Selected papers - Garr

sto ospita sia il centro di coordinamento della
griglia che quello che coordina e gestisce
i dati custoditi in neuGRID. Il livello 1 è caratterizzato
invece dai centri di calcolo veri e
propri (IRCCS Fatebenfratelli, Karolinska Institute,
VU Medical Centre). In pratica, tutti
gli utenti finali possono accedere alla potenza
di calcolo del livello 1 utilizzando il portale
neuGRID (http://neugrid.healthgrid.org)e
sfruttando la suite di applicativi messi a loro
disposizione (fig.1).
Ad oggi, l’infrastruttura neuGRID è attiva
al 100%. In particolare, sia il livello 0 che il livello
1 sono completamente configurati e funzionanti
e, conseguentemente, l’intera potenza
di calcolo è usufruibile da parte dell’utente
finale. Entro la fine del 2010 saranno conclusi
tutti i lavori di ottimizzazione dell’interfaccia
e, successivamente, la griglia neuGRID sarà
pronta per essere testata e ulteriormente raffinata
entro la fine del 2010. Infine, da un punto
di vista infrastrutturale neuGRID è connesso
alla rete GARR e alla rete paneuropea GÉANT.
neuGRID consentirà di effettuare analisi in
maniera semplice, efficiente ed efficace. Infatti,
una volta che i neuroscienziati e neuroricercatori
ottengono il proprio certificato, possono
accedere tramite il portale web di neuGRID ai
servizi resi disponibili. A tal proposito, in neu-
GRID è stata adottata la tecnologia Web 2.0
Ajax-based e il sistema di single sign-on, in
modo tale da consentire all’utilizzatore finale
di eseguire complesse analisi sfruttando la rapidità
e la potenza di calcolo della griglia. Tutto
il sistema neuGRID è stato pensato integrando
le più rigorose politiche di sicurezza e gli standard
web più innovativi oggi utilizzabili.
Una volta acceduto al sistema, e prima di
far correre e disegnare le proprie pipeline di
analisi di immagini di pazienti affetti da patologie
cerebrali, il neuroscienziato può definire
e selezionare la propria popolazione di studio
e/o di riferimento. In neuGRID tutto ciò è reso
possibile sfruttando un efficiente sistema di
database distribuito chiamato LORIS. Questo
Fig. 2 Pannello superiore: Portale neuGRID;
Pannello inferiore sinistro: Loris Dataset;
Pannello inferiore destro: Immagine anonimizzata.
sistema fornisce, infatti, la possibilità di effettuare
controlli di qualità preventivi sull’immagine
che si andrà ad analizzare e consente
di formulare delle specifiche query per poter
interagire con l’intero archivio costituito
da più di 8000 scansioni cerebrali.
Inoltre, trattando neuGRID dati sensibili,
si è cercato di porre molta attenzione anche
all’impiego e alla gestione di tali dati e delle
relative informazioni ad essi associati. È importante
sottolineare che qualsiasi acquisizione
cerebrale, prima di essere archiviata in LO-
RIS, subisce una opportuna anonimizzazione
e una deturpazione delle caratteristiche biometriche
del volto al fine di garantire la privacy
di ogni soggetto archiviato nel sistema neu-
GRID (fig.2).
In seguito, l’utente, una volta autenticatosi
e scelto il campione di studio, potrà essere
interessato a sottomettere le proprie analisi ai
Computing Elements (CE) della griglia. neu-
GRID, per venire incontro alle esigenze di differenti
utenti finali, offre due diverse possibilità
per effettuare il processamento delle immagini:
utilizzare l’interfaccia a riga di comando
tramite un’opportuna shell (GSI-SSH), oppure,
utilizzare una Graphical User Interface
(GUI) evitando la scrittura di qualsiasi riga
di codice. Ciò risulta essere molto utile so-
17