Capitolo 2 - Omero

‣ Metodi chimici: Bromuro di cianogeno (CNBr): il metodo che prevede iltrattamento della proteina con CNBr è uno dei metodichimici che dà i migliori risultati ed è quindi unodei più utilizzati. Questo reattivo permette discindere la catena polipeptidica specificamente incorrispondenza dell'estremità COOH terminale deiresidui di metionina. Normalmente una proteinacontiene un numero molto limitato di residui diMetionina, quindi con il CNBr si ottengono di solitopochi frammenti, di dimensioni anche elevate. Ipeptidi che si ottengono presentano come amminoacidoC-terminale un residuo di omoserina o di omoserinalattone. I legami Met-Ser e Met-Thr vengono scissisolo parzialmente. Scissione ai residui di Triptofano: Vi sono diversireattivi che possono scindere una proteina incorrispondenza del lato carbossilico dei residui diTrp, tuttavia molti di essi determinano anchemodificazioni a carico di diversi amminoacidi,determinando quindi la formazione di prodotti che nonsono poi riconoscibili durante l'analisi sequenziale.Uno dei reattivi migliori sembra essere l'acido o-iodosobenzoico, che tuttavia può scindere la proteinain corrispondenza anche di alcuni residui diTirosina.