Basispracticum Biologische Chemie - Biochemistry

INLEIDING
Opzet van het practicum
Het practicum bestaat uit twee delen: een theoretisch en een praktisch deel.
De theorie is toegespitst op de uit te voeren experimenten en zal in een serie
colleges behandeld worden. Naast de colleges is de theorie opgenomen in
de handleiding en soms wordt voor extra informatie verwezen naar het boek
Biochemistry.
Het praktisch deel omvat het uitvoeren van de experimenten, het (foutloos)
uitrekenen van de verkregen resultaten en en het schrijven van een verslag.
In het verslag moeten de in de handleiding gestelde vragen worden beantwoord.
De verslagen worden mits tijdig ingeleverd nagekeken en teruggegeven
zodat men goed voorbereid aan de toets kan deelnemen. Deze wordt
in de examenweek afgenomen. In deze toets zal de kennis over de in het
verslag beantwoorde vragen en het foutloos kunnen uitrekenen van experimenten
zoals ze tijdens het practicum zijn geoefend worden getest. Voorbeeldtoetsen
zijn te vinden op het Internet (biochemistry.wur.nl/pbc/index.
html).
Het Biochemisch deel van dit practicum zal worden beoordeeld aan de hand
van het verslag (deze beoordeling bepaalt het eindcijfer voor 2/3) en het resultaat
van de toets (bepaalt het eindcijfer voor 1/3). Wel is het zo dat er voor
de twee toetsen van dit vak (de biochemie- en moleculaire biologie-toets)
een bodemcijfer geldt, namelijk een 5.5!
De cijfers voor het biochemie- en het moleculair biologische deel van dit
practicum bepalen elk de helft van het eindcijfer.
Inhoud van het practicum
Tijdens dit practicum zal ervaring worden opgedaan met enige, veel gebruikte
biochemische technieken en analysemethoden en de daarbij noodzakelijke
apparatuur. Bij de keuze van de experimenten is zoveel mogelijk
geprobeerd een breed scala van experimenten aan te bieden in een vorm
zoals je ze in andere niet-biochemische disciplines kunt tegenkomen. De
technieken die je tijdens het practicum gaat oefenen en de apparatuur die je
daarbij moet bedienen zijn de volgende:
- enzymactiviteitsmetingen en kwantitatieve bepalingen met behulp van
enzymen
- spectrofotometrie en fluorimetrie
- het bepalen van de specifieke activiteit van een enzym in transgene plant
- polarografische zuurstofmetingen
- computer graphics
- isoelectrisch focusseren gevolgd door een enzymactiviteitsmeting in de
gel.
- oefenen in het opzetten en in silico uitvoeren van een kwantitatieve immunologische
bepaling en het volgen van een protocol van een immunoprecipitatie
en identificatie van polypeptideketens met massaspectroscopie
en een databasezoekactie.
Verslag
Het verslag dient te worden gemaakt om de assistent de mogelijkheid te
geven te beoordelen hoe je het experiment heeft uitgevoerd en of je in staat
- -