PSC pasienter (dersom de ikke allerede deltar i den<br />
prospektive kohorten) <strong>for</strong>elegges mulighet <strong>for</strong> deltakelse i studiene når de kommer til<br />
utredning/oppfølging. Studiesykepleier gjen<strong>no</strong>mgår ukentlig listen over neste ukes<br />
pasienter, både <strong>for</strong> sengeposten og dagenheten, og identifiserer aktuelle pasienter.<br />
Studiesykepleier gjen<strong>no</strong>mfører så samtykkesamtale som beskrevet over og ved samtykke<br />
fylles også «Databaseskjema, Lever- og gallegangssykdommer» ut (vedlegg 3). Det tas ikke<br />
full «blodprøvetakingspakke» <strong>for</strong> disse pasientene, kun blodprøvetakingen til DNA<br />
ekstraksjon. Prøvetakingen gjen<strong>no</strong>mføres ved Avdeling <strong>for</strong> medisinsk biokjemi, OUS<br />
Rikshospitalet (se kapittel 5 <strong>for</strong> egen prosedyre) og pasienten får med seg et eget<br />
prøvetakingsskjema (vedlegg 12). Personale ved <strong>NoPSC</strong> varsles av avd. <strong>for</strong> medisinsk<br />
biokjemi når prøvetaking er gjen<strong>no</strong>mført og prøvene bringes så til <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong> <strong>for</strong><br />
registrering og lagring.<br />
Pasienter som meldes på Levertransplantasjonsventelisten<br />
Alle pasienter som meldes på levertransplantasjonsventelisten uavhengig av diag<strong>no</strong>se vil bli<br />
<strong>for</strong>espurt om deltakelse i studiene, med mindre de allerede er inkludert. Pasienter som er<br />
levertransplanterte, men ikke tidligere inkludert, vil også bli <strong>for</strong>espurt når de kommer til<br />
kontroll ved dagenheten, evt. sengeposten. Studiesykepleier gjen<strong>no</strong>mgår ukentlig<br />
pasientlistene <strong>for</strong> Seksjon <strong>for</strong> <strong>for</strong>døyelsessykdommer slik at aktuelle nye pasienter<br />
identifiseres. Studiesykepleier in<strong>for</strong>merer legene om hvilke pasienter som skal <strong>for</strong>espørres<br />
via den daglige vaktrapporten. In<strong>for</strong>masjonssamtale og <strong>for</strong>espørsel om deltakelse i studiene<br />
<strong>Prosedyrebok</strong> ved <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong>_Versjon 03.docx Org.enhet: Norsk senter <strong>for</strong> PSC, Avd. <strong>for</strong> transplantasjonsmedisin Nivå:4<br />
Dokumentversjon: 1 Utarbeidet av: Hege Dahlen Sollid Godkj. av: Tom Hemming Karlsen Dato: 18.06.13 Side 5 av 96
gjen<strong>no</strong>mføres deretter av legene i <strong>for</strong>bindelse med annen in<strong>for</strong>masjon som blir gitt til<br />
pasienten.<br />
Rutinemessig fylles følgende skjema ut ved påmelding til levertransplantasjonsventelisten<br />
(står i perm merket «LEVERTX – påmelding»):<br />
Meldeskjema til Immu<strong>no</strong>logisk Institutt (IMMI)<br />
o Sendes til IMMI med bud<br />
<br />
<br />
<br />
Leverregisterets dataregistrering Form A – grønt ark<br />
o Legges i hyllen merket «Levertransplantasjon» til Tom Hemming Karlsen<br />
Samtykkeskjema <strong>for</strong> registrering i Norsk levertransplantasjonsregister<br />
o Legges i posthyllen til studiesykepleier ved <strong>NoPSC</strong><br />
For ikke tidligere inkluderte pasienter: «Forespørsel om deltakelse i <strong>for</strong>skning, Leverog<br />
gallegangssykdommer» Norsk senter <strong>for</strong> PSC – blått ark<br />
o Gjelder både pasienter som meldes på ventelisten og pasienter som<br />
kommer til kontroll etter levertransplantasjon: Studiesykepleier legger blått<br />
samtykkeskjema i pasientens oppholdsperm. Ved sengeposten in<strong>for</strong>merer<br />
legen pasienten og <strong>for</strong>espør om samtykke, mens ved dagenheten er<br />
studiesykepleier ansvarlig. Pasienten beholder så in<strong>for</strong>masjonsdelen av<br />
dokumentet (5 sider), og det signerte skjemaet legges i posthyllen til<br />
studiesykepleier ved <strong>NoPSC</strong>.<br />
Leder ved <strong>NoPSC</strong> og studiesykepleier mottar oppdatert transplantasjonsventeliste fra<br />
sekretær ved IMMI hver fredag/mandag. Studiesykepleier markerer hvilke pasienter som har<br />
samtykket og distribuerer listen til de ansvarlige <strong>for</strong> prøvetaking ved levertransplantasjon.<br />
Når pasient innkalles <strong>for</strong> levertransplantasjon kontaktes leder ved <strong>NoPSC</strong> av<br />
transplantasjonskoordinator. Det kontrolleres <strong>for</strong> hvorvidt samtykke <strong>for</strong>eligger og om<br />
levereksplantatet er av interesse <strong>for</strong> prøvetaking. <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong> ønsker å samle biologisk<br />
materiale fra:<br />
<br />
<br />
<br />
Pasienter med immu<strong>no</strong>logisk leversykdom (eks. PSC, primær biliær cirrhose,<br />
autoimmun hepatitt)<br />
Pasienter der gallegangene og/eller deler av leveren kan benyttes som<br />
<strong>no</strong>rmalmateriale (eks. lokalisert cancer uten grunnsykdom)<br />
Pasienter med kjent smitte / fare <strong>for</strong> smitte tas det ikke prøver fra<br />
Ansvaret <strong>for</strong> prøvetakingen <strong>for</strong>deles så etter en rotasjonsliste, <strong>for</strong> tiden bestående av de<br />
vitenskapelige ansatte ved <strong>NoPSC</strong> med medisinsk utdanning. Ansvarlig person kontakter<br />
operasjonsstuen <strong>for</strong> tidsplanlegging slik at prøvetaking kan utføres umiddelbart etter<br />
eksplantasjon. For utdypende in<strong>for</strong>masjon om prøvetakingsprosedyren ved transplantasjon,<br />
se kapittel 10.<br />
Pasienter ved Gastroenterologisk undersøkelsesenhet (Gastrolab)<br />
Endoskopisk Retrograd Cholangio Pancreaticografi (ERCP)-undersøkelse utføres rutinemessig<br />
ved Gastrolab. Studiesykepleier ved <strong>NoPSC</strong> følger kontinuerlig med på pasientlistene <strong>for</strong> å<br />
fange opp aktuelle pasienter. Vi har anledning til å ta galle- og børstecytologiprøve fra<br />
pasienter som har samtykket, også gjentatte prøvetakinger hvis det er indikasjon. For<br />
pasienter som allerede er inkludert med prøver i <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong>, <strong>for</strong>hører studiesykepleier<br />
seg med legen som tar innkomstsamtalen om det er aktuelt med ny prøvetaking. I tillegg<br />
<strong>Prosedyrebok</strong> ved <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong>_Versjon 03.docx Org.enhet: Norsk senter <strong>for</strong> PSC, Avd. <strong>for</strong> transplantasjonsmedisin Nivå:4<br />
Dokumentversjon: 1 Utarbeidet av: Hege Dahlen Sollid Godkj. av: Tom Hemming Karlsen Dato: 18.06.13 Side 6 av 96
kontrolleres CA19-9 verdien, og ved stigning er det aktuelt med nye prøver. Se kapittel 9 <strong>for</strong><br />
utdypende prøvetakingsprosedyre.<br />
Friske personer til kontrollmaterialet<br />
Personer som har samtykket til deltakelse i Forsknings<strong>biobank</strong>en ved Immu<strong>no</strong>logisk institutt<br />
(IMMI), OUS Rikshospitalet ble i 2009/2010 <strong>for</strong>espurt om ny prøvetaking ved <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong><br />
(se vedlegg 7). Alle svar ble registrert i en database som administreres av Prof. Benedicte A.<br />
Lie ved IMMI. De som svarte positivt utgjør vårt kontrollmateriale. I løpet av 2009/2010<br />
samlet vi inn blodprøver fra litt over 100 personer. Prøvetaking ble gjen<strong>no</strong>mført jamfør<br />
kapittel 3 i <strong>Prosedyrebok</strong> <strong>for</strong> <strong>biobank</strong> ved <strong>NoPSC</strong>, v 02 (30.09.09). Deltakerne fylte også ut et<br />
spørreskjema om røykevaner. De som sto på faste medisiner, med unntak av p-piller, ble<br />
som hovedregel ikke inkludert (kommentar ble lagt inn i Medinsightdatabasen). Det vil<br />
kunne være aktuelt å kalle inn flere friske kontroller <strong>for</strong> ny blodprøve. Prøvetakingen vil da<br />
følge <strong>Prosedyrebok</strong> <strong>for</strong> <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong> v03.<br />
Materialkategorier som samles inn fra pasienter og friske kontroller<br />
PSC kohort<br />
Blodprøver (kapittel 5), urinprøver (kapittel 6) og fecesprøver (kapittel 7)<br />
Radiologiske undersøkelser (kapittel 8)<br />
Klinisk in<strong>for</strong>masjon og spørreskjemaer (vedlegg 5, vedlegg 6 og vedlegg 9 del D)<br />
PSC pasienter som ikke er del av PSC kohorten<br />
Blodprøver til DNA ekstraksjon (se kapittel 5)<br />
Pasienter som gjen<strong>no</strong>mgår levertransplantasjon (flere ulike diag<strong>no</strong>ser)<br />
Galle, lever- og gallegangsbiopsier fra eksplantert lever (kapittel 10)<br />
Pasienter som gjen<strong>no</strong>mgår ERCP-undersøkelse<br />
Børstecytologiprøve og galle (kapittel 9)<br />
Frisk kontrollpopulasjon<br />
Blodprøver (kapittel 5)<br />
Kapittel 2 – <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong>ing i andre sammenhenger<br />
IBSEN20<br />
IBSEN20 er en registreringsstudie av pasienter med kronisk inflammatoriske<br />
tarmsykdommer i sør-øst Norge (IBSEN studien), 20 år etter diag<strong>no</strong>setidspunkt.<br />
Prosjektleder: Bjørn Moum<br />
Prosjektet er en prospektiv oppfølging av pasienter med ulcerøs colitt og Crohns sykdom,<br />
som har hatt sykdommen i 20 år. Studien er en <strong>for</strong>lengelse av IBSEN-studien, som startet i<br />
1990, med <strong>for</strong>mål å kartlegge prog<strong>no</strong>se og prog<strong>no</strong>stiske markører <strong>for</strong> kompliserende<br />
sykdom, risiko <strong>for</strong> malignitet, genetisk kartlegging og mortalitet. 20 års studien omfatter<br />
oppfølging av klinisk og epidemiologisk kartlegging, radiologiske, serologiske og<br />
endoskopiske (med bioptiske) biomarkørundersøkelser med tanke på intestinal dysplasi og<br />
kreftutvikling. Det er videre et delmål i studien å kartlegge revmatologisk sykdom, annen<br />
ekstraintestinal sykdom, livskvalitet, helseøko<strong>no</strong>miske aspekter og uførhet,<br />
medikament<strong>for</strong>bruk og komorbiditet. 5- og 10-års kontrollstudiene er gjen<strong>no</strong>mført.<br />
<strong>Prosedyrebok</strong> ved <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong>_Versjon 03.docx Org.enhet: Norsk senter <strong>for</strong> PSC, Avd. <strong>for</strong> transplantasjonsmedisin Nivå:4<br />
Dokumentversjon: 1 Utarbeidet av: Hege Dahlen Sollid Godkj. av: Tom Hemming Karlsen Dato: 18.06.13 Side 7 av 96
Mottak av prøver ved <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong><br />
Ved <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong> mottas, registreres og lagres PAXgene- og BD P100 blodprøverørene fra<br />
innsamlingen. Prosedyren er som følger:<br />
<br />
<br />
<br />
<br />
Sett PAXgene rørene i -20 °C fryser (flyttes på et senere tidspunkt til -80 °C)<br />
Sentrifuger BD P100 røret på nytt ved 1600 x g i 30 min (ved romtemperatur)<br />
Fordel BD P100 plasma på Matrixrør, 250 µL pr rør<br />
I Medinsight<br />
o<br />
o<br />
o<br />
Hent opp person vha fødselsnummer<br />
I det kliniske skjemaet<br />
• Velg hoveddiag<strong>no</strong>se: Ukjent (<strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong> kjenner ikke diag<strong>no</strong>sen)<br />
• Velg prosjektdeltakelse: IBSEN 20 deltaker<br />
• I kommentarfeltet: skriv inn «IBSEN20IDnr: XX» (får dette av Jorunn<br />
Bratlie). F.eks: IBSEN20IDnr: 47 (ikke <strong>no</strong>e mer kommentar enn det!)<br />
Hent opp <strong>biobank</strong>modulen og skann inn rørene<br />
• Følg prosedyre <strong>for</strong> registrering av BD P100 rør, se kapittel 5, med<br />
følgende endringer:<br />
• Prøvetaker: Ekstern prøvetaker<br />
• I kommentarfeltet: skriv inn «IBSEN20IDnr: XX»<br />
• Skriv inn kommentar (ordrett!): «Sentrifugert på nytt hos oss»<br />
• Evt. hemolyse registreres også (svak, middels, sterk)<br />
o Prøvene fryses ved -80 °C<br />
Biobankprosjekt Tarm<br />
Prosjektleder: Knut Lundin, Gastro undersøkelseslab.<br />
«Biobankprosjekt Tarm» er et samarbeidsprosjekt mellom Seksjon <strong>for</strong><br />
<strong>for</strong>døyelsessykdommer, herunder gastro undersøkelseslab, sengepost og dagenhet, Seksjon<br />
<strong>for</strong> klinisk immu<strong>no</strong>logi og infeksjonsmedisin og Norsk senter <strong>for</strong> PSC (<strong>NoPSC</strong>), alle tilhørende<br />
Kreft, kirurgi og transplantasjonsklinikken, Oslo Universitetssykehus HF Rikshospitalet.<br />
Prosjektet tar høyde <strong>for</strong> å samle inn biologisk materiale og kliniske opplysninger fra<br />
pasienter med inflammatorisk tarmsykdom, IBD (Ulcerøs kolitt eller Mb. Crohn) og variabel<br />
immunsvikt med hypogammaglobulinemi, CVID (Common Variable Immu<strong>no</strong>deficiency). Det<br />
er også ønskelig å etablere et kontrollmateriale bestående av pasienter som henvises til<br />
gastro- og/eller koloskopiundersøkelse, men som viser seg og ikke ha makro- eller<br />
mikroskopiske <strong>for</strong>andringer i gastrointestinaltraktus.<br />
Til innhenting av biopsimateriale og kliniske opplysninger benyttes en modifisert versjon av<br />
IBSEN II protokollen (vedlegg 9, del A-D). Det registreres blant annet tidligere sykehistorie og<br />
pågående medikasjon, samt makro- og mikroskopiske funn ved endoskopi. I tillegg utføres<br />
ulike sykdoms- og symptom scores.<br />
Rutiner ved inkludering<br />
Ved Seksjon <strong>for</strong> klinisk immu<strong>no</strong>logi og infeksjonsmedisin (CVID pasienter) identifiserer<br />
stipendiat aktuelle pasienter, og pasientkoordinator in<strong>for</strong>meres via kommentar i<br />
internhenvisningsskjema. Studiesykepleier ved <strong>NoPSC</strong> kontaktes av stipendiat når aktuelle<br />
pasienter settes opp til endoskopi.<br />
<strong>Prosedyrebok</strong> ved <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong>_Versjon 03.docx Org.enhet: Norsk senter <strong>for</strong> PSC, Avd. <strong>for</strong> transplantasjonsmedisin Nivå:4<br />
Dokumentversjon: 1 Utarbeidet av: Hege Dahlen Sollid Godkj. av: Tom Hemming Karlsen Dato: 18.06.13 Side 8 av 96
Ved Gastro undersøkelseslab identifiseres aktuelle pasienter på henvisningstidspunktet.<br />
Ansvarlig lege stempler aktuelle henvisninger med stempelet «Biobankprosjekt Tarm» slik at<br />
sekretær ved Gastro undersøkelsesenhet blir oppmerksom på disse. Sekretær skriver da<br />
under merknad: «Biobankprosjekt Tarm». Studiesykepleier ved <strong>NoPSC</strong> er i jevn dialog med<br />
sekretær, men får i tillegg hver torsdag liste over neste ukes endoskopipasienter <strong>for</strong><br />
gjen<strong>no</strong>mgang.<br />
Studiesykepleier ringer aktuelle pasientene i <strong>for</strong>kant og in<strong>for</strong>merer om at de vil bli <strong>for</strong>espurt<br />
om deltakelse i studiene. Aktuelle prøvetakinger planlegges i tett dialog med<br />
<strong>biobank</strong>ansvarlig bioingeniør ved <strong>NoPSC</strong> og bioingeniør ved gastro undersøkelseslab, og<br />
settes deretter opp i ukesprogrammet. Ved oppmøtetidspunkt vil pasienten bli <strong>for</strong>elagt<br />
samtykkein<strong>for</strong>masjonen av studiesykepleier. Samtykkedokumentet som benyttes ved<br />
Biobankprosjekt Tarm heter «Forespørsel om deltakelse i <strong>for</strong>skning - Tarmsykdommer»<br />
(vedlegg 8). Det gis tid <strong>for</strong> gjen<strong>no</strong>mlesning før man <strong>for</strong>hører seg om personen ønsker å delta<br />
i studiene. Pasienter som samtykker til deltakelse i studiene gis et studienummer av<br />
studiesykepleier ved <strong>NoPSC</strong>, og det gjen<strong>no</strong>mføres et pasientintervju (se vedlegg 9 del A og<br />
D).<br />
Prøvetaking og preparering<br />
Studiesykepleier in<strong>for</strong>merer bioingeniørene slik at blod- og biopsiprøvetaking gjen<strong>no</strong>mføres.<br />
Biobankansvarlig bioingeniør ved <strong>NoPSC</strong> gjen<strong>no</strong>mfører blodprøvetaking etter gjeldende<br />
prosedyrer ved <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong> (kapittel 5). Blodprøvene tas konsekvent etter tømming av<br />
tarmen, men før endoskopi. Prøvene prepareres og registreres i Medinsight etter gjeldende<br />
prosedyrer ved <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong>. Det hukes av <strong>for</strong> deltakelse i Biobankprosjekt Tarm. Leger<br />
ved Gastro undersøkelseslab gjen<strong>no</strong>mfører undersøkelsen og ved prøvetaking av<br />
tarmbiopsiene (vedlegg 10) bistår bioingeniør ved Gastro undersøkelseslab med teknisk<br />
assistanse. Biopsiprøvene prepareres og lagres etter gjeldende rutiner ved gastro<br />
undersøkelseslab. Ved tilfeller der endoskopiundersøkelsen ikke gjen<strong>no</strong>mføres etter<br />
protokoll er det viktig at studiesykepleier in<strong>for</strong>meres. Blodprøver kastes ikke, men det legges<br />
inn kommentar i Medinsightdatabasen.<br />
Registrering av kliniske data<br />
Bioin<strong>for</strong>matiker ved <strong>NoPSC</strong> har etablert en Access database der alle kliniske data registreres<br />
manuelt. Studiesykepleier ved <strong>NoPSC</strong> er ansvarlig <strong>for</strong> denne registreringen. Det etableres<br />
også en kodenøkkel mellom bioingeniør ved gastrolab sin database og Medinsight.<br />
Kontroll av preanalytiske feilkilder<br />
Prøvetakingstidspunkt vil kunne påvirke resultatene, der<strong>for</strong> ønsker man å etablere et panel<br />
bestående av 10 personer hvor det tas 3 sett med blodprøver, hhv før og etter tømming av<br />
tarm og etter endoskopi.<br />
Kapittel 3 – Kvalitetskontroll av langtidslagret materiale ved <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong><br />
Som en del av kvalitetssikringen ved <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong> starter vi fra <strong>2013</strong> en holdbarhetsstudie<br />
<strong>for</strong> å fremtidig kunne dokumentere kvaliteten av våre langtidslagrede blodprøver. Studien vil<br />
inngå som del av spesialistgodkjenningen til <strong>biobank</strong>ansvarlig bioingeniør. Det planlegges<br />
innsamling av blodprøver fra 30 pasienter og 30 friske personer. Inkludering av pasienter vil<br />
<strong>for</strong>egå parallelt med første årlige innkalling av PSC kohorten (se kapittel 1). Kohorten av<br />
friske personer vil rekrutteres blant ansatte ved OUS.<br />
<strong>Prosedyrebok</strong> ved <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong>_Versjon 03.docx Org.enhet: Norsk senter <strong>for</strong> PSC, Avd. <strong>for</strong> transplantasjonsmedisin Nivå:4<br />
Dokumentversjon: 1 Utarbeidet av: Hege Dahlen Sollid Godkj. av: Tom Hemming Karlsen Dato: 18.06.13 Side 9 av 96
Det skal tappes samme blodprøvetakingspakke som <strong>for</strong> PSC kohort pasientene (kapittel 5),<br />
og prøvene prepareres, alikvoteres og lagres etter de samme prosedyrene. Det<br />
gjen<strong>no</strong>mføres en baselinemåling av utvalgte analytter ved prøvetakingstidspunktet ved<br />
Avdeling <strong>for</strong> medisinsk biokjemi, OUS Rikshospitalet (akkreditert laboratorium). Deretter vil<br />
de samme analyttene måles etter 3 – 9 – 18 – 30 – 54 måneder, før man deretter måler<br />
hvert tredje år. Følgende analytter måles: Natrium, Kalium, ASAT, Albumin, IgG, Total<br />
bilirubin, Kolesterol og CRP. Det samles også inn CTAD rør <strong>for</strong> senere måling av cytokiner.<br />
Siden prosjektet strekker seg over mange år, planlagt tidsramme er 25 år, vil det kunne<br />
<strong>for</strong>ekomme utskiftning av metoder og instrumenter ved analyselaboratoriet. Eventuelle<br />
utskiftninger vil der<strong>for</strong> bli dokumentert i løpet av studien slik at man kan ta høyde <strong>for</strong> dette.<br />
Et alternativ er, ved store endringer, å gjen<strong>no</strong>mføre en ny innsamling av materiale som kan<br />
analyseres parallelt med det første materialet.<br />
Analyseresultatene vil lagres i egnet database, og resultatene vil bli analysert v.h.a. ulike<br />
statistiske metoder. Målet er å dokumentere stabiliteten av prøvene, samt påvise eventuelle<br />
avvik pga langtidslagringen.<br />
For detaljert in<strong>for</strong>masjon, se eget prosjektdokument.<br />
Kapittel 4 – Registrering av kliniske og biologiske data<br />
Ved OUS Rikshospitalet benyttes Medinsightdatabasen til registering av klinisk in<strong>for</strong>masjon,<br />
samt all relevant in<strong>for</strong>masjon knyttet til de biologiske prøvene som samles inn. Medinsight<br />
er opprinnelig en klinisk database utviklet ved Institutt <strong>for</strong> medisinsk in<strong>for</strong>matikk (IMI) ved<br />
Radiumhospitalet. I 2009 ble det, i et samarbeid mellom <strong>NoPSC</strong> og IMI, utviklet en<br />
<strong>biobank</strong>/sporingsmodul til databasen. Personer som samtykker til deltakelse i studiene blir<br />
hentet inn v.h.a. personnummer, og ved inkludering i databasen gis personen et unikt<br />
løpenummer (<strong>NoPSC</strong>1, <strong>NoPSC</strong>2 osv).<br />
Ved Haukeland etableres en elektronisk sporingsløsning i løpet av <strong>2013</strong>. I mellomtiden<br />
oppbevares den kliniske in<strong>for</strong>masjonen og prøvetakingsskjemaene i låsbart skap. Det<br />
<strong>for</strong>delte biologiske materialet skannes inn i Excel og lagres <strong>for</strong> senere overføring til<br />
elektronisk system.<br />
I den kliniske delen av Medinsightdatabasen fylles følgende skjema ut:<br />
Klinisk skjema: relevant klinisk in<strong>for</strong>masjon, basert på databaseskjema (vedlegg 3).<br />
Studiesykepleier er ansvarlig <strong>for</strong> dette.<br />
ERCP skjema: detaljert in<strong>for</strong>masjon vedrørende ERCP undersøkelse fylles ut <strong>for</strong><br />
aktuelle pasienter. Prof. Lars Aabakken ved gastrolab er ansvarlig <strong>for</strong> dette.<br />
Kumulative data: Blodprøveresultater fra avd. <strong>for</strong> medisinsk biokjemi, registreres<br />
manuelt av studiesykepleier.<br />
Det biologiske materialet som samles inn prepareres etter prosedyrer beskrevet i kapittel 5,<br />
6, 7, 9 og 10. Det innsamlede materialet lagres på rør med unike 2D barkoder (Matrix), og<br />
disse skannes inn i <strong>biobank</strong>/sporingsmodulen. I denne modulen registreres deretter<br />
følgende in<strong>for</strong>masjon til hvert enkelt rør (<strong>biobank</strong>ansvarlig bioingeniør er ansvarlig):<br />
<br />
<br />
<br />
<br />
<br />
Materialkategori<br />
Prøvetakingsdato<br />
Prøvetakingstidspunkt (klokkeslett)<br />
Prepareringsdato<br />
Primærfiksering<br />
<strong>Prosedyrebok</strong> ved <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong>_Versjon 03.docx Org.enhet: Norsk senter <strong>for</strong> PSC, Avd. <strong>for</strong> transplantasjonsmedisin Nivå:4<br />
Dokumentversjon: 1 Utarbeidet av: Hege Dahlen Sollid Godkj. av: Tom Hemming Karlsen Dato: 18.06.13 Side 10 av 96
o<br />
Beskriver innholdet i røret som prøven er tatt på (f. eks: galle overføres til tomt<br />
nunc rør, mens EDTA-plasma tas på rør med K 2 EDTA)<br />
Preparering<br />
o<br />
Hvilken protokoll (SOP) prøven har blitt preparert etter (med versjonsnummer)<br />
o Ved endring i SOP oppdateres versjonsnummeret og endringen registreres vha<br />
skjemaet «Skjema <strong>for</strong> registrering av endringer i <strong>biobank</strong>prosedyren» (se<br />
vedlegg 18). Ved senere uttak kan dette tas hensyn til, hvis relevant.<br />
Navn på prøvetaker<br />
Navn på materialpreparant<br />
Volum (µL) (hvis relevant)<br />
Restvolum<br />
o<br />
Oppdateres automatisk ved uttak av prøvemateriale<br />
Antall ganger prøven har vært tint<br />
o<br />
Oppdateres automatisk ved uttak av prøvemateriale<br />
Konsentrasjon (hvis relevant)<br />
Konsentrasjonsenhet (hvis relevant)<br />
Kvalitetsparametre (hvis relevant)<br />
Er personen fastende (hvis relevant)<br />
Det registreres om det er kontrastvæske til stede i prøvemateriale tatt ved ERCP<br />
undersøkelse<br />
For prøver tatt ved levertransplantasjon registreres tiden fra uttak til prøven er tatt<br />
Detaljert posisjonsin<strong>for</strong>masjon kobles til prøvene (fryser, rack, skuff, plass,<br />
boksnummer og posisjon i boks)<br />
o<br />
Alt materiale <strong>for</strong>deles på to ulike frysere slik at kun halvparten av materialet<br />
affiseres ved fryserproblemer. Temperaturen i fryserne logges en gang pr time,<br />
og fryserne er koblet til sykehusets SD anlegg. Ved Haukeland er det kun én<br />
fryser.<br />
Eventuelle kommentarer og avvik<br />
o<br />
Avvik registreres på eget avviksskjema som oppbevares i perm (vedlegg 19), i<br />
tillegg <strong>no</strong>teres avviket i kommentarfeltet til prøvene det gjelder.<br />
Alle uttak registreres i egen logg som er synlig på denne siden (kapittel 12)<br />
<strong>Prosedyrebok</strong> ved <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong>_Versjon 03.docx Org.enhet: Norsk senter <strong>for</strong> PSC, Avd. <strong>for</strong> transplantasjonsmedisin Nivå:4<br />
Dokumentversjon: 1 Utarbeidet av: Hege Dahlen Sollid Godkj. av: Tom Hemming Karlsen Dato: 18.06.13 Side 11 av 96
Kapittel 5 – Prøvetaking av blodprøver<br />
Rutiner ved blodprøvetaking<br />
Generelle retningslinjer<br />
Alle prøvetakinger utføres så likt det lar seg gjøre, da pre-analytiske variasjoner kan påvirke<br />
nedstrøms analyser. Retningslinjene er som følger:<br />
<br />
<br />
<br />
<br />
<br />
<br />
Så få prøvetakere som mulig<br />
Så langt det lar seg gjøre ønsker man at pasienten skal være fastende<br />
Ønskelig å ikke stresse vedkommende under prøvetaking<br />
Pasienten sitter/ligger under prøvetaking<br />
Prøvetakingsrørene tas alltid i samme rekkefølge<br />
Prøvetakingsrørene vendes <strong>for</strong>siktig 6-8 ganger<br />
Alle avvik registreres på eget skjema (vedlegg 19)<br />
Som hovedregel ønsker vi å tilstrebe kun én venepunksjon pr pasient. Der det ikke lar seg<br />
gjøre tappes resten av rørene, inkludert et nytt kasteglass, ved en ny venepunksjon. Ved<br />
prøvetakinger der man også tar med glass på vegne av avd. <strong>for</strong> medisinsk biokjemi følges<br />
egen prosedyre:<br />
<br />
<br />
Prøvetakingsrørene fra avd. <strong>for</strong> medisinsk biokjemi skal ikke <strong>for</strong>styrre den<br />
standardiserte rekkefølgen av vår prøvetakingsserie, evt. rør tas der<strong>for</strong> i etterkant.<br />
Unntaket er citratrør til koagulasjonsanalyser. Dette tas før vår serie da<br />
koagulasjonsparametrene vil kunne påvirkes etter hvert som blod tappes i rørene.<br />
Det tas så et nytt kasteglass etter citratrøret før vår serie av blodprøverør tas.<br />
Følgende utstyr benyttes ved prøvetaking<br />
<br />
<br />
<br />
<br />
<br />
<br />
<br />
Staseslange<br />
Holder<br />
Vacuette sikkerhetsVPS 21G, 19cm (nål)<br />
o Dette er en steril engangskanyle med slange som letter prøvetakingen, også<br />
kalt «butterfly»<br />
o Må benyttes da den <strong>for</strong>hindrer tilbakeslag av væske fra CTAD- og PAXgenerørene<br />
o Pga slangen må det tappes 1-2 ml blod i et tomt rør (såkalt kasteglass) slik at<br />
systemet fylles med blod før første prøvetakingsrør i serien tappes<br />
Bomullsdotter<br />
Medisinsk tape<br />
Prøvetakingsrør (NB: Sjekk alltid holdbarheten på ekstrarør som står i kurven)<br />
Stativ<br />
Rekvisisjon (vedlegg 11)<br />
<br />
Navnelapper med pasientens ID<br />
<strong>Prosedyrebok</strong> ved <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong>_Versjon 03.docx Org.enhet: Norsk senter <strong>for</strong> PSC, Avd. <strong>for</strong> transplantasjonsmedisin Nivå:4<br />
Dokumentversjon: 1 Utarbeidet av: Hege Dahlen Sollid Godkj. av: Tom Hemming Karlsen Dato: 18.06.13 Side 12 av 96
Prøvetakingsrør og rekkefølge – <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong> <strong>2013</strong>-<strong>2017</strong><br />
Blodprøvetakingspakke<br />
Antall rør x ml blod<br />
1. «Kasteglass» – rør uten tilsetning 1 x 1,0 ml<br />
2. Serum<br />
(BD Vacutainer® SST II Plus Advancer)<br />
3. EDTA plasma til proteinstudier<br />
(BD Vacutainer® Plus Plastic K 2 EDTA)<br />
4. EDTA blod til DNA ekstraksjon<br />
(BD Vacutainer® Plus Plastic K 2 EDTA)<br />
5. BD P100 rør til proteinstudier 1<br />
(BD Vacutainer®)<br />
1 x 8,5 ml<br />
1 x 10 ml<br />
1 x 10 ml<br />
1 x 8,5 ml<br />
6. CTAD rør til cytokinstudier 2 (BD Vacutainer®) 2 x 4,5 ml<br />
7. «Kasteglass» – rør uten tilsetning 3 1 x 2 ml<br />
8. PAXgene TM rør til RNA ekstraksjon 4 (PreAnalytiX, Qiagen/BD) 1 x 2,5 ml<br />
Totalt blodvolum pr pasient<br />
51,5 ml<br />
1 BD P100-røret har en mekanisk separator som sørger <strong>for</strong> enkel separering av plasma. Røret er spraytørket med K 2 EDTA<br />
antikoagulant og merkebeskyttede proteinstabilisatorer. Nb! Noen av rørene har en produksjonsfeil; hvis filteret blir skjøves<br />
nedover må nytt rør tas.<br />
2 CTAD rør: lysømfintlig, må oppbevares mørkt.<br />
3 For kasteglass nr 2 (punkt 7) er det viktig å fylle røret, da man må fjerne evt. rester i prøvetakingssystemet (ventilen) fra<br />
tilsetningsvesken i CTAD røret<br />
4 PAXgene TM -røret inneholder en tilsetning som stabiliserer in vivo gentranskripsjonsprofil ved å redusere in vitro RNA<br />
degradering og minimerer/ begrenser geninduksjonen. Røret må holdes vertikalt ved oppbevaring og prøvetaking, da<br />
tilsetningen kan være helseskadelig <strong>for</strong> pasienten. Det må alltid benyttes butterfly-nål ved prøvetakingen.<br />
For PSC pasienter som ikke deltar i den prospektive kohorten tas det ikke full<br />
blodprøvepakke, men kun EDTA blod til DNA ekstraksjon. Prøvetakingen <strong>for</strong>egår da ved avd.<br />
<strong>for</strong> medisinsk biokjemi og det tas følgende:<br />
Antall rør x ml<br />
blod<br />
1. EDTA blod til DNA ekstraksjon<br />
(BD Vacutainer® Plus Plastic K 2 EDTA)<br />
4 x 6 ml<br />
Totalt blodvolum pr pasient<br />
24 ml<br />
<strong>Prosedyrebok</strong> ved <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong>_Versjon 03.docx Org.enhet: Norsk senter <strong>for</strong> PSC, Avd. <strong>for</strong> transplantasjonsmedisin Nivå:4<br />
Dokumentversjon: 1 Utarbeidet av: Hege Dahlen Sollid Godkj. av: Tom Hemming Karlsen Dato: 18.06.13 Side 13 av 96
Prepareringsprosedyrer og registrering i Medinsightdatabasen<br />
For prøvetaking gjen<strong>no</strong>mført ved OUS Rikshospitalet registreres prøvetakingen i<br />
Samtykkedatabasen på sikkert og beskyttet område på OUS-nett. Deretter registreres<br />
pasienten i Medinsightdatabasen og gis et studienummer, med mindre dette allerede er<br />
gjort i <strong>for</strong>bindelse med registrering av samtykke og kliniske data. Ved Haukeland gis<br />
pasienten et studienummer. Det printes deretter ut etiketter med studienummeret samt<br />
prøvetakingsdato. Disse klistres over pasientens ID-lapp på de rør som skal oppbevares i<br />
fryser <strong>for</strong> senere preparering (EDTA-blod til DNA ekstraksjon og PAXgene rør til RNA<br />
ekstraksjon). Deretter behandles blodprøvene etter de protokoller som beskrives her. For en<br />
helt detaljert prosedyre, se dokumentet «Detaljert prøveprepareringsprosedyre».<br />
Rekvisisjonen plasseres i perm i låsbart skap.<br />
EDTA plasma proteomikkprotokoll, v02 (BD Vacutainer® Plus Plastic K2EDTA, 10 ml rør)<br />
Endring fra v01 (06.02.12): 1: Ved sentrifugering trinn 2 (15 000 x g) innstilles sentrifugen på<br />
4 °C, og temperaturen vil gradvis synke. 2: Fordelt EDTA plasma plasseres på tørris <strong>for</strong><br />
begynnende nedkjøling før registrering og plassering i fryser.<br />
<br />
<br />
<br />
<br />
<br />
<br />
Innen 30 minutter etter prøvetaking sentrifugeres prøven i 15 minutter ved 1500 x g<br />
i en utsvingssentrifuge <strong>for</strong> å pelettere blodplater.<br />
Plasma overføres så til nødvendig antall 1,5 ml eppendorfrør. For å unngå<br />
kontaminering av plasma med intakte celler, må man være meget <strong>for</strong>siktig å ikke<br />
komme nær buffycoatlaget som er mellom de røde blodcellene og plasma. Stopp<br />
oppsamlingen av plasma ca 0,5 cm fra buffycoatlaget.<br />
Avpipettert plasma sentrifugeres umiddelbart ved 4 °C (innen 15 minutter fra første<br />
sentrifugering er ferdig) i 15 minutter ved 15 000 x g i en fastrotorsentrifuge (dette<br />
fjerner rester av cellemateriale). Pipetter deretter av 90 % av plasmaet. Man lar 10<br />
% være igjen <strong>for</strong> å være sikker på å ikke få med <strong>no</strong>e fra cellepeletten.<br />
Plasma avpipetteres og <strong>for</strong>deles på ca 15 Matrixrør, 250 µL pr rør. Matrixrørene<br />
plasseres på tørris under <strong>for</strong>delingen.<br />
Rørene skannes og registreres i Medinsightdatabasen<br />
o<br />
o<br />
o<br />
Materialkategori: Plasma<br />
Primærfiksering: EDTA<br />
Preparering: Plasma proteomikkprotokoll, v02<br />
Rørene plasseres i respektive bokser og fryses ved -80 °C, halvparten i fryser 1 og<br />
halvparten i fryser 2 (ved Haukeland er det kun én fryser)<br />
BD P100 proteomikkprotokoll, v02 (BD Vacutainer®)<br />
Endring fra v01 (15.02.12): 1. BD P100 rør plasseres i lystett eske ved ankomst <strong>biobank</strong>.<br />
Dette <strong>for</strong> å hindre evt. degradering pga lys (både sollys og lysstoffrør). 2. Fordelt BD P100<br />
plasma plasseres på tørris <strong>for</strong> begynnende nedkjøling før registrering og plassering i fryser.<br />
<br />
<br />
<br />
<br />
Plasser prøvene i en lystett eske umiddelbart etter ankomst <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong> / lab<br />
Sentrifuger i 30 minutter ved 1600 x g i en utsvingssentrifuge<br />
Plasma avpipetteres og <strong>for</strong>deles på ca 12 Matrixrør, 250 µL pr rør. Matrixrørene<br />
plasseres på tørris under <strong>for</strong>delingen.<br />
Rørene skannes og registreres i Medinsightdatabasen:<br />
<strong>Prosedyrebok</strong> ved <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong>_Versjon 03.docx Org.enhet: Norsk senter <strong>for</strong> PSC, Avd. <strong>for</strong> transplantasjonsmedisin Nivå:4<br />
Dokumentversjon: 1 Utarbeidet av: Hege Dahlen Sollid Godkj. av: Tom Hemming Karlsen Dato: 18.06.13 Side 14 av 96
o<br />
o<br />
o<br />
Materialkategori: Plasma<br />
Primærfiksering: BD P100<br />
Preparering: BD P100 proteomikkprotokoll, v02<br />
Rørene plasseres i respektive bokser og fryses ved - 80 °C innen 1-2 h etter<br />
prøvetaking (vi gjen<strong>no</strong>mfører nedfrysning så raskt som overhode mulig), halvparten i<br />
fryser 1 og halvparten i fryser 2 (ved Haukeland er det kun én fryser).<br />
Serumprotokoll, v02 (BD Vacutainer® SST II Plus Advance, 10/8,5 ml rør)<br />
Endring fra v01 (15.02.12): 1: Serumrør plasseres i lystett eske ved ankomst <strong>biobank</strong>. Dette<br />
<strong>for</strong> å hindre evt. degradering pga lys (både sollys og lysstoffrør). Kjent påvirkning på f.eks.<br />
bilirubin. 2: Fordelt serum plasseres på tørris <strong>for</strong> begynnende nedkjøling før registrering og<br />
plassering i fryser<br />
<br />
<br />
Plasser prøvene i en lystett eske umiddelbart etter ankomst <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong> / lab<br />
Koaguler prøvene i minimum 30 minutter i romtemperatur<br />
Sentrifuger i 10 minutter ved 1800 x g i utsvingssentrifuge (sentrifugeres innen 1,5<br />
time etter prøvetaking)<br />
<br />
<br />
<br />
Serum avpipetteres og <strong>for</strong>deles på ca 15 Matrixrør, 250 µL pr rør. Matrixrørene<br />
plasseres på tørris under <strong>for</strong>delingen.<br />
Rørene skannes og registreres i Medinsightdatabasen<br />
o<br />
o<br />
o<br />
Materialkategori: Serum<br />
Primærfiksering: Ingen tilsetning, SST rør<br />
Preparering: Serumprotokoll, v02<br />
Rørene plasseres i respektive bokser og fryses ved -80 °C, halvparten i fryser 1 og<br />
halvparten i fryser 2 (ved Haukeland er det kun én fryser)<br />
CTAD cytokinprotokoll, v01 (BD Vacutainer® CTAD, bufret citrat, 5/4,5 ml rør)<br />
<br />
<br />
<br />
<br />
<br />
Rørene oppbevares mørkt etter ankomst <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong> / lab<br />
Sentrifugeres i 20 min ved 2000 x g i en utsvingssentrifuge<br />
Plasma avpipetteres og <strong>for</strong>deles på ca 18 Matrixrør, 250 µL pr rør<br />
Rørene skannes og registreres i Medinsightdatabasen<br />
o<br />
o<br />
o<br />
Materialkategori: Plasma<br />
Primærfiksering: CTAD<br />
Preparering: CTAD cytokinprotokoll, v01<br />
Rørene plasseres i respektive bokser og fryses ved -80 °C, halvparten i fryser 1 og<br />
halvparten i fryser 2 (ved Haukeland er det kun én fryser)<br />
PAXgene TM rør til RNA ekstraksjon, v02 (PreAnalytiX, Qiagen/BD)<br />
<br />
<br />
Røret skal stå minst 2 timer (og maks 72 timer) i romtemperatur før nedfrysning (kan<br />
fryses med en gang, men da må rørene stå i romtemperatur 2 timer etter tining)<br />
o NB: Inkubering over natt i romtemperatur kan gi økt utbytte (dette trinnet<br />
kan også gjen<strong>no</strong>mføres ved tining til ekstraksjon)<br />
Blodprøverøret merkes med studienummer og fryses som det er i to trinn:<br />
<strong>Prosedyrebok</strong> ved <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong>_Versjon 03.docx Org.enhet: Norsk senter <strong>for</strong> PSC, Avd. <strong>for</strong> transplantasjonsmedisin Nivå:4<br />
Dokumentversjon: 1 Utarbeidet av: Hege Dahlen Sollid Godkj. av: Tom Hemming Karlsen Dato: 18.06.13 Side 15 av 96
1. 24 timer ved -20 °C (ved helg står prøvene 3 døgn før flytting)<br />
2. Deretter ved -80 °C (plasserer i boks etter prøvetakingsmåned og år)<br />
Det ekstraheres RNA fra PAXgene rørene vha prepareringsprosedyren PAXgene TM blood RNA<br />
kit, v02 (PAXgene TM blood miRNA Kit til RNA ekstraksjon, PreAnalytix, Qiagen/BD). Endring<br />
fra v01: Byttet til nyere kit fra leverandør som i tillegg ekstraherer ut mikro-RNA. Prøvene ble<br />
tidligere tint i kjøleskap over natt, nå tines de på benk i romtemperatur over natt. For<br />
detaljert prosedyre, se dokumentet «Detaljert prøveprepareringsprosedyre_Ekstraksjon av<br />
RNA vha PAXgene TM Blood miRNA Kit».<br />
Ferdig ekstrahert RNA konsentrasjonsmåles vha Na<strong>no</strong>Drop (Thermo) og kvaliteten<br />
kontrolleres vha 2100 Bioanalyzer (Agilent). Deretter alikvoteres og registreres prøven i<br />
Medinsightdatabasen:<br />
<br />
<br />
RNA alikvoteres til 4 stk Matrixrør, 15-20 µl pr rør<br />
o<br />
Det avpipetteres x µl RNA til cDNA syntese (volumet avhenger av<br />
konsentrasjonen til prøven, se under).<br />
Rørene skannes og registreres i Medinsightdatabasen<br />
o<br />
o<br />
o<br />
o<br />
o<br />
Materialkategori: RNA<br />
Primærfiksering: PAXgene blood RNA<br />
Preparering: PAXgene TM blood RNA kit, v02<br />
Konsentrasjon: XX ng/µL<br />
260/280-, 260/230- og RIN-verdiene registreres<br />
Prøvene fryses deretter ved – 80 °C<br />
cDNA syntese, v01<br />
cDNA syntetiseres vha prosedyre gitt av leverandør (gjøres ikke rutinemessig, til nå har<br />
SuperScript III First-Strand Synthesis System <strong>for</strong> RT-PCR, Invitrogen, og QuantiTect Reverse<br />
Transcription Kit, Qiagen vært benyttet).<br />
20 µl cDNA overføres til et Matrixrør, skannes og registreres i Medinsightdatabasen<br />
o<br />
o<br />
o<br />
o<br />
Materialkategori: cDNA<br />
Primærfiksering: PAXgene blood RNA<br />
Preparering: cDNA protokoll, v01<br />
Konsentrasjon: XX ng/µL<br />
Prøvene fryses deretter ved – 80 °C<br />
EDTA fullblod til IMMIs In-house metode <strong>for</strong> DNA ekstraksjon (utsaltning), v01 (BD<br />
Vacutainer® Plus Plastic K2EDTA, 10 ml rør)<br />
<br />
Blodprøverørene merkes med studienummer og fryses som de er ved - 80 °C.<br />
Plasseres i bokser etter prøvetakingsmåned og år.<br />
Det ekstraheres DNA fra rørene vha protokollen «IMMIs in-house metode <strong>for</strong> DNAekstraksjon<br />
(utsaltningsmetode), v01». For utfyllende prosedyre; se dokumentet «Detaljert<br />
prøveprepareringsprosedyre_Ekstraksjon av DNA vha IMMIs in-house metode (utsaltning)».<br />
Ferdig ekstrahert DNA konsentrasjonsmåles vha Na<strong>no</strong>Drop (Thermo), kvaliteten kontrolleres<br />
vha gel-elektro<strong>for</strong>ese, alikvoteres og registreres deretter i Medinsightdatabasen:<br />
<br />
<br />
DNA alikvoteres til 4-5 stk Matrixrør, ca 70 µl pr rør<br />
Rørene skannes og registreres i Medinsightdatabasen<br />
<strong>Prosedyrebok</strong> ved <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong>_Versjon 03.docx Org.enhet: Norsk senter <strong>for</strong> PSC, Avd. <strong>for</strong> transplantasjonsmedisin Nivå:4<br />
Dokumentversjon: 1 Utarbeidet av: Hege Dahlen Sollid Godkj. av: Tom Hemming Karlsen Dato: 18.06.13 Side 16 av 96
o Materialkategori: DNA<br />
o Primærfiksering: EDTA<br />
o Preparering: IMMIs In-house metode <strong>for</strong> DNA-ekstraksjon, v01<br />
o Konsentrasjon: xxx ng/µL<br />
o 260/280- og 260/230-verdiene registreres<br />
Prøvene fryses deretter ved – 20 °C<br />
EDTA fullblod til IMMIs In-house metode <strong>for</strong> DNA ekstraksjon (utsaltning), v01 (BD<br />
Vacutainer® Plus Plastic K2EDTA, 2 stk 4 eller 6 ml rør) tatt ved avd. <strong>for</strong> medisinsk biokjemi<br />
Det benyttes egen rekvisisjon (vedlegg 12). Prøvetaker ved avd. <strong>for</strong> medisinsk biokjemi caller<br />
på <strong>NoPSC</strong> når prøvetaking er gjen<strong>no</strong>mført, og personale ved <strong>NoPSC</strong> bringer prøvene til<br />
<strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong>.<br />
<br />
<br />
<br />
Kontroller at pasient-ID stemmer overens (rekvisisjon og blodprøverør)<br />
Registrer pasienten i Medinsight og skriv ut ID lapper<br />
Finn fram to stk 15 ml Sarstedt rør og merk disse<br />
Vend blodprøverørene 6-8 ganger, overfør deretter blodet til Sarstedtrørene, 2<br />
blodprøverør pr Sarstedtrør.<br />
<br />
<br />
<br />
Rørene plasseres i – 80 °C fryser nr 3 i hvit pappeske merket med riktig måned<br />
Rekvisisjonen plasseres i egen perm i låsbart skap.<br />
Studiesykepleier ved <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong> er ansvarlig <strong>for</strong> å registrere prøvetakingen i<br />
Samtykkedatabasen på sikkert/beskyttet område på OUS-nett.<br />
Det ekstraheres DNA fra rørene som beskrevet over.<br />
Tempus TM rør til RNA ekstraksjon, v01 (Applied Biosystems)<br />
Dette røret ble benyttet ved blodprøvetaking av friske personer til<br />
kontrollmaterialet, i tillegg til et PAXgene-rør. Ved neste prøvetakingsrunde vil<br />
Tempusrøret utgå.<br />
Røret ble merket med studienr og fryst ved -20 °C<br />
<br />
Det ekstraheres RNA fra Tempus rør vha protokoll fra Applied Biosystems som er<br />
etablert hos Immungenetikkgruppa v/ Prof. Benedicte A. Lie ved Avd. <strong>for</strong> medisinsk<br />
genetikk, OUS Ullevål.<br />
Kapittel 6 – Prøvetaking av urinprøver<br />
In<strong>for</strong>masjonsskriv og utstyr til prøvetaking vil bli sendt hjem til pasienten i <strong>for</strong>kant av<br />
besøket (vedlegg 13). Inneliggende pasienter gis det samme utstyret direkte<br />
Urinprotokoll, v02<br />
Endring fra v01 (01.01.13): Urinprøver fryses nå ved - 80 °C. Første innsamling av urin ble<br />
gjort etter protokollen til Dr. Tim Lankisch, Department of Gastroenterology Hepatology and<br />
Endocri<strong>no</strong>logy, Han<strong>no</strong>ver Medical School, Germany. Etter litteratursøk har vi kommet fram<br />
til at optimal lagringstemperatur er -80 °C.<br />
<strong>Prosedyrebok</strong> ved <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong>_Versjon 03.docx Org.enhet: Norsk senter <strong>for</strong> PSC, Avd. <strong>for</strong> transplantasjonsmedisin Nivå:4<br />
Dokumentversjon: 1 Utarbeidet av: Hege Dahlen Sollid Godkj. av: Tom Hemming Karlsen Dato: 18.06.13 Side 17 av 96
Morgenurin (hvis mulig) samles i et urinprøveglass uten tilsetning og det bringes til<br />
<strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong> / Haukeland samme dag.<br />
o<br />
Utføres prøvetakingen ved sengepost samles morgenurinen i et prøveglass<br />
og plasseres i kjøleskap av sykepleier ved posten.<br />
Prøven oppbevares i kjøleskap/på is hvis <strong>for</strong>deling ikke kan skje umiddelbart, men<br />
<strong>for</strong>deling skal skje på prøvetakingsdatoen.<br />
Prøvehåndtering og registrering:<br />
<br />
Ved mottak kontrolleres det at IDnr på rør og prøvetakingsrekvisisjon stemmer<br />
overens<br />
Urinprøven <strong>for</strong>deles på ca 16 stk 1.0 ml Matrixrør, alikvoter á 950 µL<br />
<br />
Prøvene skannes og registreres i Medinsightdatabasen:<br />
o<br />
o<br />
o<br />
Materialkategori: Urin<br />
Primærfiksering: tomt rør<br />
Preparering: Urinprotokoll, v02<br />
Fryses deretter ved – 80 °C<br />
Prøverekvisisjonen oppbevares i låsbart skap. Ved OUS Rikshospitalet registrerer<br />
<strong>biobank</strong>ansvarlig bioingeniør (evt. studiesykepleier) prøvetakingen i Samtykkedatabasen.<br />
Kapittel 7 – Prøvetaking av fecesprøver<br />
Pasientene får med prøvetakingsutstyr hjem, og etter gjen<strong>no</strong>mført prøvetaking sendes<br />
prøvene via post til <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong>/ Haukeland<br />
Fecesprotokoll (PSP® Spin Stool DNA sampling tube (Invitek) og tomt prøvetakingsrør), v01<br />
Pasienten gjen<strong>no</strong>mfører prøvetaking i hht protokoll (vedlegg 14) og fyller ut<br />
kartleggingsskjema (vedlegg 15)<br />
Prøvehåndtering og registrering:<br />
<br />
Ved mottak kontrolleres det at IDnr på rør og prøvetakingsrekvisisjon stemmer<br />
overens. Det <strong>no</strong>teres også prøvetakings- og nedfrysningsdato.<br />
Fecesprøvene fryses ved - 80 °C<br />
DNA fra fecesprøven ekstraheres vha PSP Spin Stool DNA Plus Kit (Nordic Biolabs). Ferdig<br />
ekstrahert DNA <strong>for</strong>deles på Matrixrør og skannes inn i Medinsight:<br />
DNA fra hver av fecesprøvene <strong>for</strong>deles på 4 stk Matrixrør, alikvoter á 40 µL<br />
<br />
Prøvene skannes og registres i Medinsightdatabasen:<br />
o<br />
o<br />
o<br />
Materialkategori: Bakterielt DNA<br />
Primærfiksering: PSP rør / tomt rør<br />
Preparering: Fecesprotokoll, v01<br />
Fryses deretter ved – 80 °C<br />
Prøverekvisisjonen oppbevares i låsbart skap. Ved OUS Rikshospitalet registrerer<br />
<strong>biobank</strong>ansvarlig bioingeniør (evt. studiesykepleier) prøvetakingen i Samtykkedatabasen.<br />
<strong>Prosedyrebok</strong> ved <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong>_Versjon 03.docx Org.enhet: Norsk senter <strong>for</strong> PSC, Avd. <strong>for</strong> transplantasjonsmedisin Nivå:4<br />
Dokumentversjon: 1 Utarbeidet av: Hege Dahlen Sollid Godkj. av: Tom Hemming Karlsen Dato: 18.06.13 Side 18 av 96
Kapittel 8 – Ultralyd lever og galleveier og shear wave elastografi av lever og<br />
milt<br />
Undersøkelsen gjen<strong>no</strong>mføres i <strong>for</strong>bindelse med den årlige kontrollen <strong>for</strong> PSC kohorten som<br />
sokner til Haukeland. Ultralydundersøkelse med shear wave elastografi utføres <strong>for</strong> tiden kun<br />
ved Nasjonalt Senter <strong>for</strong> Gastroenterologisk Ultraso<strong>no</strong>grafi, Haukeland Universitetssykehus.<br />
Ultralyd er viktig i oppfølgingen av pasienter med PSC med tanke på bedømming av<br />
progresjon av gallegangspatologi (strikturer og dilatasjoner), utvikling av fibrose og cirrhose,<br />
bedømming av portal hypertensjon, overvåking med tanke på maligne lesjoner i lever og<br />
polypper i galleblæren. Shear wave elastografi er en ny modalitet som måler hastigheten av<br />
ultralydbølgers passasje gjen<strong>no</strong>m vevet som et uttrykk <strong>for</strong> elastisiteten i vevet, og korrelerer<br />
med histologisk fibrosegrad.<br />
Standard ultralyd av lever, milt og galleveier<br />
Grå-skala, B-mode ultralyd: Det utføres en grundig rutineundersøkelse av lever,<br />
galleveier og porta med 3,5-5 MHz probe med tanke på å karakterisere morfologiske<br />
<strong>for</strong>andringer i lever, galleveier og porta hepatis, og særlig med tanke på å identifisere<br />
typiske funn ved PSC. Funn og målinger <strong>no</strong>teres i eget skjema.<br />
o Venstre leverlapp scannes i horisontal- og sagittalsnitt subcostalt i midtlinjen,<br />
diameteren på eventuelle utvidede galleganger måles. Leverspissen og<br />
leverkapselens regelmessighet vurderes. Parenchymet vurderes<br />
(<strong>no</strong>rmalt/grovtrabekulært) og eventuelle lesjoner måles og beskrives.<br />
o Høyre leverlapp scannes mens proben vippes nedover subcostalt langs<br />
costabuen, og deretter fra høyre flanke intercostalt i minst to intercostalrom.<br />
Eventuelle utvidede galleganger måles, ellers som <strong>for</strong> venstre leverlapp.<br />
o Leverens størrelse måles i største anteroposteriore diameter subcostalt,<br />
midtclavikulært i sagittalsnitt.<br />
o Attenuasjon måles ved gråtonemåling i to like store ROIs i ulik dybde, og ved å<br />
sammenlikne gråtone i nyre og lever ved samme dybde.<br />
o Galleblærens lengde og bredde, samt største veggtykkelse, måles. Eventuelle<br />
galleblærepolypper <strong>no</strong>teres, størrelse og antall. Gallestein eller sludge <strong>no</strong>teres.<br />
o Måle diameter av ductus choledochus og/eller ductus hepaticus communis<br />
dersom mulig. Eventuell sludge i galleganger kommenteres.<br />
o Eventuell ascites kommenteres, gjerne som små, moderate eller store mengder<br />
Dopplerundersøkelse:<br />
o Måle hastighetsprofilen i vv. hepaticae, bedømme om der er <strong>no</strong>rmal trifasisk flow<br />
eller avflatet profil.<br />
o Måle flowhastighet i v porta i porta hepatis, angi hastighet og om blodstrømmen<br />
er reversert. Mål v portas diameter samme sted.<br />
Milt: Måle miltens lengde og bredde. Bedømme parenchym og kommentere eventuelle<br />
kollateraler.<br />
Shear-wave elastografi av lever og milt<br />
Det tas 10 gyldige målinger i høyre leverlapp fra høyre flanke intercostalt. Målingene<br />
skal tas mellom 2-4 cm fra leverkapselen. Målinger < 1 cm fra leverkapselen vil kunne gi<br />
høye verdier. Unngå store kar eller galleganger. Resultatene oppgis i shear wave<br />
velocity (m/s). Notér antall mislykkede målinger. Ved mindre enn 60 % suksessrate,<br />
<strong>Prosedyrebok</strong> ved <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong>_Versjon 03.docx Org.enhet: Norsk senter <strong>for</strong> PSC, Avd. <strong>for</strong> transplantasjonsmedisin Nivå:4<br />
Dokumentversjon: 1 Utarbeidet av: Hege Dahlen Sollid Godkj. av: Tom Hemming Karlsen Dato: 18.06.13 Side 19 av 96
<strong>for</strong>kastes undersøkelsen. Målingene skal tas ved midt-respiratorisk pustestopp. Det er<br />
viktig at proben utøver minimalt trykk mot pasienten, da trykk fra proben vil gi falskt<br />
<strong>for</strong>høyede verdier.<br />
Det tas 10 gyldige målinger i venstre leverlapp, subcostalt.<br />
Det tas 10 gyldige målinger i milten ved intercostalt snitt i venstre sideflate ved<br />
midtaxillærlinjen.<br />
Kapittel 9 – Prøvetaking ved ERCP undersøkelse<br />
Rutiner ved prøvetaking<br />
Sykepleier ved ERCP-lab caller på oss når undersøkelsen starter. Ansvarlig ved <strong>NoPSC</strong> (p.t.<br />
studiesykepleier) utfører så følgende:<br />
<br />
Det kontrolleres <strong>for</strong> at samtykke <strong>for</strong>eligger<br />
Rekvisisjon fylles ut (vedlegg 16)<br />
<br />
<br />
<br />
<br />
<br />
<br />
<br />
<br />
<br />
Flytende nitrogen tappes på en termos (rom E1.U011)<br />
Isbiter fylles i en isoporeske (ismaskin står inne på fryserrommet i <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong>).<br />
Termos, isoporeske og rekvisisjon bringes til ERCP-lab (Lab 12, Radiologisk avdeling)<br />
1,0 ml Matrixrør (til børstecytologiprøven) og 1,8 ml nuncrør (til galle) oppbevares<br />
på ERCP-labben og settes fram av sykepleier<br />
Prøvene tas av endoskopør (se under)<br />
Ansvarlig person ved <strong>NoPSC</strong> varsles når prøvene er tatt og henter disse ved ERCP lab<br />
Ved mottak av prøvene sjekkes pasientens ID og det signeres på navnlappen<br />
Evt avvik <strong>no</strong>teres (f.eks. om galle har stått i romtemperatur)<br />
Prøvene bringes så til <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong> <strong>for</strong> registrering i Medinsight og lagring<br />
Prøvetaking, preparering og registrering i Medinsightdatabasen<br />
Børstecytologiprøve, v01<br />
<br />
<br />
<br />
<br />
Det tas 2 børstecytologiprøver som legges i hvert sitt rør.<br />
o<br />
o<br />
Børste nr. 1: Til avdeling <strong>for</strong> patologi (<strong>NoPSC</strong> er ikke involvert i denne<br />
prosedyren)<br />
Børste nr 2: Til <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong><br />
Børsteprøven plasseres i et tomt 1,0 ml Matrixrør og legges i termos med flytende<br />
nitrogen<br />
Prøven bringes til <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong><br />
Prøven skannes og registreres i Medinsightdatabasen:<br />
o<br />
o<br />
o<br />
Materialkategori: Børstecytologiprøve<br />
Primærfiksering: Tomt rør<br />
Preparering: Ingen, v01<br />
Fryses deretter ved -80 °C<br />
<br />
Overskudd av nitrogen lar man <strong>for</strong>dampe i termosen<br />
<strong>Prosedyrebok</strong> ved <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong>_Versjon 03.docx Org.enhet: Norsk senter <strong>for</strong> PSC, Avd. <strong>for</strong> transplantasjonsmedisin Nivå:4<br />
Dokumentversjon: 1 Utarbeidet av: Hege Dahlen Sollid Godkj. av: Tom Hemming Karlsen Dato: 18.06.13 Side 20 av 96
Galleprøve med og uten proteaseinhibitor, v02 (med) / v01 (uten)<br />
Prosedyreendring: F.o.m. (12.04.11) tilsettes proteaseinhibitor til galle <strong>for</strong> å unngå<br />
degradering av proteiner. Ved prøvetaking av galle tas et lite volum av og fryses uten<br />
proteaseinhibitor, mens restvolumet tilsettes inhibitor. Man arbeider på tørris ved<br />
alikvotering (vil stort sett finne en isoporeske med tørris i fryser nr 3). Hvis det ikke er mer<br />
tørris igjen finner man dette på et rom vis-á-vis <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong>.<br />
<br />
Hele volumet med galle overføres til et 1,8 ml nuncrør<br />
o<br />
o<br />
o<br />
Oppbevares på is<br />
Glasset med galle merkes med pasientens navnelapp, i tillegg til isoporesken<br />
og termosen med LN2<br />
Prøven bringes til <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong><br />
Hvis ca 1 ml galle: 2 x 100 µl avpipetteres til Matrixrør og registreres i Medinsightdatabasen<br />
<br />
<br />
<br />
Materialkategori: Galle<br />
Primærfiksering: Galle-ERCP<br />
Preparering: Ingen, v01<br />
Resten av volumet, ca 800 µl, overføres til nuncrør med pre<strong>for</strong>delt 10 µl proteaseinhibitor<br />
(står ferdig <strong>for</strong>delte rør i -20 fryser, nedre dør, nederste hylle, venstre skuff, merket boks). Til<br />
hvert nuncrør overføres ca 1 ml galle. Bland godt med pipette, <strong>for</strong>del så galle med<br />
proteaseinhibitor på Matrixrør, alikvoter á 100 µl.<br />
Rørene skannes og registreres i Medinsightdatabasen<br />
<br />
<br />
<br />
Materialkategori: Galle<br />
Primærfiksering: Galle-ERCP<br />
Preparering: Galle-ERCP proteaseinhibitor-protokoll, v01<br />
Hvis ca 0,5 ml galle: overfør da kun 1 x 100 µl til et Matrixrør. Det pipetters ut 5 µl<br />
proteaseinhibitor fra nuncrøret, før resten av gallevolumet overføres. Følg ellers samme<br />
prosedyre som over ved registrering i Medinsight.<br />
Lagring av galleprøver:<br />
<br />
Rørene <strong>for</strong>deles på respektive lagringsbokser merket ERCP-galle som står i<br />
«arbeidsracket» i hylle 1 i fryser nr 3. Hold lagringsboksene på tørris hele tiden<br />
Pasientprøvene splittes i A- og B-serien av bokser, halvparten av prøvene i hver<br />
boks. Spesielt viktig at de to rørene uten proteaseinhibitor havner i hver sin<br />
lagringsboks!<br />
Prøvene fryses ved -80 °C<br />
Prøverekvisisjonen settes i perm i låsbart skap i <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong>. Studiesykepleier registrerer<br />
prøvetakingen i Samtykkedatabasen.<br />
<strong>Prosedyrebok</strong> ved <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong>_Versjon 03.docx Org.enhet: Norsk senter <strong>for</strong> PSC, Avd. <strong>for</strong> transplantasjonsmedisin Nivå:4<br />
Dokumentversjon: 1 Utarbeidet av: Hege Dahlen Sollid Godkj. av: Tom Hemming Karlsen Dato: 18.06.13 Side 21 av 96
Kapittel 10 – Prøvetaking ved levertransplantasjon<br />
Utstyr til prøvetakingen<br />
To utstyrspakker er klargjort <strong>for</strong> dette <strong>for</strong>målet:<br />
Kirurgisk brikke (denne befinner seg på operasjonsstuen)<br />
<br />
<br />
<br />
<br />
<br />
Skalpell (holder) (Engangsskalpell finnes også på «rent lager» på operasjon)<br />
Sonde<br />
Saks<br />
Pinsett<br />
Peang<br />
I tillegg fås følgende på operasjonsstuen ved henvendelse til ansvarlig<br />
operasjonssykepleier:<br />
<br />
<br />
<br />
<br />
<br />
<br />
<br />
Trillebord<br />
Bordtrekk til trillebordet<br />
Underlag til å legge ekstirpert lever på<br />
Skalpellblad<br />
Hansker<br />
Ekstra stor bøtte (den største de har)<br />
Steril pose<br />
Is (ismaskin på rom tvers oven<strong>for</strong> operasjonssal 4)<br />
<br />
Sort kar til å ha lever i under prøvetakning<br />
Kurv med rør og reagenser (Alt står klart i egen kurv og skal inneholde følgende):<br />
<br />
<br />
<br />
34 stk Matrix 2D-barkodede rør (<strong>for</strong>håndsmerket med nummer)<br />
25 stk <strong>for</strong> frysing av biopsier (nr 1-25) (0,5 ml rør)<br />
4 stk <strong>for</strong> <strong>for</strong>malinfiksering av biopsier (nr 26-29) (1,0 ml rør)<br />
o 750 µL 4 % bufret Formalin pr rør<br />
5 stk <strong>for</strong> evt. prøvetaking av lymfeknuter/tumor (nr 30-34)<br />
<br />
<br />
<br />
<br />
o 4 stk 0,5 ml rør<br />
o 1 stk 1,0 ml rør med 750 µL 4 % bufret <strong>for</strong>malin<br />
3 nuncrør (til galle uten proteaseinhibitor)<br />
Pakke med engangspipetter (plast) <strong>for</strong> samling av galle fra galleblæren<br />
2 stk Sylinderbiopsi-nål (T Lok Bone Marrow Biopsy Needle, Angiotech Denmark<br />
A/S), diameter 1,8mm. NB! Biopsienes størrelse vil variere i lengden<br />
2 stk termoser til flytende nitrogen<br />
Skjema <strong>for</strong> registrering av prøvetaking og prøveidentifisering (vedlegg 17)<br />
<br />
<br />
<br />
Utskrift av prosedyren<br />
Ny, ren penn<br />
Klokke<br />
<strong>Prosedyrebok</strong> ved <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong>_Versjon 03.docx Org.enhet: Norsk senter <strong>for</strong> PSC, Avd. <strong>for</strong> transplantasjonsmedisin Nivå:4<br />
Dokumentversjon: 1 Utarbeidet av: Hege Dahlen Sollid Godkj. av: Tom Hemming Karlsen Dato: 18.06.13 Side 22 av 96
NB! Prøvetakings- og prøveidentifiseringsskjema vil kunne bli kontaminert underveis i<br />
prosedyren. Side 1 bør holdes i plastlomme. Side 2 og 3 (beskrivelse av innhold i rør) kastes<br />
når alt er registrert i Medinsightdatabasen.<br />
Følgende står IKKE i kurven og må hentes før man går på operasjonsstua:<br />
<br />
<br />
<br />
<br />
<br />
Tørris overføres til egen isoporeske.<br />
2-metylbutan (isopentan, Merck) står i -80 fryser, ca 50 ml pr glass. Denne settes på<br />
tørris.<br />
En isoporeske fylles med is, isoporesken merkes «galle».<br />
Nuncrør med tilsatt 10 µL proteaseinhibitor står i -20 fryser. Ta med 3 stk rør,<br />
plasseres på is.<br />
Flytende nitrogen tappes på 2 nitrogen-termoser.<br />
o<br />
Den ene termosen settes i kurven, den andre lar man stå i <strong>biobank</strong>en<br />
(trenger denne ved registrering av prøvene)<br />
Prøvetakingsprosedyre<br />
Generelle rutiner ved prøvetaking til <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong> ved levertransplantasjon<br />
Preparering <strong>for</strong>egår enten på innledningsrom eller skyllerommet uten<strong>for</strong><br />
operasjonssalen.<br />
<br />
<br />
<br />
Den uttatte lever håndteres umiddelbart <strong>for</strong> fiksering av vevsprøvene. All<br />
prøvetaking skal utføres på en slik måte at ingen løse vevsbiter oppstår.<br />
Hvis tilstedeværelse av kreftvev så benyttes egen sylinderbiopsinål til dette vevet.<br />
Det vil være fare <strong>for</strong> kontaminering hvis samme biopsinål benyttes til både kreft- og<br />
<strong>no</strong>rmalvev<br />
Vev som skal prepareres med 2-metylbutan (NB: Ekstremt brannfarlig. Unngå<br />
innånding. Må ikke helles i vask):<br />
o Biopsien dyppes 2-3 sekunder i iskald 2-metylbutan vha en pinsett<br />
o Overfør prøven til 0,5 ml Matrixrør<br />
o Skru korken godt igjen og slipp røret i nitrogentermosen<br />
<br />
<br />
Vev som skal prepareres med <strong>for</strong>malin:<br />
o Vevet plasseres i rør med <strong>for</strong>malin (1,0 ml Matrixrør)<br />
o Oppbevares ved romtemperatur<br />
Galle oppbevares på is<br />
Prosedyre<br />
1. Start klokken i det leveren tas ut! Tiden fra leveren er ute til de respektive prøvene<br />
er på plass i Matrixrørene <strong>no</strong>teres på prøvetakingsskjemaet<br />
2. Det tas umiddelbart 4 stk. sylinderbiopsier fra overflaten av hver leverlapp <strong>for</strong><br />
preparering med 2-metylbutan.<br />
3. Det tas 4 stk. sylinderbiopsier (40 mm, 1.8 mm) fra dypet/hilusnære områder av<br />
hver leverlapp (2-metylbutan).<br />
4. Galleblæren identifiseres og det lages et lite hull <strong>for</strong> pipettering av galle. Det samles<br />
opptil 3 x 1 ml med galle fra galleblæren i NUNC-rør med proteaseinhibitor,<br />
<strong>Prosedyrebok</strong> ved <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong>_Versjon 03.docx Org.enhet: Norsk senter <strong>for</strong> PSC, Avd. <strong>for</strong> transplantasjonsmedisin Nivå:4<br />
Dokumentversjon: 1 Utarbeidet av: Hege Dahlen Sollid Godkj. av: Tom Hemming Karlsen Dato: 18.06.13 Side 23 av 96
tilsvarende tas 3 x 1 ml uten proteaseinhibitor. Man benytter sterile plastpipetter og<br />
overfører gallen til Nuncrør som plasseres på is. Husk å vende røret 5 -10 ganger slik<br />
at proteaseinhibitor blir jevnt <strong>for</strong>delt!<br />
5. Det tas 2 langsgående skjærebiopsier fra galleblæren (2-metylbutan).<br />
6. Det tas totalt 4 stk. sylinder-biopsier (40 mm, 1.8 mm) fra hver leverlapp som<br />
prepareres med <strong>for</strong>malin (2 fra overflaten, 2 fra dypet/hilusnært).<br />
7. Avslutning:<br />
7.1. Hvis prosedyre <strong>for</strong> isolering av cholangiocytter skal gjen<strong>no</strong>mføres legges<br />
leveren i steril pose og plasseres i bøtten oppå et islag. Etterpå fylles det godt<br />
rundt og oppå med is. Bøtten må merkes med pasient-ID-klistrelapp. Husk å få<br />
med histologiremisse, jfr. under, samt flere klistrelapper.<br />
7.2. Hvis «gammel» prosedyre legges <strong>no</strong>en skivesnitt i leveren (ca 1,5 cm<br />
mellomrom) og leveres i bøtte til operasjonssykepleier (<strong>for</strong>malin etc. og<br />
levering på patologen vil ordnes av personalet på operasjon)<br />
7.3. Man kaster så skarpt utstyr (biopsi nål, mandreng etc.) i gul boks.<br />
Flasken med brukt 2-metylbutan settes til avdampning i avtrekkskap. Hell ut overskuddet av<br />
2-metylbutan i brun avfallsflaske og sett den lille til avdampning.<br />
Etterarbeid hvis det skal gjen<strong>no</strong>mføres isolering av cholangiocytter (kapittel 11)<br />
Bøtten bringes til patologen og settes på gulvet innerst på kjølerommet (rom nr. A2.M034).<br />
Adgangskort til patologen finnes i låsbart skap. Det må medbringes ferdig utfylt<br />
histologiremisse som er signert av eller på vegne av kirurgen. Avtal med kirurg hva som skal<br />
stå på remissen før du <strong>for</strong>later operasjonssal. Denne legges oppå bøtten sammen med 2<br />
ekstra klistrelapper (plastlomme).<br />
Ansvarlig person ved <strong>NoPSC</strong> må få beskjed om at levertransplantat er levert patologen.<br />
Ansvarlig person skal tidlig neste arbeidsdagen kontakte patologiassistentene <strong>for</strong> å gi<br />
beskjed. Det må da avtales hvem de skal kontakte når preparat til vårt bruk er klart til<br />
avhenting.<br />
Registreringsprosedyre i Medinsight og etterarbeid<br />
Prøvene registreres så i Medinsightdatabasen. Vær nøye med rutinene i <strong>biobank</strong>en, unngå å<br />
kontaminere pipetter, tastatur, pc-mus etc. Husk å vaske alle overflater med 70 %<br />
desinfeksjonssprit ved endt prosedyre. Beskriv biopsiene så godt det lar seg gjøre, tenk over<br />
hvilken in<strong>for</strong>masjon som er nyttig på et senere tidspunkt. Praktisk tips <strong>for</strong> vevsbiopsiene:<br />
Benytt to termoser med nitrogen. For å holde oversikten over hvilke rør som er skannet<br />
(viktig å arbeide raskt slik at prøvene ikke tiner), slippes skannede rør ned i den andre<br />
termosen.<br />
Vevsbiopsier tatt på 2-metylbutan, v01<br />
<br />
<br />
<br />
<br />
<br />
Materialkategori: Eksplantat biopsi<br />
Primærfiksering: Snap freeze (2-metylbutan)<br />
Preparering: Ingen, v01<br />
Beskriv biopsien i kommentarfeltet, husk også å skrive inn når biopsien er tatt (tiden<br />
fra lever ble tatt ut til prøven ble tatt)<br />
Lagres i gassfasen av flytende nitrogen<br />
<strong>Prosedyrebok</strong> ved <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong>_Versjon 03.docx Org.enhet: Norsk senter <strong>for</strong> PSC, Avd. <strong>for</strong> transplantasjonsmedisin Nivå:4<br />
Dokumentversjon: 1 Utarbeidet av: Hege Dahlen Sollid Godkj. av: Tom Hemming Karlsen Dato: 18.06.13 Side 24 av 96
o<br />
Se oversikt på utsiden av nitrogentanken <strong>for</strong> å finne ut hvor det er ledig<br />
plass til prøvene. Alle prøver skal stå i gassfasen, følg der<strong>for</strong> anvisningene på<br />
tanken <strong>for</strong> plassering av prøver. Biobankansvarlig har ansvaret <strong>for</strong> å plassere<br />
nye bokser her, men husk å gi beskjed når ny boks startes. Overskudd av<br />
nitrogen lar man bare være i termosen og denne settes til <strong>for</strong>dampning i<br />
avtrekkskap.<br />
Galle fra levertransplantasjon med og uten proteaseinhibitor, v01<br />
Hent en isoporeske og fyll denne med is. Sett så Matrixboksen med Matrixrør på is. Galle<br />
<strong>for</strong>deles på 0,5 ml Matrixrør, alikvoter á 250 µL.<br />
<br />
<br />
Galleprøver uten proteaseinhibitor:<br />
o Materialkategori: Galle<br />
o Primærfiksering: Galle-lever-tx uten proteaseinhibitor, v01<br />
o Preparering: Ingen, v01<br />
Galleprøver med proteaseinhibitor:<br />
o Materialkategori: Galle<br />
o Primærfiksering: Galle-lever-tx med proteaseinhibitor<br />
o Preparering: Galle-lever-tx proteaseinhibitor-protokoll, v01<br />
Prøvene fryses ved -80 °C<br />
Prøverekvisisjonen (side 1 i plastlomme) settes i gul perm som står i låsbart skap i<br />
<strong>biobank</strong>en. Biobankansvarlig registrerer prøvetakingen i Samtykkedatabasen. Alle involverte<br />
får mail om at prøver fra levertransplantasjon er tatt. Det opplyses også om det er aktuelt<br />
med celleisolering (ny prosedyre) eller ikke (gammel prosedyre).<br />
Vevsbiopsier tatt på <strong>for</strong>malin, v01<br />
<br />
<br />
<br />
<br />
Materialkategori: Eksplantat biopsi<br />
Primærfiksering: Formalin<br />
Preparering: Ingen, v01<br />
Beskriv biopsien i kommentarfeltet, husk også å skrive inn hvor lang tid etter leveren<br />
var ute prøven ble tatt<br />
Prøvene tatt på <strong>for</strong>malin oppbevares i egen Matrixboks som holdes ved romtemperatur i<br />
avtrekkskap. Matrixrørene er merket med Medinsight ID nummer og barkodenummer<br />
(skrives på med tusj). Etter minimum 24 timer og innen 1 uke etter prøvetaking bringes de til<br />
avdeling <strong>for</strong> patologi <strong>for</strong> fremføring, og barkodenummeret skrives over på den lille<br />
parafinkassetten. Obs: benytter kun spesialtusj fra patologen. Dagen etter gjen<strong>no</strong>mføres<br />
innstøping i parafin av <strong>biobank</strong>ansvarlig bioingeniør. Når prøven kommer tilbake fra avd. <strong>for</strong><br />
patologi registreres følgende i Medinsightdatabasen:<br />
<br />
<br />
<br />
<br />
Prøven søkes opp vha barkoden<br />
Huk av <strong>for</strong> «ja» i cellen «Parafinblokk»<br />
Fyll inn dato i feltet «Parafin innstøpingsdato»<br />
Prøven lagres så i eget skap inne på fryserommet (rommet holder ca. 21 °C).<br />
Rydding: Sett kurv og resten av utstyret inn i avtrekkskapet. Isoporesker med blodsøl kastes i<br />
«Spesialavfallsbeholder». I etterkant av gjen<strong>no</strong>mført prosedyre klargjøres tx-kitet etter<br />
følgende prosedyre: «Klargjøring av tx-kit etter endt prosedyre». Ansvaret ligger hos<br />
<strong>biobank</strong>ansvarlig bioingeniør ved <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong>.<br />
<strong>Prosedyrebok</strong> ved <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong>_Versjon 03.docx Org.enhet: Norsk senter <strong>for</strong> PSC, Avd. <strong>for</strong> transplantasjonsmedisin Nivå:4<br />
Dokumentversjon: 1 Utarbeidet av: Hege Dahlen Sollid Godkj. av: Tom Hemming Karlsen Dato: 18.06.13 Side 25 av 96
Kapittel 11 – Isolation of human Biliary Epithelial Cells (Cholangiocytes)<br />
Under levertransplantasjon vil det kunne tas en ekstra prøve til isolering av cholangiocytter<br />
(se kapittel 10), såkalt «ny prosedyre». Leverprøven tas av patologer ved avdeling <strong>for</strong><br />
patologi i etterkant av at preparatet har ankommet avdelingen.<br />
Protocol with credit from: Prof. Mario Strazzabosco, Department of Internal Medicine,<br />
Section of Digestive Diseases, Yale University, USA.<br />
Protocol<br />
1) In a large culture dish, finely dice 30 gram of liver tissue into 3-4 mm pieces with sterile<br />
scalpel or scissors<br />
a) Add some PBS if the tissue fastens/sticks on the dish<br />
2) Put into a beaker* with 50 ml PBS (+ CaCl2 6,5 ul and MgCl2 52,5 ul) or HBSS<br />
a) *or culture dish<br />
3) Add 5 ml of Collagenase IA (10mg/ml) to give a final concentration of 1 mg/ml<br />
4) Place at 37 °C <strong>for</strong> 90 min (in meanwhile prepare Percoll and the Plating medium, see<br />
step 13 and 31)<br />
a) Check after 45 min. For <strong>no</strong>n-fibrotic tissue, the time might be shortened. If very<br />
fibrotic, you need up to 90 min<br />
5) Sieve through a tea strainer, keeping the filtrate and re-dice the liver into very fine<br />
pieces<br />
a) Use a new cell culture dish <strong>for</strong> this filtrate<br />
6) Place back (leftovers) into the filtrate and place at 37 °C <strong>for</strong> a<strong>no</strong>ther 30-60 min<br />
(depending on texture of tissue)<br />
a) Important: be sure to scrape everything of the strainer, and add this to the solution.<br />
7) Sieve the liver back through a tea strainer saving the filtrate<br />
8) Wash the liver/strainer with PBS (without additives) until the filtrate is fairly clear or<br />
until you have a volume of approximately 200 ml, work at room temperature<br />
a) Whatever is <strong>no</strong>t solved at this time, one scrapes off and discard to a waste<br />
container.<br />
b) Put all the tea strainer equipment in a large beaker with Virkon. Leave <strong>for</strong> at least 30<br />
min, be<strong>for</strong>e washing it thoroughly. The equipment needs to be washed in the<br />
washing machine and autoclaved.<br />
9) Dispense filtrate into 8 sterile 50 ml tubes (fill to 25 ml) and spin 2000 rpm <strong>for</strong> 10 min<br />
10) Decant* the supernatants to waste and resuspend the pellets in 4 sterile 50 ml tubes in<br />
PBS (fill to 25 ml)<br />
a) * Use a pipetteboy.<br />
<strong>Prosedyrebok</strong> ved <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong>_Versjon 03.docx Org.enhet: Norsk senter <strong>for</strong> PSC, Avd. <strong>for</strong> transplantasjonsmedisin Nivå:4<br />
Dokumentversjon: 1 Utarbeidet av: Hege Dahlen Sollid Godkj. av: Tom Hemming Karlsen Dato: 18.06.13 Side 26 av 96
) The pellets are brown-red, often with a gray top layer. Try <strong>no</strong>t to disturb the pellet,<br />
but if some of the gray layer is disturbed/pipette up this is ok.<br />
c) Add two and two pellets together in 4 new 50 ml tubes<br />
11) Spin 2000 rpm <strong>for</strong> 10 min<br />
12) Decant* the supernatants to waste and resuspend the pellets in 1 sterile 50 ml tube in<br />
PBS (fill to 24 ml)<br />
a) * Use a pipetteboy<br />
b) Tip: add approx 1 ml to the first tube, resuspend and then transfer that volume to<br />
the next tube. Continue until the volumes from the 4 tubes are collected together,<br />
and then transfer to a new 50 ml tube. Add up to 24 ml with PBS. If extra PBS is<br />
added one can use the extra volume to clean out the 4 tubes.<br />
c) Nb: total volume <strong>no</strong>t more than 24 ml!<br />
13) Prepare Percoll gradients in 14 ml tubes (Falcon, cat <strong>no</strong>: 352057) (3.5 ml Percoll 33 % +<br />
3.5 ml Percoll 77 %) (n =8). Percoll and PBS must be cold, please see next page <strong>for</strong><br />
recipe. First pipette 33 % and then 77 % under the 33 %. Be careful <strong>no</strong>t to mix them.<br />
14) Gently pipette 3 ml of suspension onto the top of each Percoll gradient<br />
a) Use a pipet boy and 5 ml stripette, add the volume to the walls of the tube just<br />
above the percoll gradient<br />
b) Tip: Make sure the pipette boy is turned to minimum dispensing (slow speed)!<br />
15) Spin 2000 rpm <strong>for</strong> 30 min (at 4 °C)<br />
16) Take off the top layer of “grud” to waste (usually brown foamy cloudy layer)<br />
a) Use a plastic Pasteur pipette to remove the “grud”, and then a manual pipette with<br />
a long 1000 µL ART tip to transfer the differential band<br />
17) Pipette off the differential band of cells into 8 sterile 14 ml tubes (take the next layer,<br />
the majority of cholangiocytes are close to the third layer, so try to “clean” the border<br />
with next layer. Usually it should be around 2 ml of Percoll that can be collected). Keep<br />
the bottom phase of Percoll and combine it with PBS from step 29<br />
a) Use a manual pipette (long 1000 µl ART tip), 2-3 times per tube<br />
18) Make up to 10 ml with PBS (mix well)<br />
a) PBS at RT<br />
b) Use pipette boy or pour directly from the flask<br />
19) Spin 2000 rpm <strong>for</strong> 10 min (at 4 °C)<br />
a) Remove the supernatant using a pipette boy and then with a manual pipette (can<br />
remove almost everything)<br />
<strong>Prosedyrebok</strong> ved <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong>_Versjon 03.docx Org.enhet: Norsk senter <strong>for</strong> PSC, Avd. <strong>for</strong> transplantasjonsmedisin Nivå:4<br />
Dokumentversjon: 1 Utarbeidet av: Hege Dahlen Sollid Godkj. av: Tom Hemming Karlsen Dato: 18.06.13 Side 27 av 96
20) Resuspend pellets in a drop of PBS then collect into one tube, make up to 10 ml with PBS<br />
(RT)<br />
a) Important to just add a drop (
32) Leave to settle <strong>for</strong> 2 days<br />
a) If colonies are settled unevenly, trypsinase and split to new flasks.<br />
33) Re-feed as required<br />
a) Freeze when confluent<br />
i) 70 % filtered DMEM, 20 % filtered FBS and 10 % filtered DMSO<br />
ii) Freeze gradually and store in liquid nitrogen<br />
34) Supernatant from step 29: spin 2000 rpm <strong>for</strong> 10 min, resuspend in 7 ml DME + 10 %FBS<br />
+antibiotic/antimycotic solution and seed into 25 cm 2 plate. Next day (can stand over<br />
the weekend) change the medium. There should be attached cells – fibroblasts.<br />
a) Mix 90 ml of DME with 10 ml FBS and 1 ml antiobiotic/antimycotic (100X)<br />
b) Freeze when confluent<br />
i) 70 % filtered DMEM, 20 % filtered FBS and 10 % filtered DMSO<br />
ii) Freeze gradually and store in liquid nitrogen<br />
Cholangiocyte passage<br />
Remove medium and add 4ml of PBS (Ca 2+ , Mg 2+ free)<br />
Everything must be 37 °C<br />
<br />
<br />
<br />
<br />
Remove PBS and add 0.5ml of Trypsin<br />
Incubate (maximum) 3 – 4 min at 37 °C, check detachment of cells every minute or so<br />
Resuspend cells with 10 ml Plating medium and centrifuge 10 min at 800xg<br />
Resuspend pellet in 7 ml of Plating medium<br />
Change plating with Plating medium after 24/48h<br />
Reagent preparation<br />
Percoll gradient protocol (All reagents must be refrigerated)<br />
Stock Percoll:<br />
<br />
<br />
<br />
135 ml neat Percoll<br />
15 ml 10x PBS<br />
Use a pipette boy and mix in a small beaker<br />
77 % Percoll:<br />
<br />
<br />
77 ml stock Percoll<br />
23 ml 1x cold PBS<br />
33 % Percoll:<br />
<br />
<br />
33 ml stock Percoll<br />
67 ml 1x cold PBS<br />
<strong>Prosedyrebok</strong> ved <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong>_Versjon 03.docx Org.enhet: Norsk senter <strong>for</strong> PSC, Avd. <strong>for</strong> transplantasjonsmedisin Nivå:4<br />
Dokumentversjon: 1 Utarbeidet av: Hege Dahlen Sollid Godkj. av: Tom Hemming Karlsen Dato: 18.06.13 Side 29 av 96
Prepare Percoll gradients in 14 ml tubes (Falcon, cat <strong>no</strong>: 352057):<br />
n = 8 tubes<br />
Percoll and PBS must be cold<br />
3.5 ml Percoll 33 % + 3.5 ml Percoll 77 %<br />
First pipette 33 % and then 77 % under the 33 % layer<br />
o When pipetting the 77 % layer make sure to pipette very slow! Make sure<br />
the stripette is at the very bottom of the tube, and when the volume is<br />
added remove the stripette very slowly.<br />
Be careful <strong>no</strong>t to mix them.<br />
Leave cold until time to use.<br />
HBSS- Hank´s Balanced Salt Solution (Invitrogen 14025-092, 500 ml)<br />
Cholera toxin (C8052 Sigma)<br />
Stock 1: dissolve 1mg in 1ml of H2O, store at 4 °C<br />
Stock 2: dissolve 5ul of Stock solution 1 in 1 ml of H2O<br />
Add 200ul of Stock 2 to 100ml Medium<br />
Insulin (I6634 Sigma)<br />
Sol. 1: dilute 100ul of HCl 0.01N in 120ml of H2O<br />
Dissolve 20mg of Insulin in 10ml of sol. 1, store at 4 °C<br />
Hydrocortisone (H2270 Sigma)<br />
Dissolve 10mg of Hydrocortisone in 1 ml of etilic alchool, then add 19ml of medium; store at<br />
–20 °C<br />
EGF (E4127 Sigma)<br />
BSA solution: dissolve 10mg BSA in 10ml of saline solution<br />
Dissolve 100ul EGF (1 vial) in 2ml BSA solution; store at –20 °C<br />
HGF (H966 Sigma)<br />
Dissolve 1 vial (5 ug) in 500 ul PBS (0.1 % BSA)<br />
Triiodotironina (T6397 Sigma)<br />
Dilute 1 vial in 1ml di NaOH 1N; add 49ml of medium; store at –20 °C<br />
<strong>Prosedyrebok</strong> ved <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong>_Versjon 03.docx Org.enhet: Norsk senter <strong>for</strong> PSC, Avd. <strong>for</strong> transplantasjonsmedisin Nivå:4<br />
Dokumentversjon: 1 Utarbeidet av: Hege Dahlen Sollid Godkj. av: Tom Hemming Karlsen Dato: 18.06.13 Side 30 av 96
Plating medium (100ml):<br />
45 ml Ham’s F12 (cooler room or cell lab)<br />
45 ml DMEM (art.<strong>no</strong>: 31885-013, 1 g/L gluc) (cooler room or cell lab)<br />
10 ml FBS (fridge, cell lab, or the freezer, PCR room, Alexey box)<br />
250 µl stock Insulin (old fridge, lab, with the Percoll)<br />
10 µl EGF (freezer, PCR room, Alexey box)<br />
200 µl Cholera toxin (old fridge, lab, with the Percoll)<br />
67 µl Triiodothironin (freezer, PCR room, Alexey box)<br />
80 µl Hydrocortisone (freezer, PCR room, Alexey box)<br />
1 ml Antibiotic/antimycotic solution (fridge, cell lab)<br />
10 µl hHGF (H966 Sigma)<br />
Use a 150 ml 0.22 µm filter. Take a 50 ml tube and add 45 ml F12. Add all the “small<br />
volumes”, mix well. Then, add 45 ml of DMEM, 10 ml of FBS and the F12 mix to the filter.<br />
Add suction and filter through.<br />
Kapittel 12 – Uttak av biologisk- og klinisk materiale fra <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong><br />
<strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong> er en fellesressurs <strong>for</strong> alle prosjekter som støttes av <strong>NoPSC</strong> og andre<br />
relevante prosjekter knyttet til <strong>NoPSC</strong> målsettinger. Forespørsel om uthentig av materiale<br />
skjer via søknadsskjema (vedlegg 20) som sendes til ledergruppen ved <strong>NoPSC</strong>. Ledergruppen<br />
vurderer kvaliteten på prosjektet samt nytteverdien med hensyn til PSC <strong>for</strong>skningen<br />
generelt. Biobanken er en generell <strong>for</strong>sknings<strong>biobank</strong> basert på bredt, frivillig samtykke og<br />
alle nye prosjekter må der<strong>for</strong> i tillegg søke tillatelse fra Regional Etisk Komité (REK) før<br />
oppstart, og godkjent REK nummer må oppgis ved alle uttak og registreres sammen med<br />
uttaket i Medinsight. Ved positivt svar sendes skjemaet til <strong>biobank</strong>ansvarlig bioingeniør <strong>for</strong><br />
planlegging og gjen<strong>no</strong>mføring av uttaket, samt til administrativt ansvarlig <strong>for</strong> kontroll av<br />
MTA/ andre juridiske avtaler (se kapittel 13).<br />
Uttak kan gjen<strong>no</strong>mføres ved at man har en <strong>for</strong>håndsutvalgt liste over aktuelle prøver /<br />
alikvoter (lagret på 2D barkodemerkede Matrixrør) fra en gruppe pasienter eller kontroller,<br />
eller man kan gjen<strong>no</strong>mføre søk og filtreringer basert på utvalgte kriterier blant alle<br />
registrerte parametre i Medinsightdatabasen. Man kan også be om et tilfeldig utvalgt<br />
innen<strong>for</strong> en materialkategori. Man kan gjøre et fullstendig uttak av enkeltrør, eller et<br />
deluttak (<strong>for</strong> eksempel 100 µl serum fra 200 ulike pasientprøver). Uavhengig av<br />
fremgangsmåte ender man opp med en liste med barkoder som identifiserer de utvalgte<br />
prøvene.<br />
Ved uttak kontrolleres det <strong>for</strong> at man har plukket de bestilte rørene ved at 2D barkodene<br />
skannes inn og sammenlignes med bestillingslisten. Ved korrekt gjen<strong>no</strong>mført uttak<br />
oppdateres posisjonsin<strong>for</strong>masjonen (fra detaljert in<strong>for</strong>masjon om plassering i fryser til at<br />
røret er «ute»). Ingen rør med tilhørende in<strong>for</strong>masjon slettes fra databasen, men det legges<br />
til in<strong>for</strong>masjon om hvilket prosjekt det er uthentet til. Ved deluttak oppdateres volumet<br />
automatisk og det registreres av prøven er tint 1 gang. Ved deluttak posisjoneres rørene<br />
med restvolumet på nytt i sporingsløsningen. For detaljert prosedyre <strong>for</strong> uttak i Medinsight,<br />
se dokumentet «Uttak av materiale fra <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong>».<br />
<strong>Prosedyrebok</strong> ved <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong>_Versjon 03.docx Org.enhet: Norsk senter <strong>for</strong> PSC, Avd. <strong>for</strong> transplantasjonsmedisin Nivå:4<br />
Dokumentversjon: 1 Utarbeidet av: Hege Dahlen Sollid Godkj. av: Tom Hemming Karlsen Dato: 18.06.13 Side 31 av 96
Kapittel 13 – Forsendelse og mottak av biologisk- og klinisk materiale<br />
I de fleste <strong>for</strong>skningsprosjekter er det behov <strong>for</strong> samarbeid med ulike institusjoner og<br />
industrielle samarbeidspartnere, både nasjonale og internasjonale. Ved <strong>for</strong>sendelse av<br />
materialet til samarbeidspartnere sendes kun avidentifiserte opplysninger og prøver tildelt<br />
kodenummer som kun kan spores tilbake til pasienten av prosjektlederen ved <strong>NoPSC</strong>. Ved<br />
mottak og <strong>for</strong>sendelse av både biologisk- og klinisk materiale signeres juridisk bindende<br />
avtaler av begge parter i henhold til enhver tid gjeldende internt regelverk ved OUS.<br />
Hovedhensikten er å sikre at materialet benyttes utelukkende til avtalt prosjekt og dermed i<br />
tråd med avgitt pasientsamtykke. Materialet skal aldri videre<strong>for</strong>midles til tredjepart uten at<br />
det inngås ny avtale. P.t. gjelder følgende:<br />
<br />
Ved <strong>for</strong>sendelse av biologisk materiale til samarbeidspartner benyttes en Agreement<br />
on Human biological Material Transfer (MTA, vedlegg 21). Se også hjemmesiden til<br />
Avdeling <strong>for</strong> <strong>for</strong>skningsadministrasjon og <strong>biobank</strong> ved OUS.<br />
Ved <strong>for</strong>sendelse av datamateriale til samarbeidspartner signeres en<br />
samarbeidsavtale, såkalt Collaborating Agreement. Denne begrenser hva mottaker<br />
kan gjøre med datamaterialet.<br />
<br />
<br />
<br />
Ved avtale om f.eks. lagring av data skal en databehandleravtale (Data Transfer<br />
Agreement, DTA) signeres. Se hjemmesiden til Kompetansesenter <strong>for</strong> personvern og<br />
in<strong>for</strong>masjonssikkerhet ved OUS.<br />
Ved mottak av materiale eller data fra andre institusjoner benytter man deres<br />
dokumenter.<br />
Ved samarbeidsprosjekter som strekker seg over lengre tid bør en Research<br />
Agreement signeres.<br />
Kapittel 14 – Føring av <strong>for</strong>skningsprotokoll<br />
Alle eksperimenter og prosedyrer ved <strong>NoPSC</strong> laboratoriet skal logges i egen<br />
<strong>for</strong>skningsprotokoll av den som utfører prosedyren, det gjelder både bioingeniører, PhD<br />
studenter, post doc’er og andre ved laboratoriet (vedlegg 22, engelsk versjon). Sidene i<br />
boken skal være nummererte og prosedyrene skrives enten inn <strong>for</strong> hånd eller det limes inn<br />
en utskrift fra Word, Excel etc. Protokollen tilhører <strong>NoPSC</strong> og følgende skal <strong>no</strong>teres:<br />
<br />
<br />
<br />
<br />
<br />
<br />
<br />
<br />
<br />
Tittel på <strong>for</strong>søket<br />
Dato<br />
Hensikt med <strong>for</strong>søket<br />
Materialene som blir benyttet, inkludert prøveoppsett<br />
Reagenser inkl lot nr (kun ved endring i lot nr)<br />
Selve prosedyren / protokollen<br />
Hvilke instrumenter som ble benyttet<br />
Resultater (inkludert referanse til rådata hvis det <strong>for</strong>eligger elektronisk, samt alle<br />
beregninger)<br />
Konklusjon, diskusjon og evt. avvik fra protokollen.<br />
<strong>Prosedyrebok</strong> ved <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong>_Versjon 03.docx Org.enhet: Norsk senter <strong>for</strong> PSC, Avd. <strong>for</strong> transplantasjonsmedisin Nivå:4<br />
Dokumentversjon: 1 Utarbeidet av: Hege Dahlen Sollid Godkj. av: Tom Hemming Karlsen Dato: 18.06.13 Side 32 av 96
Protokoller man benytter jevnlig er det <strong>no</strong>k å vise til, men et minimum av in<strong>for</strong>masjon skal<br />
skrives ned daglig:<br />
<br />
<br />
<br />
<br />
<br />
Dato<br />
Prøveoppsett<br />
Resultater<br />
Konklusjon<br />
Evt. avvik<br />
Kapittel 15 – Lagring av data underveis og ved avslutning av prosjekt<br />
Bioin<strong>for</strong>matiske analyser skal loggføres på lik linje med <strong>for</strong>søk på laboratoriet, og ansvaret<br />
ligger hos den som utfører analysen, evt. prosjektleder. Det er der<strong>for</strong> ønskelig at det ved<br />
analyse av datasett <strong>no</strong>teres følgende:<br />
<br />
<br />
<br />
<br />
<br />
<br />
<br />
<br />
Tittel på prosjekt/analysen<br />
Dato/tidsperiode<br />
Hensikt med prosjektet/analysene<br />
Datasett som benyttes<br />
Programmer som benyttes (inkludert versjon av referansege<strong>no</strong>mer etc.)<br />
Steg-<strong>for</strong>-steg beskrivelse av (hoved)trinnene som ble utført (inkl parametere)<br />
Resultater (endelige resultatdatasett og plot etc.)<br />
Konklusjon/diskusjon<br />
Ved avslutning av et prosjekt ved <strong>NoPSC</strong> er det viktig å sikre tilgang til data på et senere<br />
tidspunkt. Prosjektleder er ansvarlig <strong>for</strong> at det overføres data (både rådata og resultater) til<br />
en ekstern harddisk, samt at det skrives et innholdsdokument som beskriver dataene og<br />
hvor de finnes.<br />
<strong>Prosedyrebok</strong> ved <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong>_Versjon 03.docx Org.enhet: Norsk senter <strong>for</strong> PSC, Avd. <strong>for</strong> transplantasjonsmedisin Nivå:4<br />
Dokumentversjon: 1 Utarbeidet av: Hege Dahlen Sollid Godkj. av: Tom Hemming Karlsen Dato: 18.06.13 Side 33 av 96
Vedlegg 1: Forespørsel om deltakelse i <strong>for</strong>skning “Lever- og<br />
gallegangssykdommer”<br />
Forespørsel om deltakelse i <strong>for</strong>skning<br />
“Lever- og gallegangssykdommer”<br />
Bakgrunn og hensikt<br />
Dette er et spørsmål til deg om å delta i <strong>for</strong>skning <strong>for</strong> å øke kunnskapen om lever- og<br />
gallegangssykdommer. Leger og <strong>for</strong>skere ved Rikshospitalet arbeider hele tiden <strong>for</strong> å<br />
<strong>for</strong>bedre <strong>for</strong>ståelsen av årsaken til lever- og gallegangssykdommer og <strong>for</strong> å <strong>for</strong>bedre<br />
diag<strong>no</strong>stikk og behandling av slike tilstander. Resultatene av <strong>for</strong>skningen kan gi oss verdifull<br />
kunnskap og <strong>for</strong>ståelse av mekanismer som kan ha betydning <strong>for</strong> framtidig oppfølging og<br />
behandling av pasientene.<br />
Hva innebærer deltakelse i studiene<br />
I <strong>for</strong>bindelse med utredning og behandling av din sykdom kan det bli nødvendig å ta prøver<br />
av blod, urin og andre kroppsvæsker og i enkelte tilfeller også vevsprøver <strong>for</strong> å stille<br />
diag<strong>no</strong>sen og bestemme riktig behandling. Vi spør deg om du vil gi tillatelse til:<br />
<br />
<br />
<br />
<br />
at deler av prøvene som blir til overs kan oppbevares til senere bruk i <strong>for</strong>skning på leverog<br />
gallegangssykdommer<br />
at blod- og/eller vevsprøver som allerede finnes ved Rikshospitalets laboratorier, tatt i<br />
<strong>for</strong>bindelse med tidligere undersøkelser og behandling eller <strong>for</strong>skningsprosjekt, også kan<br />
benyttes i <strong>for</strong>skningen<br />
å ta ekstra blodprøver til studier av arvestoff (gener) og andre komponenter av mulig<br />
betydning <strong>for</strong> utvikling av lever- og gallegangssykdom<br />
å ta ekstra celleprøver og galle fra gallegangene dersom vi uansett må undersøke disse,<br />
ekstra vevsprøve i tilfelle du opereres og ekstra prøver fra tykktarmen dersom vi<br />
allikevel undersøker den<br />
Mulige <strong>for</strong>deler og ulemper<br />
Resultatene av <strong>for</strong>skningen vil ikke ha direkte betydning <strong>for</strong> din behandling på det<br />
nåværende tidspunkt, men de vil danne grunnlag <strong>for</strong> bedre behandlingstilbud <strong>for</strong> pasienter<br />
med lever- og gallegangssykdommer i framtiden. Blodprøven kan som oftest tas samtidig<br />
med andre planlagte prøver. Dersom dette ikke passer, må den tas separat.<br />
Hva skjer med prøvene og in<strong>for</strong>masjonen om deg<br />
Kodenummer.<br />
Prøvene tatt av deg og in<strong>for</strong>masjonen som registreres om deg skal kun brukes slik som<br />
beskrevet i denne in<strong>for</strong>masjonen. Prøvene blir merket med et kodenummer og vil bli<br />
behandlet uten navn og fødselsnummer eller andre direkte gjenkjennende opplysninger.<br />
Listen som knytter ditt navn til kodenummeret vil bli oppbevart separat. Det er kun<br />
autorisert personell knyttet til <strong>for</strong>skningsprosjektene som har adgang til navnelisten og som<br />
kan finne tilbake til deg.<br />
Det vil ikke være mulig å identifisere deg i resultatene av studiene når disse publiseres.<br />
<strong>Prosedyrebok</strong> ved <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong>_Versjon 03.docx Org.enhet: Norsk senter <strong>for</strong> PSC, Avd. <strong>for</strong> transplantasjonsmedisin Nivå:4<br />
Dokumentversjon: 1 Utarbeidet av: Hege Dahlen Sollid Godkj. av: Tom Hemming Karlsen Dato: 18.06.13 Side 34 av 96
Biobank.<br />
Prøvene vil bli lagret i en <strong>for</strong>sknings<strong>biobank</strong> ved Rikshospitalet. Biobanken er tilrådd av<br />
Regional etisk komité <strong>for</strong> medisinsk og helsefaglig <strong>for</strong>skningsetikk og godkjent av<br />
Helsedirektoratet.<br />
Opplysninger fra pasientjournal og kopling til andre registre.<br />
Opplysningene dine kan ikke inngå i <strong>no</strong>en <strong>for</strong>m <strong>for</strong> <strong>for</strong>skning før det enkelte prosjekt er<br />
tilrådd av Personver<strong>no</strong>mbudet <strong>for</strong> <strong>for</strong>skning ved Rikshospitalet HF, samt godkjent av<br />
Regional etisk komité <strong>for</strong> medisinsk og helsefaglig <strong>for</strong>skningsetikk. En effektiv utnyttelse av<br />
prøvene i <strong>for</strong>skningsøyemed vil kunne medføre behov <strong>for</strong> å sammenstille <strong>for</strong>skningsdata<br />
knyttet til prøvene med opplysninger fra din pasientjournal ved Rikshospitalet (herunder<br />
også Nordisk levertransplantasjonsregister) eller annet sykehus du behandles ved, eventuelt<br />
også med journal ved andre helseinstitusjoner eller hos fastlege. Det kan også være aktuelt å<br />
koble <strong>for</strong>skningsdata med andre registre (eksempelvis Kreftregisteret, Dødsårsaksregisteret,<br />
Medisinsk fødselsregister eller Folkeregisteret). Slik kobling vil bare skje etter <strong>for</strong>utgående<br />
godkjenning fra Datatilsynet og Regional etisk komité <strong>for</strong> medisinsk og helsefaglig<br />
<strong>for</strong>skningsetikk. Alle data lagres i henhold til prosedyrer som er godkjent av<br />
Personver<strong>no</strong>mbudet ved Rikshospitalet HF.<br />
Utlevering av materiale og opplysninger til andre. Forskning skjer gjerne ved samarbeid<br />
mellom ulike institusjoner og <strong>for</strong>egår ofte over landegrensene. Det kan der<strong>for</strong> bli aktuelt å<br />
sende avidentifiserte opplysninger og prøver (tildelt kodenummer som kun kan spores<br />
tilbake til din person av den <strong>no</strong>rske prosjektlederen) til samarbeidspartnere ved andre<br />
institusjoner og industrielle samarbeidspartnere både i Norge og i utlandet. Dette kan være<br />
land med lover som ikke tilfredsstiller europeisk personvernlovgivning.<br />
Frivillig deltakelse.<br />
Det er frivillig å delta i studiene. Du kan når som helst og uten å oppgi <strong>no</strong>en grunn trekke ditt<br />
samtykke til å delta. Dette vil ikke få konsekvenser <strong>for</strong> din videre behandling. Dersom du<br />
ønsker å delta, undertegner du samtykkeerklæringen på siste side. Dersom du senere ønsker<br />
å trekke deg eller har spørsmål til studiene, kan du kontakte overlege, dr. med. Kirsten Muri<br />
Boberg, professor, dr. med. Erik Schrumpf, eller lege, PhD Tom Hemming Karlsen, Medisinsk<br />
avd., Rikshospitalet, tlf. 23 07 06 60 el. 23 07 00 00.<br />
Ytterligere in<strong>for</strong>masjon om studiene finnes i kapittel A – utdypende <strong>for</strong>klaring av hva<br />
studiene innebærer.<br />
Ytterligere in<strong>for</strong>masjon om <strong>biobank</strong>, personvern og <strong>for</strong>sikring finnes i kapittel B –<br />
Personvern, <strong>biobank</strong>, øko<strong>no</strong>mi og <strong>for</strong>sikring.<br />
Samtykkeerklæring følger etter kapittel B<br />
Kapittel A – utdypende <strong>for</strong>klaring av hva deltakelse i <strong>for</strong>skning innebærer<br />
Hvem blir <strong>for</strong>espurt om å delta i <strong>for</strong>skning på “Lever- og gallegangssykdommer”<br />
Pasienter som er henvist til Rikshospitalet eller andre sykehus i Norge til utredning og/eller<br />
behandling <strong>for</strong> lever- og/eller gallegangssykdom og deres nære slektninger kan bli <strong>for</strong>espurt<br />
om å gi sitt samtykke til deltakelse i studiene.<br />
Bakgrunnsin<strong>for</strong>masjon om studiene<br />
Årsaken til mange lever- og gallegangssykdommer er ukjent. Gener er av betydning <strong>for</strong><br />
utviklingen av flere av disse sykdommene, men sannsynligvis spiller også andre faktorer en<br />
<strong>Prosedyrebok</strong> ved <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong>_Versjon 03.docx Org.enhet: Norsk senter <strong>for</strong> PSC, Avd. <strong>for</strong> transplantasjonsmedisin Nivå:4<br />
Dokumentversjon: 1 Utarbeidet av: Hege Dahlen Sollid Godkj. av: Tom Hemming Karlsen Dato: 18.06.13 Side 35 av 96
viktig rolle. Vi ønsker å kartlegge videre hvilke gener som kan bidra til utvikling og <strong>for</strong>løp av<br />
lever- og gallegangssykdom og hvordan gener kan samspille med immunsystemet eller andre<br />
faktorer. Økt <strong>for</strong>ståelse av sykdomsmekanismene kan gi grunnlag <strong>for</strong> bedre oppfølging og<br />
behandling av pasienter med slike sykdommer.<br />
Noen pasienter med lever- og gallegangssykdom har også tarmbetennelse. For å få bedre<br />
<strong>for</strong>ståelse av hvor<strong>for</strong> enkelte utvikler både lever/gallegangs- og tarmsykdom, vil vi kartlegge<br />
<strong>for</strong>andringer i tarmen hos pasienter som har samtidig tarmbetennelse. Noen ganske få<br />
pasienter med lever- og gallegangssykdom utvikler komplikasjoner i <strong>for</strong>m av <strong>for</strong>stadier til<br />
kreft eller kreft i lever, galleveier eller tarm. Vi vil arbeide med å utvikle metoder <strong>for</strong> å kunne<br />
påvise tidlige stadier av kreft, slik at behandling kan iverksettes så tidlig som mulig.<br />
Prøver fra blod, vevsvæsker og vev<br />
Blodprøver kan som regel tas i <strong>for</strong>bindelse med at det skal tas prøver som ledd i utredning<br />
eller behandling. Dersom dette ikke passer, ber vi om å få ta ekstra prøver på vanlig måte.<br />
Andre vevsvæsker og vevsprøver vil bare tas i <strong>for</strong>bindelse med prosedyrer som er planlagt i<br />
<strong>for</strong>bindelse med utredning eller behandling (<strong>for</strong> eksempel gallegangsundersøkelse v/ERCP og<br />
tarmundersøkelse v/kolo<strong>no</strong>skopi).<br />
Mulige <strong>for</strong>deler<br />
Resultatene av <strong>for</strong>skningen vil ikke ha direkte betydning <strong>for</strong> din behandling på det<br />
nåværende tidspunkt, men de vil danne grunnlag <strong>for</strong> bedre behandlingstilbud <strong>for</strong> pasienter<br />
med lever- og gallegangssykdommer i framtiden. Dette kan også komme deg til nytte.<br />
Mulige ubehag/ulemper<br />
Bortsett fra at det kan bli aktuelt å ta en ekstra blodprøve, mener vi at deltakelse i studiene<br />
ikke vil medføre ekstra ubehag eller ulemper <strong>for</strong> deg.<br />
Ny in<strong>for</strong>masjon som kan påvirke studiene<br />
Dersom ny in<strong>for</strong>masjon blir tilgjengelig som kan påvirke din villighet til å delta i studiene, vil<br />
du bli orientert så raskt som mulig.<br />
Kapittel B – Personvern, <strong>biobank</strong>, øko<strong>no</strong>mi og <strong>for</strong>sikring<br />
Personvern<br />
Opplysninger som registreres om deg vil gjelde <strong>for</strong>hold som vi mener kan være av betydning<br />
<strong>for</strong> utvikling og <strong>for</strong>løp av lever- og gallegangssykdom. Dette vil også inkludere opplysninger<br />
om eventuell tarmsykdom eller andre tilstander som av og til ses samtidig med lever- og<br />
gallegangssykdommer. Vi vil registrere symptomer, blodprøvesvar, funn ved andre typer<br />
undersøkelser (<strong>for</strong> eksempel røntgenundersøkelser) og behandling som er gitt. Vi vil primært<br />
benytte opplysninger fra din journal ved Rikshospitalet. Av og til vil det være nødvendig å<br />
innhente supplerende opplysninger av tilsvarende type fra journal hos fastlege eller annen<br />
helseinstitusjon.<br />
I enkelte prosjekter kan det bli aktuelt å koble <strong>for</strong>skningsdata til andre registre. Slik kobling<br />
vil bare skje etter <strong>for</strong>utgående godkjenning av Datatilsynet og Regional etisk komité <strong>for</strong><br />
medisinsk og helsefaglig <strong>for</strong>skningsetikk. Opplysninger fra aktuelle registre omfatter:<br />
eventuell kreft<strong>for</strong>ekomst (Kreftregisteret), dødsårsak (Dødsårsaksregisteret), medisinske<br />
<strong>for</strong>hold rundt fødsel (Medisinsk fødselsregister) og bosted (Folkeregisteret). Alle data lagres i<br />
henhold til prosedyrer som er godkjent av Personver<strong>no</strong>mbudet.<br />
<strong>Prosedyrebok</strong> ved <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong>_Versjon 03.docx Org.enhet: Norsk senter <strong>for</strong> PSC, Avd. <strong>for</strong> transplantasjonsmedisin Nivå:4<br />
Dokumentversjon: 1 Utarbeidet av: Hege Dahlen Sollid Godkj. av: Tom Hemming Karlsen Dato: 18.06.13 Side 36 av 96
Rikshospitalet HF ved administrerende direktør er databehandlingsansvarlig.<br />
Biobank<br />
Prøver fra blod, andre vevsvæsker og vev og in<strong>for</strong>masjonen utledet av dette materialet vil bli<br />
lagret i en <strong>for</strong>sknings<strong>biobank</strong> ved Rikshospitalet. Hvis du sier ja til å delta i studiene, gir du<br />
også samtykke til at det biologiske materialet og analyseresultater inngår i <strong>biobank</strong>en.<br />
Overlege, dr. med. Kirsten Muri Boberg er ansvarshavende <strong>for</strong> <strong>for</strong>sknings<strong>biobank</strong>en.<br />
Biobanken og helseopplysningene planlegges å lagres i første omgang til 2028. Det kan bli<br />
aktuelt å søke om <strong>for</strong>lenget oppbevaring, og vi ber der<strong>for</strong> om å kunne komme tilbake <strong>for</strong> å<br />
be om slik <strong>for</strong>lengelse. Når <strong>for</strong>skningsprosjektet avsluttes, vil materiale og opplysninger bli<br />
destruert og slettet etter interne retningslinjer.<br />
Utlevering av materiale og opplysninger til andre<br />
Hvis du sier ja til å delta i studiene, gir du også ditt samtykke til at prøver og avidentifiserte<br />
opplysninger utleveres til <strong>for</strong>skningsgrupper vi samarbeider med. Vi samarbeider i størst<br />
utstrekning med <strong>for</strong>skningsgrupper innen EU, men samarbeidet kan også gjelde land med<br />
lover som ikke tilfredsstiller europeisk personvernlovgivning. Foreløpig har vi etablert<br />
samarbeid med <strong>for</strong>skningsgrupper ved Huddinge sjukhus (Sverige), John Radcliffe Hospital<br />
(England), University of Cambridge (England), Christian-Albrechts Universität (Tyskland),<br />
Academic Medical Center (Nederland) og Medical University of Graz (Østerrike).<br />
Rett til innsyn og sletting av opplysninger om deg og sletting av prøver<br />
Hvis du sier ja til å delta i studiene, har du rett til å få innsyn i hvilke opplysninger som er<br />
registrert om deg. Du har videre rett til å få korrigert eventuelle feil i de opplysningene vi har<br />
registrert. Dersom du trekker deg fra studiene, kan du kreve å få slettet innsamlede prøver<br />
og opplysninger. Opplysninger som allerede er publisert kan imidlertid ikke slettes fra<br />
eventuelle publikasjoner.<br />
Øko<strong>no</strong>mi<br />
Prosjektet og <strong>biobank</strong>en er finansiert gjen<strong>no</strong>m <strong>for</strong>skningsmidler som er gitt av Canica AS<br />
(v/Stein Erik Hagen) og som <strong>for</strong>valtes av Universitetet i Oslo. Prosjektet er ikke ment å gi<br />
øko<strong>no</strong>misk avkastning. Prosjektansvarlig og andre som arbeider med prosjektet har ingen<br />
<strong>for</strong>m <strong>for</strong> øko<strong>no</strong>misk vinning knyttet til prosjektet.<br />
Forsikring<br />
Du har vanlige pasientrettigheter som ledd i din kontakt med helseinstitusjonen og eventuell<br />
søknad til Norsk pasientskadeerstatning kan sendes på vanlig måte. Det er ingen spesiell<br />
<strong>for</strong>sikring knyttet til prosjektene.<br />
In<strong>for</strong>masjon om utfallet av studiene<br />
Deltakerne har rett til å få in<strong>for</strong>masjon om resultatene av studiene som utføres. I hovedsak<br />
vil resultatene bli tilgjengelige som publikasjoner i internasjonale vitenskapelige tidsskrift.<br />
<strong>Prosedyrebok</strong> ved <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong>_Versjon 03.docx Org.enhet: Norsk senter <strong>for</strong> PSC, Avd. <strong>for</strong> transplantasjonsmedisin Nivå:4<br />
Dokumentversjon: 1 Utarbeidet av: Hege Dahlen Sollid Godkj. av: Tom Hemming Karlsen Dato: 18.06.13 Side 37 av 96
Samtykke til deltakelse i studiene<br />
Navnelapp:<br />
Jeg er villig til å delta i studiene “Lever- og gallegangssykdommer”.<br />
---------------------------------------------------------------------------<br />
(Signert av prosjektdeltaker, dato)<br />
Sted<strong>for</strong>tredende samtykke når berettiget, enten i tillegg til personen selv eller isteden<strong>for</strong><br />
---------------------------------------------------------------------------<br />
(Signert av nærstående, dato)<br />
Jeg bekrefter å ha gitt in<strong>for</strong>masjon om studiene<br />
---------------------------------------------------------------------------<br />
(Signert, medlem av prosjektledelsen, dato)<br />
<strong>Prosedyrebok</strong> ved <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong>_Versjon 03.docx Org.enhet: Norsk senter <strong>for</strong> PSC, Avd. <strong>for</strong> transplantasjonsmedisin Nivå:4<br />
Dokumentversjon: 1 Utarbeidet av: Hege Dahlen Sollid Godkj. av: Tom Hemming Karlsen Dato: 18.06.13 Side 38 av 96
Vedlegg 2: Forespørsel om samtykke til <strong>for</strong>sknings<strong>biobank</strong> <strong>for</strong> magetarmsykdommer<br />
Forespørsel om samtykke til <strong>for</strong>sknings<strong>biobank</strong> <strong>for</strong> magetarmsykdommer<br />
Bakgrunn og hensikt<br />
Forskning på helseopplysninger relatert til pasienters diag<strong>no</strong>se, behandling og prog<strong>no</strong>se er<br />
avgjørende <strong>for</strong> å sikre befolkningen en høy kvalitet på helsetjenestetilbudet. Ved Helse<br />
Bergen HF/Haukeland Universitetssykehus arbeider vi kontinuerlig med å oppnå ny<br />
kunnskap innen gastroenterologiske sykdomstilstander (særlig mage/tarm, lever/galleveier<br />
og bukspyttkjertelen). For å kunne utføre denne <strong>for</strong>skningen er vi avhengig av pasientenes<br />
samtykke.<br />
Samtykkets omfang og dine rettigheter<br />
I <strong>for</strong>bindelse med utredning og behandling av din sykdom kan det bli nødvendig å ta prøver<br />
av blod, urin og andre kroppsvæsker og i enkelte tilfeller også vevsprøver <strong>for</strong> å stille<br />
diag<strong>no</strong>sen og bestemme riktig behandling. Vi spør deg om du vil gi tillatelse til:<br />
at deler av prøvene som blir til overs kan oppbevares til senere bruk i <strong>for</strong>skning på magetarmsykdommer<br />
at blod- og/eller vevsprøver som allerede finnes ved laboratorier ved Haukeland<br />
Universitetssykehus, tatt i <strong>for</strong>bindelse med tidligere undersøkelser og behandling eller<br />
<strong>for</strong>skningsprosjekt, også kan benyttes i <strong>for</strong>skningen<br />
å ta ekstra blodprøver til studier av arvestoff (gener) og andre komponenter av mulig<br />
betydning <strong>for</strong> utvikling av mage-tarmsykdommer<br />
å ta ekstra celleprøver og galle fra gallegangene dersom vi uansett må undersøke disse,<br />
ekstra vevsprøve i tilfelle du opereres og ekstra prøver fra magesekken/tarmen dersom<br />
vi allikevel undersøker den<br />
å ta bilder av indre organer og oppbevare dem til bruk i <strong>for</strong>skningsøyemed<br />
Ved å signere samtykkeerklæringen aksepterer du at opplysninger og eventuelt<br />
prøvemateriale kan benyttes til <strong>for</strong>skning innen mage-tarmsykdommer. I tillegg kan du bli<br />
spurt om å besvare spørreskjemaer og delta på oppfølgingstiltak <strong>for</strong> å samle inn ytterligere<br />
opplysninger eller prøver. En effektiv utnyttelse av prøvene i <strong>for</strong>skningsøyemed vil kunne<br />
medføre behov <strong>for</strong> å sammenstille <strong>for</strong>skningsdata knyttet til prøvene med opplysninger fra<br />
din pasientjournal ved Haukeland Universitetssykehus eller annet sykehus du behandles ved,<br />
eventuelt også med journal ved andre helseinstitusjoner eller hos fastlege.<br />
Det kan i enkelte <strong>for</strong>skningsprosjekter være aktuelt å benytte relevante opplysninger fra<br />
landsomfattende helseregistere. Eksempler på slike registre er Kreftregisteret,<br />
Fødseslregisteret, Dødsårsaksregisteret, Vaksineregisteret, Nasjonalt Pasientregister og<br />
Statistisk Sentralbyrås familie- og sosialregister.<br />
Eventuelle prøver og in<strong>for</strong>masjonen som registreres om deg vil bli behandlet konfidensielt<br />
og bli brukt til <strong>for</strong>skning innen mage-tarmsykdommer. Alle opplysningene vil bli behandlet<br />
uten navn og fødselsnummer eller andre direkte gjenkjennende opplysninger. En kode<br />
knytter deg til dine opplysninger og prøver gjen<strong>no</strong>m en navneliste. Det er kun autorisert<br />
personell knyttet til <strong>for</strong>skningsprosjektene som har adgang til navnelisten og som kan finne<br />
<strong>Prosedyrebok</strong> ved <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong>_Versjon 03.docx Org.enhet: Norsk senter <strong>for</strong> PSC, Avd. <strong>for</strong> transplantasjonsmedisin Nivå:4<br />
Dokumentversjon: 1 Utarbeidet av: Hege Dahlen Sollid Godkj. av: Tom Hemming Karlsen Dato: 18.06.13 Side 39 av 96
tilbake til deg. Det vil ikke være mulig å identifisere deg i <strong>for</strong>skningsresultatene når disse<br />
publiseres.<br />
Du har krav på nødvendig in<strong>for</strong>masjon i <strong>for</strong>kant om de studiene du inkluderes i. Slik<br />
in<strong>for</strong>masjon vil omfatte:<br />
Hensikten med studien<br />
Biologisk materiale og evt. tester som er nødvendig<br />
Hvilke opplysninger som skal hentes fra din journal i og uten<strong>for</strong> sykehuset<br />
Om det er behov <strong>for</strong> å koble data mot landsdekkende helseregistere og hvilke<br />
Når det biologiske materialet og opplysningene i prosjektet blir slettet<br />
Evt. utlevering av biologisk materiale til andre <strong>no</strong>rske eller internasjonale<br />
<strong>for</strong>skningsmiljøer<br />
Dine rettigheter<br />
Du vil bli tilskrevet om studier som det kan være aktuelt å inkludere deg i.<br />
Dersom du godtar deltakelse i et prosjekt, trenger du ikke gjøre <strong>no</strong>e når du<br />
mottar denne in<strong>for</strong>masjonen<br />
Dersom du ikke vil delta i den aktuelle studien, kan du reservere deg fra<br />
deltakelse ved å henvende deg til sykehuset og den som er oppgitt som<br />
kontakperson <strong>for</strong> studien<br />
Personvern og etikk. Prøvene vil bli lagret i en <strong>for</strong>sknings<strong>biobank</strong>. Biobanken er godkjent av<br />
Regional komité <strong>for</strong> medisinsk og helsefaglig <strong>for</strong>skningsetikk. Alle data lagres i henhold til<br />
prosedyrer som er godkjent av Personver<strong>no</strong>mbudet ved Haukeland Universitetssykehus.<br />
Prøvene og opplysningene dine kan ikke inngå i <strong>no</strong>en <strong>for</strong>m <strong>for</strong> <strong>for</strong>skning før det enkelte<br />
prosjekt er godkjent av Personver<strong>no</strong>mbudet <strong>for</strong> <strong>for</strong>skning ved Haukeland<br />
Universitetssykehus, samt godkjent av Regional komité <strong>for</strong> medisinsk og helsefaglig<br />
<strong>for</strong>skningsetikk.<br />
Mulige <strong>for</strong>deler og ulemper<br />
Resultatene av <strong>for</strong>skningen vil ikke ha direkte betydning <strong>for</strong> din behandling på det<br />
nåværende tidspunkt, men de vil danne grunnlag <strong>for</strong> bedre behandlingstilbud <strong>for</strong> pasienter<br />
med mage-tarm sykdommer i framtiden. Blodprøven kan som oftest tas samtidig med andre<br />
planlagte prøver. Dersom dette ikke passer, må den tas separat.<br />
Utlevering av materiale og opplysninger til andre. Forskning skjer gjerne ved samarbeid<br />
mellom ulike institusjoner og <strong>for</strong>egår ofte over landegrensene. Det kan der<strong>for</strong> bli aktuelt å<br />
sende avidentifiserte opplysninger og prøver (tildelt kodenummer som kun kan spores<br />
tilbake til din person av den <strong>no</strong>rske prosjektlederen) til samarbeidspartnere ved andre<br />
institusjoner og industrielle samarbeidspartnere både i Norge og i utlandet. Dette kan være<br />
land med lover som ikke tilfredsstiller europeisk personvernlovgivning. Utlevering av<br />
opplysninger og prøver til samarbeidende <strong>for</strong>skere vil bli lagt frem <strong>for</strong> Regional komité <strong>for</strong><br />
medisinsk og helsefaglig <strong>for</strong>skningsetikk i aktuell prosjektsøknad.<br />
Ytterligere in<strong>for</strong>masjon<br />
Du kan når som helst og uten å oppgi <strong>no</strong>en grunn trekke ditt samtykke til å delta. Du kan<br />
også til enhver tid få innsyn i hvilke opplysninger som er registrert om deg. Du har videre rett<br />
til å få korrigert eventuelle feil i de opplysningene vi har registrert. Dersom du trekker tilbake<br />
samtykket, kan du kreve å få slettet innsamlede prøver og opplysninger, med mindre<br />
opplysningene allerede er inngått i analyser, er brukt i vitenskapelige publikasjoner, eller er<br />
innsamlet i <strong>for</strong>bindelse med legemiddelutprøving. Dette vil ikke få konsekvenser <strong>for</strong> din<br />
<strong>Prosedyrebok</strong> ved <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong>_Versjon 03.docx Org.enhet: Norsk senter <strong>for</strong> PSC, Avd. <strong>for</strong> transplantasjonsmedisin Nivå:4<br />
Dokumentversjon: 1 Utarbeidet av: Hege Dahlen Sollid Godkj. av: Tom Hemming Karlsen Dato: 18.06.13 Side 40 av 96
videre behandling. Dersom du ønsker å delta, undertegner du samtykkeerklæringen på siste<br />
side.<br />
Dersom du har spørsmål til studiene, kan du kontakte lege og prosjektleder Mette<br />
Vesterhus, Medisinsk avdeling, Haukeland Universitetssykehus, telefon 55 97 58 35 eller 55<br />
97 5000.<br />
Kapittel A- utdypende <strong>for</strong>klaring av hva deltakelse i <strong>for</strong>skning innebærer<br />
Hvem blir <strong>for</strong>espurt om å delta i <strong>for</strong>skning innen mage-tarmsykdommer<br />
Pasienter som er henvist til Haukeland Universitetssykehus eller andre sykehus i Norge til<br />
utredning og/eller behandling <strong>for</strong> mage-, tarm-, lever-, galleveis- og/eller<br />
bukspyttkjertelsykdommmer og deres nære slektninger kan bli <strong>for</strong>espurt om å gi sitt<br />
samtykke til deltakelse i studiene.<br />
Bakgrunnsin<strong>for</strong>masjon om studiene<br />
Årsaken til mange mage-tarmsykdommer er ukjent. Gener er av betydning <strong>for</strong> utviklingen av<br />
flere av disse sykdommene, men sannsynligvis spiller også andre faktorer en viktig rolle. Vi<br />
ønsker å kartlegge videre hvilke faktorer som bidrar til utvikling og <strong>for</strong>løp av magetarmsykdommer.<br />
Økt <strong>for</strong>ståelse av sykdomsmekanismene kan gi grunnlag <strong>for</strong> bedre<br />
oppfølging og behandling av pasienter med slike sykdommer. Vi ønsker å kartlegge hvordan<br />
vi kan påvise faktorer som er av betydning <strong>for</strong> sykdomsutvikling, enten gjen<strong>no</strong>m<br />
laboratorieteknikker eller andre metoder (<strong>for</strong> eksempel ultralyd). Noen ganske få pasienter<br />
med mage-tarmsykdommer utvikler komplikasjoner i <strong>for</strong>m av <strong>for</strong>stadier til kreft eller kreft i<br />
lever, galleveier eller tarm. Vi vil arbeide med å utvikle metoder <strong>for</strong> å kunne påvise tidlige<br />
stadier av kreft, slik at behandling kan iverksettes så tidlig som mulig.<br />
Prøver fra blod, vevsvæsker og vev<br />
Blodprøver kan som regel tas i <strong>for</strong>bindelse med at det skal tas prøver som ledd i utredning<br />
eller behandling. Dersom dette ikke passer, ber vi om å få ta ekstra prøver på vanlig måte.<br />
Andre vevsvæsker og vevsprøver vil bare tas i <strong>for</strong>bindelse med prosedyrer som er planlagt i<br />
<strong>for</strong>bindelse med utredning eller behandling (<strong>for</strong> eksempel gallegangsundersøkelse v/ERCP og<br />
tarmundersøkelse v/kolo<strong>no</strong>skopi).<br />
Mulige <strong>for</strong>deler<br />
Resultatene av <strong>for</strong>skningen vil ikke ha direkte betydning <strong>for</strong> din behandling på det<br />
nåværende tidspunkt, men de vil danne grunnlag <strong>for</strong> bedre behandlingstilbud <strong>for</strong> pasienter<br />
med mage-tarmsykdommer i framtiden. Dette kan også komme deg til nytte.<br />
Mulige ubehag/ulemper<br />
Bortsett fra at det kan bli aktuelt å ta en ekstra blodprøve, mener vi at deltakelse i studiene<br />
ikke vil medføre ekstra ubehag eller ulemper <strong>for</strong> deg.<br />
Ny in<strong>for</strong>masjon som kan påvirke studiene<br />
Dersom ny in<strong>for</strong>masjon blir tilgjengelig som kan påvirke din villighet til å delta i studiene, vil<br />
du bli orientert så raskt som mulig.<br />
<strong>Prosedyrebok</strong> ved <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong>_Versjon 03.docx Org.enhet: Norsk senter <strong>for</strong> PSC, Avd. <strong>for</strong> transplantasjonsmedisin Nivå:4<br />
Dokumentversjon: 1 Utarbeidet av: Hege Dahlen Sollid Godkj. av: Tom Hemming Karlsen Dato: 18.06.13 Side 41 av 96
Kapittel B - Personvern, <strong>biobank</strong>, øko<strong>no</strong>mi og <strong>for</strong>sikring<br />
Personvern<br />
Opplysninger som registreres om deg vil gjelde <strong>for</strong>hold som vi mener kan være av betydning<br />
<strong>for</strong> utvikling og <strong>for</strong>løp av mage-tarmsykdommer. Dette vil også inkludere opplysninger om<br />
eventuelle tilstander som av og til ses samtidig med mage-tarmsykdommer (<strong>for</strong> eksempel<br />
leddgikt). Vi vil registrere symptomer, blodprøvesvar, funn ved andre typer undersøkelser<br />
(<strong>for</strong> eksempel røntgenundersøkelser) og behandling som er gitt. Vi vil primært benytte<br />
opplysninger fra din journal ved Haukeland Universitetssykehus. Av og til vil det være<br />
nødvendig å innhente supplerende opplysninger av tilsvarende type fra journal hos fastlege<br />
eller annen helseinstitusjon.<br />
I enkelte prosjekter kan det bli aktuelt å koble <strong>for</strong>skningsdata til andre registre. Slik kobling<br />
vil bare skje etter <strong>for</strong>utgående godkjenning av Datatilsynet og Regional etisk komité <strong>for</strong><br />
medisinsk og helsefaglig <strong>for</strong>skningsetikk. Opplysninger fra aktuelle registre omfatter:<br />
eventuell kreft<strong>for</strong>ekomst (Kreftregisteret), dødsårsak (Dødsårsaksregisteret), medisinske<br />
<strong>for</strong>hold rundt fødsel (Medisinsk fødselsregister) og bosted (Folkeregisteret). Alle data lagres i<br />
henhold til prosedyrer som er godkjent av Personver<strong>no</strong>mbudet.<br />
Helse Bergen HF ved administrerende direktør er databehandlingsansvarlig.<br />
Biobank<br />
Prøver fra blod, andre vevsvæsker og vev og in<strong>for</strong>masjonen utledet av dette materialet vil bli<br />
lagret i en <strong>for</strong>sknings<strong>biobank</strong> ved Haukeland Universitetssykehus. Hvis du sier ja til å delta i<br />
studiene, gir du også samtykke til at det biologiske materialet og analyseresultater inngår i<br />
<strong>biobank</strong>en. Professor Trygve Hausken er ansvarshavende <strong>for</strong> <strong>for</strong>sknings<strong>biobank</strong>en.<br />
Biobanken og helseopplysningene planlegges å lagres i første omgang til 2032. Det kan bli<br />
aktuelt å søke om <strong>for</strong>lenget oppbevaring, og vi ber der<strong>for</strong> om å kunne komme tilbake <strong>for</strong> å<br />
be om slik <strong>for</strong>lengelse. Når <strong>for</strong>skningsprosjektet avsluttes, vil materiale og opplysninger bli<br />
destruert og slettet etter interne retningslinjer.<br />
Utlevering av materiale og opplysninger til andre<br />
Hvis du sier ja til å delta i studiene, gir du også ditt samtykke til at prøver og avidentifiserte<br />
opplysninger utleveres til <strong>for</strong>skningsgrupper vi samarbeider med. Vi samarbeider i størst<br />
utstrekning med <strong>for</strong>skningsgrupper innen EU, men samarbeidet kan også gjelde land med<br />
lover som ikke tilfredsstiller europeisk personvernlovgivning.<br />
Rett til innsyn og sletting av opplysninger om deg og sletting av prøver<br />
Hvis du sier ja til å delta i studiene, har du rett til å få innsyn i hvilke opplysninger som er<br />
registrert om deg. Du har videre rett til å få korrigert eventuelle feil i de opplysningene vi har<br />
registrert. Dersom du trekker deg fra studiene, kan du kreve å få slettet innsamlede prøver<br />
og opplysninger. Opplysninger som allerede er publisert kan imidlertid ikke slettes fra<br />
eventuelle publikasjoner.<br />
Øko<strong>no</strong>mi<br />
Prosjektet og <strong>biobank</strong>en er finansiert gjen<strong>no</strong>m <strong>for</strong>skningsmidler fra ulike kilder (bl.a<br />
Universitetet i Bergen, Norges Forskningsråd, Universitetet i Oslo, Helse Vest og Helse Sør-<br />
Øst). Prosjektet er ikke ment å gi øko<strong>no</strong>misk avkastning. Prosjektansvarlig og andre som<br />
arbeider med prosjektet har ingen <strong>for</strong>m <strong>for</strong> øko<strong>no</strong>misk vinning knyttet til prosjektet.<br />
<strong>Prosedyrebok</strong> ved <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong>_Versjon 03.docx Org.enhet: Norsk senter <strong>for</strong> PSC, Avd. <strong>for</strong> transplantasjonsmedisin Nivå:4<br />
Dokumentversjon: 1 Utarbeidet av: Hege Dahlen Sollid Godkj. av: Tom Hemming Karlsen Dato: 18.06.13 Side 42 av 96
Forsikring<br />
Du har vanlige pasientrettigheter som ledd i din kontakt med helseinstitusjonen og eventuell<br />
søknad til Norsk pasientskadeerstatning kan sendes på vanlig måte. Det er ingen spesiell<br />
<strong>for</strong>sikring knyttet til prosjektene.<br />
In<strong>for</strong>masjon om utfallet av studiene<br />
Deltakerene har rett til å få in<strong>for</strong>masjon om resultatene av studiene som utføres. I hovedsak<br />
vil resultatene bli tilgjengelige som publikasjoner i internasjonale vitenskapelige tidsskrift.<br />
Skjema <strong>for</strong> samtykke til <strong>for</strong>skning<br />
Voksne over 16 år<br />
Forskningsområde<br />
Gastroenterologi<br />
Prosjektleders navn<br />
Klinikk/avdeling<br />
Prosjektnummer<br />
Trygve Hausken<br />
Medisinsk avdeling<br />
All <strong>for</strong>skningsdeltakelse er frivillig. Dersom du ønsker å delta, undertegner du denne<br />
samtykkeerklæringen. Om du nå sier ja til å delta, kan du senere når som helst og uten å<br />
oppgi <strong>no</strong>en grunn, trekke tilbake ditt samtykke uten at det påvirker din øvrige behandling.<br />
Dersom du senere ønsker å trekke deg eller har spørsmål om <strong>for</strong>skningen, kan du kontakte<br />
prosjektleder.<br />
Jeg er villig til at prøver og opplysninger om meg brukes i <strong>for</strong>skning på magetarmsykdommer<br />
Navn med blokkbokstaver<br />
Fødselsnummer (11 siffer)<br />
Dato<br />
Underskrift<br />
Jeg bekrefter å ha gitt in<strong>for</strong>masjon om <strong>for</strong>skning på mage-tarmsykdommer<br />
Dato Underskrift Brukerkode (4-<br />
tegnskode)<br />
Eventuelle kommentarer:<br />
<strong>Prosedyrebok</strong> ved <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong>_Versjon 03.docx Org.enhet: Norsk senter <strong>for</strong> PSC, Avd. <strong>for</strong> transplantasjonsmedisin Nivå:4<br />
Dokumentversjon: 1 Utarbeidet av: Hege Dahlen Sollid Godkj. av: Tom Hemming Karlsen Dato: 18.06.13 Side 43 av 96
Vedlegg 3: Databaseskjema – Prosjekt “Lever- og gallegangssykdommer”<br />
Prosjekt “Lever- og gallegangssykdommer”<br />
Registrering av parametre til databasen. Vi ønsker her å få med supplerende opplysninger i<br />
tillegg til ordinær journal. Sett kryss ved aktuelt svar.<br />
Fylt ut av (navn): _____________________________________<br />
Dato: _________<br />
1. Pasient ID (navnelapp)<br />
2. Hoveddiag<strong>no</strong>se<br />
(endelig ikke endelig, kan bli revurdert)<br />
PSC (primær skleroserende cholangitt)<br />
PBC (primær biliær cirrhose)<br />
AIH (autoimmun hepatitt)<br />
Small-duct PSC (diag<strong>no</strong>stiske kriterier: 1) Normal ERCP, 2) Hvis ikke IBD, leverbiopsi<br />
“typisk” <strong>for</strong> PSC, 3) Hvis IBD, tilstrekkelig at leverbiopsi er “<strong>for</strong>enlig” med PSC)<br />
Indetermiate (kronisk “autoimmun” leversykdom som ikke er sikkert klassifisert)<br />
Malign/mistenkt malign sykdom, uten PSC<br />
Annen leversykdom<br />
3. Røyking – (regelmessig bruk) på diag<strong>no</strong>setidspunktet<br />
Ja – nåværende<br />
Nei – eksrøyker<br />
Nei – aldrirøyker<br />
3. Alkoholenheter per dag – på diag<strong>no</strong>setidspunktet<br />
0-1.0<br />
>1.0-3.0<br />
>3.0<br />
Det er nyttig å spørre pasienten om antall enheter <strong>for</strong> eksempel siste 4 uker og dividere på<br />
antall dager.<br />
4. Autoimmun sykdom hos pasienten (velg mer enn én om relevant)<br />
(endelig Ikke endelig, kan bli revurdert)<br />
Diabetes mellitus type I Nefritt<br />
Thyroideasykdom<br />
Vitiligo<br />
Cøliaki<br />
Systemisk lupus<br />
erytematosus<br />
Revmatoid artritt<br />
Vaskulitt<br />
Sarcoidose<br />
Fibroserende alveolitt<br />
Psoriasis<br />
Sacroileitt<br />
<strong>Prosedyrebok</strong> ved <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong>_Versjon 03.docx Org.enhet: Norsk senter <strong>for</strong> PSC, Avd. <strong>for</strong> transplantasjonsmedisin Nivå:4<br />
Dokumentversjon: 1 Utarbeidet av: Hege Dahlen Sollid Godkj. av: Tom Hemming Karlsen Dato: 18.06.13 Side 44 av 96
5. Familiær <strong>for</strong>ekomst av leversykdom (PSC, PBC, AIH) el. IBD (Crohn, UC)<br />
(endelig<br />
ikke endelig, kan bli revurdert)<br />
Slektskap<br />
Mor<br />
Far<br />
Søster<br />
Bror<br />
Datter<br />
Sønn<br />
Andre<br />
(spesifiser)<br />
Type leversykdom/IBD<br />
6. Dato første patologiske blodprøve <strong>for</strong>enlig med leversykdommen<br />
(endelig ikke endelig, kan bli revurdert)<br />
Måned<br />
År<br />
7. Dato første symptom leversykdom<br />
(endelig ikke endelig, kan bli revurdert)<br />
Måned<br />
År<br />
8. Første ERCP som var diag<strong>no</strong>stisk <strong>for</strong> PSC ble utført:<br />
(endelig ikke endelig, kan bli revurdert)<br />
Sykehus: Måned År<br />
9. Dato første symptom tarmsykdom<br />
(endelig ikke endelig, kan bli revurdert)<br />
Måned<br />
År<br />
10. Første colo<strong>no</strong>skopi som ga diag<strong>no</strong>se IBD ble utført:<br />
(endelig ikke endelig, kan bli revurdert)<br />
Sykehus: Måned År<br />
11. Evt. kolektomi ble utført:<br />
(endelig ikke endelig, kan bli revurdert)<br />
Sykehus: Måned År<br />
<strong>Prosedyrebok</strong> ved <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong>_Versjon 03.docx Org.enhet: Norsk senter <strong>for</strong> PSC, Avd. <strong>for</strong> transplantasjonsmedisin Nivå:4<br />
Dokumentversjon: 1 Utarbeidet av: Hege Dahlen Sollid Godkj. av: Tom Hemming Karlsen Dato: 18.06.13 Side 45 av 96
Vedlegg 4: Invitasjon til deltakelse i PSC kohort<br />
Invitasjon til å delta i<br />
Prospektiv studie av primær skleroserende cholangitt (PSC)<br />
I januar <strong>2013</strong> starter en prospektiv studie av primær skleroserende cholangitt (PSC), og du<br />
inviteres med dette til å delta. Dersom du velger å delta, vil du innkalles til årlig undersøkelse<br />
ved Gastroseksjonen, Medisinsk avdeling, Haukeland Universitetssykehus. Studien vil i første<br />
omgang pågå i fem år, med muligheter til <strong>for</strong>lengelse.<br />
Hensikten med studien<br />
PSC er en kronisk sykdom av ukjent årsak, med kronisk betennelse og <strong>for</strong>snevringer i<br />
gallegangene, som over tid kan lede til arrdannelse og utvikling av skrumplever. Vi vet at det<br />
er stor variasjon i sykdoms<strong>for</strong>løpet, men mangler gode verktøy <strong>for</strong> å vurdere<br />
sykdomsaktivitet og prog<strong>no</strong>se. Vi ønsker å undersøke om vi kan finne nye markører <strong>for</strong><br />
sykdomsaktivitet og sykdomsprogresjon. Dette vil være viktig både <strong>for</strong> å vurdere prog<strong>no</strong>se<br />
hos den enkelte, og <strong>for</strong> å fremskaffe kunnskap som kan gi utgangspunkt <strong>for</strong> utvikling av<br />
målrettet behandling. Resultatene av <strong>for</strong>skningen vil ikke ha direkte betydning <strong>for</strong> din<br />
behandling på det nåværende tidspunkt, men vil danne grunnlag <strong>for</strong> bedre<br />
behandlingstilbud <strong>for</strong> pasienter med PSC i framtiden.<br />
Hva undersøkes ved kontrollene<br />
Ved kontrollene vil det tas blodprøver – både «de vanlige» som pleier å kontrolleres, og<br />
ekstra blodprøver, urin- og avføringsprøver til Forsknings<strong>biobank</strong> <strong>for</strong> mage-tarmsykdommer.<br />
Det vil gjøres MR, MRCP, og ultralyd med elastografi. Elastografi måler hastigheten av<br />
ultralydbølgers passasje gjen<strong>no</strong>m vevet som et uttrykk <strong>for</strong> elastisitet, og sier <strong>no</strong>e om graden<br />
av arrdannelse (fibrose). Elastografi har ingen kjente bivirkninger. Du vil kunne få tilbud om<br />
kontrast-ultralyd, som innebærer injeksjon av kontrastmiddel bestående av mikrobobler<br />
som kan brukes til å visualisere blodgjen<strong>no</strong>mstrømningen i vev. Dette kan bl.a. benyttes til å<br />
vurdere betennelse og fibrose. Kontrast-ultralyd er i vanlig bruk ved Haukeland<br />
universitetssykehus, og har få og sjeldne, milde bivirkninger, hovedsakelig i <strong>for</strong>m av lokalt<br />
ubehag rundt innstikksstedet.<br />
Før du eventuelt velger å delta, vil du få anledning til å lese et mer omfattende<br />
in<strong>for</strong>majonsskriv om Forsknings<strong>biobank</strong>en og hvordan prøver og opplysninger om deg vil<br />
lagres. Du må så signere samtykkeerklæring <strong>for</strong> Forsknings<strong>biobank</strong> <strong>for</strong> magetarmsykdommer.<br />
Du kan når som helst og uten å oppgi <strong>no</strong>en grunn trekke ditt samtykke til å<br />
delta. Prøver og in<strong>for</strong>masjonen som registreres om deg vil bli behandlet konfidensielt.<br />
Dersom du ønsker å delta eller har spørsmål til studien, kan du kontakte<br />
Mette Nåmdal Vesterhus<br />
(lege, prosjektansvarlig)<br />
Medisinsk avdeling, Haukeland Universitetssykehus<br />
5021 Bergen<br />
Telefon:<br />
e-post:<br />
<strong>Prosedyrebok</strong> ved <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong>_Versjon 03.docx Org.enhet: Norsk senter <strong>for</strong> PSC, Avd. <strong>for</strong> transplantasjonsmedisin Nivå:4<br />
Dokumentversjon: 1 Utarbeidet av: Hege Dahlen Sollid Godkj. av: Tom Hemming Karlsen Dato: 18.06.13 Side 46 av 96
Skjema <strong>for</strong> samtykke til <strong>for</strong>skning<br />
- Voksne over 16 år<br />
Forskningsområde<br />
Gastroenterologi<br />
Prosjektleders navn<br />
Klinikk/avdeling<br />
Prosjektnummer<br />
Mette Vesterhus<br />
Medisinsk avdeling<br />
All <strong>for</strong>skningsdeltakelse er frivillig. Dersom du ønsker å delta, undertegner du denne<br />
samtykkeerklæringen. Om du nå sier ja til å delta, kan du senere når som helst og uten å<br />
oppgi <strong>no</strong>en grunn, trekke tilbake ditt samtykke uten at det påvirker din øvrige behandling.<br />
Dersom du senere ønsker å trekke deg eller har spørsmål om <strong>for</strong>skningen, kan du kontakte<br />
prosjektleder.<br />
Jeg er villig til å delta i en prospektiv studie av primær skleroserende cholangitt. □<br />
Navn med blokkbokstaver<br />
Fødselsnummer (11 siffer)<br />
Dato<br />
Underskrift<br />
Jeg bekrefter å ha gitt in<strong>for</strong>masjon om prospektiv studie av primær skleroserende cholangitt<br />
Dato Underskrift Brukerkode (4-<br />
tegnskode)<br />
Eventuelle kommentarer:<br />
<strong>Prosedyrebok</strong> ved <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong>_Versjon 03.docx Org.enhet: Norsk senter <strong>for</strong> PSC, Avd. <strong>for</strong> transplantasjonsmedisin Nivå:4<br />
Dokumentversjon: 1 Utarbeidet av: Hege Dahlen Sollid Godkj. av: Tom Hemming Karlsen Dato: 18.06.13 Side 47 av 96
Vedlegg 5: PSC-40 skjema (PBC-40 adaptert <strong>for</strong> PSC)<br />
<strong>Prosedyrebok</strong> ved <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong>_Versjon 03.docx Org.enhet: Norsk senter <strong>for</strong> PSC, Avd. <strong>for</strong> transplantasjonsmedisin Nivå:4<br />
Dokumentversjon: 1 Utarbeidet av: Hege Dahlen Sollid Godkj. av: Tom Hemming Karlsen Dato: 18.06.13 Side 48 av 96
<strong>Prosedyrebok</strong> ved <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong>_Versjon 03.docx Org.enhet: Norsk senter <strong>for</strong> PSC, Avd. <strong>for</strong> transplantasjonsmedisin Nivå:4<br />
Dokumentversjon: 1 Utarbeidet av: Hege Dahlen Sollid Godkj. av: Tom Hemming Karlsen Dato: 18.06.13 Side 49 av 96
<strong>Prosedyrebok</strong> ved <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong>_Versjon 03.docx Org.enhet: Norsk senter <strong>for</strong> PSC, Avd. <strong>for</strong> transplantasjonsmedisin Nivå:4<br />
Dokumentversjon: 1 Utarbeidet av: Hege Dahlen Sollid Godkj. av: Tom Hemming Karlsen Dato: 18.06.13 Side 50 av 96
<strong>Prosedyrebok</strong> ved <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong>_Versjon 03.docx Org.enhet: Norsk senter <strong>for</strong> PSC, Avd. <strong>for</strong> transplantasjonsmedisin Nivå:4<br />
Dokumentversjon: 1 Utarbeidet av: Hege Dahlen Sollid Godkj. av: Tom Hemming Karlsen Dato: 18.06.13 Side 51 av 96
Vedlegg 6: IPSCSG pruritus skjema<br />
<strong>Prosedyrebok</strong> ved <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong>_Versjon 03.docx Org.enhet: Norsk senter <strong>for</strong> PSC, Avd. <strong>for</strong> transplantasjonsmedisin Nivå:4<br />
Dokumentversjon: 1 Utarbeidet av: Hege Dahlen Sollid Godkj. av: Tom Hemming Karlsen Dato: 18.06.13 Side 52 av 96
<strong>Prosedyrebok</strong> ved <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong>_Versjon 03.docx Org.enhet: Norsk senter <strong>for</strong> PSC, Avd. <strong>for</strong> transplantasjonsmedisin Nivå:4<br />
Dokumentversjon: 1 Utarbeidet av: Hege Dahlen Sollid Godkj. av: Tom Hemming Karlsen Dato: 18.06.13 Side 53 av 96
<strong>Prosedyrebok</strong> ved <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong>_Versjon 03.docx Org.enhet: Norsk senter <strong>for</strong> PSC, Avd. <strong>for</strong> transplantasjonsmedisin Nivå:4<br />
Dokumentversjon: 1 Utarbeidet av: Hege Dahlen Sollid Godkj. av: Tom Hemming Karlsen Dato: 18.06.13 Side 54 av 96
<strong>Prosedyrebok</strong> ved <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong>_Versjon 03.docx Org.enhet: Norsk senter <strong>for</strong> PSC, Avd. <strong>for</strong> transplantasjonsmedisin Nivå:4<br />
Dokumentversjon: 1 Utarbeidet av: Hege Dahlen Sollid Godkj. av: Tom Hemming Karlsen Dato: 18.06.13 Side 55 av 96
Vedlegg 7: Forespørsel om å gi nye blodprøver til <strong>for</strong>skningsprosjekt<br />
Utfylt skjema returneres til Immu<strong>no</strong>logisk institutt.<br />
Vennligst returner så snart som mulig. Bruk vedlagte frankerte konvolutt.<br />
FORESPØRSEL OM Å GI NYE BLODPRØVER TIL FORSKNINGSPROSJEKT<br />
Stiles kun til personer som er med i Det <strong>no</strong>rske benmargsgiverregisteret og <strong>for</strong>sknings<strong>biobank</strong>en.<br />
EKSTRA BLODPRØVER TIL FORSKNINGSBIOBANK FOR CELLULÆRE OG MOLEKYLÆRE<br />
FORSKNINGSPROGRAMMER<br />
Prosjektleder: Dr.philos. Benedicte A. Lie, Immu<strong>no</strong>logisk institutt, Rikshospitalet<br />
Du har tidligere vervet deg til Det <strong>no</strong>rske benmargsgiverregisteret og sagt ja til å la din blodprøve<br />
inngå i en <strong>for</strong>sknings<strong>biobank</strong> på Immu<strong>no</strong>logisk institutt (IMMI) ved Rikshospitalet Universitetssykehus.<br />
Vi henvender oss til deg nå <strong>for</strong> å spørre om du vil gi oss nye blodprøver til vårt <strong>no</strong>rmalmateriale. Vi<br />
spør også om du vil fylle ut et kort spørreskjema med syv enkle spørsmål om røykevaner.<br />
Spørreskjemaet om røykevaner fylles ut ved prøvetakning.<br />
Våre <strong>for</strong>skere trenger blodprøver fra friske personer som kan utgjøre et kontrollmateriale<br />
(<strong>no</strong>rmalmateriale). IMMI driver en rekke ulike studier <strong>for</strong> å <strong>for</strong>stå sykdommer og finne nye<br />
behandlings<strong>for</strong>mer. I den <strong>for</strong>bindelse undersøker vi ulike celletyper, proteiner, DNA og RNA fra<br />
blodprøver. Ved slike studier trenger vi et <strong>no</strong>rmalmateriale som prøvesvarene fra pasientene kan<br />
sammenlignes med, og blodprøvene vi ønsker å ta nå gjør at vi kan gjen<strong>no</strong>mføre flere typer analyser<br />
enn i det materialet vi allerede har. Tilsvarende kan opplysninger om røykevaner hos friske brukes i<br />
studier av betydningen av røyking ved <strong>for</strong>skjellige sykdommer.<br />
Blodprøvene vi ønsker å ta skal håndteres etter spesielle prosedyrer, slik at de må tas på<br />
Rikshospitalet. Du vil få kompensasjon <strong>for</strong> reiseutgifter (offentlig kommunikasjon eller egen bil (etter<br />
Statens satser)).<br />
Forsknings<strong>biobank</strong>en oppfyller kravene til Lov om <strong>biobank</strong> og har godkjennelse av Regional etisk<br />
komité, er meldt til Personver<strong>no</strong>mbudet <strong>for</strong> <strong>for</strong>skning og til Sosial- og helsedirektoratet.<br />
Det er frivillig å delta og du kan når som helst trekke din prøve uten å oppgi grunn, uten at dette har<br />
<strong>no</strong>en betydning <strong>for</strong> din deltagelse i Benmargsgiverregisteret, <strong>for</strong> deg som blodgiver eller ditt <strong>for</strong>hold til<br />
Rikshospitalet. Så lenge det finnes prøvemateriale i vår <strong>for</strong>sknings<strong>biobank</strong>, vil prøvene være<br />
tilgjengelig <strong>for</strong> <strong>for</strong>skerne ved IMMI, evt. <strong>for</strong>skere ved andre institusjoner vi samarbeider med nasjonalt<br />
og internasjonalt. Forsknings<strong>biobank</strong>en med database skal oppbevares til 31.12.2025. På dette<br />
tidspunkt vil datamaterialet bli a<strong>no</strong>nymisert, eller det vil bli innhentet nødvendige tillatelser til videre<br />
oppbevaring.<br />
Samtykkeerklæring:<br />
Jeg samtykker i at jeg kan bli kontaktet <strong>for</strong> å gjøre avtale om når jeg kan møte på Rikshospitalet <strong>for</strong><br />
prøvetakning og utfylling av spørreskjema som kan inngå i <strong>for</strong>sknings<strong>biobank</strong>en.<br />
Personnummer<br />
Telefonnummer (dagtid)<br />
Dato<br />
Navn (BLOKKBOKSTAVER)<br />
Mobiltelefonnummer<br />
Underskrift<br />
<strong>Prosedyrebok</strong> ved <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong>_Versjon 03.docx Org.enhet: Norsk senter <strong>for</strong> PSC, Avd. <strong>for</strong> transplantasjonsmedisin Nivå:4<br />
Dokumentversjon: 1 Utarbeidet av: Hege Dahlen Sollid Godkj. av: Tom Hemming Karlsen Dato: 18.06.13 Side 56 av 96
Vedlegg 8: Forespørsel om deltakelse i <strong>for</strong>skning “Tarmsykdommer”<br />
Forespørsel om deltakelse i <strong>for</strong>skning<br />
“Tarmsykdommer”<br />
Bakgrunn og hensikt<br />
Dette er et spørsmål til deg om å delta i <strong>for</strong>skning <strong>for</strong> å øke kunnskapen om<br />
tarmsykdommer. Leger og <strong>for</strong>skere ved Rikshospitalet arbeider hele tiden <strong>for</strong> å <strong>for</strong>bedre<br />
<strong>for</strong>ståelsen av årsaken til tarmsykdommer og <strong>for</strong> å <strong>for</strong>bedre diag<strong>no</strong>stikk og behandling av<br />
slike tilstander. Resultatene av <strong>for</strong>skningen kan gi oss verdifull kunnskap og <strong>for</strong>ståelse av<br />
mekanismer som kan ha betydning <strong>for</strong> framtidig oppfølging og behandling av pasientene.<br />
Hva innebærer deltakelse i studiene<br />
I <strong>for</strong>bindelse med utredning og behandling av din sykdom kan det bli nødvendig å ta prøver<br />
av blod, urin og andre kroppsvæsker og også vevsprøver <strong>for</strong> å stille diag<strong>no</strong>sen og bestemme<br />
riktig behandling. Vi spør deg om du vil gi tillatelse til:<br />
at deler av prøvene som blir til overs kan oppbevares til senere bruk i <strong>for</strong>skning på<br />
tarmsykdommer<br />
at blod- og/eller vevsprøver som allerede finnes ved Rikshospitalets laboratorier, tatt i<br />
<strong>for</strong>bindelse med tidligere undersøkelser og behandling eller <strong>for</strong>skningsprosjekt, også kan<br />
benyttes i <strong>for</strong>skningen<br />
å ta ekstra blodprøver til studier av ulike komponenter av mulig betydning <strong>for</strong> utvikling<br />
av tarmsykdommer<br />
å ta ekstra avføringsprøve <strong>for</strong> undersøkelse av om bakteriesammensetningen er av<br />
betydning <strong>for</strong> utvikling av tarmsykdommer<br />
å ta ekstra vevsprøver fra tarmen og magesekken dersom vi uansett må undersøke<br />
denne<br />
Mulige <strong>for</strong>deler og ulemper<br />
Resultatene av <strong>for</strong>skningen vil ikke ha direkte betydning <strong>for</strong> din behandling på det<br />
nåværende tidspunkt, men de vil danne grunnlag <strong>for</strong> bedre behandlingstilbud <strong>for</strong> pasienter<br />
med tarmsykdommer i framtiden. Blodprøven og avføringsprøven kan som oftest tas<br />
samtidig med andre planlagte prøver. Dersom dette ikke passer, må de tas separat.<br />
Hva skjer med prøvene og in<strong>for</strong>masjonen om deg<br />
Kodenummer. Prøvene tatt av deg og in<strong>for</strong>masjonen som registreres om deg skal kun<br />
brukes slik som beskrevet i denne in<strong>for</strong>masjonen. Prøvene blir merket med et kodenummer<br />
og vil bli behandlet uten navn og fødselsnummer eller andre direkte gjenkjennende<br />
opplysninger. Listen som knytter ditt navn til kodenummeret vil bli oppbevart separat. Det er<br />
kun autorisert personell knyttet til <strong>for</strong>skningsprosjektene som har adgang til navnelisten og<br />
som kan finne tilbake til deg.<br />
Det vil ikke være mulig å identifisere deg i resultatene av studiene når disse publiseres.<br />
Biobank. Prøvene vil bli lagret i en <strong>for</strong>sknings<strong>biobank</strong> ved Rikshospitalet. Biobanken er<br />
tilrådd av Regional etisk komité <strong>for</strong> medisinsk og helsefaglig <strong>for</strong>skningsetikk og godkjent av<br />
Helsedirektoratet.<br />
<strong>Prosedyrebok</strong> ved <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong>_Versjon 03.docx Org.enhet: Norsk senter <strong>for</strong> PSC, Avd. <strong>for</strong> transplantasjonsmedisin Nivå:4<br />
Dokumentversjon: 1 Utarbeidet av: Hege Dahlen Sollid Godkj. av: Tom Hemming Karlsen Dato: 18.06.13 Side 57 av 96
Opplysninger fra pasientjournal og kopling til andre registre. Opplysningene dine kan ikke<br />
inngå i <strong>no</strong>en <strong>for</strong>m <strong>for</strong> <strong>for</strong>skning før det enkelte prosjekt er tilrådd av Personver<strong>no</strong>mbudet <strong>for</strong><br />
<strong>for</strong>skning ved Rikshospitalet HF, samt godkjent av Regional etisk komité <strong>for</strong> medisinsk og<br />
helsefaglig <strong>for</strong>skningsetikk. En effektiv utnyttelse av prøvene i <strong>for</strong>skningsøyemed vil kunne<br />
medføre behov <strong>for</strong> å sammenstille <strong>for</strong>skningsdata knyttet til prøvene med opplysninger fra<br />
din pasientjournal ved Rikshospitalet eller annet sykehus du behandles ved, eventuelt også<br />
med journal ved andre helseinstitusjoner eller hos fastlege. Det kan også være aktuelt å<br />
koble <strong>for</strong>skningsdata med andre registre (eksempelvis Kreftregisteret, Dødsårsaksregisteret,<br />
Medisinsk fødselsregister eller Folkeregisteret). Slik kobling vil bare skje etter <strong>for</strong>utgående<br />
godkjenning fra Datatilsynet og Regional etisk komité <strong>for</strong> medisinsk og helsefaglig<br />
<strong>for</strong>skningsetikk. Alle data lagres i henhold til prosedyrer som er godkjent av<br />
Personver<strong>no</strong>mbudet ved Rikshospitalet HF.<br />
Utlevering av materiale og opplysninger til andre. Forskning skjer gjerne ved samarbeid<br />
mellom ulike institusjoner og <strong>for</strong>egår ofte over landegrensene. Det kan der<strong>for</strong> bli aktuelt å<br />
sende avidentifiserte opplysninger og prøver (tildelt kodenummer som kun kan spores<br />
tilbake til din person av den <strong>no</strong>rske prosjektlederen) til samarbeidspartnere ved andre<br />
institusjoner og industrielle samarbeidspartnere både i Norge og i utlandet. Dette kan være<br />
land med lover som ikke tilfredsstiller europeisk personvernlovgivning.<br />
Frivillig deltakelse<br />
Det er frivillig å delta i studiene. Du kan når som helst og uten å oppgi <strong>no</strong>en grunn trekke ditt<br />
samtykke til å delta. Dette vil ikke få konsekvenser <strong>for</strong> din videre behandling. Dersom du<br />
ønsker å delta, undertegner du samtykkeerklæringen på siste side. Dersom du senere ønsker<br />
å trekke deg eller har spørsmål til studiene, kan du kontakte overlege, dr. med. Knut Lundin,<br />
professor Pål Aukrust eller lege, PhD Tom Hemming Karlsen, Medisinsk avd., Rikshospitalet,<br />
tlf. 23 07 00 00.<br />
Ytterligere in<strong>for</strong>masjon om studiene finnes i kapittel A – utdypende <strong>for</strong>klaring av hva<br />
studiene innebærer.<br />
Ytterligere in<strong>for</strong>masjon om <strong>biobank</strong>, personvern og <strong>for</strong>sikring finnes i kapittel B –<br />
Personvern, <strong>biobank</strong>, øko<strong>no</strong>mi og <strong>for</strong>sikring.<br />
Samtykkeerklæring følger etter kapittel B.<br />
Kapittel A- utdypende <strong>for</strong>klaring av hva deltakelse i <strong>for</strong>skning innebærer<br />
Hvem blir <strong>for</strong>espurt om å delta i <strong>for</strong>skning på “Tarm<strong>for</strong>skning”<br />
Pasienter som er henvist til Rikshospitalet eller andre sykehus i Norge til utredning og/eller<br />
behandling <strong>for</strong> tarmsykdommer og deres nære slektninger kan bli <strong>for</strong>espurt om å gi sitt<br />
samtykke til deltakelse i studiene.<br />
Bakgrunnsin<strong>for</strong>masjon om studiene<br />
Årsaken til mange tarmsykdommer er ukjent. Gener er av betydning <strong>for</strong> utviklingen av flere<br />
av disse sykdommene, men sannsynligvis spiller også andre faktorer en viktig rolle. Vi ønsker<br />
å kartlegge videre hvilke gener som kan bidra til utvikling og <strong>for</strong>løp av tarmsykdommer og<br />
hvordan gener kan samspille med immunsystemet, tarmfloraen eller andre faktorer. Økt<br />
<strong>for</strong>ståelse av sykdomsmekanismene kan gi grunnlag <strong>for</strong> bedre oppfølging og behandling av<br />
pasienter med slike sykdommer.<br />
<strong>Prosedyrebok</strong> ved <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong>_Versjon 03.docx Org.enhet: Norsk senter <strong>for</strong> PSC, Avd. <strong>for</strong> transplantasjonsmedisin Nivå:4<br />
Dokumentversjon: 1 Utarbeidet av: Hege Dahlen Sollid Godkj. av: Tom Hemming Karlsen Dato: 18.06.13 Side 58 av 96
For å få bedre <strong>for</strong>ståelse av hvor<strong>for</strong> pasienter med ulike sykdomstilstander utvikler<br />
betennelse i tarmen vil vi kartlegge <strong>for</strong>andringer i tarmen og bakteriefloraen hos pasienter<br />
som har samtidig tarmbetennelse. Noen ganske få pasienter med tarmsykdom utvikler<br />
komplikasjoner i <strong>for</strong>m av <strong>for</strong>stadier til kreft eller kreft. Vi vil arbeide med å utvikle metoder<br />
<strong>for</strong> å kunne påvise tidlige stadier av kreft, slik at behandling kan iverksettes så tidlig som<br />
mulig.<br />
Prøver fra blod, vevsvæsker og vev<br />
Blodprøver og evt. avføringsprøve kan som regel tas i <strong>for</strong>bindelse med at det skal tas prøver<br />
som ledd i utredning eller behandling. Dersom dette ikke passer, ber vi om å få ta ekstra<br />
prøver på vanlig måte. Andre vevsvæsker og vevsprøver vil bare tas i <strong>for</strong>bindelse med<br />
prosedyrer som er planlagt i <strong>for</strong>bindelse med utredning eller behandling (<strong>for</strong> eksempel<br />
tarmundersøkelse v/kolo<strong>no</strong>skopi og/eller gastroskopi).<br />
Mulige <strong>for</strong>deler<br />
Resultatene av <strong>for</strong>skningen vil ikke ha direkte betydning <strong>for</strong> din behandling på det<br />
nåværende tidspunkt, men de vil danne grunnlag <strong>for</strong> bedre behandlingstilbud <strong>for</strong> pasienter<br />
med tarmsykdommer i framtiden. Dette kan også komme deg til nytte.<br />
Mulige ubehag/ulemper<br />
Bortsett fra at det kan bli aktuelt å ta en ekstra blodprøve, mener vi at deltakelse i studiene<br />
ikke vil medføre ekstra ubehag eller ulemper <strong>for</strong> deg.<br />
Ny in<strong>for</strong>masjon som kan påvirke studiene<br />
Dersom ny in<strong>for</strong>masjon blir tilgjengelig som kan påvirke din villighet til å delta i studiene, vil<br />
du bli orientert så raskt som mulig.<br />
Kapittel B - Personvern, <strong>biobank</strong>, øko<strong>no</strong>mi og <strong>for</strong>sikring<br />
Personvern<br />
Opplysninger som registreres om deg vil gjelde <strong>for</strong>hold som vi mener kan være av betydning<br />
<strong>for</strong> utvikling og <strong>for</strong>løp av tarmsykdom. Dette vil også inkludere opplysninger om andre<br />
tilstander som av og til ses samtidig med tarmsykdommer (<strong>for</strong> eksempel <strong>for</strong>styrrelser i<br />
immunapparatet). Vi vil registrere symptomer, blodprøvesvar, funn ved andre typer<br />
undersøkelser (<strong>for</strong> eksempel røntgenundersøkelser) og behandling som er gitt. Vi vil primært<br />
benytte opplysninger fra din journal ved Rikshospitalet. Av og til vil det være nødvendig å<br />
innhente supplerende opplysninger av tilsvarende type fra journal hos fastlege eller annen<br />
helseinstitusjon.<br />
I enkelte prosjekter kan det bli aktuelt å koble <strong>for</strong>skningsdata til andre registre. Slik kobling<br />
vil bare skje etter <strong>for</strong>utgående godkjenning av Datatilsynet og Regional etisk komité <strong>for</strong><br />
medisinsk og helsefaglig <strong>for</strong>skningsetikk. Opplysninger fra aktuelle registre omfatter:<br />
eventuell kreft<strong>for</strong>ekomst (Kreftregisteret), dødsårsak (Dødsårsaksregisteret), medisinske<br />
<strong>for</strong>hold rundt fødsel (Medisinsk fødselsregister) og bosted (Folkeregisteret). Alle data lagres i<br />
henhold til prosedyrer som er godkjent av Personver<strong>no</strong>mbudet.<br />
Rikshospitalet HF ved administrerende direktør er databehandlingsansvarlig.<br />
Biobank<br />
Prøver fra blod, avføring, andre vevsvæsker og vev og in<strong>for</strong>masjonen utledet av dette<br />
materialet vil bli lagret i en <strong>for</strong>sknings<strong>biobank</strong> ved Rikshospitalet. Hvis du sier ja til å delta i<br />
<strong>Prosedyrebok</strong> ved <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong>_Versjon 03.docx Org.enhet: Norsk senter <strong>for</strong> PSC, Avd. <strong>for</strong> transplantasjonsmedisin Nivå:4<br />
Dokumentversjon: 1 Utarbeidet av: Hege Dahlen Sollid Godkj. av: Tom Hemming Karlsen Dato: 18.06.13 Side 59 av 96
studiene, gir du også samtykke til at det biologiske materialet og analyseresultater inngår i<br />
<strong>biobank</strong>en. Overlege, dr. med. Knut Lundin er ansvarshavende <strong>for</strong> <strong>for</strong>sknings<strong>biobank</strong>en.<br />
Biobanken og helseopplysningene planlegges å lagres i første omgang til 2032. Det kan bli<br />
aktuelt å søke om <strong>for</strong>lenget oppbevaring, og vi ber der<strong>for</strong> om å kunne komme tilbake <strong>for</strong> å<br />
be om slik <strong>for</strong>lengelse. Når <strong>for</strong>skningsprosjektet avsluttes, vil materiale og opplysninger bli<br />
destruert og slettet etter interne retningslinjer.<br />
Utlevering av materiale og opplysninger til andre<br />
Hvis du sier ja til å delta i studiene, gir du også ditt samtykke til at prøver og avidentifiserte<br />
opplysninger utleveres til <strong>for</strong>skningsgrupper vi samarbeider med. Vi samarbeider i størst<br />
utstrekning med <strong>for</strong>skningsgrupper innen EU, men samarbeidet kan også gjelde land med<br />
lover som ikke tilfredsstiller europeisk personvernlovgivning. Utveksling vil kun skje etter at<br />
man har etablert kontrakt med samarbeidende <strong>for</strong>skningsinstitusjon som sikrer at materialet<br />
blir korrekt ivaretatt.<br />
Rett til innsyn og sletting av opplysninger om deg og sletting av prøver<br />
Hvis du sier ja til å delta i studiene, har du rett til å få innsyn i hvilke opplysninger som er<br />
registrert om deg. Du har videre rett til å få korrigert eventuelle feil i de opplysningene vi har<br />
registrert. Dersom du trekker deg fra studiene, kan du kreve å få slettet innsamlede prøver<br />
og opplysninger. Opplysninger som allerede er publisert kan imidlertid ikke slettes fra<br />
eventuelle publikasjoner.<br />
Øko<strong>no</strong>mi<br />
Prosjektet og <strong>biobank</strong>en er finansiert gjen<strong>no</strong>m <strong>for</strong>skningsmidler fra ulike kilder (<strong>for</strong> eksempel<br />
Helse-Sør Øst og Forskningsrådet). Prosjektet er ikke ment å gi øko<strong>no</strong>misk avkastning.<br />
Prosjektansvarlig og andre som arbeider med prosjektet har ingen <strong>for</strong>m <strong>for</strong> øko<strong>no</strong>misk<br />
vinning knyttet til prosjektet.<br />
Forsikring<br />
Du har vanlige pasientrettigheter som ledd i din kontakt med helseinstitusjonen og eventuell<br />
søknad til Norsk pasientskadeerstatning kan sendes på vanlig måte. Det er ingen spesiell<br />
<strong>for</strong>sikring knyttet til prosjektene.<br />
In<strong>for</strong>masjon om utfallet av studiene<br />
Deltakerene har rett til å få in<strong>for</strong>masjon om resultatene av studiene som utføres. I hovedsak<br />
vil resultatene bli tilgjengelige som publikasjoner i internasjonale vitenskapelige tidsskrift.<br />
<strong>Prosedyrebok</strong> ved <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong>_Versjon 03.docx Org.enhet: Norsk senter <strong>for</strong> PSC, Avd. <strong>for</strong> transplantasjonsmedisin Nivå:4<br />
Dokumentversjon: 1 Utarbeidet av: Hege Dahlen Sollid Godkj. av: Tom Hemming Karlsen Dato: 18.06.13 Side 60 av 96
Samtykke til deltakelse i studiene<br />
Navnelapp:<br />
Jeg er villig til å delta i studiene “Tarmsykdommer”.<br />
----------------------------------------------------------------------------------------------------------------<br />
(Signert av prosjektdeltaker, dato)<br />
Sted<strong>for</strong>tredende samtykke når berettiget, enten i tillegg til personen selv eller isteden<strong>for</strong><br />
(Signert av nærstående, dato)<br />
Jeg bekrefter å ha gitt in<strong>for</strong>masjon om studiene<br />
----------------------------------------------------------------------------------------------------------------<br />
(Signert, medlem av prosjektledelsen, dato)<br />
<strong>Prosedyrebok</strong> ved <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong>_Versjon 03.docx Org.enhet: Norsk senter <strong>for</strong> PSC, Avd. <strong>for</strong> transplantasjonsmedisin Nivå:4<br />
Dokumentversjon: 1 Utarbeidet av: Hege Dahlen Sollid Godkj. av: Tom Hemming Karlsen Dato: 18.06.13 Side 61 av 96
Vedlegg 9: Skjemaer ved prøvetaking til Biobankprosjekt Tarm<br />
<strong>Prosedyrebok</strong> ved <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong>_Versjon 03.docx Org.enhet: Norsk senter <strong>for</strong> PSC, Avd. <strong>for</strong> transplantasjonsmedisin Nivå:4<br />
Dokumentversjon: 1 Utarbeidet av: Hege Dahlen Sollid Godkj. av: Tom Hemming Karlsen Dato: 18.06.13 Side 62 av 96
<strong>Prosedyrebok</strong> ved <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong>_Versjon 03.docx Org.enhet: Norsk senter <strong>for</strong> PSC, Avd. <strong>for</strong> transplantasjonsmedisin Nivå:4<br />
Dokumentversjon: 1 Utarbeidet av: Hege Dahlen Sollid Godkj. av: Tom Hemming Karlsen Dato: 18.06.13 Side 63 av 96
<strong>Prosedyrebok</strong> ved <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong>_Versjon 03.docx Org.enhet: Norsk senter <strong>for</strong> PSC, Avd. <strong>for</strong> transplantasjonsmedisin Nivå:4<br />
Dokumentversjon: 1 Utarbeidet av: Hege Dahlen Sollid Godkj. av: Tom Hemming Karlsen Dato: 18.06.13 Side 64 av 96
<strong>Prosedyrebok</strong> ved <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong>_Versjon 03.docx Org.enhet: Norsk senter <strong>for</strong> PSC, Avd. <strong>for</strong> transplantasjonsmedisin Nivå:4<br />
Dokumentversjon: 1 Utarbeidet av: Hege Dahlen Sollid Godkj. av: Tom Hemming Karlsen Dato: 18.06.13 Side 65 av 96
<strong>Prosedyrebok</strong> ved <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong>_Versjon 03.docx Org.enhet: Norsk senter <strong>for</strong> PSC, Avd. <strong>for</strong> transplantasjonsmedisin Nivå:4<br />
Dokumentversjon: 1 Utarbeidet av: Hege Dahlen Sollid Godkj. av: Tom Hemming Karlsen Dato: 18.06.13 Side 66 av 96
<strong>Prosedyrebok</strong> ved <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong>_Versjon 03.docx Org.enhet: Norsk senter <strong>for</strong> PSC, Avd. <strong>for</strong> transplantasjonsmedisin Nivå:4<br />
Dokumentversjon: 1 Utarbeidet av: Hege Dahlen Sollid Godkj. av: Tom Hemming Karlsen Dato: 18.06.13 Side 67 av 96
<strong>Prosedyrebok</strong> ved <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong>_Versjon 03.docx Org.enhet: Norsk senter <strong>for</strong> PSC, Avd. <strong>for</strong> transplantasjonsmedisin Nivå:4<br />
Dokumentversjon: 1 Utarbeidet av: Hege Dahlen Sollid Godkj. av: Tom Hemming Karlsen Dato: 18.06.13 Side 68 av 96
<strong>Prosedyrebok</strong> ved <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong>_Versjon 03.docx Org.enhet: Norsk senter <strong>for</strong> PSC, Avd. <strong>for</strong> transplantasjonsmedisin Nivå:4<br />
Dokumentversjon: 1 Utarbeidet av: Hege Dahlen Sollid Godkj. av: Tom Hemming Karlsen Dato: 18.06.13 Side 69 av 96
<strong>Prosedyrebok</strong> ved <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong>_Versjon 03.docx Org.enhet: Norsk senter <strong>for</strong> PSC, Avd. <strong>for</strong> transplantasjonsmedisin Nivå:4<br />
Dokumentversjon: 1 Utarbeidet av: Hege Dahlen Sollid Godkj. av: Tom Hemming Karlsen Dato: 18.06.13 Side 70 av 96
<strong>Prosedyrebok</strong> ved <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong>_Versjon 03.docx Org.enhet: Norsk senter <strong>for</strong> PSC, Avd. <strong>for</strong> transplantasjonsmedisin Nivå:4<br />
Dokumentversjon: 1 Utarbeidet av: Hege Dahlen Sollid Godkj. av: Tom Hemming Karlsen Dato: 18.06.13 Side 71 av 96
<strong>Prosedyrebok</strong> ved <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong>_Versjon 03.docx Org.enhet: Norsk senter <strong>for</strong> PSC, Avd. <strong>for</strong> transplantasjonsmedisin Nivå:4<br />
Dokumentversjon: 1 Utarbeidet av: Hege Dahlen Sollid Godkj. av: Tom Hemming Karlsen Dato: 18.06.13 Side 72 av 96
<strong>Prosedyrebok</strong> ved <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong>_Versjon 03.docx Org.enhet: Norsk senter <strong>for</strong> PSC, Avd. <strong>for</strong> transplantasjonsmedisin Nivå:4<br />
Dokumentversjon: 1 Utarbeidet av: Hege Dahlen Sollid Godkj. av: Tom Hemming Karlsen Dato: 18.06.13 Side 73 av 96
<strong>Prosedyrebok</strong> ved <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong>_Versjon 03.docx Org.enhet: Norsk senter <strong>for</strong> PSC, Avd. <strong>for</strong> transplantasjonsmedisin Nivå:4<br />
Dokumentversjon: 1 Utarbeidet av: Hege Dahlen Sollid Godkj. av: Tom Hemming Karlsen Dato: 18.06.13 Side 74 av 96
<strong>Prosedyrebok</strong> ved <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong>_Versjon 03.docx Org.enhet: Norsk senter <strong>for</strong> PSC, Avd. <strong>for</strong> transplantasjonsmedisin Nivå:4<br />
Dokumentversjon: 1 Utarbeidet av: Hege Dahlen Sollid Godkj. av: Tom Hemming Karlsen Dato: 18.06.13 Side 75 av 96
<strong>Prosedyrebok</strong> ved <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong>_Versjon 03.docx Org.enhet: Norsk senter <strong>for</strong> PSC, Avd. <strong>for</strong> transplantasjonsmedisin Nivå:4<br />
Dokumentversjon: 1 Utarbeidet av: Hege Dahlen Sollid Godkj. av: Tom Hemming Karlsen Dato: 18.06.13 Side 76 av 96
<strong>Prosedyrebok</strong> ved <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong>_Versjon 03.docx Org.enhet: Norsk senter <strong>for</strong> PSC, Avd. <strong>for</strong> transplantasjonsmedisin Nivå:4<br />
Dokumentversjon: 1 Utarbeidet av: Hege Dahlen Sollid Godkj. av: Tom Hemming Karlsen Dato: 18.06.13 Side 77 av 96
<strong>Prosedyrebok</strong> ved <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong>_Versjon 03.docx Org.enhet: Norsk senter <strong>for</strong> PSC, Avd. <strong>for</strong> transplantasjonsmedisin Nivå:4<br />
Dokumentversjon: 1 Utarbeidet av: Hege Dahlen Sollid Godkj. av: Tom Hemming Karlsen Dato: 18.06.13 Side 78 av 96
<strong>Prosedyrebok</strong> ved <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong>_Versjon 03.docx Org.enhet: Norsk senter <strong>for</strong> PSC, Avd. <strong>for</strong> transplantasjonsmedisin Nivå:4<br />
Dokumentversjon: 1 Utarbeidet av: Hege Dahlen Sollid Godkj. av: Tom Hemming Karlsen Dato: 18.06.13 Side 79 av 96
<strong>Prosedyrebok</strong> ved <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong>_Versjon 03.docx Org.enhet: Norsk senter <strong>for</strong> PSC, Avd. <strong>for</strong> transplantasjonsmedisin Nivå:4<br />
Dokumentversjon: 1 Utarbeidet av: Hege Dahlen Sollid Godkj. av: Tom Hemming Karlsen Dato: 18.06.13 Side 80 av 96
Vedlegg 10: Prøvetaking av biopsier ved Biobankprosjekt Tarm<br />
3. januar 2012<br />
BIOPSIER BIOBANKPROSJEKT TARM (Aukrust/Fevang/Karlsen/Jørgensen/Lundin)<br />
GASTROSKOPI (biopsier fra øsofagus kun ved indikasjon)<br />
Ventrikkel<br />
Merkes<br />
2 biopsier corpus fikseres i <strong>for</strong>malin G-IV<br />
1 biopsi corpus til HP test (hurtigtest hvis ikke PPI, i så fall dyrkning)<br />
2 biopsier antrum fikseres i <strong>for</strong>malin G-III<br />
1 biopsi antrum til HP test<br />
2 biopsier fra antrum til virus undersøkelse<br />
Duodenum<br />
4 biopsier duodenum nedre kne orienteres og fikseres i <strong>for</strong>malin G-I<br />
2 biopsier nedre kne til Lurium G-I<br />
2 biopsier nedre kne, orienteres fryses i OCT/flytende N2 G-I<br />
2 biopsier nedre kne, fryses “tørt” i flytende N2 G-I<br />
2 biopsier fra bulbus, orienteres og fikseres i <strong>for</strong>malin G-II<br />
2 biopsier fra bulbus til virus undersøkelse<br />
KOLOSKOPI (andre biopsier ved indikasjon)<br />
Terminale ileum<br />
3 biopsier terminale ileum fikseres i <strong>for</strong>malin K-0<br />
2 biopsier terminale ileum i Lurium K-0<br />
2 biopsier terminale ileum, orienteres og fryses i OCT/flytende N2 K-0<br />
2 biopsier terminale ileum, fryses “tørt” i flytende N2<br />
Kolon ascendens<br />
3 biopsier fikseres i <strong>for</strong>malin K-II<br />
2 biopsier i Lurium K-II<br />
2 biopsier orienteres og fryses i OCT/flytende N2 K-II<br />
2 biopsier fryses “tørt” i flytende N2<br />
Kolon transversum<br />
3 biopsier fikseres i <strong>for</strong>malin K-IV<br />
Kolon descendens<br />
3 biopsier fikseres i <strong>for</strong>malin K-VI<br />
Kolon sigmoideum<br />
3 biopsier fikseres i <strong>for</strong>malin K-VII<br />
2 biopsier i Lurium K-VII<br />
2 biopsier orienteres og fryses i OCT/flytende N2 K-VII<br />
2 biopsier til virus undersøkelse<br />
Rectum<br />
3 biopsier fikseres i <strong>for</strong>malin K-VIII<br />
2 biopsier i Lurium K-VIII<br />
2 biopsier orienteres og fryses i OCT/flytende N2 K-VIII<br />
2 biopsier fryses “tørt” i flytende N2<br />
Eget system <strong>for</strong> arkivering av disse biopsiene er etablert. Bokser som ved IBSEN-II.<br />
<strong>Prosedyrebok</strong> ved <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong>_Versjon 03.docx Org.enhet: Norsk senter <strong>for</strong> PSC, Avd. <strong>for</strong> transplantasjonsmedisin Nivå:4<br />
Dokumentversjon: 1 Utarbeidet av: Hege Dahlen Sollid Godkj. av: Tom Hemming Karlsen Dato: 18.06.13 Side 81 av 96
Vedlegg 11: Prøvetaking til <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong> - Blodprøver<br />
PRØVETAKING TIL <strong>NoPSC</strong> BIOBANK<br />
Blodprøver<br />
Pasientinfo (navnelapp):<br />
Prøvetakingsdato/kl:<br />
Er pasienten fastende: Ja / Nei<br />
Prøvetaker (Sign):<br />
Registrert:<br />
Medinsight<br />
Samtykkedatabase<br />
Antall alikvoter:<br />
EDTA plasma<br />
BD P100 plasma, lot nr:<br />
Serum<br />
<strong>Prosedyrebok</strong> ved <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong>_Versjon 03.docx Org.enhet: Norsk senter <strong>for</strong> PSC, Avd. <strong>for</strong> transplantasjonsmedisin Nivå:4<br />
Dokumentversjon: 1 Utarbeidet av: Hege Dahlen Sollid Godkj. av: Tom Hemming Karlsen Dato: 18.06.13 Side 82 av 96
Vedlegg 12: Prøvetaking ved <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong> - blodprøvetaking til DNA<br />
ekstraksjon<br />
<strong>Prosedyrebok</strong> ved <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong>_Versjon 03.docx Org.enhet: Norsk senter <strong>for</strong> PSC, Avd. <strong>for</strong> transplantasjonsmedisin Nivå:4<br />
Dokumentversjon: 1 Utarbeidet av: Hege Dahlen Sollid Godkj. av: Tom Hemming Karlsen Dato: 18.06.13 Side 83 av 96
Vedlegg 13: Prøvetaking av urinprøve til prosjekt – brev til deltaker<br />
Kjære prosjektdeltager<br />
Vedlagt følger et nummerert urinprøveglass og en Ziplock pose til å oppbevare og transportere<br />
urinprøven. Prøveglasset og skjemaet er merket med et unikt nummer og navn.<br />
Urinprøvetaking morgenurin:<br />
1. Vask rundt urinrørsåpningen med mild såpe og vann.<br />
2. Ta midtstråleprøve: la den første urinen gå i toalettet, lat vannet i uri<strong>no</strong>ppsamlingsglasset. Ca<br />
20 ml er tilstrekkelig (ca halvfullt glass, men mindre mengde fungerer også bra), resten av<br />
urinen kan gå i toalettet.<br />
3. Prøveglasset rengjøres om nødvendig på utsiden og legges i vedlagte Ziplock plastpose.<br />
4. Urinprøven må ikke oppbevares i romtemperatur, men settes i kjøleskap etter at den er tatt.<br />
5. Merk prøvetakningsskjema med dato og klokkeslett <strong>for</strong> når prøven ble tatt (samme skjema<br />
som <strong>for</strong> avføringsprøven).<br />
6. Urinprøven leveres samtidig med blodprøvetakingen.<br />
Med vennlig hilsen,<br />
(Prosjektleder)<br />
<strong>Prosedyrebok</strong> ved <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong>_Versjon 03.docx Org.enhet: Norsk senter <strong>for</strong> PSC, Avd. <strong>for</strong> transplantasjonsmedisin Nivå:4<br />
Dokumentversjon: 1 Utarbeidet av: Hege Dahlen Sollid Godkj. av: Tom Hemming Karlsen Dato: 18.06.13 Side 84 av 96
Vedlegg 14: Prøvetaking av avføringsprøver til prosjekt – brev til deltaker<br />
Kjære prosjektdeltager<br />
Vedlagt finner du utstyr <strong>for</strong> prøvetaking og <strong>for</strong>sendelse av avføringsprøve:<br />
<br />
<br />
<br />
<br />
<br />
<br />
Instruksjon <strong>for</strong> prøvetaking og <strong>for</strong>sendelse<br />
Prøvetakingsskjema med spørsmål som du må fylle ut og sende sammen med<br />
prøven<br />
2 stk avføringsoppsamler til toalettskålen (1 er reserve)<br />
2 prøvetakingsrør; 1 tomt rør (rød el. blå kork) og 1 rør med stabiliseringsvæske<br />
(brun kork)<br />
2 stk Ziplock plastposer til å beskytte prøvene under oppbevaring/transport<br />
Ferdigfrankert returkonvolutt<br />
Med vennlig hilsen,<br />
(Prosjektleder)<br />
Instruksjon <strong>for</strong> prøvetaking av avføringsprøve<br />
Vennligst les gjen<strong>no</strong>m punkt 1-9 før prøvetaking.<br />
NB:<br />
<br />
<br />
<br />
Vent med å ta prøven hvis du står på antibiotika, helst 2 uker etter siste tablett.<br />
Avføringsprøven kan postlegges kun mandag t.o.m. onsdag og bør ikke være mer en<br />
24 timer gammel ved postlegging. Dette er viktig <strong>for</strong>di prøven blir ødelagt etter 3<br />
døgn.<br />
Prøveglassene og skjemaet er merket med et unikt nummer og navn.<br />
1. Pass på å late vannet først slik at det ikke kommer urin i avføringsoppsamleren<br />
2. Klargjør avføringsoppsamleren og plasser på toalettsetet som angitt i figurene<br />
nederst.<br />
3. Sett deg ned på toalettet og samle avføringen direkte i avføringsoppsamleren.<br />
(Dersom det ved et uhell kommer urin sammen med avføringen, gjøre et nytt <strong>for</strong>søk<br />
senere med den andre avføringsoppsamleren som er i pakken).<br />
4. I lokket på prøvetakingssrøret er det festet en plastskje. Ved hjelp av skjeen tas<br />
avføringen over i prøvetagningsrøret. Ikke overfør mer enn én skje avføring til røret!<br />
5. Skru korken godt igjen! Pass godt på at gjengene treffer.<br />
6. Rist prøveglasset så prøveløsningen blir mest mulig oppløst/jevn (avføringen vil<br />
likevel sjelden løse seg helt opp).<br />
7. Prøveglasset rengjøres om nødvendig på utsiden og legges i vedlagte Ziplock<br />
plastposer, bruk 2 poser utenpå hverandre.<br />
8. Fyll ut vedlagte prøvetakingsskjema og legg sammen med Ziplock plastposen inn i<br />
svarsendingskonvolutten. Prøveglasset og skjemaet er allerede merket med et unikt<br />
nummer og trenger ikke merkes med navn.<br />
<strong>Prosedyrebok</strong> ved <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong>_Versjon 03.docx Org.enhet: Norsk senter <strong>for</strong> PSC, Avd. <strong>for</strong> transplantasjonsmedisin Nivå:4<br />
Dokumentversjon: 1 Utarbeidet av: Hege Dahlen Sollid Godkj. av: Tom Hemming Karlsen Dato: 18.06.13 Side 85 av 96
9. Send prøven samme dag eller senest påfølgende dag. Konvolutten med røret er<br />
tilpasset å kunne legges i en vanlig rød postkasse, men det kan være du må trykke<br />
litt <strong>for</strong> å få konvolutten gjen<strong>no</strong>m spalten i postkassen.<br />
Hvis du har spørsmål angående prøvetaking eller du ønsker en ekstra oppsamlingshatt kan<br />
du ringe (tlf nr) eller sende en epost til (e-post prosjektleder/koordinator).<br />
1. Legg avføringsoppsamleren på flatt underlag med papiret opp. Brett opp kantene på<br />
begge sider.<br />
2. Riv av tape-beskyttelsen på flippene på begge sider<br />
3. Sett i toalettskålen og fest flippene på toalettsetet<br />
<strong>Prosedyrebok</strong> ved <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong>_Versjon 03.docx Org.enhet: Norsk senter <strong>for</strong> PSC, Avd. <strong>for</strong> transplantasjonsmedisin Nivå:4<br />
Dokumentversjon: 1 Utarbeidet av: Hege Dahlen Sollid Godkj. av: Tom Hemming Karlsen Dato: 18.06.13 Side 86 av 96
Vedlegg 15: Kartleggingsspørsmål ved prøvetaking av avføringsprøver til<br />
prosjekt<br />
Prøvenummer: «feces_nr»<br />
(tilsvarer nummeret på røret)<br />
Prøvetakingsskjema<br />
Dette arket fylles ut og returneres sammen med avføringsprøven<br />
Husk å ikke ta prøven torsdag til lørdag, da blir den <strong>for</strong> gammel før den når frem.<br />
Spørsmål:<br />
Tidspunkt <strong>for</strong> prøvetaking: Dato:___________ Tidspunkt:_____________<br />
1. Følger du en spesiell diett Ja Nei<br />
2. Hvis ja, hvilken diett, (vegetarianer, glutenfri, lavkarbo etc.), spesifiser kort:<br />
3. Har du brukt antibiotika siste 4 uker Ja Nei<br />
4. Hvis ja, hvilken type antibiotika brukte du eventuelt da<br />
(navn)____________________________<br />
5. Hvor mange antibiotikakurer har du tatt siste året (antall og helst navn på typen)<br />
Antall: Type:<br />
6. Har du husdyr Ja Nei Hvis ja, spesifiser kort (eks: hund):<br />
7. Har du røkt daglig siste måned Ja Nei<br />
8. Har du utlagt tarm Ja Nei<br />
9. Hva er din høyde og vekt Høyde (cm):_____________ Vekt (kg):<br />
Skriv opp alle dine faste medisiner: (dose er ikke nødvendig, kun preparatnavn)<br />
Evt. kommentarer<br />
<strong>Prosedyrebok</strong> ved <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong>_Versjon 03.docx Org.enhet: Norsk senter <strong>for</strong> PSC, Avd. <strong>for</strong> transplantasjonsmedisin Nivå:4<br />
Dokumentversjon: 1 Utarbeidet av: Hege Dahlen Sollid Godkj. av: Tom Hemming Karlsen Dato: 18.06.13 Side 87 av 96
Vedlegg 16: Prøvetaking til <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong> – Børstecytologi- og galleprøver<br />
tatt ved ERCP<br />
PRØVETAKING TIL <strong>NoPSC</strong> BIOBANK<br />
Børstecytologi- og galleprøver<br />
Pasientinfo (navnelapp):<br />
Prøvetakingsdato:<br />
Fremgangsmåte:<br />
Børstecytologiprøven legges i tørt Matrixrør og slippes ned i termos med nitrogen.<br />
Galle overføres til nuncrør. La stå på is.<br />
Varsle når prøvetakingen er ferdig: calling 22185 (evt. 23871)<br />
Fylles ut av sykepleier ved ERCP lab:<br />
Hva ble tatt Kontrast tilstede: Tidspunkt<br />
Børstecytologiprøve Ja Nei<br />
Galle Ja Nei<br />
Sign <strong>for</strong> kontrollert pasient ID:<br />
Evt. kommentarer:<br />
Endoskopør:<br />
Prøvene hentet av:<br />
Prøvene <strong>for</strong>delt av:<br />
Registrert:<br />
Medinsight<br />
Samtykkedatabase<br />
<strong>Prosedyrebok</strong> ved <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong>_Versjon 03.docx Org.enhet: Norsk senter <strong>for</strong> PSC, Avd. <strong>for</strong> transplantasjonsmedisin Nivå:4<br />
Dokumentversjon: 1 Utarbeidet av: Hege Dahlen Sollid Godkj. av: Tom Hemming Karlsen Dato: 18.06.13 Side 88 av 96
Vedlegg 17: Prøvetaking til <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong> – Biopsier- og galleprøver fra<br />
eksplantert lever<br />
PRØVETAKING TIL <strong>NoPSC</strong> BIOBANK<br />
Biopsier- og galleprøver fra eksplantert lever<br />
Pasientinfo (navnelapp):<br />
Dato:<br />
Når (kl) ble lever tatt ut:<br />
Når (kl) var prøvene ferdig tatt:<br />
Hva ble tatt<br />
Leverbiopsier (SnapFreeze)<br />
Leverbiopsier (<strong>for</strong>malin)<br />
Lymfeknuter<br />
Tumor<br />
Galle<br />
Gallestein<br />
Puss<br />
Evt. kommentarer/avvik:<br />
Prøvetaker:<br />
Registrert:<br />
Samtykkedatabase<br />
Medinsight<br />
<strong>Prosedyrebok</strong> ved <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong>_Versjon 03.docx Org.enhet: Norsk senter <strong>for</strong> PSC, Avd. <strong>for</strong> transplantasjonsmedisin Nivå:4<br />
Dokumentversjon: 1 Utarbeidet av: Hege Dahlen Sollid Godkj. av: Tom Hemming Karlsen Dato: 18.06.13 Side 89 av 96
BESKRIVELSE AV PRØVER TATT VED LEVERTRANSPLANTASJON:<br />
RØR NR BESKRIVELSE TID FRA VEV ER<br />
TATT UT<br />
Rør 1<br />
Rør 2<br />
Rør 3<br />
Rør 4<br />
Rør 5<br />
Rør 6<br />
Rør 7<br />
Rør 8<br />
Rør 9<br />
Rør 10<br />
Rør 11<br />
Rør 12<br />
Rør 13<br />
Rør 14<br />
Rør 15<br />
Rør 16<br />
Rør 17<br />
Rør 18<br />
Rør 19<br />
Rør 20<br />
Rør 21<br />
Rør 22<br />
Rør 23<br />
Rør 24<br />
Rør 25<br />
Rør 26<br />
Rør 27<br />
Rør 28<br />
Rør 29<br />
Rør 30<br />
Rør 31<br />
Rør 32<br />
Rør 33<br />
Rør 34<br />
Rør 35<br />
<strong>Prosedyrebok</strong> ved <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong>_Versjon 03.docx Org.enhet: Norsk senter <strong>for</strong> PSC, Avd. <strong>for</strong> transplantasjonsmedisin Nivå:4<br />
Dokumentversjon: 1 Utarbeidet av: Hege Dahlen Sollid Godkj. av: Tom Hemming Karlsen Dato: 18.06.13 Side 90 av 96
Vedlegg 18: Registreringsskjema <strong>for</strong> endringer i prosedyrene ved <strong>NoPSC</strong><br />
<strong>biobank</strong><br />
Alle endringer som registreres i dette skjema skal føre til en versjonsoppdatering i<br />
Medinsight (f.eks fra v01 til v02). Alle prøver preparert etter denne dato skal registreres med<br />
den nye versjon. Alle tidligere preparerte prøver vil <strong>for</strong>tsatt ligge med den gamle versjonen<br />
registrert.<br />
Dato<br />
Nytt versjonsnummer<br />
Navn på protokoll som skal oppdateres<br />
Hva er endringen<br />
Hvor<strong>for</strong> gjør man denne endringen<br />
Registrert/lagt inn i Medinsight (dato,<br />
sign)<br />
Satt inn i permen (dato, sign)<br />
Endret i <strong>Prosedyrebok</strong>a (dato, sign)<br />
<strong>Prosedyrebok</strong> ved <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong>_Versjon 03.docx Org.enhet: Norsk senter <strong>for</strong> PSC, Avd. <strong>for</strong> transplantasjonsmedisin Nivå:4<br />
Dokumentversjon: 1 Utarbeidet av: Hege Dahlen Sollid Godkj. av: Tom Hemming Karlsen Dato: 18.06.13 Side 91 av 96
Vedlegg 19: Avviksskjema <strong>for</strong> prøvetaking ved <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong><br />
Dato<br />
Prøvetaker<br />
Pasientinfo (navnelapp)<br />
Avviksmelding:<br />
Dato registrert i Medinsight<br />
Signatur<br />
<strong>Prosedyrebok</strong> ved <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong>_Versjon 03.docx Org.enhet: Norsk senter <strong>for</strong> PSC, Avd. <strong>for</strong> transplantasjonsmedisin Nivå:4<br />
Dokumentversjon: 1 Utarbeidet av: Hege Dahlen Sollid Godkj. av: Tom Hemming Karlsen Dato: 18.06.13 Side 92 av 96
Vedlegg 20: Registreringsskjema <strong>for</strong> uttak fra <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong><br />
Uttak nr.<br />
Dato<br />
Bestiller/søker<br />
Info ad evt. <strong>for</strong>sendelse<br />
Prosjektnavn<br />
REK godkjenning<br />
MTA signert (ja/nei). Legges ved som<br />
vedlegg.<br />
Collaborating Agreement (ved<br />
<strong>for</strong>sendelse av data) signert (ja/nei).<br />
Legges ved som vedlegg.<br />
Materialkategori<br />
Antall prøver<br />
Volum (hvis relevant)<br />
Andre kriterier<br />
Kort beskrivelse av prosjektet/hensikt<br />
med uttaket<br />
Godkjent av ledergruppen<br />
Uttaksdato<br />
Ansvarlig ved NOPSC (uthenter)<br />
Evt. kommentarer rundt uttaket<br />
Prøveoversikt<br />
Uttak registrert i Medinsight<br />
(dato/sign)<br />
<strong>Prosedyrebok</strong> ved <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong>_Versjon 03.docx Org.enhet: Norsk senter <strong>for</strong> PSC, Avd. <strong>for</strong> transplantasjonsmedisin Nivå:4<br />
Dokumentversjon: 1 Utarbeidet av: Hege Dahlen Sollid Godkj. av: Tom Hemming Karlsen Dato: 18.06.13 Side 93 av 96
Vedlegg 21: Agreement on Human Biological Material Transfer (MTA)<br />
This Agreement is based upon the document<br />
“Oslo University Hospital (OUH) Policy on Human Biological Material<br />
Transfer”<br />
1. Institutions covered by this Agreement<br />
2. Administrative and Medical Responsibility<br />
The signed declares authority to execute this Agreement on behalf of the institutions.<br />
Provider:<br />
Recipient:<br />
3. Appropriate Permissions<br />
The Recipient must document approval from a Regional Committee <strong>for</strong> Medical Research<br />
Ethics and the Directorate <strong>for</strong> Health and Social Affairs regarding <strong>biobank</strong>. OUH requires<br />
the permission of the Privacy Ombudsman and the Head of <strong>biobank</strong> and register support<br />
at the hospital be<strong>for</strong>e any agreement on transfer of personal data and human biological<br />
material can be signed.<br />
Ethical approval from Regional Committee <strong>for</strong> Medical Research Ethics, ref.<strong>no</strong>.:<br />
If relevant, ref.<strong>no</strong> from Helsedirektoratet and/or Biobankregister ref.<strong>no</strong>. :<br />
If relevant, internal approval and ref.<strong>no</strong>.:<br />
4. In<strong>for</strong>mation regarding the Do<strong>no</strong>rs of the Material<br />
5. In<strong>for</strong>mation regarding the Type and Amount of Material<br />
6. In<strong>for</strong>mation regarding the Use of the Material<br />
The Recipient agrees that personal data /biological material provided by OUH will be<br />
used only <strong>for</strong> the purposes specified in this Agreement.<br />
7. In<strong>for</strong>mation regarding the Storage and Destruction (if relevant) of the Material<br />
8. Ethical Considerations related to the Transfer and Use of the Material<br />
9. Responsibility<br />
The Recipient understands that OUH attempts to avoid providing human biological<br />
material contaminated with infectious agents such as hepatitis and HIV. All material<br />
should there<strong>for</strong>e be handled as potentially infectious. The Recipient agreesto be<br />
responsible <strong>for</strong> in<strong>for</strong>ming and training personnel in the dangers and procedures <strong>for</strong> safe<br />
handling of human biological material. The Recipient agrees to take all risks and<br />
responsibilities in connection with the receipt, handling, storage and use of human<br />
biological material provided by OUH. The Recipient further agrees to indemnify and<br />
protect OUH from any claims, costs, damages or expenses resulting from the use of the<br />
human biological material provided by OUH. The Provider of a <strong>research</strong> <strong>biobank</strong> will<br />
depend on the specific <strong>research</strong> project, while the leader of a department is Provider on<br />
transfer of human material from a diag<strong>no</strong>stic and treatment <strong>biobank</strong>. The head of<br />
<strong>biobank</strong> and register support at OUH is system responsible <strong>for</strong> all <strong>biobank</strong>s at OUH and<br />
must approve and sign the Agreement on behalf of the institution in cases where an<br />
<strong>Prosedyrebok</strong> ved <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong>_Versjon 03.docx Org.enhet: Norsk senter <strong>for</strong> PSC, Avd. <strong>for</strong> transplantasjonsmedisin Nivå:4<br />
Dokumentversjon: 1 Utarbeidet av: Hege Dahlen Sollid Godkj. av: Tom Hemming Karlsen Dato: 18.06.13 Side 94 av 96
entire or a part of a <strong>biobank</strong> established at OUH is to be transferred to a<strong>no</strong>ther<br />
responsible institution.<br />
10. Use by Third Parts<br />
The Recipient must agree to <strong>no</strong>t transfer human biological material (or any portion<br />
thereof) supplied by OUH to third parts without the prior written consent from OUH.<br />
11. Commercial Human Biological Material Utilisation<br />
The Recipient can <strong>no</strong>t commercially distribute any portion of the human biological<br />
material provided by OUH, or any products directly extracted from these tissues (e.g.<br />
protein, mRNA, or DNA). Exemption from this condition may be agreed upon in cases<br />
where the material will be part of products intended <strong>for</strong> human diag<strong>no</strong>stics and/or<br />
treatment purposes.<br />
If the Recipient wants to use or licence the material or modifications of the material <strong>for</strong><br />
commercial purposes, the Recipient agrees, in advance of such use, to negotiate in good<br />
faith with OUH to establish the terms of a commercial licence.<br />
12. Recovery of Costs<br />
OUH does <strong>no</strong>t commercially distribute human biological material, but may charge the<br />
Recipient a fee to cover the costs of providing the service.<br />
Date:<br />
Date:<br />
_____________________________<br />
OUH (Provider)<br />
Name<br />
_________________________________<br />
[Insert] (Recipient)<br />
Name<br />
<strong>Prosedyrebok</strong> ved <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong>_Versjon 03.docx Org.enhet: Norsk senter <strong>for</strong> PSC, Avd. <strong>for</strong> transplantasjonsmedisin Nivå:4<br />
Dokumentversjon: 1 Utarbeidet av: Hege Dahlen Sollid Godkj. av: Tom Hemming Karlsen Dato: 18.06.13 Side 95 av 96
Vedlegg 22: Skjema <strong>for</strong> føring av <strong>for</strong>skningsprotokoll ved <strong>NoPSC</strong><br />
Title<br />
Date:<br />
Purpose:<br />
Materials:<br />
Lot nr reagents:<br />
Procedure:<br />
Instruments used:<br />
Results:<br />
(incl. reference to the raw-data), calculations<br />
Bio statistical analysis per<strong>for</strong>med:<br />
Conclusion and deviations from protocol:<br />
<strong>Prosedyrebok</strong> ved <strong>NoPSC</strong> <strong>biobank</strong>_Versjon 03.docx Org.enhet: Norsk senter <strong>for</strong> PSC, Avd. <strong>for</strong> transplantasjonsmedisin Nivå:4<br />
Dokumentversjon: 1 Utarbeidet av: Hege Dahlen Sollid Godkj. av: Tom Hemming Karlsen Dato: 18.06.13 Side 96 av 96