12.07.2015 Views

SodininkyStĖ ir darŽininkyStĖ 27(3)

SodininkyStĖ ir darŽininkyStĖ 27(3)

SodininkyStĖ ir darŽininkyStĖ 27(3)

SHOW MORE
SHOW LESS
  • No tags were found...

You also want an ePaper? Increase the reach of your titles

YUMPU automatically turns print PDFs into web optimized ePapers that Google loves.

obels genų ar jų fragmentų (Sansavini <strong>ir</strong> kt., 2004). Žinomos DNR sekos sudarogalimybę kurti funkcinius žymenis. Tokie žymenys vertinami taikant ASPS (apibrėžtossekos pagausinta sritis; angl. SCAR – sequence-characterized amplified region),SPPS (suskaidytos pagausintos polimorfiškos sekos; angl. CAPS – cleaved amplifiedpolymorphic sequences), VGKP (vienos grandinės konformacijos polimorfizmas;angl. SSCP – single stand conformation polymorphism) <strong>ir</strong> VNP (vieno nukleotidopolimorfizmas; angl. SNP – single nucleotide polymorphism) metodus, kurie suteikiagalimybę analizuoti konkrečių DNR sekos nukleotidų polimorfizmą <strong>ir</strong> susieti tai sugeno funkcija (de Vienne <strong>ir</strong> kt., 2003). Kadangi koduojančios genų sekos tiesiogiaisąlygoja fenotipą, todėl funkcinių žymenų alelių įva<strong>ir</strong>ovė atspindi fenotipų įva<strong>ir</strong>ovę.Tuo tarpu PSP (paprastų sekų pasikartojimo; angl. SSR – simple sequence repeat),PFIP (pagausintų fragmentų ilgio polimorfizmas; angl. AFLP – amplified fragmentlength polymorphism) <strong>ir</strong> kiti visame genome pasklidę žymenys leidžia kurti visą genomąapimančius genetinius žemėlapius. Europoje obels genomo genetinis žemėlapisbuvo sudarytas vykdant EAGMAP projektą (King, 1996), kai ‘Prima’ × ‘Fiesta’ p<strong>ir</strong>moskartos palikuonių genotipai buvo analizuoti RFIP (restrikcijos fragmentų ilgio polimorfizmas;angl. RFLP – restriction fragment lenght polimorphism), APPD (atsitiktinaipagausinta polimorfiška DNR; angl. RAPD – randomly amplified polymorphic DNA),izofermentų, PFIP, ASPS <strong>ir</strong> PSP žymenų metodais. Nustatyta 17 genetinių grupių,atstovaujančių 17-kai haploidinių obels chromosomų (Maliepaard <strong>ir</strong> kt., 1998). Daugmolekulinių žymenų sukurta vykdant DARE projektą (Lespinasse <strong>ir</strong> kt., 2000). NaujųPFIP <strong>ir</strong> mikrosatelitų žymenų panaudojimas gerokai patikslino genetinį žemėlapį.Vėliau buvo sukurtas obels paprastų sekų pasikartojimo (PSP; angl. SSR simple sequencerepeat) žymenų prisotintas molekulinis žemėlapis (Liebhard <strong>ir</strong> kt., 2002), kurisbuvo panaudotas identifikuoti genomo sritis, lemiančias kiekybinius požymius, kaip,pavyzdžiui, poligeninį atsparumą rauplėms (Liebhard <strong>ir</strong> kt., 2003). Tokie žemėlapiai,siejantys molekulinius žymenis su atsparumo požymiais, yra naudojami atliekantankstyvą hibridų atranką atsparumo ligoms selekcijos programose. Efektyvus žymuoturi būti labai arti prie t<strong>ir</strong>iamą požymį sąlygojančio geno, kad rekombinacija neįvyktųnet <strong>ir</strong> vertinant labai didelį palikuonių skaičių.Sukurta daug žymenų, sk<strong>ir</strong>tų identifikuoti monogeninio atsparumo požymius.APPD žymenys sukurti Va, Vb, (Hemmat <strong>ir</strong> kt., 2003), Vbj (Gygax <strong>ir</strong> kt., 2004), Vd(Tartarani <strong>ir</strong> kt., 2004), Vf (Tartarini, 1996), Vr2 (Patocchi <strong>ir</strong> kt., 2004) atsparumopožymiams. RFIP <strong>ir</strong> PFIP žymenys sukurti Vg (Durel <strong>ir</strong> kt., 2000) <strong>ir</strong> Vr2 (Patocchi<strong>ir</strong> kt., 2004) atsparumui. Mikrosatelitų žymenys susieti su Vbj (Gygax <strong>ir</strong> kt., 2004), Vf(Vinatzer <strong>ir</strong> kt., 2004), Vg (Durel <strong>ir</strong> kt., 2000), Vr-A/Vh2 bei Vx/Vh4/Vr1 (Bus <strong>ir</strong> kt.,2005 b), Vr2 (Patocchi <strong>ir</strong> kt., 2004), Vm (Patocchi <strong>ir</strong> kt., 2005), VT57 (Bus <strong>ir</strong> kt., 2005 b)genais. Sukurti ASPS žymenys Vbj (Gygax <strong>ir</strong> kt., 2004), Vd (Tartarani <strong>ir</strong> kt., 2004),Vf (Tartarini <strong>ir</strong> kt., 1999), Vr-A/Vh2 bei Vx/Vh4/Vr1 (Bus <strong>ir</strong> kt., 2005 b), Vm (Cheng<strong>ir</strong> kt., 1998) genams. SPPS žymenys sukurti Vf genui (Gianfranceschi <strong>ir</strong> kt., 1996).Izofermentų žymenys buvo panaudoti Va atsparumo požymio tyrimuose (Pancardi<strong>ir</strong> kt., 1995).Siekiant sukurti obelis, kuo atsparesnes ligoms, pasaulyje panaudojamos <strong>ir</strong> genųinžinerijos technologijos. Tokių tyrimų tikslas gali būti dvejopas. Vienu atveju genųinžinerija panaudojama kaip kryptingas <strong>ir</strong> greitas metodas obelų atsparumo genams68

Hooray! Your file is uploaded and ready to be published.

Saved successfully!

Ooh no, something went wrong!