scienze della vita roma, 22-23 ottobre 2012 - SIF

(Hexacorallia: Antipatharia) from Indonesia (North Sulawesi, Celebes Sea) The Linnean Society of London,
Zoological Journal of the Linnean Society. DOI: 10.1111/j.1096-3642.2012.00834.x
4. Makapedua DM, Barucca M, Forconi M, Antonucci N, Bizzaro D, Amici A, Carradori MR, Olmo E, Canapa A.
(2011). Genome size, GC percentage and 5mC level in the Indonesian coelacanth Latimeria menadoensis. Marine
Genomics. 4:167-172. (affiliazione INBB)
5. Corinaldesi C, Barucca M, Luna GM, Dell’Anno A. (2011). Preservation, origin and genetic imprint of
extracellular DNA in permanently anoxic deep-sea sediments Molecular Ecology Mol. Ecol. 20:642-654.
6. Trifonov VA, Giovannotti M, O’Brien PCM, Wallduck M, Lovell F, Rens W, Parise-Maltempi PP, Caputo V,
Ferguson-Smith MA (2011) Chromosomal evolution in Gekkonidae.I. Chromosomes painting between gecko and
Hemidactylus species reveals phylogenetic relationships within the group. Chromosome Res. 19: 843-955
7. Pokornà M, Giovannotti M, Kratochvìl L, Kasai F, Trifonov VA, O’Brien PCM, Caputo V, Olmo E, Fergusonsmith
MA, Renz W (2011)Strong conservation of the bird Z chromosome in reptilian genomes is revealed by
comparative painting despite 275 My divergence. Chromosoma 120(5) 455-468
8. Caputo V, Giovannotti M, Nisi Cerioni P, Splendiani A, Tagliavini VA, Olmo E (2011) Chromosomal study of a
lamprey (Lampetra zanandrei Vladykov 1955) (Petromyonida: Petromyzontiformes) conventional and FISH
analysis. Chromosome Res. 19: 481-491.
9. Morescalchi MA, Barucca M, Stingo V, Capriglione T. (2010). Polypteridae (Actinopterygii: Cladistia) and
DANA-SINEs insertions. Mar. Genomics. 3: 79-84.
10. La Mesa M, Caputo V, Eastman JT (2010) Some reproductive traits of the Tristan klipfish, Bovichtus diacanthus
(Carmichael 1819) (Nototheniodei: Bovichtidae) from Tristan da Cunha (South Africa) Polare Biology 33: 337-346
11. Barucca M, Biscotti MA, Forconi M, Regoli F, Olmo E, Canapa A. (2010).Characterization and phylogenetic
analysis of vitellogenin coding sequences in the Antarctic fish Trematomus bernacchii. J. Exp. Zool (Mol. Dev.
Evol.). 314B: 645-652. (affiliazione INBB)
12. Giovannotti M, Caputo V, O’Brien PCM, Lovell FL, Trifonov V, Nisi Cerioni P, Olmo E, Ferguson-Smith MA,
Rens W (2010) Skinks (Reptilia: Scincidae) have higly conserved karyotypes as revealed by chromosome painting
Cytogenet Genome Res 127: 224-231
PROSPETTIVE ED OBIETTIVI PER PROSSIMI TRE ANNI
Visti i risultati ottenuti, per i prossimi tre anni si intende proseguire lo studio intrapreso sul trascrittoma di Latimeria
menadoensis, attraverso l’elaborazione bioinformatica volta all’identificazione degli oltre 64.000 trascritti che saranno
di estremo interesse per comprendere la storia evolutiva di molti geni.
COLLABORAZIONI INTERNAZIONALI IN ATTO
Per lo studio dei geni della determinazione e del differenziamento sessuale in Latimeria, l’unità collabora con il Prof.
Manfred Schartl, del Physiological Chemistry Biocenter, University of Wuerzburg, (Wuerzburg, Germania).
Per lo studio degli elementi trasponibili attivi in Latimeria è in atto una collaborazione con il Prof. Jean Nicolas Volff
dell’Institut de Génomique Fonctionelle de Lyone, Université de Lyone (Lione, Francia).
L’unità inoltre fa parte del Coelacanth Genome Project coordinato dalla Dr Jessica Alfoldi del BROAD Institute
(Cambridge, MA, USA).
PRINCIPALI ATTREZZATURE DI CUI DISPONE L’UNITÀ DI RICERCA
1. Sequenziatore automatico di acidi nucleici ABI Prism Genetic Analize 310 Applied Biosystems
2. P.A.L.M. laser dissecting microscope (Olympus)
3. Fotomicroscopio a fluorescenza con analizzatore di immagine (Olympus)
4. Sistemi di amplificazione genica PCR System 2004(Perkin Elmer) e MyCycler (BioRad)
5. IQ5 multicolor Real-Time PCR detection system (BioRad)
6. Citofluorimetro COULTER EPICS XL
PAROLE CHIAVE
Latimeria menadoensis, coelacanth, transcriptome, gene evolution.
138