Basispracticum Biologische Chemie - Biochemistry
Basispracticum Biologische Chemie - Biochemistry
Basispracticum Biologische Chemie - Biochemistry
Create successful ePaper yourself
Turn your PDF publications into a flip-book with our unique Google optimized e-Paper software.
den worden. Dit is als volgt in te zien. De nettolading van een eiwit is net als<br />
dat van de aminozuren waaruit een eiwit is opgebouwd afhankelijk van de<br />
pH. Bij een lage pH zal een eiwit een positieve lading hebben, bij een hoge<br />
pH een negatieve lading. Ergens tussen beide extremen in zal de nettolading<br />
nul zijn. De pH waarbij dit het geval is, noemt men de pI, het isoelectrisch<br />
punt van het eiwit.<br />
In een electrisch veld zal een eiwit afhankelijk van zijn nettolading in de<br />
richting van de anode (+ pool) of in de richting van de kathode (- pool)<br />
bewegen. Wanneer het eiwit in een gel met een pH gradiënt beweegt, zal<br />
de lading van het eiwit met de veranderende pH afnemen. Het eiwit blijft<br />
bewegen totdat het eiwit bij zijn pI waarde is aangekomen en geen nettolading<br />
meer heeft. Zolang de pH gradiënt in de gel stabiel is zal de diffusie die<br />
bij andere chromatografische technieken piekverbreding geeft niet optreden<br />
omdat het eiwit steeds weer terugbeweegt naar de pH waarde van zijn<br />
isoelectrische punt. Deze eigenschap, het concentreren van de moleculen<br />
is uniek voor het isoelectrisch focusseren. De stabiele pH gradiënt in de gel<br />
wordt gevormd door speciale buffers aan de gel toe te voegen, de zogenaamde<br />
amfolieten. Dit zijn alifatische polyamino-polycarboxyl zuren.<br />
Tijdens de electroforese treden er bij de electroden<br />
redoxreacties op. Bij de anode (+ pool) is dit de oxidatie<br />
van H 2 O. De anode wordt zuur. Bij de kathode<br />
(- pool) vindt reductie van H + plaats. De kathode<br />
wordt dus basisch. Deze pH gradiënt zet zich ook in de<br />
gel voort als deze niet sterk gebufferd wordt. Geladen<br />
moleculen (waaronder eiwitten en amfolieten) gaan onder invloed van het<br />
electrisch veld door de gel migreren. De eiwitten vanaf de plaats waar ze zijn<br />
opgebracht en de amfolieten door de gehele gel. De amfolieten bereiken<br />
hun pI veel sneller dan eiwitten omdat de amfolieten die veel kleiner zijn<br />
dan eiwitten sneller diffunderen. Ook kan men voordat de eiwitten opgebracht<br />
worden, de gel met amfolieten prefocusseren. Gezien hun amfolitisch<br />
karakter bufferen de amfolieten de pH lokaal en houden hiermee de door de<br />
electrode reacties veroorzaakte pH gradiënt in stand.<br />
2- Dimensionale electroforese<br />
De combinatie van isoelectrisch focusseren van eiwitten en SDS-PAGE in een<br />
richting loodrecht op de richting van het isoelectrisch focusseren, noemt<br />
men 2-dimensionale electroforese. Het oplossend vermogen van de combinatie<br />
van deze twee electroforese technieken is zeer groot.<br />
Isoenzymen (<strong>Biochemistry</strong> 6de editie p. 283; 5de editie p. 274 - 275)<br />
Isoenzymen zijn enzymen die verschillen in hun aminozuurvolgorde maar<br />
die wel dezelfde reactie katalyseren. Meestal hebben de isoenzymen verschillende<br />
katalytische eigenschappen zoals verschillen in de KM waarde of<br />
wordt de activiteit op een verschillende manier gereguleerd. Isoenzymen<br />
worden altijd door verschillende genloci gecodeerd. Men neemt aan dat<br />
isoenzymen zijn ontstaan door genduplicatie gevolgd door gendivergentie.<br />
Wanneer een enzym op een zelfde locus op een chromosoom verschilt van<br />
het enzym op het complementaire chromosoom dan spreekt men niet van<br />
isoenzymen maar van genetische verschillen per individu. Bovendien kan<br />
het zo zijn dat er expressie vanaf beide allelen plaatsvindt in heterozygoten.<br />
In dit experiment wordt het isoenzympatroon van fosfoglucomutase be-<br />
- 53 -