PowerPoint 演示文稿 - abc
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马 Tetherin 蛋 白 的 结 构 预 测<br />
The structural prediction of equine Tetherin protein<br />
组 号 : 09<br />
汇 报 人 : 苏 朝<br />
组 长 : 蒋 露<br />
组 员 : 王 德 丽 、 孙 建 慧<br />
苏 朝
背 景<br />
• 人 Tetherin 蛋 白 是 一 种 细 胞 跨 膜 蛋 白 , 具 有 4 个<br />
结 构 域 : 胞 内 区 、 跨 膜 区 、 胞 外 区 、GPI 区 。<br />
• 人 Tetherin 蛋 白 具 有 抑 制 HIV 释 放 的 作 用 , 但 其<br />
具 体 作 用 机 理 尚 不 清 楚 。<br />
• 与 HIV 同 属 于 慢 病 毒 的 马 传 染 性 贫 血 病 毒<br />
(EIAV) 是 最 简 单 的 慢 病 毒 , 常 常 作 为 研 究<br />
HIV 的 模 型 。<br />
• 在 实 验 室 里 分 离 出 与 人 Tetherin 蛋 白 类 似 的 一<br />
种 蛋 白 , 命 名 为 马 Tetherin 蛋 白 , 同 样 具 有 抑<br />
制 EIAV 释 放 的 作 用 ( 数 据 未 发 表 )。
人 Tetherin 蛋 白 的 结 构
目 的<br />
人 Tetherin<br />
抑 制<br />
HIV<br />
预 测<br />
提 供 模 型<br />
马 Tetherin<br />
抑 制<br />
EIAV
在 Uniprot 搜 索 Tetherin
Identical positions Identity Similar positions<br />
54 28.723% 53<br />
人 、 大 鼠 、 小 鼠 Tetherin 氨 基 酸 序 列 分 析 显 示 ,<br />
它 们 的 氨 基 酸 序 列 相 似 性 很 低
糖 基 化 位 点<br />
跨 膜 区 域<br />
半 胱 氨 酸<br />
前 肽
卷 曲 螺 旋<br />
结 果 显 示 : 人 、 大 鼠 、 小 鼠 Tetherin 具 有 相 似<br />
的 结 构 , 半 胱 氨 酸 、 糖 基 化 位 点 高 度 保 守 , 具<br />
有 类 似 的 前 肽 和 跨 膜 区 域 。
Identical positions Identity Similar positions<br />
24 12.435% 43<br />
结 果 显 示 : 各 个 物 种 的 Tetherin 氨 基 酸 序 列 相 似<br />
性 很 低<br />
结 论 :Tetherin 蛋 白 发 挥 作 用 可 能 与 序 列 无 关 而<br />
与 它 特 定 的 结 构 有 密 切 关 系
使 用 needle 对 比 马 、 小 鼠 、 大 鼠 、 人<br />
Rat 和 equine<br />
的 氨 基 酸 序 列<br />
Mouse 和 equine<br />
Human 和 equine
用 MEGA5 对 比 马 、 人 、 小 鼠 、 大 鼠 tetherin<br />
蛋 白 的 糖 基 化 位 点 和 半 胱 氨 酸 位 点
CBS 网 站 TMHMM 预 测 跨 膜 区 域<br />
马<br />
人<br />
小 鼠<br />
大 鼠
Tmap 跨 膜 区 域 预 测<br />
马<br />
人<br />
小 鼠<br />
大 鼠
ExPSy 网 站 的 protscal 预 测<br />
马<br />
人<br />
小 鼠<br />
大 鼠
马<br />
人<br />
小 鼠<br />
大 鼠
结 果 与 结 论<br />
• 结 果 : 马 Tetherin 氨 基 酸 序 列 与 马 、 人 、 小<br />
鼠 、 大 鼠 的 Tetherin 序 列 具 有 较 低 的 相 似 性 ,<br />
但 跨 膜 区 域 结 构 类 似 。<br />
• 结 论 : 马 Tetherin 蛋 白 有 可 能 具 有 与 人<br />
Tetherin 蛋 白 类 似 的 结 构 , 其 发 挥 功 能 的 作<br />
用 机 理 可 能 与 人 Tetherin 蛋 白 发 挥 作 用 机 理<br />
类 似 。 这 样 可 以 通 过 研 究 马 Tetherin 蛋 白 与<br />
EIAV 的 作 用 机 理 为 研 究 人 Tetherin 蛋 白 与 HIV<br />
提 供 参 考 模 型 。
谢 谢 指 导