scienze della vita roma, 22-23 ottobre 2012 - SIF

RESPONSABILE SCIENTIFICO
OLMO ETTORE
UNITÀ DI RICERCA INBB
Ancona
LINEA DI RICERCA
Analisi del trascrittoma nel fossile vivente Latimeria menadoensis.
COMPONENTI DEL GRUPPO
Aderenti INBB
Olmo Ettore PO e.olmo@univpm.it
Caputo Vincenzo PA v.caputo@univpm.it
Canapa Adriana PA a.canapa@univpm.it
Barucca Marco RU m.barucca@univpm.it
Giovannotti Massimo BC m.giovannotti@univpm.it
Nisi Cerioni Paola PT p.nisicerioni@univpm.it
Forconi Marikò DR m.forconi@univpm.it
Biscotti Maria Assunta A assuntabiscotti@tiscali.it
SEDE UNITÀ DI RICERCA
Dipartimento di Scienze della Vita e dell’Ambiente, Università Politecnica delle Marche, Facoltà di Scienze, Ancona
Indirizzo via Brecce Bianche 60131 Ancona
Telefono 0712204614
Fax 0712204609
e-mail: r.baiocchi@univpm.it;
SEZIONE INBB DI APPARTENENZA
Roma
RIASSUNTO DELL’ATTIVITÀ SVOLTA NEGLI ULTIMI TRE ANNI
Obiettivi
Nell’ultimo triennio l’attenzione di questa unità di ricerca è stata rivolta prevalentemente alla comprensione della storia
evolutiva, attraverso analisi genetiche molecolari, di un raro esemplare di Latimeria menadoensis. E’ noto che gli
esemplari del genere Latimeria sono di enorme interesse evolutivo dal momento che rappresentano fossili viventi che
possono testimoniare ancora oggi come dovevano essere quei pesci che 400 milioni di anni fa hanno abbandonato la
vita acquatica per spostarsi sulla terra e dare origine ai tetrapodi. La possibilità di disporre di tessuto di fegato e gonade
di un individuo maschio adulto, sesto ed ultimo esemplare catturato a partire dal 1997, è stata resa possibile grazie ad
una convenzione di ricerca fra l’Università Politecnica delle Marche e l’Università di Sam Ratulangi di Manado in
Indonesia. Visto l’interesse di questo esemplare gli obiettivi della ricerca hanno riguardato la comprensione
dell’evoluzione dei geni coinvolti nello sviluppo, nel differenziamento e nei processi metabolici.
Risultati ottenuti
Il primo studio intrapreso è stato quello di valutare attraverso analisi citofluorimetriche il valore quantitativo del DNA
per cellula di L. menadoensis, visto che analisi di questo tipo precedentemente effettuate sulla congenerica specie
Latimeria chalumnae avevano prodotto risultati discordanti. A questi dati sono stati aggiunti inoltre, con analisi in
HPLC, quelli relativi alla composizione in GC e al grado di metilazione del DNA. Successivamente in seguito
all’estrazione dell’RNA si è proceduto con tecnologia Illumina, ad ottenere i trascrittomi da fegato e gonade del
celacanto indonesiano. Dopo assemblaggi e diverse analisi bioinformatiche i due trascrittomi hanno permesso di
identificare circa 64.000 trascritti. Il primo risultato ottenuto dal trascrittoma è stato quello di completare un lavoro
volto all’identificazione e caratterizzazione della completa famiglia genica della vitellogenina in Latimeria
menadoensis. Inoltre, grazie l’eccezionale qualità dei dati ottenuti che verranno pubblicati a breve, sono state intraprese
delle analisi che hanno portato all’identificazione dei trascritti per le proteine responsabili del differenziamento
sessuale, dei processi immunologici, delle vie secretorie e delle risposte agli stress ambientali.
PUBBLICAZIONI PIÙ SIGNIFICATIVE NEL PERIODO 2010-2012
1. Canapa A, Olmo E, Forconi M, Pallavicini A, Makapedua MD, Biscotti MA, Barucca M. (2012). Composition and
phylogenetic analysis of vitellogenin coding sequences in the Indonesian coelacanth Latimeria menadoensis. J.
Exp. Zool. (Mol. Dev. Evol.) 00:1–13. DOI: 10.1002/jezb.22455 (affiliazione INBB)
2. Pokornà M, Giovannotti M, Kratochvìl L, Caputo V, Olmo E, ferguson-Smith MA, Rens W (2012) Conservation of
chromosomes syntenic with avian autosomes in squamate reptiles revealed by comparative painting. Chromosoma,
DOI 10.1007/s00412-012-0371-z
3. Bo M, Bavestrello G, Barucca M, Makapedua DM, Poliseno A, Forconi M., Olmo E, Canapa A. (2012).
Morphological and molecular characterization of the problematic whip black coral genus Stichopathes
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