Κεφάλαιο 28.pdf

© ΠΑΝΕΠΙΣΤΗΜΙΑΚΕΣ ΕΚΔΟΣΕΙΣ ΚΡΗΤΗΣ ΣΥΜΠΛΗΡΩΜΑΤΙΚΟ ΥΛΙΚΟ ΓΙΑ ΤΟ ΧΗΜΙΚΟ ΤΜΗΜΑ ΤΟΥ ΠΑΝ/ΜΙΟΥ ΑΘΗΝΩΝ912 KEΦAΛAIO 28 · Σύνθεση και μάτισμα RNAνέναρξη της μεταγραφής. Να προτείνετε μια πιθανή εξήγησηγια τον ατελέσφορο κύκλο.11. Αναστολή πολυμεράσης. Η κορδισεπίνη αναστέλλει τησύνθεση πολυ(Α) σε χαμηλές συγκεντρώσεις και τη σύνθεσηRNA σε υψηλότερες συγκεντρώσεις.15. Πολυπλοκότητα πρωτεώματος. Ποιες διεργασίες που εξετάστηκανστο κεφάλαιο αυτό κάνουν το πρωτέωμα πιοπολύπλοκο από το γονιδίωμα; Ποιες διεργασίες θα μπορούσαννα ενισχύσουν ακόμη περισσότερο την πολυπλοκότητααυτή;16. Τεχνική διαχωρισμού. Να προτείνετε έναν τρόπο με τονοποίο θα μπορούσατε να διαχωρίσετε mRNA από άλλουςτύπους RNA σε ένα ευκαρυωτικό κύτταρο.NNH 2Ασκήσεις ερμηνείας δεδομένωνHO(α) Ποια είναι η βάση της αναστολής από την κορδισεπίνη;(β) Γιατί η σύνθεση πολυ(Α) είναι πιο ευαίσθητη στηνπαρουσία κορδισεπίνης;(γ) Χρειάζεται η κορδισεπίνη τροποποίηση για ναασκήσει τη δράση της;12. Ένα επιπλέον τμήμα. Ποια είναι η αλληλουχία αμινοξέωντου επιπλέον τμήματος της πρωτεΐνης που συντίθεταισε έναν θαλασσαιμικό ασθενή που έχει μια μετάλλαξηη οποία οδηγεί σε εναλλακτικό μάτισμα; (βλ. Eικόνα28.28). Το πλαίσιο ανάγνωσης μετά τη θέση διάσπασηςαρχίζει με TCT.13. Ένα μήνυμα μακριάς ουράς. Ένας άλλος ασθενής με θαλασσαιμίαείχε μια μετάλλαξη που οδήγησε στην παραγωγήενός mRNA για την αλυσίδα β της αιμοσφαιρίνηςπου ήταν 900 νουκλεοτίδια μακρύτερη από την κανονική.Η ουρά πολυ(Α) αυτού του μεταλλαγμένου mRNAήταν τοποθετημένη μερικά νουκλεοτίδια μετά από τη μοναδικήαλληλουχία AAUAAA της επιπρόσθετης αλληλουχίας.Να προτείνετε μια μετάλλαξη που θα μπορούσενα οδηγήσει στην παραγωγή αυτού του αλλοιωμένουmRNA.Άσκηση μηχανισμούHO14. Διόρθωση RNA. Πολλά μόρια ουριδίνης εισέρχονται σεμερικά mRNA στα τρυπανοσώματα. Τα κατάλοιπα ουριδίνηςπροέρχονται από ουρές πολυ(U) μιας αλυσίδας-δότη.Τριφωσφορικοί νουκλεοζίτες δεν συμμετέχουν στηναντίδραση αυτή. Να προτείνετε έναν μηχανισμό αντίδρασηςπου είναι υπεύθυνος για την ανακάλυψη αυτή.(Υπόδειξη: Να συσχετίσετε τη διόρθωση RNA με το μάτισμαRNA.)OHNNKÔÚ‰ÈÛÂapple›ÓË (3ã-‰ÂÔ͢·‰ÂÓÔÛ›ÓË)N17. Ένα γενικό πείραμα. Πυρήνες απομονώθηκαν από εγκέφαλο,ήπαρ και μυς. Στη συνέχεια οι πυρήνες επωάστηκανμε α- 32 Ρ-UTP σε συνθήκες που επιτρέπουν τη σύνθεσηRNA, εκτός του ότι κατά την επώαση υπήρχε έναςαναστολέας της έναρξης της μεταγραφής. Το ραδιενεργόRNA απομονώθηκε και υβριδοποιήθηκε με διάφορεςαλληλουχίες DNA προσαρτημένες σε μια μικροσυστοιχίαDNA. Στα διαγράμματα που παρατίθενται, η έντασητων σκιάσεων υποδηλώνει περίπου πόσο mRNA προσκολλάταισε κάθε αλληλουχία DNA.◊apple·Ú M˘˜ EÁΤʷÏÔ˜(α) Γιατί η ένταση της υβριδοποίησης διαφέρει μεταξύτων γονιδίων;(β) Γιατί είναι σημαντικό το γεγονός ότι μερικά απότα μόρια RNA εμφανίζουν διαφορετικά σχήματα υβριδοποίησηςστους διαφορετικούς ιστούς;(γ) Μερικά γονίδια εκφράζονται σε όλους τους ιστούς.Ποια νομίζετε ότι μπορεί να είναι η φύση αυτών των γονιδίων;(δ) Να προτείνετε έναν λόγο για την προσθήκη ενόςαναστολέα της έναρξης της μεταγραφής στο μείγμα τηςαντίδρασης.18. Χριστουγεννιάτικα δένδρα. Το αυτοραδιογράφημα που παρατίθεταιδείχνει μερικά βακτηριακά γονίδια που υφίστανταιμεταγραφή. Να αναγνωρίσετε το DNA. Τί είναιοι κλώνοι αυξανόμενου μεγέθους; Πού βρίσκεται η έναρξητης μεταγραφής; Πού βρίσκεται το τέλος της μεταγραφής;Επάνω στη σελίδα, ποια είναι η κατεύθυνση τηςσύνθεσης RNA; Τί μπορείτε να συμπεράνετε για τοναριθμό των ενζύμων που συμμετέχουν στη σύνθεση RNAενός δεδομένου γονιδίου;Ασκήσεις συνδυασμού ύλης από διάφορα κεφάλαια