108 第五章 图库 放,若为TRUE,则x、y和z都会被缩放到[0, 1]范围内,若为FALSE,那么 所有坐标轴都按照数据的原始量纲处理,这样可以得到数据的真实比例; expand为z轴的缩放因子,它决定了z轴的长短;col为组成曲面的所有小方 块的颜色;border为组成曲面的小方块的边框样式,设置为NA可以去掉边 框;ltheta和lphi设置透视图的光源位置;shade决定的阴影效果;box为逻辑 值,设定透视图是否需要画外框;axes决定是否画坐标轴;nticks为坐标轴 刻度线的数目;ticktype设定坐标轴刻度类型,取值’simple’则简单画箭头 表示坐标轴,’detailed’则将详细的刻度标记在坐标轴上。 图5.24为我们展示了新西兰Maunga Whau火山的“真面目”,读者不 妨将这幅立体图形与前面章节中的等高图(图5.17)和颜色图(图5.20)对 应起来并分别体会等高图和颜色图是怎样展示三维数据的。 grDevices包提供了一个相关的三维透视图转换函数trans3d(),它可 以将一个空间的点的三维坐标根据透视图的特征转换为平面坐标,这样 我们就可以很方便地使用一般的底层作图函数向立体图中添加图形元素。 图5.25就是这样的一个例子,读者可以参考persp()帮助文件中的示例。 最后,我们介绍另一个专门的三维图形包:scatterplot3d (Ligges and Mächler, 2003),这个包提供了更方便且美观的作图函数scatterplot3d(); 在lattice包(Sarkar, 2010)中也有三维图形函数cloud()和wireframe();此外, rgl包(Adler and Murdoch, 2010)也不失为一个非常便利的三维数据探索工 具,它基于OpenGL系统写成,最大的优势在于它生成的三维图形可以通 过鼠标交互操作,例如拖拽旋转等,立体效果非常逼真,限于rgl的系统比 较庞大,这里我们就不详细介绍了。 5.19 因素效应图 方差分析是很常见的统计模型,它的目的是比较不同组别之间的因变 量均值是否有显著差异,因素效应图所展现的就是各种分组条件下因变量 的水平,这里的水平可以由任何统计函数定义,例如均值、中位数等。 R中因素效应图的函数为plot.design(),其用法如下: 1 > usage(plot.design) plot.design(x, y = NULL, fun = mean, data = NULL, ..., ylim = NULL, xlab = "Factors", ylab = NULL, main = NULL, ask = NULL, xaxt = par("xaxt"), axes = TRUE, xtick = FALSE)
5.19 因素效应图 109 1 > plot.design(warpbreaks, col = "blue") mean of breaks 25 30 35 A B Factors L M H wool tension 图 5.26: 经纱断裂数据的因素效应图:每种羊毛(A、B)和拉力强度(L、 M、H)下断裂数目的均值。 x为包含自变量(分类变量)的数据框,它也可以包含因变量,这种情 况下第二个参数就不必提供了;y为因变量;fun为计算因变量水平的函数; data为所有数据,包含自变量和因变量,当参数x为一个公式时,则会用到 本参数提取数值,否则不必提供本参数;其它参数用于调整图形外观或设 置图形标题、标记等,此处略去。 我们以经纱断裂数据warpbreaks为例,这个数据包含三个变量:经 纱断裂数目breaks、羊毛种类wool(A、B两种)和拉力强度tension(L、 M、H三种强度)。我们可以通过因素效应图看羊毛种类和拉力强度两个变 量分别对经纱断裂根数的影响,如图5.26。图中的刻度线展示出了不同羊毛 种类和拉力强度下断裂根数的均值。我们也可以通过方差分析模型进一步 看这两种因素的影响: 1 > summary(aov(breaks ~ wool + tension, data = warpbreaks)) Df Sum Sq Mean Sq F value Pr(>F) wool 1 451 451 3.34 0.0736 . tension 2 2034 1017 7.54 0.0014 ** Residuals 50 6748 135 --- Signif. codes: 0 *** 0.001 ** 0.01 * 0.05 . 0.1 1
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现代统计图形 谢益辉 2010
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• 自由软件用户往往有某
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目录 序言 i 代序一 . . . . .
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5.25 向日葵散点图 . . . . . .
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附录 B 作图技巧 163 B.1 添
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5.4 泊松分布随机数茎叶图
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表格 5.1 二维列联表的经典
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序言 代序一 代序二 作者
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Coefficients: Estimate Std. Error t
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2 第一章 历史 图 1.1: Playfai
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6 第一章 历史 图 1.4: 南丁
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8 第一章 历史 图 1.5: Minard
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10 第一章 历史 总的说来,
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12 第二章 工具 大小,如条
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18 第二章 工具 其实没有必
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20 第二章 工具
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22 第三章 细节 3.1 par()函数
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24 第三章 细节 1:10 2 4 6 8 10
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26 第三章 细节 las 坐标轴
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30 第三章 细节 3.2 plot()及
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32 第三章 细节 xlim, ylim 设
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34 第四章 元素 4.1 颜色 默
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36 第四章 元素 4.1.2 颜色生
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40 第四章 元素 每一类调色
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46 第四章 元素 图2.1已经使
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56 第四章 元素 1 > data(Export
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- Page 94: 74 第五章 图库 1 > library(MSG
- Page 97 and 98: 5.7 条件密度图 77 R中关联
- Page 99 and 100: 5.7 条件密度图 79 小到大在
- Page 101 and 102: 5.8 等高图 81 1 > data(ChinaLife
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- Page 105 and 106: 5.9 条件分割图 85 1 > par(mar
- Page 107 and 108: 5.10 一元函数曲线图 87 1 > c
- Page 109 and 110: 5.12 颜色等高图 89 1 > dotchar
- Page 111 and 112: 5.13 四瓣图 91 finite = TRUE), y
- Page 113 and 114: 5.13 四瓣图 93 表 5.1: 二维
- Page 115 and 116: 5.14 颜色图 95 C和E系的优比
- Page 117 and 118: 5.14 颜色图 97 1 > par(mar = rep
- Page 119 and 120: 5.15 矩阵图 99 1 > sines = outer
- Page 121 and 122: 5.16 马赛克图 101 1 > ftable(Ti
- Page 123 and 124: 5.17 散点图矩阵 103 较低。
- Page 125 and 126: 5.18 三维透视图 105 倍数;fon
- Page 127: 5.18 三维透视图 107 Sinc( r )
- Page 131 and 132: 5.21 平滑散点图 111 1 > par(ma
- Page 133 and 134: 5.22 棘状图 113 可将图5.28放
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- Page 137 and 138: 5.23 星状图 117 1 > # 预设调
- Page 139 and 140: 5.24 带状图 119 1 > layout(matri
- Page 141 and 142: 5.25 向日葵散点图 121 1 > sun
- Page 143 and 144: 5.26 符号图 123 1 > par(mar = c(
- Page 145: 5.27 饼图 125 增长率 总人口
- Page 148 and 149: 128 第五章 图库 种以比例
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