Basispracticum Biologische Chemie - Biochemistry

Basispracticum Biologische Chemie - Biochemistry Basispracticum Biologische Chemie - Biochemistry

biochemistry.wur.nl
from biochemistry.wur.nl More from this publisher
21.09.2013 Views

VERSLAG OVER BLOK 3 Urinezuurbepaling - Geef in het verslag de gevonden waarden van de DDL bepaling en de zuurstofmetingen. Bereken uit deze getallen de juiste concentratie van de urinezuurstandaard en de concentratie van urinezuur in de urine. Geef aan hoe je de berekening uit hebt gevoerd. - Vergelijk de resultaten van beide bepalingsmethoden. Welke methode geeft de meest betrouwbare uitkomst? - De molaire extinctiecoëfficiënt van DDL, ε DDL (410nm) = 8 x 10 3 M -1 .cm -1 . GOT-GPT metingen - Geef de reactievergelijking van de door GOT en GPT gekatalyseerde reactie en geef aan met welke volgreactie de activiteit gedetecteerd wordt. - Geef in je verslag aan hoe je het aantal units GOT en GPT per liter serum uit gemeten extinctieveranderingen hebt berekend. (1 unit is die hoeveelheid enzym die per min 1 μmol product produceert bij 30°C). ε NADH bij 340 nm = 6.3 mM -1 .cm 1 . - Geef aan hoe je hebt gecontroleerd dat de gemeten GOT en GPT activiteit ook echt de activiteit van de GOT en GPT enzymen was en niet die van de detectie-enzymen. - Waarom is het zo belangrijk precies bij 30°C de activiteit te meten? - Bepaal het “DeRitis” quotiënt. - Welke conclusies kan je trekken uit de GOT en GPT metingen en uit de waarde van het “DeRitis” quotiënt met betrekking tot een mogelijke ziekte van de patiënt? Isoelectrisch focusseren • Presenteer een scan van de gel. • Tracht uit de samenstelling van de fosfoglucomutase reactiemix te achterhalen volgens welke reacties de activiteit van fosfoglucomutase in de agarose-gel gedetecteerd is. (Info: PMS oxideert NAD(P)H en gereduceerd PMS reduceert NBT; gereduceerd NBT is niet oplosbaar en slaat neer). • Beschrijf de uitkomst van het isoelectrisch focuseringsexperiment. Geef aan hoeveel isoenzymen er in runderspier en varkensspier worden aangetroffen. • Is het mogelijk met behulp van het fosfoglucomutase isoenzym patroon een uitspraak te doen over de aanwezigheid van rundvlees en varkensvlees in het rundergehakt? • Is de inhoud van het vleesproduct van Albert Heijn (‘slavink’) in overeenstemming met het label dat op het vleesproduct aanwezig is? (zie vorige bladzijde) Geef aan of de testmethode goed genoeg geweest is om de aangegeven samenstelling te kunnen detecteren. Realiseer je dat runderhart ook rundvlees is en dat glycogeen een belangrijke energiebron voor spiercontractie is in skeletspier maar niet in hartspier. Hartspier mag namelijk niet verzuren. - 58 -

Basispracticum Biologische Chemie: Biochemie-deel Blok 1 (in silico experimenten): - gebruik van antilichamen in detectie en analyse van eiwitten en eiwitcomplexen - opzetten van een (fluorimetrische) enzymactiviteitsmeting Blok 2: - het gebruiken van fluorescentie en lichtabsorptie bij fysiologische studies (in vivo fluorescentie, ΔG berekeningen) - het gebruik van computer graphics om het werkingsmechanisme van enzymen te bestuderen (CG) Blok3: - de detectie van (weefselspecifieke) enzymen of substraten voor het vaststellen van: jicht, een hartaanval of een levercirrose, de aan/afwezigheid van varkens/rundvlees in slavinken Blok 1 In silico experimenten: detectie van eiwitten en eiwit(enzym)compexen Isolatie en identificatie enzymcomplexen • Bepalen van de kwaliteit (titer) van een IgG oplossing • Het uitvoeren van een immunoprecipitatie • Analyse van het geprecipiteerde eiwitcomplex m.b.v proteomics (een trypsine digestie van een bandje uit een SDS gel; het bepalen van de massa’s van de peptides in het digest; het vergelijken van de massa’s met databases van eiwitten) Kwantitatieve bepaling van een eiwit • Het bepalen van een hormoonconcentratie m.b.v. de ELISA methode Het meten van genexpressie met een reporterenzym • Opzetten en in silico uitvoeren van een fluorimetrische enzymactiviteitsmeting (ß-glucuronidase in een transgene plant) Structuur IgG molecuul Het Fc-domein is de bindingsplaats voor protein A of anti-IgG (konijn) opgewekt in een geit PowerPoint paginanummer 1

VERSLAG OVER BLOK 3<br />

Urinezuurbepaling<br />

- Geef in het verslag de gevonden waarden van de DDL bepaling en de<br />

zuurstofmetingen. Bereken uit deze getallen de juiste concentratie van de<br />

urinezuurstandaard en de concentratie van urinezuur in de urine. Geef aan<br />

hoe je de berekening uit hebt gevoerd.<br />

- Vergelijk de resultaten van beide bepalingsmethoden. Welke methode<br />

geeft de meest betrouwbare uitkomst?<br />

- De molaire extinctiecoëfficiënt van DDL, ε DDL (410nm) = 8 x 10 3 M -1 .cm -1 .<br />

GOT-GPT metingen<br />

- Geef de reactievergelijking van de door GOT en GPT gekatalyseerde reactie<br />

en geef aan met welke volgreactie de activiteit gedetecteerd wordt.<br />

- Geef in je verslag aan hoe je het aantal units GOT en GPT per liter serum<br />

uit gemeten extinctieveranderingen hebt berekend. (1 unit is die hoeveelheid<br />

enzym die per min 1 μmol product produceert bij 30°C). ε NADH<br />

bij 340 nm = 6.3 mM -1 .cm 1 .<br />

- Geef aan hoe je hebt gecontroleerd dat de gemeten GOT en GPT activiteit<br />

ook echt de activiteit van de GOT en GPT enzymen was en niet die van de<br />

detectie-enzymen.<br />

- Waarom is het zo belangrijk precies bij 30°C de activiteit te meten?<br />

- Bepaal het “DeRitis” quotiënt.<br />

- Welke conclusies kan je trekken uit de GOT en GPT metingen en uit de<br />

waarde van het “DeRitis” quotiënt met betrekking tot een mogelijke<br />

ziekte van de patiënt?<br />

Isoelectrisch focusseren<br />

• Presenteer een scan van de gel.<br />

• Tracht uit de samenstelling van de fosfoglucomutase reactiemix te achterhalen<br />

volgens welke reacties de activiteit van fosfoglucomutase in de<br />

agarose-gel gedetecteerd is. (Info: PMS oxideert NAD(P)H en gereduceerd<br />

PMS reduceert NBT; gereduceerd NBT is niet oplosbaar en slaat neer).<br />

• Beschrijf de uitkomst van het isoelectrisch focuseringsexperiment. Geef<br />

aan hoeveel isoenzymen er in runderspier en varkensspier worden aangetroffen.<br />

• Is het mogelijk met behulp van het fosfoglucomutase isoenzym patroon<br />

een uitspraak te doen over de aanwezigheid van rundvlees en varkensvlees<br />

in het rundergehakt?<br />

• Is de inhoud van het vleesproduct van Albert Heijn (‘slavink’) in overeenstemming<br />

met het label dat op het vleesproduct aanwezig is? (zie vorige<br />

bladzijde) Geef aan of de testmethode goed genoeg geweest is om de<br />

aangegeven samenstelling te kunnen detecteren. Realiseer je dat runderhart<br />

ook rundvlees is en dat glycogeen een belangrijke energiebron<br />

voor spiercontractie is in skeletspier maar niet in hartspier. Hartspier mag<br />

namelijk niet verzuren.<br />

- 58 -

Hooray! Your file is uploaded and ready to be published.

Saved successfully!

Ooh no, something went wrong!