scienze della vita roma, 22-23 ottobre 2012 - SIF

RESPONSABILE SCIENTIFICO
CORRADINI ROBERTO
UNITA’ DI RICERCA INBB
Parma
LINEA DI RICERCA
Sintesi e funzione biologica di acidi peptido nucleici PNA e loro modificazioni
COMPOSIZIONE DEL GRUPPO
Aderenti INBB
Corradini Roberto PA roberto.corradini@unipr.it
Manicardi Alex
Bertucci Alessandro
BC
DR
92
alex.manicardi@unipr.it
alessandro.bertucci@nemo.unipr.it
SEDE UNITÀ DI RICERCA
Indirizzo Dipartimento di Chimica-Università di Parma- Parco Area delle Scienze 17/A 43124 Parma
Telefono +39-0521-905406
Fax +39-0521-905472
E-mail dip.chimica@unipr.it
SEZIONE INBB DI APPARTENENZA
Milano
RIASSUNTO DELL’ATTIVITÀ SVOLTA NEGLI ULTIMI TRE ANNI
Obiettivi
Sviluppo di nuove strutture di sintesi basate sul modello degli acidi peptido nucleici (PNA) per il riconoscimento
selettivo di sequenze di DNA e RNA a scopo terapeutico e diagnostico. Studio degli aspetti strutturali dei PNA che
conferiscono maggiore affinità o selettività nei confronti degli acidi nucleici.
Risultati ottenuti
Sono stati descritti PNA con modificazioni sul backbone che hanno mostrato proprietà migliorate in termini di affinità e
di selettività. E’ stato elaborato un modello generale che collega la struttura delle modificazioni, in particolare gli aspetti
stereochimici, con le prestazioni nelle interazioni con il DNA. Sono stati inoltre elaborati metodi per la
funzionalizzazione delle nucleobasi. In campo terapeutico sono stati prodotti PNA che si sono rivelati efficaci
nell’inibizione di oncogeni in tumori pediatrici, con efficacia dimostrata in studi preclinici su modelli murini (in
Collaborazione con il gruppo del Prof. Andrea Pession, Università di Bologna). Sono stati messi a punto PNA anti-miR,
curando in particolar modo l’introduzione di gruppi che facilitino la veicolazione cellullare. I PNA prodotti sono stati
utilizzati in colture cellulari e hanno mostrato la capacità di inibire l’azione di miR cinvolti nel differenziamento
cellulare e in patologie tumorali (in collaborazione con il gruppo del Prof. Roberto Gambari, Uiversità di Ferrara).
In campo diagnostico sono state messe a punto metodologie basate su surface palsmon resonance imaging (SPRI) e
nanoparticelle (in collaborazione con il gruppo del Prof. Giuseppe Spoto, Università di Catania) che permettono la
rivelazione diretta di DNA estratto da campioni biologici senza amplificazione mediante PCR. Sempre in campo
diagnostico sono stati prodotti i primi esempi di biosensori basati su fibre ottiche a cristallo fotonico in grado di
riconoscere DNA in maniera altamente selettiva (in Collborazione con il gruppo del Prof. Stefano Selleri, Università di
Parma).
PUBBLICAZIONI PIÙ SIGNIFICATIVE NEL PERIODO 2010-2012
1) E. COSCELLI, M. SOZZI, F. POLI, D.E PASSARO, A. CUCINOTTA, S. SELLERI, R. CORRADINI, R.
MARCHELLI. Towards Highly Specific DNA Biosensor: PNA-Modified Suspended Core Photonic Crystal
Fiber IEEE J Sel Top Quant 2010, 16, 967-972.
2) F. TOTSINGAN, V. JAIN, W. C. BRACKEN, A. FACCINI, T. TEDESCHI, R. MARCHELLI, R. CORRADINI, N.
R. KALLENBACH, M. M. GREEN Conformational Heterogeneity in PNA:PNA Duplexes Macromolecules
2010, 43, 2692–270.
3) R. D’AGATA, R. CORRADINI, C. FERRETTI , L. ZANOLI, M. GATTI, R. MARCHELLI, G. SPOTO
Ultrasensitive detection of non-amplified genomic DNA by nanoparticle-enhanced surface plasmon resonance
imaging Biosensors and Bioelectronics 2010, 25 , 2095–2100.
4) A. CALABRETTA, D. WASSERBERG,, G.A. POSTHUMA-TRUMPIE. ,V. SUBRAMANIAM, A. VAN
AMERONGEN,;R. CORRADINI, T. TEDESCHI, S. SFORZA,; D. N REINHOUDT, R. MARCHELLI, J.
HUSKENS, P. JONKHEIJM. Patterning of Peptide Nucleic Acids Using Reactive Microcontact Printing
Langmuir 2011, 27, 1536-1542.
5) S. SFORZA, R. CORRADINI, T. TEDESCHI, R. MARCHELLI. Food analysis and food authentication by peptide
nucleic acid (PNA)-based technologies Chemical Society Reviews 2011, 40, 221-232.