scienze della vita roma, 22-23 ottobre 2012 - SIF

RESPONSABILE SCIENTIFICO:
RIGO ADELIO
UNITA’ DI RICERCA INBB
Padova
LINEA DI RICERCA
1. Biomolecole coinvolte nelle reazioni di ossido-riduzione e nello “stress ossidativo”;
2. Studi di metabolomica in fluidi biologici mediante NMR
3. Studio di interazioni bimolecolari mediante SPR per applicazioni biomediche;
COMPOSIZIONE DEL GRUPPO
Aderenti INBB
Di Paolo Maria Luisa RU marialuisa.dipaolo@unipd.it
Rigo Adelio PO adelio.rigo@unipd.it
Rossetto Monica BC monica.rossetto@unipd.it
Vanzani Paola. BC paola.vanzani@unipd.it
Zennaro Lucio. RU lucio.zennaro@unipd.it
Non Aderenti INBB
Bonaiuto Emanuela BC emanuela.bonaiuto@unipd.it
SEDE UNITÀ DI RICERCA
Università di Padova – Dipartimento di Medicina Molecolare - (sede Chimica Biologia)
Indirizzo…Via G. Colombo 3, 35131 -PADOVA
Telefono 049-8276119/8276264.
Fax …049-8073310
E-mail: marialuisa.diapolo@unipd.it; lucio.zennaro@unipd.it
SEZIONE INBB DI APPARTENENZA
Padova
RIASSUNTO DELL’ATTIVITÀ SVOLTA NEGLI ULTIMI TRE ANNI
Obiettivi
1. Mettere in luce i vari tipi di interazioni che controllano il "docking" di molecole (substrati ed inibitori) con il
sito catalitico di alcuni metallo-enzimi (ammino ossidasi, etc.) e chiarire i meccanismi dei processi in cui sono
coinvolte molecole dotate di “attività antiossidante;
2. Studio di metabolomica mediante Risonanza Magnetica Nucleare ( 1 H-NMR) in biofluidi umani per lo
screening di nuovi biomarker e/o identificazione di profili metabolici specifici presenti in alcune patologie.
3. Studiare l'interazione bimolecolare proteina-proteina GPx7 - PDI (Glutation perossidasi 7 e Disolfuro
isomerasi) mediante SPR (Surface plasmon Resonance), con potenziale applicazione in campo biomedico.
Risultati ottenuti
1. Gli studi di struttura-funzione su due diverse ammino ossidasi (enzimi che generano acqua ossigenata), una di
origine vegetale (da germogli di pisello) ed una da adipociti umani, hanno consentito l’individuazione dei
parametri strutturali di una molecola (substrato e inibitore) necessari per ottimizzare l’interazione con il sito
attivo di questi enzimi.. Sono stati sviluppati e messi a punto metodi per valutare le proprietà antiossidanti (in
particolare nella perossidazione lipidica) di alcuni polifenoli e vitamine, i meccanismi con cui intervengono nei
processi di "scavenging" di radicali liberi ed i possibili effetti sinergici. E’ stata inoltre messa in luce in alcuni
alimenti la presenza di radicali liberi stabili, indice di una elevata capacità antiossidante di questi alimenti.
2. Metabolomica. L’analisi preliminare di fluidi biologici di individui sani e pazienti affetti da varie patologie (es.
adenocarcinoma) ha messo in luce le zone spettrali in cui la varianza tra individui sani e pazienti è significativa.
L’aumento della numerosità dei campioni e ulteriori indagini potranno consentire l’individuazione dei
metaboliti coinvolti in alcune patologie e spiegare possibili meccanismi coinvolti.
3. Lo studio mediante SPR ha dimostrato che esiste una interazione bimolecolare tra GPx7 e PDI e ha permesso di
calcolare le costanti cinetiche di associazione e dissociazione. Lo studio comparativo condotto con GPx di
drosofila e con mutanti ha evidenziato le peculiarità strutturali di GPx7 convalidando i dati di attività
enzimatica.
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