21.09.2013 Views

Basispracticum Biologische Chemie - Biochemistry

Basispracticum Biologische Chemie - Biochemistry

Basispracticum Biologische Chemie - Biochemistry

SHOW MORE
SHOW LESS

Create successful ePaper yourself

Turn your PDF publications into a flip-book with our unique Google optimized e-Paper software.

den worden. Dit is als volgt in te zien. De nettolading van een eiwit is net als<br />

dat van de aminozuren waaruit een eiwit is opgebouwd afhankelijk van de<br />

pH. Bij een lage pH zal een eiwit een positieve lading hebben, bij een hoge<br />

pH een negatieve lading. Ergens tussen beide extremen in zal de nettolading<br />

nul zijn. De pH waarbij dit het geval is, noemt men de pI, het isoelectrisch<br />

punt van het eiwit.<br />

In een electrisch veld zal een eiwit afhankelijk van zijn nettolading in de<br />

richting van de anode (+ pool) of in de richting van de kathode (- pool)<br />

bewegen. Wanneer het eiwit in een gel met een pH gradiënt beweegt, zal<br />

de lading van het eiwit met de veranderende pH afnemen. Het eiwit blijft<br />

bewegen totdat het eiwit bij zijn pI waarde is aangekomen en geen nettolading<br />

meer heeft. Zolang de pH gradiënt in de gel stabiel is zal de diffusie die<br />

bij andere chromatografische technieken piekverbreding geeft niet optreden<br />

omdat het eiwit steeds weer terugbeweegt naar de pH waarde van zijn<br />

isoelectrische punt. Deze eigenschap, het concentreren van de moleculen<br />

is uniek voor het isoelectrisch focusseren. De stabiele pH gradiënt in de gel<br />

wordt gevormd door speciale buffers aan de gel toe te voegen, de zogenaamde<br />

amfolieten. Dit zijn alifatische polyamino-polycarboxyl zuren.<br />

Tijdens de electroforese treden er bij de electroden<br />

redoxreacties op. Bij de anode (+ pool) is dit de oxidatie<br />

van H 2 O. De anode wordt zuur. Bij de kathode<br />

(- pool) vindt reductie van H + plaats. De kathode<br />

wordt dus basisch. Deze pH gradiënt zet zich ook in de<br />

gel voort als deze niet sterk gebufferd wordt. Geladen<br />

moleculen (waaronder eiwitten en amfolieten) gaan onder invloed van het<br />

electrisch veld door de gel migreren. De eiwitten vanaf de plaats waar ze zijn<br />

opgebracht en de amfolieten door de gehele gel. De amfolieten bereiken<br />

hun pI veel sneller dan eiwitten omdat de amfolieten die veel kleiner zijn<br />

dan eiwitten sneller diffunderen. Ook kan men voordat de eiwitten opgebracht<br />

worden, de gel met amfolieten prefocusseren. Gezien hun amfolitisch<br />

karakter bufferen de amfolieten de pH lokaal en houden hiermee de door de<br />

electrode reacties veroorzaakte pH gradiënt in stand.<br />

2- Dimensionale electroforese<br />

De combinatie van isoelectrisch focusseren van eiwitten en SDS-PAGE in een<br />

richting loodrecht op de richting van het isoelectrisch focusseren, noemt<br />

men 2-dimensionale electroforese. Het oplossend vermogen van de combinatie<br />

van deze twee electroforese technieken is zeer groot.<br />

Isoenzymen (<strong>Biochemistry</strong> 6de editie p. 283; 5de editie p. 274 - 275)<br />

Isoenzymen zijn enzymen die verschillen in hun aminozuurvolgorde maar<br />

die wel dezelfde reactie katalyseren. Meestal hebben de isoenzymen verschillende<br />

katalytische eigenschappen zoals verschillen in de KM waarde of<br />

wordt de activiteit op een verschillende manier gereguleerd. Isoenzymen<br />

worden altijd door verschillende genloci gecodeerd. Men neemt aan dat<br />

isoenzymen zijn ontstaan door genduplicatie gevolgd door gendivergentie.<br />

Wanneer een enzym op een zelfde locus op een chromosoom verschilt van<br />

het enzym op het complementaire chromosoom dan spreekt men niet van<br />

isoenzymen maar van genetische verschillen per individu. Bovendien kan<br />

het zo zijn dat er expressie vanaf beide allelen plaatsvindt in heterozygoten.<br />

In dit experiment wordt het isoenzympatroon van fosfoglucomutase be-<br />

- 53 -

Hooray! Your file is uploaded and ready to be published.

Saved successfully!

Ooh no, something went wrong!