scienze della vita roma, 22-23 ottobre 2012 - SIF
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Linea di ricerca 2 - messa a punto di devices per l'analisi rapida di provenienza e salubrità del pescato<br />
In questa linea di ricerca ci siamo interessati <strong>della</strong> ricerca di marcatori molecolari di specie e di popolazione<br />
sufficientemente corti da poter essere in seguito implementati su sistemi miniaturizzati e portatili. La nostra ricerca si è<br />
rivolta allo studio <strong>della</strong> specie Xiphias gladius (pesce spada). Abbiamo studiato le relazioni filogenetiche tra popolazioni<br />
di questo pesce catturate in aree diverse (Mediterraneo, Atlantico, Indo-Pacifico). La costruzione di alberi basati su<br />
aplotipi ha reso semplice ed immediato il riconoscimento <strong>della</strong> provenienza geografica, oltre che <strong>della</strong> specie, per<br />
campioni incogniti. Il nostro studio ha quindi avuto riscontri ed apprezzamenti anche nel pubblico non-scientifico. Ci<br />
proponiamo per il futuro di allargare le nostre investigazioni ad altre specie di interesse commerciale e a monitorare altri<br />
parametri di salubrità quali contaminanti ed interferenti endocrini. Lo scopo finale sarà quello di rendere disponibile al<br />
pubblico e alle autorità di controllo sistemi automatizzati in grado di effettuare queste analisi.<br />
PUBBLICAZIONI PIÙ SIGNIFICATIVE NEL PERIODO 2010-<strong>2012</strong> (asteriscate le pubblicazioni che riportano l'affiliazione<br />
all'INBB)<br />
1) AM. Amorini, M. Tuttobene, F.M. Tomasello, F. Biazzo, S. Gullotta, V. De Pinto, G. Lazzarino, B. Tavazzi.<br />
Glucose ameliorates the metabolic profile and mitochondrial function of platelet concentrates during storage in<br />
autologous plasma (<strong>2012</strong>) Blood Transfusion, 13, 1-10<br />
*2) A. Messina, S.Reina, F. Guarino and V. De Pinto VDAC isoforms from mammals (<strong>2012</strong>) Biochim Biophys Acta,<br />
1818, 1466-1476<br />
*3) D. De Stefani, A.Bononi, A. Romagnoli, A. Messina, V. De Pinto, P. Pinton and R. Rizzuto VDAC1 selectively<br />
transfers apoptotic Ca(2+) signals to mitochondria (<strong>2012</strong>) Cell Death and Differentiation 19, 267-273<br />
*4) A.M. Pappalardo, F. Guarino, S. Reina, A. Messina and V. De Pinto Geographically widespread swordfish<br />
barcode stock identification: a case study of its application (2011) PLOS ONE 6, 10: e25516<br />
*5) M. Lolicato, S. Reina, A. Messina, F. Guarino, M. Winterhalter, R. Benz and V. De Pinto Generation of<br />
artificial channels by multimerization of β-strands from natural porin. (2011) Biol. Chem. 392, 617-24<br />
*6) V. De Pinto, S. Reina, F. Tomasello, F. Guarino, A. Messina Investigations on N-Terminal Chimeras of VDAC<br />
Isoforms (2011) Bioph. J. 100, S. 1, 250a-251a<br />
*7) S. Reina, V. Palermo, A. Guarnera, F. Guarino, A. Messina, C. Mazzoni, V. De Pinto. Swapping of the Nterminus<br />
of VDAC1 with VDAC3 restores full activity of the channel and confers anti-aging features to the cell.<br />
FEBS Letters (2010) 584, 2837-44<br />
*8) V. Shoshan-Barmatz, V. De Pinto, M. Zweckstetter, Z. Raviv, N. Keinan, N. Arbel. VDAC, a multi-functional<br />
mitochondrial protein regulating cell life and death. (2010) Mol. Aspects Med. 31, <strong>22</strong>7-85<br />
*9) V. De Pinto, A. Messina, D.J. Lane, A. Lawen. Voltage-dependent anion-selective channel (VDAC) in the<br />
plasma membrane. (2010) FEBS Lett. 584, 1793-9<br />
*10) V. De Pinto, S. Reina, A. Guarnera, F. M. Tomasello, F. Guarino, A. Messina. Role of the N-terminal moiety in<br />
VDAC isoforms (2010) Bioph. J. 98, 3, Supp. 1, 208a<br />
*11) V. De Pinto, F. Guarino, A. Guarnera, A. Messina, S. Reina, F. Tomasello, V. Palermo, C. Mazzoni.<br />
Characterization of human VDAC isoforms: A peculiar function for VDAC3? (2010) Biochim Biophys Acta.<br />
1797, 1268-75<br />
PROSPETTIVE ED OBIETTIVI PER I PROSSIMI TRE ANNI<br />
1) Cristallizzazione e modelling delle isoforme VDAC2 e 3. Studi di docking con farmaci.<br />
2) Coinvolgimento <strong>della</strong> porina mitocondriale VDAC in patologie di interesse metabolico. Questo studio utilizza anche<br />
il lievito S. cerevisiae come sistema modello. In questo studio verranno utilizzate proteine chimeriche basate sui modelli<br />
umani e di esse verrà verificata la funzionalità sulla base di utilizzazione di ceppi di lievito privi delle porine endogene<br />
o di linee cellulari umane opportunamente silenziate o delete dei VDAC endogeni. Le patologie che verranno indagate<br />
sono la SLA, il Parkinson's e alcune forme di tumore linfocitario, in cui VDAC è stato chiamato in causa.<br />
3) Realizzazione di dispositivi biosensoriali o a microchip da poter usare per applicazioni di tracciabilità e<br />
rintracciabilità molecolare di specie e per l'analisi di salubrità alimentare attraverso lo studio di interferenti endocrini<br />
diffusi nell'ambiente marino.<br />
COLLABORAZIONI INTERNAZIONALI IN ATTO<br />
Prof. Mathias Wintherhalter, Jacobs University, Bremen, Germany<br />
Prof. Sebastian Hiller, Biozentrum, Basel University, Germany<br />
Prof. Varda Shoshan-Barmatz, Negev Institute of Technology, Beer Sheva, Israel<br />
PRINCIPALI ATTREZZATURE DI CUI DISPONE L’UNITÀ DI RICERCA<br />
Confocal Microscope Olympus Fluo View 1000 (a disposizione, non di proprietà)<br />
Sistema per elettroforesi bidimensionale Bio-Rad basato su Protean 1000 IEF e vari sistemi di SDS-PAGE.<br />
Real Time PCR Real Plex Eppendorf<br />
Robot per esperimenti di cristalllizzazione<br />
Sistemi biochimici e c<strong>roma</strong>tografici per l'espressione e la purificazione di proteine ricombinanti<br />
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