scienze della vita roma, 22-23 ottobre 2012 - SIF
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RESPONSABILE SCIENTIFICO<br />
CASADIO RITA<br />
LINEA DI RICERCA<br />
Sviluppo di tools per problem solving in Biologia Moderna<br />
UNITA’ DI RICERCA INBB<br />
Bologna<br />
COMPOSIZIONE DEL GRUPPO<br />
Aderenti INBB<br />
Casadio Rita PO * casadio@biocomp.unibo.it<br />
Non Aderenti INBB<br />
Martelli Pier Luigi RU * gigi@biocomp.unibo.it<br />
Fariselli Piero RU * piero@biocomp.unibo.it<br />
Castrense Savojardo DR * savojard@biocomp.unibo.it<br />
Piovesan Damiano DR * piovesan@biocomp.unibo.it<br />
Profiti Giuseppe DR * profgiuseppe@gmail.com<br />
Indio Valentina DR * valentina@biocomp.unibo.it<br />
Tasco Gianluca BC * gluca@biocomp.unibo.it<br />
Rossi Ivan A ivan@biodec.com<br />
Eusebi Alberto A alberto@biodec.com<br />
SEDE UNITÀ DI RICERCA<br />
Indirizzo Via San Giacomo 9/2 – 40126 Bologna<br />
Telefono 051 - 2094005<br />
Fax 051 - 2094005<br />
E-mail casadio@biocomp.unibo.it<br />
SEZIONE INBB DI APPARTENENZA<br />
Bologna<br />
RIASSUNTO DELL’ATTIVITÀ SVOLTA NEGLI ULTIMI TRE ANNI<br />
Obiettivi<br />
Il nostro gruppo di ricerca sviluppa soluzioni computazionali a problemi di rilevanza nell’era genomica e post-genomica<br />
occupandosi principalmente <strong>della</strong> annotazione strutturale e funzionale di geni e proteine e <strong>della</strong> loro interazione. Inoltre<br />
una linea di ricerca specifica è dedicata a stabilire la relazione tra mutazioni e malattie nel genoma umano.<br />
Risultati ottenuti<br />
I principali risultati ottenuti elencano: una banca dati per l'annotazione funzionale e strutturale di proteomi (BAR+), lo<br />
sviluppo ed implementazione di predittori per l'annotazioni di varianti e la loro applicazione per il riconoscimento di<br />
marcatori molecolari di rare forme di cancro(vedi elenco delle pubblicazioni sotto riportato; per l'elenco completo delle<br />
pubblicazioni del periodo in questione vedi www.biocomp.unibo.it/publications.html)<br />
PUBBLICAZIONI PIÙ SIGNIFICATIVE NEL PERIODO 2010-<strong>2012</strong> ((*) affiliazione anche al Consorzio)<br />
1. Martelli PL, Fariselli P, Balzani E, Casadio R -Predicting cancer-associated germline variations in proteins-<br />
BMC Genomics Jun 18;13 Suppl 4:S8 (<strong>2012</strong>) (*)<br />
2. Vaccarelli G, Antonacci R, Tasco G, Yang F, El Ashmaoui HM, Hassanane MS, Massari S, Casadio R,<br />
Ciccarese S. Generation of diversity by somatic mutation in the Camelus dromedarius T-cell receptor gamma (TCRG)<br />
variable domains - Eur J Immunol (<strong>2012</strong>, in press) (*)<br />
3. Martelli PL, Fariselli P, Balzani E, Casadio R -Predicting cancer-associated germline variations in proteins-<br />
BMC Genomics Jun 18;13 Suppl 4:S8 (<strong>2012</strong>) (*)<br />
4. Squerzanti M, Cervellati C, Ura B, Mischiati C, Pucci P, Annunziata S, Iannone C, Casadio R, Bergamini CM,<br />
Esposito C -The side chain of glutamine 13 is the acyl-donor amino acid modified by type 2 transglutaminase in subunit<br />
T of the native rabbit skeletal muscle troponin complex- Amino Acids (2011, in press) (*)<br />
5. Pantaleo MA, Nannini M, Astolfi A, Biasco G; GIST Study Group Bologna -A distinct pediatric-type<br />
gastrointestinal st<strong>roma</strong>l tumor in adults: potential role of succinate dehydrogenase subunit A mutations- Am J Surg<br />
Pathol 35:1750-1752 (2011) (*)<br />
6. Savojardo C, Fariselli P, Casadio R -Improving the detection of transmembrane beta-barrel chains with N-to-1<br />
extreme learning machines- Bioinformatics 27:31<strong>23</strong>-3128 (2011) (*)<br />
7. Casadio R, Vassura M, Tiwari S, Fariselli P, Martelli PL -Correlating disease related mutations to their effect<br />
on protein stability: a large scale analysis of the human proteome- Hum Mutat 32:1161-1170 (2011) (*)<br />
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