Κεφάλαιο 28.pdf

© ΠΑΝΕΠΙΣΤΗΜΙΑΚΕΣ ΕΚΔΟΣΕΙΣ ΚΡΗΤΗΣ ΣΥΜΠΛΗΡΩΜΑΤΙΚΟ ΥΛΙΚΟ ΓΙΑ ΤΟ ΧΗΜΙΚΟ ΤΜΗΜΑ ΤΟΥ ΠΑΝ/ΜΙΟΥ ΑΘΗΝΩΝ3'901Eπεξεργασία των προϊόντων της μεταγραφήςEÍfiÓÈÔ1ı¤ÛËÌ·Ù›ÛÌ·ÙÔ˜5'5'AGPGUAAGUEÍfiÓÈÔ22' OH3'GPGACNY nı¤ÛËÌ·Ù›ÛÌ·ÙÔ˜3'YAR £¤ÛËY ‰È·ÎÏ¿‰ˆÛ˘NY5'GUAAGU5'P3' OHGAGPGACYP3'2' ARYNY3'GPGA+5'GUAAGUP3'OHGACNY nYP3'2' ARYNY5'Úfi‰ÚÔÌÔ ÌfiÚÈÔEӉȿÌÂÛÔ‰ÔÌ‹˜ ‚Úfi¯Ô˘ÚÔ˚fiÓÌ·Ù›ÛÌ·ÙÔ˜MÔÚÊ‹ ‚Úfi¯Ô˘ÙÔ˘ ÈÓÙÚÔÓ›Ô˘EIKONA 28.29 Μηχανισμός ματίσματος που χρησιμοποιείται για πρόδρομα μόρια mRNA. Το ανοδικό(5΄) εξόνιο φαίνεται μπλε, το καθοδικό (3΄) εξόνιο φαίνεται πράσινο και η θέση διακλάδωσης φαίνεταικίτρινη. Το Υ σημαίνει νουκλεοτίδιο πουρίνης, το R νουκλεοτίδιο πυριμιδίνης και το Ν οποιοδήποτενουκλεοτίδιο. Η θέση ματίσματος 5΄ προσβάλλεται από την ομάδα 2΄-ΟΗ του καταλοίπου αδενοσίνηςτης θέσης διάσπασης. Η θέση ματίσματος 3΄ προσβάλλεται από τη νεοσχηματιζόμενη ομάδα 3΄-ΟΗ τουανοδικού εξονίου. Τα εξόνια συνδέονται και το ιντρόνιο ελευθερώνεται με τη μορφή βρόχου. [Κατά P.A. Sharp, Cell 2(1985):3980.]28.3.4 Tο μάτισμα αποτελείται από δύο αντιδράσειςτρανσεστεροποίησηςΤο μάτισμα νεοσυντιθέμενων μορίων mRNA είναι μια πολύπλοκη διεργασία.Χρειάζεται τη συνεργασία αρκετών μικρών μορίων RNA και πρωτεϊνών πουσχηματίζουν ένα μεγάλο σύμπλοκο, το οποίο ονομάζεται σωμάτιο ματίσματος.Ωστόσο, η χημεία της διεργασίας ματίσματος είναι απλή. Το μάτισμα αρχίζειμε τη διάσπαση του φωσφοδιεστερικού δεσμού μεταξύ του ανοδικού εξονίου(εξόνιο 1) και του 5΄-άκρου του ιντρονίου (Eικόνα 28.29). Η προσβάλλουσαομάδα στην αντίδραση αυτή είναι η 2΄-υδροξυλική ομάδα ενός καταλοίπου αδενυλικούστη θέση διακλάδωσης. Ένας 2΄,5΄-φωσφοδιεστερικός δεσμός σχηματίζεταιμεταξύ αυτού του καταλοίπου Α και της φωσφορικής ομάδας του 5΄άκρουτου ιντρονίου. Αυτή η αντίδραση είναι μια τρανσεστεροποίηση.R 1OO– –OO OP RRTÚ·ÓÛÂÛÙÂÚÔappleÔ›ËÛË32 + HR POO1O OR 3 +HOΕπισημαίνεται ότι το συγκεκριμένο κατάλοιπο αδενυλικού συνδέεται επίσηςμε άλλα δύο νουκλεοτίδια διά μέσου κανονικών 3΄,5΄-φωσφοδιεστερικώνδεσμών (Eικόνα 28.30). Επομένως, μια διακλάδωση δημιουργείται στη θέση αυτήκαι σχηματίζεται ένα ενδιάμεσο δομής βρόχου.Στη συνέχεια, το 3΄-ΟΗ άκρο του εξονίου 1 προσβάλλει τον φωσφοδιεστερικόδεσμό μεταξύ του ιντρονίου και του εξονίου 2. Τα εξόνια 1 και 2 συνδέονταικαι το ιντρόνιο ελευθερώνεται με τη μορφή βρόχου. Και στην περίπτωσηαυτή η αντίδραση είναι μια τρανσεστεροποίηση. Επομένως, το μάτι-R 2OPO5'O–OO3' 2'O O O–O POA‰ÂÓ›ÓËO O–O POO –OPOOOH°Ô˘·Ó›ÓËEIKONA 28.30 Θέση διακλάδωσης κατά τομάτισμα. Η δομή της θέσης διακλάδωσης στοενδιάμεσο δομής βρόχου στο οποίο το κατάλοιποαδενυλικού συνδέεται με τρία νουκλεοτίδια μέσωφωσφοδιεστερικών δεσμών. Ο νέος σύνδεσμος2΄-5΄ φαίνεται κόκκινος και οι συνηθισμένοι3΄- 5΄δεσμοί μπλε.