24.09.2013 Views

Farmaceutische wetenschappen BSc - Vrije Universiteit Amsterdam

Farmaceutische wetenschappen BSc - Vrije Universiteit Amsterdam

Farmaceutische wetenschappen BSc - Vrije Universiteit Amsterdam

SHOW MORE
SHOW LESS

Create successful ePaper yourself

Turn your PDF publications into a flip-book with our unique Google optimized e-Paper software.

<strong>Farmaceutische</strong> <strong>wetenschappen</strong> <strong>BSc</strong><br />

<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011<br />

<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 I


De opleiding <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen richt zich op de bestudering van medicijnen, op het doen van<br />

wetenschappelijk onderzoek hiernaar en op de toepassing van de verworven kennis. Het is een combinatie van<br />

Scheikunde, Biologie en Medische Vakken.<br />

Binnen de bacheloropleiding doe je kennis op van alle gebieden binnen de <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen:<br />

Biomolecular Drug Analysis, Computational MEdicinal Chemistry and Toxicology, Drug Design and Synthesis,<br />

Molecular Pharmacology en Molecular Toxicology.<br />

Met de opleiding wordt beoogd zodanige kennis, vaardigheid en inzicht bij te brengen op het gebied van de<br />

<strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen dat de afgestudeerde in aanmerking kan komen voor een masteropleiding in de<br />

<strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen. Dit kan een onderzoeksrichting zijn, maar ook een opleiding op het gebied van<br />

Communicatie en Educatie of een meer maatschappijgerichte opleiding.<br />

Eveneens is het essentieel dat de afgestudeerde zich bekwaamd heeft in het verantwoord kiezen in<br />

wetenschappelijke problematieken. Om deze doelstellingen te bereiken is in de eerste plaats een brede<br />

basisopleiding nodig met daarin ook aandacht voor algemene academische vorming. Daarnaast is het noodzakelijk<br />

dat de student gedurende enige tijd actief deelneemt aan het farmaceutisch onderzoek.<br />

Meer opleidingsinformatie is te vinden op de de FEW-website.<br />

Een complete beschrijving van deze opleiding is te vinden in de Onderwijs- en Examenregeling op de FEW-website.<br />

Klik op de onderstaande links om informatie over de vakken te bekijken. Voor meer informatie voer de opleiding zelf<br />

kun je terecht bij je studieadviseur.<br />

<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 II


Inhoudsopgave<br />

Eerste jaar bachelor FAR 1<br />

Verplichte vakken 1<br />

Verplichte algemene onderdelen 2<br />

Tweede jaar bachelor FAR 2<br />

Verplichte keuze 1 uit 2 3<br />

Verplichte vakken 3<br />

Derde jaar bachelor FAR 3<br />

Individuele vakken 4<br />

Bachelor project 4<br />

Keuze ruimte 6<br />

Verdiepingsvakken Analytical chemistry and applied Spectroscopy 6<br />

Verdiepingsvakken Farmacochemie 7<br />

Verdiepingsvakken Fysische chemie 7<br />

Verdiepingsvakken Organische chemie 8<br />

Verdiepingsvakken Theoretische chemie 8<br />

Derde jaar bachelor FAR keuzevakken CEM Orientatie op de C/E/M-variant 8<br />

Verplichte vakken 8<br />

Vak: Bachelorproject Bio-analytische screeningstechnieken 9<br />

Vak: Bachelorproject Bio-analytische screeningstechnieken 9<br />

Vak: Bachelorproject Farmacochemie BMA 10<br />

Vak: Bachelorproject Farmacochemie BMA 11<br />

Vak: Bachelorproject Imaging en Laser Control van Foto-Chemie 11<br />

Vak: Bachelorproject Imaging en Laser Control van Foto-Chemie 12<br />

Vak: Bachelorproject Imaging en Laser Control van Foto-Chemie 13<br />

Vak: Bachelorproject Med. Chem., Drug Disc. & Target Find. 13<br />

Vak: Bachelorproject Med. Chem., Drug Disc. & Target Find. 14<br />

Vak: Bachelorproject Mol. Tox., Comp. Med. Chem. & Tox. 14<br />

Vak: Bachelorproject Mol. Tox., Comp. Med. Chem. & Tox. 14<br />

Vak: Bachelorproject Mol. Tox., Drug, Disp. and Saf. Assessm. 15<br />

Vak: Bachelorproject Mol. Tox., Drug, Disp. and Saf. Assessm. 15<br />

Vak: Bachelorproject Multidimensionale scheidingstechnieken 16<br />

Vak: Bachelorproject Multidimensionale scheidingstechnieken 16<br />

Vak: Bachelorproject Organometaal synthese 17<br />

Vak: Bachelorproject Organometaal synthese 18<br />

Vak: Bachelorproject Organometaal synthese 18<br />

Vak: Bachelorproject Spectroscopische detectie- en identificatietechnieken 19<br />

Vak: Bachelorproject Spectroscopische detectie- en identificatietechnieken 20<br />

Vak: Bachelorproject Spectroscopische detectie- en identificatietechnieken 20<br />

Vak: Bachelorproject Synthese en structuuranalyse 21<br />

Vak: Bachelorproject Synthese en structuuranalyse 22<br />

Vak: Bachelorproject Synthese en structuuranalyse 23<br />

Vak: Bachelorproject Theoretical Chemistry 24<br />

Vak: Bachelorproject Theoretical Chemistry 24<br />

<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 III


Vak: Bachelorproject Theoretical Chemistry 25<br />

Vak: Bachelorproject Toegepaste theoretische chemie 26<br />

Vak: Bachelorproject Toegepaste theoretische chemie 27<br />

Vak: Bachelorproject Toegepaste theoretische chemie 28<br />

Vak: Basischemie 29<br />

Vak: Basispracticum farmacochemie 30<br />

Vak: Basispracticum Farmacochemie 31<br />

Vak: Basiswiskunde 31<br />

Vak: Bioanalyse eiwitten 32<br />

Vak: Bio-Analytical Chemistry 32<br />

Vak: Biochemie 32<br />

Vak: Biochemie 34<br />

Vak: Blusinstructie: Praktijk S&F/N&S/SBI incl MNW. 35<br />

Vak: Blusinstructie: Theorie: S&F/N&S/W/I/SBI gelijktijdig in Q1 35<br />

Vak: BP Farmacochemie MC, DD&S 35<br />

Vak: BP Farmacochemie MC, DD&S 35<br />

Vak: Calculus 1 35<br />

Vak: Chemie / farmacochemie en samenleving 36<br />

Vak: Chemische binding 37<br />

Vak: Computational (Pharmaco)Chemistry 37<br />

Vak: Computationele organische chemie Computational Organic Chemistry 38<br />

Vak: <strong>Farmaceutische</strong> toxicologie 38<br />

Vak: Farmacochemie in context 39<br />

Vak: Farmacokinetiek en ADME processen 39<br />

Vak: FEW individueel vak intern 39<br />

Vak: Fysica en medische fysica 1 40<br />

Vak: Geschiedenis van de natuur<strong>wetenschappen</strong> 40<br />

Vak: Heterologe expressie van biotransformatie enzymen 41<br />

Vak: Identificatietechnieken 42<br />

Vak: Inleiding computergebruik 42<br />

Vak: Innovatieproject geneesmiddelen 43<br />

Vak: Integrated Practical Course 43<br />

Vak: Keuzevak BioAnalytische massaspectrometrie 44<br />

Vak: Keuzevak BioAnalytische screeningstechnieken 45<br />

Vak: Keuzevak Fysische Chemie 45<br />

Vak: Keuzevak Fysische Chemie 46<br />

Vak: Keuzevak Luminescence Spectr. and Mol-Mol interaction 46<br />

Vak: Keuzevak Luminescence Spectr. and Mol-Mol interaction 47<br />

Vak: Keuzevak Med. Chem., Drug Design & Synth. 47<br />

Vak: Keuzevak Med. Chem., Drug Design & Synth. 47<br />

Vak: Keuzevak Med. Chem., Drug Disc. & Target Find. 48<br />

Vak: Keuzevak Med. Chem., Drug Disc. & Target Find. 48<br />

Vak: Keuzevak Mol. Tox., Comp. Med. Chem. & Tox. 48<br />

Vak: Keuzevak Mol. Tox., Comp. Med. Chem. & Tox. 49<br />

Vak: Keuzevak Mol. Tox., Drug, Disp. and Saf. Assessm. 50<br />

<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 IV


Vak: Keuzevak Multidimensionale scheidingstechnieken 50<br />

Vak: Keuzevak Spectroscopische detectie- en identificatietechniek 51<br />

Vak: Keuzevak Spectroscopische detectie- en identificatietechniek 51<br />

Vak: Keuzevak Theoretische Chemie 52<br />

Vak: Keuzevak Theoretische Chemie 52<br />

Vak: Levende chemie 53<br />

Vak: Maatschappelijke aspecten van de natuur<strong>wetenschappen</strong> 53<br />

Vak: Macromoleculen en katalyse 54<br />

Vak: Mathematische methoden 55<br />

Vak: Medische (patho)fysiologie 2 56<br />

Vak: Medische fysiologie 1 56<br />

Vak: Medische fysiologie II 57<br />

Vak: Mentoraat / Tutoraat 57<br />

Vak: Modern Developments in Pharmacochemistry 58<br />

Vak: Moleculaire mechanismen van ziekten 58<br />

Vak: Moleculaire modeling 59<br />

Vak: Natuurstoffen 60<br />

Vak: Open House Analytical Chemistry and applied Spectroscopy 60<br />

Vak: Open house Chemical Biology 61<br />

Vak: Open House Comp. Med. Chem. & Tox. 61<br />

Vak: Open House DDS 61<br />

Vak: Open House Drug Discovery & Target Finding 61<br />

Vak: Open House MolTox 62<br />

Vak: Organische chemie 1 62<br />

Vak: Organische chemie 2 62<br />

Vak: Organische chemie 3: moderne organische synthese 63<br />

Vak: Organometaalchemie 64<br />

Vak: Oriëntatie op de M-variant 64<br />

Vak: Oriëntatie science educatie 65<br />

Vak: Practicum Bio-analytische chemie 67<br />

Vak: Practicum Moderne synthetische methoden 67<br />

Vak: Project Bio-analytische chemie 68<br />

Vak: Radiofarmacochemie 69<br />

Vak: Statistiek 70<br />

Vak: Structuurbiologie 70<br />

Vak: Studie en loopbaan 70<br />

Vak: Synthese practicum 71<br />

Vak: Thermodynamics 71<br />

Vak: Van atoom tot (bio)molecuul 72<br />

Vak: Van molecuul tot medicijn 73<br />

Vak: Veiligheidsinstructie S, F, MNW en SBI 30min 74<br />

Vak: Voorlichting door studentendecanen en CSL 74<br />

Vak: Wetenschapscommunicatie voor Bèta-onderzoekers 74<br />

Vak: Why Chemical Reactions Happen 75<br />

Vak: Wijsgerige vorming: natuur<strong>wetenschappen</strong>, filosofie en ethiek 76<br />

<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 V


Eerste jaar bachelor FAR<br />

Eerste jaar voor studenten gestart in 2010/2011<br />

In het eerste jaar zijn alle vakken verplicht, er zijn geen keuzevakken.<br />

Het programma in het eerste jaar vormt een basis; het geeft een eerste<br />

overzicht van de <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen en is bedoeld als een<br />

verbreding van de kennis op diverse terreinen.<br />

Het eerste jaar van de bachelor heeft een oriënterende en selecterende<br />

functie. De student kan zich tijdens het eerste studiejaar oriënteren op<br />

de gekozen opleiding, dat wil zeggen: voldoet de opleiding aan de<br />

verwachting en is men er geschikt voor. Het programma van het eerste<br />

jaar geeft een eerste overzicht van de opleiding en geeft een verbreding<br />

van de kennis.<br />

De selecterende functie komt vooral tot uiting in de studieresultaten.<br />

De studieresultaten worden gevolgd door de studieadviseur. Als het nodig<br />

is worden studenten opgeroepen voor een gesprek. Op grond van de cijfers<br />

wordt aan het eind van het eerste jaar aan elke eerstejaars een (niet-<br />

bindend) schriftelijk studieadvies gestuurd.<br />

Opleidingsdelen:<br />

-<br />

-<br />

Verplichte vakken<br />

Verplichte algemene onderdelen<br />

Verplichte vakken<br />

Vakken:<br />

Naam Periode Credits Code<br />

Basischemie Periode 1 3.0 X_435077<br />

Basispracticum<br />

farmacochemie<br />

Basispracticum<br />

Farmacochemie<br />

3.0 X_430561<br />

Periode 1 4.0 X_435078<br />

Basiswiskunde 3.0 X_401069<br />

Bio-Analytical Chemistry Periode 5 3.0 X_430094<br />

Biochemie 3.0 X_430562<br />

Biochemie Periode 2 6.0 X_435051<br />

Calculus 1 Periode 2 3.0 X_400300<br />

Chemie / farmacochemie en<br />

samenleving<br />

Periode 4 3.0 X_435080<br />

Chemische binding Periode 2 3.0 X_435079<br />

Farmacochemie in context 3.0 X_430566<br />

Farmacokinetiek en ADME<br />

processen<br />

Periode 6 3.0 X_435084<br />

Identificatietechnieken Periode 5 6.0 X_435081<br />

<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 1 van 76


Innovatieproject<br />

geneesmiddelen<br />

Verplichte algemene onderdelen<br />

Vakken:<br />

Tweede jaar bachelor FAR<br />

Tweede jaar voor studenten gestart in 2009/2010<br />

Periode 3 6.0 X_435095<br />

Levende chemie 3.0 X_430569<br />

Medische fysiologie 1 Periode 1 3.0 X_430059<br />

Organische chemie 1 Periode 5 3.0 X_435091<br />

Practicum Bio-analytische<br />

chemie<br />

Project Bio-analytische<br />

chemie<br />

Periode 6 3.0 X_435085<br />

In het tweede studiejaar wordt beoogd een verdieping van kennis, inzicht<br />

en vaardigheden op deelgebieden van de farmaceutische Wetenschappen tot<br />

stand te<br />

brengen. Dit vormt de basis voor de differentiatie in het derde jaar.<br />

In periode 4 is er een verplichte keuze tussen de vakken<br />

Maatschappelijke aspecten van<br />

natuur<strong>wetenschappen</strong> en Geschiedenis van de natuur<strong>wetenschappen</strong>.<br />

Daarnaast volg je het verplichte onderdeel Studie en Loopbaan in periode<br />

5. Tijdens deze cursus wordt er expliciet aandacht besteed aan jouw<br />

competenties en vaardigheden, zodat jij je bewust wordt van jouw sterke<br />

punten. Daarnaast krijg je meer inzicht in keuzemogelijkheden binnen de<br />

opleiding en mogelijkheden na de bacheloropleiding.<br />

6.0 X_430577<br />

Van atoom tot (bio)molecuul 6.0 X_430580<br />

Van molecuul tot medicijn 3.0 X_430581<br />

Why Chemical Reactions<br />

Happen<br />

Periode 4 3.0 X_435088<br />

Naam Periode Credits Code<br />

Blusinstructie: Praktijk<br />

S&F/N&S/SBI incl MNW.<br />

Blusinstructie: Theorie:<br />

S&F/N&S/W/I/SBI gelijktijdig<br />

in Q1<br />

Periode 1 0.0 X_000002<br />

Periode 1 0.0 X_000003<br />

Inleiding computergebruik 0.0 X_000004<br />

Mentoraat / Tutoraat Periode 1 0.0 X_000008<br />

Veiligheidsinstructie S, F,<br />

MNW en SBI 30min<br />

Voorlichting door<br />

studentendecanen en CSL<br />

Periode 1 0.0 X_000019<br />

0.0 X_000007<br />

<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 2 van 76


Opleidingsdelen:<br />

-<br />

-<br />

Verplichte keuze 1 uit 2<br />

Verplichte vakken<br />

Vakken:<br />

Naam Periode Credits Code<br />

Studie en loopbaan Periode 1, Periode 5 0.0 X_000018<br />

Verplichte keuze 1 uit 2<br />

Verplichte keuze van 1 uit 2<br />

Vakken:<br />

Naam Periode Credits Code<br />

Geschiedenis van de<br />

natuur<strong>wetenschappen</strong><br />

Maatschappelijke aspecten<br />

van de<br />

natuur<strong>wetenschappen</strong><br />

Verplichte vakken<br />

Vakken:<br />

Derde jaar bachelor FAR<br />

Derde jaar voor studenten gestart in 2008/2009<br />

Periode 4 3.0 X_420148<br />

Periode 4 3.0 X_420153<br />

Naam Periode Credits Code<br />

Bioanalyse eiwitten Periode 1 3.0 X_435099<br />

<strong>Farmaceutische</strong> toxicologie Periode 1 3.0 X_430103<br />

Fysica en medische fysica 1 Periode 4 3.0 X_430060<br />

Integrated Practical Course Periode 5 12.0 X_430516<br />

Mathematische methoden Periode 4 6.0 X_401022<br />

Medische (patho)fysiologie<br />

2<br />

Periode 2 6.0 X_436503<br />

Medische fysiologie II 6.0 X_430102<br />

Moleculaire modeling Periode 6 6.0 X_435103<br />

Organische chemie 2 Periode 1 3.0 X_435007<br />

Statistiek Periode 1+2 6.0 X_420223<br />

Synthese practicum Periode 2, Periode 3 6.0 X_435192<br />

Thermodynamics Periode 2 3.0 X_430513<br />

Het derde studiejaar is opgebouwd uit een aantal verplichte vakken,<br />

<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 3 van 76


daarnaast is er veel keuzeruimte die ingevuld moet worden met een<br />

eindproject en daarnaast keuzevakken. In het tweede deel van het derde<br />

studiejaar zijn ook de cursussen oriëntatie op de C-, E-, en M-variant<br />

geprogrammeerd.<br />

Je moet, voordat je begint aan de afronding van de bacheloropleiding,<br />

goedkeuring van je programma vragen aan de examencommissie via het<br />

formulier 'aanvraag goedkeuring bachelorprogramma'. De studieadviseur<br />

zal je hier tijdig op wijzen en je helpen bij het invullen. Ook de<br />

coördinatoren van de secties<br />

kunnen advies en ondersteuning bieden bij de keuzes die gemaakt moeten<br />

worden.<br />

Opleidingsdelen:<br />

-<br />

-<br />

-<br />

-<br />

Individuele vakken<br />

Bachelor project<br />

Keuze ruimte<br />

Verplichte vakken<br />

Vakken:<br />

Naam Periode Credits Code<br />

Open House Analytical<br />

Chemistry and applied<br />

Spectroscopy<br />

Open house Chemical<br />

Biology<br />

Open House Comp. Med.<br />

Chem. & Tox.<br />

Individuele vakken<br />

Vakken:<br />

Bachelor project<br />

Periode 1 0.0 X_000009<br />

Periode 1 0.0 X_000010<br />

Periode 1 0.0 X_000011<br />

Open House DDS Periode 1 0.0 X_000012<br />

Open House Drug<br />

Discovery & Target Finding<br />

Periode 1 0.0 X_000013<br />

Open House MolTox Periode 1 0.0 X_000014<br />

Naam Periode Credits Code<br />

FEW individueel vak intern 6.0 X_INDVAKI_09<br />

Verplichte keuze van 1 project van minimaal 18 ects en max 24 ects in<br />

het gebied van de <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen (X_430524, X_430525, X_<br />

430527, X_430528, X_430530, X_430531, X_430533, X_430534, X_430536 en X_<br />

430537). Binnen een project van<br />

24 ects is een combinatie van twee verschillende disciplines mogelijk.<br />

<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 4 van 76


Vakken:<br />

Naam Periode Credits Code<br />

Bachelorproject Bioanalytische<br />

screeningstechnieken<br />

Bachelorproject Bioanalytische<br />

screeningstechnieken<br />

Bachelorproject<br />

Farmacochemie BMA<br />

Bachelorproject<br />

Farmacochemie BMA<br />

Bachelorproject Imaging en<br />

Laser Control van Foto-<br />

Chemie<br />

Bachelorproject Imaging en<br />

Laser Control van Foto-<br />

Chemie<br />

Bachelorproject Imaging en<br />

Laser Control van Foto-<br />

Chemie<br />

Bachelorproject Med.<br />

Chem., Drug Disc. & Target<br />

Find.<br />

Bachelorproject Med.<br />

Chem., Drug Disc. & Target<br />

Find.<br />

Bachelorproject Mol. Tox.,<br />

Comp. Med. Chem. & Tox.<br />

Bachelorproject Mol. Tox.,<br />

Comp. Med. Chem. & Tox.<br />

Bachelorproject Mol. Tox.,<br />

Drug, Disp. and Saf.<br />

Assessm.<br />

Bachelorproject Mol. Tox.,<br />

Drug, Disp. and Saf.<br />

Assessm.<br />

Bachelorproject<br />

Multidimensionale<br />

scheidingstechnieken<br />

Bachelorproject<br />

Multidimensionale<br />

scheidingstechnieken<br />

Bachelorproject<br />

Organometaal synthese<br />

Bachelorproject<br />

Organometaal synthese<br />

Bachelorproject<br />

Organometaal synthese<br />

Ac. Jaar (september) 18.0 X_435117<br />

Ac. Jaar (september) 24.0 X_435118<br />

Ac. Jaar (september) 18.0 X_430524<br />

Ac. Jaar (september) 24.0 X_430525<br />

Ac. Jaar (september) 12.0 X_435052<br />

Ac. Jaar (september) 18.0 X_435114<br />

Ac. Jaar (september) 24.0 X_435116<br />

Ac. Jaar (september) 18.0 X_430530<br />

Ac. Jaar (september) 24.0 X_430531<br />

Ac. Jaar (september) 18.0 X_430533<br />

Ac. Jaar (september) 24.0 X_430534<br />

Ac. Jaar (september) 18.0 X_430536<br />

Ac. Jaar (september) 24.0 X_430537<br />

Ac. Jaar (september) 18.0 X_435122<br />

Ac. Jaar (september) 24.0 X_435123<br />

Ac. Jaar (september) 12.0 X_435104<br />

Ac. Jaar (september) 18.0 X_435133<br />

Ac. Jaar (september) 24.0 X_435134<br />

<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 5 van 76


Bachelorproject<br />

Spectroscopische detectieen<br />

identificatietechnieken<br />

Bachelorproject<br />

Spectroscopische detectieen<br />

identificatietechnieken<br />

Bachelorproject<br />

Spectroscopische detectieen<br />

identificatietechnieken<br />

Bachelorproject Synthese<br />

en structuuranalyse<br />

Bachelorproject Synthese<br />

en structuuranalyse<br />

Bachelorproject Synthese<br />

en structuuranalyse<br />

Bachelorproject Theoretical<br />

Chemistry<br />

Bachelorproject Theoretical<br />

Chemistry<br />

Bachelorproject Theoretical<br />

Chemistry<br />

Bachelorproject Toegepaste<br />

theoretische chemie<br />

Bachelorproject Toegepaste<br />

theoretische chemie<br />

Bachelorproject Toegepaste<br />

theoretische chemie<br />

BP Farmacochemie MC,<br />

DD&S<br />

BP Farmacochemie MC,<br />

DD&S<br />

Keuze ruimte<br />

De keuzeruimte van 24, 18 of 12 ec kan worden ingevuld met een keuze uit<br />

onderstaande vakken.<br />

Voor de invulling van de keuzeonderdelen is de goedkeuring van de<br />

examencommissie vereist.<br />

Opleidingsdelen:<br />

-<br />

-<br />

-<br />

-<br />

-<br />

-<br />

Verdiepingsvakken Analytical chemistry and applied Spectroscopy<br />

Verdiepingsvakken Farmacochemie<br />

Verdiepingsvakken Fysische chemie<br />

Verdiepingsvakken Organische chemie<br />

Verdiepingsvakken Theoretische chemie<br />

Derde jaar bachelor FAR keuzevakken CEM Orientatie op de C/E/M-variant<br />

Verdiepingsvakken Analytical chemistry and applied Spectroscopy<br />

Vakken:<br />

Ac. Jaar (september) 18.0 X_435119<br />

Ac. Jaar (september) 24.0 X_435121<br />

Ac. Jaar (september) 12.0 X_435470<br />

Ac. Jaar (september) 18.0 X_435128<br />

Ac. Jaar (september) 24.0 X_435129<br />

Ac. Jaar (september) 12.0 X_435550<br />

Ac. Jaar (september) 12.0 X_430517<br />

Ac. Jaar (september) 18.0 X_435126<br />

Ac. Jaar (september) 24.0 X_435127<br />

Ac. Jaar (september) 18.0 X_435131<br />

Ac. Jaar (september) 24.0 X_435132<br />

Ac. Jaar (september) 12.0 X_435570<br />

Ac. Jaar (september) 18.0 X_430527<br />

Ac. Jaar (september) 24.0 X_430528<br />

<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 6 van 76


Naam Periode Credits Code<br />

Keuzevak BioAnalytische<br />

massaspectrometrie<br />

Keuzevak BioAnalytische<br />

screeningstechnieken<br />

Keuzevak Luminescence<br />

Spectr. and Mol-Mol<br />

interaction<br />

Keuzevak Luminescence<br />

Spectr. and Mol-Mol<br />

interaction<br />

Keuzevak Multidimensionale<br />

scheidingstechnieken<br />

Keuzevak Spectroscopische<br />

detectie- en<br />

identificatietechniek<br />

Keuzevak Spectroscopische<br />

detectie- en<br />

identificatietechniek<br />

Verdiepingsvakken Farmacochemie<br />

Vakken:<br />

Verdiepingsvakken Fysische chemie<br />

Vakken:<br />

Ac. Jaar (september) 3.0 X_435026<br />

Ac. Jaar (september) 3.0 X_435028<br />

Ac. Jaar (september) 3.0 X_435032<br />

Ac. Jaar (september) 6.0 X_435033<br />

Ac. Jaar (september) 3.0 X_435037<br />

6.0 X_430568<br />

Ac. Jaar (september) 3.0 X_435039<br />

Naam Periode Credits Code<br />

Heterologe expressie van<br />

biotransformatie enzymen<br />

Keuzevak Med. Chem.,<br />

Drug Design & Synth.<br />

Keuzevak Med. Chem.,<br />

Drug Design & Synth.<br />

Keuzevak Med. Chem.,<br />

Drug Disc. & Target Find.<br />

Keuzevak Med. Chem.,<br />

Drug Disc. & Target Find.<br />

Keuzevak Mol. Tox., Comp.<br />

Med. Chem. & Tox.<br />

Keuzevak Mol. Tox., Comp.<br />

Med. Chem. & Tox.<br />

Keuzevak Mol. Tox., Drug,<br />

Disp. and Saf. Assessm.<br />

Ac. Jaar (september) 6.0 X_430549<br />

Ac. Jaar (september) 3.0 X_430542<br />

Ac. Jaar (september) 6.0 X_430543<br />

Ac. Jaar (september) 3.0 X_430544<br />

Ac. Jaar (september) 6.0 X_430545<br />

Ac. Jaar (september) 3.0 X_430546<br />

Ac. Jaar (september) 6.0 X_430547<br />

Ac. Jaar (september) 3.0 X_430548<br />

Naam Periode Credits Code<br />

<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 7 van 76


Keuzevak Fysische Chemie Ac. Jaar (september) 3.0 X_430540<br />

Keuzevak Fysische Chemie Ac. Jaar (september) 6.0 X_430541<br />

Verdiepingsvakken Organische chemie<br />

Vakken:<br />

Naam Periode Credits Code<br />

Computationele organische<br />

chemie Computational<br />

Organic Chemistry<br />

Verdiepingsvakken Theoretische chemie<br />

Vakken:<br />

Derde jaar bachelor FAR keuzevakken CEM Orientatie op de C/E/M-variant<br />

Vakken:<br />

Verplichte vakken<br />

Vakken:<br />

Ac. Jaar (september) 9.0 X_435017<br />

Macromoleculen en katalyse Ac. Jaar (september) 6.0 X_435450<br />

Natuurstoffen Ac. Jaar (september) 6.0 X_435440<br />

Organische chemie 3:<br />

moderne organische<br />

synthese<br />

Periode 3 3.0 X_435109<br />

Organometaalchemie Ac. Jaar (september) 3.0 X_435018<br />

Practicum Moderne<br />

synthetische methoden<br />

Ac. Jaar (september) 9.0 X_435016<br />

Naam Periode Credits Code<br />

Keuzevak Theoretische<br />

Chemie<br />

Keuzevak Theoretische<br />

Chemie<br />

Ac. Jaar (september) 3.0 X_430538<br />

Ac. Jaar (september) 6.0 X_430539<br />

Naam Periode Credits Code<br />

Oriëntatie op de M-variant Periode 4 6.0 X_400375<br />

Oriëntatie science educatie Periode 4 6.0 O_ORIBETA<br />

Wetenschapscommunicatie<br />

voor Bèta-onderzoekers<br />

Periode 4 6.0 AB_470185<br />

<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 8 van 76


Naam Periode Credits Code<br />

Computational<br />

(Pharmaco)Chemistry<br />

Modern Developments in<br />

Pharmacochemistry<br />

Moleculaire mechanismen<br />

van ziekten<br />

Bachelorproject Bio-analytische screeningstechnieken<br />

Doel vak<br />

Het verwerven van praktisch en theoretisch inzicht omtrent een bepaald<br />

thema aan de hand van het zelfstandig opzetten en uitvoeren van een<br />

onderzoeksproject.<br />

Inhoud vak<br />

Het primaire doel is het ontwikkelen van complete bioanalytische<br />

systemen waarmee zowel de selectiviteit als de gevoeligheid verbeterd<br />

kan worden. Bovendien wordt het in de industrie en de kliniek steeds<br />

belangrijker om grote aantallen monsters in een korte tijd te kunnen<br />

analyseren, vandaar dat de ontwikkeling en optimalisering van<br />

geautomatiseerde multidimensionale systemen een belangrijke plaats<br />

inneemt. Het gaat hierbij om toepassing van biospecifieke en<br />

massaspectrometrische technieken. Centraal staan de ontwikkeling van<br />

methoden voor peptiden, eiwitten en metabolieten in een complexe matrix.<br />

Onderwijsvorm<br />

Zelfstandig opzetten en uitvoeren van een onderzoeksproject.<br />

Literatuur<br />

Praktische handleidingen en basisliteratuur.<br />

Doelgroep<br />

3F, 3S<br />

Periode 2 6.0 X_435350<br />

Periode 2 3.0 X_430515<br />

Periode 3 3.0 X_430104<br />

Radiofarmacochemie Periode 1 3.0 X_436502<br />

Structuurbiologie Periode 1 6.0 X_430080<br />

Wijsgerige vorming:<br />

natuur<strong>wetenschappen</strong>,<br />

filosofie en ethiek<br />

Periode 1 3.0 X_435340<br />

Vakcode X_435117 (435117)<br />

Periode Ac. Jaar (september)<br />

Credits 18.0<br />

Voertaal Nederlands<br />

Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />

Coördinator dr. H. Lingeman<br />

Overige informatie<br />

Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12<br />

studiepunten (vakcode 435460) kan in overleg met de coördinator worden<br />

uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 435117) of 24 studiepunten<br />

(vakcode 435118).<br />

Bachelorproject Bio-analytische screeningstechnieken<br />

<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 9 van 76


Vakcode X_435118 (435118)<br />

Periode Ac. Jaar (september)<br />

Credits 24.0<br />

Voertaal Nederlands<br />

Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />

Coördinator dr. H. Lingeman<br />

Doel vak<br />

Het verwerven van praktisch en theoretisch inzicht omtrent een bepaald<br />

thema aan de hand van het zelfstandig opzetten en uitvoeren van een<br />

onderzoeksproject.<br />

Inhoud vak<br />

Het primaire doel is het ontwikkelen van complete bioanalytische<br />

systemen waarmee zowel de selectiviteit als de gevoeligheid verbeterd<br />

kan worden. Bovendien wordt het in de industrie en de kliniek steeds<br />

belangrijker om grote aantallen monsters in een korte tijd te kunnen<br />

analyseren, vandaar dat de ontwikkeling en optimalisering van<br />

geautomatiseerde multidimensionale systemen een belangrijke plaats<br />

inneemt. Het gaat hierbij om toepassing van biospecifieke en<br />

massaspectrometrische technieken. Centraal staan de ontwikkeling van<br />

methoden voor peptiden, eiwitten en metabolieten in een complexe matrix.<br />

Onderwijsvorm<br />

Zelfstandig opzetten en uitvoeren van een onderzoeksproject.<br />

Literatuur<br />

Praktische handleidingen en basisliteratuur.<br />

Doelgroep<br />

3F, 3S<br />

Overige informatie<br />

Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12<br />

studiepunten (vakcode 435460) kan in overleg met de coördinator worden<br />

uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 435117) of 24 studiepunten<br />

(vakcode 435118).<br />

Bachelorproject Farmacochemie BMA<br />

Vakcode X_430524 (430524)<br />

Periode Ac. Jaar (september)<br />

Credits 18.0<br />

Voertaal Nederlands<br />

Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />

Coördinator dr. H. Lingeman<br />

Inhoud vak<br />

De inhoud van het bachelorproject wordt in overleg met de docent<br />

bepaald. Dit geldt ook voor het aantal contacturen en te gebruiken<br />

studiemateriaal. Neem tijdig contact op met de docent.<br />

Overige informatie<br />

<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 10 van 76


Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12<br />

studiepunten (vakcode 430523) kan in overleg met de coordinator worden<br />

uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 430524) of 24 studiepunten<br />

(vakcode 430525).<br />

Bachelorproject Farmacochemie BMA<br />

Vakcode X_430525 (430525)<br />

Periode Ac. Jaar (september)<br />

Credits 24.0<br />

Voertaal Nederlands<br />

Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />

Coördinator dr. H. Lingeman<br />

Inhoud vak<br />

De inhoud van het bachelorproject wordt in overleg met de docent<br />

bepaald. Dit geldt ook voor het aantal contacturen en te gebruiken<br />

studiemateriaal. Neem tijdig contact op met de docent.<br />

Overige informatie<br />

Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12<br />

studiepunten (vakcode 430523) kan in overleg met de coordinator worden<br />

uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 430524) of 24 studiepunten<br />

(vakcode 430525).<br />

Bachelorproject Imaging en Laser Control van Foto-Chemie<br />

Vakcode X_435052 (435052)<br />

Periode Ac. Jaar (september)<br />

Credits 12.0<br />

Voertaal Nederlands<br />

Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />

Coördinator prof. dr. M.H.M. Janssen<br />

Doel vak<br />

Verkrijgen van inzicht in het verloop van elementaire chemische<br />

processen, met name laser geinduceerde foto-chemische processen, en in<br />

de krachten die een rol spelen bij het vormen en breken van een<br />

chemische binding. Kennismaking met experimentele technieken op het<br />

gebied van (ultrasnelle) lasers, moleculaire bundels en geavanceerde<br />

imaging detectoren.<br />

Inhoud vak<br />

Er zijn twee onderzoeksthema's waarbinnen een eindproject kan worden<br />

uitgevoerd:<br />

- Tijdoplgeloste fotodynamica, coherent control en imaging met behulp<br />

van ultrasnelle femtoseconde lasers.<br />

- Fotodynamica van niet-adiabatische chemie.<br />

Voor een globale omschrijving van deze twee onderzoeksthema's wordt<br />

verwezen naar de beschrijving van de onderzoeksstage<br />

('Laserspectroscopie') in de masterfase. Belangrijke aspecten bij het<br />

uitvoeren van het eindproject zijn dat nadat het onderwerp is besproken<br />

<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 11 van 76


met de begeleider, de student zelf een onderzoeksplan opstelt, het<br />

onderzoek uitvoert en hiervan verslag doet.<br />

Literatuur<br />

Praktische handleidingen, boeken en literatuur.<br />

Doelgroep<br />

3S, 3F<br />

Overige informatie<br />

Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12<br />

studiepunten (vakcode 435052) kan in overleg met de coordinator worden<br />

uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 435114) of 24 studiepunten<br />

(vakcode 435116).<br />

Bachelorproject Imaging en Laser Control van Foto-Chemie<br />

Vakcode X_435114 (435114)<br />

Periode Ac. Jaar (september)<br />

Credits 18.0<br />

Voertaal Nederlands<br />

Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />

Coördinator prof. dr. M.H.M. Janssen<br />

Doel vak<br />

Verkrijgen van inzicht in het verloop van elementaire chemische<br />

processen, met name laser geinduceerde foto-chemische processen, en in<br />

de krachten die een rol spelen bij het vormen en breken van een<br />

chemische binding. Kennismaking met experimentele technieken op het<br />

gebied van (ultrasnelle) lasers, moleculaire bundels en geavanceerde<br />

imaging detectoren.<br />

Inhoud vak<br />

Er zijn twee onderzoeksthema's waarbinnen een eindproject kan worden<br />

uitgevoerd:<br />

- Tijdoplgeloste fotodynamica, coherent control en imaging met behulp<br />

van ultrasnelle femtoseconde lasers.<br />

- Fotodynamica van niet-adiabatische chemie.<br />

Voor een globale omschrijving van deze twee onderzoeksthema's wordt<br />

verwezen naar de beschrijving van de onderzoeksstage<br />

('Laserspectroscopie') in de masterfase. Belangrijke aspecten bij het<br />

uitvoeren van het eindproject zijn dat nadat het onderwerp is besproken<br />

met de begeleider, de student zelf een onderzoeksplan opstelt, het<br />

onderzoek uitvoert en hiervan verslag doet.<br />

Literatuur<br />

Praktische handleidingen, boeken en literatuur.<br />

Doelgroep<br />

3S, 3F<br />

Overige informatie<br />

Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12<br />

studiepunten (vakcode 435052) kan in overleg met de coordinator worden<br />

uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 435114) of 24 studiepunten<br />

<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 12 van 76


(vakcode 435116).<br />

Bachelorproject Imaging en Laser Control van Foto-Chemie<br />

Vakcode X_435116 (435116)<br />

Periode Ac. Jaar (september)<br />

Credits 24.0<br />

Voertaal Nederlands<br />

Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />

Coördinator prof. dr. M.H.M. Janssen<br />

Doel vak<br />

Verkrijgen van inzicht in het verloop van elementaire chemische<br />

processen, met name laser geinduceerde foto-chemische processen, en in<br />

de krachten die een rol spelen bij het vormen en breken van een<br />

chemische binding. Kennismaking met experimentele technieken op het<br />

gebied van (ultrasnelle) lasers, moleculaire bundels en geavanceerde<br />

imaging detectoren.<br />

Inhoud vak<br />

Er zijn twee onderzoeksthema's waarbinnen een eindproject kan worden<br />

uitgevoerd:<br />

- Tijdoplgeloste fotodynamica, coherent control en imaging met behulp<br />

van ultrasnelle femtoseconde lasers.<br />

- Fotodynamica van niet-adiabatische chemie.<br />

Voor een globale omschrijving van deze twee onderzoeksthema's wordt<br />

verwezen naar de beschrijving van de onderzoeksstage<br />

('Laserspectroscopie') in de masterfase. Belangrijke aspecten bij het<br />

uitvoeren van het eindproject zijn dat nadat het onderwerp is besproken<br />

met de begeleider, de student zelf een onderzoeksplan opstelt, het<br />

onderzoek uitvoert en hiervan verslag doet.<br />

Literatuur<br />

Praktische handleidingen, boeken en literatuur.<br />

Doelgroep<br />

3S, 3F<br />

Overige informatie<br />

Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12<br />

studiepunten (vakcode 435052) kan in overleg met de coordinator worden<br />

uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 435114) of 24 studiepunten<br />

(vakcode 435116).<br />

Bachelorproject Med. Chem., Drug Disc. & Target Find.<br />

Vakcode X_430530 (430530)<br />

Periode Ac. Jaar (september)<br />

Credits 18.0<br />

Voertaal Nederlands<br />

Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />

Coördinator dr. J.N.M. Commandeur<br />

<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 13 van 76


Inhoud vak<br />

De inhoud van het bachelorproject wordt in overleg met de docent<br />

bepaald. Dit geldt ook voor het aantal contacturen en te gebruiken<br />

studiemateriaal. Neem tijdig contact op met de docent.<br />

Overige informatie<br />

Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12<br />

studiepunten (vakcode 430529) kan in overleg met de coordinator worden<br />

uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 430530) of 24 studiepunten<br />

(vakcode 430531).<br />

Bachelorproject Med. Chem., Drug Disc. & Target Find.<br />

Vakcode X_430531 (430531)<br />

Periode Ac. Jaar (september)<br />

Credits 24.0<br />

Voertaal Nederlands<br />

Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />

Coördinator dr. J.N.M. Commandeur<br />

Inhoud vak<br />

De inhoud van het bachelorproject wordt in overleg met de docent<br />

bepaald. Dit geldt ook voor het aantal contacturen en te gebruiken<br />

studiemateriaal. Neem tijdig contact op met de docent.<br />

Overige informatie<br />

Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12<br />

studiepunten (vakcode 430529) kan in overleg met de coordinator worden<br />

uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 430530) of 24 studiepunten<br />

(vakcode 430531).<br />

Bachelorproject Mol. Tox., Comp. Med. Chem. & Tox.<br />

Vakcode X_430533 (430533)<br />

Periode Ac. Jaar (september)<br />

Credits 18.0<br />

Voertaal Nederlands<br />

Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />

Coördinator dr. J.N.M. Commandeur<br />

Inhoud vak<br />

De inhoud van het bachelorproject wordt in overleg met de docent<br />

bepaald. Dit geldt ook voor het aantal contacturen en te gebruiken<br />

studiemateriaal. Neem tijdig contact op met de docent.<br />

Overige informatie<br />

Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12<br />

studiepunten (vakcode 430532) kan in overleg met de coordinator worden<br />

uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 430533) of 24 studiepunten<br />

(vakcode 430534).<br />

Bachelorproject Mol. Tox., Comp. Med. Chem. & Tox.<br />

<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 14 van 76


Vakcode X_430534 (430534)<br />

Periode Ac. Jaar (september)<br />

Credits 24.0<br />

Voertaal Nederlands<br />

Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />

Coördinator dr. J.N.M. Commandeur<br />

Inhoud vak<br />

De inhoud van het bachelorproject wordt in overleg met de docent<br />

bepaald. Dit geldt ook voor het aantal contacturen en te gebruiken<br />

studiemateriaal. Neem tijdig contact op met de docent.<br />

Overige informatie<br />

Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12<br />

studiepunten (vakcode 430532) kan in overleg met de coordinator worden<br />

uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 430533) of 24 studiepunten<br />

(vakcode 430534).<br />

Bachelorproject Mol. Tox., Drug, Disp. and Saf. Assessm.<br />

Vakcode X_430536 (430536)<br />

Periode Ac. Jaar (september)<br />

Credits 18.0<br />

Voertaal Nederlands<br />

Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />

Coördinator dr. J.N.M. Commandeur<br />

Inhoud vak<br />

De inhoud van het bachelorproject wordt in overleg met de docent<br />

bepaald. Dit geldt ook voor het aantal contacturen en te gebruiken<br />

studiemateriaal. Neem tijdig contact op met de docent.<br />

Overige informatie<br />

Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12<br />

studiepunten (vakcode 430535) kan in overleg met de coordinator worden<br />

uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 430536) of 24 studiepunten<br />

(vakcode 430537).<br />

Bachelorproject Mol. Tox., Drug, Disp. and Saf. Assessm.<br />

Vakcode X_430537 (430537)<br />

Periode Ac. Jaar (september)<br />

Credits 24.0<br />

Voertaal Nederlands<br />

Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />

Coördinator dr. J.N.M. Commandeur<br />

Inhoud vak<br />

De inhoud van het bachelorproject wordt in overleg met de docent<br />

bepaald. Dit geldt ook voor het aantal contacturen en te gebruiken<br />

studiemateriaal. Neem tijdig contact op met de docent.<br />

<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 15 van 76


Overige informatie<br />

Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12<br />

studiepunten (vakcode 430535) kan in overleg met de coordinator worden<br />

uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 430536) of 24 studiepunten<br />

(vakcode 430537).<br />

Bachelorproject Multidimensionale scheidingstechnieken<br />

Vakcode X_435122 (435122)<br />

Periode Ac. Jaar (september)<br />

Credits 18.0<br />

Voertaal Nederlands<br />

Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />

Coördinator dr. H. Lingeman<br />

Doel vak<br />

Het doel is het verwerven van praktisch en theoretisch inzicht over een<br />

bepaald thema aan de hand van het zelfstandig opzetten en uitvoeren van<br />

een onderzoeksproject.<br />

Inhoud vak<br />

Het primaire doel is het ontwikkelen van complete analytische systemen,<br />

waarmee zowel de selectiviteit als de gevoeligheid verbeterd kan<br />

worden. Met name de ontwikkeling en optimalisering van geautomatiseerde<br />

multi-dimensionale systemen neemt een centrale plaats in bij dit type<br />

onderzoek. Het gaat hierbij om de koppeling van gaschromatografische of<br />

vloeistofchromatografische systemen met elkaar en met verschillende<br />

detectiesystemen.<br />

Onderwijsvorm<br />

Zelfstandig opzetten en uitvoeren van een onderzoeksproject.<br />

Doelgroep<br />

3F, 3S<br />

Overige informatie<br />

Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12<br />

studiepunten (vakcode 435490) kan in overleg met de coordinator worden<br />

uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 435122) of 24 studiepunten<br />

(vakcode 435123).<br />

Bachelorproject Multidimensionale scheidingstechnieken<br />

Vakcode X_435123 (435123)<br />

Periode Ac. Jaar (september)<br />

Credits 24.0<br />

Voertaal Nederlands<br />

Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />

Coördinator dr. H. Lingeman<br />

Doel vak<br />

<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 16 van 76


Het doel is het verwerven van praktisch en theoretisch inzicht over een<br />

bepaald thema aan de hand van het zelfstandig opzetten en uitvoeren van<br />

een onderzoeksproject.<br />

Inhoud vak<br />

Het primaire doel is het ontwikkelen van complete analytische systemen,<br />

waarmee zowel de selectiviteit als de gevoeligheid verbeterd kan<br />

worden. Met name de ontwikkeling en optimalisering van geautomatiseerde<br />

multi-dimensionale systemen neemt een centrale plaats in bij dit type<br />

onderzoek. Het gaat hierbij om de koppeling van gaschromatografische of<br />

vloeistofchromatografische systemen met elkaar en met verschillende<br />

detectiesystemen.<br />

Onderwijsvorm<br />

Zelfstandig opzetten en uitvoeren van een onderzoeksproject.<br />

Doelgroep<br />

3F, 3S<br />

Overige informatie<br />

Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12<br />

studiepunten (vakcode 435490) kan in overleg met de coordinator worden<br />

uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 435122) of 24 studiepunten<br />

(vakcode 435123).<br />

Bachelorproject Organometaal synthese<br />

Vakcode X_435104 (435104)<br />

Periode Ac. Jaar (september)<br />

Credits 12.0<br />

Voertaal Nederlands<br />

Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />

Coördinator dr. J.C. Slootweg<br />

Doel vak<br />

Kennismaken met geavanceerde experimentele organometaalchemie.<br />

Inhoud vak<br />

In dit vak maak je kennis met synthetische technieken in de<br />

organometaal chemie. In dit project dat nauw gelieerd is aan lopend<br />

onderzoek werk je aan nieuwe organofosfor verbindingen en reagentia,<br />

katalysatoren, en (macro)cyclische structuren. Je leert technieken die<br />

de moderne chemicus tot zijn beschikking heeft om zuurstof en<br />

vochtgevoelige verbindingen te synthetiseren, en je gebruikt<br />

verschillende NMR methodes voor je analyses en chromatografische<br />

methodes voor de scheiding van je verbindingen; van kristallen worden,<br />

indien relvevant, X-ray structuren gemeten.<br />

Onderwijsvorm<br />

Practicumverslag<br />

Aanbevolen voorkennis<br />

Organische chemie I & II, practicum organische synthese.<br />

Doelgroep<br />

<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 17 van 76


3S, 3F<br />

Overige informatie<br />

Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12<br />

studiepunten (vakcode 435104) kan in overleg met de coordinator worden<br />

uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 435133) of 24 studiepunten<br />

(vakcode 435134).<br />

Bachelorproject Organometaal synthese<br />

Vakcode X_435133 (435133)<br />

Periode Ac. Jaar (september)<br />

Credits 18.0<br />

Voertaal Nederlands<br />

Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />

Coördinator dr. J.C. Slootweg<br />

Doel vak<br />

Kennismaken met geavanceerde experimentele organometaalchemie.<br />

Inhoud vak<br />

In dit vak maak je kennis met synthetische technieken in de<br />

organometaal chemie. In dit project dat nauw gelieerd is aan lopend<br />

onderzoek werk je aan nieuwe organofosfor verbindingen en reagentia,<br />

katalysatoren, en (macro)cyclische structuren. Je leert technieken die<br />

de moderne chemicus tot zijn beschikking heeft om zuurstof en<br />

vochtgevoelige verbindingen te synthetiseren, en je gebruikt<br />

verschillende NMR methodes voor je analyses en chromatografische<br />

methodes voor de scheiding van je verbindingen; van kristallen worden,<br />

indien relvevant, X-ray structuren gemeten.<br />

Onderwijsvorm<br />

Practicumverslag<br />

Aanbevolen voorkennis<br />

Organische chemie I & II, practicum organische synthese.<br />

Doelgroep<br />

3S, 3F<br />

Overige informatie<br />

Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12<br />

studiepunten (vakcode 435104) kan in overleg met de coordinator worden<br />

uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 435133) of 24 studiepunten<br />

(vakcode 435134).<br />

Bachelorproject Organometaal synthese<br />

Vakcode X_435134 (435134)<br />

Periode Ac. Jaar (september)<br />

Credits 24.0<br />

Voertaal Nederlands<br />

Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />

Coördinator dr. J.C. Slootweg<br />

<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 18 van 76


Doel vak<br />

Kennismaken met geavanceerde experimentele organometaalchemie.<br />

Inhoud vak<br />

In dit vak maak je kennis met synthetische technieken in de<br />

organometaal chemie. In dit project dat nauw gelieerd is aan lopend<br />

onderzoek werk je aan nieuwe organofosfor verbindingen en reagentia,<br />

katalysatoren, en (macro)cyclische structuren. Je leert technieken die<br />

de moderne chemicus tot zijn beschikking heeft om zuurstof en<br />

vochtgevoelige verbindingen te synthetiseren, en je gebruikt<br />

verschillende NMR methodes voor je analyses en chromatografische<br />

methodes voor de scheiding van je verbindingen; van kristallen worden,<br />

indien relvevant, X-ray structuren gemeten.<br />

Onderwijsvorm<br />

Practicumverslag<br />

Aanbevolen voorkennis<br />

Organische chemie I & II, practicum organische synthese.<br />

Doelgroep<br />

3S, 3F<br />

Overige informatie<br />

Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12<br />

studiepunten (vakcode 435104) kan in overleg met de coordinator worden<br />

uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 435133) of 24 studiepunten<br />

(vakcode 435134).<br />

Bachelorproject Spectroscopische detectie- en identificatietechnieken<br />

Vakcode X_435119 (435119)<br />

Periode Ac. Jaar (september)<br />

Credits 18.0<br />

Voertaal Nederlands<br />

Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />

Coördinator prof. dr. C. Gooijer<br />

Doel vak<br />

Het doel is het verwerven van praktisch en theoretisch inzicht omtrent<br />

een bepaald thema aan de hand van het zelfstandig opzetten en uitvoeren<br />

van een onderzoeksproject.<br />

Inhoud vak<br />

Het ontwikkelen van nieuwe spectroscopische technieken die voor<br />

analytische toepassingen kunnen worden gebruikt. Het gaat hier met name<br />

om laser detectiesystemen voor de chromatografie of electroforese en op<br />

Raman spectroscopische en hoge-resolutie spectroscopie systemen voor de<br />

specifieke en gevoelige detectie van organische verbindingen.<br />

Onderwijsvorm<br />

Zelfstandig opzetten en uitvoeren van een onderzoeksproject.<br />

Literatuur<br />

<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 19 van 76


Praktische handleidingen en basisliteratuur.<br />

Doelgroep<br />

3S, 3F<br />

Overige informatie<br />

Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12<br />

studiepunten (vakcode 435470) kan in overleg met de coordinator worden<br />

uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 435119) of 24 studiepunten<br />

(vakcode 435121).<br />

Bachelorproject Spectroscopische detectie- en identificatietechnieken<br />

Vakcode X_435121 (435121)<br />

Periode Ac. Jaar (september)<br />

Credits 24.0<br />

Voertaal Nederlands<br />

Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />

Coördinator prof. dr. C. Gooijer<br />

Doel vak<br />

Het doel is het verwerven van praktisch en theoretisch inzicht omtrent<br />

een bepaald thema aan de hand van het zelfstandig opzetten en uitvoeren<br />

van een onderzoeksproject.<br />

Inhoud vak<br />

Het ontwikkelen van nieuwe spectroscopische technieken die voor<br />

analytische toepassingen kunnen worden gebruikt. Het gaat hier met name<br />

om laser detectiesystemen voor de chromatografie of electroforese en op<br />

Raman spectroscopische en hoge-resolutie spectroscopie systemen voor de<br />

specifieke en gevoelige detectie van organische verbindingen.<br />

Onderwijsvorm<br />

Zelfstandig opzetten en uitvoeren van een onderzoeksproject.<br />

Literatuur<br />

Praktische handleidingen en basisliteratuur.<br />

Doelgroep<br />

3S, 3F<br />

Overige informatie<br />

Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12<br />

studiepunten (vakcode 435470) kan in overleg met de coordinator worden<br />

uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 435119) of 24 studiepunten<br />

(vakcode 435121).<br />

Bachelorproject Spectroscopische detectie- en identificatietechnieken<br />

Vakcode X_435470 (435470)<br />

Periode Ac. Jaar (september)<br />

Credits 12.0<br />

Voertaal Nederlands<br />

Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />

<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 20 van 76


Coördinator prof. dr. C. Gooijer<br />

Doel vak<br />

Het doel is het verwerven van praktisch en theoretisch inzicht omtrent<br />

een bepaald thema aan de hand van het zelfstandig opzetten en uitvoeren<br />

van een onderzoeksproject.<br />

Inhoud vak<br />

Het ontwikkelen van nieuwe spectroscopische technieken die voor<br />

analytische toepassingen kunnen worden gebruikt. Het gaat hier met name<br />

om laser detectiesystemen voor de chromatografie of electroforese en op<br />

Raman spectroscopische en hoge-resolutie spectroscopie systemen voor de<br />

specifieke en gevoelige detectie van organische verbindingen.<br />

Onderwijsvorm<br />

Zelfstandig opzetten en uitvoeren van een onderzoeksproject.<br />

Literatuur<br />

Praktische handleidingen en basisliteratuur.<br />

Doelgroep<br />

3S, 3F<br />

Overige informatie<br />

Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12<br />

studiepunten (vakcode 435470) kan in overleg met de coordinator worden<br />

uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 435119) of 24 studiepunten<br />

(vakcode 435121).<br />

Bachelorproject Synthese en structuuranalyse<br />

Vakcode X_435128 (435128)<br />

Periode Ac. Jaar (september)<br />

Credits 18.0<br />

Voertaal Nederlands<br />

Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />

Coördinator prof. dr. ir. R.V.A. Orru<br />

Doel vak<br />

Zelfstandig onderzoek.<br />

Inhoud vak<br />

In dit project zal op een geïntegreerde wijze binnen de sectie OAC<br />

gewerkt gaan worden. Tijdens het praktisch werk aan een<br />

meerstaps-synthese komt een aantal aspecten van organisch chemisch<br />

onderzoek aan de orde: karakteriseren van verbindingen (spectroscopie),<br />

bepalen van eigenschappen (rekenen) en mechanistisch onderzoek<br />

(kinetiek).<br />

Onderwijsvorm<br />

Zelfstandig onderzoek binnen de sectie.<br />

Toetsvorm<br />

Het project wordt afgesloten met schriftelijke en mondelinge<br />

verslaglegging (proeve van bekwaamheid).<br />

<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 21 van 76


Literatuur<br />

Wordt per project aangegeven.<br />

Aanbevolen voorkennis<br />

435090: Organische chemie 1<br />

435160: Organische chemie 2<br />

435140: Anorganische chemie 1<br />

435290: Anorganische chemie 2<br />

435192: Practicum Synthese<br />

Doelgroep<br />

3S<br />

Overige informatie<br />

Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12<br />

studiepunten (vakcode 435550) kan in overleg met de coordinator worden<br />

uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 435128) of 24 studiepunten<br />

(vakcode 435129).<br />

Bachelorproject Synthese en structuuranalyse<br />

Vakcode X_435129 (435129)<br />

Periode Ac. Jaar (september)<br />

Credits 24.0<br />

Voertaal Nederlands<br />

Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />

Coördinator prof. dr. ir. R.V.A. Orru<br />

Doel vak<br />

Zelfstandig onderzoek.<br />

Inhoud vak<br />

In dit project zal op een geïntegreerde wijze binnen de sectie OAC<br />

gewerkt gaan worden. Tijdens het praktisch werk aan een<br />

meerstaps-synthese komt een aantal aspecten van organisch chemisch<br />

onderzoek aan de orde: karakteriseren van verbindingen (spectroscopie),<br />

bepalen van eigenschappen (rekenen) en mechanistisch onderzoek<br />

(kinetiek).<br />

Onderwijsvorm<br />

Zelfstandig onderzoek binnen de sectie.<br />

Toetsvorm<br />

Het project wordt afgesloten met schriftelijke en mondelinge<br />

verslaglegging (proeve van bekwaamheid).<br />

Literatuur<br />

Wordt per project aangegeven.<br />

Aanbevolen voorkennis<br />

435090: Organische chemie 1<br />

435160: Organische chemie 2<br />

435140: Anorganische chemie 1<br />

435290: Anorganische chemie 2<br />

435192: Practicum Synthese<br />

<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 22 van 76


Doelgroep<br />

3S<br />

Overige informatie<br />

Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12<br />

studiepunten (vakcode 435550) kan in overleg met de coordinator worden<br />

uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 435128) of 24 studiepunten<br />

(vakcode 435129).<br />

Bachelorproject Synthese en structuuranalyse<br />

Vakcode X_435550 (435550)<br />

Periode Ac. Jaar (september)<br />

Credits 12.0<br />

Voertaal Nederlands<br />

Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />

Coördinator prof. dr. ir. R.V.A. Orru<br />

Doel vak<br />

Zelfstandig onderzoek.<br />

Inhoud vak<br />

In dit project zal op een geïntegreerde wijze binnen de sectie OAC<br />

gewerkt gaan worden. Tijdens het praktisch werk aan een<br />

meerstaps-synthese komt een aantal aspecten van organisch chemisch<br />

onderzoek aan de orde: karakteriseren van verbindingen (spectroscopie),<br />

bepalen van eigenschappen (rekenen) en mechanistisch onderzoek<br />

(kinetiek).<br />

Onderwijsvorm<br />

Zelfstandig onderzoek binnen de sectie.<br />

Toetsvorm<br />

Het project wordt afgesloten met schriftelijke en mondelinge<br />

verslaglegging (proeve van bekwaamheid).<br />

Literatuur<br />

Wordt per project aangegeven.<br />

Aanbevolen voorkennis<br />

435090: Organische chemie 1<br />

435160: Organische chemie 2<br />

435140: Anorganische chemie 1<br />

435290: Anorganische chemie 2<br />

435192: Practicum Synthese<br />

Doelgroep<br />

3S<br />

Overige informatie<br />

Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12<br />

studiepunten (vakcode 435550) kan in overleg met de coordinator worden<br />

uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 435128) of 24 studiepunten<br />

(vakcode 435129).<br />

<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 23 van 76


Bachelorproject Theoretical Chemistry<br />

Vakcode X_430517 (430517)<br />

Periode Ac. Jaar (september)<br />

Credits 12.0<br />

Voertaal Nederlands<br />

Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />

Coördinator prof. dr. L. Visscher<br />

Doel vak<br />

Het aanleren van de vaardigheden die gebruikt worden in de<br />

quantumtheoretische chemie.<br />

Inhoud vak<br />

Het doen van berekeningen om een beter inzicht te krijgen in<br />

moleculaire structuur, reactiemechanismen of spectroscopie is niet meer<br />

weg te denken uit de moderne chemie. In dit bachelorproject wordt onder<br />

gekeken naar hoe de theorie achter deze methoden tot stand komt en hoe<br />

deze theorie kan worden gebruikt in moderne quantumchemische software<br />

(ADF, DIRAC). Daarnaast krijgt de toepassing en validatie van recent<br />

ontwikkelde methoden veel aandacht. Actuele onderwerpen die aan bod<br />

kunnen komen zijn subsysteem dichtheids-functionaaltheorie, ab initio<br />

moleculaire dynamica, responstheorie, chemie en spectroscopie van<br />

f-elementen lanthanides, actinides).<br />

Onderwijsvorm<br />

De student krijgt in de eerste weken een verdieping van de stof die aan<br />

de orde is gekomen in de cursus Computational Chemistry. Hierbij zal de<br />

nadruk liggen op technieken die relevant zijn voor het gekozen<br />

onderzoeksproject. Daarna worden deze methoden toegepast in een<br />

onderzoeksproject onder dagelijkse begeleiding van een van de<br />

promovendi en/of postdocs van de sectie.<br />

Literatuur<br />

Atkins, P.W., Molecular Quantum Mechanics 3rd ed. Oxford: Oxford<br />

University Press.<br />

Selectie van recente review artikelen.<br />

Doelgroep<br />

3S, 3F<br />

Overige informatie<br />

Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12<br />

studiepunten (vakcode 430517) kan in overleg met de coordinator worden<br />

uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 435126) of 24 studiepunten<br />

(vakcode 435127).<br />

Bachelorproject Theoretical Chemistry<br />

Vakcode X_435126 (435126)<br />

Periode Ac. Jaar (september)<br />

Credits 18.0<br />

Voertaal Nederlands<br />

<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 24 van 76


Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />

Coördinator prof. dr. L. Visscher<br />

Doel vak<br />

Het aanleren van de vaardigheden die gebruikt worden in de<br />

quantumtheoretische chemie.<br />

Inhoud vak<br />

Het doen van berekeningen om een beter inzicht te krijgen in<br />

moleculaire structuur, reactiemechanismen of spectroscopie is niet meer<br />

weg te denken uit de moderne chemie. In dit bachelorproject wordt onder<br />

gekeken naar hoe de theorie achter deze methoden tot stand komt en hoe<br />

deze theorie kan worden gebruikt in moderne quantumchemische software<br />

(ADF, DIRAC). Daarnaast krijgt de toepassing en validatie van recent<br />

ontwikkelde methoden veel aandacht. Actuele onderwerpen die aan bod<br />

kunnen komen zijn subsysteem dichtheids-functionaaltheorie, ab initio<br />

moleculaire dynamica, responstheorie, chemie en spectroscopie van<br />

f-elementen lanthanides, actinides).<br />

Onderwijsvorm<br />

De student krijgt in de eerste weken een verdieping van de stof die aan<br />

de orde is gekomen in de cursus Computational Chemistry. Hierbij zal de<br />

nadruk liggen op technieken die relevant zijn voor het gekozen<br />

onderzoeksproject. Daarna worden deze methoden toegepast in een<br />

onderzoeksproject onder dagelijkse begeleiding van een van de<br />

promovendi en/of postdocs van de sectie.<br />

Literatuur<br />

Atkins, P.W., Molecular Quantum Mechanics 3rd ed. Oxford: Oxford<br />

University Press.<br />

Selectie van recente review artikelen.<br />

Doelgroep<br />

3S, 3F<br />

Overige informatie<br />

Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12<br />

studiepunten (vakcode 430517) kan in overleg met de coordinator worden<br />

uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 435126) of 24 studiepunten<br />

(vakcode 435127).<br />

Bachelorproject Theoretical Chemistry<br />

Vakcode X_435127 (435127)<br />

Periode Ac. Jaar (september)<br />

Credits 24.0<br />

Voertaal Nederlands<br />

Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />

Coördinator prof. dr. L. Visscher<br />

Doel vak<br />

Het aanleren van de vaardigheden die gebruikt worden in de<br />

quantumtheoretische chemie.<br />

<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 25 van 76


Inhoud vak<br />

Het doen van berekeningen om een beter inzicht te krijgen in<br />

moleculaire structuur, reactiemechanismen of spectroscopie is niet meer<br />

weg te denken uit de moderne chemie. In dit bachelorproject wordt onder<br />

gekeken naar hoe de theorie achter deze methoden tot stand komt en hoe<br />

deze theorie kan worden gebruikt in moderne quantumchemische software<br />

(ADF, DIRAC). Daarnaast krijgt de toepassing en validatie van recent<br />

ontwikkelde methoden veel aandacht. Actuele onderwerpen die aan bod<br />

kunnen komen zijn subsysteem dichtheids-functionaaltheorie, ab initio<br />

moleculaire dynamica, responstheorie, chemie en spectroscopie van<br />

f-elementen lanthanides, actinides).<br />

Onderwijsvorm<br />

De student krijgt in de eerste weken een verdieping van de stof die aan<br />

de orde is gekomen in de cursus Computational Chemistry. Hierbij zal de<br />

nadruk liggen op technieken die relevant zijn voor het gekozen<br />

onderzoeksproject. Daarna worden deze methoden toegepast in een<br />

onderzoeksproject onder dagelijkse begeleiding van een van de<br />

promovendi en/of postdocs van de sectie.<br />

Literatuur<br />

Atkins, P.W., Molecular Quantum Mechanics 3rd ed. Oxford: Oxford<br />

University Press.<br />

Selectie van recente review artikelen.<br />

Doelgroep<br />

3S, 3F<br />

Overige informatie<br />

Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12<br />

studiepunten (vakcode 430517) kan in overleg met de coordinator worden<br />

uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 435126) of 24 studiepunten<br />

(vakcode 435127).<br />

Bachelorproject Toegepaste theoretische chemie<br />

Vakcode X_435131 (435131)<br />

Periode Ac. Jaar (september)<br />

Credits 18.0<br />

Voertaal Nederlands<br />

Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />

Coördinator prof. dr. F.M. Bickelhaupt<br />

Doel vak<br />

Het begrijpen en voorspellen van moleculaire structuren en chemische<br />

reactiviteit op het gebied van de organische, anorganische, fysische en<br />

biologische chemie.<br />

Inhoud vak<br />

De theoretische chemie is niet meer weg te denken uit de moderne<br />

scheikunde. Tal van eigenschappen kunnen met chemische nauwkeurigheid<br />

berekend worden, waardoor experimenteel moeilijk of niet te achterhalen<br />

grootheden alsnog bestudeerd of voorspeld kunnen worden. Toch is het<br />

potentieel van de theoretische chemie hiermee nog lang niet uitgeput.<br />

Om syntheses, katalysatoren of farmacologisch actieve moleculen in<br />

sterkere mate langs rationele weg (en dus in mindere mate door<br />

<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 26 van 76


"uitproberen") te kunnen ontwerpen is het van cruciaal belang om<br />

nauwkeurigheid te verbinden met gefundeerd en diepgaand inzicht in de<br />

achterliggende mechanismen in de electronische structuur. Dit geldt ook<br />

als het onderzoek in de vorm van computational chemistry geschiedt.<br />

Inzicht kan hierbij verkregen worden d.m.v. nadere analyse van de<br />

berekende golffunctie en bindingsenergie. Het doel van deze basiscursus<br />

is het verwerven van de vaardigheden, die nodig zijn om de aard van een<br />

chemisch fenomeen in detail te begrijpen, waarbij het in de zogenaamde<br />

Kohn-Sham-dichtheidsfunctionaaltheorie besloten molecuul-orbitaal-(MO)<br />

model een centrale rol speelt.<br />

Onderwijsvorm<br />

De cursus bestaat uit een intensieve theoretische inleiding in de<br />

eerste week, gevolgd door een onderzoeksfase, waarbij de student<br />

deelneemt aan een onderzoeksproject binnen de afdeling.<br />

Literatuur<br />

Fragmenten uit:<br />

Albright, T.A., Burdett, J.K., and Whangbo, M.H., Orbital Interactions<br />

in Chemistry, New York: Wiley-Interscience, 1985.<br />

Bickelhaupt, F.M., and Baerends, E.J., Kohn-Sham Density Functional<br />

Theory: Predicting and Understanding Chemistry. in Rev. Computational<br />

Chemistry, Volume 15, Eds. Lipkowitz, K.B. and Boyd, D.B. New York:<br />

Wiley-VCH, Vol. 15.<br />

Cramer, C.J., Essentials of Computational Chemistry: Theories and<br />

Models, Chichester: Wiley-VCH, 2002.<br />

Doelgroep<br />

3S, 3F<br />

Overige informatie<br />

Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12<br />

studiepunten (vakcode 435570) kan in overleg met de coordinator worden<br />

uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 435131) of 24 studiepunten<br />

(vakcode 435132).<br />

Bachelorproject Toegepaste theoretische chemie<br />

Vakcode X_435132 (435132)<br />

Periode Ac. Jaar (september)<br />

Credits 24.0<br />

Voertaal Nederlands<br />

Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />

Coördinator prof. dr. F.M. Bickelhaupt<br />

Doel vak<br />

Het begrijpen en voorspellen van moleculaire structuren en chemische<br />

reactiviteit op het gebied van de organische, anorganische, fysische en<br />

biologische chemie.<br />

Inhoud vak<br />

De theoretische chemie is niet meer weg te denken uit de moderne<br />

scheikunde. Tal van eigenschappen kunnen met chemische nauwkeurigheid<br />

berekend worden, waardoor experimenteel moeilijk of niet te achterhalen<br />

grootheden alsnog bestudeerd of voorspeld kunnen worden. Toch is het<br />

potentieel van de theoretische chemie hiermee nog lang niet uitgeput.<br />

<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 27 van 76


Om syntheses, katalysatoren of farmacologisch actieve moleculen in<br />

sterkere mate langs rationele weg (en dus in mindere mate door<br />

"uitproberen") te kunnen ontwerpen is het van cruciaal belang om<br />

nauwkeurigheid te verbinden met gefundeerd en diepgaand inzicht in de<br />

achterliggende mechanismen in de electronische structuur. Dit geldt ook<br />

als het onderzoek in de vorm van computational chemistry geschiedt.<br />

Inzicht kan hierbij verkregen worden d.m.v. nadere analyse van de<br />

berekende golffunctie en bindingsenergie. Het doel van deze basiscursus<br />

is het verwerven van de vaardigheden, die nodig zijn om de aard van een<br />

chemisch fenomeen in detail te begrijpen, waarbij het in de zogenaamde<br />

Kohn-Sham-dichtheidsfunctionaaltheorie besloten molecuul-orbitaal-(MO)<br />

model een centrale rol speelt.<br />

Onderwijsvorm<br />

De cursus bestaat uit een intensieve theoretische inleiding in de<br />

eerste week, gevolgd door een onderzoeksfase, waarbij de student<br />

deelneemt aan een onderzoeksproject binnen de afdeling.<br />

Literatuur<br />

Fragmenten uit:<br />

Albright, T.A., Burdett, J.K., and Whangbo, M.H., Orbital Interactions<br />

in Chemistry, New York: Wiley-Interscience, 1985.<br />

Bickelhaupt, F.M., and Baerends, E.J., Kohn-Sham Density Functional<br />

Theory: Predicting and Understanding Chemistry. in Rev. Computational<br />

Chemistry, Volume 15, Eds. Lipkowitz, K.B. and Boyd, D.B. New York:<br />

Wiley-VCH, Vol. 15.<br />

Cramer, C.J., Essentials of Computational Chemistry: Theories and<br />

Models, Chichester: Wiley-VCH, 2002.<br />

Doelgroep<br />

3S, 3F<br />

Overige informatie<br />

Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12<br />

studiepunten (vakcode 435570) kan in overleg met de coordinator worden<br />

uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 435131) of 24 studiepunten<br />

(vakcode 435132).<br />

Bachelorproject Toegepaste theoretische chemie<br />

Vakcode X_435570 (435570)<br />

Periode Ac. Jaar (september)<br />

Credits 12.0<br />

Voertaal Nederlands<br />

Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />

Coördinator prof. dr. F.M. Bickelhaupt<br />

Doel vak<br />

Het begrijpen en voorspellen van moleculaire structuren en chemische<br />

reactiviteit op het gebied van de organische, anorganische, fysische en<br />

biologische chemie.<br />

Inhoud vak<br />

De theoretische chemie is niet meer weg te denken uit de moderne<br />

scheikunde. Tal van eigenschappen kunnen met chemische nauwkeurigheid<br />

berekend worden, waardoor experimenteel moeilijk of niet te achterhalen<br />

<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 28 van 76


grootheden alsnog bestudeerd of voorspeld kunnen worden. Toch is het<br />

potentieel van de theoretische chemie hiermee nog lang niet uitgeput.<br />

Om syntheses, katalysatoren of farmacologisch actieve moleculen in<br />

sterkere mate langs rationele weg (en dus in mindere mate door<br />

"uitproberen") te kunnen ontwerpen is het van cruciaal belang om<br />

nauwkeurigheid te verbinden met gefundeerd en diepgaand inzicht in de<br />

achterliggende mechanismen in de electronische structuur. Dit geldt ook<br />

als het onderzoek in de vorm van computational chemistry geschiedt.<br />

Inzicht kan hierbij verkregen worden d.m.v. nadere analyse van de<br />

berekende golffunctie en bindingsenergie. Het doel van deze basiscursus<br />

is het verwerven van de vaardigheden, die nodig zijn om de aard van een<br />

chemisch fenomeen in detail te begrijpen, waarbij het in de zogenaamde<br />

Kohn-Sham-dichtheidsfunctionaaltheorie besloten molecuul-orbitaal-(MO)<br />

model een centrale rol speelt.<br />

Onderwijsvorm<br />

De cursus bestaat uit een intensieve theoretische inleiding in de<br />

eerste week, gevolgd door een onderzoeksfase, waarbij de student<br />

deelneemt aan een onderzoeksproject binnen de afdeling.<br />

Literatuur<br />

Fragmenten uit:<br />

Albright, T.A., Burdett, J.K., and Whangbo, M.H., Orbital Interactions<br />

in Chemistry, New York: Wiley-Interscience, 1985.<br />

Bickelhaupt, F.M., and Baerends, E.J., Kohn-Sham Density Functional<br />

Theory: Predicting and Understanding Chemistry. in Rev. Computational<br />

Chemistry, Volume 15, Eds. Lipkowitz, K.B. and Boyd, D.B. New York:<br />

Wiley-VCH, Vol. 15.<br />

Cramer, C.J., Essentials of Computational Chemistry: Theories and<br />

Models, Chichester: Wiley-VCH, 2002.<br />

Doelgroep<br />

3S, 3F<br />

Overige informatie<br />

Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12<br />

studiepunten (vakcode 435570) kan in overleg met de coordinator worden<br />

uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 435131) of 24 studiepunten<br />

(vakcode 435132).<br />

Basischemie<br />

Vakcode X_435077 (435077)<br />

Periode Periode 1<br />

Credits 3.0<br />

Voertaal Nederlands<br />

Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />

Coördinator dr. K. Retra<br />

Doel vak<br />

Het doel van de cursus is het aanleren van de basisprincipes van chemie<br />

en de farmacochemie, het gelijktrekken van het beginniveau van alle<br />

studenten.<br />

Inhoud vak<br />

<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 29 van 76


In een geïntegreerd hoor-/werkcollege komen veel onderwerpen van de<br />

middelbare school weer aan orde, zoals zuur/base berekeningen,<br />

evenwichten, vormingsenergieën en elektrochemie. De nadruk ligt hierbij<br />

op berekeningen. Verder zullen nieuwe begrippen worden geïntroduceerd<br />

zoals thermodynamische begrippen en stofeigenschappen zoals pKa<br />

waarden. Tevens zal aandacht besteed worden aan de achtergrond van de<br />

basispractica.<br />

Onderwijsvorm<br />

Geïntegreerd hoor-/werkcollege.<br />

Literatuur<br />

Zumdahl, S.S., Chemical Principles 6th ed.<br />

En een studiehandleiding verstrekt door de docent.<br />

Doelgroep<br />

1F, 1S<br />

Basispracticum farmacochemie<br />

Vakcode X_430561 ()<br />

Credits 3.0<br />

Voertaal Nederlands<br />

Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />

Coördinator dr. J.N.M. Commandeur<br />

Doel vak<br />

Het aanleren van basisvaardigheden die nodig zijn voor het uitvoeren<br />

van experimenten alsmede een eerste kennismaking met het onderzoek dat<br />

wordt uitgevoerd bij de verschillende secties die betrokken zijn bij de<br />

opleiding <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen.<br />

Inhoud vak<br />

Het aanleren van basisvaardigheden die nodig zijn voor het uitvoeren<br />

van experimenten alsmede de kennismaking met (experimentele)<br />

technieken/methoden in de verschillende farmacochemische richtingen. Op<br />

het practicum worden enkele experimenten/projecten uitgevoerd waarin<br />

een aantal basisvaardigheden wordt geoefend. Deze vaardigheden worden<br />

daarna gebruikt bij het uitvoeren van onderzoeksprojecten later in het<br />

curriculum. Die vaardigheden betreffen o.a. het bestuderen van de<br />

theorie/literatuuronderzoek, definiëren van een hypothese, opstellen<br />

van een plan van aanpak, ontwerpen van een experiment, uitvoeren van<br />

het experiment, bijhouden van een labjournaal, kritische beoordeling<br />

van de resultaten, alsmede mondelingen en schriftelijke rapportage.<br />

Onderwijsvorm<br />

Het practicum wordt wordt uitgevoerd als projectmatig onderwijs,<br />

waarbij de student aan de hand van opdrachten zelf alle noodzakelijke<br />

gegevens, de theoretische achtergrond en de voorschriften moet opzoeken<br />

en het experiment zelf vormgeven.<br />

Toetsvorm<br />

Verslagen, Meetrapporten en Labjournaal<br />

Literatuur<br />

<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 30 van 76


Tijdens het practicum zal voldoende literatuur aanwezig zijn om de<br />

opdrachten te kunnen uitvoeren.<br />

Doelgroep<br />

1F<br />

Overige informatie<br />

Het met een voldoende afronden van het Basispracticum Farmacochemie is<br />

alleen dan mogelijk, indien de brandblusinstructie en de<br />

veiligheidsinstructie naar behoren zijn afgerond.<br />

Basispracticum Farmacochemie<br />

Vakcode X_435078 (435078)<br />

Periode Periode 1<br />

Credits 4.0<br />

Voertaal Nederlands<br />

Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />

Coördinator dr. J.N.M. Commandeur<br />

Docent(en) dr. J.N.M. Commandeur<br />

Lesmethode(n) Hoorcollege, Practicum<br />

Onderwijsvorm<br />

Het practicum wordt wordt uitgevoerd als projectmatig onderwijs,<br />

waarbij de student aan de hand van opdrachten zelf alle noodzakelijke<br />

gegevens, de theoretische achtergrond en de voorschriften moet opzoeken<br />

en het experiment zelf vormgeven.<br />

Toetsvorm<br />

Verslagen, Meetrapporten en Labjournaal<br />

Literatuur<br />

Tijdens het practicum zal voldoende literatuur aanwezig zijn om de<br />

opdrachten te kunnen uitvoeren.<br />

Doelgroep<br />

1F<br />

Basiswiskunde<br />

Vakcode X_401069 ()<br />

Credits 3.0<br />

Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />

Coördinator drs. J.A. Los<br />

Doel vak<br />

Het doel van deze cursus is het ophalen en bijbrengen van wiskundige<br />

basisvaardigheden die nodig zijn in vervolgcolleges zoals Calculus en<br />

Statistiek.<br />

Inhoud vak<br />

De cursus begint met een herhaling van vwo stof. Sommige onderwerpen<br />

zullen op wiskunde b niveau afgesloten worden. Ook komen een aantal<br />

<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 31 van 76


nieuwe onderwerpen aan bod (deels afhankelijk van je vwo-voorkennis):<br />

integreren, goniometrie, limieten, complexe getallen en bewijzen met<br />

volledige inductie.<br />

Onderwijsvorm<br />

Gemengd hoor- en werkcollege en huiswerkopgaven.<br />

Toetsvorm<br />

Een afsluitend schriftelijk tentamen en een tussentoets.<br />

Literatuur<br />

Basisboek wiskunde (tweede editie), Jan van de Craats en Rob Bosch,<br />

Pearson, ISBN 978-90-430-1673-5. Aangevuld met een dictaat.<br />

Doelgroep<br />

1F, 1MNW, 1S, 1SBI<br />

Bioanalyse eiwitten<br />

Vakcode X_435099 (435099)<br />

Periode Periode 1<br />

Credits 3.0<br />

Voertaal Nederlands<br />

Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />

Coördinator dr. J. Kool<br />

Docent(en) dr. J. Kool<br />

Lesmethode(n) Werkcollege<br />

Bio-Analytical Chemistry<br />

Vakcode X_430094 (430094)<br />

Periode Periode 5<br />

Credits 3.0<br />

Voertaal Nederlands<br />

Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />

Coördinator prof. dr. H. Irth<br />

Docent(en) dr. H. Lingeman, prof. dr. H. Irth<br />

Lesmethode(n) Hoorcollege<br />

Toetsvorm<br />

De toetsing bestaat uit verschillende onderdelen, o.a. theoretische<br />

voorbereiding, experimentele vaardigheden, schriftelijke<br />

verslaglegging, motivatie/inzicht.<br />

Literatuur<br />

Tijdens het practicum zal voldoende literatuur aanwezig zijn om de<br />

opdrachten te kunnen uitvoeren.<br />

Biochemie<br />

Vakcode X_430562 ()<br />

<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 32 van 76


Credits 3.0<br />

Voertaal Nederlands<br />

Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />

Coördinator J.C. Vos<br />

Doel vak<br />

Het hoorcollege dient om inzicht te geven in de basisprincipes van de<br />

bouw van levende cellen, de chemische structuur van de bestanddelen van<br />

deze cellen en de manier waarop cellen energie winnen uit de afbraak<br />

van voedingsstoffen en deze energie gebruiken voor groei en deling, als<br />

ook basisprincipes van de moleculaire biologie van de levende cel, de<br />

manier waarop genetische informatie in cellen wordt opgeslagen en de<br />

verwerking van deze informatie tot de eiwitten van de cel. Ook de<br />

belangrijkste aspecten van recombinant DNA technologie worden behandeld.<br />

Inhoud vak<br />

Aandacht voor de genetische informatiestroom DNA -> RNA -> eiwit en de<br />

manier waarop deze informatiestroom wordt gereguleerd. Tenslotte komen<br />

de belangrijkste onderdelen van de recombinant DNA technologie aan de<br />

orde (genetische modificatie, DNA volgorde analyse, PCR, etc.).<br />

Vervolgens wordt bekeken op welke manier een cel zijn energie verkrijgt<br />

uit voedsel. De afbraakroutes van de belangrijkste voedingsstoffen<br />

(koolhydraten en vetten) worden besproken, gevolgd door de structuur en<br />

functie van biologische membranen die een centrale rol spelen in de<br />

omzetting van de zo gewonnen energie in een voor de cel bruikbare vorm<br />

(ATP). Ook de fotosynthese komt aan bod.<br />

Onderwijsvorm<br />

Hoorcollege. Op de de Blackboard site behorend bij dit vak worden<br />

vragen aangeboden aan de hand waarvan de studenten zichzelf kunnen<br />

toetsen.<br />

Toetsvorm<br />

Biochemie zal worden getoetst aan de hand van twee deeltentamens, Het<br />

eerste deel zal gaan over de hoofdstukken waarin cellen, celbouw,<br />

bouwstenen van biochemisch belangrijke macromoleculen, DNA, eiwit<br />

alsmede enzymfunctie wordt behandeld. Het tweede deeltentamen zal de<br />

hoofdstukken toetsen waarin DNA repair, transcriptie en translatie,<br />

genomes, moleculair biologische technieken en cellulair metabolisme en<br />

energiehuishouding aan de orde komen.<br />

Literatuur<br />

Alberts, B. e.a., Essential Cell Biology 3rd ed, 2009. Voornamelijk de<br />

hoofdstukken 7-9, 10-14, zoals aangegeven in de studiehandleiding bij<br />

<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 33 van 76


dit college.<br />

Aanbevolen voorkennis<br />

Levende Chemie<br />

Doelgroep<br />

1F, 1MNW, mBio<br />

Biochemie<br />

Vakcode X_435051 (435051)<br />

Periode Periode 2<br />

Credits 6.0<br />

Voertaal Nederlands<br />

Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />

Coördinator dr. M.H. Siderius<br />

Doel vak<br />

Het hoorcollege dient om inzicht te geven in de basisprincipes van de<br />

bouw van levende cellen, de chemische structuur van de bestanddelen van<br />

deze cellen en de manier waarop cellen energie winnen uit de afbraak<br />

van voedingsstoffen en deze energie gebruiken voor groei en deling, als<br />

ook basisprincipes van de moleculaire biologie van de levende cel, de<br />

manier waarop genetische informatie in cellen wordt opgeslagen en de<br />

verwerking van deze informatie tot de eiwitten van de cel. Ook de<br />

belangrijkste aspecten van recombinant DNA technologie worden behandeld.<br />

Inhoud vak<br />

Er wordt begonnen met het bespreken van de structurele en functionele<br />

opbouw van de levende cel, waarna de verschillende soorten<br />

(macro)moleculen die in de cel aanwezig zijn worden behandeld.<br />

Vervolgens wordt bekeken op welke manier een cel zijn energie verkrijgt<br />

uit voedsel. De afbraakroutes van de belangrijkste voedingsstoffen<br />

(koolhydraten en vetten) worden besproken, gevolgd door de structuur en<br />

functie van biologische membranen die een centrale rol spelen in de<br />

omzetting van de zo gewonnen energie in een voor de cel bruikbare vorm<br />

(ATP). Ook de fotosynthese komt aan bod. Tevens de behandeling van de<br />

structuur en functie van DNA en de manier waarop DNA in de celkern is<br />

opgevouwen tot chromosomen. Vervolgens de genetische informatiestroom<br />

DNA -> RNA -> eiwit en de manier waarop deze informatiestroom wordt<br />

gereguleerd. Tenslotte komen de belangrijkste onderdelen van de<br />

recombinant DNA technologie aan de orde (genetische modificatie, DNA<br />

volgorde analyse, PCR, etc.).<br />

Onderwijsvorm<br />

Hoorcollege. Op de de Blackboard site behorend bij dit vak worden<br />

vragen aangeboden aan de hand waarvan de studenten zichzelf kunnen<br />

toetsen.<br />

Toetsvorm<br />

Biochemie zal worden getoetst aan de hand van twee deeltentamens, Het<br />

eerste deel zal gaan over de hoofdstukken waarin cellen, celbouw,<br />

bouwstenen van biochemisch belangrijke macromoleculen, DNA, eiwit<br />

alsmede enzymfunctie wordt behandeld. Het tweede deeltentamen zal de<br />

hoofdstukken toetsen waarin DNA repair, transcriptie en translatie,<br />

genomes, moleculair biologische technieken en cellulair metabolisme en<br />

<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 34 van 76


energiehuishouding aan de orde komen.<br />

Literatuur<br />

Alberts, B. e.a., Essential Cell Biology 3rd ed, 2009. delen hieruit<br />

zoals aangegeven in de studiehandleiding bij dit college.<br />

Doelgroep<br />

1F, 1MNW, 1S, 1SBI, 1W-B<br />

Blusinstructie: Praktijk S&F/N&S/SBI incl MNW.<br />

Vakcode X_000002 ()<br />

Periode Periode 1<br />

Credits 0.0<br />

Voertaal Nederlands<br />

Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />

Lesmethode(n) Practicum<br />

Blusinstructie: Theorie: S&F/N&S/W/I/SBI gelijktijdig in Q1<br />

Vakcode X_000003 ()<br />

Periode Periode 1<br />

Credits 0.0<br />

Voertaal Nederlands<br />

Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />

Lesmethode(n) Hoorcollege<br />

BP Farmacochemie MC, DD&S<br />

Vakcode X_430527 (430527)<br />

Periode Ac. Jaar (september)<br />

Credits 18.0<br />

Voertaal Nederlands<br />

Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />

Coördinator dr. J.N.M. Commandeur<br />

BP Farmacochemie MC, DD&S<br />

Vakcode X_430528 (430528)<br />

Periode Ac. Jaar (september)<br />

Credits 24.0<br />

Voertaal Nederlands<br />

Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />

Coördinator dr. J.N.M. Commandeur<br />

Calculus 1<br />

<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 35 van 76


Vakcode X_400300 ()<br />

Periode Periode 2<br />

Credits 3.0<br />

Voertaal Nederlands<br />

Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />

Coördinator drs. J.A. Los<br />

Docent(en) dr. C.M. Quant, drs. J.A. Los<br />

Lesmethode(n) Hoorcollege, Werkcollege<br />

Chemie / farmacochemie en samenleving<br />

Vakcode X_435080 (435080)<br />

Periode Periode 4<br />

Credits 3.0<br />

Voertaal Nederlands<br />

Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />

Coördinator dr. J.E. van Muijlwijk-Koezen<br />

Doel vak<br />

1. De studenten krijgen inzicht in de wereld van de chemie. Ze leren<br />

mensen en organisaties uit de chemie kennen en bouwen een netwerk op.<br />

2. De studenten ontdekken hoe de samenleving eruit ziet, wat de<br />

samenleving weet van chemie en hoe de samenleving denkt over chemie.<br />

3. De studenten ontwikkelen (verder) een aantal academische<br />

vaardigheden zoals projectmatig werken, presenteren, rapporteren,<br />

doelgericht interviewen, bewust zijn van eigen competenties en<br />

motivatie voor het opleidingsgebied, feedback geven en kritisch<br />

beoordelen.<br />

4. De drie bovenstaande doelen hebben tot resultaat dat de studenten<br />

een houding ontwikkelen om een goed ambassadeur voor hun vak te zijn.<br />

Inhoud vak<br />

Tijdens de cursus wordt in projectvorm gewerkt. De wereld van de chemie<br />

wordt ingeleid met drie gastcolleges gegeven door drie chemici werkend<br />

voor organisaties die een belangrijke rol spelen in die wereld. Ook<br />

moeten de studenten drie chemici van buiten de VU interviewen uit het<br />

onderzoek, de industrie en het onderwijs.<br />

De studenten verkennen de samenleving door het uitvoeren van een<br />

onderzoek naar het imago van de chemie in de samenleving. Dit onderzoek<br />

wordt uitgevoerd in groepen. De studenten rapporteren mondeling en<br />

schriftelijk over dit onderzoek, waarbij verschillende vaardigheden aan<br />

bod komen.<br />

De cursus wordt feestelijk afgesloten met een borrel, waar de studenten<br />

zullen strijden om de eer van de beste elevator pitch over chemie, een<br />

van de individuele opdrachten.<br />

Onderwijsvorm<br />

Hoor- en werkcolleges, groepsopdrachten en individuele opdrachten<br />

Toetsvorm<br />

Beoordeling vindt plaats aan de hand van:<br />

- Het functioneren in het groepswerk.<br />

- De resultaten van de groepsopdrachten.<br />

<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 36 van 76


- De resultaten van de individuele opdrachten.<br />

Doelgroep<br />

1S, 1F<br />

Chemische binding<br />

Vakcode X_435079 (435079)<br />

Periode Periode 2<br />

Credits 3.0<br />

Voertaal Nederlands<br />

Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />

Coördinator prof. dr. C. Gooijer<br />

Doel vak<br />

Doel van het college is de introductie van quantummechanische concepten<br />

voor het beschrijven van atomen en moleculen om zicht te krijgen op hun<br />

chemische eigenschappen.<br />

Inhoud vak<br />

Na een introductie in de quantumwereld wordt het waterstofatoom<br />

behandeld en vervolgens de opbouw van het periodiek systeem besproken.<br />

Vervolgens komt het concept van chemische binding aan de orde eerst op<br />

basis van Lewis-structuren en daarna op basis van elektronen orbitals.<br />

Tenslotte zullen de elektronenspectroscopie en de vibratiespectroscopie<br />

worden geintroduceerd.<br />

Onderwijsvorm<br />

Gecombineerd hoorcollege en werkcollege<br />

Literatuur<br />

Zumdahl, S.S., Chemical Principles 6th ed, Houghton Mifflin Comp, 2009<br />

(ISBN 0-618-94690-X). chapters 12, 13 and 14.<br />

Doelgroep<br />

1F, 1S<br />

Computational (Pharmaco)Chemistry<br />

Vakcode X_435350 (435350)<br />

Periode Periode 2<br />

Credits 6.0<br />

Voertaal Nederlands<br />

Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />

Coördinator prof. dr. F.M. Bickelhaupt<br />

Docent(en) prof. dr. F.M. Bickelhaupt<br />

Lesmethode(n) Hoorcollege, Practicum<br />

Doel vak<br />

Het leren van moderne quantumchemische methoden en met name het<br />

toepassen daarvan bij het computerondersteund oplossen van chemische<br />

problemen.<br />

<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 37 van 76


Onderwijsvorm<br />

De cursus bestaat uit een hoorcollege en een practicum, waarin een kort<br />

researchproject is opgenomen.<br />

Literatuur<br />

Cramer, C.J. Essentials of Computational Chemistry: Theories and<br />

Models. Chichester: Wiley-VCH, 2002.<br />

Doelgroep<br />

3F, 3S<br />

Overige informatie<br />

In verband met het verschil in voorkennis van de studenten S en F is er<br />

voor een aantal colleges onderscheid gemaakt in verplichte en<br />

vrijwillige college-uren.<br />

De twee college-uren "Symmetrie en Hückel-theorie" zijn verplicht voor<br />

3F studenten en vrijwillig voor 3S studenten.<br />

De twee college-uren "Modeling" zijn verplicht voor 3S studenten en<br />

vrijwillig voor 3F studenten.<br />

Computationele organische chemie Computational Organic Chemistry<br />

Vakcode X_435017 (435017)<br />

Periode Ac. Jaar (september)<br />

Credits 9.0<br />

Voertaal Nederlands<br />

Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />

Coördinator dr. A.W. Ehlers<br />

Doel vak<br />

Kennismaken met moderne "computational chemistry" methoden om de<br />

structuur, eigenschappen en de reactiviteit van organische moleculen te<br />

onderzoeken.<br />

Onderwijsvorm<br />

Practicumproject.<br />

Literatuur<br />

Foresman, J.B., and Frisch, A., Exploring Chemistry with Electronic<br />

Structure Methods 2nd ed. Gaussian Inc. of in overleg met de docent.<br />

Doelgroep<br />

3S, 3F<br />

<strong>Farmaceutische</strong> toxicologie<br />

Vakcode X_430103 (430103)<br />

Periode Periode 1<br />

Credits 3.0<br />

Voertaal Nederlands<br />

Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />

Coördinator dr. J.N.M. Commandeur<br />

Docent(en) dr. J.N.M. Commandeur<br />

<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 38 van 76


Lesmethode(n) Werkcollege<br />

Doel vak<br />

Het verkrijgen van inzicht in de wijze waarop de risicoschatting van<br />

nieuwe (kandidaat)geneesmiddelen plaatsvindt op basis van pre-klinische<br />

en klinische studies.<br />

Onderwijsvorm<br />

Hoorcolleges.<br />

Literatuur<br />

Mulder, G.J., and Dencker, L., Pharmaceutical Toxicology: Safety<br />

Sciences of Drugs, Pharmaceutical Press, 2007 (ISBN: 10-0-85369 593 8).<br />

Farmacochemie in context<br />

Vakcode X_430566 ()<br />

Credits 3.0<br />

Voertaal Nederlands<br />

Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />

Coördinator dr. E. Ruijter<br />

Farmacokinetiek en ADME processen<br />

Vakcode X_435084 (435084)<br />

Periode Periode 6<br />

Credits 3.0<br />

Voertaal Nederlands<br />

Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />

Coördinator dr. J.N.M. Commandeur<br />

Docent(en) dr. J.N.M. Commandeur<br />

Lesmethode(n) Hoorcollege<br />

Doel vak<br />

Het verkrijgen van kennis en inzicht in de onderliggende processen die<br />

de lotgevallen van een geneesmiddel in het lichaam bepalen en de<br />

mathematische beschrijving hiervan met behulp van compartimentmodellen.<br />

Onderwijsvorm<br />

Hoorcolleges, werkcolleges.<br />

Literatuur<br />

Shargel, L. e.a., Applied Biopharmaceutics and Pharmacokinetics 5th ed,<br />

McGraw-Hill, 2005 (ISBN: 0-07-137550-3).<br />

Doelgroep<br />

1F<br />

FEW individueel vak intern<br />

Vakcode X_INDVAKI_09 ()<br />

<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 39 van 76


Credits 6.0<br />

Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />

Fysica en medische fysica 1<br />

Vakcode X_430060 (430060)<br />

Periode Periode 4<br />

Credits 3.0<br />

Voertaal Nederlands<br />

Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />

Coördinator prof. dr. K.S.E. Eikema<br />

Docent(en) prof. dr. K.S.E. Eikema, dr. R.N. Frese<br />

Lesmethode(n) Hoorcollege, Werkcollege<br />

Doel vak<br />

Doelstelling van het college Fysica en medische fysica I is de<br />

basisbegrippen van de natuurkunde te introduceren die ten grondslag<br />

liggen aan de mechanische verschijnselen in de levende natuur.<br />

Inhoud vak<br />

Fysica is de wetenschap die de eigenschappen van de materie beschrijft<br />

in termen van natuurwetten. De fysica speelt bij het begrijpen van de<br />

eigenschappen van de levende materie en het menselijk lichaam een<br />

essentiële rol. In dit college zullen eerst de wetten van Newton<br />

behandeld worden waarmee de bewegingen van voorwerpen onder invloed van<br />

krachten beschreven kunnen worden. Het gedrag van vloeistoffen en de<br />

stabiliteit van vaste structuren en mechanische trillingen komen<br />

vervolgens aan de orde. In een aantal voorbeelden worden diverse<br />

toepassingen besproken.<br />

Onderwijsvorm<br />

Voorstudie, hoorcollege met demonstraties en discussie, werkcollege en<br />

zelfstudie.<br />

Literatuur<br />

Giancoli, D.C., Physics for Scientists and Engineers with Modern<br />

Physics 4th ed. New Jersey: Prentice Hall.<br />

Aanbevolen voorkennis<br />

Het college sluit aan op Practicum Natuurkunde. Het college bereidt<br />

voor op:<br />

- Fysica en medische fysica II<br />

- Natuurkunde en gezondheid, Structuur van de materie (MNW)<br />

- Thermodynamica, Kernenergie en Duurzame energie (SBI)<br />

Doelgroep<br />

1MNW, 1SBI, 2F<br />

Geschiedenis van de natuur<strong>wetenschappen</strong><br />

Vakcode X_420148 (420148)<br />

Periode Periode 4<br />

Credits 3.0<br />

<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 40 van 76


Voertaal Nederlands<br />

Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />

Coördinator prof. dr. F.H. van Lunteren<br />

Docent(en) prof. dr. F.H. van Lunteren<br />

Lesmethode(n) Hoorcollege<br />

Doelgroep<br />

2F, 2MNW, 2N, 2S<br />

Heterologe expressie van biotransformatie enzymen<br />

Vakcode X_430549 (430549)<br />

Periode Ac. Jaar (september)<br />

Credits 6.0<br />

Voertaal Nederlands<br />

Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />

Coördinator dr. J.N.M. Commandeur<br />

Doel vak<br />

Dit vak heeft tot doel de student zich te laten verdiepen in de<br />

strategieën en experimentele benaderingen die worden gebruikt om<br />

specifieke biotransformatie-enzymen (zoals P450s, glutathione<br />

transferases, etc.) tot expressie te brengen in cellulaire organismen.<br />

Inhoud vak<br />

Biotransformatie, ook wel metabolisme genoemd, speelt een zeer<br />

belangrijke rol in de verwerking van geneesmiddelen door het lichaam.<br />

Aan de ene kant is biotransformatie vaak bepalend voor de<br />

halfwaardetijd waarmee een geneesmiddel wordt geëlimineerd vanuit het<br />

plasma. Aan de andere kant kunnen bij metabolisme reactieve<br />

metabolieten ontstaan die met cellulair materiaal reageren, zoals<br />

eiwitten, DNA of membranen. Het menselijke genoom codeert voor enkele<br />

honderden enzymen die in meer of mindere mate bij het metabolisme van<br />

geneesmiddelen betrokken kunnen zijn. Om de rol van de enzymen beter<br />

te kunnen bestuderen, zijn voor de belangrijkste<br />

biotransformatie-enzymen expressiesystemen ontwikkeld in verschillende<br />

organismes, zoals Escherichia coli, gist, insectcellen, Salmonella<br />

typhimurium, zoogdiercellen, etc. De keuze van het organisme hangt af<br />

van het doel wat wordt beoogd, bijv. grote schaal expressie (mg-gram)<br />

voor biocatalyse of kristallisatie, lage schaal expressie voor in vitro<br />

(geno)toxiciteit experimenten.<br />

Onderwijsvorm<br />

Aan de hand van een lijst van opdrachten zal een literatuurstudie<br />

worden uitgevoerd naar eigenschappen, expressie en mutagenese van een<br />

specifiek biotransformatie-enzym. Op verschillende momenten zal de<br />

voortgang worden besproken met de docenten.<br />

Toetsvorm<br />

Van de literatuurstudie wordt een rapport gemaakt, dat in een<br />

nabespreking mondeling dient te worden toegelicht.<br />

Aanbevolen voorkennis<br />

<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 41 van 76


Dit vak borduurt voort op theorie die is behandeld in de cursus<br />

Biochemie (1e jaar) en de expressie-experimenten die zijn uitgevoerd in<br />

het Geintegreerde practicum (2e jaar). Ter ondersteuning van de<br />

literatuurstudie wordt aanbevolen het volgende boek aan te schaffen of<br />

te lenen: Primrose and Twyman, Principles of Gene Manipulation and<br />

Genomics 8th ed. Dit boek wordt later ook gebruikt voor het vak<br />

'Chemistry of life' in de master Drug Discovery and Safety.<br />

Doelgroep<br />

3F, 3S<br />

Identificatietechnieken<br />

Vakcode X_435081 (435081)<br />

Periode Periode 5<br />

Credits 6.0<br />

Voertaal Nederlands<br />

Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />

Coördinator dr. F. Ariese<br />

Docent(en) dr. F.J.J. de Kanter, dr. H. Lingeman, dr. F. Ariese<br />

Lesmethode(n) Hoorcollege, Practicum<br />

Doel vak<br />

Het doel van deze cursus is om inzicht en praktische vaardigheden te<br />

verwerven op het gebied van moleculaire spectroscopische technieken en<br />

hun toepassingen voor de identificatie van verbindingen.<br />

Inhoud vak<br />

Achtergronden van de verschillende spectroscopische technieken worden<br />

behandeld, waarbij steeds verbanden worden gelegd met de structuur van<br />

moleculen. De volgende technieken zullen aan bod komen: UV-Vis<br />

absorptiespectroscopie, vibratiespectroscopie (infrarood en Raman),<br />

fluorescentiespectroscopie, kernspin resonantie (NMR) en<br />

massaspectrometrie. (Bio)analytische toepassingen van deze technieken<br />

zullen aan bod komen. Spectroscopische berekeningen en interpretatie<br />

van spectra zullen worden geoefend.<br />

Onderwijsvorm<br />

Hoorcollege, werkcollege en practicum.<br />

Literatuur<br />

Harris, D.C., Quantitative Chemical Analysis.<br />

Collegedictaat.<br />

Doelgroep<br />

1F<br />

Inleiding computergebruik<br />

Vakcode X_000004 ()<br />

Credits 0.0<br />

Voertaal Nederlands<br />

Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />

<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 42 van 76


Innovatieproject geneesmiddelen<br />

Vakcode X_435095 (435095)<br />

Periode Periode 3<br />

Credits 6.0<br />

Voertaal Nederlands<br />

Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />

Coördinator dr. C. de Graaf<br />

Docent(en) dr. C. de Graaf<br />

Lesmethode(n) Hoorcollege<br />

Doel vak<br />

Het verwerven van kennis en inzicht in het ontwikkelingstraject van<br />

nieuwe geneesmiddelen, als voorbeeld van een innovatieproces.<br />

Onderwijsvorm<br />

Na een introductie wordt in gemengde groepjes (studenten <strong>Farmaceutische</strong><br />

Wetenschappen, Science, Business & Innovation, en Medische<br />

Natuur<strong>wetenschappen</strong>) gewerkt aan een uitgebreide case waarin de<br />

ontwikkeling van een geneesmiddel voor een bepaalde ziekte aan bod<br />

komt. De nadruk ligt aan de bèta-kant op de moleculaire processen die<br />

aan de ziekte ten grondslag liggen en het zelfstandig doornemen van de<br />

verschillende randvoorwaarden waaraan dit type geneesmiddel moet<br />

voldoen. Aan de gamma-kant ligt het zwaartepunt op het toepassen van<br />

het bedrijfskundige concepten.<br />

Aan de case wordt gedurende de hele periode gewerkt. Daarnaast vinden<br />

(gast)colleges plaats waarin de verschillende stappen in het<br />

geneesmiddelontwikkelings- en vermarketingstraject worden besproken.<br />

Enkele stappen worden nader bestudeerd door het maken van een korte<br />

opdracht.<br />

Het volgen van een aantal (gast)colleges is verplicht; tijdens de<br />

eerste bijeenkomst zal worden aangegeven om welke colleges het gaat.<br />

Literatuur<br />

De te bestuderen stof en achtergrond informatie worden tijdens de<br />

cursus via Blackboard ter beschikking gesteld.<br />

Doelgroep<br />

1F, 1SBI<br />

Integrated Practical Course<br />

Vakcode X_430516 (430516)<br />

Periode Periode 5<br />

Credits 12.0<br />

Voertaal Nederlands<br />

Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />

Coördinator dr. J.N.M. Commandeur<br />

Docent(en) dr. J.N.M. Commandeur, dr. J. Kool<br />

<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 43 van 76


Lesmethode(n) Hoorcollege, Werkcollege, Practicum<br />

Doel vak<br />

Het verkrijgen van inzicht in de toepassing van biochemische,<br />

moleculair biologische, farmacologische/toxicologische en<br />

(bio)analytische technieken in (farmaco)chemisch onderzoek.<br />

Het ontwikkelen van praktische vaardigheden om deze technieken toe te<br />

passen in een geïntegreerd onderzoeksproject.<br />

Het leren mondeling en schriftelijk presenteren van verkregen<br />

onderzoeksresultaten.<br />

Onderwijsvorm<br />

Dit practicum heeft de opzet van een geïntegreerd onderzoeksproject en<br />

wordt afgesloten met een plenaire posterpresentatie.<br />

Literatuur<br />

Practicumhandleiding en aangeleverde literatuur.<br />

Doelgroep<br />

2F, 2S<br />

Keuzevak BioAnalytische massaspectrometrie<br />

Vakcode X_435026 (435026)<br />

Periode Ac. Jaar (september)<br />

Credits 3.0<br />

Voertaal Nederlands<br />

Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />

Coördinator dr. H. Lingeman<br />

Doel vak<br />

Het introduceren van massaspectrometrische technieken die gebruikt<br />

kunnen worden voor de analyse van biologisch actieve verbindingen.<br />

Inhoud vak<br />

Massaspectrometrie is tegenwoordig de meest gebruikte methode om<br />

chemische verbindingen te karakteriseren, te identificeren en<br />

kwantitatief te bepalen. Allereerst zullen alle onderdelen van de<br />

verschillende typen massaspectrometers worden besproken, van<br />

massaspectometrie met de verschillende scheidingsmethoden. Tot slot<br />

zullen toepassingen aan de orde komen op het gebied van de bio-analyse,<br />

metabolieten onderzoek, schreeningsmonitoringsprogramma's en<br />

karakteriseren en identificatie van complexe macro-moleculaire (bijv.<br />

eiwitten) systemen.<br />

Onderwijsvorm<br />

Het studieonderdeel bestaat uit twee onderdelen waarvan het theoretisch<br />

deel (hoorcollege, werkcollege) voorafgaande aan het praktisch deel<br />

gevolgd moet worden. Het theoretisch deel (3 studiepunten) kan ook<br />

afzonderlijk worden gevolgd.<br />

Literatuur<br />

<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 44 van 76


Basisliteratuur en informatie van het internet.<br />

Aanbevolen voorkennis<br />

Basiskennis analytische chemie.<br />

Doelgroep<br />

3F, 3S, 3MNW<br />

Keuzevak BioAnalytische screeningstechnieken<br />

Vakcode X_435028 (435028)<br />

Periode Ac. Jaar (september)<br />

Credits 3.0<br />

Voertaal Nederlands<br />

Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />

Coördinator dr. H. Lingeman<br />

Doel vak<br />

Het doel is het verwerven van van theoretisch en/of praktisch inzicht<br />

aan de hand van een goed gedefinieerd bio-analytisch probleem.<br />

Inhoud vak<br />

De verschillende vormen van vloeistofchromatografie zijn tegenwooordig<br />

de meest gebruikte methoden om chemische verbindingen kwalitatief en/of<br />

kwantitatief te bepalen. Allereerst zullen de verschillende vormen van<br />

vloeistofchromatografie en de hierbij horende detectietechnieken worden<br />

besproken. Vervolgens zal uitgebreid worden inggegaan op de<br />

monstervoorbewerkingstechnieken die gebruikt kunnen worden. Tot slot<br />

zullen toepassingen aan de orde komen op het gebied van de bio-analyse,<br />

metabolieten onderzoek, screeningsmonitoringsprogramma's en<br />

karakteriseren en identificatie van complexe macro-moleculaire (bijv.<br />

eiwitten) systemen.<br />

Onderwijsvorm<br />

Het studieonderdeel bestaat uit twee onderdelen waarvan het theoretisch<br />

deel (hoorcollege, werkcollege) voorafgaande aan het praktisch deel<br />

gevolgd moet worden. Het theoretisch deel (3 studiepunten) kan ook<br />

afzonderlijk worden gevolgd.<br />

Literatuur<br />

Basisliteratuur en informatie van het internet.<br />

Aanbevolen voorkennis<br />

Basiskennis analytische chemie.<br />

Keuzevak Fysische Chemie<br />

Vakcode X_430540 (430540)<br />

Periode Ac. Jaar (september)<br />

Credits 3.0<br />

Voertaal Nederlands<br />

Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />

Coördinator prof. dr. M.H.M. Janssen<br />

<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 45 van 76


Inhoud vak<br />

De inhoud van het keuzevak wordt in overleg met de docent bepaald. Dit<br />

geldt ook voor het aantal contacturen en te gebruiken studiemateriaal.<br />

Neem tijdig contact op met de docent.<br />

Keuzevak Fysische Chemie<br />

Vakcode X_430541 (430541)<br />

Periode Ac. Jaar (september)<br />

Credits 6.0<br />

Voertaal Nederlands<br />

Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />

Coördinator prof. dr. M.H.M. Janssen<br />

Inhoud vak<br />

De inhoud van het keuzevak wordt in overleg met de docent bepaald. Dit<br />

geldt ook voor het aantal contacturen en te gebruiken studiemateriaal.<br />

Neem tijdig contact op met de docent.<br />

Keuzevak Luminescence Spectr. and Mol-Mol interaction<br />

Vakcode X_435032 (435032)<br />

Periode Ac. Jaar (september)<br />

Credits 3.0<br />

Voertaal Nederlands<br />

Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />

Coördinator dr. F. Ariese<br />

Doel vak<br />

Het introduceren van luminescentietechnieken die gebruikt kunnen worden<br />

voor de analyse van biologisch actieve verbindingen.<br />

Inhoud vak<br />

De onderwerpen die aan de orde komen omvatten de principes van<br />

fluorescentie, fosforescentie, lang-levende luminescentie,<br />

chemiluminescentie en bioluminescentie. Verder zal er aandacht worden<br />

besteed aan 'energy-transfer' mechanismen en andere processen die de<br />

luminescentie van organische processen beinvloeden. De mogelijkheden<br />

van het invoeren van luminescentie 'probes' en hoge resolutietechnieken<br />

zullen eveneens aan de orde komen. Tot slot zullen een aantal<br />

bio-analytische toepassingen worden besproken waarbij technieken als<br />

laser fluorescentie en tijd-opgelost meten niet vergeten zullen worden.<br />

Onderwijsvorm<br />

Het studieonderdeel bestaat uit een theoretisch en een praktisch<br />

gedeelte. Het theoretisch deel kan afzonderlijk gevolgd worden (zie de<br />

opmerking bij deze vakomschrijving).<br />

Aanbevolen voorkennis<br />

Basiskennis analytische en fysische chemie.<br />

<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 46 van 76


Doelgroep<br />

3F, 3S<br />

Keuzevak Luminescence Spectr. and Mol-Mol interaction<br />

Vakcode X_435033 (435033)<br />

Periode Ac. Jaar (september)<br />

Credits 6.0<br />

Voertaal Nederlands<br />

Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />

Coördinator dr. F. Ariese<br />

Doel vak<br />

Het introduceren van luminescentietechnieken die gebruikt kunnen worden<br />

voor de analyse van biologisch actieve verbindingen.<br />

Inhoud vak<br />

De onderwerpen die aan de orde komen omvatten de principes van<br />

fluorescentie, fosforescentie, lang-levende luminescentie,<br />

chemiluminescentie en bioluminescentie. Verder zal er aandacht worden<br />

besteed aan 'energy-transfer' mechanismen en andere processen die de<br />

luminescentie van organische processen beinvloeden. De mogelijkheden<br />

van het invoeren van luminescentie 'probes' en hoge resolutietechnieken<br />

zullen eveneens aan de orde komen. Tot slot zullen een aantal<br />

bio-analytische toepassingen worden besproken waarbij technieken als<br />

laser fluorescentie en tijd-opgelost meten niet vergeten zullen worden.<br />

Onderwijsvorm<br />

Het studieonderdeel bestaat uit een theoretisch en een praktisch<br />

gedeelte. Het theoretisch deel kan afzonderlijk gevolgd worden (zie de<br />

opmerking bij deze vakomschrijving).<br />

Aanbevolen voorkennis<br />

Basiskennis analytische en fysische chemie.<br />

Doelgroep<br />

3F, 3S<br />

Keuzevak Med. Chem., Drug Design & Synth.<br />

Vakcode X_430542 (430542)<br />

Periode Ac. Jaar (september)<br />

Credits 3.0<br />

Voertaal Nederlands<br />

Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />

Coördinator dr. I.J.P. de Esch<br />

Inhoud vak<br />

De inhoud van het keuzevak wordt in overleg met de docent bepaald. Dit<br />

geldt ook voor het aantal contacturen en te gebruiken studiemateriaal.<br />

Neem tijdig contact op met de docent.<br />

Keuzevak Med. Chem., Drug Design & Synth.<br />

<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 47 van 76


Vakcode X_430543 (430543)<br />

Periode Ac. Jaar (september)<br />

Credits 6.0<br />

Voertaal Nederlands<br />

Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />

Coördinator dr. I.J.P. de Esch<br />

Inhoud vak<br />

De inhoud van het keuzevak wordt in overleg met de docent bepaald. Dit<br />

geldt ook voor het aantal contacturen en te gebruiken studiemateriaal.<br />

Neem tijdig contact op met de docent.<br />

Keuzevak Med. Chem., Drug Disc. & Target Find.<br />

Vakcode X_430544 (430544)<br />

Periode Ac. Jaar (september)<br />

Credits 3.0<br />

Voertaal Nederlands<br />

Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />

Coördinator dr. I.J.P. de Esch<br />

Inhoud vak<br />

De inhoud van het keuzevak wordt in overleg met de docent bepaald. Dit<br />

geldt ook voor het aantal contacturen en te gebruiken studiemateriaal.<br />

Neem tijdig contact op met de docent.<br />

Keuzevak Med. Chem., Drug Disc. & Target Find.<br />

Vakcode X_430545 (430545)<br />

Periode Ac. Jaar (september)<br />

Credits 6.0<br />

Voertaal Nederlands<br />

Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />

Coördinator dr. I.J.P. de Esch<br />

Inhoud vak<br />

De inhoud van het keuzevak wordt in overleg met de docent bepaald. Dit<br />

geldt ook voor het aantal contacturen en te gebruiken studiemateriaal.<br />

Neem tijdig contact op met de docent.<br />

Keuzevak Mol. Tox., Comp. Med. Chem. & Tox.<br />

Vakcode X_430546 (430546)<br />

Periode Ac. Jaar (september)<br />

Credits 3.0<br />

Voertaal Nederlands<br />

Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />

Coördinator dr. J.N.M. Commandeur<br />

<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 48 van 76


Doel vak<br />

Vertrouwd raken met modellen en methoden die gebruikt worden in<br />

computersimulaties aan eiwitten.<br />

Inhoud vak<br />

Biomoleculaire modeling en simulatie is een belangrijke 'tool' om<br />

biochemische, farmaceutische en moleculair-toxicologische processen<br />

zoals (mis)vouwing van eiwitten en de interactie van medicijnen met<br />

eiwitten/enzymen te kunnen begrijpen en voorspellen. In de afgelopen<br />

jaren zijn biomoleculaire modellen (krachtvelden, interaction finger<br />

print methoden) steeds nauwkeuriger geworden, en zijn er steeds<br />

efficientere in silico methoden (virtual screening, free-energy<br />

methoden) ontwikkeld om bindingsaffiniteiten te berekenen.<br />

Onderwijsvorm<br />

Tijdens de cursus zullen, aan de hand van door de docent aangereikte<br />

literatuur, belangrijke recente ontwikkelingen op het gebied van<br />

bindingsaffiniteits-berekeningen en/of krachtveld-ontwikkeling in kaart<br />

worden gebracht.<br />

Toetsvorm<br />

Toetsing vindt mondeling of schriftelijk plaats.<br />

Literatuur<br />

Wordt beschikbaar gesteld door de docent.<br />

Aanbevolen voorkennis<br />

Dit vak bouwt verder op theorie die is behandeld in vakken als<br />

Moleculaire Modeling voor Farmacochemici (2F), en Computational<br />

(Pharmaco)Chemistry (3F en 3S).<br />

Doelgroep<br />

3F<br />

Keuzevak Mol. Tox., Comp. Med. Chem. & Tox.<br />

Vakcode X_430547 (430547)<br />

Periode Ac. Jaar (september)<br />

Credits 6.0<br />

Voertaal Nederlands<br />

Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />

Coördinator dr. J.N.M. Commandeur<br />

Doel vak<br />

Vertrouwd raken met modellen en methoden die gebruikt worden in<br />

computersimulaties aan eiwitten.<br />

Inhoud vak<br />

Biomoleculaire modeling en simulatie is een belangrijke 'tool' om<br />

biochemische, farmaceutische en moleculair-toxicologische processen<br />

zoals (mis)vouwing van eiwitten en de interactie van medicijnen met<br />

eiwitten/enzymen te kunnen begrijpen en voorspellen. In de afgelopen<br />

jaren zijn biomoleculaire modellen (krachtvelden, interaction finger<br />

print methoden) steeds nauwkeuriger geworden, en zijn er steeds<br />

efficientere in silico methoden (virtual screening, free-energy<br />

<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 49 van 76


methoden) ontwikkeld om bindingsaffiniteiten te berekenen.<br />

Onderwijsvorm<br />

Tijdens de cursus zullen, aan de hand van door de docent aangereikte<br />

literatuur, belangrijke recente ontwikkelingen op het gebied van<br />

bindingsaffiniteits-berekeningen en/of krachtveld-ontwikkeling in kaart<br />

worden gebracht.<br />

Toetsvorm<br />

Toetsing vindt mondeling of schriftelijk plaats.<br />

Literatuur<br />

Wordt beschikbaar gesteld door de docent.<br />

Aanbevolen voorkennis<br />

Dit vak bouwt verder op theorie die is behandeld in vakken als<br />

Moleculaire Modeling voor Farmacochemici (2F), en Computational<br />

(Pharmaco)Chemistry (3F en 3S).<br />

Doelgroep<br />

3F<br />

Keuzevak Mol. Tox., Drug, Disp. and Saf. Assessm.<br />

Vakcode X_430548 (430548)<br />

Periode Ac. Jaar (september)<br />

Credits 3.0<br />

Voertaal Nederlands<br />

Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />

Coördinator dr. J.N.M. Commandeur<br />

Inhoud vak<br />

Biotransformatie, ook wel metabolisme genoemd, speelt een zeer<br />

belangrijke rol in de verwerking van geneesmiddelen door het lichaam.<br />

Aan de ene kant is biotransformatie vaak bepalend voor de<br />

halfwaardetijd waarmee een geneesmiddel wordt geëlimineerd vanuit het<br />

plasma. Aan de andere kant kunnen bij metabolisme reactieve<br />

metabolieten ontstaan die met cellulair materiaal reageren, zoals<br />

eiwitten, DNA of membranen. Het menselijke genoom codeert voor enkele<br />

honderden enzymen die in meer of mindere mate bij het metabolisme van<br />

geneesmiddelen betrokken kunnen zijn. Om de rol van de enzymen beter<br />

te kunnen bestuderen, zijn voor de belangrijkste<br />

biotransformatie-enzymen expressiesystemen ontwikkeld in verschillende<br />

organismes, zoals Escherichia coli, gist, insectcellen, Salmonella<br />

typhimurium, zoogdiercellen, etc. De keuze van het organisme hangt af<br />

van het doel wat wordt beoogd, bijv. grote schaal expressie (mg-gram)<br />

voor biocatalyse of kristallisatie, lage schaal expressie voor in vitro<br />

(geno)toxiciteit experimenten.<br />

Overige informatie<br />

Dit keuzevak bestaat in twee varianten. De basisvariant van 3<br />

studiepunten (vakcode 430548) kan in overleg met de coordinator worden<br />

uitgebreid naar 6 studiepunten (vakcode 430549).<br />

Keuzevak Multidimensionale scheidingstechnieken<br />

<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 50 van 76


Vakcode X_435037 (435037)<br />

Periode Ac. Jaar (september)<br />

Credits 3.0<br />

Voertaal Nederlands<br />

Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />

Coördinator dr. H. Lingeman<br />

Doel vak<br />

Het doel is het verwerven van theoretisch en/of praktisch inzicht aan<br />

de hand van een goed gedefinieerd complex analytisch probleem.<br />

Inhoud vak<br />

Het primaire doel is het introduceren van complexe analytische systemen<br />

waarmee zowel de selectiviteit als de gevoeligheid verbeterd kan<br />

worden. Met name de ontwikkeling en optimalisering van geautomatiseerde<br />

multidimensionale systemen en 'high-throughput' systemen zullen aan de<br />

orde komen. Het gaat hierbij om de koppeling van gaschromatografische<br />

of vloeistofchromatografische systemen met elkaar en met verschillende<br />

detectiesystemen (bijv. massaspectrometrie).<br />

Onderwijsvorm<br />

Het studieonderdeel bestaat uit twee onderdelen waarvan het theoretisch<br />

deel (hoorcollege, werkcollege) voorafgaande aan het praktisch deel<br />

gevolgd moet worden. Het theoretisch deel (3 studiepunten) kan ook<br />

afzonderlijk worden gevolgd.<br />

Literatuur<br />

Basisliteratuur en informatie van het internet.<br />

Aanbevolen voorkennis<br />

Basiskennis analytische chemie.<br />

Keuzevak Spectroscopische detectie- en identificatietechniek<br />

Vakcode X_430568 ()<br />

Credits 6.0<br />

Voertaal Nederlands<br />

Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />

Coördinator dr. F. Ariese<br />

Overige informatie<br />

Dit vak wordt op individuele basis aangeboden in overleg met de docent.<br />

Keuzevak Spectroscopische detectie- en identificatietechniek<br />

Vakcode X_435039 (435039)<br />

Periode Ac. Jaar (september)<br />

Credits 3.0<br />

Voertaal Nederlands<br />

Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />

Coördinator prof. dr. C. Gooijer<br />

<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 51 van 76


Doel vak<br />

Het doel is het verwerven van praktisch en theoretisch inzicht omtrent<br />

een bepaald thema uit het grote aanbod van spectroscopische detectie-<br />

en identificatietechnieken.<br />

Inhoud vak<br />

Het ontwikkelen en testen van nieuwe spectroscopische technieken die<br />

voor analytische toepassingen kunnen worden gebruikt. Het gaat hier met<br />

name om laser detectiesystemen voor chromatografie of electroforese en<br />

om Raman spectroscopische en hoge-resolutie spectroscopie sytemen voor<br />

de specifieke en gevoelige detectie van organische verbindingen.<br />

Onderwijsvorm<br />

Het studieonderdeel bestaat uit een theoretisch en een praktisch<br />

gedeelte. Het theoretisch deel (3 studiepunten) kan ook afzonderlijk<br />

worden gevolgd. Het volgen van zowel het theoretisch deel als het<br />

praktisch deel levert 3 extra studiepunten op voor een totaal van 6<br />

studiepunten.<br />

Aanbevolen voorkennis<br />

Basiskennis analytische en fysische chemie.<br />

Doelgroep<br />

3F, 3MNW, 3S<br />

Keuzevak Theoretische Chemie<br />

Vakcode X_430538 (430538)<br />

Periode Ac. Jaar (september)<br />

Credits 3.0<br />

Voertaal Nederlands<br />

Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />

Coördinator prof. dr. L. Visscher<br />

Inhoud vak<br />

De inhoud van het keuzevak wordt in overleg met de docent bepaald. Dit<br />

geldt ook voor het aantal contacturen en te gebruiken studiemateriaal.<br />

Neem tijdig contact op met de docent.<br />

Keuzevak Theoretische Chemie<br />

Vakcode X_430539 (430539)<br />

Periode Ac. Jaar (september)<br />

Credits 6.0<br />

Voertaal Nederlands<br />

Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />

Coördinator prof. dr. L. Visscher<br />

Inhoud vak<br />

De inhoud van het keuzevak wordt in overleg met de docent bepaald. Dit<br />

geldt ook voor het aantal contacturen en te gebruiken studiemateriaal.<br />

Neem tijdig contact op met de docent.<br />

<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 52 van 76


Levende chemie<br />

Vakcode X_430569 ()<br />

Credits 3.0<br />

Voertaal Nederlands<br />

Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />

Coördinator dr. M.H. Siderius<br />

Doel vak<br />

Het hoorcollege dient om inzicht te geven in de basisprincipes van de<br />

bouw van levende cellen, de chemische structuur van de bestanddelen van deze ce<br />

gebruiken voor groei en deling, als ook basisprincipes van de<br />

moleculaire biologie van de levende cel, de manier waarop genetische informatie<br />

belangrijkste aspecten van recombinant DNA technologie worden behandeld.<br />

Inhoud vak<br />

Er wordt begonnen met het bespreken van de structurele en functionele<br />

opbouw van de levende cel, waarna de verschillende soorten<br />

(macro)moleculen die in de cel aanwezig zijn worden behandeld.<br />

Aandacht voor eiwitstructuur en functie, met name in het metabolisme<br />

(Enzym activiteit, Michaelis-Menten kinetiek, Allostere effecten). De<br />

afbraakroutes van de belangrijkste voedingsstoffen<br />

(koolhydraten en vetten) worden rudimentair besproken. Tevens de<br />

behandeling van de<br />

structuur en functie van DNA en de manier waarop DNA in de celkern is<br />

opgevouwen tot chromosomen en de aspecten van DNA replicatie en herstel.<br />

Onderwijsvorm<br />

Hoorcollege. Op de de Blackboard site behorend bij dit vak worden<br />

vragen aangeboden aan de hand waarvan de studenten zichzelf kunnen<br />

Toetsvorm<br />

Biochemie zal worden getoetst aan de hand van twee deeltentamens, Het<br />

eerste deel zal gaan over de hoofdstukken waarin cellen, celbouw,<br />

bouwstenen van biochemisch belangrijke macromoleculen, DNA, eiwit<br />

alsmede enzymfunctie wordt behandeld. Het tweede deeltentamen zal de<br />

hoofdstukken toetsen waarin DNA repair, transcriptie en translatie,<br />

genomes, moleculair biologische technieken en cellulair metabolisme en<br />

energiehuishouding aan de orde komen.<br />

Literatuur<br />

Alberts, B. e.a., Essential Cell Biology 3rd ed, 2009. Hoofdstukken 1<br />

t/m 6, aangevuld met delen zoals aangegeven in de studiehandleiding<br />

Doelgroep<br />

1F, 1MNW, 1S, 1-SBI, 1W-B, mBio<br />

Maatschappelijke aspecten van de natuur<strong>wetenschappen</strong><br />

Vakcode X_420153 (420153)<br />

Periode Periode 4<br />

Credits 3.0<br />

Voertaal Nederlands<br />

<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 53 van 76


Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />

Coördinator prof. dr. J.G.F. Bunders-Aelen<br />

Docent(en) prof. dr. J.G.F. Bunders-Aelen<br />

Lesmethode(n) Hoorcollege<br />

Doel vak<br />

De student beschikt over kennis en inzicht in de interacties tussen<br />

wetenschap en maatschappij.<br />

De student beschikt over kennis en inzicht in de dynamiek van<br />

wetenschap- en technologie ontwikkeling en de rol van sociale processen<br />

daarbij.<br />

De student beschikt over kennis en inzicht in moderne instrumenten<br />

zoals, technology assessment en interactief beleid etc om wetenschap in<br />

maatschappelijk gewenste richtingen te sturen.<br />

De student is in staat om een gefundeerd oordeel geven over<br />

maatschappelijke en ethische aspecten van wetenschap.<br />

De student is instaat om kritisch te reflecteren op zijn<br />

maatschappelijke verantwoordelijkheid als wetenschapper.<br />

Inhoud vak<br />

De cursus gaat in op de wisselwerking tussen wetenschap, technologie en<br />

samenleving. Aan de hand van concrete, actuele vraagstukken wordt eerst<br />

ingegaan op recente knelpunten, dilemma's en controverses in de relatie<br />

wetenschap-maatschappij. Daarna gaat de cursus in op diverse inzichten<br />

en instrumenten (`Technology Assessment'), ethische aspecten,<br />

interactief beleid en maatschappelijk verantwoord ondernemen, die van<br />

belang zijn bij het tot stand brengen van een pro-actieve oordeels en<br />

besluitvorming over W&S ontwikkelingen. Na het theoretische gedeelte van<br />

de cursus, schrijf je samen met een groepje studenten een essay. In dit<br />

essay reflecteer je op een actuele natuurwetenschappelijke ontwikkeling<br />

die belangrijke maatschappelijke consequenties met zich meebrengt.<br />

Onderwijsvorm<br />

Hoorcollege<br />

Toetsvorm<br />

Toets en schriftelijke rapportage met mondelinge presentatie.Voor beide<br />

onderdelen moet minimaal een voldoende gehaald worden.<br />

Literatuur<br />

Syllabus.<br />

Doelgroep<br />

2F, 2MNW, 2N, 2S<br />

Overige informatie<br />

Alle studenten N, S, F en MNW moeten kiezen tussen Geschiedenis van de<br />

natuur<strong>wetenschappen</strong> en Maatschappelijke aspecten van de<br />

natuur<strong>wetenschappen</strong>.<br />

Inlichtingen bij Joske Bunders kamer U-552 de Boelelaan 1081, tel. (020)<br />

598 7030.<br />

Inschrijven in TIS, https://tis.vu.nl/tis/menu is voor dit vak<br />

verplicht! Inschrijven is mogelijk tot 14 dagen voor aanvang van de<br />

cursus.<br />

Macromoleculen en katalyse<br />

<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 54 van 76


Vakcode X_435450 (435450)<br />

Periode Ac. Jaar (september)<br />

Credits 6.0<br />

Voertaal Nederlands<br />

Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />

Coördinator dr. J.C. Slootweg<br />

Doel vak<br />

Het kennisnemen van en inzicht verkrijgen in enkele belangrijke<br />

aspecten (synthese, eigenschappen, toepassingen) van synthetische<br />

macromoleculen.<br />

Inhoud vak<br />

In deze cursus wordt kort stilgestaan bij natuurlijk voorkomende<br />

macromoleculen, maar de nadruk ligt op synthetische polymeren. Er wordt<br />

een overzicht gegeven van de syntheseroutes, eigenschappen, en<br />

toepassingen van verschillende klassen polymeren. Aan de orde komen<br />

begrippen als: additie-polymeren, condensatie-polymeren, radicaal<br />

polymerisaties, ionische polymerisaties, gekatalyseerde polymerisaties<br />

(Ziegler-Natta), cross-linking, thermoplastics, fibers, elastomeren,<br />

thermohardende harsen, kunststof recycling.<br />

Onderwijsvorm<br />

Na een beperkte introductie waarbij ook twee experimenten zullen worden<br />

uitgevoerd (polymerisatie en depolymerisatie) zullen de studenten zich<br />

de stof vooral eigen maken door een speciale studie te maken van een<br />

industrieel belangrijk polymeer, daarover een korte scriptie te<br />

schrijven en de inhoud hiervan te presenteren.<br />

Literatuur<br />

Clayden e.a., Organic Chemistry. Oxford: Oxford University Press, 2001.<br />

hoofdstuk 52 en aanvullend materiaal.<br />

Aanbevolen voorkennis<br />

Organische chemie I en II<br />

Doelgroep<br />

3S, 3F<br />

Mathematische methoden<br />

Vakcode X_401022 (401022)<br />

Periode Periode 4<br />

Credits 6.0<br />

Voertaal Nederlands<br />

Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />

Coördinator dr. F. Heinloth<br />

Docent(en) dr. F. Heinloth<br />

Lesmethode(n) Hoorcollege, Werkcollege<br />

Doelgroep<br />

2F<br />

<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 55 van 76


Medische (patho)fysiologie 2<br />

Vakcode X_436503 (436503)<br />

Periode Periode 2<br />

Credits 6.0<br />

Voertaal Nederlands<br />

Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />

Coördinator prof. dr. G.J.M. Stienen<br />

Lesmethode(n) Hoorcollege, Practicum<br />

Doel vak<br />

Het doel van de cursus is het verwerven van kennis van en inzicht in de<br />

endocriene functies in het menselijk lichaam: hormonale controle, de<br />

nierfunctie, voeding en spijsvertering, de voortplanting, groei en<br />

veroudering, de afweer en het bloed.<br />

Inhoud vak<br />

De cursus is opgebouwd uit de volgende delen met de bijbehorende<br />

onderwerpen:<br />

- hormonale controle<br />

- de nierfunctie<br />

- voeding en spijsvertering<br />

- de voortplanting, groei en veroudering<br />

- bloed(stelping), afweer.<br />

Toetsvorm<br />

Inleveren van de antwoorden op de werkgroepvragen, van de<br />

practicumverslagen en het houden van de presentatie is verplicht. De<br />

cijfers hiervan tellen mee in de eindbeoordeling. De cursus wordt<br />

afgesloten met een tentamen met 40 meerkeuze en 8 open vragen.<br />

Medische fysiologie 1<br />

Vakcode X_430059 (430059)<br />

Periode Periode 1<br />

Credits 3.0<br />

Voertaal Nederlands<br />

Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />

Lesmethode(n) Hoorcollege, Werkcollege, Practicum<br />

Doel vak<br />

Het verwerven van kennis van en inzicht in het membraantransport, de<br />

bouw en functie van het zenuwstelsel, het hart en de bloedsomloop onder<br />

normale omstandigheden en tijdens ziekte.<br />

Inhoud vak<br />

De volgende onderwerpen komen aan bod:<br />

- Transport van stoffen over het celmembraan.<br />

- Bouw van zenuwvezels, neuronale schakelingen, meten van de<br />

voortplantingsnelheid van de actiepotentiaal.<br />

- Bouw en functie van het hart, ECG, bloeddrukmeting.<br />

- Centrale en perifere zenuwstelsel: neuronale paden en reflexen.<br />

<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 56 van 76


- Sensorische en motorische functie.<br />

- Bewustzijn en gedrag: EEG, evoked potentials.<br />

Onderwijsvorm<br />

Patiëntdemonstraties, hoorcolleges, werkgroepen met casussen, practica<br />

en presentaties. Onderwerpen patiëntdemonstraties: rugklachten, het<br />

carpaal tunnel syndroom en dwarslaesie. In de hoorcolleges zullen de<br />

klinische problemen in verband gebracht worden met bovengenoemde<br />

cursusonderwerpen. Hierbij zal een relatie gelegd worden tussen de<br />

ziektebeelden, de bouw, functie en werking van het zenuwstelsel, de<br />

zintuigen, het hart en de bloedsomloop. Een belangrijke plaats wordt<br />

ingenomen door het elektromyogram (EMG), de mechanische eigenschappen<br />

van botten en spieren, het elektrocardiogram (ECG) en het<br />

elektro-encefalogram (EEG). De werkgroepen en practica zijn erop<br />

gericht de zelfwerkzaamheid van de studenten te stimuleren. In de<br />

werkgroepen zullen bovengenoemde onderwerpen uitgediept worden aan de<br />

hand van concrete klinisch georiënteerde vragen en opdrachten. De<br />

practica vormen een illustratie en demonstratie van behandelde<br />

principes. Hierbij komen de volgende onderwerpen aan bod:<br />

- Zenuwgeleiding en Rugklachten<br />

- Elektrische activiteit van het hart<br />

- Bloeddruk meting<br />

- Bewustzijn en Gedrag.<br />

Toetsvorm<br />

Inleveren van de antwoorden op de werkgroepvragen en van de<br />

practicumverslagen is verplicht. De cijfers hiervan tellen mee in de<br />

eindbeoordeling. De periode wordt afgesloten met een tentamen bestaande<br />

uit 30 meerkeuze en 8 open vragen.<br />

Literatuur<br />

Vander, Sherman, and Luciano, Human Physiology 11th ed. MacGrawHill.<br />

Daarnaast wordt een syllabus beschikbaar gesteld met daarin opgenomen<br />

de werkgroep vragen/opdrachten en de practicumhandleiding.<br />

Doelgroep<br />

1F, 1LI-HA<br />

Medische fysiologie II<br />

Vakcode X_430102 (430102)<br />

Credits 6.0<br />

Voertaal Nederlands<br />

Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />

Mentoraat / Tutoraat<br />

Vakcode X_000008 ()<br />

Periode Periode 1<br />

Credits 0.0<br />

Voertaal Nederlands<br />

Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />

Lesmethode(n) Hoorcollege<br />

<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 57 van 76


Overige informatie<br />

Iedere eerstejaars student Business Analytics is verplicht deel te nemen<br />

aan het Eerstejaars mentoraat in periodes 1 en 2. Het met een voldoende<br />

afronden van het vak Wiskunde wereldwijd is alleen mogelijk indien is<br />

deelgenomen aan het Eerstejaars mentoraat.<br />

Modern Developments in Pharmacochemistry<br />

Vakcode X_430515 (430515)<br />

Periode Periode 2<br />

Credits 3.0<br />

Voertaal Nederlands<br />

Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />

Coördinator prof. dr. N.P.E. Vermeulen<br />

Docent(en) prof. dr. N.P.E. Vermeulen<br />

Lesmethode(n) Hoorcollege<br />

Doel vak<br />

Het doel van dit college is de student kennis van en inzicht te laten<br />

verwerven in het onderzoek naar de ontdekking (discovery) en de<br />

ontwikkeling (development) van nieuwe geneesmiddelen, met name in de<br />

nieuwste ontwikkelingen daarin. Ook zal kennis verworven worden in het<br />

succes/falen van deze processen.<br />

Inhoud vak<br />

In dit studieonderdeel zullen diverse moderne ontwikkelingen in het<br />

'discovery' en 'development' proces van de ontwikkeling van nieuwe<br />

geneesmiddelen. De nadruk ligt op verdieping van eerder in de <strong>BSc</strong>-FAR<br />

behandelde stof, dit aan de hand van recente onderzoeksartikelen.<br />

Onderwerpen die aan de orde komen zijn: drug design en synthese,<br />

moleculaire farmacologie ('target finding and validation'), cellulaire<br />

'stress and signaling', moleculaire toxicologie ('ADME and drug<br />

safety'), 'computational medicinal chemistry and toxicology' en<br />

bioanalyse van geneesmiddelen. Ook zullen systeem en netwerk analysie<br />

en biomarkers aan de orde komen.<br />

Onderwijsvorm<br />

Er wordt gebruik gemaakt van Blackboard, en de stof wordt behandeld in<br />

de vorm van 'journal clubs' over recente onderzoeksartikelen,<br />

discussie-sessies en mondelinge presentaties door de studenten in<br />

aanwezigheid van deskundige onderzoekers/docenten.<br />

Literatuur<br />

Het studiemateriaal zal bestaan uit recente researchartikelen uit de<br />

verschillende specialisatie-gebieden in MSc-opleiding Drug Discovery<br />

and Safety.<br />

Doelgroep<br />

3F<br />

Moleculaire mechanismen van ziekten<br />

Vakcode X_430104 (430104)<br />

<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 58 van 76


Periode Periode 3<br />

Credits 3.0<br />

Voertaal Nederlands<br />

Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />

Coördinator dr. J.E. van Muijlwijk-Koezen<br />

Docent(en) dr. J.E. van Muijlwijk-Koezen<br />

Lesmethode(n) Hoorcollege, Werkcollege<br />

Onderwijsvorm<br />

Na een inleiding over een van bovengenoemde ziekten zullen studenten in<br />

groepjes deelopdrachten t.a.v. deze ziekte uitwerken. Hierbij worden<br />

artikelen uit de wetenschappelijke literatuur gebruikt. Op geregelde<br />

tijden zal over de stof worden gediscussieerd met de begeleidende<br />

docent. De resultaten worden aan de overige studenten gepresenteerd,<br />

afwisselend schriftelijk en mondeling.<br />

Moleculaire modeling<br />

Vakcode X_435103 (435103)<br />

Periode Periode 6<br />

Credits 6.0<br />

Voertaal Nederlands<br />

Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />

Coördinator dr. C. de Graaf<br />

Docent(en) dr. I.J.P. de Esch, dr. C. de Graaf<br />

Lesmethode(n) Hoorcollege, Practicum<br />

Doel vak<br />

Het leren van verschillende rekenkundige benaderingen om de biologische<br />

activiteit van nieuwe medicijnmoleculen te begrijpen en te voorspellen.<br />

Verschillende technieken die worden gebruikt in de moderne<br />

farmacochemie zullen behandeld worden en de student zal de voor- en<br />

nadelen van de individuele methoden leren inschatten.<br />

Inhoud vak<br />

De computer wordt in toenemende mate gebruikt voor het vinden en<br />

ontwerpen van nieuwe stoffen met gewenste biologische activiteit. Deze<br />

'in silico' methoden stellen de farmacochemicus in staat om efficiënter<br />

nieuwe geneesmiddelen te ontwikkelen. Verder dragen de verschillende<br />

technologieën bij aan een beter begrip van de werking van liganden en<br />

biologische targets. In dit vak zal aandacht worden besteed aan het nut<br />

van moleculaire modeling en hoe moleculen beschreven kunnen worden door<br />

de computer (2D descriptoren, 3D descriptoren, atomair, quantum<br />

chemisch). De eigenschappen van liganden die verantwoordelijk zijn voor<br />

de activiteit worden geïdentificeerd door middel van (3D)QSAR,<br />

farmacofoor modeling, en molecular docking. Het berekenen van de<br />

conformaties van moleculen zal worden behandeld met behulp van<br />

moleculaire mechanica, waarbij ook verschillende sampling methodes<br />

worden behandeld (systematisch, Monte Carlo, moleculaire dynamica). Ook<br />

zal kort worden ingegaan op quantum mechanische manieren om moleculen<br />

te beschrijven. Vervolgens zullen de toepassing van deze methodes in<br />

rationele drug discovery besproken worden zoals virtual screening en<br />

'de novo' design benaderingen.<br />

<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 59 van 76


Onderwijsvorm<br />

Hoorcolleges, werkcollege, practica.<br />

Toetsvorm<br />

De beoordeling zal plaatsvinden op basis van schriftelijke tentamens en<br />

tussentijdse opdrachten.<br />

Literatuur<br />

Collegedictaat.<br />

Doelgroep<br />

2F<br />

Natuurstoffen<br />

Vakcode X_435440 (435440)<br />

Periode Ac. Jaar (september)<br />

Credits 6.0<br />

Voertaal Nederlands<br />

Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />

Coördinator dr. E. Ruijter<br />

Doel vak<br />

Doel van deze cursus is het verkrijgen van een overzicht over de<br />

structuur, eigenschappen en reacties van de verschillende hoofdklassen<br />

van natuurstoffen.<br />

Inhoud vak<br />

Aansluitend op de basiskennis organische chemie en biochemie worden in<br />

deze cursus een aantal aspecten van de natuurstofchemie behandeld. De<br />

biologische activiteit van vele natuurstoffen hangt nauw samen met hun<br />

unieke en diverse structuren. De structurele kenmerken en<br />

biosynthetische aspecten van o.a. polyketiden, suikers, peptiden,<br />

terpenen en steroïden, alkaloïden en flavonoïden zijn de hoofdthema's<br />

van deze cursus. Hun specifieke rol in de natuur en een aantal<br />

specifieke fysische en chemische eigenschappen zullen worden behandeld.<br />

Onderwijsvorm<br />

Tutorial.<br />

Literatuur<br />

Dewick, P.M., Medicinal Natural Products 3rd ed, Wiley-VCH, 2009.<br />

Aanbevolen voorkennis<br />

Organische Chemie I en II, Biochemie (aangeraden: Organische Chemie III)<br />

Doelgroep<br />

3F, 3S<br />

Open House Analytical Chemistry and applied Spectroscopy<br />

Vakcode X_000009 ()<br />

Periode Periode 1<br />

Credits 0.0<br />

<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 60 van 76


Voertaal Nederlands<br />

Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />

Coördinator dr. H. Lingeman<br />

Docent(en) dr. H. Lingeman<br />

Lesmethode(n) Bijeenkomst<br />

Open house Chemical Biology<br />

Vakcode X_000010 ()<br />

Periode Periode 1<br />

Credits 0.0<br />

Voertaal Nederlands<br />

Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />

Coördinator dr. M.H. Siderius<br />

Docent(en) dr. M.H. Siderius<br />

Lesmethode(n) Bijeenkomst<br />

Open House Comp. Med. Chem. & Tox.<br />

Vakcode X_000011 ()<br />

Periode Periode 1<br />

Credits 0.0<br />

Voertaal Nederlands<br />

Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />

Coördinator dr. B.C. Oostenbrink<br />

Docent(en) dr. B.C. Oostenbrink<br />

Lesmethode(n) Bijeenkomst<br />

Open House DDS<br />

Vakcode X_000012 ()<br />

Periode Periode 1<br />

Credits 0.0<br />

Voertaal Nederlands<br />

Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />

Coördinator dr. I.J.P. de Esch<br />

Docent(en) dr. I.J.P. de Esch<br />

Lesmethode(n) Bijeenkomst<br />

Open House Drug Discovery & Target Finding<br />

Vakcode X_000013 ()<br />

Periode Periode 1<br />

Credits 0.0<br />

<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 61 van 76


Voertaal Nederlands<br />

Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />

Coördinator prof. dr. M.J. Smit<br />

Docent(en) prof. dr. M.J. Smit<br />

Lesmethode(n) Bijeenkomst<br />

Open House MolTox<br />

Vakcode X_000014 ()<br />

Periode Periode 1<br />

Credits 0.0<br />

Voertaal Nederlands<br />

Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />

Coördinator dr. J.N.M. Commandeur<br />

Docent(en) dr. J.N.M. Commandeur<br />

Lesmethode(n) Bijeenkomst<br />

Organische chemie 1<br />

Vakcode X_435091 (435091)<br />

Periode Periode 5<br />

Credits 3.0<br />

Voertaal Nederlands<br />

Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />

Coördinator prof. dr. K. Lammertsma<br />

Docent(en) prof. dr. K. Lammertsma<br />

Lesmethode(n) Hoorcollege, Werkcollege<br />

Literatuur<br />

Clayden e.a., Organic Chemistry, Oxford: Oxford University Press, 2001<br />

(ISBN 019850346).<br />

Organische chemie 2<br />

Vakcode X_435007 (435007)<br />

Periode Periode 1<br />

Credits 3.0<br />

Voertaal Nederlands<br />

Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />

Coördinator prof. dr. ir. R.V.A. Orru<br />

Docent(en) prof. dr. ir. R.V.A. Orru<br />

Lesmethode(n) Hoorcollege<br />

Doel vak<br />

Het college beoogt het aanleren van basiskennis organische chemie.<br />

<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 62 van 76


Inhoud vak<br />

Dit college vormt één geheel met het eerstejaarscollege. Het zet voort<br />

met de presentatie van specifieke reactietypen, nu eens niet<br />

georganiseerd naar functionele groepen, maar rondom een<br />

gemeenschappelijk mechanisme: nucleofiele substituties, eliminaties,<br />

addities aan meervoudige koolstof-koolstofbindingen, electrofiele<br />

aromatische substituties, addities en substitutie aan carbonylgroepen,<br />

omleggingen.<br />

Eveneens wordt aandacht besteed aan syntheseplanning.<br />

Onderwijsvorm<br />

Hoorcollege 16 uur; werkcollege 9 uur.<br />

Aanbevolen voorkennis<br />

Organische chemie I<br />

Doelgroep<br />

2S, 2F<br />

Organische chemie 3: moderne organische synthese<br />

Vakcode X_435109 (435109)<br />

Periode Periode 3<br />

Credits 3.0<br />

Voertaal Nederlands<br />

Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />

Docent(en) prof. dr. ir. R.V.A. Orru, dr. E. Ruijter<br />

Lesmethode(n) Hoorcollege<br />

Doel vak<br />

Uitbreiden van de basiskennis organische chemie en organische synthese.<br />

Inhoud vak<br />

Dit vak bouwt voort op de colleges organische chemie I en II en het<br />

practicum organische synthese. Er zal ruim aandacht worden besteed aan<br />

nieuwe ontwikkelingen in de organische synthese. Zo worden de<br />

basisprincipes van de combinatoriële chemie, solution en solid phase,<br />

diversity oriented benaderingen besproken, maar ook moderne parallelle<br />

synthese technieken, automatische opzuiveringstechnieken en database<br />

gestuurde synthese planning komen aan bod. Verder wordt het rationeel<br />

(computer ondersteund) ontwerpen van complexe syntheses besproken. Ook<br />

komen onderwerpen als asymmetrische katalyse, omleggings-,<br />

cycloadditie- en radicaalreacties aan bod.<br />

Onderwijsvorm<br />

Werkcolleges/opdrachten<br />

Toetsvorm<br />

Opdracht<br />

Literatuur<br />

Clayden e.a., Organic Chemistry, Oxford: Oxford University Press, 2001<br />

(ISBN 019850346).<br />

<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 63 van 76


Aanbevolen voorkennis<br />

Organische chemie I en II.<br />

Doelgroep<br />

3F, 3S, mi-MC, mi-AMC<br />

Organometaalchemie<br />

Vakcode X_435018 (435018)<br />

Periode Ac. Jaar (september)<br />

Credits 3.0<br />

Voertaal Nederlands<br />

Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />

Coördinator dr. A.W. Ehlers<br />

Doel vak<br />

Het doel van dit college is het verdiepen van de basiskennis op het<br />

gebied van coordinatiechemie en de organometaalchemie.<br />

Inhoud vak<br />

Er wordt aandacht besteed aan de volgende onderwerpen:<br />

- organometaalchemie van overgangsmetalen<br />

- organometaalcomplexen en organische synthese<br />

- homogene katalyse<br />

- bio-anorganische chemie (metallo-enzymen, biomimetica).<br />

Onderwijsvorm<br />

Zelfstudie.<br />

Literatuur<br />

Elschenbroich, C., Organometallics 3rd ed. Weinheim: Wiley-VCH. of in<br />

overleg met de docent.<br />

Doelgroep<br />

3S, 3F<br />

Oriëntatie op de M-variant<br />

Vakcode X_400375 (400375)<br />

Periode Periode 4<br />

Credits 6.0<br />

Voertaal Nederlands<br />

Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />

Docent(en) A. van Luijn MSc<br />

Lesmethode(n) Hoorcollege<br />

Doel vak<br />

- Het verwerven van kennis en inzicht in de met name in<br />

beleidsprocessen, beleidstheorie en beleidsanalyse;<br />

- Het verwerven van kennis en inzicht in de structuur en het beleid van<br />

de Nederlandse overheid met name op het gebied van wetenschap;<br />

- Het verwerven van kennis en inzicht in managementprocessen en<br />

-theorieën, met specifieke aandacht voor kennismanagement en<br />

<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 64 van 76


projectmanagement;<br />

- De student is instaat om beleid te analyseren en beleidsopties te<br />

identificeren;<br />

- De student is instaat tot projectmatig werken in teamverband;<br />

- De student beschikt over vaardigheden, zoals onderzoeksopzet maken,<br />

literatuurstudie, kritisch analyseren, argumenteren, en schriftelijk en<br />

mondeling presenteren;<br />

- Oriëntatie op de M-variant, dan wel de masters Management,<br />

Policy-Analysis and Entrepreneurship.<br />

Inhoud vak<br />

Beleid speelt op vele manieren en niveaus een rol in onze samenleving.<br />

Ook binnen de wetenschap heb je eigenlijk altijd met beleid te maken.<br />

Enerzijds speelt beleid een rol bij het stimuleren en/of reguleren van<br />

wetenschappelijk onderzoek. Anderzijds wordt wetenschap ingezet om<br />

beleid rondom een maatschappelijk probleem te ondersteunen of te<br />

adviseren.<br />

Ook management speelt in allerlei situaties en op allerlei niveaus een<br />

rol. Zo wordt wetenschappelijk onderzoek altijd intern aangestuurd door<br />

het management of direct door het hoofd van de afdeling, maar ook meer<br />

indirect door het faculteitsbestuur en College van Bestuur.<br />

Ook al lijken beleid en management veelal ad hoc vorm gegeven te<br />

worden, toch zijn er structurele processen en ordenende principes aan<br />

te wijzen. Inzicht in deze processen en principes maakt dat je begrijpt<br />

waarom bepaalde keuzes gemaakt worden en bijvoorbeeld waarom beleid er<br />

uitziet zoals het in een beleidsnota geformuleerd wordt.<br />

In het eerste deel van deze cursus krijg je colleges over diverse<br />

beleids- en managementaspecten geïllustreerd aan de hand van praktische<br />

casussen. Dit deel wordt afgesloten met een tentamen.<br />

Het tweede deel van de cursus bestaat uit een projectopdracht waarin de<br />

analyse van een actueel, maatschappelijk en natuurwetenschappelijk<br />

vraagstuk in relatie tot (overheids)beleid centraal staat. Voorbeelden<br />

zijn nanotechnologie, Q- koorts, orgaandonatie of biobrandstof. De<br />

nadruk ligt hierbij op zelfwerkzaamheid, eigen initiatief en<br />

oordeelsvorming en op het werken in teamverband. Wij willen daarmee een<br />

leersituatie creëren die nauw aansluit bij de praktijk van beleidsmatig<br />

onderzoek en projectmatig werken. De problematiek en de verschillende<br />

beleidsopties rond dit vraagstuk worden kritisch geanalyseerd. De<br />

resultaten, conclusies en aanbevelingen worden weergegeven in een<br />

beleidsadviesrapport dat aan het eind van de cursus mondeling<br />

gepresenteerd wordt.<br />

Onderwijsvorm<br />

De eerste helft van de cursus zal bestaan uit werkcolleges, de tweede<br />

helft uit het uitvoeren van een projectopdracht in teamverband.<br />

Literatuur<br />

Informatie over literatuur wordt via Blackboard verstrekt.<br />

Doelgroep<br />

Derdejaars FEW-studenten.<br />

Overige informatie<br />

Onderdeel van de M-oriëntatie.<br />

Oriëntatie science educatie<br />

<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 65 van 76


Vakcode O_ORIBETA (991010)<br />

Periode Periode 4<br />

Credits 6.0<br />

Voertaal Nederlands<br />

Coördinator ir. J.G. Schoonhoven<br />

Doel vak<br />

Voor een student die deze cursus heeft doorlopen geldt:<br />

de student is bereid en in staat te reflecteren op zijn/haar<br />

functioneren,<br />

de student is in staat om aan te geven wat het betekent om een goede<br />

docent in de bovenbouw te zijn,<br />

de student is in staat om zijn eigen geschiktheid voor het beroep van<br />

docent te beoordelen,<br />

de student kan aangeven of het beroep van docent iets voor hem/haar is,<br />

de student verwerft een aantal communicatieve en didactische<br />

vaardigheden.<br />

Inhoud vak<br />

De cursus bestaat de eerste week uit diverse werkcolleges, de volgende<br />

drie weken uit een stage op een school voor voortgezet onderwijs. elke<br />

week is er een praktijkbespreking en verdieping op de VU. De stage is<br />

het belangrijkste onderdeel van de cursus, deze voer je uit samen met<br />

een medestudent. In totaal zal de stage ongeveer twaalf dagen in beslag<br />

nemen.<br />

Tijdens de werkcolleges komen de volgende onderwerpen aan de orde:<br />

Hoe bouw je een presentatie op, hoe kom je over.<br />

Hoe vertaal je (wetenschappelijke) informatie naar het niveau van je<br />

doelgroep.<br />

Wat doet een (goede) leraar allemaal.<br />

Wat is het verschil tussen presenteren en onderwijzen.<br />

Welke kenmerken heeft de doelgroep en hoe kun je daar rekening mee<br />

houden.<br />

Hoe ontwerp je een (activerende) les.<br />

Hoe krijg je je doelgroep actief.<br />

Met welke communicatieve aspecten in de klas moet je rekening houden.<br />

Tijdens de stage onderneem je de volgende activiteiten:<br />

observeren van lessen;<br />

zelf minimaal vier lessen geven, in zowel onderbouw als bovenbouw;<br />

uitvoeren van een klein onderzoek;<br />

zo veel mogelijk deelnemen aan alle activiteiten op school en zo<br />

(hernieuwd) kennis maken met het voortgezet onderwijs vanuit het<br />

docenten perspectief.<br />

Onderwijsvorm<br />

Je levert aan het eind van de cursus een verslag in. Het verslag is een<br />

samenhangend verhaal dat een beeld geeft van jouw leerproces tijdens de<br />

cursus. Met je verslag laat je zien waar je staat als mogelijk<br />

toekomstig docent. Het gaat primair om het zichtbaar maken van je<br />

ontwikkeling, niet noodzakelijk om te bewijzen dat je een goede docent<br />

bent. Werkcolleges en stage vormen samen een voltijds programma, het<br />

is niet mogelijk gelijktijdig andere colleges te volgen.<br />

Doelgroep<br />

<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 66 van 76


Deelname aan de cursus staat open voor derdejaars bachelorstudenten van<br />

de faculteiten Exacte Wetenschappen en Aard- en Levens<strong>wetenschappen</strong>. De<br />

cursus wordt aangeraden voor studenten die overwegen de<br />

lerarenopleiding te gaan volgen binnen de masteropleiding (E- variant)<br />

of aansluitend op hun masteropleiding. Ook voor studenten die<br />

vaardigheden op willen doen in het verzorgen van wetenschappelijke<br />

presentaties is de cursus interessant.<br />

Overige informatie<br />

Meer informatie is te verkrijgbaar bij Arjan Schooonhoven:<br />

a.schoonhoven@ond. vu. nl, of te vinden op www.onderwijscentrum.vu.nl<br />

Practicum Bio-analytische chemie<br />

Vakcode X_435085 (435085)<br />

Periode Periode 6<br />

Credits 3.0<br />

Voertaal Nederlands<br />

Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />

Coördinator dr. J. Kool<br />

Doel vak<br />

Het doel is het aanleren van de basisprincipes van de bio-analytische<br />

chemie en het leren opzetten en uitvoeren van bio-analytisch-chemische<br />

experimenten.<br />

Inhoud vak<br />

Dit betekent dat allereerst de, uit analytisch oogpunt belangrijke,<br />

fysich-chemische eigenschappen van de te onderzoeken verbindingen<br />

bestudeerd zullen worden. Vervolgens worden de bio-analytisch-chemische<br />

technieken opgezocht waarmee deze verbindingen bepaald kunnen worden,<br />

waarna een analysevoorschrift wordt opgesteld. Hierna worden de<br />

bepalingen uitgevoerd en worden de resultaten in een verslag<br />

weergegeven. De noodzakelijke theoretische achtergrond wordt gegeven in<br />

de vorm van werk- en instructiecolleges.<br />

Onderwijsvorm<br />

Het practicum wordt wordt uitgevoerd als projectmatig onderwijs,<br />

waarbij de student aan de hand van opdrachten zelf alle noodzakelijke<br />

gegevens, de theoretische achtergrond en de voorschriften moet opzoeken<br />

en het experiment zelf vormgeven.<br />

Literatuur<br />

Tijdens het practicum zal voldoende literatuur aanwezig zijn om de<br />

opdrachten te kunnen uitvoeren.<br />

Doelgroep<br />

1F<br />

Practicum Moderne synthetische methoden<br />

Vakcode X_435016 (435016)<br />

Periode Ac. Jaar (september)<br />

Credits 9.0<br />

<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 67 van 76


Voertaal Nederlands<br />

Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />

Coördinator dr. E. Ruijter<br />

Doel vak<br />

Kennismaken met nieuwste experimentele ontwikkelingen in de organische<br />

synthese.<br />

Inhoud vak<br />

In dit vak maak je kennis met de nieuwste experimentele technieken in<br />

de organische synthese. Je gaat werken aan een project dat direct met<br />

lopend onderzoek verknoopt is. Parallelle synthese methodiek met behulp<br />

van semi-automatische apparatuur wordt toegepast in combinatie met<br />

parallelle opwerkingstechnieken m.b.v. indampmodules en automatische<br />

kolomchromatografie. Ook leer je syntheses en zuiveringen absoluut<br />

water- en zuurstofvrij uitvoeren d.m.v. Schlenk-technieken en het<br />

werken met een glovebox.<br />

Onderwijsvorm<br />

Practicumproject<br />

Literatuur<br />

Clayden e.a., Organic Chemistry, Oxford: Oxford University Press (ISBN<br />

019850346).<br />

Aanbevolen voorkennis<br />

Organische chemie I & II, practicum organische synthese,<br />

kernspinresonantie (NMR).<br />

Doelgroep<br />

3S, 3F<br />

Project Bio-analytische chemie<br />

Vakcode X_430577 ()<br />

Credits 6.0<br />

Voertaal Nederlands<br />

Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />

Coördinator dr. H. Lingeman<br />

Doel vak<br />

Het verwerven van kennis en het opzetten en uitvoeren van analytische<br />

technieken die gebruikt kunnen worden bij de (kwantitatieve) bepaling<br />

van geneesmiddelen en endogene componenten in biologische systemen.<br />

Inhoud vak<br />

In een geïntegreerd hoor-/werkcollege en practicum komen de technieken<br />

aan de orde die gebruikt kunnen worden voor zowel de kwalitatieve als<br />

kwantitatieve bepaling van geneesmiddelen, met de hierbij horende<br />

metabolieten en/of ontledingsproducten in een biologische matrix. Dit<br />

betekent dat aan de hand van de fysisch-chemische eigenschappen van de<br />

te onderzoeken verbinding een protocol wordt opgesteld, waarmee deze<br />

verbinding bepaald kan worden. Vervolgens wordt de bepaling uitgevoerd<br />

en worden de resultaten in een verslag weergegeven.<br />

<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 68 van 76


Onderwijsvorm<br />

Geïntegreerd hoor- /werkcollege en projectmatig onderwijs, waarbij de<br />

student aan de hand van opdrachten zelf alle noodzakelijke gegevens,<br />

theoretische achtergrond en de voorschriften moet opzoeken en het<br />

experiment zelf vorm moet geven.<br />

Toetsvorm<br />

Schriftelijk tentamen en beoordeling van de praktische activiteiten<br />

(inclusief voorbereiding, experimentele vaardigheden, schriftelijke<br />

verslaglegging). Beide onderdelen tellen gelijkwaardig mee in<br />

eindbeoordeling en geen van beide onderdelen mag lager dan een 5 zijn.<br />

Literatuur<br />

Materiaal beschikbaar gesteld door de docenten. Uitgebreide informatie<br />

over de behandelde stof kan worden gevonden in D.C. Harris, Quantitative<br />

Chemical Analysis, Eighth Edition, W.H. Freeman and Company, New York,<br />

2010.<br />

Doelgroep<br />

1F (periode 6), 1MNW (periode 5)<br />

Voor studenten MNW begonnen in 2011/2012: Project Bio-analytische chemie<br />

(6 ec) vervangt Bio-analytische chemie (X_430094)+ Practicum bioanalyse<br />

(X_430511)<br />

Overige informatie<br />

Slagingseis 1F:<br />

Het met een voldoende afronden van het vak Bio-Analytische Chemie is<br />

alleen dan mogelijk, indien de onderdelen van tutoraat FAR 1B naar<br />

behoren zijn afgerond.<br />

Radiofarmacochemie<br />

Vakcode X_436502 (436502)<br />

Periode Periode 1<br />

Credits 3.0<br />

Voertaal Nederlands<br />

Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />

Coördinator dr. A.D. Windhorst<br />

Lesmethode(n) Hoorcollege<br />

Doel vak<br />

Het college heeft tot doel studenten inzicht te geven op welke wijze<br />

radiofarmaca gemaakt worden en wat de toepassing is in de nucleaire<br />

geneeskunde.<br />

Toetsvorm<br />

De beoordeling zal plaatsvinden op basis van een schriftelijke tentamen<br />

met open vragen.<br />

Literatuur<br />

Voor deze cursus is een syllabus beschikbaar. Deze wordt overhandigd op<br />

het eerste college. Via Blackboard zal extra cursus materiaal ter<br />

beschikking komen.<br />

<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 69 van 76


Aanbevolen voorkennis<br />

Deelnemers aan dit college dienen bij voorkeur organische chemie te<br />

hebben gevolgd.<br />

Statistiek<br />

Vakcode X_420223 (420223)<br />

Periode Periode 1+2<br />

Credits 6.0<br />

Voertaal Nederlands<br />

Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />

Coördinator dr. C.M. Quant<br />

Docent(en) dr. C.M. Quant<br />

Lesmethode(n) Hoorcollege, Werkcollege<br />

Onderwijsvorm<br />

Hoorcollege, werkcollege en computerpracticum.<br />

Doelgroep<br />

2SBI en 2F<br />

Structuurbiologie<br />

Vakcode X_430080 (430080)<br />

Periode Periode 1<br />

Credits 6.0<br />

Voertaal Nederlands<br />

Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />

Coördinator dr. D.P. Geerke<br />

Docent(en) dr. D.P. Geerke<br />

Lesmethode(n) Hoorcollege<br />

Doel vak<br />

Het verkrijgen van inzicht in de moleculaire elementen die de basis<br />

vormen van de structuur en functie van biomoleculen. Tevens, het opdoen<br />

van kennis over de methoden die gebruikt worden om de structuur en<br />

functie van eiwitten te analyseren.<br />

Onderwijsvorm<br />

Hoorcolleges, zelfstudie, opdrachten.<br />

Literatuur<br />

Branden, C., and Tooze, J., Introduction to Protein Structure, Garland,<br />

1999.<br />

Studie en loopbaan<br />

Vakcode X_000018 ()<br />

Periode Periode 1, Periode 5<br />

Credits 0.0<br />

Voertaal Nederlands<br />

<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 70 van 76


Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />

Coördinator drs. M. Touwen<br />

Lesmethode(n) Hoorcollege<br />

Overige informatie<br />

In periode 1 voor 3F en 3S, in periode 5 voor 2F en 2S.<br />

Synthese practicum<br />

Vakcode X_435192 (435192)<br />

Periode Periode 2, Periode 3<br />

Credits 6.0<br />

Voertaal Nederlands<br />

Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />

Coördinator dr. J.C. Slootweg<br />

Docent(en) dr. J.C. Slootweg<br />

Lesmethode(n) Hoorcollege, Practicum<br />

Doel vak<br />

Het doel van het practicum is de student vaardigheid bij te brengen in<br />

de preparatieve organische en (in mindere mate) anorganische chemie,<br />

alsook een beeld te geven hoe de (an)organisch chemicus zijn<br />

experimentele resultaten verkrijgt.<br />

Inhoud vak<br />

Tijdens dit practicum ligt aanvankelijk het accent op het aanleren van<br />

een aantal basale isolatie- en zuiveringstechnieken zoals<br />

kristalliseren, destilleren, sublimeren, extraheren, chromatografie<br />

(GLC, kolomchromatografie). Deze technieken worden geleerd tijdens een<br />

aantal eenstapssyntheses, die tevens de collegestof illustreren. De<br />

syntheses worden deels op macroschaal (2-10 g) en deels op microschaal<br />

(50-100 mg) uitgevoerd. In de eerste periode wordt tevens het<br />

werkcollege spectroscopische technieken gegeven, ten behoeve van de<br />

interpretatie van de in de loop van het practicum op te nemen IR, UV,<br />

NMR, en ook massaspectra. Later worden enkele meerstapssyntheses<br />

uitgevoerd, waarbij het van belang is elk tussenproduct goed te<br />

zuiveren en te karakteriseren. De meeste experimenten kennen een<br />

'probleem-oplossende' aanpak, waarbij aandacht wordt besteed aan<br />

onderzoeksmethodiek.<br />

Onderwijsvorm<br />

De student werkt individueel binnen een groep o.l.v. een assistent.<br />

Literatuur<br />

Lehman, J.W., Multiscale Operational Organic Chemistry 2nd ed, New<br />

Jersey: Prentice Hall, 2009.<br />

Aanbevolen voorkennis<br />

Organische chemie 1 en 2.<br />

Doelgroep<br />

2S, 2F<br />

Thermodynamics<br />

<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 71 van 76


Vakcode X_430513 (430513)<br />

Periode Periode 2<br />

Credits 3.0<br />

Voertaal Nederlands<br />

Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />

Coördinator dr. G. van der Zwan<br />

Docent(en) dr. G. van der Zwan<br />

Lesmethode(n) Hoorcollege, Werkcollege<br />

Doel vak<br />

Leren toepassen van thermodynamica op chemische processen.<br />

Inhoud vak<br />

Het eerste deel van het college zal bestaan uit het bestuderen van<br />

warmte en arbeid, de afleiding van de grootheid entropie en het bepalen<br />

van de richting van spontane processen. Nieuwe grootheden als enthalpie<br />

en vrije energie zullen worden ingevoerd, en de toepassing van de twee<br />

hoofdwetten van de thermodynamica (je kan geen energie uit niets maken,<br />

en warmte stroomt spontaan van warm naar koud) op chemische processen<br />

zal vervolgens aan de orde komen.<br />

Chemisch evenwicht, en effecten van druk en temperatuur daarop kunnen<br />

dan effectief worden bestudeerd. Toepassing van de thermodynamica op<br />

redox reacties, de wet van Nernst en de electrochemische cel vormen het<br />

laatste onderdeel van dit college.<br />

Onderwijsvorm<br />

Hoor- en werkcolleges.<br />

Literatuur<br />

Wordt nader bekendgemaakt.<br />

Van atoom tot (bio)molecuul<br />

Vakcode X_430580 ()<br />

Credits 6.0<br />

Voertaal Nederlands<br />

Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />

Coördinator prof. dr. F. Bickelhaupt<br />

Doel vak<br />

Dit vak beoogt de bouwstenen aan te dragen waarop alle chemische<br />

disciplines rusten en zodoende een solide fundament voor de gehele<br />

hierop volgende studie te leggen. Tegelijkertijd wordt ernaar gestreefd<br />

de scheikunde in de context van andere natuur<strong>wetenschappen</strong> te plaatsen<br />

(thema "Van Atoom tot Biomolecuul") alsmede haar relevantie voor het<br />

verschijnsel leven duidelijk te maken (thema "Levende Chemie").<br />

Inhoud vak<br />

Chemie is de wetenschap van stoffen, hun structuur en eigenschappen, en<br />

met name hun omzetting via chemische reacties. Binnen de<br />

natuur<strong>wetenschappen</strong> neemt de chemie een centrale plaats in en heeft vele<br />

raakvlakken met de andere disciplines, van de fysica tot en met de<br />

biologie.<br />

<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 72 van 76


Binnen het thema "Van Atoom tot Biomolecuul" (periode 1) wordt het<br />

multidisciplinaire karakter geaccentueerd door het behandelen van<br />

fundamentele scheikundige begrippen die relevant zijn in de context van<br />

de verschillende natuur<strong>wetenschappen</strong>. In dit kader zullen o.a. aan bod<br />

komen: “evenwichten”, “pH berekeningen”, “oplosbaarheid”,<br />

“oxidatietoestand” en “redoxchemie”.<br />

Bij de overgang naar het thema "Levende Chemie" (periode 2) verschuift<br />

het zwaartepunt van het vak "Van Atoom tot Biomolecuul" naar complexere<br />

aspecten van de scheikunde, beginnend bij de fysische en anorganische<br />

chemie via de (metaal)organische chemie tot aan de biologische chemie.<br />

De volgende onderwerpen worden in dit kader behandeld: "alles is<br />

chemie", "atomen en het periodieke systeem", "moleculaire structuur",<br />

"electronische structuur en chemische binding", "chemische reacties",<br />

"thermodynamica", "kinetiek", "inleiding organische chemie", "inleiding<br />

biochemie", "zelf gegevens opzoeken in de chemische literatuur".<br />

Onderwijsvorm<br />

De cursus bestaat uit een hoorcollege en een werkcollege.<br />

Toetsvorm<br />

tentamen<br />

Literatuur<br />

Steven S. Zumdahl, Chemical Principles, 6th Ed., Houghton Mifflin<br />

Company: Boston, New York, 2009<br />

Doelgroep<br />

1F, 1S, 3-SBI, mi-Sc, mi-BI<br />

Overige informatie<br />

Voor studenten 1S: Het met een voldoende afronden van het vak Van atoom<br />

tot (bio)molecuul is alleen dan mogelijk, indien de onderdelen van<br />

Tutoraat SK 1A naar behoren zijn afgerond.<br />

Deze slagingseis geldt alleen voor 1S, niet voorde andere doelgroepen.<br />

Van molecuul tot medicijn<br />

Vakcode X_430581 ()<br />

Credits 3.0<br />

Voertaal Nederlands<br />

Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />

Coördinator dr. I.J.P. de Esch<br />

Doel vak<br />

Dit vak geeft inzicht in de manieren waarop biologisch actieve moleculen<br />

gevonden worden en hoe ze ontwikkeld worden tot medicijnen.<br />

Inhoud vak<br />

Er wordt aandacht besteed aan strategieën om de activiteit van<br />

biologische targets (receptor, enzym of transporteiwit) te beïnvloeden<br />

met geneesmiddelmoleculen. Daarbij zullen moleculaire herkenning, het<br />

screenen van grote stoffenbibliotheken en rationele ontwerpmethodiek,<br />

alsmede de relatie tussen de chemische structuur en de biologische<br />

activiteit (SAR) aan de orde komen. Ook wordt aandacht besteed aan<br />

diagnostiek en therapie, bijvoorbeeld door moleculen te binden aan een<br />

specifiek biologisch target waardoor de werking van het biomolecuul<br />

<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 73 van 76


estudeerd kan worden. Verschillende imaging technieken die gebruikt<br />

worden om targets zichtbaar te maken, zullen worden besproken aan de<br />

hand van cases uit de praktijk. Er zal een bezoek gebracht worden aan de<br />

betrokken centra van het VU Medisch Centrum. Bij de kostbare<br />

ontwikkeling van deze medicijnen en diagnostica is het essentieel om het<br />

intellectueel eigendom (IP) te beschermen teneinde de enorme research<br />

investeringen te kunnen terugverdienen. We zullen dan ook nadrukkelijk<br />

aandacht besteden aan de rol en aanpak van patenten. Tot slot moeten de<br />

medicijnen voor klinische testen en marktintroductie op grote schaal<br />

worden gesynthetiseerd met behulp van proceschemie. De hiermee gepaard<br />

gaande uitdagingen, bekende hordes in de race van molecuul tot medicijn,<br />

zullen worden behandeld.<br />

Onderwijsvorm<br />

Hoorcolleges, werkcollege (gebruik CD Roms, opdrachten), bezoek aan<br />

centra op de VU voor Diagnostiek & Therapie en zelfstudie.<br />

Toetsvorm<br />

Web-tussentoetsen<br />

Schriftelijk tentamen<br />

Literatuur<br />

Patrick, G., An Introduction to Medicinal Chemistry 4th ed.<br />

Oxford: Oxford University Press. 2009, ISBN: 0199234477<br />

Handouts<br />

Aanbevolen voorkennis<br />

Van Atoom tot Biomolecuul<br />

Van Gen tot Geneesmiddel<br />

Innovatieproject Geneesmiddelen<br />

Doelgroep<br />

1F, 2-SBI<br />

Veiligheidsinstructie S, F, MNW en SBI 30min<br />

Vakcode X_000019 ()<br />

Periode Periode 1<br />

Credits 0.0<br />

Voertaal Nederlands<br />

Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />

Voorlichting door studentendecanen en CSL<br />

Vakcode X_000007 ()<br />

Credits 0.0<br />

Voertaal Nederlands<br />

Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />

Wetenschapscommunicatie voor Bèta-onderzoekers<br />

Vakcode AB_470185 (450003)<br />

Periode Periode 4<br />

<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 74 van 76


Credits 6.0<br />

Voertaal Engels<br />

Faculteit Fac. der Aard- en Levens<strong>wetenschappen</strong><br />

Coördinator R.C. van Koten MSc<br />

Docent(en) prof. dr. J.E.W. Broerse, R.C. van Koten MSc, dr. M.J.W.<br />

Bos<br />

Lesmethode(n) Hoorcollege, Werkgroep<br />

Doel vak<br />

Verwerven van kennis en inzicht in de verschillende modellen van<br />

wetenschapscommunicatie (deficiet, context, interactie en<br />

participatie), haar parameters en gebruikelijke applicatiedomeinen.<br />

Verwerven van kennis en inzicht van de beperkingen en mogelijkheden<br />

van de verschillende media waarin de modellen tot uitdrukking kunnen<br />

komen (journalistiek, TV en film, het Internet, musea en science<br />

centra).<br />

Verkrijgen van vaardigheid in het ontwerpen van een doelgroepgerichte<br />

communicatie<br />

Het opdoen van leerervaring met het werken in een multidisciplinaire<br />

groep<br />

Inhoud vak<br />

Wetenschap heeft verstrekkende gevolgen voor de maatschappij (bv. ICT,<br />

biotechnologie, nanotechnologie, farmacie). Maar hoe kijkt de<br />

maatschappij eigenlijk naar wetenschappelijke ontwikkelingen? Wat vindt<br />

de industrie van wat we uitgevonden hebben en wat denken andere<br />

wetenschappers van onze kennis? De visie van deze mensen over ons en<br />

ons werk is van groot belang voor de richting die het onderzoek in de<br />

nabije toekomst gaat nemen.<br />

Daarom is communicatie over wetenschap van cruciaal belang. In deze<br />

cursus raak je vertrouwt met een aantal modellen van<br />

wetenschapscommunicatie, het herkennen van hun toepassingen in de<br />

praktijk en de verschillende soorten publiek die men ermee kan<br />

aanspreken (populariseren voor leken, informatieoverdracht voor de<br />

industrie, faciliteren van interdisciplinair onderzoek in de<br />

wetenschap). Door middel van opdrachten raak je bekend met de<br />

praktische kant van wetenschapscommunicatie, bijvoorbeeld<br />

wetenschapsjournalistiek, voorlichting, etc. De opdrachten worden deels<br />

individueel uitgevoerd en deels in een multidisciplinaire groep.<br />

Onderwijsvorm<br />

Colleges, opdracht, zelfstudie<br />

Literatuur<br />

(Online) syllabus<br />

Doelgroep<br />

Keuzecursus voor derdejaars <strong>BSc</strong> Biomedische Wetenschappen en Biologie.<br />

Speciaal aanbevolen voor studenten die overwegen de C- variant<br />

(wetenschapscommunicatie) in hun masterprogramma op te nemen.<br />

Overige informatie<br />

Voor meer informatie: reinout.van.koten@falw.vu.nl<br />

Why Chemical Reactions Happen<br />

<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 75 van 76


Vakcode X_435088 (435088)<br />

Periode Periode 4<br />

Credits 3.0<br />

Voertaal Nederlands<br />

Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />

Coördinator prof. dr. C. Gooijer<br />

Docent(en) prof. dr. C. Gooijer, prof. dr. K. Lammertsma<br />

Lesmethode(n) Hoorcollege<br />

Doel vak<br />

Het doel van het college is - in nauwe aansluiting met het voorafgaande<br />

college Chemische Binding - nader in te gaan op de quantummechanische<br />

beschrijving van moleculen en de basis te leggen voor de beantwoording<br />

van de vraag waarom en wanneer chemische reacties plaatsvinden. Veel<br />

aandacht wordt besteed aan evenwichtsconstanten in relatie tot de<br />

tweede hoofdwet van de thermodynamice.<br />

Inhoud vak<br />

Molecular orbitals voor homo- en hetero-tweeatomige moleculen;<br />

elektronenverdeling in grotere moleculen; een aantal basale chemische<br />

reacties; chemische evenwichten; reactiesnelheden; binding in<br />

geconjugeerde systemen.<br />

Onderwijsvorm<br />

Gecombineerd hoorcollege en werkcollege<br />

Literatuur<br />

Keeler, J., and Wothers, P., Why Chemical Reactions Happen, New York:<br />

Oxford University Press, 2003 (ISBN 0-19-924-9733).<br />

Doelgroep<br />

1S, 1F<br />

Wijsgerige vorming: natuur<strong>wetenschappen</strong>, filosofie en ethiek<br />

Vakcode X_435340 (435340)<br />

Periode Periode 1<br />

Credits 3.0<br />

Voertaal Nederlands<br />

Faculteit Faculteit der Exacte Wetenschappen<br />

Coördinator dr. G.C. Eigner<br />

Lesmethode(n) Hoorcollege, Werkcollege<br />

Literatuur<br />

Horsten, L. Douven, I. en Weber, E., Wetenschapsfilosofie. Assen: Van<br />

Gorcum, 2007.<br />

<strong>Vrije</strong> <strong>Universiteit</strong> <strong>Amsterdam</strong> - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B <strong>Farmaceutische</strong> Wetenschappen - 2010-2011 8-6-2012 - Pagina 76 van 76

Hooray! Your file is uploaded and ready to be published.

Saved successfully!

Ooh no, something went wrong!