0-TESTO COMPLETO.pdf - Fondazione Santa Lucia

libera. Per l’inserimento, è stato fondamentale creare dei filtri che permettessero
di descrivere una relazione coerente fra i dati, con confronti che validino
le relazioni stesse.
Terminata la Banca Dati ProFunDistance è stata sviluppata un’interfaccia
web facilmente accessibile e navigabile dove l’utente può compilare dei campi
chiave, lanciando query ed avendo come risposta tutta l’informazione possibile,
chiara e scaricabile in locale. L’interfaccia è stata sviluppata con JAVA
per la parte server, HTML e javascript per la visualizzazione lato client ed
oltre una home page, ad una pagina per effettuare le query di ricerca con le
relative pagine di visualizzazione dei dati risultanti, anche una pagina che
mostra delle statistiche operate sulla Banca Dati.
Conclusioni – Una volta terminata la fase di test del sistema informatico, sarà
fondamentale valutare l’applicazione che gruppi sperimentali ne faranno ed
eventualmente avere una rete di feedback per una ulteriore validazione delle
interazioni a seguito degli esperimenti.
A questo scopo diverrà molto utile avere una misura di tipo probabilistico
della precisione dell’informazione per ogni singola interazione, quindi generare
una punteggio vero e proprio per dare all’utente la possibilità di capire
quanto affidarsi a quel dato e quanto invece prenderlo con cautela. Questo
tipo di score verrà costruito proprio sulla base di tutti i dati raccolti.
Potrebbe essere interessante sviluppare un predittore che dia una stima
della probabilità per cui una determinata proteina possa interagire con altre
proteine sulla base delle sue interazioni, della sua localizzazione e delle patologie
ad essa associate. Per questo diviene fondamentale aggiungere ulteriori
annotazioni alle proteine implicate nelle interazioni, come per esempio dei
dati riguardanti la coespressione, aumentando la precisione predittiva del
sistema.
RUOLO DELLA CHINASI ATM (ATAXIA TELANGIECTASIA MUTATED)
NEL CONTROLLO DELL’UBIQUITINAZIONE
PROTEASOMA-UBIQUITINA DIPENDENTE (Simonetta Santini)
Borse di studio
Introduzione – L’Atassia-Telangiectasia è una malattia genetica autosomica
recessiva caratterizzata da neurodegenerazione cerebellare progressiva che
determina atassia, telangiectasia, sensibilità alle radiazioni ionizzanti, ed alta
incidenza nello sviluppo di tumori soprattutto a carico dell’apparato immunitario.
A livello molecolare tale patologia è caratterizzata dall’assenza funzionale
di una proteina chiamata ATM (Ataxia Telangiectasia Mutated). ATM è
una serina/treonina chinasi ed è il principale trasduttore cellulare del danno
al DNA a doppia elica (DSB). In risposta al danno al DNA, ATM fosforila in
serina e treonina diversi substrati attivando quindi una cascata di trasduzione
del segnale che indirizza la cellula verso l’arresto del ciclo o la morte programmata
(apoptosi). È stato recentemente identificato nel nostro laboratorio un
nuovo ruolo di ATM come modulatore dell’apoptosi indotta dal recettore Fas.
Si è riscontrato che cellule linfoblastoidi prive di una proteina ATM funzionale
sono sensibilmente resistenti alla morte indotta dal recettore Fas; tale
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