Basispracticum Biologische Chemie - Biochemistry
Basispracticum Biologische Chemie - Biochemistry Basispracticum Biologische Chemie - Biochemistry
Op de voorkant staat de kristalstructuur van het transacetylase enzym van het pyruvaat dehydrogenase complex uit de bacterie Azotobacter vinelandii. Het transacetylase enzymcomplex vormt de basis voor het pyruvaat dehydrogenase multienzymcomplex. Het multienzymcomplex bestaat uit het pyruvaat dehydrogenase, het dihydrolipoyl transacetylase en het dihydrolipoyl dehydrogenase. De structurele integratie van drie verschillende enzymen maakt een gecoördineerde katalyse van een complexe reactie mogelijk. De tweede afbeelding is de structuur van het Catabolite gene Activator Protein (CAP) uit E. coli gebonden aan DNA. Door de binding wordt de DNA helix ongeveer 90 graden gebogen. Het eiwit heeft via twee helix-loop-helix motieven sterke interacties met het DNA via de ‘major grooves’ van de DNA dubbel helix. Twee 43 graden knikken zorgen ervoor dat de normaal rechte DNA helix-as ongeveer 90 graden wordt gebogen. Hierdoor wordt RNA polymerase sterker aan de promotor plaats gebonden en wordt gen expressie gestimuleerd.
INHOUD In de colleges wordt de theoretische achtergrond van de experimenten toegelicht, worden de experimenten besproken en in een kader geplaatst. In de practicumhandleiding is elk experiment voorzien van een inleiding en eventueel een stuk theorie. Vervolgens wordt het experimentele deel beschreven. De handouts van de PowerPoint presentaties zijn aan het eind van de handleiding toegevoegd. Inleiding 2 Blok 1: in silico experimenten Overzicht 5 - Immunoprecipitatie en proteomics (IP) 5 - Enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) 8 - β-Glucuronidase als reporterenzym voor genexpressie (GUS) 11 Verslag over de experimenten van blok 1 15 Blok 2: gebruik van (spectroscopische) technieken om biochemische systemen te bestuderen Overzicht 17 Theoriedeel absorptie en fluorescentie 17 Experimenteel deel (In vivo) fluorescentie (IVF) 25 Het werkingsmechanisme van lactaat dehydrogenase 53 Metingen aan lactaatdehydrogenase (LDH-1) 32 Het uitwerken van het LDH experiment (LDH-2) 35 Computer Graphics van LDH (LDH-3) 38 Verslag over de experimenten blok 2 44 Blok 3: kwantitatieve analyses met behulp van enzymen Overzicht 45 Urinezuurbepaling (UZ) 46 Klinische enzymactiviteitsmetingen (KE) 50 Electroforese 52 Isoelectrisch focusseren met het Pharmacia PhastSystem (IEF) 55 Verslag over de experimenten blok 3 57 Handouts PowerPoints College - -
- Page 1: Basispracticum Biologische Chemie B
- Page 5 and 6: ent het experiment foutloos uit te
- Page 7 and 8: GLOBAAL OVERZICHT OVER DE EXPERIMEN
- Page 9 and 10: Gegevens en rekenvoorbeelden Het mo
- Page 11 and 12: worden gebracht. Een methode is de
- Page 13 and 14: Vuistregels Begin met het gebruiken
- Page 15 and 16: De reactievergelijking is: MUG + H
- Page 17 and 18: Meten onder v MAX condities De Mich
- Page 19 and 20: Figuur 2.1 Quantum-mechanische voor
- Page 21 and 22: Het restant licht valt op de fotomu
- Page 23 and 24: Figuur 2.3 Een schematische voorste
- Page 25 and 26: tage van de intensiteit van de lich
- Page 27 and 28: Figuur 2.5 Links staat het absorpti
- Page 29 and 30: wordt het signaal dat afkomstig is
- Page 31 and 32: het sequencen van DNA de aminozuurv
- Page 33 and 34: Tabel 2.1 Effect van plaatsgerichte
- Page 35 and 36: • Meet de absorptie gedurende ong
- Page 37 and 38: Computer gegenereerde getallen (mL
- Page 39 and 40: Gebruik voor de berekening van de d
- Page 41 and 42: - Het werken met het Control panel:
- Page 43 and 44: OPDRACHTEN EN VRAGEN CG EXPERIMENT
- Page 45 and 46: Figuur 2.8 De overgangstoestand voo
- Page 47 and 48: Figuur 3.1 Kristallen van natriumur
- Page 49 and 50: Figuur 3.4 De electrode reacties va
- Page 51 and 52: Figuur 3.7 Structuur van acetylacet
INHOUD<br />
In de colleges wordt de theoretische achtergrond van de experimenten toegelicht, worden de experimenten besproken<br />
en in een kader geplaatst.<br />
In de practicumhandleiding is elk experiment voorzien van een inleiding en eventueel een stuk theorie. Vervolgens<br />
wordt het experimentele deel beschreven. De handouts van de PowerPoint presentaties zijn aan het eind van de<br />
handleiding toegevoegd.<br />
Inleiding 2<br />
Blok 1: in silico experimenten<br />
Overzicht 5<br />
- Immunoprecipitatie en proteomics (IP) 5<br />
- Enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) 8<br />
- β-Glucuronidase als reporterenzym voor genexpressie (GUS) 11<br />
Verslag over de experimenten van blok 1 15<br />
Blok 2: gebruik van (spectroscopische) technieken om biochemische systemen te bestuderen<br />
Overzicht 17<br />
Theoriedeel absorptie en fluorescentie 17<br />
Experimenteel deel<br />
(In vivo) fluorescentie (IVF) 25<br />
Het werkingsmechanisme van lactaat dehydrogenase 53<br />
Metingen aan lactaatdehydrogenase (LDH-1) 32<br />
Het uitwerken van het LDH experiment (LDH-2) 35<br />
Computer Graphics van LDH (LDH-3) 38<br />
Verslag over de experimenten blok 2 44<br />
Blok 3: kwantitatieve analyses met behulp van enzymen<br />
Overzicht 45<br />
Urinezuurbepaling (UZ) 46<br />
Klinische enzymactiviteitsmetingen (KE) 50<br />
Electroforese 52<br />
Isoelectrisch focusseren met het Pharmacia PhastSystem (IEF) 55<br />
Verslag over de experimenten blok 3 57<br />
Handouts PowerPoints College<br />
- -
Change language