18.09.2013 Views

Gram pozitif koklar

Gram pozitif koklar

Gram pozitif koklar

SHOW MORE
SHOW LESS

You also want an ePaper? Increase the reach of your titles

YUMPU automatically turns print PDFs into web optimized ePapers that Google loves.

Sık izole edilen <strong>Gram</strong> Pozitif ve<br />

<strong>Gram</strong> Negatif Bakterilerin<br />

Özellikleri ve<br />

Tanı Algoritmaları<br />

Dr.ERKAN YULA<br />

2009<br />

erkanyula@gmail.com


<strong>Gram</strong> <strong>pozitif</strong> <strong>koklar</strong><br />

• Stafilo<strong>koklar</strong><br />

• Strepto<strong>koklar</strong><br />

• Mikro<strong>koklar</strong><br />

<strong>Gram</strong> <strong>pozitif</strong> basiller/çomaklar<br />

•Corinobacteriumlar<br />

•Lactobasilluslar<br />

•Bacilleceae ailesi basiller<br />

Basilluslar<br />

B.subtilis<br />

B.cereus<br />

B.anthracis<br />

Clostridium’lar ………


<strong>Gram</strong> negatif <strong>koklar</strong><br />

• Neisserialar<br />

• Veionella’lar<br />

<strong>Gram</strong> negatif basiller<br />

• Enterobaktericeae üyeleri<br />

• Non-fermantatif basiller


ALGORİTİMDE İLK BASAMAK<br />

GRAM BOYAMA


<strong>Gram</strong> <strong>pozitif</strong> <strong>koklar</strong><br />

Katalaz (+)<br />

•Stafilo<strong>koklar</strong><br />

•Mikro<strong>koklar</strong><br />

•Planokok<br />

•Stomatokok<br />

•Deinokok<br />

Katalaz (-)<br />

Fakültatif anaeropmikroaerofil<br />

•Strepto<strong>koklar</strong><br />

•Aerokok<br />

•Pediokok<br />

•Gemella<br />

•Leukonostok<br />

Anarerop<br />

<strong>koklar</strong><br />

•Peptokok<br />

•Peptostreptokok<br />

•Ruminokok<br />

•Sarcina<br />

•Coprokok


+<br />

Oksidase<br />

Streptokok


1-<strong>Gram</strong> <strong>pozitif</strong> KATALAZ <strong>pozitif</strong> <strong>koklar</strong><br />

Micrococcus<br />

• Klinik materyallerde kontaminasyona yol açan etken<br />

• Stafilo<strong>koklar</strong>la karıştırılırlar<br />

• Furazolidin R ve oksidaz olumlu<br />

• Lizostafine duyarlı<br />

• Oksidatif üreme


1-<strong>Gram</strong> <strong>pozitif</strong> KATALAZ <strong>pozitif</strong> <strong>koklar</strong><br />

Staphylococcus<br />

•Düzensiz üzüm salkımı, <strong>Gram</strong> <strong>pozitif</strong> küresel<br />

<strong>koklar</strong>dır<br />

•Hareketsiz, katalaz olumlu<br />

•Sporsuz<br />

•Fakültatif anaerop<br />

•Normal flora üyesi


1-<strong>Gram</strong> <strong>pozitif</strong> KATALAZ <strong>pozitif</strong> <strong>koklar</strong><br />

Staphylococcus<br />

Patojen olan en sık karşılaşılan türler<br />

Koagülaz Novabiosin DNaz Mannitol<br />

Tuz agar<br />

S.aureus + duyarlı + +<br />

S.epidermidis - duyarlı - -<br />

S.saprophyticus - dirençli - -<br />

S.intermedius - duyarlı + -


1-<strong>Gram</strong> <strong>pozitif</strong> KATALAZ <strong>pozitif</strong> <strong>koklar</strong><br />

Staphylococcus


1-<strong>Gram</strong> <strong>pozitif</strong> KATALAZ <strong>pozitif</strong> <strong>koklar</strong><br />

S.epidermitis<br />

Staphylococcus<br />

MRSA<br />

S.saprofiticus


1-<strong>Gram</strong> <strong>pozitif</strong> KATALAZ <strong>pozitif</strong> <strong>koklar</strong><br />

Staphylococcus<br />

Katalaz, peroksidaz<br />

H2O2 H20 + O2 Strepto<strong>koklar</strong>dan ayırma,Tüm Zorunlu anaeroplar (-)<br />

Kanlı By


1-<strong>Gram</strong> <strong>pozitif</strong> KATALAZ <strong>pozitif</strong> <strong>koklar</strong><br />

İnsan ++<br />

Tavşan ++<br />

Koyun +<br />

Sığır +<br />

EDTA<br />

Heparin<br />

Sitrat<br />

Serbest<br />

koagülaz<br />

Staphylococcus<br />

Fibrinojen fibrin<br />

EDTA’lı<br />

plazma<br />

4*-24 sa<br />

35 o C


1-<strong>Gram</strong> <strong>pozitif</strong> KATALAZ <strong>pozitif</strong> <strong>koklar</strong><br />

Staphylococcus<br />

Bağlı<br />

koagülaz


1-<strong>Gram</strong> <strong>pozitif</strong> KATALAZ <strong>pozitif</strong> <strong>koklar</strong><br />

• S. aureus<br />

Koagülaz <strong>pozitif</strong> <strong>koklar</strong><br />

• S. lugdunensis* - bağlı koagülaz<br />

• S. schleiferi - bağlı koagülaz<br />

• S. aureus<br />

• S. schleiferi<br />

DNaz <strong>pozitif</strong> <strong>koklar</strong><br />

*Ornitin dekarboksilaz (+)


1-<strong>Gram</strong> <strong>pozitif</strong> KATALAZ <strong>pozitif</strong> <strong>koklar</strong><br />

Staphylococcus<br />

Mannitol Tuz agar selektif by.Tarama amaçlı


1-<strong>Gram</strong> <strong>pozitif</strong> KATALAZ <strong>pozitif</strong> <strong>koklar</strong><br />

Staphylococcus<br />

DNaz Agar - S. aureus


1-<strong>Gram</strong> <strong>pozitif</strong> KATALAZ <strong>pozitif</strong> <strong>koklar</strong><br />

Staphylococcus<br />

Hızlı tanı, Latex aglutinasyonu, MRSA


1-<strong>Gram</strong> <strong>pozitif</strong> KATALAZ <strong>pozitif</strong> <strong>koklar</strong><br />

Staphylococcus<br />

Hızlı tanı - Api staph<br />

0 GLU FRU MAL LAC TRE MAN XLT MEL


Streptokok


2-<strong>Gram</strong> <strong>pozitif</strong> KATALAZ negatif <strong>koklar</strong><br />

Streptococcus<br />

• <strong>Gram</strong> (+), Katalaz (-),yuvarlak oval kok<br />

• Hareketsiz, sporsuz, zincir (sıvı by.)<br />

• Çoğu fakültatif anaerop<br />

• Glikozu heksoz difosfat yolu ile metobolize<br />

ederek laktik asit<br />

• Ph 7.4 optimal,%10 CO 2 üreme ve hemolizi<br />

artıtır<br />

• Doğada ve normal florada yaygın


2-<strong>Gram</strong> <strong>pozitif</strong> KATALAZ negatif <strong>koklar</strong><br />

Streptococcus<br />

Streptolizin O<br />

Streptolizin S


2-<strong>Gram</strong> <strong>pozitif</strong> KATALAZ negatif <strong>koklar</strong><br />

Streptococcus


2-<strong>Gram</strong> <strong>pozitif</strong> KATALAZ negatif <strong>koklar</strong><br />

Streptococcus<br />

Beta hemolitik streptokok algoritma<br />

A Grubu β hem.<br />

Strep.<br />

Bacitracin disk<br />

S R<br />

Ba- S<br />

%40 safrada<br />

üreme ve eskülin<br />

-<br />

Diğer<br />

strepto<strong>koklar</strong><br />

+<br />

D grubu<br />

streptokok


2-<strong>Gram</strong> <strong>pozitif</strong> KATALAZ negatif <strong>koklar</strong><br />

Streptococcus<br />

Op- S<br />

Alfa hemolitik streptokok algoritma<br />

S.pneumonia<br />

Op- R<br />

Optokin disk<br />

S R<br />

%40 safrada<br />

üreme ve eskülin<br />

-<br />

Viridans<br />

strepto<strong>koklar</strong><br />

-<br />

Non-<br />

Enterokok<br />

+<br />

D grubu<br />

streptokok<br />

%6,5<br />

NaCl<br />

+<br />

Enterokok


2-<strong>Gram</strong> <strong>pozitif</strong> KATALAZ negatif <strong>koklar</strong><br />

Streptococcus<br />

Non-hemolitik streptokok algoritma<br />

%40 safrada<br />

üreme ve eskülin<br />

-<br />

Diğer<br />

strepto<strong>koklar</strong><br />

-<br />

Non-<br />

Enterokok<br />

+<br />

D grubu<br />

streptokok<br />

%6,5<br />

NaCl<br />

+<br />

Enterokok


2-<strong>Gram</strong> <strong>pozitif</strong> KATALAZ negatif <strong>koklar</strong><br />

Streptococcus<br />

Pnomokok – Kapsül - Diplokok


2-<strong>Gram</strong> <strong>pozitif</strong> KATALAZ negatif <strong>koklar</strong><br />

Streptococcus<br />

Pnomokok- alfa hem. Göbekli koloniler<br />

otoliz


2-<strong>Gram</strong> <strong>pozitif</strong> KATALAZ negatif <strong>koklar</strong><br />

Streptococcus<br />

Viridans strepto<strong>koklar</strong>


2-<strong>Gram</strong> <strong>pozitif</strong> KATALAZ negatif <strong>koklar</strong><br />

Streptococcus<br />

S.agalactia


2-<strong>Gram</strong> <strong>pozitif</strong> KATALAZ negatif <strong>koklar</strong><br />

Streptococcus<br />

S.pyogenes


2-<strong>Gram</strong> <strong>pozitif</strong> KATALAZ negatif <strong>koklar</strong><br />

Streptococcus-Testler<br />

Optokin S- pnomokok<br />

Mukoid koloni


2-<strong>Gram</strong> <strong>pozitif</strong> KATALAZ negatif <strong>koklar</strong><br />

S.aureus<br />

Streptococcus-Testler<br />

S.agalactia<br />

CAMP test- B grubu- sinerjik etki


2-<strong>Gram</strong> <strong>pozitif</strong> KATALAZ negatif <strong>koklar</strong><br />

Streptococcus-Testler<br />

Safrada erime deneyleri tüp-plak


2-<strong>Gram</strong> <strong>pozitif</strong> KATALAZ negatif <strong>koklar</strong><br />

Streptococcus-Testler<br />

E.faeceium +<br />

S.bovis -<br />

Pyrrolidonyl<br />

arylamidase<br />

S.pyogenes +


2-<strong>Gram</strong> <strong>pozitif</strong> KATALAZ negatif <strong>koklar</strong><br />

Streptococcus-Testler<br />

Safra eskülin agar<br />

Enterokokus (+)


2-<strong>Gram</strong> <strong>pozitif</strong> KATALAZ negatif <strong>koklar</strong><br />

Streptococcus-Testler<br />

%6.5 NaCl buyyonda üreme<br />

entero<strong>koklar</strong>ı (Pozitif)<br />

non-entero<strong>koklar</strong>dan ayırır(Negatif).


2-<strong>Gram</strong> <strong>pozitif</strong> KATALAZ negatif <strong>koklar</strong><br />

Streptococcus-Testler<br />

+ -<br />

Hippurat hidrolizi- S.agalactiae +<br />

K.aerogenes +<br />

Hippurat benzoat + ferrik klorür


2-<strong>Gram</strong> <strong>pozitif</strong> KATALAZ negatif <strong>koklar</strong><br />

Servikal<br />

örnekler<br />

Boğaz<br />

örnekleri<br />

Streptococcus-Testler<br />

Hızlı tanı LATEX aglütinasyonu<br />

IFA,ELISA,DNA PROB


<strong>Gram</strong> negatif <strong>koklar</strong><br />

• Neisseriaceae ailesi<br />

– Neisserialar<br />

N. menengitis<br />

N. gonore<br />

– Moraxella<br />

– Acinetobacter<br />

– Eikinella<br />

– Kingella ...


<strong>Gram</strong> negatif <strong>koklar</strong><br />

• Gr (-) diplokok<br />

• Aerop<br />

Neisserialar<br />

• Hareketsiz, sporsuz<br />

• Bazen kapsüllü<br />

• Oksidaz <strong>pozitif</strong><br />

• Katalaz <strong>pozitif</strong> (N.elongata dışında)<br />

• Çoğu flora elemanı


<strong>Gram</strong> negatif <strong>koklar</strong><br />

Neisserialar<br />

Thayer martin ve çikolata agarda üreme


<strong>Gram</strong> negatif <strong>koklar</strong><br />

Neisserialar<br />

Bütirat testi


<strong>Gram</strong> negatif <strong>koklar</strong><br />

Neisserialar<br />

OKSİDAZ


<strong>Gram</strong> negatif <strong>koklar</strong><br />

Neisserialar


<strong>Gram</strong> negatif <strong>koklar</strong><br />

Neisserialar


<strong>Gram</strong> negatif <strong>koklar</strong><br />

Acinetobacter<br />

• Oksidaz-laktoz negatif<br />

• Nitrat redüksiyonu negatif<br />

• Hareketsiz, kapsüllü<br />

• Nasokomiyal infeksiyon<br />

• Direnç…


<strong>Gram</strong> negatif <strong>koklar</strong><br />

Acinetobacter


3-<strong>Gram</strong> <strong>pozitif</strong> basiller<br />

<strong>Gram</strong> Pozitif Basiller<br />

+<br />

aerop anaerop<br />

Clostridium spp


3-<strong>Gram</strong> <strong>pozitif</strong> aerop basiller<br />

Basilluslar<br />

• Aerop, <strong>Gram</strong> <strong>pozitif</strong>, parelel zincirler<br />

• Sporlu, şekli bozmayan<br />

• Kapsüllü – infekte materyalde (B.atrachis)<br />

• Doğada yaygın<br />

– B.cereus - besin zehirlenmesi,pirinç<br />

– B.subtilis – kontaminasyon, süt ekşime<br />

– B.atrachis – püstüla malign, şarbon


3-<strong>Gram</strong> <strong>pozitif</strong> sporlu aerop basiller<br />

Bacillus subtilis ,sub-terminal spor


3-<strong>Gram</strong> <strong>pozitif</strong> sporlu aerop basiller<br />

Bacillus cereus <strong>Gram</strong> boyama, hemolitik koloniler


3-<strong>Gram</strong> <strong>pozitif</strong> sporlu aerop basiller<br />

Bacillus anthracis Non-hemolitik, düz, koloniler<br />

5% koyun kanlı agar


3-<strong>Gram</strong> <strong>pozitif</strong> sporlu aerop basiller<br />

Basilluslar<br />

B.anthracis<br />

Hareket -<br />

Kapsül +<br />

Beta hemoliz -<br />

10 u penisilin S<br />

B.cereus<br />

+<br />

-<br />

+<br />

R


+<br />

aerop anaerop<br />

Lactobasillus<br />

Clostridium spp


3-<strong>Gram</strong> <strong>pozitif</strong> sporlu ANaerop basiller<br />

• Sporlu, anaerop, basil<br />

Clostridium<br />

• Santral, sub-terminal,terminal<br />

• Florada ve doğada yaygın<br />

C.tetani<br />

C.botulinum: besin zehirlenmesi<br />

C.perfringers (welchii): septik miyozit,gazlı gangren,gıda zehirl.<br />

C.difficile :Pseudomembranoz enterokolit<br />

• Tanı zor: Klinik + Dokudan hazırlanan <strong>Gram</strong> boyama


3-<strong>Gram</strong> <strong>pozitif</strong> sporlu Anaerop basiller<br />

C.tetani, terminal spor


3-<strong>Gram</strong> <strong>pozitif</strong> Anaerop basiller<br />

Lactobacillus<br />

subakut endokarditli hasta<br />

GENİTAL FLORA ÜYESİ<br />

Lactobaslluslar<br />

Lactobacillus Smear intrauterin<br />

mukozada


+<br />

aerop anaerop<br />

Clostridium spp


3-<strong>Gram</strong> <strong>pozitif</strong> basiller<br />

Corynebacteriumlar<br />

• <strong>Gram</strong> <strong>pozitif</strong>, fakültatif anaerop<br />

• Flora üyesi<br />

• X,V,L, Çin harfleri<br />

– C. diphteria<br />

Metakromatik cisim- löfflerin metilen mavisi-<br />

Babest-ernest granülleri<br />

Tellüritli besiyerinde siyah koloni


3-<strong>Gram</strong> <strong>pozitif</strong> basiller<br />

Corynebacterium jeikeium <strong>Gram</strong> boyama peritoneal sıvı


3-<strong>Gram</strong> <strong>pozitif</strong> basiller<br />

Difteroit <strong>Gram</strong> boyama


3-<strong>Gram</strong> <strong>pozitif</strong> basiller<br />

C. diphteria - metilen mavisi


3-<strong>Gram</strong> <strong>pozitif</strong> basiller<br />

C. diphteria – potasyum tellurit


<strong>Gram</strong> Negatif Basiller


Enterobactericeae üyeleri<br />

• E. coli<br />

• Shigella<br />

• Salmonella<br />

• Citrobacter<br />

• Klebsiella<br />

• Enterobacter<br />

• Hafnia<br />

• Proteus<br />

• Providencia<br />

• Moranella<br />

• Yersinia<br />

• Erwinia<br />

• Serratia<br />

• Erdwardsiella<br />

• Yokenella<br />

• Xenorhabdus<br />

• Trabuisiella<br />

• Tatumella<br />

• Rahnella<br />

• Photohalodus<br />

• Pantoea<br />

• Pragia<br />

• Obesumbacterium<br />

• Moellerella<br />

• Budvicia<br />

• ButtiauxellaCedecea<br />

• Ewingella<br />

• Kluyvera<br />

• Leclercia<br />

• Leminorella


Enterobactericeae özellikleri<br />

• Gr (-) basil<br />

• Sporsuz, fakültatif anaerop<br />

• Fermantatif (glikozu asit,gaz +-)<br />

• Katalaz (+) S. dysenteria O grup 1 hariç<br />

• Oksidaz (-)<br />

o Çoğu hareketli Klebsiella<br />

Y. pestis<br />

Shigella<br />

Bazı Salmonella serovarları


Enterobactericeae özellikleri<br />

• Laktoz (-)<br />

Salmonella<br />

Shigella<br />

Proteus<br />

Serratia<br />

Yersinia<br />

Morganella<br />

Edwardsiella<br />

• Laktoz (+)<br />

Escherichia coli<br />

Enterobacter<br />

Klebsiella<br />

Citrobacter*<br />

Serratia*<br />

Hafnia*<br />

Providencia*<br />

* Geç fermentasyon 24 sa.


Hektoen<br />

enterik<br />

agar<br />

A. Escherichia coli<br />

B. Escherichia coli & Klebsiella pneumoniae karbonhidrat fermantasyonu ve asit oluşumu<br />

C: Salmonella sp.<br />

D: Proteus mirabilis<br />

Hem Salmonella sp. & Proteus mirabilis hidrojen sulfit oluşturur.<br />

E: Pseudomona aeruginosa Renksiz koloni


Enterobactericeae- Testler<br />

Salmonella- hidrojen<br />

sülfit oluşumu


Enterobactericeae- Testler<br />

EMB- E.coli


Enterobactericeae- Testler<br />

E.coli<br />

XLD Agar<br />

Salmonella


Enterobactericeae- Testler<br />

Kanlı Agar<br />

Proteus spp.-Tipik deniz dalgası


Enterobactericeae- Testler<br />

CIN Agar<br />

Y.enterocolitica selektif by.


Enterobactericeae- Testler<br />

Sorbitol (-)<br />

Sorbitollu McConkey<br />

E.coli O157:H7 tespiti


Enterobactericeae- Testler<br />

OKSİDAZ<br />

Tetra metil p fenilen diamin oksidaz etkileşimi<br />

Pseudomonas,Neisseria,Vibrio,Aeromonas


Enterobactericeae- Testler<br />

INDOL<br />

Triptofonaz<br />

Triptofan İndol<br />

kovaks ayıracı<br />

Para dimetil-<br />

amino-benzaldehit


Enterobactericeae- Testler<br />

HAREKET


Enterobactericeae- Testler<br />

METİL KIRMIZISI TESTİ<br />

Glikoz fermentasyonu ve asit oluşumu ?


Enterobactericeae- Testler<br />

-<br />

NİTRAT REDÜKSİYONU<br />

+


Enterobactericeae- Testler<br />

TSI


Enterobactericeae- Testler<br />

SİTRAT


Enterobactericeae- Testler<br />

VOGES PROSKAUER<br />

Glikoz asetil metil karbinol oluşumu?<br />

Alfa naftol + KOH ayıracı


Enterobactericeae - Testler<br />

ÜRE<br />

Üreaz enzimi, Proteus spp.


Enterobactericeae - Testler<br />

ONPG<br />

(ORTO NİTRO FENİL BETA GALAKTOZİDAZ)<br />

Laktozlu besiyerinde üremiş<br />

koloni<br />

Tuzlu su süspansiyonu<br />

Toluen ve ONPG eriği<br />

Etüv<br />

1-8-18 sa kontrol<br />

Laktozu geç parçalayan bakterilerin hızlı tespiti


• Doğada yaygın<br />

• P.aeruginosa<br />

Non fermantatif<br />

<strong>Gram</strong> (-) Basiller<br />

– Sporsuz, kapsülsüsz, haraketli,<br />

– Oksidaz ve katalaz <strong>pozitif</strong>,laktoz negatif<br />

– Pyoverdin ve pyosiyanin* pigmentleri<br />

– 41 C de de üreyebilir (P.floresccens ayırır)<br />

– Aromatik meyve kokusu<br />

– İndol,H2S,VP,Metil Kırmızısı negatif<br />

*p.aeruginosa tipik, antibakteryel


Non fermantatifler<br />

Mac conkey- laktoz<br />

negatif koloni<br />

Pseudomonas<br />

Kanlı By.


Non fermantatifler<br />

Pseudomonas<br />

Pyoverdin ve pyosiyanin<br />

Ayrıca pyorubrin, pyomelanin pigmenti oluşturabilirler


Non fermantatifler<br />

Pseudomonas<br />

Pyoverdin - Müller Hilton agar


Non fermantatifler<br />

Pseudomonas<br />

UV Test- Floresein


Ticari Test Kitleri<br />

• Sık kullanılan hızlı tanı yönt.<br />

– Enterotube II (BD Bioscience, Cockeysville, MD)<br />

– API 20E (BioMerieux Vitek Inc., Hazelwood MO)


OTOMATİZE SİSTEMLER<br />

• Hastanelerde inokülasyonuda içeren otomatize hızlı ID sistemleri<br />

kullanılmaktadir<br />

- VITEK vb.<br />

• Birçok örneği aynı anda optik senserleri ile okuyarak antibiyogram<br />

testlerinide uygulayan bilgisayar yazılımlarıdır.<br />

• Hata payı çok düşük ve identifikasyon spektrumu çok<br />

geniştir.Onlarca reaksiyonu değerlendirirler<br />

• Saf koloni oluşturulmalı<br />

• Maliyet artışı


TEŞEKKÜRLER

Hooray! Your file is uploaded and ready to be published.

Saved successfully!

Ooh no, something went wrong!