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(19) 대한민국특허청(KR) (12) 공개특허공보(A) - Questel

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(51) Int. Cl.<br />

(<strong>19</strong>) <strong>대한민국특허청</strong>(<strong>KR</strong>)<br />

(<strong>12</strong>) <strong>공개특허공보</strong>(A)<br />

C07K 14/11 (2006.01) A61K 39/42 (2006.01)<br />

C<strong>12</strong>N 7/01 (2006.01) C<strong>12</strong>N 15/11 (2006.01)<br />

(21) 출원번호 10-2009-7003756<br />

(22) 출원일자 2009년02월24일<br />

심사청구일자 없음<br />

번역문제출일자 2009년02월24일<br />

(86) 국제출원번호 PCT/US2007/075585<br />

국제출원일자 2007년08월09일<br />

(87) 국제공개번호 WO 2008/02<strong>19</strong>59<br />

국제공개일자 2008년02월21일<br />

(30) 우선권주장<br />

60/821,832 2006년08월09일 미국(US)<br />

60/942,804 2007년06월08일 미국(US)<br />

전체 청구항 수 : 총 71 항<br />

(54) 인플루엔자 헤마글루티닌 및 뉴라미니다제 변이체<br />

(57) 요 약<br />

(11) 공개번호 10-2009-0053794<br />

(43) 공개일자 2009년05월27일<br />

(71) 출원인<br />

메디뮨 엘엘씨<br />

미국 20878 메릴랜드주 게이테르스부르크 원 메디<br />

뮨 웨이<br />

더 가번먼트 오브 더 유나이티드 스테이츠 오브<br />

아메리카, 내셔널 인스티튜츠 오브 헬스<br />

미국 메릴랜드주 20852 록크빌 6011 이그제큐티브<br />

불바드 스위트 325<br />

(72) 발명자<br />

양 친-펭<br />

미국 캘리포니아주 95<strong>12</strong>9 산 호세 카탈리나 드라<br />

이브 4581<br />

켐블 조지<br />

미국 캘리포니아주 95070 사라토가 바이어 그랜드<br />

드라이브 <strong>19</strong>585<br />

(뒷면에 계속)<br />

(74) 대리인<br />

김성기, 김진회<br />

(조류 범유행성) 인플루엔자 헤마글루티닌 및 뉴라미니다제 변이체를 포함하는 폴리펩티드, 폴리뉴클레오티드,<br />

방법, 조성물을 제공한다.<br />

- 1 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


(72) 발명자<br />

서바라오 칸타<br />

미국 워싱톤 디씨 20009 노스웨스트 윌러드 스트리<br />

트 1720<br />

- 2 -<br />

머피 브라이언<br />

공개특허 10-2009-0053794<br />

미국 매릴랜드주 베데스다 투스카라워스 로드 5410


특허청구의 범위<br />

청구항 1<br />

a) 서열 번호 21-26 또는 33-38 또는 45 중 어느 하나에 제시된 뉴클레오티드에 의해 코딩된 아미노산 서열을<br />

포함하는 폴리펩티드;<br />

b) 서열 번호 27-32 또는 39-44 중 어느 하나에 제시된 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩티드;<br />

c) 서열 번호 27-32 또는 39-44 중 어느 하나에 제시된 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩티드의 성숙 형태;<br />

d) 고도로 엄격한 조건하에서 (a), (b) 또는 (c)를 코딩하는 뉴클레오티드 서열을 포함하는 폴리뉴클레오티드에<br />

하이브리드화하는 폴리뉴클레오티드에 의해 코딩된 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩티드; 및<br />

e) (b)의 폴리펩티드와 90% 이상의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩티드로 구성된 군으로<br />

부터 선택되는 단리된 폴리펩티드.<br />

청구항 2<br />

제1항의 하나 이상의 폴리펩티드의 면역학적 유효량을 포함하는 면역원성 조성물.<br />

청구항 3<br />

제1항의 폴리펩티드에 특이적으로 결합하는 단리된 항체.<br />

청구항 4<br />

생리학적으로 허용되는 담체 중의 제1항의 폴리펩티드의 면역학적 유효량을 개체에게 투여하는 단계를<br />

포함하는, 인플루엔자 바이러스에 대한 방어 면역 반응을 형성하기 위해 개체의 면역계를 자극하는 방법.<br />

청구항 5<br />

제1항의 폴리펩티드를 포함하는 재조합 인플루엔자 바이러스.<br />

청구항 6<br />

제5항의 재조합 인플루엔자 바이러스의 면역학적 유효량을 포함하는 면역원성 조성물.<br />

청구항 7<br />

생리학적으로 허용되는 담체 중의 제5항의 재조합 인플루엔자 바이러스의 면역학적 유효량을 개체에게 투여하는<br />

단계를 포함하는, 인플루엔자 바이러스에 대한 방어 면역 반응을 형성하기 위해 개체의 면역계를 자극하는<br />

방법.<br />

청구항 8<br />

a) 서열 번호 21-26 또는 33-38 또는 45 중 어느 하나에 제시된 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 상보적 서열을<br />

포함하는 폴리뉴클레오티드;<br />

b) 서열 번호 27-32 또는 39-44 중 어느 하나에 제시된 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩티드를 코딩하는 뉴클<br />

레오티드 서열, 또는 그의 상보적 뉴클레오티드 서열을 포함하는 폴리뉴클레오티드;<br />

c) 고도로 엄격한 조건하에서 실질적으로 전길이의 (a)의 폴리뉴클레오티드에 걸쳐 하이브리드화하는 폴리뉴클<br />

레오티드; 및<br />

d) (a)의 폴리뉴클레오티드와 98% 이상의 서열 동일성을 갖는 뉴클레오티드 서열을 포함하는 폴리뉴클레오티드<br />

로 구성된 군으로부터 선택되는 단리된 폴리뉴클레오티드.<br />

청구항 9<br />

제8항의 하나 이상의 폴리뉴클레오티드를 포함하는 면역원성 조성물.<br />

- 3 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


청구항 10<br />

제8항의 하나 이상의 폴리뉴클레오티드를 포함하는 세포.<br />

청구항 11<br />

제8항의 폴리뉴클레오티드를 포함하는 벡터.<br />

청구항 <strong>12</strong><br />

제11항에 있어서, 플라스미드, 코스미드, 파지, 바이러스, 또는 바이러스의 단편인 벡터.<br />

청구항 13<br />

제<strong>12</strong>항에 있어서, 발현 벡터인 벡터.<br />

청구항 14<br />

제13항의 벡터를 포함하는 세포.<br />

청구항 15<br />

제8항의 하나 이상의 폴리뉴클레오티드를 포함하는 인플루엔자 바이러스.<br />

청구항 16<br />

제15항에 있어서, 재배열(reassortant) 바이러스인 바이러스.<br />

청구항 17<br />

A/앤 아버/6/60으로부터의 6개의 내부 게놈 분절과, 서열 번호 27-32, 및 39-44의 폴리펩티드로 구성된 군으로<br />

부터 선택되는 HA 및/또는 NA 폴리펩티드를 코딩하는 2개의 게놈 분절을 포함하는 6:2 재배열 인플루엔자 바이<br />

러스.<br />

청구항 18<br />

폴리뉴클레오티드가 발현될 수 있도록 하는 조건하에 적합한 배양 배지에서 제14항의 세포를 배양하는 단계; 및<br />

상기 세포를 포함하는 세포 군집 또는 배지로부터 재배열 인플루엔자 바이러스를 단리하는 단계를 포함하는, 재<br />

배열 인플루엔자 바이러스를 생성하는 방법.<br />

청구항 <strong>19</strong><br />

제17항의 재배열 인플루엔자 바이러스의 면역학적 유효량을 포함하는 면역원성 조성물.<br />

청구항 20<br />

생리학적으로 유효한 담체 중의 제17항의 재배열 인플루엔자 바이러스의 면역학적 유효량을 개체에게 투여하는<br />

단계를 포함하는, 인플루엔자 바이러스에 대한 방어 면역 반응을 형성하기 위해 개체의 면역계를 자극하는<br />

방법.<br />

청구항 21<br />

폴리뉴클레오티드가 발현될 수 있도록 하는 조건하에 적합한 배양 배지에서 제10항의 세포를 배양하는 단계; 및<br />

세포 또는 배지로부터 폴리펩티드를 단리하는 단계를 포함하는, 단리된 또는 재조합 폴리펩티드를 생성하는 방<br />

법.<br />

청구항 22<br />

바이러스 감염에 대한 면역원성 반응을 형성하는데 유효한 양으로 제17항의 바이러스를 피험체에게 투여하는 단<br />

계를 포함하는, 피험체에서 바이러스 감염을 예방학적으로 또는 치료학적으로 치료하는 방법.<br />

- 4 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


청구항 23<br />

제22항에 있어서, 피험체가 인간인 방법.<br />

청구항 24<br />

제<strong>19</strong>항에 있어서, 헤마글루티닌이 변형된 다염기 절단 부위를 포함하는 면역원성 조성물.<br />

청구항 25<br />

제<strong>19</strong>항의 조성물을 포함하는 약독화 인플루엔자 생백신.<br />

청구항 26<br />

제<strong>19</strong>항의 조성물을 포함하는 분할(split) 바이러스 또는 사멸 바이러스 백신.<br />

청구항 27<br />

제24항의 조성물을 포함하는 약독화 인플루엔자 생백신.<br />

청구항 28<br />

제24항의 조성물을 포함하는 분할 바이러스 또는 사멸 바이러스 백신.<br />

청구항 29<br />

i) 인플루엔자 바이러스의 복제를 지지할 수 있는 숙주 세포 군집으로, A/앤 아버/6/60의 6개 이상의 내부 게놈<br />

분절; 및 서열 번호 27-32, 및 39-44의 폴리펩티드로 구성된 군으로부터 선택되는 HA 및/또는 NA 폴리펩티드를<br />

코딩하는 폴리뉴클레오티드를 포함하는 하나 이상의 게놈 분절에 상응하는 뉴클레오티드 서열을 포함하는 복수<br />

의 벡터를 도입하는 단계;<br />

ii) 35℃이하의 온도에서 숙주 세포 군집을 배양하는 단계; 및<br />

iii) 인플루엔자 바이러스를 회수하는 단계를 포함하는, 세포 배양물에서 인플루엔자 바이러스를 생성하는<br />

방법.<br />

청구항 30<br />

제29항에 있어서, HA 및/또는 NA 폴리펩티드를 코딩하는 폴리뉴클레오티드가<br />

a) 서열 번호 21, 23-26 또는 33-38, 또는 45 중 어느 하나의 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 상보적 뉴클레오티<br />

드 서열을 포함하는 폴리뉴클레오티드;<br />

b) 서열 번호 27-32 또는 39-44 중 어느 하나에 제시된 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩티드를 코딩하는 뉴클<br />

레오티드 서열, 또는 그의 상보적 뉴클레오티드 서열을 포함하는 폴리뉴클레오티드;<br />

c) 고도로 엄격한 조건하에서 실질적으로 전길이의 (a)의 폴리뉴클레오티드에 걸쳐 하이브리드화하는 폴리뉴클<br />

레오티드; 및<br />

d) (a)의 폴리뉴클레오티드와 98% 이상의 서열 동일성을 갖는 뉴클레오티드 서열을 포함하는 폴리뉴클레오티드<br />

로 구성된 군으로부터 선택되는 것인 방법.<br />

청구항 31<br />

제29항의 방법에 의해 생성된 인플루엔자 바이러스의 면역학적 유효량을 포함하는 면역원성 조성물.<br />

청구항 32<br />

제30항의 방법에 의해 생성된 인플루엔자 바이러스의 면역학적 유효량을 포함하는 면역원성 조성물.<br />

청구항 33<br />

생리학적으로 유효한 담체 중의 제29항의 방법에 의해 생성된 인플루엔자 바이러스의 면역학적 유효량을 개체에<br />

- 5 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


게 투여하는 단계를 포함하는, 인플루엔자 바이러스에 대한 방어 면역 반응을 형성하기 위해 개체의 면역계를<br />

자극하는 방법.<br />

청구항 34<br />

생리학적으로 유효한 담체 중의 제30항의 방법에 의해 생성된 인플루엔자 바이러스의 면역학적 유효량을 개체에<br />

게 투여하는 단계를 포함하는, 인플루엔자 바이러스에 대한 방어 면역 반응을 형성하기 위해 개체의 면역계를<br />

자극하는 방법.<br />

청구항 35<br />

제31항의 면역원성 조성물을 개체에게 투여하는 단계를 포함하는, 인플루엔자 바이러스에 대한 방어 면역 반응<br />

을 형성하기 위해 개체의 면역계를 자극하는 방법.<br />

청구항 36<br />

제32항의 면역원성 조성물을 개체에게 투여하는 단계를 포함하는, 인플루엔자 바이러스에 대한 방어 면역 반응<br />

을 형성하기 위해 개체의 면역계를 자극하는 방법.<br />

청구항 37<br />

제31항의 면역원성 조성물을 포함하는 약독화 인플루엔자 생백신.<br />

청구항 38<br />

제32항의 면역원성 조성물을 포함하는 분할 바이러스 또는 사멸 바이러스 백신.<br />

청구항 39<br />

A/앤 아버/6/60 이외의 하나 이상의 공여 바이러스로부터의 6개의 내부 게놈 분절과, 서열 번호 27-32, 및 39-<br />

44의 폴리펩티드로 구성된 군으로부터 선택되는 HA 및/또는 NA 폴리펩티드를 코딩하는 2개의 게놈 분절을 포함<br />

하는 6:2 재배열 인플루엔자 바이러스.<br />

청구항 40<br />

제39항에 있어서, 상기 공여 바이러스가 온도 감수성, 저온 적응성, 또는 약독화 표현형 중 하나 이상을 포함<br />

하는 것인 6:2 재배열 인플루엔자 바이러스.<br />

청구항 41<br />

제39항에 있어서, 상기 공여 바이러스가 PR8인 6:2 재배열 인플루엔자 바이러스.<br />

청구항 42<br />

제39항에 있어서, 상기 공여 바이러스가 A/레닌그라드/17인 6:2 재배열 인플루엔자 바이러스.<br />

청구항 43<br />

제39항의 재배열 인플루엔자 바이러스의 면역학적 유효량을 포함하는 면역원성 조성물.<br />

청구항 44<br />

제40항의 재배열 인플루엔자 바이러스의 면역학적 유효량을 포함하는 면역원성 조성물.<br />

청구항 45<br />

제41항의 재배열 인플루엔자 바이러스의 면역학적 유효량을 포함하는 면역원성 조성물.<br />

청구항 46<br />

제42항의 재배열 인플루엔자 바이러스의 면역학적 유효량을 포함하는 면역원성 조성물.<br />

- 6 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


청구항 47<br />

생리학적으로 유효한 담체 중의 제39항의 재배열 인플루엔자 바이러스의 면역학적 유효량을 개체에게 투여하는<br />

단계를 포함하는, 인플루엔자 바이러스에 대한 방어 면역 반응을 형성하기 위해 개체의 면역계를 자극하는<br />

방법.<br />

청구항 48<br />

생리학적으로 유효한 담체 중의 제40항의 재배열 인플루엔자 바이러스의 면역학적 유효량을 개체에게 투여하는<br />

단계를 포함하는, 인플루엔자 바이러스에 대한 방어 면역 반응을 형성하기 위해 개체의 면역계를 자극하는<br />

방법.<br />

청구항 49<br />

생리학적으로 유효한 담체 중의 제41항의 재배열 인플루엔자 바이러스의 면역학적 유효량을 개체에게 투여하는<br />

단계를 포함하는, 인플루엔자 바이러스에 대한 방어 면역 반응을 형성하기 위해 개체의 면역계를 자극하는<br />

방법.<br />

청구항 50<br />

생리학적으로 유효한 담체 중의 제42항의 재배열 인플루엔자 바이러스의 면역학적 유효량을 개체에게 투여하는<br />

단계를 포함하는, 인플루엔자 바이러스에 대한 방어 면역 반응을 형성하기 위해 개체의 면역계를 자극하는<br />

방법.<br />

청구항 51<br />

바이러스 감염에 대한 면역원성 반응을 형성하는데 유효한 양으로 제39항의 바이러스를 피험체에게 투여하는 단<br />

계를 포함하는, 피험체에서 바이러스 감염을 예방학적으로 또는 치료학적으로 치료하는 방법.<br />

청구항 52<br />

바이러스 감염에 대한 면역원성 반응을 형성하는데 유효한 양으로 제41항의 바이러스를 피험체에게 투여하는 단<br />

계를 포함하는, 피험체에서 바이러스 감염을 예방학적으로 또는 치료학적으로 치료하는 방법.<br />

청구항 53<br />

바이러스 감염에 대한 면역원성 반응을 형성하는데 유효한 양으로 제42항의 바이러스를 피험체에게 투여하는 단<br />

계를 포함하는, 피험체에서 바이러스 감염을 예방학적으로 또는 치료학적으로 치료하는 방법.<br />

청구항 54<br />

제51항에 있어서, 상기 바이러스가 사멸 또는 불활성화된 것인 방법.<br />

청구항 55<br />

제52항에 있어서, 상기 바이러스가 사멸 또는 불활성화된 것인 방법.<br />

청구항 56<br />

제53항에 있어서, 상기 바이러스가 사멸 또는 불활성화된 것인 방법.<br />

청구항 57<br />

제43항에 있어서, 헤마글루티닌이 변형된 다염기 절단 부위를 포함하는 면역원성 조성물.<br />

청구항 58<br />

제44항에 있어서, 헤마글루티닌이 변형된 다염기 절단 부위를 포함하는 면역원성 조성물.<br />

청구항 59<br />

- 7 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


제45항에 있어서, 헤마글루티닌이 변형된 다염기 절단 부위를 포함하는 면역원성 조성물.<br />

청구항 60<br />

제46항에 있어서, 헤마글루티닌이 변형된 다염기 절단 부위를 포함하는 면역원성 조성물.<br />

청구항 61<br />

제47항에 있어서, 피험체가 인간인 방법.<br />

청구항 62<br />

제48항에 있어서, 피험체가 인간인 방법.<br />

청구항 63<br />

제49항에 있어서, 피험체가 인간인 방법.<br />

청구항 64<br />

제45항의 조성물을 포함하는 약독화 인플루엔자 생백신.<br />

청구항 65<br />

제46항의 조성물을 포함하는 약독화 인플루엔자 생백신.<br />

청구항 66<br />

i) 인플루엔자 바이러스의 복제를 지지할 수 있는 숙주 세포 군집으로,<br />

(a) A/앤 아버/6/60이 아닌 제1 인플루엔자 균주의 6개 이상의 내부 게놈 분절; 및 서열 번호 27-32, 및 39-<br />

44의 폴리펩티드로 구성된 군으로부터 선택되는 HA 또는 NA 폴리펩티드를 코딩하는 하나 이상의 게놈 분절; 또<br />

는<br />

(b) A/앤 아버/6/60이 아니며, 약독화, 저온 적응성 및 온도 감수성으로 구성된 군으로부터 선택되는 하나 이상<br />

의 표현형 특질을 포함하는 제1 인플루엔자 균주의 6개 이상의 내부 게놈 분절; 및 서열 번호 27-32, 및 39-<br />

44의 폴리펩티드로 구성된 군으로부터 선택되는 HA 또는 NA 폴리펩티드를 코딩하는 하나 이상의 게놈 분절<br />

에 상응하는 뉴클레오티드 서열을 포함하는 복수의 벡터를 도입하는 단계;<br />

ii) 35℃이하의 온도에서 숙주 세포 군집을 배양하는 단계; 및<br />

iii) 인플루엔자 바이러스를 회수하는 단계를 포함하는, 세포 배양물에서 인플루엔자 바이러스를 생성하는<br />

방법.<br />

청구항 67<br />

제66항의 방법에 의해 생성된 인플루엔자 바이러스의 면역학적 유효량을 포함하는 면역원성 조성물.<br />

청구항 68<br />

생리학적으로 유효한 담체 중의 제66항의 방법에 의해 생성된 인플루엔자 바이러스의 면역학적 유효량을 개체에<br />

게 투여하는 단계를 포함하는, 인플루엔자 바이러스에 대한 방어 면역 반응을 형성하기 위해 개체의 면역계를<br />

자극하는 방법.<br />

청구항 69<br />

제67항의 면역원성 조성물을 개체에게 투여하는 단계를 포함하는, 인플루엔자 바이러스에 대한 방어 면역 반응<br />

을 형성하기 위해 개체의 면역계를 자극하는 방법.<br />

청구항 70<br />

제67항의 면역원성 조성물을 포함하는 약독화 인플루엔자 생백신.<br />

- 8 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


<br />

<br />

<br />

<br />

<br />

청구항 71<br />

제67항의 면역원성 조성물을 포함하는 분할 바이러스 또는 사멸 바이러스 백신.<br />

명 세 서<br />

배 경 기 술<br />

매년 많은 개체들이 상이한 인플루엔자 바이러스 균주와 상이한 유형의 인플루엔자 바이러스로 감염되고 있기<br />

때문에 지역 사회 보건 관점에서 뿐만 아니라, 상업적인 측면에 있어서 다양하며 진화하고 있는 인플루엔자 균<br />

주에 대한 백신이 중요하다. 유아, 노인, 적절한 건강 관리를 받지 못하는 개체 및 면역이 약화된 사람은 특히<br />

상기와 같은 감염으로부터 사망할 위험에 있다. 인플루엔자 감염의 문제를 악화시키는 것은 신규한 인플루엔자<br />

균주가 쉽게 진화하며, 다양한 종 사이에서 퍼질 수 있다는 것이며, 이로 인해 새로운 백신이 연속적으로 생산<br />

되어야 한다.<br />

상기와 같이 상이한 인플루엔자 바이러스/바이러스 균주에 대해 특이적인 방어 면역 반응을 일으킬 수 있는 다<br />

수의 백신이 50여년간 제조되었으며, 이는 전 바이러스 백신, 분할(split) 바이러스 백신, 표면 항원 백신 및<br />

생 약독화 바이러스 백신을 포함한다. 그러나, 이들 백신 유형들 중 어느 것의 적절한 제제가 전신 면역 반응을<br />

일으킬 수 있는 반면, 생 약독화 바이러스 백신은 기도내 국소적인 점막 면역을 자극시킬 수 있는 장점도 갖고<br />

있다. 백신 제조를 위해 인플루엔자 바이러스, 및 그의 단편을 제조하는 상당수의 연구들이 본 발명자와 동료들<br />

에 의해 이루어졌다; 예를 들면, 미국 출원 번호 제60/420,708호(2002년 10월 23일 출원); 제60/574,117호<br />

(2004년 5월 24일 출원); 제10/423,828호(2003년 4월 25일 출원); 제60/578,962호(2004년 6월 <strong>12</strong>일 출원); 및<br />

제10/870,690호(2004년 6월 16일 출원)(상기의 개시 내용이 본원에서 참고로 인용된다)를 참조한다.<br />

상이한 인플루엔자 균주의 연속적인 출현(또는 재출현)으로 인하여 새로운 인플루엔자 백신이 계속적으로 요구<br />

되고 있다. 그러한 백신은 전형적으로 새롭게 출현한 바이러스 균주의 항원 부분을 사용하여 재조되는 바, 신규<br />

한, 새롭게 출현한, 또는 새롭게 재출현한 바이러스 균주의 폴리펩티드 및 폴리뉴클레오티드(특히 항원 유전자<br />

서열)가 매우 바람직할 수 있다.<br />

본 발명은 여러 유형의 백신 제조에서 뿐만 아니라, 연구, 진단 등에서 사용될 수 있는, 신규의 및/또는 새롭게<br />

단리된 인플루엔자 헤마글루티닌 및 뉴라미니다제 변이체를 제공한다. 많은 다른 잇점들은 하기 리뷰를 통해 명<br />

백해질 것이다.<br />

발명의 상세한 설명<br />

발명의 요약<br />

본원의 몇몇 측면에서, 본 발명은 서열 번호 1부터 서열 번호 10, 또는 서열 번호 21부터 서열 번호 26, 또는<br />

서열 번호 33부터 서열 번호 38에 의해 코딩되는 폴리펩티드 중 어느 하나; 서열 번호 11부터 서열 번호 20, 또<br />

는 서열 번호 27부터 서열 번호 32, 또는 서열 번호 39부터 서열 번호 44의 폴리펩티드 중 어느 하나; 오직, 서<br />

열 번호 11부터 서열 번호 20, 또는 서열 번호 27부터 서열 번호 32, 또는 서열 번호 39부터 서열 번호 44의 폴<br />

리펩티드를 코딩하는 오픈 리딩 프레임만; 서열 번호 11-20, 또는 서열 번호 27-32, 또는 서열 번호 39-44의 폴<br />

리펩티드의 임의의 대체 형태(예로서, 신호 펩티드가 없는 성숙한 형태, 또는 오픈 리딩 프레임 바깥쪽 5' 및<br />

3' 서열이 없는 성숙한 형태, 또는 바이러스(예로서, 인플루엔자) 표면상에서 발현되는 서열이 없는 성숙한 형<br />

태); 고도로 엄격한 조건하에서 실질적으로 전길이의, 서열 번호 1부터 서열 번호 10, 또는 서열 번호 21부터<br />

서열 번호 26, 서열 번호 33-38, 또는 서열 번호 45의 폴리뉴클레오티드 서열에 걸쳐 하이브리드화하는 폴리뉴<br />

클레오티드 서열에 의해 코딩되는 임의의 폴리펩티드; 고도로 엄격한 조건하에서 서열 번호 1부터 서열 번호<br />

10, 또는 서열 번호 21부터 서열 번호 26, 서열 번호 33-38, 또는 서열 번호 45의 폴리뉴클레오티드 서열에 걸<br />

쳐 하이브리드화하는 폴리뉴클레오티드 서열에 의해 코딩되는 임의의 폴리펩티드; 및 서열이 헤마글루티닌 또는<br />

뉴라미니다제 폴리펩티드를 포함하는 것인 상기중 어느 것의 단편, 또는 헤마글루티닌 또는 뉴라미니다제 폴리<br />

펩티드의 단편, 바람직하게는, 전길이의 본 발명의 폴리펩티드에 특이적으로 결합하는 항체를 생성하는 단편으<br />

로부터 선택되는 단리된 또는 재조합 폴리펩티드를 포함한다. 다양한 실시태양에서, 본 발명의 단리된 또는 재<br />

조합 폴리펩티드는 상기 폴리펩티드 중 어느 것의 약 300개의 인접한 아미노산 잔기와 실질적으로 동일한다. 추<br />

가의 다른 실시태양에서, 본 발명은 상기 폴리펩티드 중 어느 것의 적어도 약 350개 이상의 인접한 아미노산;<br />

적어도 약 400개 이상의 인접한 아미노산; 적어도 약 450개 이상의 인접한 아미노산; 적어도 약 500개 이상의<br />

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공개특허 10-2009-0053794


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인접한 아미노산; 적어도 약 520개 이상의 인접한 아미노산; 적어도 약 550개 이상의 인접한 아미노산; 적어도<br />

약 559개 이상의 인접한 아미노산; 적어도 약 565개 이상의 인접한 아미노산; 또는 적어도 약 566개 이상의 인<br />

접한 아미노산과 실질적으로 동일한 아미노산 서열을 포함하는 단리된 또는 재조합 폴리펩티드를 포함한다. 몇<br />

몇 실시태양에서, 폴리펩티드 서열(예로서, 본원 "서열"에 열거되어 있는 것)은 565개 미만, 559개 미만 등의<br />

아미노산을 포함한다. 그러한 실시태양에서, 열거되어 있는 것 중 더욱 짧은 폴리펩티드는 임의로 565개 미만,<br />

559개 미만 등의 아미노산을 포함한다. 추가의 다른 실시태양에서, 본 발명의 폴리펩티드는 임의로 융합<br />

단백질, 리더 서열을 포함하는 단백질, 전구체 폴리펩티드, 분비 신호 또는 위치 신호를 포함하는 단백질, 또는<br />

에피토프 태그, E-태그, 또는 His 에피토프 태그를 포함하는 단백질을 포함한다. 추가의 다른 실시태양에서, 본<br />

발명은 상기 열거된 것 중 적어도 하나의 폴리펩티드와 적어도 85%, 적어도 90%, 적어도 93%, 적어도 95%, 적어<br />

도 98%, 적어도 98.5%, 적어도 99%, 적어도 99.2%, 적어도 99.4%, 적어도 99.6%, 적어도 99.8%, 또는 적어도<br />

99.9%의 서열 동일성을 갖는 서열을 포함하는 폴리펩티드를 포함한다. 본 발명의 헤마글루티닌 서열은 변형되지<br />

않은 다염기 절단 부위를 포함하는 서열 및 변형된 다염기 절단 부위를 포함하는 서열, 둘 모두를 포함할 수 있<br />

다(이로써, 바이러스는 난(egg)에서 성장할 수 있다). 서열 번호 11, 13, 15, 17, <strong>19</strong>, 27, 29, 31, 39, 41, 또<br />

는 43의 헤마글루티닌 폴리펩티드 서열은 내인성 아미노 말단 신호 펩티드 서열을 포함하지만, 본 발명의 헤마<br />

글루티닌 폴리펩티드 서열은 또한 성숙한 형태의 (아미노 말단 신호 펩티드가 절단된 형태의) 헤마글루티닌 폴<br />

리펩티드를 포함한다. 임의의 인플루엔자 균주의 임의의 헤마글루티닌 폴리펩티드 서열의 절단 부위는 당업계의<br />

임의의 많은 방법을 사용함으로써 통상적으로 결정되거나 예측될 수 있다.<br />

다른 측면에서, 본 발명은 상기 열거된 하나 이상의 폴리펩티드, 또는 그의 단편을 포함하는 조성물을<br />

포함한다. 본 발명은 또한 상기 기술된 적어도 하나의 아미노산 서열, 또는 그의 단편을 포함하는 적어도 1개의<br />

항원에 대해 발생된 폴리클로날 항혈청에 특이적으로 결합하는 폴리펩티드를 포함한다. 상기 기술된 폴리펩티드<br />

에 대하여 특이적인 상기와 같은 항체 또한 본 발명의 특징이 된다. 본 발명의 폴리펩티드는 임의로 면역원성이<br />

다.<br />

본 발명은 또한 상기 기술된 임의의 폴리펩티드들 중 하나 이상을 면역학적 유효량으로 포함하는 면역원성 조성<br />

물 뿐만 아니라, 생리학적으로 허용가능한 담체 중의 상기 임의의 폴리펩티드들을 면역학적 유효량으로 개체에<br />

게 투여하는 단계를 포함하는 개체의 면역계를 자극시켜 인플루엔자 바이러스에 대한 방어 면역 반응을 일으키<br />

는 방법을 포함한다.<br />

추가로, 본 발명은 면역학적 유효량의 상기와 같은 재조합 인플루엔자 바이러스를 포함하는 면역원성 조성물 이<br />

외에, 상기의 하나 이상의 폴리펩티드 또는 폴리뉴클레오티드를 포함하는 재조합 인플루엔자 바이러스를 포함한<br />

다. 생리학적으로 허용가능한 담체 중의 면역학적 유효량의 상기와 같은 재조합 인플루엔자 바이러스를 투여함<br />

으로써 개체의 면역계를 자극시켜 인플루엔자 바이러스에 대한 방어 면역 반응을 일으키는 방법 또한 본 발명의<br />

일부이다.<br />

다른 측면에서, 본 발명은 서열 번호 1부터 서열 번호 10, 또는 서열 번호 21부터 서열 번호 26, 또는 서열 번<br />

호 33부터 서열 번호 38, 또는 서열 번호 45(또는 그의 상보성 서열)의 폴리뉴클레오티드 서열 중 어느 하나,<br />

서열 번호 11부터 서열 번호 20, 또는 서열 번호 27부터 서열 번호 32, 또는 서열 번호 39부터 서열 번호 44(또<br />

는 그의 상보성 폴리뉴클레오티드 서열)의 폴리펩티드를 코딩하는 폴리뉴클레오티드 서열 중 어느 하나, 고도로<br />

엄격한 조건하에서 실질적으로 전길이의 상기 폴리뉴클레오티드 서열 중 어느 것에 걸쳐 하이브리드화하는 폴리<br />

뉴클레오티드 서열, 및 바람직하게 서열이 헤마글루티닌 또는 뉴라미니다제 폴리펩티드 또는 헤마글루티닌 또는<br />

뉴라미니다제 폴리펩티드의 단편을 코딩하는 것인 상기와 같은 폴리뉴클레오티드 서열 중 어느 것의 모두 또는<br />

단편을 포함하는 폴리뉴클레오티드 서열로부터 선택된 단리된 핵산 또는 재조합 핵산을 포함한다. 본 발명은 또<br />

한 상기 핵산에 의해 코딩되는 임의의 폴리펩티드의 적어도 약 300개 이상의 인접한 아미노산개 이상의 아미노<br />

산; 적어도 약 350개 이상의 아미노산; 적어도 약 400개 이상의 아미노산; 적어도 약 450개 이상의 아미노산;<br />

적어도 약 500개 이상의 아미노산; 적어도 약 502개 이상의 아미노산; 적어도 약 550개 이상의 아미노산; 적어<br />

도 약 559개 이상의 아미노산; 적어도 약 565개 이상의 아미노산; 또는 적어도 약 566개 이상의 아미노산과 실<br />

질적으로 동일한 아미노산 서열을 코딩하는 단리된 핵산 또는 재조합 핵산을 포함한다. 또한, 아미노산 길이가<br />

예를 들어, 566개 미만, 565개 미만, 559개 미만 등인 경우(예로서, "서열" 참조)에는 상기 길이가 임의로 566<br />

개 미만, 565개 미만, 559개 미만 등임을 이해하여야 한다. 본 발명은 또한 헤마글루티닌 또는 뉴라미니다제 폴<br />

리펩티드, 또는 하나 이상의 헤마글루티닌 또는 뉴라미니다제 폴리펩티드의 하나 이상의 단편을 코딩하는 폴리<br />

뉴클레오티드를 포함하는 상기 핵산 중 임의의 것을 포함한다. 본 발명의 다른 측면은 서열이 상기 기술된 폴리<br />

뉴클레오티드들 중 적어도 하나와 적어도 98%의 동일성, 적어도 98.5%의 동일성, 적어도 99%의 동일성, 적어도<br />

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공개특허 10-2009-0053794


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99.2%의 동일성, 적어도 99.4%의 동일성, 적어도 99.6%의 동일성, 적어도 99.8%의 동일성, 또는 적어도 99.9%의<br />

동일성을 갖는 폴리펩티드(임의로 헤마글루티닌 또는 뉴라미니다제 폴리펩티드)를 코딩하는 단리된 핵산 또는<br />

재조합 핵산을 포함한다. 본 발명은 또한 상기 기술된 폴리뉴클레오티드 서열들 중 하나 이상을 돌연변이화하거<br />

나 재조합하여 제조된 헤마글루티닌 또는 뉴라미니다제의 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 핵산 또는 재조합 핵산<br />

을 포함한다. 본 발명의 폴리뉴클레오티드 서열은 임의로는 예로서, 리더 서열, 전구체 서열, 또는 에피토프 태<br />

그 서열 등의 것 중 하나 이상을 포함하고, 임의로 융합 단백질(예로서, 추가의 핵산 서열을 하나 이상 포함하<br />

는 융합 단백질)을 코딩할 수 있다.<br />

추가의 다른 실시태양에서, 본 발명은 2개 이상의 상기 기술된 핵산을 갖는 조성물(예로서, 적어도 약 2개,<br />

5개, 10개, 50개 이상의 핵산을 포함하는 라이브러리)을 포함한다. 그러한 조성물은 임의로 하나 이상의 상기<br />

기술된 핵산을(예로서, 기계적으로, 화학적으로, 제한 엔도뉴클레아제/RN아제/DN아제를 사용한 효소적인 것으로<br />

등) 절단함으로써 제조할 수 있다. 본 발명의 다른 조성물은 예로서, 데옥시리보뉴클레오티드 트리포스페이트<br />

및 열안정성 핵산 폴리머라제의 존재하에서 하나 이상의 상기 기술된 핵산을 인큐베이션시킴으로써 제조된 조성<br />

물을 포함한다.<br />

본 발명은 또한 상기 기술된 핵산, 또는 그의 절단된 또는 증폭된 단편 또는 생성물을 포함하는 세포를 포함한<br />

다. 그러한 세포는 임의로 상기 핵산에 의해 코딩되는 폴리펩티드를 발현할 수 있다. 본 발명의 다른 실시태양<br />

은 상기 기술된 핵산 중 어느 것을 포함하는 벡터(예로서, 플라스미드, 코스미드, 파지, 바이러스, 바이러스 단<br />

편 등)를 포함한다. 그러한 벡터는 임의로 발현 벡터를 포함할 수 있다. 본 발명의 바람직한 발현 벡터로는 pol<br />

I 프로모터 및 종결자 서열을 포함하는 벡터, 또는 pol I 및 pol II 프로모터, 둘 모두를 사용하는 벡터인 "pol<br />

I/pol II 프로모터 시스템"(예로서, ([[Zobel et al., Nucl. Acids Res. <strong>19</strong>93, 21:3607]; US20020164770;<br />

[Neumann et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA <strong>19</strong>99, 96:9345]; [Fodor et al., J. Virol. <strong>19</strong>99, 73:9679];<br />

및 US20030035814)))을 포함하나, 이에 한정되지 않는다. 상기 벡터에 의해 형질도입된 세포 또한 본 발명에 포<br />

함된다.<br />

몇몇 실시태양에서, 본 발명은 하나 이상의 상기 기술된 핵산(예로서, 헤마글루티닌 및/또는 뉴라미니다제를 코<br />

딩하는 핵산), 또는 그의 단편을 하나 이상 포함하는 바이러스(예로서, 인플루엔자 바이러스)를 포함한다. 상기<br />

바이러스를 포함하는 면역원성 조성물 또한 본 발명의 일부이다. 그러한 바이러스는 예를 들어, 6:2 재배열 바<br />

이러스(예로서, 하나 이상의 공여 바이러스로부터의 영역을 코딩하는 6개의 유전자와, 임의로 헤마글루티닌 및/<br />

또는 뉴라미니다제를 포함할 수 있는, 하나 이상의 상기 기술된 뉴클레오티드 서열(또는 하나 이상의 그의<br />

단편)로부터의 영역을 코딩하는 2개의 유전자를 포함하는 6:2 재배열 바이러스)와 같은 재배열 바이러스를 포함<br />

할 수 있다. 본 발명의 재배열 바이러스(임의로 생 바이러스)는 예로서, 저온 감수성, 저온 적응, 약독화 공여<br />

바이러스 중 하나 이상의 것인 공여 바이러스를 포함할 수 있다. 예를 들어, 재배열 바이러스는 예로서, A/앤<br />

아버/6/60, PR8 등을 포함할 수 있다. 본 발명의 재배열 바이러스는 별법으로 A/앤 아버/6/60을 제외할 수<br />

있다. 본 발명의 하나의 바람직한 실시태양은 바이러스가 6:2 재배열 인플루엔자 바이러스이며, A/앤 아버/6/60<br />

으로부터의 영역을 코딩하는 6개의 유전자와, 서열 번호 11-20, 서열 번호 27-32, 및 서열 번호 39-44의 폴리펩<br />

티드로 구성된 군으로부터 선택되는 폴리펩티드를 코딩하는 영역을 코딩하는 2개의 유전자를 포함하는 것인 재<br />

배열 인플루엔자 바이러스이다. 대체 실시태양에서, 본 발명의 재배열 인플루엔자 바이러스는 바이러스가 A/앤<br />

아버/6/60 이외의 하나 이상의 공여 바이러스로부터의 영역을 코딩하는 6개의 유전자와, 서열 번호 11-20, 서열<br />

번호 27-32, 및 서열 번호 39-44의 폴리펩티드로 구성된 군으로부터 선택되는 폴리펩티드를 코딩하는 영역을 코<br />

딩하는 2개의 유전자를 포함하는 것인, 6:2 재배열 인플루엔자 바이러스를 포함한다. 또다른 대체<br />

실시태양에서, 본 발명의 재배열 인플루엔자 바이러스는 바이러스가 A/앤 아버/6/60 이외의 하나 이상의 공여<br />

바이러스로부터의 영역을 코딩하는 6개의 유전자와, 임의의 범유행성 인플루엔자 균주로부터의 HA 또는 NA 폴리<br />

펩티드인 영역을 코딩하는 2개의 유전자를 포함하는 것인, 6:2 재배열 인플루엔자 바이러스를 포함한다. 핵산이<br />

발현될 수 있도록 하는 조건하에 적합한 배양 배지에서 인플루엔자 바이러스를 수반하는 숙주 세포를 배양하고,<br />

하나 이상의 상기 숙주 세포 또는 상기 배지로부터 재조합 인플루엔자 바이러스를 단리시키는 단계를 통해 재조<br />

합 인플루엔자 바이러스를 제조하는 방법 또한 본 발명의 일부이다.<br />

본원의 다른 실시태양에서, 본 발명은 상기 기술된 재조합 인플루엔자 바이러스 중 어느 것을 면역학적 유효량<br />

으로 갖는 면역원성 조성물을 포함한다. 다른 실시태양은 (임의로 생리학적으로 허용가능한 담체 중의) 상기 기<br />

술된 재조합 인플루엔자 바이러스 중 어느 것을 면역학적 유효량으로 개체에게 투여하여 개체의 면역계를 자극<br />

시켜 인플루엔자 바이러스에 대한 방어 면역 반응을 일으키는 방법을 포함한다.<br />

본 발명의 다른 측면은 핵산이 발현될 수 있도록 하는 조건하에 적합한 배양 배지에서 상기 임의의 숙주 세포를<br />

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배양하고, 하나 이상의 상기 숙주 세포, 또는 상기 세포가 배양된 배지로부터 폴리펩티드를 단리시켜 단리된 폴<br />

리펩티드 또는 재조합 폴리펩티드를 제조하는 방법을 포함한다.<br />

면역원성 조성물 또한 본 발명의 특징이 된다. 예를 들어, 상기 기술된 임의의 폴리펩티드들 및/ 또는 핵산들<br />

중 하나 이상, 및 임의로 부형제, 예를 들어, 약제학적으로 허용가능한 부형제 또는 하나 이상의 약제학적으로<br />

허용가능한 투여 성분을 포함하는 면역원성 조성물이다. 본 발명의 면역원성 조성물은 또한(예로서, 하나 이상<br />

의 약제학적으로 허용가능한 투여 성분과 함께) 임의의 하나 이상의 상기 기술된 바이러스도 포함할 수 있다.<br />

피험체에게 상기 바이러스(또는 면역원성 조성물)들 중 임의의 것을 유효량 투여함으로써 피험체에서 면역원성<br />

반응을 일으키는 방법 또한 본 발명에 포함된다. 추가로, 바이러스 감염에 대한 면역원성 반응을 일으키는데 유<br />

효한 양으로 임의의 하나 이상의 상기 기술된 바이러스(또는 면역원성 조성물)를 투여함으로써 피험체에서 바이<br />

러스 감염(예로서, 바이러스성 인플루엔자)을 예방학적으로 또는 치료학적으로 치료하는 방법 또한 본 발명의<br />

일부이다. 상기와 같은 치료법을 위한 피험체는 포유동물(예로서, 인간)을 포함할 수 있다. 그러한 방법 또한<br />

피험체에게 생체내 투여하는 것 뿐만 아니라, 피험체의 하나 이상의 세포에 시험관내에서 또는 생체외에서 투여<br />

하는 것을 포함할 수 있다. 추가로, 상기 방법은 또한 예방학적으로 또는 치료학적으로 바이러스 감염을 치료하<br />

는데 유효한 양으로 피험체에게 투여되는, 바이러스와 약제학적으로 허용가능한 부형제의 조성물을 투여하는 것<br />

을 포함할 수 있다.<br />

다른 측면에서 본 발명은 하나 이상의 범유행성 인플루엔자 균주의 헤마글루티닌 및/또는 뉴라미니다제 폴리펩<br />

티드를 코딩하는 핵산 서열, 및 A/앤 아버/6/60의 하나 이상의 폴리펩티드를 코딩하는 핵산 서열을 포함하는 조<br />

성물을 포함한다. 추가로, 본 발명은 하나 이상의 범유행성 인플루엔자 균주의 헤마글루티닌 및/또는 뉴라미니<br />

다제 폴리펩티드를 코딩하는 핵산 서열, 및 PR8 또는 A/앤 아버/6/60의 하나 이상의 폴리펩티드를 코딩하는 핵<br />

산 서열을 포함하는 조성물을 포함한다. 그러한 서열은 본원 "서열"에 열거된 것을 포함할 수 있다. 추가로, 본<br />

발명의 바람직한 실시태양은 하나 이상의 범유행성 인플루엔자 균주의 헤마글루티닌 및/또는 뉴라미니다제를 코<br />

딩하는 서열, 및 6:2 재배열체 중 선택된 골격 균주를 코딩하는 핵산 서열을 포함하는 조성물을 포함한다. 그러<br />

한 조성물은 바람직하게 본원 "서열"로부터 선택된 헤마글루티닌 및 뉴라미니다제를 코딩하는 서열을 포함하며,<br />

여기서, 골격 균주는 PR8 또는 A/앤 아버/6/60이다. 본 발명은 또한 헤마글루티닌이 변형된 다염기 절단 부위를<br />

포함하는 것인, 상기 기술된 것과 같은 조성물을 포함한다. 본 발명은 또한 상기 조성물을 포함하는 생 약독화<br />

인플루엔자 백신을 포함한다.<br />

본 발명의 이러한 특징과 목적 및 기타의 특징과 목적은 첨부된 도면 및 보충물과 함께 하기의 상세한 설명을<br />

참고함으로써 더 잘 이해할 수 있을 것이다.<br />

실 시 예<br />

실시예 1: H5N1 ca 바이러스 및 백신 작제 및 분석<br />

H5N1 HA/NA 서열을 포함하는 본원의 다양한 서열을 사용하여 인플루엔자 바이러스 및 백신을 제조하였다. 그러<br />

한 백신 중의 HA 서열은 HA내 다염기 절단 부위를 제거함으로써 야생형으로부터 변경시켰다. ca A/AA/6/60과 함<br />

께 HA/NA 서열을 재배열하였다(6:2의 재배열체).<br />

3개의 H5N1 인플루엔자 균주를 본 실시예에서 사용하였다: AVN/<strong>12</strong>03/2004, A/HK/491/<strong>19</strong>97, 및 A/HK/213/2003.<br />

상기 균주는 또한 본 실시예에서는 이들이 지정된 년도에 기초하여 '97, '03, 및 '04 균주로도 지칭된다. 이들<br />

3개의 균주의 HA 서열 상동성은 95-96%이다. 도 1은 바이러스/백신을 작제하기 위해 사용된, 대표적인 HA 서열,<br />

'04 HA 서열의 다염기 절단 부위의 변형을 도시한다. 앞서 언급한 바와 같이. 본 발명의 다양한 실시태양은 제<br />

거되는 다염기 절단 부위 영역이 다른 서열을 포함한다. 상기 참조.<br />

언급한 바와 같이, 변형된 H5N1 서열 (즉, 변형된 '97, '03, 및 '04 유전자)를 사용하여 ca A/AA/6/60을 갖는<br />

6:2 재배열 바이러스를 작제하였다. 기타의 바람직한 골격(예로서, PR8 등) 또한 사용된다는 것을 이해할 것이<br />

며, 그리고 이는 본원 도처에서 명시되고 있다.<br />

본 발명의 6:2 재배열체에 있어서, HA 및 NA 유전자 서열은 하나 이상의 야생형 모체 바이러스로부터 유래하였<br />

는데, 즉, '03 바이러스의 HA 및 NA 유전자 서열은 A/HK/213/2003으로부터 유래하였고, '04 바이러스의 HA 및<br />

NA 유전자 서열은 A/VN/<strong>12</strong>03/2004로부터 유래하였으며, '97 바이러스의 HA 및 NA 유전자 서열은 A/HK/491/<strong>19</strong>97<br />

로부터 유래한 반면, 유전자 서열은 A/HK/486/<strong>19</strong>97로부터 유래하였다. 6:2 재배열체 중 나머지 유전자는<br />

A/AA/6/60 ca 모체 바이러스로부터 유도된 것과 같은 서열 분석법에 의해 특징화하였다. 재배열된 바이러스는<br />

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<br />

난에서 8.0-8.5 log10 TCID50으로까지 복제하였다. 그러나, log10 TCID50이 약 7.0 내지 약 9.0, 약 7.5-8.5, 또<br />

는 약 8.0-8.5인 다른 실시태양 또한 본 발명의 범주내 포함된다는 것을 이해할 것이다. 작제된 바이러스에서<br />

내인성 프로테아제에 의한 변형된 HA의 절단가능성은 시험관내에서는 제안되었고, 바이러스는 성장에 대해 트립<br />

신(예로서, 약 0.1 ug/ml 내지 약 1.0 ug/ml)에 의존하였다. 작제된 바이러스는 시험관내 분석법에 의해 분석한<br />

바, 온도 감수성이었다.<br />

H5N1 ca 재배열 바이러스(변형된 '97, '03, 또는 '04 HA 유전자를 갖는 것)는 닭에 대해 치사성을 띠지는 않았<br />

다. 예를 들어, 4주된 SPF 백색 플리머스 록(Plymouth Rock) 닭에 1:10의 스톡 바이러스 희석액(10 8-8.75<br />

TCID50/ml)을 정맥내로 접종하고, 10일간 관찰하였을 때, 야생형 '97, '03, 및 '04 H5N1이 사용된 경우에는 8마<br />

리의 닭 중 8마리가 1-2일내 사망한 반면, H5N1 ca 재배열 바이러스가 사용된 경우에는 8마리의 닭 중 한마리도<br />

죽지 않은 것이 관찰되었다. 도 2에 나타낸 바와 같이, 비내로 투여된 H5N1 ca 재배열 바이러스는 닭에서 복제<br />

되지 않았다.<br />

H5N1 ca 재배열체 또한 마우스에 대해 치사성을 띠지는 않았다. H5N1 야생형 균주에 대한 TCID50도 나타내는 도<br />

3을 참조한다. 도 4는 마우스에서 <strong>19</strong>97 및 2004 H5N1 ca 재배열 바이러스 복제가 제한된다는 것을 나타낸다. 도<br />

5는 H5N1 ca 재배열된 바이러스 복제가 마우스의 폐에서는 제한된다는 것을 나타낸다.<br />

단일의, 백신 비내 투여 후 마우스에서 유도된 혈청 HAI 항체 역가의 비교(2003 야생형과 2003 ca 비교)를 도 6<br />

에 나타낸다. 도 7 및 15는 유사한 측정치를 나타내는데, 단, 혈청 중화 항체 역가를 사용한다.<br />

도 8은 H5N1 ca 재배열 바이러스가 마우스를 50, 500, 또는 5,000 LD50의 야생형 H5N1 바이러스를 사용한 치사<br />

항원자극으로부터 방어한다는 것을 나타낸다. 도 9는 마우스 폐에서 동종성 및 이종성 H5N1 항원자극 바이러스<br />

복제로부터의 방어 효능을 보여준다. 알 수 있는 바와 같이, ca 재배열 바이러스는 야생형 바이러스보다 덜 복<br />

제되었다. 도 10은 마우스의 상기도를 사용하여 얻은 관련 데이타를 나타낸다. 당업자는 동종성 및 이종성 항원<br />

자극(예로서, 2003 백신이 2003 야생형 항원자극(동종성)에 대해 방어하는지 여부를 시험하는 것 또는 2003 백<br />

신 <strong>19</strong>97 야생형 항원자극(이종성)에 대해 방어하는지 여부를 시험하는 것 등)에 대해 정통할 것이다.<br />

도 11은 마우스에서 동종성 또는 이종성 H5N1 야생형 바이러스를 고용량(1O 5<br />

TCID50)으로 사용한 항원자극에 대<br />

해 2004 H5N1 ca 백신에 의해 부여된 방어 효능을 나타낸다. 도 <strong>12</strong>는 마우스에서 동종성 또는 이종성 H5N1 야생<br />

형 바이러스를 고용량(1O 5<br />

TCID50)으로 사용한 항원자극에 대해 <strong>19</strong>97 및 2003 H5N1 ca 백신에 의해 부여된 방어<br />

효능을 나타낸다. 도 13은 마우스에서 저용량 또는 고용량의 동종성 H5N1 야생형 바이러스를 사용한 항원자극에<br />

대해 2004 H5N1 ca 백신에 의해 부여된 방어 효능을 나타낸다. 도 11-13은 시험된 백신이 기타 관련 바이러스에<br />

대해 방어할 수 있다는 것을 입증한다.<br />

건강한 성인 인간에서 비내로 분무하여 투여한 경우, '04 백신의 내성은 우수하였고, 그의 복제는 고도로 제한<br />

되었다. 건강한 성인에서 백신의 복제 제한에 관해 도 27을 참조한다. 건강한 성인 중 일부에서는 10 6.7<br />

'04 백신에 대한 HI 항체 반응도 관찰되었다. 도 28을 참조한다.<br />

TCID50의<br />

본 실시예는 본 발명의 예시적인 H5N1 ca 재배열 바이러스/백신에 관한 몇몇 주안점을 입증한다. 변형된 ca 재<br />

배열 '97, '03, 및 '04 바이러스는 시험관내 ts 표현형, 닭에서의 발병성 상실 및 마우스에서의 약독화를 갖는<br />

것으로 나타났다. 약독화는 또한 페럿에 존재하는 것으로 예측된다. 마우스에서 야생형 바이러스를 사용한 치사<br />

성 항원자극 및 전신 전파에 대한 방어 효능 및 교차 방어 효능 또한 나타낸다. 마우스의 기도에서 야생형 항원<br />

자극 바이러스의 복제에 대한 방어 효능 및 교차 방어 효능 또한 기대된다.<br />

2회의 백신 투약 이후 면역원성 및 효능이 개선되었는지 여부를 측정하기 위해; 인간이 아닌 영장류에서의 면역<br />

원성을 평가하기 위해; 페럿에서의 약독화 및 백신 효능을 평가하기 위해; 마우스에서 생산된 백신의 관찰된 효<br />

능에 대한 체액성 및 세포성 면역의 기여를 측정하기 위해; 2003 HA의 어떤 잔기가 면역원성을 증진시키는데 도<br />

움이 되며, 그를 <strong>19</strong>97 및 2004 HAs로 도입시키는데 도움이 되는지를 측정하기 위해; 및 다염기 아미노산 절단<br />

부위의 결실 및 유전자 배열이 미치는 효과를 측정하기 위해 이들(및 유사한) 바이러스/백신을 사용하는 것에<br />

주시한다.<br />

실시예 2: H6 ca 바이러스 및 백신의 작제 및 분석<br />

- 13 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


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3개의 재조합 인플루엔자 바이러스 한 세트와 H6 HA 서열을 포함하는 백신을 제조하였다: (a) A/오리(이는 A/오<br />

리77의 H6 HA 및 N9 NA를 포함하였다); (b) A/검둥오리(이는 A/검둥오리97의 H6 HA 및 N1 NA를 포함하였다);<br />

및 (c) A/청둥오리(이는 A/청둥오리85의 H6 HA 및 N2 NA를 포함하였다). 각 재조합 바이러스의 6개의 내부 게놈<br />

분절은 ca A/AA/6/60의 것이었다.<br />

각각의 A/오리, A/검둥오리, 및 A/청둥오리 재조합 바이러스를 페럿의 비갑개 및 폐에서 약독성이었다. 페럿에<br />

10 7<br />

TCID50 재조합(ca; 바로 앞 문단 참조) 또는 야생형(wt) H6 인플루엔자 바이러스를 비내로 접종하였다. 검사<br />

하기 위해 감염후 3일째 페럿으로부터 비갑개 및 폐 조직을 수거하였다. 도 16은 재조합 바이러스(ca)를 접종받<br />

은 페럿의 비갑개 및 폐 조직이 각각의 대응 wt 바이러스를 접종받은 페럿의 비갑개 및 폐 조직에서보다 더 낮<br />

은 바이러스 역가를 나타내었다는 것을 보여준다.<br />

A/오리, A/검둥오리, 및 A/청둥오리 재조합(ca) 바이러스 각각은 또한 페럿에서 면역원성이었다. 도 17을 참조<br />

한다.<br />

도 18은 A/오리, A/검둥오리, 및 A/청둥오리 백신에 의해 부여받은 방어 효능을 보여준다. 페럿을 7 log10 PFU<br />

재조합 A/오리, A/검둥오리, 또는 A/청둥오리 백신을 단일 투약하여 백신화하였다. 이어서, 페럿을 7 log10 PFU<br />

wt A/오리, A/검둥오리, 또는 A/청둥오리 바이러스로 항원자극시켰다. 항원자극후 3일째 페럿의 폐 및 비갑개를<br />

수거하고, 조직 중의 바이러스 역가를 측정하였다. 도 18은 페럿에서 동종성 및 이종성 야생형 H6 바이러스에<br />

대한, 재조합(ca) H6 백신에 의해 부여받은 방어 효능을 보여준다.<br />

실시예 3: H7N3, BC 04 ca. 바이러스 및 백신의 작제 및 분석<br />

추가의 재조합 인플루엔자 바이러스 및 백신은 A/ck/BC/CN-6/04(BC 04 ca)의 HA H7 및 NA N3 서열을 사용하여<br />

제조하였다. 이러한 HA 및 NA 서열을 ca A/AA/6/60의 6개의 내부 게놈 분절과 조합하였다.<br />

BC 04 ca 백신은 페럿에서 약독성이었다. 페럿에 10 7<br />

TCID50 백신을 0.5 mL로 하여 비내로 접종하였다. 접종후 3<br />

일째, 페럿 비갑개, 폐, 뇌, 및 후구를 수거하였다. 이들 각각의 조직 중의 바이러스 역가는 wt 바이러스<br />

A/BC/CN-6/04 또는 A/BC/CN-7/04를 접종받은 페럿과 비교하였을 때 백신 바이러스를 접종받은 페럿에서 감소하<br />

였다. 도 <strong>19</strong>를 참조한다.<br />

BC 04 ca 백신은 마우스에서 면역원성이었다. BC 04 ca 백신을 받은 마우스에서 4주째 중화 항체가 검출되었고,<br />

역가는 8주에 걸쳐 상승하였다. 백신의 2차 투약으로 항체 역가가 증폭되었지만, 획득한 최종 역가는 단일 투약<br />

후의 것과 유사하였다. 도 20을 참조한다.<br />

도 21 및 22는 동종성 및 이종성 H7 wt 바이러스, 둘 모두에 대한, BC 04 ca 백신에 의해 부여받은 방어 효능을<br />

보여준다. 도 21의 경우, 항원자극 4주전 1회의 백신 투약, 항원자극 8주전 1회의 백신 투약, 또는 50 LD50 동종<br />

성(A/ck/BC/CN-7/04) 및 이종성(A/NL/2<strong>19</strong>/03 또는 A/tk/Eng/63) H7 wt 바이러스를 사용하여 치사 항원자극 이<br />

전에 2회에 걸친 백신 투약(4주간의 간격을 두고 투여됨)으로 마우스에 비내로 접종하였다. 치사 항원자극 이후<br />

마우스의 체중 변화를 14일 동안 매일 모니터하여 wt 인플루엔자 바이러스 항원자극과 관련된 사망율을 모니터<br />

하였다.<br />

동종성 A/ck/BC/CN-7/04 바이러스로 치사 감염된 각각의 마우스의 경우, 항원자극 4주전 1회의 백신 투약으로<br />

투여되었는지(a), 항원자극 8주전 1회의 백신 투약으로 투여되었는지(b) 또는 항원자극 이전에 2회에 걸친 백신<br />

투약으로 투여되었는지(c)와는 상관없이 체중 변화는 거의 관찰되지 않거나, 전혀 관찰되지 않았다. 유사하게,<br />

이종성 인플루엔자 바이러스, A/NL/2109/03(d, e, f) 또는 A/tk/Eng/63(g, h, i)으로 마우봄보 항원자극한 후<br />

에는 체중 손실이 거의 관찰되지 않거나, 전혀 관찰되지 않았다. 또한, 항원자극 4주전 1회의 백신 투약으로 투<br />

여되었는지(d 또는 g), 항원자극 8주전 1회의 백신 투약으로 투여되었는지(e, 또는 h), 또는 항원자극 이전에 2<br />

회에 걸친 백신 투약으로 투여되었는지(i의 경우)와는 상관없이 체중 손실은 없은 것으로 관찰되었다.<br />

도 22는 H7N3 BC 04 ca 백신의 효능을 보여주는 추가의 증거를 제공한다. H7N3 BC 04 ca 백신을 받은 마우스의<br />

비갑개(a) 및 폐(b), 둘 모두에서 ck/BC/CN-6/04(H7N3), ck/BC/CN-7/04(H7N3), NL/2<strong>19</strong>/03(H7N7),<br />

tk/Eng/63(H7N3), tk/UT/95(H7N3), 및 tk/VA/02(H7N2) 바이러스를 사용한 항원자극에 대한 방어가 관찰되었다.<br />

실시예 4: H9N2 G9/AA ca. 바이러스 및 백신의 작제 및 분석<br />

A/ck/홍콩/G9/97의 HA H9 및 NA N2 서열(G9/AA ca)을 사용하여 추가의 재조합 인플루엔자 바이러스 및 백신을<br />

- 14 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


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제조하였다. 이들 HA 및 NA 서열을 ca A/AA/6/60의 6개의 내부 게놈 분절과 함께 조합하였다.<br />

H9N2 G9/AA ca 백신은 페럿에서 약독성이었다. H9N2 G9 wt 바이러스와 비교하였을 때, H9N2 G9/AA ca 바이러스<br />

를 투여한 후의 페럿의 비갑개(a) 및 폐(b)에서의 바이러스 역가는 감소한 것으로 나타났으며, 이에 대해서는<br />

도 23을 참조한다.<br />

도 24는 마우스에서 H9N2 G9 ca 백신의 효능을 보여주는 증거를 제공한다. H9N2 G9 ca 백신을 받은 마우스에서<br />

는 H9N2 G9 wt 및 A/HK/1073/99 바이러스를 사용한 항원자극에 대한 방어가 관찰되었다.<br />

H9N2 G9/AA ca 백신은 또한 임상 시험 세팅의 건강한 성인에서 내성은 우수하였다. 점비제에 의해 H9N2 G9/AA<br />

ca 백신을 건강한 성인에게 투여하였다. 건강한 성인에서 H9N2 G9/AA ca 백신은 복제에 있어 매우<br />

제한적이었다. 도 25를 참고한다. 추가로, 10 7.0<br />

HI 역가가 4배 초과로 증가하는 것이 유도되었다. 도 26을 참조한다.<br />

TCID50의 H9N2 G9/AA ca 백신 투여로 건강한 지원자 중 92%에서<br />

명확하게 하고 이해를 돕기 위한 목적으로 상기의 발명은 보다 상세히 기술되었지만, 본 발명의 진실된 범주로<br />

부터 벗어남 없이 형식대로 및 상세히 다양하게 변형될 수 있다는 것을 본 개시를 해독함으로써 당업자는 명백<br />

하게 이해할 것이다. 예를 들어, 상기 기술된 모든 기법과 장치는 다양하게 조합하여 사용될 수 있다. 본 출원<br />

에서 인용된 모든 간행물, 특허, 특허 출원, 또는 기타 문서들은 각각의 개별 간행물, 특허, 특허 출원, 또는<br />

기타 문서가 모든 목적을 위해 참고로 인용된다는 것을 개별적으로 나타내는 바와 같이 모든 목적을 위해서 상<br />

기의 전문이 참고로 포함된다. 특히, 2006년 8월 9일 출원된 미국 가출원 번호 제60/821,832호 및 2007년 6월 8<br />

일 출원된 미국 가출원 번호 제60/942,804호의 전문이 모든 목적을 위해 본원에서 인용된다.<br />

본 발명의 추가의 실시태양은 표 3 및 4에서 제시한다.<br />

표 3<br />

구체적인 실시태양<br />

구체적인 실시태양<br />

1 a) 서열 번호 21-26 또는 33-38 또는 45 중 어느 하나에 제시된 폴리뉴클레오티드에 의해 코딩<br />

된 폴리펩티드;<br />

b) 서열 번호 27-32 또는 39-44 중 어느 하나에 제시된 폴리펩티드;<br />

c) 서열 번호 27-32 또는 39-44 중 어느 하나에 제시된, 성숙한 형태의 폴리펩티드;<br />

d) 고도로 엄격한 조건하에서 (a), (b) 또는 (c)를 코딩하는 폴리뉴클레오티드 서열에 하이브리<br />

드화하는 폴리뉴클레오티드 서열에 의해 코딩된 폴리펩티드; 및<br />

e) (b)의 폴리펩티드와 적어도 90%의 서열 동일성을 갖는 폴리펩티드로 구성된 군으로부터 선택<br />

되는 단리된 폴리펩티드.<br />

2 면역학적 유효량의, 실시태양 1의 적어도 하나의 폴리펩티드를 포함하는 면역원성 조성물.<br />

3 실시태양 1의 폴리펩티드에 특이적으로 결합하는 단리된 항체.<br />

4 생리학적으로 허용가능한 담체 중 면역학적 유효량의, 실시태양 1의 폴리펩티드를 개체에게 투<br />

여하는 단계를 포함하는, 인플루엔자 바이러스에 대한 방어 면역 반응을 일으키기 위해 개체의<br />

면역계를 자극시키는 방법.<br />

5 실시태양 1의 폴리펩티드를 포함하는 재조합 인플루엔자 바이러스.<br />

6 면역학적 유효량의, 실시태양 5의 재조합 인플루엔자 바이러스를 포함하는 면역원성 조성물.<br />

7 생리학적으로 허용가능한 담체 중 면역학적 유효량의, 실시태양 5의 재조합 인플루엔자 바이러<br />

스를 개체에게 투여하는 단계를 포함하는, 인플루엔자 바이러스에 대한 방어 면역 반응을 일으<br />

키기 위해 개체의 면역계를 자극시키는 방법.<br />

8 a) 서열 번호 21-26 또는 33-38 또는 45 중 어느 하나에 제시된 폴리뉴클레오티드 서열, 또는<br />

그의 상보적 서열;<br />

b) 서열 번호 27-32 또는 39-44 중 어느 하나에 제시된 폴리펩티드를 코딩하는 폴리뉴클레오티<br />

드 서열, 또는 그의 상보적 폴리뉴클레오티드 서열;<br />

c) 고도로 엄격한 조건하에서 실질적으로 전길이의 (a)의 폴리뉴클레오티드 서열에 걸쳐 하이브<br />

리드화하는 폴리뉴클레오티드 서열; 및<br />

d) (a)의 폴리뉴클레오티드 서열과 적어도 98%의 서열 동일성을 갖는 폴리뉴클레오티드 서열로<br />

구성된 군으로부터 선택되는 단리된 핵산.<br />

9 실시태양 8의 적어도 하나의 핵산을 포함하는 면역원성 조성물.<br />

- 15 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


10 실시태양 8의 적어도 하나의 핵산을 포함하는 세포.<br />

11 실시태양 8의 핵산을 포함하는 벡터.<br />

<strong>12</strong> 실시태양 <strong>12</strong>에 있어서, 플라스미드, 코스미드, 파지, 바이러스, 또는 바이러스의 단편인 벡터.<br />

13 실시태양 <strong>12</strong>에 있어서, 발현 벡터인 벡터.<br />

14 실시태양 13의 벡터를 포함하는 세포.<br />

15 실시태양 8의 하나 이상의 핵산을 포함하는 인플루엔자 바이러스.<br />

16 실시태양 15에 있어서, 재배열 바이러스인 바이러스.<br />

17 A/앤 아버/6/60으로부터의 영역을 코딩하는 6개의 유전자와, 서열 번호 27-32, 및 39-44의 폴리<br />

펩티드로 구성된 군으로부터 선택되는 폴리펩티드를 코딩하는 영역을 코딩하는 2개의 유전자를<br />

포함하는 6:2 재배열 인플루엔자 바이러스.<br />

18 핵산이 발현될 수 있도록 하는 조건하에 적합한 배양 배지 중 실시태양 14의 세포를 배양하는<br />

단계; 및 상기 세포를 포함하는 세포 군집 또는 배지로부터 재조합 인플루엔자 바이러스를 단리<br />

시키는 단계를 포함하는, 재조합 인플루엔자 바이러스를 제조하는 방법.<br />

<strong>19</strong> 면역학적 유효량의, 실시태양 17의 재조합 인플루엔자 바이러스를 포함하는 면역원성 조성물.<br />

20 생리학적으로 유효한 담체 중 면역학적 유효량의, 실시태양 17의 재조합 인플루엔자 바이러스를<br />

개체에게 투여하는 단계를 포함하는, 인플루엔자 바이러스에 대한 방어 면역 반응을 일으키기<br />

위해 개체의 면역계를 자극시키는 방법.<br />

21 상기 핵산이 발현될 수 있도록 하는 조건하에 적합한 배양 배지 중 실시태양 10의 숙주 세포를<br />

배양하는 단계; 및 하나 이상의 숙주 세포 또는 배지로부터 폴리펩티드를 단리시키는 단계를 포<br />

함하는, 단리된 또는 재조합 폴리펩티드를 제조하는 방법.<br />

22 바이러스 감염에 대한 면역원성 반응을 일으키는데 유효한 양으로 실시태양 17의바이러스를 피<br />

험체에게 투여하는 단계를 포함하는, 피험체에서 바이러스 감염을 예방학적으로 또는 치료학적<br />

으로 치료하는 방법.<br />

23 실시태양 22에 있어서, 피험체가 인간인 방법.<br />

24 실시태양 <strong>19</strong>에 있어서, 헤마글루티닌이 변형된 다염기 절단 부위를 포함하는 면역원성 조성물.<br />

25 실시태양 <strong>19</strong>의 조성물을 포함하는 생 약독화 인플루엔자 백신.<br />

26 실시태양 <strong>19</strong>의 조성물을 포함하는 분할 바이러스 또는 사멸된 바이러스 백신.<br />

27 실시태양 24의 조성물을 포함하는 생 약독화 인플루엔자 백신.<br />

28 실시태양 24의 조성물을 포함하는 분할 바이러스 또는 사멸된 바이러스 백신.<br />

29 i) 인플루엔자 바이러스의 복제를 지지할 수 있는 숙주 세포 군집으로 A/앤 아버/6/60인 제1 인<br />

플루엔자 균주의 적어도 6개의 내부 게놈 분절; 및 범유행성 인플루엔자 균주인 제2 인플루엔자<br />

균주의 면역원성 인플루엔자 표면 항원을 코딩하는 적어도 하나의 게놈 분절을 코딩하는 핵산을<br />

포함하는 복수개의 벡터를 도입하는 단계;<br />

ii) 35℃이하의 온도에서 숙주 세포 군집을 배양하는 단계; 및<br />

iii) 복수개의 인플루엔자 바이러스를 회수하는 단계를 포함하는, 세포 배양물에서 인플루엔자<br />

바이러스를 제조하는 방법.<br />

30 실시태양 29에 있어서, 복수개의 벡터가<br />

a) 서열 번호 21-26 또는 33-38, 또는 45 중 어느 하나의 폴리뉴클레오티드 서열, 또는 그의 상<br />

보적 서열;<br />

b) 서열 번호 27-32 또는 39-44 중 어느 하나의 폴리펩티드를 코딩하는 폴리뉴클레오티드 서열,<br />

또는 그의 상보적 폴리뉴클레오티드 서열;<br />

c) 고도로 엄격한 조건하에서 실질적으로 전길이의 (a)의 폴리뉴클레오티드 서열에 걸쳐 하이브<br />

리드화하는 폴리뉴클레오티드 서열; 및<br />

d) (a)의 폴리뉴클레오티드 서열과 적어도 98%의 서열 동일성을 갖는 폴리뉴클레오티드 서열로<br />

구성된 군으로부터 선택되는 적어도 하나의 단리된 핵산을 포함하는 것인 방법.<br />

31 실시태양 29의 인플루엔자 바이러스를 면역학적 유효량으로 포함하는 면역원성 조성물.<br />

32 실시태양 30의 인플루엔자 바이러스를 면역학적 유효량으로 포함하는 면역원성 조성물.<br />

33 생리학적으로 유효한 담체 중 실시태양 29의 인플루엔자 바이러스를 면역학적 유효량으로 개체<br />

에게 투여하는 단계를 포함하는, 인플루엔자 바이러스에 대한 방어 면역 반응을 일으키기 위해<br />

개체의 면역계를 자극시키는 방법.<br />

34 생리학적으로 유효한 담체 중 실시태양 30의 인플루엔자 바이러스를 면역학적 유효량으로 개체<br />

에게 투여하는 단계를 포함하는, 인플루엔자 바이러스에 대한 방어 면역 반응을 일으키기 위해<br />

개체의 면역계를 자극시키는 방법.<br />

35 실시태양 31의 면역원성 조성물을 개체에게 투여하는 단계를 포함하는, 인플루엔자 바이러스에<br />

대한 방어 면역 반응을 일으키기 위해 개체의 면역계를 자극시키는 방법.<br />

36 실시태양 32의 면역원성 조성물을 개체에게 투여하는 단계를 포함하는, 인플루엔자 바이러스에<br />

대한 방어 면역 반응을 일으키기 위해 개체의 면역계를 자극시키는 방법.<br />

37 실시태양 31의 면역원성 조성물을 포함하는 생 약독화 인플루엔자 백신.<br />

38 실시태양 32의 면역원성 조성물을 포함하는 분할 바이러스 또는 사멸된 바이러스 백신.<br />

- 16 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


표 4<br />

구체적인 실시태양<br />

1 a) 서열 번호 21-26 또는 33-38 또는 45 중 어느 하나에 제시된 뉴클레오티드에 의해 코딩된 아<br />

미노산 서열을 포함하는 폴리펩티드;<br />

b) 서열 번호 27-32 또는 39-44 중 어느 하나에 제시된 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩티드;<br />

c) 서열 번호 27-32 또는 39-44 중 어느 하나에 제시된 아미노산 서열을 포함하는, 성숙한 형태<br />

의 폴리펩티드;<br />

d) 고도로 엄격한 조건하에서 (a), (b) 또는 (c)를 코딩하는 뉴클레오티드 서열을 포함하는 폴<br />

리뉴클레오티드에 하이브리드화하는 폴리뉴클레오티드에 의해 코딩된 아미노산 서열을 포함하는<br />

폴리펩티드; 및<br />

e) (b)의 폴리펩티드와 적어도 90%의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩티드<br />

로 구성된 군으로부터 선택되는 단리된 폴리펩티드.<br />

2 면역학적 유효량의, 실시태양 1의 적어도 하나의 폴리펩티드를 포함하는 면역원성 조성물.<br />

3 실시태양 1의 폴리펩티드에 특이적으로 결합하는 단리된 항체.<br />

4 생리학적으로 허용가능한 담체 중 면역학적 유효량의, 실시태양 1의 폴리펩티드를 개체에게 투<br />

여하는 단계를 포함하는, 인플루엔자 바이러스에 대한 방어 면역 반응을 일으키기 위해 개체의<br />

면역계를 자극시키는 방법.<br />

5 실시태양 1의 폴리펩티드를 포함하는 재조합 인플루엔자 바이러스.<br />

6 면역학적 유효량의, 실시태양 5의 재조합 인플루엔자 바이러스를 포함하는 면역원성 조성물.<br />

7 생리학적으로 허용가능한 담체 중 면역학적 유효량의, 실시태양 5의 재조합 인플루엔자 바이러<br />

스를 개체에게 투여하는 단계를 포함하는, 인플루엔자 바이러스에 대한 방어 면역 반응을 일으<br />

키기 위해 개체의 면역계를 자극시키는 방법.<br />

8 a) 서열 번호 21-26 또는 33-38 또는 45 중 어느 하나에 제시된 뉴클레오티드 서열, 또는 그의<br />

상보적 서열을 포함하는 폴리뉴클레오티드;<br />

b) 서열 번호 27-32 또는 39-44 중 어느 하나에 제시된 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩티드를<br />

코딩하는 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 상보적 뉴클레오티드 서열을 포함하는 폴리뉴클레오티<br />

드;<br />

c) 고도로 엄격한 조건하에서 실질적으로 전길이의 (a)의 폴리뉴클레오티드에 걸쳐 하이브리드<br />

화하는 폴리뉴클레오티드; 및<br />

d) (a)의 폴리뉴클레오티드와 적어도 98%의 서열 동일성을 갖는 뉴클레오티드 서열을 포함하는<br />

폴리뉴클레오티드로 구성된 군으로부터 선택되는 단리된 폴리뉴클레오티드.<br />

9 실시태양 8의 적어도 하나의 폴리뉴클레오티드를 포함하는 면역원성 조성물.<br />

10 실시태양 8의 적어도 하나의 폴리뉴클레오티드를 포함하는 세포.<br />

11 실시태양 8의 폴리뉴클레오티드를 포함하는 벡터.<br />

<strong>12</strong> 실시태양 11에 있어서, 플라스미드, 코스미드, 파지, 바이러스, 또는 바이러스의 단편인 벡터.<br />

13 실시태양 <strong>12</strong>에 있어서, 발현 벡터인 벡터.<br />

14 실시태양 13의 벡터를 포함하는 세포.<br />

15 실시태양 8의 하나 이상의 폴리뉴클레오티드를 포함하는 인플루엔자 바이러스.<br />

16 실시태양 15에 있어서, 재배열 바이러스인 바이러스.<br />

17 A/앤 아버/6/60으로부터의 6개의 내부 게놈 분절과, 서열 번호 27-32, 및 39-44의 폴리펩티드로<br />

구성된 군으로부터 선택되는 HA 및/또는 NA 폴리펩티드를 코딩하는 2개의 게놈 분절을 포함하는<br />

6:2 재배열 인플루엔자 바이러스.<br />

18 상기 폴리뉴클레오티드가 발현될 수 있도록 하는 조건하에 적합한 배양 배지 중 실시태양 14의<br />

세포를 배양하는 단계; 및 상기 세포를 포함하는 세포 군집 또는 배지로부터 재배열 인플루엔자<br />

바이러스를 단리시키는 단계를 포함하는, 재배열 인플루엔자 바이러스를 제조하는 방법.<br />

<strong>19</strong> 면역학적 유효량의, 실시태양 17의 재배열 인플루엔자 바이러스를 포함하는 면역원성 조성물.<br />

20 생리학적으로 유효한 담체 중 면역학적 유효량의, 실시태양 17의 재배열 인플루엔자 바이러스를<br />

개체에게 투여하는 단계를 포함하는, 인플루엔자 바이러스에 대한 방어 면역 반응을 일으키기<br />

위해 개체의 면역계를 자극시키는 방법.<br />

21 상기 폴리뉴클레오티드가 발현될 수 있도록 하는 조건하에 적합한 배양 배지 중 실시태양 10의<br />

세포를 배양하는 단계; 및 세포 또는 배지로부터 폴리펩티드를 단리시키는 단계를 포함하는, 단<br />

리된 또는 재조합 폴리펩티드를 제조하는 방법.<br />

- 17 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


22 바이러스 감염에 대한 면역원성 반응을 일으키는데 유효한 양으로 실시태양 17의바이러스를 피<br />

험체에게 투여하는 단계를 포함하는, 피험체에서 바이러스 감염을 예방학적으로 또는 치료학적<br />

으로 치료하는 방법.<br />

23 실시태양 22에 있어서, 피험체가 인간인 방법.<br />

24 실시태양 <strong>19</strong>에 있어서, 헤마글루티닌이 변형된 다염기 절단 부위를 포함하는 면역원성 조성물.<br />

25 실시태양 <strong>19</strong>의 조성물을 포함하는 생 약독화 인플루엔자 백신.<br />

26 실시태양 <strong>19</strong>의 조성물을 포함하는 분할 바이러스 또는 사멸된 바이러스 백신.<br />

27 실시태양 24의 조성물을 포함하는 생 약독화 인플루엔자 백신.<br />

28 실시태양 24의 조성물을 포함하는 분할 바이러스 또는 사멸된 바이러스 백신.<br />

29 i) 인플루엔자 바이러스의 복제를 지지할 수 있는 숙주 세포 군집으로 A/앤 아버/6/60의 적어도<br />

6개의 내부 게놈 분절; 및 서열 번호 27-32, 및 39-44의 폴리펩티드로 구성된 군으로부터 선택<br />

되는 HA 및/또는 NA 폴리펩티드를 코딩하는 폴리뉴클레오티드를 포함하는 적어도 하나의 게놈<br />

분절에 상응하는 뉴클레오티드 서열을 포함하는 복수개의 벡터를 도입하는 단계;<br />

ii) 35℃이하의 온도에서 숙주 세포 군집을 배양하는 단계; 및<br />

iii) 인플루엔자 바이러스를 회수하는 단계를 포함하는, 세포 배양물에서 인플루엔자 바이러스<br />

를 제조하는 방법.<br />

30 실시태양 29에 있어서, HA 및/또는 NA 폴리펩티드를 코딩하는 폴리뉴클레오티드가<br />

a) 서열 번호 21, 23-26 또는 33-38, 또는 45 중 어느 하나의 뉴클레오티드 서열, 또는 그의<br />

상보적 뉴클레오티드 서열을 포함하는 폴리뉴클레오티드;<br />

b) 서열 번호 27-32 또는 39-44 중 어느 하나에 제시된 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩티드<br />

를 코딩하는 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 상보적 뉴클레오티드 서열을 포함하는 폴리뉴클레오<br />

티드;<br />

c) 고도로 엄격한 조건하에서 실질적으로 전길이의 (a)의 폴리뉴클레오티드에 걸쳐 하이브리드<br />

화하는 폴리뉴클레오티드; 및<br />

d) (a)의 폴리뉴클레오티드와 적어도 98%의 서열 동일성을 갖는 뉴클레오티드 서열을 포함하는<br />

폴리뉴클레오티드로 구성된 군으로부터 선택되는 것인 방법.<br />

31 실시태양 29의 방법에 의해 제조된 인플루엔자 바이러스를 면역학적 유효량으로 포함하는 면역<br />

원성 조성물.<br />

32 실시태양 30의 방법에 의해 제조된 인플루엔자 바이러스를 면역학적 유효량으로 포함하는 면역<br />

원성 조성물.<br />

33 생리학적으로 유효한 담체 중 실시태양 29의 방법에 의해 제조된 인플루엔자 바이러스를 면역학<br />

적 유효량으로 개체에게 투여하는 단계를 포함하는, 인플루엔자 바이러스에 대한 방어 면역 반<br />

응을 일으키기 위해 개체의 면역계를 자극시키는 방법.<br />

34 생리학적으로 유효한 담체 중 실시태양 30의 방법에 의해 제조된 인플루엔자 바이러스를 면역학<br />

적 유효량으로 개체에게 투여하는 단계를 포함하는, 인플루엔자 바이러스에 대한 방어 면역 반<br />

응을 일으키기 위해 개체의 면역계를 자극시키는 방법.<br />

35 실시태양 31의 면역원성 조성물을 개체에게 투여하는 단계를 포함하는, 인플루엔자 바이러스에<br />

대한 방어 면역 반응을 일으키기 위해 개체의 면역계를 자극시키는 방법.<br />

36 실시태양 32의 면역원성 조성물을 개체에게 투여하는 단계를 포함하는, 인플루엔자 바이러스에<br />

대한 방어 면역 반응을 일으키기 위해 개체의 면역계를 자극시키는 방법.<br />

37 실시태양 31의 면역원성 조성물을 포함하는 생 약독화 인플루엔자 백신.<br />

38 실시태양 32의 면역원성 조성물을 포함하는 분할 바이러스 또는 사멸된 바이러스 백신.<br />

39 A/앤 아버/6/60 이외의 하나 이상의 공여 바이러스로부터의 6개의 내부 게놈 분절과, 서열 번호<br />

27-32, 및 39-44의 폴리펩티드로 구성된 군으로부터 선택되는 HA 및/또는 NA 폴리펩티드를 코<br />

딩하는 2개의 게놈 분절을 포함하는 6:2 재배열 인플루엔자 바이러스.<br />

40 실시태양 39에 있어서, 공여 바이러스가 하기 표현형: 온도 감수성, 저온 적응성, 또는 약독화<br />

된 것 중 하나 이상을 포함하는 것인 6:2 재배열 인플루엔자 바이러스.<br />

41 실시태양 39에 있어서, 공여 바이러스가 PR8인 6:2 재배열 인플루엔자 바이러스.<br />

42 실시태양 39에 있어서, 공여 바이러스가 A/레닌그라드/17인 6:2 재배열 인플루엔자 바이러스.<br />

43 면역학적 유효량의, 실시태양 39의 재배열 인플루엔자 바이러스를 포함하는 면역원성 조성물.<br />

44 면역학적 유효량의, 실시태양 40의 재배열 인플루엔자 바이러스를 포함하는 면역원성 조성물.<br />

45 면역학적 유효량의, 실시태양 41의 재배열 인플루엔자 바이러스를 포함하는 면역원성 조성물.<br />

46 면역학적 유효량의, 실시태양 42의 재배열 인플루엔자 바이러스를 포함하는 면역원성 조성물.<br />

47 생리학적으로 유효한 담체 중 실시태양 39의 재배열 인플루엔자 바이러스를 면역학적 유효량으<br />

로 개체에게 투여하는 단계를 포함하는, 인플루엔자 바이러스에 대한 방어 면역 반응을 일으키<br />

기 위해 개체의 면역계를 자극시키는 방법.<br />

- 18 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


48 생리학적으로 유효한 담체 중 실시태양 40의 재배열 인플루엔자 바이러스를 면역학적 유효량으<br />

로 개체에게 투여하는 단계를 포함하는, 인플루엔자 바이러스에 대한 방어 면역 반응을 일으키<br />

기 위해 개체의 면역계를 자극시키는 방법.<br />

49 생리학적으로 유효한 담체 중 실시태양 41의 재배열 인플루엔자 바이러스를 면역학적 유효량으<br />

로 개체에게 투여하는 단계를 포함하는, 인플루엔자 바이러스에 대한 방어 면역 반응을 일으키<br />

기 위해 개체의 면역계를 자극시키는 방법.<br />

50 생리학적으로 유효한 담체 중 실시태양 42의 재배열 인플루엔자 바이러스를 면역학적 유효량으<br />

로 개체에게 투여하는 단계를 포함하는, 인플루엔자 바이러스에 대한 방어 면역 반응을 일으키<br />

기 위해 개체의 면역계를 자극시키는 방법.<br />

51 바이러스 감염에 대한 면역원성 반응을 일으키는데 유효한 양으로 실시태양 39의 바이러스를 피<br />

험체에게 투여하는 단계를 포함하는, 피험체에서 바이러스 감염을 예방학적으로 또는 치료학적<br />

으로 치료하는 방법.<br />

52 바이러스 감염에 대한 면역원성 반응을 일으키는데 유효한 양으로 실시태양 41의 바이러스를 피<br />

험체에게 투여하는 단계를 포함하는, 피험체에서 바이러스 감염을 예방학적으로 또는 치료학적<br />

으로 치료하는 방법.<br />

53 바이러스 감염에 대한 면역원성 반응을 일으키는데 유효한 양으로 실시태양 42의 바이러스를 피<br />

험체에게 투여하는 단계를 포함하는, 피험체에서 바이러스 감염을 예방학적으로 또는 치료학적<br />

으로 치료하는 방법.<br />

54 실시태양 51에 있어서, 바이러스가 사멸된 또는 불활성화된 것인 방법.<br />

55 실시태양 52에 있어서, 바이러스가 사멸된 또는 불활성화된 것인 방법.<br />

56 실시태양 53에 있어서, 바이러스가 사멸된 또는 불활성화된 것인 방법.<br />

57 실시태양 43에 있어서, 헤마글루티닌이 변형된 다염기 절단 부위를 포함하는 면역원성 조성물.<br />

58 실시태양 44에 있어서, 헤마글루티닌이 변형된 다염기 절단 부위를 포함하는 면역원성 조성물.<br />

59 실시태양 45에 있어서, 헤마글루티닌이 변형된 다염기 절단 부위를 포함하는 면역원성 조성물.<br />

60 실시태양 46에 있어서, 헤마글루티닌이 변형된 다염기 절단 부위를 포함하는 면역원성 조성물.<br />

61 실시태양 47에 있어서, 피험체가 인간인 방법.<br />

62 실시태양 48에 있어서, 피험체가 인간인 방법.<br />

63 실시태양 49에 있어서, 피험체가 인간인 방법.<br />

64 실시태양 45의 조성물을 포함하는 생 약독화 인플루엔자 백신.<br />

65 실시태양 46의 조성물을 포함하는 생 약독화 인플루엔자 백신.<br />

66 i) 인플루엔자 바이러스의 복제를 지지할 수 있는 숙주 세포 군집으로<br />

<br />

<br />

<br />

서열<br />

(a) A/앤 아버/6/60이 아닌 제1 인플루엔자 균주의 적어도 6개의 내부 게놈 분절; 및 서열 번<br />

호 27-32, 및 39-44의 폴리펩티드로 구성된 군으로부터 선택되는 HA 또는 NA 폴리펩티드를 코<br />

딩하는 적어도 하나의 게놈 분절; 또는<br />

(b) A/앤 아버/6/60이 아니며, 약독화된 것, 저온 적응성 및 온도 감수성인 것으로 구성된 군<br />

으로부터 선택되는 하나 이상의 표현형 특질을 포함하는 것인 제1 인플루엔자 균주의 적어도 6<br />

개의 내부 게놈 분절; 및 서열 번호 27-32, 및 39-44의 폴리펩티드로 구성된 군으로부터 선택<br />

되는 HA 또는 NA 폴리펩티드를 코딩하는 적어도 하나의 게놈 분절에 상응하는 뉴클레오티드 서<br />

열을 포함하는 복수개의 벡터를 도입하는 단계;<br />

ii) 35℃이하의 온도에서 숙주 세포 군집을 배양하는 단계; 및<br />

iii) 인플루엔자 바이러스를 회수하는 단계를 포함하는, 세포 배양물에서 인플루엔자 바이러스<br />

를 제조하는 방법.<br />

67 실시태양 66의 방법에 의해 제조된 인플루엔자 바이러스를 면역학적 유효량으로 포함하는 면역<br />

원성 조성물.<br />

68 생리학적으로 유효한 담체 중 실시태양 66의 방법에 의해 제조된 인플루엔자 바이러스를 면역<br />

학적 유효량으로 개체에게 투여하는 단계를 포함하는, 인플루엔자 바이러스에 대한 방어 면역<br />

반응을 일으키기 위해 개체의 면역계를 자극시키는 방법.<br />

69 실시태양 67의 면역원성 조성물을 개체에게 투여하는 단계를 포함하는, 인플루엔자 바이러스에<br />

대한 방어 면역 반응을 일으키기 위해 개체의 면역계를 자극시키는 방법.<br />

70 실시태양 67의 면역원성 조성물을 포함하는 생 약독화 인플루엔자 백신.<br />

71 실시태양 67의 면역원성 조성물을 포함하는 분할 바이러스 또는 사멸된 바이러스 백신.<br />

ca A/베트남/<strong>12</strong>03/04<br />

ca A/베트남/<strong>12</strong>03/04 H5의 뉴클레오티드 서열(서열 번호1)<br />

- <strong>19</strong> -<br />

공개특허 10-2009-0053794


<br />

<br />

<br />

<br />

<br />

전체 분자 길이: 1767 nt<br />

ca A/베트남/<strong>12</strong>03/04 H5의 아미노산 서열(서열 번호 11)<br />

전체 분자 길이: 564 aa<br />

ca A/베트남/<strong>12</strong>03/04 N1의 뉴클레오티드 서열(서열 번호 2)<br />

- 20 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


<br />

<br />

<br />

<br />

<br />

<br />

전체 분자 길이: 1398 nt<br />

ca A/베트남/<strong>12</strong>03/04 N1의 아미노산 서열(서열 번호 <strong>12</strong>)<br />

전체 분자 길이: 449 aa<br />

ca A/홍콩/213/03<br />

ca A/홍콩/213/03 H5의 뉴클레오티드 서열(서열 번호 3)<br />

- 21 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


<br />

<br />

<br />

<br />

<br />

전체 분자 길이: 1767 nt<br />

ca A/홍콩/213/03 H5의 아미노산 서열(서열 번호 13)<br />

전체 분자 길이: 564 aa<br />

ca A/홍콩/213/03 N1 (서열 번호 4)의 뉴클레오티드 서열<br />

- 22 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


<br />

<br />

<br />

<br />

<br />

<br />

전체 분자 길이: 1458 nt<br />

ca A/홍콩/213/03 N1의 아미노산 서열 (서열 번호 14)<br />

전체 분자 길이: 469 aa<br />

ca A/홍콩/491/97(HA) + A/홍콩/486/97(NA)<br />

ca A/홍콩/491/97 H5의 뉴클레오티드 서열(서열 번호 5)<br />

- 23 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


<br />

<br />

<br />

<br />

<br />

전체 분자 길이: 1767 nt<br />

ca A/홍콩/491/97 H5의 아미노산 서열(서열 번호 15)<br />

전체 분자 길이: 564 aa<br />

ca A/홍콩/486/97 N1의 뉴클레오티드 서열(서열 번호 6)<br />

- 24 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


<br />

<br />

<br />

<br />

<br />

<br />

전체 분자 길이: 1401 nt<br />

ca A/홍콩/486/97 N1의 아미노산 서열(서열 번호 16)<br />

전체 분자 길이: 450<br />

ca A/홍콩/491/97(Ser211)(HA) + ca A/홍콩/486/97(NA)<br />

ca A/홍콩/491/97(Ser211) H5의 뉴클레오티드 서열(서열 번호 7)<br />

- 25 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


<br />

<br />

<br />

<br />

<br />

전체 분자 길이: 1767 nt<br />

ca A/홍콩/491/97(Ser211) H5의 아미노산 서열(서열 번호 17)<br />

전체 분자 길이: 564 aa<br />

ca A/홍콩/486/97 N1의 뉴클레오티드 서열(서열 번호 8)<br />

- 26 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


<br />

<br />

<br />

<br />

<br />

<br />

전체 분자 길이: 1401 nt<br />

ca A/홍콩/486/97 N1의 아미노산 서열(서열 번호 18)<br />

전체 분자 길이: 450 aa<br />

ca A/ck/홍콩/G9/97<br />

ca A/ck/홍콩/G9/97의 뉴클레오티드 서열(서열 번호 9)<br />

- 27 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


<br />

<br />

<br />

<br />

<br />

전체 분자 길이: 1690 bp<br />

ca A/ck/홍콩/G9/97의 아미노산 서열(서열 번호 <strong>19</strong>)<br />

전체 분자 길이: 558 aa<br />

ca A/ck/홍콩/G9/97 N2의 뉴클레오티드 서열(서열 번호 10)<br />

- 28 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


<br />

<br />

<br />

<br />

<br />

<br />

전체 분자 길이: 1428 bp<br />

ca A/ck/홍콩/G9/97 N2의 아미노산 서열(서열 번호 20)<br />

전체 분자 길이: 469 aa<br />

A/네덜란드/2<strong>19</strong>/03<br />

A/네덜란드/2<strong>19</strong>/03 H7의 뉴클레오티드 서열(서열 번호 21)<br />

- 29 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


<br />

<br />

<br />

<br />

<br />

전체 분자 길이: 1737 bp<br />

A/네덜란드/2<strong>19</strong>/03 H7의 아미노산 서열(서열 번호 27)<br />

전체 분자 길이: 562 aa<br />

A/네덜란드/2<strong>19</strong>/03 N7의 뉴클레오티드 서열(서열 번호 22)<br />

- 30 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


<br />

<br />

<br />

<br />

<br />

<br />

<br />

전체 분자 길이: 1465 nt<br />

A/네덜란드/2<strong>19</strong>/03 N7의 뉴클레오티드 서열(서열 번호 45)<br />

전체 분자 길이: 1464 nt<br />

A/네덜란드/2<strong>19</strong>/03 N7의 아미노산 서열(서열 번호 28)<br />

전체 분자 길이: 471 aa<br />

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공개특허 10-2009-0053794


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A/ck/BC/CN-7/04<br />

A/ck/BC/CN-7/04 H7의 뉴클레오티드 서열(서열 번호 23)<br />

전체 분자 길이: 1754 bp<br />

A/ck/BC/CN-7/04 H7의 아미노산 서열(서열 번호 29)<br />

전체 분자 길이: 567 aa<br />

A/ck/BC/CN-7/04 N3의 뉴클레오티드 서열(서열 번호 24)<br />

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공개특허 10-2009-0053794


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전체 분자 길이: 1453 nt<br />

A/ck/BC/CN-7/04 N3의 아미노산 서열(서열 번호 30)<br />

전체 분자 길이: 469 aa<br />

ca A/ck/BC/CN-6/04<br />

ca A/ck/BC/CN-6/04 H7의 뉴클레오티드 서열(서열 번호 25)<br />

- 33 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


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전체 분자 길이: 1734 bp<br />

ca A/ck/BC/CN-6/04 H7의 아미노산 서열(서열 번호 31)<br />

전체 분자 길이: 560 aa<br />

ca A/ck/BC/CN-6/04 N3의 뉴클레오티드 서열(서열 번호 26)<br />

- 34 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


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전체 분자 길이: 1453 nt<br />

ca A/ck/BC/CN-6/04 N3의 아미노산 서열(서열 번호 32)<br />

전체 분자 길이: 469 aa<br />

ca A/오리<br />

ca A/오리 H6의 뉴클레오티드 서열(서열 번호 33)<br />

- 35 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


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전체 분자 길이: 1743 bp<br />

ca A/오리 H6의 아미노산 서열(서열 번호 39)<br />

전체 분자 길이: 566 aa<br />

ca A/오리 N9의 뉴클레오티드 서열(서열 번호 34)<br />

전체 분자 길이: 1460 nt<br />

ca A/오리 N9의 아미노산 서열(서열 번호 40)<br />

- 36 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


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전체 분자 길이: 470 aa<br />

ca A/검둥오리<br />

ca A/검둥오리 H6의 뉴클레오티드 서열(서열 번호 35)<br />

전체 분자 길이: 1747 bp<br />

ca A/검둥오리 H6의 아미노산 서열(서열 번호 41)<br />

전체 분자 길이: 567 aa<br />

ca A/검둥오리 N1의 뉴클레오티드 서열(서열 번호 36)<br />

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공개특허 10-2009-0053794


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전체 분자 길이: 1401 nt<br />

ca A/검둥오리 N1의 아미노산 서열(서열 번호 42)<br />

전체 분자 길이: 450 aa<br />

ca A/청둥오리<br />

ca A/청둥오리 H6의 뉴클레오티드 서열(서열 번호 37)<br />

전체 분자 길이: 1745 bp<br />

ca A/청둥오리 H6의 아미노산 서열(서열 번호 43)<br />

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공개특허 10-2009-0053794


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전체 분자 길이: 566 aa<br />

ca A/청둥오리 N2의 뉴클레오티드 서열(서열 번호 38)<br />

전체 분자 길이: 1467 nt<br />

ca A/청둥오리 N2의 아미노산 서열(서열 번호 44)<br />

전체 분자 길이: 469 aa<br />

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공개특허 10-2009-0053794


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서열번호 의미 요약<br />

도면의 간단한 설명<br />

도 1은 다염기 절단 부위를 제거하기 위해 VN/<strong>12</strong>03/2004의 HA 유전자 내로 공학처리된 변형을 나타낸다.<br />

도 2는 비내로 투여된 H5N1 ca 재배열 바이러스는 닭에서는 복제되지 못한다는 것을 나타내는 결과를 보여준다.<br />

도 3은 H5N1/AA ca 백신 후보물질이 마우스에 대해 치사적인 것은 아니라는 것을 도시한다.<br />

도 4는 <strong>19</strong>97 및 2004 H5N1 ca 재배열 바이러스의 복제는 마우스에서 제한되는 것을 도시한다.<br />

도 5는 재배열 H5N1/AA ca 인플루엔자 바이러스의 복제는 마우스의 폐에서 제한되는 것을 도시한다.<br />

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공개특허 10-2009-0053794


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도 6은 i.n.으로 백신을 단일 투약한 후 마우스에서 유도된 혈청 HAI Ab 역가를 나타낸다.<br />

도 7은 i.n.으로 백신을 단일 투약한 후 마우스에서 유도된 혈청 중화 Ab 역가를 나타낸다.<br />

도 8은 H5N1 ca 재배열 바이러스가 50, 500 또는 5000 LD50의 야생형 H5N1 바이러스를 사용한 치사 항원자극으<br />

로부터 마우스를 보호한다는 것을 도시한다.<br />

도 9는 마우스 폐에서 동종성 및 이종성 H5N1 항원자극 바이러스 복제로부터의 방어 효능을 도시한다.<br />

도 10은 마우스의 상기도에서 동종성 및 이종성 H5N1 항원자극 바이러스 복제로부터의 방어 효능을 도시한다.<br />

도 11은 마우스에서 동종성 또는 이종성 H5N1 wt 바이러스를 사용한 고용량(105 TCID5O) 항원자극에 대해 2004<br />

H5N1 ca 백신에 의해 부여되는 방어 효능을 도시한다.<br />

도 <strong>12</strong>는 마우스에서 동종성 또는 이종성 H5N1 야생형 바이러스를 사용한 고용량(105 TCID5O) 항원자극에 대해<br />

<strong>19</strong>97 및 2003 H5N1 ca 백신에 의해 부여되는 방어 효능을 도시한다.<br />

도 13은 마우스에서 저용량 또는 고용량의 동종성 H5N1 야생형 바이러스 항원자극에 대해 2004 H5N1 ca 백신에<br />

의해 부여되는 방어 효능을 도시한다.<br />

도 14는 다염기 절단 부위를 제거하기 위해 A/네덜란드/2<strong>19</strong>/03 HA의 HA 유전자내로 공학처리될 수 있는 변형을<br />

나타낸다.<br />

도 15: H5N1 ca 백신은 마우스에서 혈청 중화 항체 역가를 유도한다. 백신 투여 이전(출혈전) 및 각각의 백신<br />

투약후 28일째 혈청을 수집하였다; 검출불가능한 역가에 대해서는 값을 10으로 지정한다.<br />

도 16: H6 ca 바이러스는 페럿에서 약독성이었다. *폐의 경우, EID50/g; 비갑개의 경우, PFU/g. 10 7<br />

비내로 접종학, 조직을 감염후 3일째에 수거하였다.<br />

도 17: 페럿에서 H6 ca 백신의 면역원성.<br />

TCID50으로<br />

도 18(a) 및 18(b): 페럿에서 H6 ca 백신의 효능. (a) 폐 및 (b) 비갑개에서 바이러스 역가를 측정하였다.<br />

백신: 7 1og10 PFU 1회 투약. 항원자극: 7 1og10 PFU; 항원자극 후 3일째.<br />

도 <strong>19</strong>: H7N3 BC 04 ca는 페럿에서 약독성이었다. 접종: 0.5 mL 중 10 7<br />

일째에 수거하였다.<br />

TCID50으로 비내로 접종. 조직을 감염후 3<br />

도 20: H7N3 BC 2004 ca는 마우스에서 면역원성이다. a: ck/BC/CN-6/04 wt에 대한 혈청 중화 항체 역가의 기하<br />

평균의 역수. b: 감염후 28일째의 중화 역가와의 비교에 대한 p


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도 26: HI 항체는 건강한 성인에서 10 7.0<br />

TCID50의 H9N2 G9/AA ca에 대해 반응한다.<br />

도 27: H5N1 VN2004 A/AA ca의 복제는 건강한 성인에서 고도로 제한된다.<br />

도 28: HI 항체는 건강한 성인에서 10 6.7<br />

TCID50의 VN2004 A/AA ca에 대해 반응한다.<br />

상세한 설명<br />

본 발명은 인플루엔자 헤마글루티닌 및 뉴라미니다제의 폴리펩티드 및 폴리뉴클레오티드 서열 뿐만 아니라, 상<br />

기 서열을 포함하는 벡터, 조성물 등 및 그의 사용 방법을 포함한다. 본 발명의 추가의 특징은 본원에서 더욱<br />

상세히 설명된다.<br />

정의<br />

달리 정의되지 않는다면, 본원에서 사용되는 기술적 및 과학적 용어는 본 발명이 속한 분야의 당업자에게 통상<br />

적으로 이해되는 바와 동일한 의미를 갖는다. 하기 정의는 당업계의 정의를 보충하는 것으로, 본 출원에 관한<br />

것이며, 예로서, 임의의 공동 소유의 특허 또는 출원과 같은, 임의의 관련 또는 비관련 출원건에까지 귀속될 필<br />

요는 없다. 본원에 기술된 것과 유사하거나 등가인 임의의 방법 및 재료가 본 발명을 시험 실시하는데 사용될<br />

수 있지만, 바람직한 재료 및 방법은 본원에 기술되어 있는 것이다. 따라서, 본원에서 사용되는 용어는 단지 특<br />

정 실시태양을 기술하기 위한 목적으로 사용된 것이며, 제한하고자 하는 것은 아니다.<br />

본 명세서 및 첨부된 청구의 범위에서 사용되는 바, 단수 형태("하나"("a"), "하나"("an") 및 "그"("the"))는<br />

내용을 달리 정확하게 명시하지 않는 한 복수의 것도 포함한다. 따라서, 예를 들면, "하나의 바이러스"에 대해<br />

언급하는 것은 복수개의 바이러스를 포함하는 것이며; "숙주 세포"에 대해 언급하는 것은 숙주 세포의 혼합물<br />

등을 포함하는 것이다.<br />

"아미노산 서열"은 아미노산 잔기 중합체(단백질, 폴리펩티드 등) 또는 아미노산 중합체를 나타내는 문자 열이<br />

다.<br />

용어 "핵산," "폴리뉴클레오티드," "폴리뉴클레오티드 서열" 및 "핵산 서열" 은 싱글 스트랜드 또는 더블 스트<br />

랜드 데옥시리보뉴클레오티드 또는 리보뉴클레오티드 중합체, 그의 키메라 또는 유사체, 또는 문맥에 따라 그를<br />

나타내는 문자열을 지칭한다. 본원에서 사용되는 바, 상기 용어는 임의로 천연적으로 발생된 뉴클레오티드(예로<br />

서, 펩티드 핵산)와 유사한 방식으로 싱글 스트랜드 핵산에 하이브리드화된다는 점에서 천연 뉴클레오티드의 본<br />

질적 성질을 갖는, 천연적으로 발생된 뉴클레오티드의 유사체의 중합체를 포함한다. 달리 명시하지 않는 한, 본<br />

발명의 특정 핵산 서열은 임의로 명확하게 명시된 서열 이외에 상보적 서열을 포함한다. 임의의 구체화된 폴리<br />

뉴클레오티드 서열로부터 주어진 핵산 또는 상보적 폴리뉴클레오티드 서열(예로서, 상보적 핵산)이 결정될 수<br />

있다.<br />

용어 "핵산" 또는 "폴리뉴클레오티드"는 또한 뉴클레오티드 열에 상응될 수 있는 임의의 물리적인 단량체 열을<br />

포함하며, 이는 뉴클레오티드의 중합체(예로서, 전형적인 DNA 또는 RNA 중합체), PNAs, 변형된 올리고뉴클레오<br />

티드(예로서, 2'-O-메틸화된 올리고뉴클레오티드와 같이, 용액 중 생물학적 RNA 또는 DNA에 전형적인 것은 아닌<br />

염기를 포함하는 올리고뉴클레오티드) 등을 포함한다. 핵산은 예로서, 싱글 스트랜드 또는 더블 스트랜드일 수<br />

있다.<br />

"하위서열"은 완전한 서열까지의 것을 포함하는, 전체 서열의 임의의 일부분이다. 전형적으로 하위서열은 전장<br />

서열보다 작은 것을 포함한다. "독특한 하위서열"은 임의의 앞서 결정된 인플루엔자 폴리뉴클레오티드 또는 폴<br />

리펩티드 서열에서는 발견되지 않은 하위서열이다.<br />

폴리펩티드와 관련하여 용어 "변이체"는 참고 서열과 비교하여 하나 이상의 아미노산이 변경되어 있는 아미노산<br />

서열을 지칭한다. 변이체는 "보존적" 변화를 가질 수 있는데, 여기서, 치환된 아미노산은 류신에서 이소류신으<br />

로의 대체와 같이, 유사한 구조적 성질, 또는 화학적 성질을 갖는다. 별법으로, 변이체는 글리신에서 트리토판<br />

으로의 대체와 같이 "비보존적" 변화를 가질 수 있다. 유사한 최소한의 변형으로는 또한 아미노산 결실 또는 삽<br />

입, 또는 둘 모두를 포함할 수 있다. 아미노산 잔기가 생물학적 또는 면역학적 활성이 제거되지 않고 치환, 삽<br />

입, 또는 결실되었는지를 결정하는 것에 관한 지침은 예를 들어, DNASTAR 소프트웨어와 같이, 당업계에 잘 알려<br />

져 있는 컴퓨터 프로그램을 사용함으로써 찾아볼 수 있다. 보존적 치환의 예 또한 본원에 기술되어 있다.<br />

용어 "유전자"는 생물학적 기능과 관련하여 임의의 핵산을 지칭하는 것으로 광범위하게 사용된다. 따라서, 유전<br />

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공개특허 10-2009-0053794


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자는 코딩 서열 및/또는 그의 발현을 위해 필요한 조절 서열을 포함한다. 용어 "유전자"는 특이적인 게놈 서열<br />

뿐만 아니라, cDNA 또는 상기 게놈 서열에 의해 코딩된 mRNA에 적용된다.<br />

유전자는 또한 예를 들어, 다른 단백질에 대한 인식 서열을 형성하는 비발현 핵산 분절을 포함한다. 비발현 조<br />

절 서열로는 "프로모터" 및 "인핸서"를 포함하는데, 전사 인자와 같은 조절 단백질이 상기 "프로모터" 및 "인핸<br />

서"에 결합함으로써 인접한 또는 근접한 서열의 전사가 이루어진다. "조직 특이성" 프로모터 또는 인핸서는 특<br />

이적인 조직 유형 또는 세포 유형, 또는 유형들에서 전사를 조절하는 것이다.<br />

"유전자의 발현" 또는 "핵산의 발현"은 문맥에 따라 명시되는 바, DNA가 RNA로 전사되는 것(임의로는 예로서,<br />

스플라이싱과 같은 RNA의 변형 포함), RNA가 폴리펩티드로 번역되는 것(가능하게는, 예로서, 번역후 변형과 같<br />

은, 폴리펩티드의 추후 변형 포함), 또는 전사 및 번역, 둘 모두를 의미한다.<br />

"오픈 리딩 프레임(open reading frame)" 또는 "ORF"는 폴리펩티드로 번역될 수 있는, 번역이 가능한 DNA 또는<br />

RNA의 리딩 프레임(예로서, 유전자의 것)이다. 즉, 리딩 프레임은 정지 코돈에 의해 중단되지 않는다. 그러나,<br />

ORF라는 용어가 반드시 폴리뉴클레오티드는 실제 폴리펩티드로 번역된다는 것을 명시하는 것은 아니라는 것에<br />

주시하여야 한다.<br />

용어 "벡터"는 핵산이 유기체들, 세포들 또는 세포 성분들 간에 전파되고/거나 전달될 수 있도록 하는 수단을<br />

지칭한다. 벡터는 자발적으로 복제하거나, 숙주 세포의 염색체내로 통합될 수 있는, 플라스미드, 바이러스, 박<br />

테리오파지, 프로바이러스, 파지미드, 트랜스포존, 인공 염색체 등을 포함한다. 벡터는 또한 자발적으로 복제하<br />

지는 못하는 나형 RNA 폴리뉴클레오티드, 나형 DNA 폴리뉴클레오티드, 동일 스트랜드내에 DNA 및 RNA, 둘 모두<br />

로 이루어진 폴리뉴클레오티드, 폴리-리신-접합된 DNA 또는 RNA, 펩티드-접합된 DNA 또는 RNA, 리포좀-접합된<br />

DNA 등일 수 있다. 모두가 그러하지는 않지만, 다수의 보편적인 실시태양에서, 본 발명의 벡터는 플라스미드이<br />

다.<br />

"발현 벡터"는 벡터에 혼입되어 있는 핵산의 발현 뿐만 아니라 복제도 촉진시킬 수 있는 플라스미드와 같은 벡<br />

터이다. 전형적으로, 발현시키고자는 핵산은 프로모터 및/또는 인핸서에 "작동가능하게 연결되고," 이는 프로모<br />

터 및/또는 인핸서에 의한 전사 조절 제어에 대한 대상이 된다.<br />

"양방향 발현 벡터"는 2개의 프로모터 사이에 위치해 있는 핵산에 대하여 반대 방향으로 배향되어 있는 2개의<br />

대체 프로모터를 특징으로 하는데, 이는 발현이 양쪽 배향으로 개시될 수 있도록 함으로써 예를 들면, 플러스<br />

(+) 또는 센스 스트랜드, 및 네거티브(-) 또는 안티센스 스트랜드 RNAs, 둘 모두의 전사가 이루어질 수 있다.<br />

"폴리펩티드"는 2개 이상의 아미노산 잔기를 포함하는 중합체(예로서, 펩티드 또는 단백질)이다. 중합체는 임의<br />

로 예를 들면, 당화 등의 변형을 포함할 수 있다. 폴리펩티드의 아미노산 잔기는 천연이거나 비천연일 수 있고,<br />

치환되지 않거나, 변형되지 않거나, 치환되거나, 변형될 수 있다.<br />

본 발명과 관련하여, "단리된"이라는 용어는 일반적으로 생물학적 물질의 천연적으로 발생된 환경하에서 생물학<br />

적 물질을 수반하거나, 그와 상호작용하는 성분이 실질적으로는 없는 생물학적 물질, 예를 들면, 바이러스, 핵<br />

산 또는 단백질을 지칭한다. 단리된 생물학적 물질은 임의로 예로서, 세포 또는 야생형 바이러스와 같이 그의<br />

천연 환경에서 생물학적 물질과 함께 발견되지 않는 추가의 물질은 포함한다. 예를 들어, 세포와 같은 상기 물<br />

질이 그의 천연 환경에 존재하는 경우, 물질은 상기 환경에서 발현되는 그러한 물질에 대해 본래의 것이 아닌<br />

세포내 위치(예로서, 게놈 또는 유전 요소)에 배치될 수 있다. 예를 들어, 천연적으로 발생된 핵산(예로서, 코<br />

딩 서열, 프로모터, 및 인핸서 등)이 비천연적으로 발생된 수단에 의해 상기 핵산에 대해 본래의 것이 아닌 게<br />

놈의 유전자좌(예로서, 벡터, 예를 들면, 플라스미드 또는 바이러스 벡터 또는 앰플리콘)에 도입된다면, 이는<br />

단리된 것이다. 상기 핵산은 또한 "이종성" 핵산으로서 지칭된다. 단리된 바이러스는 예를 들면, 야생형 바이러<br />

스의 본래의 환경(예로서, 감염된 개체의 코인두) 이외의 환경(예로서, 세포 배양 시스템, 또는 세포 배양물로<br />

부터 정제)에 존재한다.<br />

바이러스와 관련하여 언급될 때, "키메라(chimeric 또는 chimera)"라는 용어는 바이러스가 1 초과의 모체 바이<br />

러스 균주 또는 공급원으로부터 유래된 유전 성분 및/또는 폴리펩티드 성분을 포함한다는 것을 의미한다. 유사<br />

하게, 바이러스 단백질과 관련하여 언급될 때, "키메라(chimeric 또는 chimera)"라는 용어는 단백질이 1 초과의<br />

모체 바이러스 균주 또는 공급원으로부터 유래된 폴리펩티드 성분(즉, 아미노산 하위서열)을 포함한다는 것을<br />

의미한다.<br />

용어 "재조합"은 물질(예로서, 핵산 또는 단백질)이 인간의 개입으로 인해 인공적으로 또는 합성적으로(비천연<br />

적으로) 변경되었음을 의미한다. 변형은 그의 천연 환경 또는 상태 내에서 실시될 수 있거나, 그로부터 제거될<br />

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공개특허 10-2009-0053794


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수 있다. 구체적으로, 예로서, 인플루엔자 바이러스는 재조합 핵산의 발현에 의해 생산된 재조합체이다. 예를<br />

들어, "재조합 핵산"은 예로서, 클로닝, DNA 셔플링 또는 다른 절차시에 핵산을 재조합함으로써, 또는 화학적<br />

또는 다른 돌연변이유발에 의해 제조된 것이며; "재조합 폴리펩티드" 또는 "재조합 단백질"은 재조합 핵산의 발<br />

현에 의해 생산된 폴리펩티드 또는 단백질이고; "재조합 바이러스," 예로서, 재조합 인플루엔자 바이러스는 재<br />

조합 핵산의 발현에 의해 생산된다.<br />

바이러스와 관련하여 언급될 때, "재배열"라는 용어는 바이러스가 1 초과의 모체 바이러스 균주 또는 공급원으<br />

로부터 유래된 유전 성분 및/또는 폴리펩티드 성분을 포함한다는 것을 의미한다. 예를 들어, 7:1 재배열체는 제<br />

1 모체 바이러스로부터 유래된 7개의 바이러스 게놈 분절(또는 유전자 분절)과, 예로서, 본 발명의 헤마글루티<br />

닌 또는 뉴라미니다제를 코딩하는, 단일의 상보적인 바이러스 게놈 분절을 포함한다. 6:2 재배열체는 제1 모체<br />

바이러스로부터 6개의 게놈 분절, 가장 보편적으로는 6개의 내부 유전자와, 다른 모체 바이러스로부터의 2개의<br />

상보적인 분절, 예로서, 헤마글루티닌 및 뉴라미니다제를 포함한다.<br />

이종성 또는 단리된 핵산과 관련하여 언급될 때, "도입된"이라는 용어는 핵산이 세포의 게놈(예로서, 염색체,<br />

플라스미드, 색소체 또는 미토콘드리아 DNA)내로 혼입되어, 자율 레플리콘으로 전환되거나, 일시적으로 발현(예<br />

로서, 형질감염된 mRNA)될 수 있는, 진핵생물 또는 원핵생물 세포내로의 핵산의 혼입을 지칭한다. 상기 용어는<br />

"감염," "형질감염," "형질전환" 및 "형질도입"과 같은 방법을 포함한다. 본 발명과 관련하여 핵산을 세포내로<br />

도입하는데 전기천공법, 인산칼슘 침전법, 지질 매개 형질감염(리포펙션) 등을 비롯한 다양한 방법이 사용될 수<br />

있다.<br />

용어 "숙주 세포"는 예로서, 벡터와 같이 이종성 핵산을 함유하며, 핵산의 복제 및/또는 발현을 지지하는 세포<br />

를 의미한다. 숙주 세포는 예로서, E. 콜라이(E. coli)와 같은 원핵생물 세포, 또는 예로서, 효모, 곤충, 양서<br />

류, 조류 또는 인간 세포를 비롯한 포유동물 세포와 같은 진핵생물 세포일 수 있다. 예시적인 숙주 세포로는 예<br />

로서, 베로(Vero)(아프리카 녹색원숭이 신장) 세포, BHK(아기 햄스터 신장: baby hamster kidney) 세포, 1차<br />

병아리 신장(PCK: primary chick kidney) 세포, 마딘-다비 개 신장(MDCK: Madin-Darby Canine Kidney) 세포,<br />

마딘-다비 소 신장 (MDBK: Madin-Darby Bovine Kidney) 세포, 293 세포(예로서, 293T 세포), 및 COS 세포(예로<br />

서, COS1, COS7 세포) 등을 포함한다.<br />

인플루엔자 바이러스의 "면역학적 유효량"은 추후의 인플루엔자 바이러스 노출에 대한 개체(예로서, 인간) 자기<br />

자신의 면역 반응을 증진시키기에 충분한 양이다. 유도된 면역 수준은 플라크 중화, 보체 고정,<br />

효소면역분석법, 또는 미세중화 분석법에 의해 중화 분비성 및/또는 혈청 항체의 양을 측정함으로써 모니터할<br />

수 있다.<br />

인플루엔자 바이러스에 대한 "방어 면역 반응"은 개체가 추후에 상기 인플루엔자 바이러스에 노출되고/거나 그<br />

로 감염되었을 때에 질환에 대해 보호적인, 개체(예로서, 인간)가 나타내는 면역 반응을 지칭한다. 몇몇의 경우<br />

에서, 인플루엔자 바이러스(예로서, 천연적으로 순환형 인플루엔자 바이러스)는 여전히 감염을 유발할 수는 있<br />

지만, 중증의 감염을 유발시킬 수는 없다. 전형적으로, 방어 면역 반응을 통해 시험관내 및 생체내에서 동일한<br />

바이러스 균주 및/또는 하위군의 바이러스(및 가능하게는 또한 상이한 비백신형 균주 및/또는 하위군의 바이러<br />

스)를 중화시킬 수 있는 숙주에 의해 발생된 혈청 및 분비성 항체를 검출가능한 수준으로 일으킨다.<br />

본원에서 사용되는 바, "항체"는 실질적으로 또는 부분적으로 면역글로불린 유전자 또는 면역글로불린 유전자의<br />

단편에 의해 코딩된 하나 이상의 폴리펩티드를 포함하는 단백질이다. 인지된 면역글로불린 유전자로는 카파, 람<br />

다, 알파, 감마, 델타, 입실론 및 뮤 불변 영역 유전자 뿐만 아니라, 무수히 많은 면역글로불린 가변 영역 유전<br />

자를 포함한다. 경쇄는 카파 또는 람다로 분류된다. 중쇄는 감마, 뮤, 알파, 델타, 또는 입실론으로 분류되며,<br />

결국 이는 각각 면역글로불린 부류인, IgG, IgM, IgA, IgD 및 IgE를 정의한다. 전형적인 면역글로불린(항체) 구<br />

조 단위는 사량체를 포함한다. 각각의 사량체는 2개의 동일한 폴리펩티드 쇄 쌍으로 구성되는데, 각각은 하나의<br />

"경쇄"(약 25 kD)와 하나의 "중쇄"(약 50-70 kD)를 갖는다. 각 쇄의 N-말단은 주로 항원 인식을 담당하는 약<br />

100 내지 110개 이상의 아미노산으로 이루어진 가변 영역을 정의한다. 가변 경쇄(VL) 및 가변 중쇄(VH)라는 용<br />

어는 각각 이러한 경쇄 및 중쇄를 지칭한다. 항체는 온전한 면역글로불린으로서, 또는 다양한 펩티다제로 분해<br />

되어 생성된 것인 다수의 잘 특징화된 단편으로서 존재한다. 따라서, 예를 들어, 펩신은 힌지 영역내 이황화 결<br />

합 아래의 항체를 분해하여 F(ab)'2를 생성하는데, 이는 그 자체가 이황화 결합에 의해 VH-CH1에 연결되어진 경<br />

쇄인 Fab 이량체이다. F(ab)'2는 힌지 영역내 이황화 결합을 파괴시키는 경미한 조건하에서 환원됨으로써<br />

(Fab')2 이량체는 Fab' 단량체로 전환될 수 있다. Fab' 단량체는 본질적으로 힌지 영역의 일부를 갖는 Fab이다<br />

(기타 항체 단편에 관한 보다 상세한 설명에 대해서는 [Fundamental Immunology, W.E. Paul, ed., Raven<br />

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공개특허 10-2009-0053794


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Press, N.Y. (<strong>19</strong>99)]를 참조한다). 온전한 항체의 분해에 의해 다양한 항체 단편이 정의되지만, 기술자는 상기<br />

와 같은 Fab' 단편은 화학적으로 또는 재조합 DNA 방법을 사용함으로써 새롭게 합성될 수 있다는 것을 이해할<br />

것이다. 따라서, 본원에서 사용되는 바, 항체라는 용어는 항체 또는 전체 항체의 변형에 의해 제조되거나, 재조<br />

합 DNA 방법을 사용함으로써 새롭게 합성된 단편을 포함한다. 항체는 예로서, 폴리클로날 항체, 모노클로날 항<br />

체, 다중 또는 단일 쇄 항체(가변 중쇄 및 가변 경쇄가 함께 (직접적으로 또는 펩티드 링커를 통해) 연결되어<br />

연속 폴리펩티드를 형성하는 것인 단일 쇄 Fv (sFv 또는 scFv) 항체 포함), 및 인간화된 항체 또는 키메라 항체<br />

를 포함한다.<br />

인플루엔자 바이러스<br />

본 발명의 폴리펩티드 및 폴리뉴클레오티드, 예로서, 서열 번호 1-45는 인플루엔자 HA 및 NA 서열의<br />

변이체이다. 일반적으로 인플루엔자 바이러스는 분절된 싱글 스트랜드 RNA 게놈을 함유하는 내부 리보뉴클레오<br />

단백질 중심부와 기질 단백질이 늘어서 있는 외부의 지단백 외피로 구성되어 있다. 인플루엔자 바이러스의 게놈<br />

은 면역원성 헤마글루티닌(HA) 및 뉴라미니다제(NA) 단백질을 코딩하는 선형(-) 스트랜드 리보핵산(RNA), 및 6<br />

개의 내부 중심부 폴리펩티드: 뉴클레오캡시드 뉴클레오단백질(NP); 기질 단백질(M); 비구조 단백질(NS); 및 3<br />

개의 RNA 폴리머라제(PA, PB1, PB2) 단백질로 이루어진 8개의 분절로 구성된다. 복제시 게놈 바이러스 RNA는 숙<br />

주 세포의 핵에서 (+) 스트랜드 메신저 RNA 및 (-) 스트랜드 게놈 cRNA로 전사된다. 8개의 게놈 분절 각각은<br />

RNA 이외에, NP 및 폴리머라제 복합체(PB1, PB2, 및 PA)를 함유하는 리보뉴클레오단백질 복합체로 패킹된다.<br />

인플루엔자는 통상 인플루엔자 A 및 인플루엔자 B 카테고리로 분류된다. 인플루엔자 A 및 인플루엔자 B 카테고<br />

리 바이러스 각각은 음극성을 갖는, 8개의 분절로 이루어진 싱글 스트랜드 RNA를 함유한다. 분절 1-3은 RNA-의<br />

존성 RNA 폴리머라제를 구성하는 3개의 폴리펩티드를 코딩한다. 분절 1은 폴리머라제 복합체 단백질 PB2를 코딩<br />

한다. 나머지 폴리머라제 단백질 PB1 및 PA는 각각 분절 2와 분절 3으로 코딩된다. 또한, 몇몇 인플루엔자 균주<br />

의 분절 1은 PB1 코딩 영역내의 대체 리딩 프레임으로부터 생산된 작은 단백질인 PB1-F2를 코딩한다. 분절 4는<br />

감염시 세포 부착 및 진입에 관여하는 헤마글루티닌(HA) 표면 당단백질을 코딩한다. 분절 5는 바이러스 RNA와<br />

관련하여 주된 구조 성분인 뉴클레오캡시드 뉴클레오단백질(NP) 폴리펩티드를 코딩한다. 분절 6은 뉴라미니다제<br />

(NA) 외피 당단백질을 코딩한다. 분절 7은 M1 및 M2로 명시되는 2개의 기질 단백질을 코딩하는데, 이는 차별적<br />

으로 스플라이싱된 mRNAs로부터 번역된 것이다. 분절 8은 2개의 비구조 단백질, NS1 및 NS2를 코딩하는데, 이는<br />

교대로 스플라이싱된 mRNAs로부터 번역된 것이다. 인플루엔자 B의 8개의 게놈 분절이 11개의 단백질을<br />

코딩한다. 가장 큰 3개의 유전자가 RNA 폴리머라제의 성분인, PB1, PB2 및 PA를 코딩한다. 분절 4는 HA 단백질<br />

을 코딩한다. 분절 5는 NP를 코딩한다. 분절 6은 NA 단백질 및 NB 단백질를 코딩한다. NB 및 NA, 이 두 단백질<br />

모두는 바이시스트론 mRNA의 중복 리딩 프레임으로 번역된다. 인플루엔자 B의 분절 7은 또한 2개의 단백질: M1<br />

및 BM2를 코딩한다. 가장 작은 분절은 2개의 생성물을 코딩하는데; NS1은 전길이의 RNA로부터 번역되는 반면,<br />

NS2는 스플라이싱된 mRNA 변이체로부터 번역된다.<br />

인플루엔자 바이러스 백신<br />

본원의 서열, 조성물 및 방법은 오로지 단독으로 그러한 것은 아니지만, 주로 백신용의 인플루엔자 바이러스 제<br />

조에 관한 것이다. 역사상, 인플루엔자 바이러스 백신은 주로 관련 균주의 실험적 예측에 의해 선택되었거나,<br />

그에 기초한 바이러스 균주를 사용하여 암닭 부화란에서 제조되었다. 보다 최근에는 허가받은 약독화된 온도 민<br />

감성 마스터 균주와 관련하여 선택된 헤마글루티닌 및/또는 뉴라미니다제 항원을 혼입시키는 재배열 바이러스가<br />

제조되었다. 암탉에서 다회에 걸쳐 계대접종하여 바이러스를 배양한 후, 인플루엔자 바이러스를 회수하고, 임의<br />

로는 예로서, 포름알데히드 및/또는 β-프로피오락톤(또는 별법으로 생 약독화 백신에서 사용)을 사용하여 불활<br />

성화시킨다. 따라서, HA 및 NA 서열(예로서, 서열 번호 1-45)이 인플루엔자 백신을 작제하는데 매우 유용하다는<br />

것을 이해할 것이다. 본 발명은 범유행성 인플루엔자 균주의 HA 및/또는 NA 서열(여기서, HA 서열은 변형된 다<br />

염기 절단 부위, 예를 들면, 본원에 기술된 변형물을 포함하는 것을 포함)을 포함하는 바이러스/백신을 포함하<br />

는데; 여기서, 바이러스/백신은 ca 골격, 예를 들면, A/AA/6/60 또는 PR8의 골격을 포함하는 것을 포함한다.<br />

백신 제조용으로 허가받은 균주 중 몇몇은 표준 세포 배양 조건하에서 효율적으로 성장할 수 없기 때문에 세포<br />

배양물에서 재조합 및 재배열 백신을 제조하려는 시도는 곤란을 겪었다. 그러나, 본 발명자들과 그의 동료들에<br />

의한 종래 연구는 벡터 시스템, 및 배양물에서 재조합 및 재배열 바이러스를 제조하는 방법을 제공하였고, 이로<br />

써, 하나 또는 다수의 선택된 바이러스 항원 균주, 예로서, 또는 B 균주, 다양한 하위유형 또는 하위균주 등에<br />

상응하며, 예로서, 본원의 HA 및/또는 NA 서열을 포함하는 백신을 신속하게 제조할 수 있게 되었다. 2002년 10<br />

월 23일 출원된 미국 출원 번호 제60/420,708호(Multi-Plasmid System for the production of Influenza<br />

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공개특허 10-2009-0053794


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virus), 2003년 4월 25일 출원된 미국 출원 번호 제10/423,828호 및 2004년 5월 24일 출워된 미국 출원 번호<br />

제60/574,117호를 참조한다. 전형적으로, 배양물은 시스템, 예를 들면, 세포 배양물 인큐베이터에서 습도 및<br />

CO2의 조절하에 예를 들면, 온도가 35℃를 초과하지 않도록 하는 자동 온도 조절 장치와 온도 조절기의 사용으로<br />

일정하게 유지되는 온도하에서 유지된다. 관심의 대상이 되는 균주로부터 유래된 상보적 분절(예로서, 본원의<br />

HA 및/또는 NA 항원성 변이체)과 함께, 마스터 인플루엔자 바이러스의 게놈 분절에 상응하는 벡터 하위세트를<br />

도입함으로써 재배열 인플루엔자 바이러스를 용이하게 수득할 수 있다. 전형적으로, 마스터 균주는 백신 투여와<br />

관련하여 바람직한 성질에 기초하여 선택된다. 예를 들어, 백신 제조를 위해, 예로서, 생 약독화 백신 제조를<br />

위해서는 저온 약독화 표현형, 저온 적응성 및/또는 온도 감수성에 대해 마스터 공여 바이러스 균주가<br />

선택된다. 본원 다른 곳, 및 예로서, 미국 특허 출원 번호 제10/423,828호 등에서 설명되는 바와 같이, 본 발명<br />

의 다양한 실시태양은 원하는 재배열 바이러스를 생성하기 위해 그 위에 HA 및/또는 NA 유전자(예로서, 본원에<br />

열거되어 있는 서열 등)가 첨가되는 "골격"으로서 A/앤 아버(AA)/6/60 인플루엔자 균주를 사용한다. 따라서, 예<br />

를 들어, 6:2 재배열체에서 2개의 유전자(즉, NA 및 HA)는 인플루엔자 균주(들)에 대한 면역원성 반응이 바람직<br />

할 경우의 인플루엔자 균주(들)로부터 유래될 것이며, 이에 반해, 다른 6개의 유전자는 앤 아버 균주, 또는 다<br />

른 골격 균주 등으로부터 유래될 것이다. 앤 아버 바이러스는 그의 저온 적응성, 약독화, 온도 감수성 특질에<br />

대해 유용하다. 물론, 본원의 HA 및 NA 서열이 다수의 기타 바이러스 유전자 또는 재배열체에 존재하는 다른 인<br />

플루엔자 유전자, 즉, 비-HA 및 비-NA 유전자를 함유하는 바이러스 유형(예로서, 다수의 상이한 "골격," 예를<br />

들면, PR8 등)과 재배열될 수 있다는 것을 이해할 것이다.<br />

본원의 다양한 실시태양은 범유행성 인플루엔자용의, 본원의 HA 및/또는 NA 서열을 갖는 생 약독화 백신을 포함<br />

한다. 그러한 백신은 전형적으로 예로서, 서열 번호 11-20, 27-32, 또는 39-44의 HA 및/또는 NA 서열, 또는 서<br />

열 번호 1-10, 21-26, 33-38, 또는 45의 상기에 상응하는 코딩 뉴클레오티드를 포함한다. 난에서 백신 바이러스<br />

균주(예로서, 재배열체)가 성장함으로써 발생하게 되는 한가지 문제는 백신이 난안에서 생산되는데 그 난을 조<br />

류 균주(범유행병에 관여할 수 있다)가 난을 죽일 수 있다는 점이며, 따라서, 종래(비-플라스미드 구제) 재배열<br />

생산법을 사용함으로써 조작, 제조 등을 하기는 어렵다. 그러한 조류 균주는 인간에서는 인플루엔자를, 그리고<br />

가능하게는 범유행병을 유발할 수 있다고 증거를 통해 제시되고 있는 바, 상기의 조류 균주는 관심의 대상이 된<br />

다. 따라서, 범유행성 균주, 예를 들면, 다양한 조류 서열(예로서, 본원의 HA 및 NA 서열)를 포함하는 인플루엔<br />

자 재배열체를 생성/조작하기 위해 플라스미드-구제 시스템을 사용하는 것이 매우 바람직할 수 있으며, 이는 본<br />

발명의 특징이 된다. 그러나, 본 서열은 또한 비-플라스미드 또는 종래 시스템과 함께 사용할 수 있다는 것을<br />

이해할 것이다.<br />

수생 조류(다른 것들 중)는 5개의 헤마글루티닌(HA) 및 9개의 뉴라미니다제(NA) 하위유형으로 이루어진 인플루<br />

엔자 A 바이러스로 감염될 수 있다. 상기 조류는 신규한 인플루엔자 하위유형이 인간 군집으로 도입될 수 있는<br />

저장소로서의 역할을 할 수 있으며, 범유행병을 유발할 수 있다. 2003년 네덜란드에서 조류 H7N7 인플루엔자 A<br />

바이러스가 인간을 감염시켰고, 그보다 좀더 일찍 홍콩에서는 조류 H5N1 및 H9N2 바이러스가 인간을 감염시켰다<br />

는 관찰 결과는 이들(및 다른) 하위유형이 범유행병을 유발할 수 있는 잠재능을 갖고 있다라는 우려를<br />

자아냈다. 따라서, 조류 인플루엔자 A 바이러스로 인간 감염을 예방하는 백신이 요구되고 있다. 인간 인플루엔<br />

자 바이러스에 대한 생, 약독화 인플루엔자 A 바이러스 백신이 최근 미국에서 허가를 받았다. 그러한 백신은 A/<br />

앤 아버(AA)/6/60(H2N2) 저온 적응성(ca) 바이러스의 내부 단백질 유전자가 재배열 바이러스(즉, 비-앤 아버 균<br />

주로부터의 헤마글루티닌 및 뉴라미니다제 유전자를 갖는 것)에 AA ca 바이러스의 저온 적응성, 약독화 및 온도<br />

감수성 표현형을 부여하는 것인 재배열 H1N1 및 H3N2 바이러스이다. 조류 인플루엔자 A 바이러스로부터의 헤마<br />

글루티닌 및 뉴라미니다제 유전자(H4-H14 하위유형) 및 AA ca 바이러스로부터의 6개의 내부 유전자 분절을 함유<br />

하는 재배열 바이러스를 생성하기 위해 종래의 유전자 재배열 및 플라스미드-기초 역 유전자 기법이 적용되어<br />

왔다. 그러한 재배열 바이러스가 본 발명의 특징이 된다. 하기 HA 및 NA 유전자 서열을 참조한다. AA ca 바이러<br />

스와 관련된 표현형이 재배열 바이러스에 존재하기 때문에 이들 바이러스는 후보 물질 백신에서 바람직할 수 있<br />

는 생물학적 성질을 갖고 있다. 백신용 근원 바이러스로서 이들 재배열 바이러스를 생성하고 평가하는 것이 범<br />

유행병 대비에 있어 중요한 단계이다. 임상 시험이 상기와 같은 생 약독화 범유행성 백신의 안전성, 감염성 및<br />

면역원성을 확립할 수 있다고 주시된다. 본 발명의 다른 실시태양은 플라스미드-구제 재배열(예로서, A/앤 아버<br />

6/60(즉, A/AA/6/60), PR8 등과의 재배열)을 통해 생성되는 범유행성 백신을 제조하기 위해서 상기 열거된 것<br />

이외에, 예로서, 조류, 돼지 등, 범유행성 바이러스 균주로부터의 범유행성 항원성 유전자 HA 및/또는 NA를 포<br />

함하는 재배열 바이러스(예로서, 백신에서 사용되는 것)를 포함한다. 상기 바이러스 및 백신의 작제 방법 및 사<br />

용 방법 또한 포함된다. 본원에서 사용되는 "범유행성 바이러스 균주"는 인간 군집에서는 유행하지 않으며, 질<br />

병 대책 센터(Centers for Disease Control) 또는 세계 보건 기구(World Health Organization)로부터 범유행성<br />

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균주로서 공표된 것이거나, 일반적으로 과학 공동체내에서는 그 자체로서 인정되는 것인 인플루엔자 균주 A 바<br />

이러스 하위유형으로서 정의된다.<br />

본원의 다양한 실시태양에서, 항원성 서열(예로서, HA 서열) 뿐만 아니라, 바이러스 및 상기 바이러스로부터의<br />

백신은 변형된 다염기 절단 부위를 포함한다. 몇몇 고도로 병원성인 조류 범유행성 인플루엔자 균주는 헤마글루<br />

티닌 서열내 다염기 아미노산 절단 부위를 포함한다. 예로서, [Li et al., J. of Infectious Diseases,<br />

179:1132-8, <strong>19</strong>99]를 참조한다. 본원의 전형적인 실시태양에서, 상기와 같은 절단 부위는 본 서열이 유래된 야<br />

생형 서열과 비교하여 예를 들면, 그의 서열내에서 변형되거나 변경된다(예로서, 이를 통해 상기 절단은 무력화<br />

되거나, 그 안에서의 절단은 감소하게 된다). 상기 변형/변경은 야생형 서열내 절단 부위의 다양한 서열에 기인<br />

하여 상이한 균주에서는 상이할 수 있다. 예를 들어, 성숙한 H5의 326-329 위치의 4개의 다염기 잔기(RRKK)는<br />

전형적으로 (wt와 비교하여) 본원 서열내에 제거되어 있다. "서열"을 참조한다. 다양한 실시태양에서, 다염기<br />

절단 부위는 여러 방법으로 변형될 수 있다(상기 방법 모두가 본 발명에 포함되어 있다). 예를 들어, 다염기 절<br />

단 부위는 한번에 1개의 아미노산이 제거될 수 있다(예로서, 1개의 R이 제거되거나, 2개의 Rs이 제거되거나, 3<br />

개의 RRK가 제거되거나, RRKK가 제거될 수 있다). 추가로, 절단 부위의 직상류부에 있는 아미노산 잔기는 또한<br />

제거되거나 변경될 수 있고(예로서, R로부터 T 등으로 변경될 수 있고); 절단 부위 바로 뒤의 아미노산 잔기를<br />

코딩하는 뉴클레오티드 또한 변형될 수 있다. 절단 부위 변형에 대한 설명에 대해서 예로서, 도 1을 참조한다.<br />

또한, 인플루엔자 바이러스의 헤마글루티닌 폴리펩티드 서열은 아미노 말단 신호 펩티드 서열을 포함하는 바,<br />

따라서, 본 발명의 헤마글루티닌 폴리펩티드 서열은 성숙한(아미노 말단 신호 펩티드가 절단된) 형태의 헤마글<br />

루티닌 폴리펩티드 및 절단되기 이전 형태인 헤마글루티닌, 둘 모두를 포함한다. 임의의 인플루엔자 균주의 임<br />

의의 헤마글루티닌 폴리펩티드 서열의 절단 부위는 당업계의 다수 방법들 중 임의의 것을 사용함으로써 통상적<br />

으로 측정되거나 예측될 수 있다.<br />

임의로 본 서열을 포함하는 바이러스(전형적으로 백신으로서 사용되거나, 백신 제조를 위해 사용되는 바이러<br />

스)에 적용되는 바, "온도 감수성," "저온 적응성" 및 "약독화"라는 용어 또한 당업계에 잘 알려져 있다. 예를<br />

들어, "온도 감수성"(ts: temperature sensitive)이라는 용어는 예로서, 바이러스가 인플루엔자 A 균주에 대해<br />

33℃에 비해 39℃에서 100배 이상 감소된 역가를 나타내거나, 바이러스가 인플루엔자 B 균주에 대해 33℃에 비<br />

해 37℃에서 100배 이상 감소된 역가를 나타내는 것을 의미한다. "저온 적응성"(ca: cold adapted)이라는 용어<br />

는 바이러스가 25℃에서, 33℃에서의 성장의 100배 이내의 성장을 보이는 것을 의미하는 반면, "약독화"(att)라<br />

는 용어는 바이러스가 페럿의 상기도에서 복제하지만, 페럿의 폐 조직에서는 검출되지 않으며, 상기 동물에서<br />

인플루엔자-유사 질환을 유발하지는 것을 의미한다. 중간 표현형을 갖는 바이러스, 즉, 39℃(A 균주 바이러스의<br />

경우) 또는 37℃(B 균주 바이러스의 경우)에서 역가가 100배 미만으로 감소된 바이러스, 또는 33℃에서의 성장<br />

을 100배를 초과하는(예로서, 200배, 500배, 1000배, 10,000배 미만 이내) 성장을 25℃에서 나타내는 바이러스,<br />

및/또는 페럿의 상기도에서의 성장과 비교하여 폐에서의 성장이 감소된 것을 나타내는 바이러스(즉, 부분적으로<br />

약독화 바이러스) 및/또는 동물에서 인플루엔자 유사 질환이 감소된 것을 나타내는 바이러스는 또한 유용한 바<br />

이러스이며, 이는 본원의 HA 및 NA 서열과 함께 사용될 수 있다는 것을 이해할 것이다.<br />

이에 다시, 본 발명의 HA 및 NA 서열은 임의로 재배열 백신(및/또는 기타 ts, cs, ca, 및/또는 att 바이러스 및<br />

백신)의 제조 또는 상기 재배열 백신에 사용된다. 그러나, 본 발명의 HA 및 NA 서열 등은 특정의 백신 조성물<br />

또는 제조 방법으로 제한되는 것이 아니며, 따라서, 균주 특이적인 HA 및 NA 항원(예로서, 서열 번호 11-20,<br />

27-32, 또는 39-44 또는 특이적인 HA 및 NA 항원을 코딩하는, 상기에 상응하는 뉴클레오티드, 예로서, 서열 번<br />

호 1-10, 21-26, 33-38, 또는 45 중 임의 것)을 사용하는, 실질적으로 임의의 백신 유형 또는 백신 제조 방법에<br />

사용될 수 있다는 것에 주목하여야 한다.<br />

플루미스트(FLUMIST)<br />

상기 언급한 바와 같이, 다수의 인플루엔자 백신 예와 유형이 존재한다. 대표적인 인플루엔자 백신은 어린이와<br />

성인을 인플루엔자 질환으로부터 보호하는 생, 약독화 백신인 플루미스트이다([Belshe et al. (<strong>19</strong>98) The<br />

efficacy of live attenuated, cold-adapted, trivalent, intranasal influenza virus vaccine in children N<br />

Engl J Med 338:1405-<strong>12</strong>]; [Nichol et al. (<strong>19</strong>99) Effectiveness of live,ttenuated intranasal influenza<br />

virus vaccine in healthy, working adults: a randomized controlled trial JAMA 282: 137-44]).<br />

전형적이고, 바람직한 실시태양에서, 본 발명의 방법 및 조성물은 플루미스트 백신 제조에 적합화되고/거나<br />

그와 함께 사용되는 것이 바람직하다. 그러나, 본원의 서열, 방법, 조성물 등은 또한 유사하거나, 심지어 상이<br />

한 바이러스 백신의 제조에도 적합화될 수 있다는 것을 당업자는 이해할 것이다.<br />

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<br />

<br />

플루미스트 백신 균주는 예로서, 보통 마스터 공여 바이러스(MDV: master donor virus)로부터의 6개의<br />

분절인, PB1, PB2, PA, NP, M 및 NS와 함께, 상기 백신이 처리하는 균주(예로서, 야생형 균주)로부터 유래된 HA<br />

및 NA 유전자 분절을 함유한다. 따라서, 본원의 HA 서열은 각종 플루미스트 제제의 일부가 된다. 플루미스트<br />

의 인플루엔자 A 균주에 대한 MDV는 순차적으로 더 낮은 온도하에 1차 닭 신장 조직 배양물 중 야생형 A/앤<br />

아버/6/60 (A/AA/6/60) 균주를 연속하여 계대접종함으로써 생성하였다[Maassab (<strong>19</strong>67) Adaptation and growth<br />

characteristics of influenza virus at 25 degrees C Nature 213:6<strong>12</strong>-4]. MDV-A는 25℃에서 효율적으로 복제<br />

하지만(ca, 저온 적응성), 그의 성장은 38 및 39℃에서 제한되어 있다(ts, 온도 감수성). 추가로, 이러한 바이<br />

러스는 감염된 페럿의 폐에서는 복제하지 못한다(att, 약독화). ts 표현형은 기도 중 가장 저온인 부위를 제외<br />

한 모든 부위에서 그의 복제를 제한함으로써 백신의 약독화에 기여하는 것으로 여겨지고 있다. 이러한 성질의<br />

안정성은 동물 모델 및 임상 시험에서 입증되었다. 화학적 돌연변이에 의해 생성된 인플루엔자 균주의 ts 표현<br />

형과는 대조적으로, MDV-A의 ts 성질은 감염된 햄스터를 거친 계대접종 후 또는 어린이로부터 얻은 방출된 단리<br />

물에서 복귀하지 않는다(최근 리뷰를 위해, [Murphy & Coelingh (2002) Principles underlying the<br />

development and use of live attenuated cold-adapted influenza A 및 B virus vaccines Viral Immunol<br />

15:295-323]를 참조한다).<br />

20,000여명의 성인 및 어린이에서 실시된 <strong>12</strong>개의 별개의 6:2 재배열 균주를 포함하는 임상 연구는 이들 백신이<br />

약독화된 것이며, 안전하고 효능이 있다는 것으로 제시하였다([Belshe et al. (<strong>19</strong>98) The efficacy of live<br />

attenuated, cold-adapted, trivalent, intranasal influenza virus vaccine in children N Engl J Med<br />

338:1405-<strong>12</strong>]; [Boyce et al. (2000) Safety and immunogenicity of adjuvanted and unadjuvanted subunit<br />

influenza vaccines administered intranasally to healthy adults Vaccine <strong>19</strong>:217-26]; [Edwards et al.<br />

(<strong>19</strong>94) A randomized controlled trial of cold adapted and inactivated vaccines for the prevention of<br />

influenza A disease J Infect Pis 169:68-76]; [Nichol et al. (<strong>19</strong>99) Effectiveness of live,ttenuated<br />

intranasal influenza virus vaccine in healthy, working adults: a randomized controlled trial JAMA 282:<br />

137-44]).<br />

MDV-A의 6개의 내부 유전자와 야생형 바이러스의 2개의 HA 및 NA 유전자 분절을 수반하는 재배열체(즉, 6:2 재<br />

배열체)는 ca, ts 및 att 표현형을 일관되게 유지한다[Maassab et al. (<strong>19</strong>82) Evaluation of a cold-<br />

recombinant influenza virus vaccine in ferrets J. Infect. Pis. 146:780-900]. 인플루엔자 B 균주를 사용하<br />

여 상기와 같은 재배열된 바이러스를 제조하는 것은 더욱 어렵지만, 최근 연구(예로서, 2002년 10월 23일 출원<br />

된 미국 출원 번호 제60/420,708호(Multi-Plasmid System for the Production of Influenza Virus), 2003년 4<br />

월 25일 출원된 미국 출원 번호 제10/423,828호, 및 2004년 5월 24일 출원된 미국 출원 번호 제60/574,117호<br />

참고)는 전적으로 클로닝된 cDNA로부터 인플루엔자 B 바이러스를 생성하기 위한 8개의 플라스미드 시스템을 제<br />

시하였다. 백신 제제, 예를 들면, 비내 투여에 유용한 생 바이러스 백신 제제에 대해 적합한 약독화 생 인플루<br />

엔자 A 및 B 바이러스 제조 방법 또한 제시하였다.<br />

상기 기술된 시스템 및 방법은 예를 들면, 비내 투여에 적합한 백신과 같은 생 약독화 백신을 비롯한 백신으로<br />

사용하기 적합한 바이러스를 포함하는 재조합 및 재배열 인플루엔자 A 및 B 바이러스를 세포 배양물에서 신속하<br />

게 제조하는데 유용하다. 본 발명의 서열(예로서, 뉴클레오티드 서열인 서열 번호 1-10, 21-26, 33-38, 또는 45<br />

및 서열 번호 11-20, 27-32, 또는 39-44의, 상기 뉴클레오티드 서열에 의해 코딩되는 상응하는 아미노산), 방법<br />

은 임의로 백신용 바이러스를 제조하기 위해 예로서, 백신 제조용의 재배열된 인플루엔자 바이러스를 포함하는<br />

상기와 같은 종래 연구와 함께, 또는 그와 조합되어 사용된다.<br />

백신의 예방학적 투여 방법 및 조성물<br />

상기 언급한 바와 같이, 별법으로, 또는 플루미스트 백신 제조에서의 용도이외에 본 발명은 다른 백신 제제에<br />

사용될 수 있다. 일반적으로, 본 발명의 재조합 및 재배열 바이러스(예로서, 서열 번호 1-10, 21, 23-26, 33-<br />

38, 또는 45의 폴리뉴클레오티드, 또는 서열 번호 11-20, 27-32, 또는 39-44의 폴리펩티드, 또는 그의 단편을<br />

포함하는 것)은 HA 및/또는 NA 서열에 의해 결정되는 바, 하나 이상의 인플루엔자 바이러스 균주에 대하여 특이<br />

적인 면역 반응을 자극시키기 위하여 면역학적 유효량으로 및 적절한 담체 또는 부형제 중 예방학적으로 투여될<br />

수 있다. 전형적으로, 담체 또는 부형제는 약제학적으로 허용가능한 담체 또는 부형제, 예를 들면, 멸균수, 염<br />

수 수용액, 완충처리된 염수 수용액, 덱스트로스 수용액, 글리세롤 수용액, 에탄올 또는 그의 조합물이다. 멸균<br />

성, pH, 등장성, 및 안정성을 보장하며 그러한 용액을 제조하는 것은 당업계에 확립된 프로토콜에 따라 수행된<br />

다. 일반적으로, 담체 또는 부형제는 알레르기 및 기타 바람직하지 못한 작용을 최소화하며, 예로서, 피하, 근<br />

- 48 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


<br />

<br />

<br />

<br />

<br />

<br />

육내, 비내 등과 같은 특정의 투여 경로에 적합하도록 선택된다.<br />

본 발명의 관련된 측면은 개체의 면역계를 자극시켜 인플루엔자 바이러스에 대한 방어 면역 반응을 일으키는 방<br />

법을 제공한다. 본 방법에서 면역학적 유효량 의 재조합 인플루엔자 바이러스(예로서, 본 발명의 HA 및/또는 NA<br />

분자를 포함하는 것), 면역학적 유효량의 본 발명의 폴리펩티드, 및/또는 면역학적 유효량의 본 발명의 핵산은<br />

생리학적으로 허용가능한 담체 중에서 개체에게 투여된다.<br />

일반적으로 본 발명의 인플루엔자 바이러스는 하나 이상의 인플루엔자 바이러스 균주(즉, 본 발명의 HA 및/또는<br />

NA 균주)에 대해 특이적인 면역 반응을 자극시키는데 충분한 양으로 투여된다. 바람직하게, 인플루엔자 바이러<br />

스를 투여하는 것이 상기 균주에 대한 방어 면역 반응을 유도한다. 하나 이상의 인플루엔자 균주에 대한 방어<br />

면역 반응을 유도하는 용량 및 방법은 당업자에게 알려져 있다. 예로서, USPN 5,922,326; ([Wright et al,<br />

Infect. Immun. 37:397-400 (<strong>19</strong>82)]; [Kim et al, Pediatrics 52:56-63 (<strong>19</strong>73)]; 및 [Wright et al., J.<br />

Pediatr. 88:931-936 (<strong>19</strong>76)])을 참조한다. 예를 들어, 인플루엔자 바이러스는 약 1-1000 HID50(인간 감염<br />

용량: human infectious dose)의 범위로, 즉, 투여량당 약 10 5<br />

- 10 8<br />

pfu (플라크 형성 단위: plaque forming<br />

unit)로 투여된다. 전형적으로, 용량은 예를 들면, 연령, 신체 상태, 체중, 성별, 섭식, 투여 시간, 및 기타 임<br />

상적 인자에 기초하여 상기 범위내에서 조정될 것이다. 예방학적 백신 제제는 예를 들면, 바늘 및 시린지, 또는<br />

바늘없는 주사 장치를 사용하여 피하 또는 근육내 주사에 의해 전신 투여된다. 별법으로, 백신 제제는 드롭스,<br />

큰 입자 에어로졸(약 10 미크론 초과), 또는 상기도로의 분무에 의해 비내로 투여된다. 상기 전달 경로들 중 어<br />

느 것이나 방어적인 전신 면역 반응을 일으키지만, 비내 투여가 인플루엔자 바이러스 진입 부위에서 점막 면역<br />

을 유도한다는 추가적인 잇점을 부여한다. 비내 투여의 경우에는 주로 약독화 생 바이러스 백신, 예로서, 약독<br />

화, 저온 적응성 및/또는 온도 감수성의 재조합 또는 재배열 인플루엔자 바이러스가 바람직하다. 상기를 참조한<br />

다. 단일 투약으로 방어 면역 반응을 자극시키는 것이 바람직하지만, 원하는 예방학적 효과를 달성하기 위해서<br />

는 동일하거나 상이한 경로에 의해 추가의 용량을 투여할 수 있다.<br />

전형적으로, 백신에 사용되는 것으로서 본 발명의 약독화 재조합 인플루엔자는 약독화 인플루엔자 바이러스로<br />

면역화된(또는 다르게는 그로 감염된) 대부분의 개체에서 감염 증상, 또는 적어도의 중증의 감염 증상이 발생하<br />

지 않도록 충분히 약독화된다. 몇몇의 경우, 약독화 인플루엔자 바이러스는 여전히 경미한 병(예로서, 경미한<br />

상기도 병) 증상을 일으킬 수 있고/거나 백신화되지 않은 개체로의 전염을 일으킬 수 있을 것이다. 그러나, 그<br />

의 병독성은 백신화된 숙주 또는 우발적인 숙주에서 중증의 하기도 감염이 발생하지 않도록 충분히 폐기된다.<br />

별법으로, 생체외 또는 생체내에서 본원의 서열을 포함하는 인플루엔자 바이러스로 가지 세포를 표적화함으로써<br />

면역 반응을 자극시킬 수 있다. 예를 들어, 인플루엔자 항원이 가지 세포에 의해 포획될 수 있도록 하는데 충분<br />

한 기간 동안 충분한 양으로 바이러스에 증식성 가지 세포를 노출시킨다. 이어서, 표준 정맥 이식 방법에 의해<br />

백신화시키고자 하는 피험체에 세포를 전달한다.<br />

단일 투약으로 방어 면역 반응을 자극시키는 것이 바람직하지만, 원하는 예방학적 효과를 달성하기 위해서는 동<br />

일하거나 상이한 경로에 의해 추가의 용량을 투여할 수 있다. 신생아 및 유아의 경우, 예를 들면, 충분한 면역<br />

수준을 유도하기 위해서는 다중 투여하는 것이 필요할 수 있다. 야생형 인플루엔자 감염에 대한 충분한 수준의<br />

방어를 유지하기 위해 필요에 따라 유년기 동안 일정 간격으로 계속하여 투여할 수 있다. 유사하게, 예를 들면,<br />

건강 관리 요원, 탁아 요원, 어린 아이의 가족 구성원, 노인 및 심폐 기능이 손상된 개체와 같이, 특히 반복적<br />

인 또는 중증의 인플루엔자 감염에 걸리기 쉬운 성인은 방어 면역 반응을 확립 및/또는 유지시키기 위하여 다중<br />

면역화를 필요로 할 수 있다. 유도된 면역 수준은 중화 분비성 및/또는 혈청 항체의 양, 원하는 방어 수준을 유<br />

도하고 유지시키는데 필요할 경우 조정되는 투여량 또는 반복되는 백신화의 측정에 의해 모니터할 수 있다.<br />

임의로, 인플루엔자 바이러스를 예방학적으로 투여하기 위한 제제는 또한 인플루엔자 항원에 대한 면역 반응을<br />

증진시키는 하나 이상의 애주번트를 함유한다. 적합한 애주번트로는 완전 프로인트 애주번트, 불완전 프로인트<br />

애주번트, 사포닌, 미네랄 겔, 예를 들면, 수산화알루미늄, 계면 활성 물질, 예를 들면, 리솔레시틴, 플루로닉<br />

폴리올, 다중음이온, 펩티드, 오일 또는 탄화수소 에멀전, 칼메트-게랑 간균(BCG: bacille Calmette-Guerin),<br />

코린박테리움 파르붐(Corynebacterium parvum), 및 합성 애주번트 QS-21을 포함한다.<br />

원한다면, 하나 이상의 면역자극성 분자의 투여와 함께 인플루엔자 바이러스백신을 예방학적으로 투여할 수 있<br />

다. 면역자극성 분자로는 면역자극성, 면역강화, 및 전염증성 활성을 갖는 다양한 사이토카인, 림포카인 및 케<br />

모카인, 예를 들면, 인터루킨(예로서, IL-1, IL-2, IL-3, IL-4, IL-<strong>12</strong>, IL-13); 성장 인자(예로서, 과립구 대<br />

식세포(GM: granulocyte-macrophage)-콜로니 자극 인자(CSF: colony stimulating factor)); 및 기타 면역자극<br />

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공개특허 10-2009-0053794


<br />

<br />

<br />

성 분자, 예를 들면, 대식세포 염증 인자, Flt3 리간드, B7.1; B7.2 등을 포함한다. 면역자극성 분자는 인플루<br />

엔자 바이러스와 동일한 제제로 투여될 수 있거나, 별도로 투여될 수 있다. 단백질(예로서, 본 발명의 HA 및/또<br />

는 NA 폴리펩티드, 예로서, 서열 번호 11-20, 27-32, 또는 39-44 중 어느 것) 또는 상기 단백질을 코딩하는 핵<br />

산(예로서, 서열 번호 1-10, 21-26, 33-38, 또는 45 중 어느 것)을 포함하는 발현 벡터의 투여로 면역자극성 효<br />

과를 가져올 수 있다.<br />

상기 기술된 방법은 시험관내, 생체외, 또는 생체내에서 치료학적으로 또는 예방학적으로 유효한 HA 및/또는 NA<br />

폴리펩티드(또는 펩티드)를 코딩하는 이종성 폴리뉴클레오티드, 또는 HA 및/또는 NA RNA(예로서, 안티센스 RNA<br />

또는 리보자임)를 포함하는 본 발명의 벡터를 표적 세포 군집에 도입시킴으로써 질환 또는 질병, 전형적으로 인<br />

플루엔자를 치료학적으로 및/또는 예방학적으로 치료하는데 유용하다. 전형적으로, 관심의 대상이 되는 폴리펩<br />

티드(또는 펩티드)를 코딩하는 폴리뉴클레오티드, 또는 RNA는 "발현 벡터" 및 "추가의 발현 요소"라는 표제하의<br />

섹션에서 상기 기술된 바와 같이 적절한 조절 서열에 작동가능하게 연결된다. 임의로, 1 초과의 이종성 코딩 서<br />

열이 단일의 벡터 또는 바이러스에 도입된다. 예를 들어, 치료학적으로 또는 예방학적으로 활성인 HA 및/또는<br />

NA 폴리펩티드를 코딩하는 폴리뉴클레오티드 또는 RNA 이외에, 벡터는 또한 추가의 치료학적 또는 예방학적 폴<br />

리펩티드, 예로서, 항원, 공자극성 분자, 사이토카인, 항체 등, 및/또는 마커 등을 포함할 수 있다.<br />

특정 하위군 중 특정의 약독화 인플루엔자 바이러스 균주로 개체를 백신화하는 것이 상이한 인플루엔자 바이러<br />

스 균주 및/또는 하위군에 대한 교차 방어를 유도할 수 있지만, 교차 방어는 원한다면, 적어도 2개의 균주, 예<br />

로서, 이들 각각이 상이한 하위군을 나타내는 것인 적어도 2개의 균주로부터의 약독화 인플루엔자 바이러스로<br />

개체를 백신화시킴으로써 증진될 수 있다. 추가로, 백신 조합물은 임의로 범유행성 백신(예로서, 범유행성 인플<br />

루엔자 균주 예를 들면, 다양한 조류 균주(예로서, 본원의 서열 참조), 또는 기타 범유행성 균주에 대한 것) 및<br />

비-범유행성 균주의 믹스를 포함한다. 백신 혼합물(또는 다중 백신화)은 인간 균주 및/또는 비-인간 인플루엔자<br />

균주(예로서, 조류 및 인간 등)로부터의 성분을 포함할 수 있다. 유사하게, 본 발명의 약독화 인플루엔자 바이<br />

러스 백신은 임의로 기타 감염체에 대한 방어 면역 반응을 유도하는 백신과 조합될 수 있다.<br />

본 발명의 폴리뉴클레오티드<br />

인플루엔자 바이러스의 HA 및 NA 폴리뉴클레오티드 분절은 코딩 영역(ORF 코딩) 및 HA 및 NA 코딩 서열의 5' 및<br />

3' 양쪽인 비코딩 영역(NCR: noncoding region) 둘 모두를 포함한다는 것은 당업계에 잘 알려져 있다. 이러한<br />

NCRs의 예는 서열 번호 1-9(ORF 바깥쪽)에 제시되어 있다. 전체 인플루엔자 바이러스 HA 및 NA 분절의 증폭을<br />

촉진시키기 위하여 프라이머가 이들 NCRs로 이루어질 수 있다는 것 또한 알려져 있다(예로서, [Hoffmann et al.<br />

Arch Virol. 2001 Dec;146(<strong>12</strong>):2275-89] 참조). 추가로, 인플루엔자의 HA 및 NA의 NCRs이 재배열의 달성율을<br />

증가시킬 수 있다. 그러므로, 이러한 NCRs의 폴리뉴클레오티드 서열(그의 단편 및 변이체(예로서, 적어도 약<br />

60%, 또는 적어도 70%, 또는 적어도 80%, 또는 적어도 90%, 또는 적어도 약 91%, 또는 적어도 약 92%, 또는 적<br />

어도 약 93%, 또는 적어도 약 94%, 또는 적어도 약 95%, 또는 적어도 약 96%, 또는 적어도 약 97%, 또는 적어도<br />

약 98%, 또는 적어도 약 98.5%, 또는 적어도 약 98.7%, 또는 적어도 약 99%, 또는 적어도 약 99.1%, 또는 적어<br />

도 약 99.2%, 또는 적어도 약 99.3%, 또는 적어도 약 99.4%, 또는 적어도 약 99.5%, 또는 적어도 약 99.6% 또<br />

는 적어도 약 99.7%, 또는 적어도 약 99.8%, 또는 적어도 약 99.9%의 동일성을 가짐) 포함)이 본 발명의 범주내<br />

포함된다. 임의의 범유행성 균주의 HA 및 NA 분절을 증폭시킬 때, (예로서, RT-PCR에 의한) 증폭을 위해 HA 및<br />

NA NCRs의 보존 영역(예로서, 관련 균주 사이에서 보존되는 영역)에 결합하는 폴리뉴클레오티드 프라이머를 제<br />

조하고 사용할 수 있다. 하나의 실시태양에서, 본 발명의 HA 및 NA 폴리뉴클레오티드는 범유행성 바이러스 균주<br />

의 HA 및 NA 서열(그의 단편 및 변이체(예로서, 적어도 약 60%, 또는 적어도 70%, 또는 적어도 80%, 또는 적어<br />

도 90%, 또는 적어도 약 91%, 또는 적어도 약 92%, 또는 적어도 약 93%, 또는 적어도 약 94%, 또는 적어도 약<br />

95%, 또는 적어도 약 96%, 또는 적어도 약 97%, 또는 적어도 약 98%, 또는 적어도 약 98.5%, 또는 적어도 약<br />

98.7%, 또는 적어도 약 99%, 또는 적어도 약 99.1%, 또는 적어도 약 99.2%, 또는 적어도 약 99.3%, 또는 적어<br />

도 약 99.4%, 또는 적어도 약 99.5%, 또는 적어도 약 99.6%, 또는 적어도 약 99.7%, 또는 적어도 약 99.8%, 또<br />

는 적어도 약 99.9%) 포함)의 NCR 및 ORF, 둘 모두를 포함한다. 대체 실시태양에서, 본 발명의 HA 및 NA 폴리뉴<br />

클레오티드는 범유행성 바이러스 균주의 HA 및 NA 서열(예로서, 서열 번호 1-9)의 NCR을 제외한, ORF(단편 및<br />

변이체(예로서, 적어도 약 60%, 또는 적어도 70%, 또는 적어도 80%, 또는 적어도 90%, 또는 적어도 약 91%, 또<br />

는 적어도 약 92%, 또는 적어도 약 93%, 또는 적어도 약 94%, 또는 적어도 약 95%, 또는 적어도 약 96%, 또는<br />

적어도 약 97%, 또는 적어도 약 98%, 또는 적어도 약 98.5%, 또는 적어도 약 98.7%, 또는 적어도 약 99%, 또는<br />

적어도 약 99.1%, 또는 적어도 약 99.2%, 또는 적어도 약 99.3%, 또는 적어도 약 99.4%, 또는 적어도 약<br />

99.5%, 또는 적어도 약 99.6%, 또는 적어도 약 99.7%, 또는 적어도 약 99.8%, 또는 적어도 약 99.9%) 포함)를<br />

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공개특허 10-2009-0053794


<br />

<br />

<br />

포함한다.<br />

본 발명의 HA 및 NA 폴리뉴클레오티드, 예로서, 서열 번호 1부터 서열 번호 10, 서열 번호 21부터 서열 번호<br />

26, 서열 번호 33부터 서열 번호 38, 서열 번호 45, 및 그의 단편은 상기 기술된 백신에 대안으로, 또는 그 이<br />

외의 많은 상이한 능력으로서 임의로 사용된다. 기타의 예시적인 용도가 본원에서 설명의 목적으로 기술되어 있<br />

으며, 이는 실제 사용 범위를 제한하는 것으로 기술된 것은 아니다. 본 발명의 뉴클레오티드 서열을 작제,<br />

정제, 및 특징화하는 상이한 방법들 또한 본원에 기술되어 있다. 몇몇 실시태양에서, 본 발명의 하나 이상의 폴<br />

리뉴클레오티드 서열을 포함하는 핵산은 유리하게는 예로서, 다른 종을 감염시키는 동종성 인플루엔자 변이체<br />

(예로서, 본원의 서열에 상동성인 것 등)를 발견 및/또는 특징화하는 핵산 하이브리드화 실험하에서, 또는 상이<br />

한 인플루엔자 출현과 같은 다양한 정황하에서 상응하는 핵산 또는 관련된 핵산을 검출하기 위한 프로브로서 사<br />

용된다. 프로브는 DNA 또는 RNA 분자, 예를 들면, 게놈 또는 클로닝된 DNA의 제한 단편, cDNAs, PCR 증폭 생성<br />

물, 전사체, 및 올리고뉴클레오티드일 수 있으며, 길이가 약 10 뉴클레오티드인 올리고뉴클레오티드에서부터 1<br />

kb 이상인 전길이의 서열 또는 cDNAs까지로 길이가 다양할 수 있다. 예를 들어, 몇몇 실시태양에서, 본 발명의<br />

프로브는 예로서, 서열 번호 1부터 서열 번호 10, 서열 번호 21부터 서열 번호 26, 서열 번호 33부터 서열 번호<br />

38, 서열 번호 45, 또는 그에 상보적 서열 중 그로부터 선택되는 폴리뉴클레오티드 서열 또는 하위서열을 포함<br />

한다. 별법으로, 상기 명시된 서열 중 하나의 변이체인 폴리뉴클레오티드 서열이 프로브로서 사용된다. 상기 변<br />

이체는 하나 또는 수개의 보존적 뉴클레오티드 변형을 포함하는 것이 가장 전형적이다. 예를 들어, 올리고뉴클<br />

레오티드 쌍(또는 세트)이 선택되는데, 여기서, 2개(그 이상)의 폴리뉴클레오티드 서열은 서로의 보존적 변형물<br />

이며, 여기서, 하나의 폴리뉴클레오티드 서열이 첫번째 변이체에 동일하게 상응하거나/하고 나머지(들)는 추가<br />

의 변이체에 동일하게 상응한다. 그러한 올리고뉴클레오티드 프로브 쌍은 예로서, 다형태 뉴클레오티드를 검출<br />

하거나, 예로서, 다른 종을 감염시키거나, 상이한(예로서, 일시적으로 또는 지리학적으로 상이한) 인플루엔자<br />

출현에 존재하는 본 HA 및 NA 서열에 상동성인 것과 같은 상동성 인플루엔자 HA 및 NA 변이체를 검출하는 특이<br />

적인 하이브리드화 실험에서 특히 유용하다. 다른 적용에서 분기성이 더욱 큰 프로브가 선택되는데, 적어도 약<br />

91%(또는 약 92%, 약 93%, 약 94%, 약 95%, 약 96%, 약 97%, 약 98%, 약 98.5%, 약 98.7%, 약 99%, 약 99.1%,<br />

약 99.2%, 약 99.3%, 약 99.4%, 약 99.5%, 또는 약 99.6% 이상, 약 99.7%, 약 99.8%, 약 99.9%, 이상) 동일한<br />

프로브가 선택된다.<br />

예로서, 본원의 서열로부터 유도된 서열로 예시된 것과 같은 본 발명의 프로브는 또한 당업계에서 통상적인 방<br />

법에 따라 추가의 유용한 폴리뉴클레오티드 서열을 동정하는데 사용될 수 있다. 한 세트의 실시태양에서, 상기<br />

기술된 것과 같은 하나 이상의 프로브는 예로서, 본원의 서열을 갖는 하나 이상의 프로브와 동일하거나, 그에<br />

대해 유의적인 서열 유사성을 갖는 서열을 포함하는 클론, 즉, 변이체, 상동체 등을 동정하기 위해 발현 생성물<br />

또는 염색체 분절의 라이브러리(예로서, 발현 라이브러리 또는 게놈 라이브러리)를 스크리닝하는데 사용된다.<br />

관련 폴리뉴클레오티드 서열을 동정하는데에는 라이브러리 스크리닝과 같은 물리적인 방법 이외에도 컴퓨터 보<br />

조 생물정보학적 접근법, 예로서, BLAST 및 기타 서열 상동성 검색 알고리즘 등 또한 사용될 수 있다는 것이 이<br />

해될 것이다. 이러한 방식에 의해 동정된 폴리뉴클레오티드 서열 또한 본 발명의 특징이 된다.<br />

올리고뉴클레오티드 프로브는 임의로 당업자에게 잘 알려져 있는 각종 방법에 의해 제조된다. 가장 전형적으로<br />

예를 들면, [Beaucage and Caruthers (<strong>19</strong>81) Tetrahedron Letts 22(20): 1859-1862]에 기재되어 있는 고체상<br />

포스포라미다이트 트리에스테르 방법과 같이 잘 알려져 있는 합성 방법에 의해 예로서는 자동 합성기를 사용하<br />

여, 또는 [Needham-Van Devanter et al. (<strong>19</strong>84) Nucl Acids Res, <strong>12</strong>:6159-6168]에 기재되어 있는 바와 같이 제<br />

조된다. 올리고뉴클레오티드는 또한 당업자에게 알려져 있는 다양한 상업적 공급원으로부터 맞춤 제작될 수 있<br />

고, 주문될 수 있다. 필요할 경우, 올리고뉴클레오티드 정제는 전형적으로 [Pearson and Regnier (<strong>19</strong>83) J<br />

Chrom 255:137-149]에 기재되어 있는 바와 같이, 천연 아크릴아미드 겔 전기영동 또는 음이온-교환 HPLC에 의해<br />

실시된다. 합성 올리고뉴클레오티드 서열은 [Maxam and Gilbert (<strong>19</strong>80) in Grossman and Moldave (eds.)<br />

Academic Press, New York, Method in Enzymology 65:499-560]의 화학 분해 방법을 사용하여 확인할 수 있다.<br />

맞춤형 올리고 또한 당업자에게 알려져 있는 다양한 상업적 공급원으로부터 용이하게 주문될 수 있다.<br />

예를 들면, 본 발명의 폴리뉴클레오티드 및 폴리펩티드를 발현하는 세포 또는 유기체(예로서, 본 발명의 서열을<br />

포함하는 바이러스를 수반하는 것)의 특질과 관련되는 것과 같은 기타 상황하에서는 폴리펩티드, 펩티드 또는<br />

항체인 프로브가 유리하게 사용된다. 예를 들어, 본 발명의 아미노산 서열(예로서, 서열 번호 11-20, 서열 번호<br />

27-32, 서열 번호 39-44) 중 어느 것으로부터 유도되고/거나, 예로서, 서열 번호 1부터 서열 번호 10, 서열 번<br />

호 21부터 서열 번호 26, 서열 번호 33부터 서열 번호 38, 및 서열 번호 45로부터 선택된, 본 발명의 폴리뉴클<br />

레오티드 서열에 의해 코딩된 단리된 또는 재조합 폴리펩티드, 폴리펩티드 단편 및 펩티드는 예로서, 파지 디스<br />

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공개특허 10-2009-0053794


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<br />

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플레이 라이브러리, 조합 라이브러리, 폴리클로날 혈청 등으로부터 항체를 동정하고 단리시키는데 유리하게 사<br />

용된다. 본 발명의 폴리펩티드 단편은 본 발명의 HA 또는 NA 폴리펩티드의 아미노산 서열(예로서, 서열 번호<br />

11-20, 서열 번호 27-32, 및 서열 번호 39-44)의 적어도 5개의 인접한 아미노산 잔기, 또는 적어도 10개의 인접<br />

한 아미노산 잔기, 또는 적어도 15개의 인접한 아미노산 잔기, 또는 적어도 20개의 인접한 아미노산 잔기, 또는<br />

적어도 25개의 인접한 아미노산 잔기, 또는 적어도 40개의 인접한 아미노산 잔기, 또는 적어도 50개의 인접한<br />

아미노산 잔기, 또는 적어도 60개의 인접한 아미노산 잔기, 또는 적어도 70개의 인접한 아미노산 잔기, 또는 적<br />

어도 80개의 인접한 아미노산 잔기, 또는 적어도 90개의 인접한 아미노산 잔기, 또는 적어도 100개의 인접한 아<br />

미노산 잔기, 또는 적어도 <strong>12</strong>5개의 인접한 아미노산 잔기, 또는 적어도 150개의 인접한 아미노산 잔기, 또는 적<br />

어도 175개의 인접한 아미노산 잔기, 또는 적어도 200개의 인접한 아미노산 잔기, 또는 적어도 250개의 인접한<br />

아미노산 잔기, 또는 적어도 350개의 인접한, 또는 적어도 400개의 인접한, 또는 적어도 450개의 인접한, 또는<br />

적어도 500개의 인접한, 또는 적어도 550개의 인접한 아미노산 잔기의 아미노산 서열을 포함하는 펩티드 또는<br />

폴리펩티드를 포함한다. 상기 폴리펩티드에 특이적으로 결합하는 상기 폴리펩티드 단편 및 항체를 코딩하는 폴<br />

리뉴클레오티드 또한 본 발명의 바람직한 실시태양이다.<br />

예로서, 서열 번호 11부터 서열 번호 20, 서열 번호 27부터 서열 번호 32, 및/또는 서열 번호 39부터 서열 번호<br />

44의 것으로, 및/또는 예로서, 서열 번호 1부터 서열 번호 10, 서열 번호 21부터 서열 번호 26, 서열 번호 33부<br />

터 서열 번호 38, 및 서열 번호 45로부터 선택되는 본 발명의 폴리뉴클레오티드 서열에 의해 코딩되는 임의의<br />

폴리펩티드 서열 또는 하위서열에 대한 항체 또한 예를 들면, 세포 또는 조직으로부터 발현 생성물을 평가하는<br />

데 있어서의 프로브로서 가치가 있다. 또한, 항체는 예로서, 본원에서 제공되는 것의, 또는 예로서, 본원에 제<br />

시된 것으로부터 선택되는 것과 같은 본 발명의 폴리뉴클레오티드 서열에 의해 코딩되는 아미노산 하위서열을<br />

포함하는 단백질의 발현을 계내에서, 조직 어레이에서, 세포, 조직 또는 유기체에서, 예를 들면, 동정되지 않은<br />

인플루엔자 바이러스 등으로 감염된 유기체에서 평가하는데 특히 적합하다. 항체는 직접 검출가능한 시약으로<br />

표지될 수 있거나, 특이 항체의 중쇄 불변 영역(즉, 이소타입)에 대하여 특이적인 2차 항체의 표지를 통해 간접<br />

적으로 검출될 수 있다. 특이적인 항체 생산에 관한 추가 설명은 하기에 제공한다.<br />

진단 분석법<br />

본 발명의 핵산 서열은 화학적으로 합성된 또는 재조합 폴리뉴클레오티드 단편, 예로서, 본원의 서열로부터 선<br />

택된 것을 사용하여 샘플 중 인플루엔자(및/또는 헤마글루티닌 및/또는 뉴라미니다제)를 검출하는 진단 분석법,<br />

헤마글루티닌-유사 및/또는 뉴라미니다제-유사 서열을 검출하는 진단 분석법, 및 임상의 인플루엔자 단리물 중<br />

균주간의 차이를 검출하는 진단 분석법에서 사용될 수 있다. 예를 들어, 적어도 10 내지 20개의 뉴클레오티드를<br />

포함하는 헤마글루티닌 및/또는 뉴라미니다제 서열의 단편은 당업계에 잘 알려져 있는 중합효소 연쇄 반응(PCR:<br />

polymerase chain reaction) 방법(예로서, 역전사-PCR)을 사용하여 핵산을 증폭시키는 프라이머로서, 및 임상<br />

표본에서 예를 들면, 인플루엔자 RNA와 같은 표적 유전 물질을 검출하는 핵산 하이브리드화 분석법에서의 프로<br />

브로서 사용될 수 있다.<br />

예로서, 본원에서 제공된 것으로부터 선택된 독특한 하위서열로 예시되는 것과 같은 본 발명의 프로브는 또한<br />

당업계에서 통상적인 방법에 따라 추가로 유용한 폴리뉴클레오티드 서열(예를 들면, 추가의 인플루엔자 균주를<br />

특징화하는 것)을 동정하는데 사용될 수 있다. 한 세트의 바람직한 실시태양에서, 상기 기술된 하나 이상의 프<br />

로브는 본원의 서열과 동일하거나, 그에 대해 유의적인 서열 동일성을 갖는 서열을 포함하는 클론을 동정하기<br />

위해 발현 생성물 또는 클로닝된 바이러스 핵산의 라이브러리(즉, 발현 라이브러리 또는 게놈 라이브러리)를 스<br />

크리닝하는데 사용된다. 결국, 이들 동정된 서열 각각은 상기 기술된 변이체 프로브 쌍 또는 세트를 비롯한 프<br />

로브를 제조하는데 사용될 수 있다. 관련 폴리뉴클레오티드 서열을 동정하는데에는 라이브러리 스크리닝과 같은<br />

물리적인 방법 이외에도 컴퓨터 보조 생물정보학적 접근법, 예로서, BLAST 및 기타 서열 상동성 검색 알고리즘<br />

등 또한 사용될 수 있다는 것이 이해될 것이다.<br />

본 발명의 프로브는 세포, 조직, 또는 기타 생물학적 샘플(예로서, 코 세척액 또는 기관지 세정액) 중 인플루엔<br />

자 핵산의 존재 여부를 검출하고, 그의 실체를 결정하는데 특히 유용하다. 예를 들어, 본 발명의 프로브는 생물<br />

학적 샘플, 예를 들면, 피험체(예로서, 인간 피험체) 또는 모델 시스템(예를 들면, 배양된 세포 샘플)이 인플루<br />

엔자, 또는 특정의 인플루엔자 균주(들)에 노출되었는지, 또는 그에 감염되었는지 여부를 측정하는데 유리하게<br />

사용된다. 생물학적 샘플 또는 모델 시스템에서 기원한(그로부터 단리된) 핵산에 선택된 프로브가 하이브리드화<br />

하는지를 검출하는 것이 프로브 폴리뉴클레오티드가 선택되어진 바이러스(또는 관련 바이러스)에 노출되었는지,<br />

또는 그로 인해 감염되었는지를 나타낸다.<br />

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공개특허 10-2009-0053794


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의도하는 적용에 따라 프로브 디자인이 영향을 받는다는 것을 이해할 것이다. 예를 들어, 수개의 대립유전자-특<br />

이 프로브-표적 상호작용이 예로서 단일 DNA 칩상에서과 같이 단일 분석법으로 검출되는 경우, 모든 프로브는<br />

동일한 융점을 갖는 것이 바람직할 수 있다. 따라서, 어레이 상의 모든 프로브에 대한 융점이 거의 유사하도록<br />

프로브의 길이는 조정된다(상이한 프로브가 상이한 GC 함량을 갖는 경우, 특정 Tm을 달성하기 위해서는 상이한<br />

프로브에 대해 상이한 길이가 필요할 수 있다는 것을 이해할 것이다). 프로브 디자인에 있어서 융점이 주된 고<br />

려사항이지만, 프로브 작제를 추가로 조정하기 위해서는 임의로 예를 들면, 프라이머 자가-상보성에 대해 선별<br />

하는 것과 같은 다른 인자가 사용된다.<br />

벡터, 프로모터 및 발현 시스템<br />

본 발명은 본원에 기술된 핵산 서열들 중 하나 이상을 혼입하고 있는 재조합 작제물을 포함한다. 그러한 작제물<br />

은 임의로 예로서, 서열 번호 1부터 서열 번호 10, 서열 번호 21부터 서열 번호 26, 서열 번호 33부터 서열 번<br />

호 38, 서열 번호 45 중 임의의 것을 포함하는 것과 같은 본 발명의 폴리뉴클레오티드 서열 또는그의 하위서열<br />

이 순방향 또는 역향 배향으로 삽입되어 있는 벡터, 예를 들면, 플라스미드, 코스미드, 파지, 바이러스, 세균<br />

인공 염색체(BAC: bacterial artificial chromosome), 효모 인공 염색체(YAC: yeast artificial chromosome)<br />

등을 포함한다. 예를 들어, 삽입된 핵산은 본 발명의 폴리뉴클레오티드 서열 중 적어도 하나의 전부 또는 그 일<br />

부를 포함하는 바이러스 염색체 서열 또는 cDNA를 포함할 수 있다. 하나의 실시태양에서, 작제물은 예를 들어,<br />

상기 서열에 작동가능하게 연결되어 있는 것을 비롯한 조절 서열을 추가로 포함한다. 다수의 적합한 벡터 및 프<br />

로모터가 당업자에게 공지되어 있으며, 이는 상업적으로 이용가능하다.<br />

본 발명의 폴리뉴클레오티드는 센스 또는 안티센스 RNA, 및 임의로, 폴리펩티드(또는 펩티드) 발현 생성물(예로<br />

서, 본 발명의 헤마글루티닌 및/또는 뉴라미니다제 분자, 또는 그의 단편)을 생성하는데 적합한 각종 벡터들 중<br />

어느 하나에 포함될 수 있다. 그러한 벡터로는 염색체, 비염색체성 및 합성 DNA 서열, 예로서, SV40의 유도체;<br />

세균 플라스미드; 파지 DNA; 바큘로바이러스; 효모 플라스미드; 플라스미드 및 파지 DNA, 바이러스 DNA, 예를<br />

들면, 백시니아, 아데노바이러스, 수두 바이러스, 슈도레이비스, 아데노바이러스, 아데노-관련 바이러스, 레트<br />

로바이러스 및 기타 다수(예로서, pCDL)의 DNA의 조합물로부터 유래된 벡터를 포함한다. 유전 물질을 세포내로<br />

도입할 수 있고, 복제가 바람직할 경우에는, 숙주에서 복제가능한 임의의 벡터가 사용될 수 있다.<br />

발현 벡터에서 관심의 대상이 되는 HA 및/또는 NA 폴리뉴클레오티드 서열은 mRNA 합성을 지시하는 적절한 전사<br />

제어 서열(예로서, 프로모터, 및 임의로 하나 이상의 인핸서)에 근접하게 그에 대한 배향으로 물리적으로 정렬<br />

된다. 즉, 관심의 대상이 되는 폴리뉴클레오티드 서열은 적절한 전사 제어 서열에 작동가능하게 연결된다. 그러<br />

한 프로모터의 예로는 LTR 또는 SV40 프로모터, E. 콜라이 lac 또는 trp 프로모터, 파지 람다 PL 프로모터, 및<br />

원핵생물 또는 진핵생물 세포 또는 그의 바이러스에서 유전자의 발현을 제어하는 것으로 알려져 있는 다른 프로<br />

모터를 포함한다.<br />

인플루엔자 바이러스 게놈 분절의 전사를 조절하기 위해 다양한 프로모터를 발현 벡터에서 사용하는 것이 적합<br />

하다. 특정 실시태양에서, 사이토메갈로바이러스 (CMV) DNA 의존 RNA 폴리머라제 II(Pol II) 프로모터가 사용된<br />

다. 원하는 경우, 예로서, 조건부 발현을 조절하기 위해 특별한 조건하에서, 또는 특별한 조직 또는 세포에서<br />

RNA 전사를 유도하는 다른 프로모터로 치환될 수 있다. 다수의 바이러스 및 포유동물 프로모터, 예로서, 인간<br />

프로모터가 이용가능하거나, 이는 주시되는 특별한 적용에 따라 단리될 수 있다. 예를 들어, 동물 및 인간 바이<br />

러스의 게놈으로부터 수득된 대체 프로모터로는 아데노바이러스(예를 들면, 아데노바이러스 2), 유두종 바이러<br />

스, B형 간염 바이러스, 폴리오마 바이러스, 및 원숭이 바이러스 40(SV40: Simian Virus 40), 및 각종 레트로바<br />

이러스 프로모터와 같은 프로모터를 포함한다. 기타 다수 중 포유동물 프로모터는 액틴 프로모터, 면역글로불린<br />

프로모터, 열 충격 프로모터 등을 포함한다.<br />

전사는 임의로 인핸서 서열을 포함함으로써 증가된다. 인핸서는 전형적으로 예를 들어, 10-500 bp로 그 길이가<br />

짧으며, 프로모터와 함께 전사를 증가시키는 역할을 하는 시스-작용성(cis-acting) DNA 요소이다. 다수의 인핸<br />

서 서열이 포유동물 유전자(헤모글로빈, 엘라스타제, 알부민, 알파-태아 단백질 및 인슐린) 및 진핵생물 세포<br />

바이러스로부터 단리되었다. 인핸서는 벡터내 이종성 코딩 서열에 대한 5' 또는 3' 위치에서 스플라이싱될 수<br />

있지만, 전형적으로는 프로모터에 대한 5' 위치로 삽입된다. 전형적으로, 프로모터, 및 원하는 경우, 추가의 전<br />

사 증진 서열은 이종성 DNA가 도입되는 숙주 세포 유형에서의 발현을 최적화하는 것으로 선택된다([Scharf et<br />

al. (<strong>19</strong>94) Heat stress promoters and transcription factors Results Probl Cell Differ 20: <strong>12</strong>5-62];<br />

[Kriegler et al. (<strong>19</strong>90) Assembly of enhancers, promoters, and splice signals to control expression of<br />

transferred genes Methods in Enzymol 185: 5<strong>12</strong>-27]). 임의로, 앰플리콘은 또한 번역 개시에 필요한 리보좀<br />

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공개특허 10-2009-0053794


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결합 위치 또는 내부 리보좀 도입 위치(IRES: internal ribosome entry site)를 함유할 수도 있다.<br />

본 발명의 벡터는 또한 유리하게 전사 종결과 mRNA 안정화에 필요한 서열, 예를 들어, 폴리아데닐화 위치 또는<br />

종결자 서열을 포함할 수 있다. 이러한 서열은 보편적으로 진핵생물 또는 바이러스 DNA 또는 cDNA의 5' 말단,<br />

경우에 따라서는 3' 말단의 비번역 부위로부터 이용가능하다. 하나의 실시태양에서, SV40 폴리아데닐화 서열은<br />

(-) 스트랜드 바이러스 게놈의 복제를 개시하는 PolI 프로모터로부터 (+) 스트랜드 mRNA 분자의 전사를 격리시<br />

키는 양방향 폴리아데닐화 부위를 제공할 수 있다.<br />

또한, 상기 기술한 바와 같이, 발현 벡터는 전술한 유전자들 이외에도, 임의로는 하나 이상의 선별가능한 마커<br />

유전자를 포함함으로써 형질전환된 숙주 세포 선별을 위한 표현형적 특징을 제공하며, 마커, 예를 들어, 디하이<br />

드로폴레이트 환원 효소 또는 네오마이신 내성은 진핵생물 세포 배양물에서의 선별을 위해 적합하다.<br />

상기 기술한 바와 같은 적절한 핵산 서열 뿐만 아니라, 적절한 프로모터 또는 제어 서열도 함유하는 벡터는 숙<br />

주 세포를 형질전환하여 단백질을 발현시키는 데 사용될 수 있다. 본 발명의 벡터는 세균 세포내에서 복제될 수<br />

있지만, 가장 빈번하게는 본 발명의 목적을 위해 벡터를 포유동물 세포, 예를 들어, 베로 세포, BHK 세포, MDCK<br />

세포, 293 세포, COS 세포 등에 도입하는 것이 바람직할 것이다.<br />

그외 다른 곳에 기술되어 있는 바와 같이, 다양한 실시태양에서, 본원의 HA 및 NA 서열은 플라스미드-구제 재배<br />

열에 관여하는 플라스미드에 포함될 수 있다. 예로서, 2002년 10월 23일 출원된 미국 출원 번호<br />

제60/420,708호; 2004년 5월 24일 출원된 제60/574,117호; 2003년 4월 25일 출원된 제10/423,828호; 2004년 6<br />

월 <strong>12</strong>일 출원된 제60/578,962호; 및 2004년 6월 16일 출원된 제10/870,690호; 및 US20020164770(본원에서 참고<br />

로 인용된다)를 참조한다. 예를 들어, 본 발명의 바람직한 발현 벡터로는 pol I 프로모터 및 종결자 서열을 포<br />

함하는 벡터, 또는 pol I 및 pol II 프로모터 둘 모두, "pol I/pol II 프로모터 시스템"를 사용하는 벡터(예로<br />

서, [Zobel et al., Nucl. Acids Res. <strong>19</strong>93, 21:3607]; US20020164770; [Neumann et al., Proc. Natl. Acad.<br />

Sci. USA <strong>19</strong>99, 96:9345]; [Fodor et al., J. Virol. <strong>19</strong>99, 73:9679]; 및 US20030035814)를 포함하나, 이에<br />

한정되지 않는다. 제조된 재배열체는 A/앤 아버/6/60 공여 균주(및/또는 그의 유도체 및 변형물), PR8 공여 균<br />

주 골격, A/레닌그라드/17 공여 균주 골격 등으로부터의 6개의 기타 인플루엔자 유전자와 함께 배열된 HA 및 NA<br />

유전자를 포함할 수 있다. 기타 골격 균주는 예를 들어, 20040137013 및 20030147916(본원에서 참고로<br />

인용된다)에 기재되어 있다.<br />

추가의 발현 요소<br />

가장 보편적으로는 인플루엔자 바이러스 HA 및/또는 NA 단백질을 코딩하는 게놈 분절은 바이러스의 기능성 단백<br />

질로의 번역을 포함하는, 그의 발현에 필요한 임의의 추가 서열을 포함한다. 다른 상황에서는 미니유전자, 또는<br />

바이러스 단백질을 코딩하는 기타 인공 작제물, 예로서, HA 및/또는 NA 단백질이 사용될 수 있다. 또한, 그러한<br />

경우에는 종종 이종성 코딩 서열의 효율적인 번역에 도움이 되는 특이적인 개시 신호를 포함하는 것이 바람직할<br />

수 있다. 이러한 신호로는 예로서, ATG 개시 코돈 및 인접 서열을 포함할 수 있다. 전체 삽입체가 확실히 번역<br />

될 수 있도록 하기 위해 개시 코돈은 바이러스 단백질에 대해 정확한 리딩 프레임으로 삽입된다. 외인성 전사<br />

요소 및 개시 코돈의 기원은 다양할 수 있으며, 이는 천연 및 합성, 둘 모두일 수 있다. 사용시 세포 시스템에<br />

적절한 인핸서를 포함함으로써 발현율을 증진시킬 수 있다.<br />

원하는 경우, 예로서, 원하는 세포 구획, 막, 또는 세포기관으로의 폴리펩티드 발현을 표적하기 위해, 또는 원<br />

형질막주위공간 또는 세포 배양 배지로의 폴리펩티드 분비를 지시하기 위해 추가의 발현 요소를 코딩하는 폴리<br />

뉴클레오티드 서열, 예를 들면, 신호 서열, 분비 또는 위치화 서열 등은 벡터내로, 보통은 관심의 대상이 되는<br />

폴리뉴클레오티드 서열을 포함하는 프레임내로 혼입될 수 있다. 그러한 서열은 당업자에게 알려져 있으며, 분비<br />

리더 펩티드, 세포기관 표적 서열(예로서, 핵 위치화 서열, ER 보존 신호, 미토콘드리아 전이 서열), 막 위치화<br />

/부착 서열(예로서, 정지 전달 서열, GPI 부착 서열) 등을 포함한다.<br />

본 발명의 핵산 서열에 의해 코딩되는 폴리펩티드가 번역될 것을 원하는 경우, 추가의 번역 특이 개시 신호가<br />

번역율을 개선시킬 수 있다. 이러한 신호로는 예로서, ATG 개시 코돈 및 인접 서열, IRES 영역 등을 포함한다.<br />

예를 들어, 예로서, 본 발명의 폴리뉴클레오티드 서열(예로서, 본원의 서열 중의 것)을 혼입하고 있는 코딩 서<br />

열, 번역 개시 코돈 및 관련 서열 요소를 포함하는 전길이의 cDNA 분자 또는 염색체 분절은 관심의 대상이 되는<br />

폴리뉴클레오티드 서열과 동시에 적절한 발현 벡터내로 삽입된다. 이러한 경우, 추가의 번역 제어 신호가 빈번<br />

히 요구되는 것은 아니다. 그러나, 유일하게 폴리펩티드 코딩 서열, 또는 그의 일부만이 삽입되는 경우에는, 예<br />

로서, ATG 개시 코돈을 비롯한, 외인성 번역 제어 신호가 관련 서열의 발현을 위해 종종 제공된다. 관심의 대상<br />

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공개특허 10-2009-0053794


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이 되는 폴리뉴클레오티드 서열이 확실히 전사될 수 있도록 하기 위해 정확한 리딩 프레임내로 개시 코돈을 놓<br />

는다. 외인성 전사 요소 및 개시 코돈의 기원은 다양할 수 있으며, 이는 천연 및 합성, 둘 모두일 수 있다. 사<br />

용시 세포 시스템에 적절한 인핸서를 포함함으로써 발현율을 증진시킬 수 있다(예로서, [Scharf D. et al.<br />

(<strong>19</strong>94) Results Probl Cell Differ 20:<strong>12</strong>5-62]; [Bittner et al. (<strong>19</strong>87) Methods in Enzymol 153:516-544]).<br />

재조합 바이러스 제조<br />

네거티브 스트랜드 RNA 바이러스는 유전적으로 조작될 수 있고, 재조합 역 유전자 접근법을 사용하여 회복될 수<br />

있다(예로서, USPN 5,166,057(Palese et al.)). 그러한 방법은 원래 인플루엔자 바이러스 게놈을 조작하는데 적<br />

용되었으며(([Luytjes et al. (<strong>19</strong>89) Cell 59:1107-1113]; [Enami et al. (<strong>19</strong>90) Proc. Natl. Acad. Sci. USA<br />

92:11563-11567])), 예로서, 광견병([Schnell et al. (<strong>19</strong>94) EMBO J. 13:4<strong>19</strong>5-4203); VSV([Lawson et al.<br />

(<strong>19</strong>95) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 92:4477-4481]); 홍역 바이러스([Radecke et al.(<strong>19</strong>95) EMBO J. 14:5773-<br />

5784]); 우역 바이러스([Baron & Barrett (<strong>19</strong>97) J. Virol. 71:<strong>12</strong>65-<strong>12</strong>71]); 인간 파라인플루엔자 바이러스<br />

(([Hoffman & Banerjee (<strong>19</strong>97) J. Virol. 71:3272-3277]; [Dubin et al. (<strong>19</strong>97) Virology 235:323-332]));<br />

SV5([He et al. (<strong>19</strong>97) Virology 237:249-260]); 개 디스템퍼 바이러스([Gassen et al. (2000) J. Virol.<br />

74:10737-44]); 및 센다이 바이러스(([Park et al. (<strong>19</strong>91) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 88: 5537-5541];<br />

[Kato et al. (<strong>19</strong>96) Genes to Cell 1:569-579]))와 같은 매우 다양한 분절형 및 비분절형 네거티브 스트랜드<br />

RNA 바이러스에 성공적으로 적용되어 왔다. 당업자는 본 발명의 HA 및 NA 서열을 포함하는 인플루엔자 바이러스<br />

를 제조할 수 있는 이러한 기법 및 유사한 기법에 정통할 것이다. 상기 방법에 따라 제조된 재조합 인플루엔자<br />

바이러스는 본 발명의 핵산 및/또는 폴리펩티드를 하나 이상 포함하는 재조합 인플루엔자 바이러스인 바, 이 또<br />

한 본 발명의 특징이 된다.<br />

세포 배양물 및 발현 숙주<br />

본 발명은 또한 본 발명의 벡터가 도입된(형질도입된, 형질전환 또는 형질감염된) 숙주 세포, 및 재조합 기법에<br />

의해 본 발명의 폴리펩티드를 제조하는 방법에 관한 것이다. 숙주 세포는 본 발명의 벡터, 예로서, 발현 벡터로<br />

유전적으로 조작(즉, 형질도입, 형질전환 또는 형질감염)된다. 상기 기술된 바와 같이, 벡터는 플라스미드, 바<br />

이러스 입자, 파지 등의 형태일 수 있다. 적절한 발현 숙주의 예로는 세균 세포, 예를 들면, E. 콜라이, 스트렙<br />

토마이세스(Streptomyces), 및 살모넬라 티피뮤리움(Salmonella typhimurium); 진균 세포, 예를 들면, 사카로<br />

마이세스 세레비지아(Saccharomyces cerevisiae), 피치아패스토리스(Pichiapastoris), 및 뉴로스포라 크라사<br />

(Neurospora crassa); 또는 곤충 세포, 예를 들면, 초파리 및 스포도프테라 프루기페르다(Spodoptera<br />

frugiperda)를 포함한다.<br />

본 발명의 HA 및 NA 분자를 배양하기 위해서 포유동물 세포가 가장 보편적으로는 사용된다. 인플루엔자 바이러<br />

스 복제를 위해 적합한 숙주 세포로는 예로서, 베로 세포, BHK 세포, MDCK 세포, 293 세포 및 COS 세포(293T 세<br />

포, COS7 세포 포함) 등을 포함한다. 보편적으로는 상기의 세포주들 중 2개, 예로서, MDCK 세포와, 293T 또는<br />

COS 세포를 포함하는 공-배양은 복제율을 개선시키는 비율, 예로서, 1:1의 비율로 사용된다. 전형적으로, 세포<br />

는 중성의 완충처리된 pH(예로서, 7.0 내지 7.2 사이의 pH)를 유지하는데 적합한 CO2 농도와 습도의 조절하에<br />

표준 시판용 배양 배지, 예를 들면, 혈청(예로서, 10% 우태아 혈청)으로 보충된 둘베코 변형 이글 배지, 또는<br />

무혈청 배지에서 배양된다. 임의로, 배지는 세균 성장 막기 위해 항생제, 예로서, 페니실린, 스트렙토마이신<br />

등, 및/또는 추가의 영양분, 예를 들면, L-글루타민, 피루브산나트륨, 비필수 아미노산, 바람직한 성장 특징을<br />

촉진시키기 위한 추가의 보충제, 예로서, 트립신, β-머캅토에탄올 등을 포함한다.<br />

공학처리된 숙주 세포는 프로모터 활성화, 형질전환체 선별, 또는 삽입된 폴리뉴클레오티드 서열의 증폭을 위해<br />

적절히 변형된 통상의 영양 배지에서 배양될 수 있다. 배양 조건, 예를 들면, 온도, pH 등은 전형적으로 발현을<br />

위해 선택되어진 특정 숙주 세포와 함께 앞서 사용되었던 것이며, 이는 당업자에게 자명할 것이며, 예로서,<br />

([Freshney (<strong>19</strong>94) Culture of Animal Cells, Manual of Basic Technique, 3 rd<br />

edition, Wiley-Liss, New<br />

York] 및 그 안에서 인용된 참고문헌)를 비롯한 본원에서 인용되는 참고문헌에서 자명해질 것이다. 도움이 되는<br />

다른 참고문헌으로는 예로서, ([Paul (<strong>19</strong>75) Cell and Tissue Culture. 5 th<br />

ed., Livingston, Edinburgh];<br />

[Adams (<strong>19</strong>80) Laboratory Techniques in Biochemistry and Molecular Biology-Cell Culture for<br />

Biochemists, Work and Burdon (eds.) Elsevier,msterdam])을 포함한다. 시험관내에서의 인플루엔자 바이러스<br />

제조시 특히 관심의 대상이 되는 조직 배양 방법에 관한 추가의 상세한 설명은 예로서, [Merten et al. (<strong>19</strong>96)<br />

Production of influenza virus in cell cultures for vaccine preparation, in Cohen and Shafferman (eds.)<br />

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공개특허 10-2009-0053794


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Novel Strategies in Design and Production of vaccine](이는 그의 전문이 모든 목적을 위해 본원에서 참고로<br />

인용된다)에 포함되어 있다. 추가로, 본 발명에 적합화된 상기 방법에 있어서의 변형은 통상의 실험을 통해 쉽<br />

게 결정될 수 있으며, 당업자는 그에 대해 정통할 것이다.<br />

인플루엔자 바이러스(예로서, 본 발명의 HA 및/또는 NA 서열을 갖는 것)를 생산하는 세포는 혈청 함유 배지 또<br />

는 무혈청 배지에서 배양될 수 있다. 몇몇의 경우, 예를 들어, 정제된 바이러스 제조를 위해서는 전형적으로 무<br />

혈청 조건에서 숙주 세포를 배양하는 것이 바람직할 수 있다. 세포는 소규모로, 예로서, 25 ml 미만의 배지로<br />

배양 튜브 또는 플라스크에서, 또는 플라스크, 병 또는 반응기 배양물 중 교반시키면서 큰 플라스크에서, 회전<br />

식 병에서, 또는 미세담체 비드(예로서, DEAE-덱스트란 미세담체 비드, 예를 들면, 도마셀(Dormacell)(Pfeifer<br />

& Langen); 슈퍼비드(Superbead)(Flow Laboratories); 스티렌 공중합체-트리-메틸아민 비드, 예를 들면, 힐렉<br />

스(Hillex)(앤아버 소재의 SoloHill))상에서 배양될 수 있다. 미세담체 비드는 부착 세포 성장을 위해 세포 배<br />

양물 1 부피당 큰 표면적을 제공하는 작은 구상이다(직경 범위는 100-200 미크론이다). 예를 들어, 1 리터의 배<br />

지는 2000만개 초과의 미세담체 비드를 포함하며, 이는 8000 ㎠ 초과의 성장 표면을 제공한다. 예로서, 백신 제<br />

소를 위해 바이러스를 상업적으로 제조하는 경우, 이는 주로 생물반응기 또는 발효장치에서 세포를 배양하는 것<br />

이 바람직할 수 있다. 생물반응기는 1 리터 미만에서부터 100 리터 초과의 부피로 이용가능하며, 예로는 Cyto3<br />

생물반응기(미네소타주 미네통카 소재의 Osmonics); NBS 생물반응기(뉴저지주 에디슨 소재의 New Brunswick<br />

Scientific); 브라운 바이오테크 인터내셔날(B. Braun Biotech International)(독일 소재의 B. Braun Biotech,<br />

Melsungen)로부터 입수한 실험실용 및 시판용 규모의 생물반응기가 있다.<br />

배양물 부피와는 상관없이 본 발명의 다수의 바람직한 측면에서는 여과를 위해 바이러스 용액을 가열시키면서,<br />

재조합 및/또는 재배열 인플루엔자 바이러스가 확실히 효율적으로 회수될 수 있도록 온도에 의존하는 다중 플라<br />

스미드 시스템을 사용하여 배양물이 적절한 온도로 유지되게 하는 것이 중요하다(예로서, 2002년 10월 23일 출<br />

원된 미국 출원 번호 제60/420,708호(Multi-Plasmid System for the Production of Influenza Virus), 2003년<br />

4월 25일 출원된 미국 출원 번호 제10/423,828호, 및 2004년 5월 24일 출원된 미국 출원 번호 제60/574,117호<br />

참고). 전형적으로, 적절한 기간 동안(예로서, 바이러스 복제시 등) 온도가 정확한 수준에 있도록 하기 위해 조<br />

절 장치, 예로서, 온도 조절기, 또는 세포 배양물 시스템 및/또는 기타 용액의 온도를 감시하고 유지시키는 다<br />

른 장치가 사용된다.<br />

본원의 몇몇 실시태양에서(예로서, 재배열 바이러스가 벡터 상의 분절로부터 제조되는 경우) 당업계에 잘 알려<br />

져 있는, 진핵생물 세포내로 이종성 핵산을 도입하는 방법, 예로서, 인산칼슘 공-침전법, 전기천공법, 미세주입<br />

법, 리포펙션, 및 폴리아민 형질감염 시약을 사용하는 형질감염과 같은 방법에 따라 인플루엔자 게놈 분절을 포<br />

함하는 벡터를 숙주 세포내로 도입(예로서, 형질도입)시킨다. 예를 들면, 재조합 바이러스 등을 제조하기 위해<br />

제조사의 설명서에 따라 폴리아민 형질감염 시약 TransIT-LT1(Minis)을 사용하여 벡터, 예로서, 플라스미드를<br />

숙주 세포, 예를 들면, COS 세포, 293T 세포 또는 COS 또는 293T 세포와 MDCK 세포의 조합물로 형질감염시킬 수<br />

있다. 따라서, 일례로, 총 부피 200 ㎕ 중 160 ㎕의 배지, 바람직하게 무혈청 배지에 희석된 대략 2 ㎕의<br />

TransIT-LT1을 사용하여 대략 1 ㎍의 각각의 벡터를 숙주 세포 군집으로 도입한다. DNA:형질감염 시약 혼합물을<br />

실온에서 45분 동안 인큐베이션시킨 후, 800 ㎕의 배지를 첨가한다. 형질감염 혼합물을 숙주 세포에 가하고, 당<br />

업자에게 잘 알려져 있는 기타 방법을 통해 세포를 배양한다. 그에 따라서 세포 배양물에서 재조합 또는 재배열<br />

바이러스의 생산을 위해 8개의 게놈 분절(PB2, PB1, PA, NP, M, NS, HA 및 NA, 예로서, 본 발명의 것) 각각을<br />

혼입하고 있는 벡터를 대략 20 ㎕ TransIT-LT1과 혼합하고, 숙주 세포내로 형질감염시킨다. 임의로, 형질감염<br />

이전에 혈청을 함유하는 배지를 예로서, Opti-MEM I과 같은 무혈청 배지로 대체하고, 4-6시간 동안 인큐베이션<br />

시킨다.<br />

별법으로, 인플루엔자 게놈 분절을 혼입하고 있는 상기와 같은 벡터를 숙주 세포내로 도입시키기 위해 전기천공<br />

이 사용될 수 있다. 예를 들어, 인플루엔자 A 또는 인플루엔자 B 바이러스를 혼입하고 있는 플라스미드 벡터는<br />

유리하게 하기 방법에 따른 전기천공을 사용하여 베로 세포내로 도입된다. 간략하면, 대략 5 x 10 6<br />

개의 베로 세<br />

포, 예로서, 10% 우태아 혈청(FBS: Fetal Bovine Serum)으로 보충된 변형된 이글스 배지(MEM: Modified<br />

Eagle's Medium)에서 배양된 상기 세포를 0.4 ml OptiMEM에 재현탁시키고, 전기천공 큐베트에 놓는다. 25 ㎕ 이<br />

하의 부피로 20 ㎍의 DNA를 큐벳내 세포에 첨가한 후, 이를 가볍게 두드림으로써 서서히 혼합시킨다. 28-33<br />

msec 사이의 시간 상수를 사용하여 300 볼트, 950 마이크로 패러드 하에 제조사의 설명서(예로서, Capacitance<br />

Extender Plus가 연결된 BioRad Gene Pulser II)에 따라 전기천공을 실시한다. 서서히 가볍게 두드림으로써 세<br />

포를 다시 혼합하고, 전기천공 후 대략 1-2분 경과 후, 10% FBS를 포함하는 0.7 ml MEM을 큐벳에 직접<br />

첨가한다. 이어서, 세포를, 2 ml MEM, 10% FBS를 함유하는 6개의 웰을 갖는 표준 조직 배양 디쉬 중 2개의 웰로<br />

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옮긴다. 큐벳을 세척하여 임의의 남아있는 세포를 회수하고, 세척 현탁액을 2개 웰로 나눈다. 최종 부피는 대략<br />

3.5 mL이다. 이어서, 바이러스 성장을 허용가능 조건, 예로서, 저온 적응성 균주의 경우, 대략 33℃에서 인큐베<br />

이션시킨다.<br />

포유동물 숙주 세포에서, 다수의 발현 시스템, 예를 들면, 바이러스 기초 시스템이 사용될 수 있다. 아데노바이<br />

러스가 발현 벡터로서 사용되는 경우, 코딩 서열은 임의로 후기 프로모터 및 3부로 나누어진 리더 서열로 구성<br />

된 아데노바이러스 전사/번역 복합체로 결찰된다. 바이러스 게놈의 비필수 E1 또는 E3 영역내 삽입으로 감염된<br />

숙주 세포에서 관심의 대상이 되는 폴리펩티드를 발현할 수 있는 생육성 바이러스를 수득하게 될 것이다[Logan<br />

and Shenk (<strong>19</strong>84) Proc Natl Acad Sci 81:3655-3659]. 또한, 전사 인핸서, 예를 들면, 라우스 육종 바이러스<br />

(RSV: rous sarcoma virus) 인핸서는 포유동물 숙주 세포에서의 발현을 증가시키기 위해 사용될 수 있다.<br />

삽입된 서열의 발현을 조절할 수 있거나, 원하는 양식대로 발현된 단백질을 프로세싱할 수 있는 능력에 대해서<br />

숙주 세포 균주는 임의로 선택된다. 상기와 같은 단백질의 변형으로는 아세틸화, 카르복실화, 당화, 인산화, 지<br />

질화 및 아실화를 포함하나, 이에 한정되지 않는다. 전구체 형태를 성숙한 형태로 절단하는 것인 단백질의 번역<br />

후 프로세싱이 때로는 올바른 삽입, 폴딩, 및/또는 기능을 위해서는 중요하다. 숙주 세포내(예로서, 세표 표면<br />

상에) 추가로 적절히 위치화시키는 것도 중요하다. 상이한 숙주 세포, 예를 들면, COS, CHO, BHK, MDCK, 293,<br />

293T, C0S7 등은 상기와 같은 번역후 활성에 대해 특이적인 세포 기구 및 특징적인 기전을 갖고 있으며, 이는<br />

현 도입된 외래 단백질의 정확한 변형과 프로세싱을 확실히 하기 위해 선택될 수 있다.<br />

본 발명의 폴리뉴클레오티드에 의해 코딩된 재조합 단백질 또는 그에 의해 코딩된 하위서열을 갖는 재조합 단백<br />

질을 장기간 동안 고수율로 제조하기 위해서는 안정적인 발현 시스템이 임의로 사용된다. 예를 들어, 본 발명의<br />

폴리펩티드를 안정적으로 발현하는 세포를, 바이러스 복제 기점 또는 내인성 발현 요소 및 선별가능한 마커 유<br />

전자를 함유하는 발현 벡터를 사용하여 형질감염시킨다. 예를 들어,벡터를 도입한후, 선별 배지로 교체하기 이<br />

전에 영양강화 배지에서 1-2일 동안 세포를 배양한다. 선별가능한 마커의 목적은 선별에 대한 내성을 부여하는<br />

것이며, 선별가능한 마커가 존재함으로써 도입된 서열을 성공적으로 발현하는 세포를 배양하고 회수할 수 있다.<br />

따라서, 예를 들면, 단일 세포 유형으로부터 유형된 것과 같은 안정적으로 형질도입된 세포의 내성을 띤 응집물<br />

은 상기 세포 유형에 적절한 조직 배양 기법의 사용으로 증식시킬 수 있다.<br />

본 발명의 폴리펩티드를 코딩하는 뉴클레오티드 서열로 형질전환된 숙주 세포는 임의로 세포 배양물로부터 코딩<br />

된 단백질의 발현과 회수에 적합한 조건하에서 배양된다. 상기 단백질을 발현하는 세포는 분류, 단리 및/또는<br />

정제될 수 있다. 재조합 세포에 의해 제조된 단백질 또는 그의 단편은 서열에 따라(예로서, 융합 단백질을 코딩<br />

하는 막 보존 신호 등에 따라) 및/또는 사용하는 벡터에 따라 분비되거나, 막에 결합하거나, 세포내 보존될 수<br />

있다.<br />

본 발명의 핵산에 상응하는 발현 생성물은 또한 동물이 아닌 세포, 예를 들면, 식물, 효모, 진균, 세균 등에서<br />

생산될 수 있다. [Sambrook, Berger and Ausubel], 그 이외에, 세포 배양물에 관한 하기의 모든 설명은<br />

([Payne et al. (<strong>19</strong>92) Plant Cell and Tissue Culture in Liquid Systems John Wiley & Sons, Inc. New<br />

York, NY]; [Gamborg and Phillips (eds.) (<strong>19</strong>95) Plant Cell Tissue and Organ Culture]; [Fundamental<br />

Methods Springer Lab Manual, Springer-Verlag (Berlin Heidelberg New York) and Atlas and Parks (eds.)<br />

The Handbook of Microbiological Media (<strong>19</strong>93) CRC Press, Boca Raton, FL])에서 찾아볼 수 있다<br />

세균 시스템에서 다수의 발현 벡터는 발현되는 생성물에 대해 의도되는 용도에 따라 선택될 수 있다. 예를<br />

들어, 항체 생산을 위해 다량의 폴리펩티드 또는 그의 단편이 필요할 경우, 쉽게 정제되는 융합 단백질을 고수<br />

준으로 발현시키는 벡터가 유리하게 사용된다. 그러한 벡터로는, 관심의 대상이 되는 코딩 서열, 예로서, 본원<br />

에서 발견되는 것 등을 포함하는 서열이 아미노-말단 번역 개시 메티오닌에 대한 서열과, 이어서 촉매적으로 활<br />

성인 베타 갈락토시다제 융합 단백질을 생산하는 베타 갈락토시다제의 7개의 잔기와 함께 프레임내 벡터내로 결<br />

찰될 수 있는 BLUESCRIPT(Stratagene)와 같은 다기능 E. 콜라이 클로닝 및 발현 벡터; pIN 벡터[Van Heeke &<br />

Schuster (<strong>19</strong>89) J Biol Chem 264:5503-5509]; pET 벡터(위스콘신주 매디슨 소재의 Novagen) 등을 포함하나,<br />

이에 한정되지 않는다. 유사하게, 효모 사카로마이세스 세레비지아에서는 구성 프로모터 또는 유도성 프로모터,<br />

예를 들면, 알파 인자, 알코올 옥시다제 및 PGH를 함유하는 다수의 벡터가 원하는 발현 생성물을 제조하는데 사<br />

용될 수 있다. 리뷰를 위해서 ([Ausubel, 하기 문헌], 및 [Grant et al, (<strong>19</strong>87); Methods in Enzymology<br />

153:516-544])을 참조한다.<br />

핵산 하이브리드화<br />

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공개특허 10-2009-0053794


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비교 하이브리드화를 사용하여 본 발명의 핵산의 보존적 변이를 비롯한, 본 발명의 핵산(예로서, 서열 번호 1-<br />

10, 서열 번호 21-26, 서열 번호 33-38, 서열 번호 45)을 동정할 수 있다. 이러한 비교 하이브리드화 방법은 본<br />

발명의 핵산을 구별하는 바람직한 방법이다. 추가로, 고도로, 초고도로(ultra-high), 및 극초고도로(ultra-<br />

ultra-high) 엄격한 조건하에서 예로서, 본원에서 나타낸 것과 같은 것으로 제시된 핵산에 하이브리드화하는 표<br />

적 핵산이 본 발명의 특징이 된다. 그러한 핵산의 예로는 주어진 핵산 서열과 비교하여 하나 또는 수개의 침묵<br />

또는 보존적 핵산 치환을 갖는 것을 포함한다.<br />

시험 표적 핵산은, 완전히 매치되는 상보적 표적에 대한 하이브리드화 대비, 프로브에 대해 ½ 이상으로 하이브<br />

리드화할 때, 즉, 매치되지 않는 표적 핵산 중 임의의 것에 대한 하이브리드화에서 관찰되는 비의 약 5x 내지<br />

10x 이상인 신호 대 잡음비로 완전히 매치되는 프로브가 완전히 매치되는 상보적 표적에 결합하도록 하는 조건<br />

하에서, 표적에 대한 프로브의 하이브리드화의 ½ 이상인 신호 대 잡음비를 가질 때, 프로브 핵산에 특이적으로<br />

하이브리드화한다고 일컬어진다.<br />

핵산은 그것이 전형적으로 용매 중 연합할 때, "하이브리드화"한다. 핵산은 다양한 잘 특징화된 물리화학적 힘,<br />

예컨대, 수소 결합, 용매 배제, 염기 적층 등으로 인해 하이브리드화한다. 핵산 하이브리드화에 관한 다수의 프<br />

로토콜은 당업계에 잘 알려져 있다. 핵산의 하이브리드화에 관한 자세한 가이드는 [Tijssen (<strong>19</strong>93) Laboratory<br />

Techniques in Biochemistry and Molecular Biology-Hybridization with Nucleic Acid Probes part I chapter<br />

2, "Overview of principles of hybridization and the strategy of nucleic acid probe assays," (Elsevier,<br />

New York)] 및 [Ausubel, Sambrook, 및 Berger and Kimmel]와 하기의 모든 문헌에 나와 있다. ([Hames and<br />

Higgins (<strong>19</strong>95) Gene Probes 1 IRL Press at 0xford University Press, 0xford, England, (Hames and Higgins<br />

1)] 및 [Hames and Higgins (<strong>19</strong>95) Gene Probes 2 IRL Press at 0xford University Press, 0xford, England<br />

(Hames and Higgins 2)])는 올리고뉴클레오티드를 포함하는 DNA 및 RNA의 합성, 표지화, 검출 및 정량화에 대한<br />

상세 내용을 제공한다.<br />

써던 또는 노던 블로트내 필터 상에 100개 초과의 상보적 잔기를 가지는 상보적 핵산의 하이브리드화를 위한 엄<br />

격한 하이브리드화 조건의 한 예는 42℃에서의 1 mg의 헤파린을 갖는 50% 포르말린이고, 여기에서, 하이브리드<br />

화는 밤새도록 수행된다. 엄격한 세정 조건의 한 예는 15분 동안 65℃에서 0.2xSSC 세정하는 것이다(SSC 완충액<br />

및 기타 핵산 하이브리드화 파라미터에 관한 설명을 위해 [Sambrook, 하기 문헌]를 참조한다). 종종 고도로 엄<br />

격한 세정 전에, 엄격성이 낮은 세정이 선행되어, 배경 프로브 신호를 제거한다. 한 예로서의 엄격성이 낮은 세<br />

정은 15분 동안 40℃에서 2x SSC를 이용하여 세정하는 것이다. 일반적으로, 특별한 하이브리드화 분석법에서 비<br />

관련 프로브에 대해 관찰되는 것보다 5x(또는 그 이상) 더 높은 신호 대 잡음비는 특정 하이브리드화의 검출을<br />

가리킨다.<br />

하이브리드화 이후, 하이브리드화되지 않은 핵산은 일련의 세정을 거쳐 제거될 수 있는데, 그의 엄격성은 원하<br />

는 결과에 따라 조절될 수 있다. 엄격성이 낮은 세정 조건(예로서, 더욱 높은 염과 더욱 낮은 온도 사용)이 감<br />

수성을 증가시키지만, 비특이적인 하이브리드화 신호와 높은 배경 신호를 생성할 수 있다. 더욱 고도로 엄격한<br />

조건(예로서, 더욱 낮은 염과 Tm에 좀더 가까운, 더욱 높은 온도 사용)은 배경 신호를 낮추며, 전형적으로는 주<br />

로 특이적인 신호는 그대로 남아있다. 또한 [Rapley, R. and Walker, J.M. eds., Molecular Biomethods<br />

Handbook (Humana Press, Inc. <strong>19</strong>98)]를 참조한다.<br />

핵산 하이브리드화 실험, 예를 들면, 써던 및 노던 하이브리드화와 관련하여 "엄격한 하이브리드화 세정 조건"<br />

은 서열에 의존하며, 이는 상이한 환경 파라미터하에서는 달라진다. 핵산의 하이브리드화에 관한 자세한 가이드<br />

는 [Tijssen (<strong>19</strong>93), 상기 문헌] 및 [Hames and Higgins, 1 and 2]에 나와 있다. 엄격한 하이브리드화 및 세정<br />

조건은 임의의 시험 핵산에 대해 실험적으로 용이하게 결정될 수 있다. 예를 들어, 고도로 엄격한 하이브리드화<br />

및 세정 조건을 결정할 때, 선택된 기준 세트가 충족될 때까지, 하이브리드화 및 세정 조건을 (예컨대, 하이브<br />

리드화 또는 세정시에 온도 증가, 염 농도 감소, 세제 농도 증가, 및/또는 포르말린과 같은 유기 용매의 농도<br />

증가에 의해) 점차적으로 증가시킨다. 예를 들어, 매치되지 않은 표적에 대한 프로브의 하이브리드화에서 관찰<br />

되는 것의 5x이상인 신호 대 잡음비로 프로브가 완전히 매치되는 상보적 표적에 결합할 때까지, 하이브리드화<br />

및 세정 조건을 점차적으로 증가시킨다.<br />

일반적으로, 특별한 하이브리드화 분석법에서 비관련 프로브에 대해 관찰되는 것보다 적어도 2x(또는 그 이상,<br />

예로서, 적어도 5x, 10x, 20x, 50x, 100x 이상) 더 높은 신호 대 잡음비는 특정 하이브리드화의 검출을 가리킨<br />

다. 두 서열간의 적어도 엄격한 하이브리드화 검출은 예로서, 본원 서열목록에서 제공하는 본 발명의 핵산과의<br />

상대적으로 강한 구조상의 유사성을 나타낸다.<br />

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"매우 엄격한" 조건은 특별한 프로브에 대한 열 융점 온도(Tm)과 동등하도록 선택된다. Tm은 시험 서열의 50%가<br />

완전히 매치되는 표적에 하이브리드화하는 (한정된 이온 강도 및 pH 하에서의) 온도이다. 본 발명의 목적상, 일<br />

반적으로, "고도로 엄격한" 하이브리드화 및 세정 조건은 한정된 이온 강도 및 pH에서 특정 서열에 대한 Tm보다<br />

약 5℃ 더 낮도록 선택된다(하기에서 언급하는 바, 고도로 엄격한 조건은 또한 비교 측면에서 언급될 수 있다).<br />

관심의 대상이 되는 뉴클레오티드 서열과 매우 가깝거나 그와 일치하는 표적 서열(예로서, "프로브")은 엄격하<br />

거나 고도로 엄격한 조건하에서 동정될 수 있다. 엄격성이 낮은 조건은 상보성이 더 작은 서열에 대해<br />

적절하다.<br />

"초고도로 엄격한" 하이브리드화 및 세척 조건은 하이브리드화 및 세정 조건의 엄격성이 완전히 매치되는 상보<br />

적 표적 핵산에 대한 프로브의 결합을 위한 신호 대 잡음비가 매치되지 않은 표적 핵산들 중 임의의 것에 대한<br />

하이브리드화에서 관찰되는 비의 10x 이상이 될 때까지 증가되는 조건이다. 완전히 매치되는 상보적 표적 핵산<br />

의 비의 ½ 이상인 신호 대 잡음비로 상기 조건 하에서 프로브에 하이브리드화하는 표적 핵산은 초고도 엄격성<br />

조건하에서 프로브에 결합한다고 일컬어진다.<br />

엄격하거나 고도로 엄격한 하이브리드화(또는 더욱더 엄격한 하이브리드화) 및 세정 조건을 결정할 때, 선택된<br />

기준 세트가 충족될 때까지, 하이브리드화 및 세정 조건을 (예컨대, 하이브리드화 또는 세정시에 온도 증가, 염<br />

농도 감소, 세제 농도 증가, 및/또는 포르말린과 같은 유기 용매의 농도 증가에 의해) 점차적으로 증가시킨다.<br />

예를 들어, 원하는 바와 같이 매치되지 않은 표적(예로서, 공용 데이타베이스, 예를 들면, 파일링시 진뱅크에<br />

존재하는 공지된 인플루엔자 서열로부터 선택되는 하나 이상의 서열 또는 하위서열을 포함하는 폴리뉴클레오티<br />

드 서열 및/또는 그의 상보적 폴리뉴클레오티드 서열)에 대한 프로브의 하이브리드화에서 관찰되는 비의 적어도<br />

2x(및 임의로 5x, 10x, 또는 100x 이상) 높은 신호 대 잡음비로 본 발명의 하나 이상의 폴리뉴클레오티드 서열,<br />

예로서, 본원에서 제공되는 것으로부터 선택되는 서열 또는 독특한 하위서열(예로서, 서열 번호 1-10, 21-26,<br />

33-38, 서열 번호 45) 및/또는 그의 상보적 폴리뉴클레오티드 서열을 포함하는 프로브가 완전히 매치되는 상보<br />

적 표적(또한, 본원에서 제공되는 것으로부터 선택되는 하나 이상의 핵산 서열 또는 하위서열을 포함하는 핵산<br />

및/또는 그의 상보적 폴리뉴클레오티드 서열)에 결합할 때까지 하이브리드화 및 세정 조건을 점차적으로 증가시<br />

킨다.<br />

본 발명의 폴리뉴클레오티드, 또는 그의 하위서열을 사용하여 신규한 표적 핵산을 수득할 수 있으며, 그러한 표<br />

적 핵산 또한 본 발명의 특징이 된다. 예를 들어, 그러한 표적 핵산은 엄격한 조건하에서 본 발명의 폴리뉴클레<br />

오티드, 예로서, 서열 번호 1-10, 21-26, 33-38, 45 중 임의의 것에 상응하는 독특한 올리고뉴클레오티드 프로<br />

브에 하이브리드화하는 서열을 포함한다.<br />

유사하게, 더 높은 엄격성 수준은 관련 하이브리드화 분석법의 하이브리드화 및/또는 세정 조건을 점차적으로<br />

증가시킴으로써 결정될 수 있다. 예를 들어, 완전히 매치되는 상보적 표적 핵산에 대한 프로브의 결합을 위한<br />

신호 대 잡음비가, 매치되지 않은 표적 핵산들 중 임의의 것에 대한 하이브리드화에서 관찰되는 비의 적어도<br />

10X, 2OX, 50X, 10OX, 또는 500X 또는 그 이상일 때까지, 하이브리드화 및 세정 조건의 엄격성을 증가시키는 조<br />

건이다. 특정 신호는 예로서, 형광 표지, 비색 표지, 방사성 표지 등과 같이, 관련 분석법에서 사용되는 표지에<br />

따라 달라질 것이다. 완전히 매치되는 상보적 표적 핵산의 비의 ½ 이상인 신호 대 잡음비로 상기 조건 하에서<br />

프로브에 하이브리드화하는 표적 핵산은 극초고도로 엄격한 조건하에서 프로브에 결합한다고 일컬어지며, 이 또<br />

한 본 발명의 특징이 된다.<br />

엄격한 조건하에서 서로에 대해 하이브리드화하지 않는 핵산은, 그것이 코딩하는 폴리펩티드가 실질적으로 동일<br />

한 경우, 여전히 실질적으로 동일하다. 이는, 예컨대, 유전 코드에 의해 허용되는 최대 코돈 퇴화를 이용하여<br />

핵산의 카피가 제조될 때 일어난다.<br />

관심의 대상이 되는 생체 분자의 클로닝, 돌연변이유발 및 발현<br />

본 발명에도 적용가능한 분자생물학적 기법, 예를 들면, 클로닝, 돌연변이화 세포 배양법 등을 기재하고 있는<br />

일반 텍스트로는 ([Berger and Kimmel, Guide to Molecular Cloning Techniques, Methods in Enzymology<br />

volume 152 Academic Press, Inc., San Diego, CA (Berger)]; [Sambrook et al., Molecular Cloning - A<br />

Laboratory Manual (3rd Ed.), Vol. 1-3, Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor, New York,<br />

2000 ("Sambrook")] 및 [Current Protocols in Molecular Biology, F. M. Ausubel et al., eds., Current<br />

Protocols, joint venture between Greene Publishing Associates, Inc. and John Wiley & Sons, Inc.,<br />

(supplemented through 2002) ("Ausubel")])을 포함한다. 이들 텍스트는 예로서, HA 및/또는 NA 분자 생성 등<br />

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<br />

과 관련된 돌연변이유발, 벡터의 사용, 프로모터 및 다수의 다른 관련 주제를 기재하고 있다.<br />

다양한 유형의 돌연변이유발은 예로서, 본 발명의 신규의 또는 새로 단리된 HA 및/또는 NA 분자를 제조 및/또는<br />

단리시키기 위해, 및/또는 본 발명의 폴리펩티드(예로서, 서열 번호 11-20 또는 27-32 또는 39-44에 기재된 HA<br />

및 NA 분자)를 추가로 변형/돌연변이화시키기 위해서 임의로 본 발명에서 사용된다. 이들은 부위 지정, 무작위<br />

점 돌연변이유발, 상동 재조합(DNA 셔플링), 우라실을 함유하는 주형을 사용한 돌연변이유발, 올리고뉴클레오티<br />

드 지정 돌연변이유발, 포스포로티오에이트 변형 DNA 돌연변이유발, 갭이 있는 이중체 DNA를 사용한 돌연변이유<br />

발 등을 포함하나, 이에 한정되지 않는다. 추가적인 적합한 방법으로는 점 미스매치 수복, 수복-결핍 숙주 균주<br />

를 사용한 돌연변이유발, 제한-선택 및 제한-정제, 결실 돌연변이유발, 총 유전자 합성에 의한 돌연변이유발,<br />

더블 스트랜드 파괴 수복 등을 포함한다. 예로서, 키메라 작제물을 이용하는 것을 포함하는 돌연변이유발도 본<br />

발명에 포함된다. 하나의 실시태양에서, 서열, 서열 비교, 물리적 성질, 결정 구조 등과 같은 천연적으로 발생<br />

된 분자, 또는 변형 또는 돌연변이화된 천연적으로 발생된 분자의 공지된 정보에 의해 돌연변이유발을 주도할<br />

수 있다.<br />

본원에서 발견되는 상기 텍스트 및 일례들은 이러한 절차를 기재할 뿐만 아니라, 하기 간행물(및 그 안에서 인<br />

용되는 참고문헌)에도 나와 있다: ([Sieber, et al., Nature Biotechnology, <strong>19</strong>:456-460 (2001)]; [Ling et<br />

al., approaches to DNA mutagenesis: an overview, Anal Biochem 254(2): 157-178 (<strong>19</strong>97)]; [Dale et al.,<br />

Oligonucleotide-directed random mutagenesis using the phosphorothioate method, Methods Mol Biol<br />

57:369-374 (<strong>19</strong>96)]; [I. A. Lorimer, I. Pastan, Nucleic Acids Res 23, 3067-8 (<strong>19</strong>95)]; [W. P. C.<br />

Stemmer, Nature 370, 389-91 (<strong>19</strong>94)]; [Arnold, Protein engineering for unusual environments, Current<br />

Opinion in Biotechnology 4:450-455 (<strong>19</strong>93)]; [Bass et al., Mutant Trp repressors with new DNA-binding<br />

specificities, Science 242:240-245 (<strong>19</strong>88)]; [Fritz et al., Oligonucleotide-directed construction of<br />

mutations: a gapped duplex DNA procedure without enzymatic reactions in vitro, Nucl Acids Res 16:<br />

6987-6999 (<strong>19</strong>88)]; [Kramer et al., Improved enzymatic in vitro reactions in the gapped duplex DNA<br />

approach to oligonucleotide-directed construction of mutations, Nucl Acids Res 16:7207 (<strong>19</strong>88)];<br />

[Sakamar and Khorana, Total synthesis and expression of a gene for the a-subunit of bovine rod outer<br />

segment guanine nucleotide-binding protein (transducin), Nucl Acids Res 14: 6361-6372 (<strong>19</strong>88)]; [Sayers<br />

et al., Y-T Exonucleases in phosphorothioate-based oligonucleotide-directed mutagenesis, Nucl Acids<br />

Res 16:791-802 (<strong>19</strong>88)]; [Sayers et al., Strand specific cleavage of phosphorothioate-containing DNA by<br />

reaction with restriction endonucleases in the presence ofethidium bromide, (<strong>19</strong>88) Nucl Acids Res<br />

16:803-814]; [Carter, Improved oligonucleotide-directed mutagenesis using M13 vectors, Methods in<br />

Enzymol 154: 382-403 (<strong>19</strong>87)]; [Kramer & Fritz Oligonucleotide-directed construction of mutations via<br />

gapped duplex DNA, Methods in Enzymol 154:350-367 (<strong>19</strong>87)]; [Kunkel, The efficiency of oligonucleotide<br />

directed mutagenesis, in Nucleic Acids & Molecular Biology (Eckstein, F. and Lilley, D.M.J, eds.,<br />

Springer Verlag, Berlin)) (<strong>19</strong>87)]; [Kunkel et al., Rapid and efficient site-specific mutagenesis<br />

without phenotypic selection, Methods in Enzymol 154, 367-382 (<strong>19</strong>87)]; [Zoller & Smith,<br />

Oligonucleotide-directed mutagenesis: a simple method using two oligonucleotide primers and a single-<br />

stranded DNA template, Methods in Enzymol 154:329-350 (<strong>19</strong>87)]; [Carter, Site-directed mutagenesis,<br />

Biochem J 237:1-7 (<strong>19</strong>86)]; [Eghtedarzadeh & Henikoff, Use of oligonucleotides to generate large<br />

deletions, Nucl Acids Res 14:5115 (<strong>19</strong>86)]; [Mandecki, Oligonucleotide-directed double-strand Break<br />

repair in plasmids of Escherichia coli: a method for site-specific mutagenesis, Proc Natl Acad Sci<br />

USA, 83:7177-7181 (<strong>19</strong>86)]; [Nakamaye & Eckstein, Inhibition of restriction endonuclease Nci I cleavage<br />

by phosphorothioate groups and its application to oligonucleotide-directed mutagenesis, Nucl Acids Res<br />

14:9679-9698 (<strong>19</strong>86)]; [Wells et al, Importance of hydrogen-bond formation in stabilizing the<br />

transition state of subtilisin, Phil Trans R Soc Lond A 317:415-423 (<strong>19</strong>86)]; [Botstein & Shortle,<br />

Strategies and applications of in vitro mutagenesis, Science 229:1<strong>19</strong>3-<strong>12</strong>01(<strong>19</strong>85)]; [Carter et al.,<br />

Improved oligonucleotide site-directed mutagenesis using M13 vectors, Nucl Acids Res 13: 4431-4443<br />

(<strong>19</strong>85)]; [Grundstrom et al., Oligonucleotide-directed mutagenesis by microscale 'shot-gun' gene<br />

synthesis, Nucl Acids Res 13:3305-3316 (<strong>19</strong>85)]; [Kunkel, Rapid and efficient site-specific mutagenesis<br />

without phenotypic selection, Proc Natl Acad Sci USA 82:488-492 (<strong>19</strong>85)]; [Smith, In vitro mutagenesis,<br />

Ann Rev Genet <strong>19</strong>:423-462(<strong>19</strong>85)]; [Taylor et al., The use of phosphorothioate-modified DNA in<br />

restriction enzyme reactions to prepare nicked DNA, Nucl Acids Res 13: 8749-8764 (<strong>19</strong>85)]; [Taylor et<br />

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<br />

<br />

<br />

al., The rapid generation of oligonucleotide-directed mutations at high frequency using<br />

phosphorothioate-modified DNA, Nucl Acids Res 13:8765-8787 (<strong>19</strong>85)]; [Wells et al., Cassette<br />

mutagenesis: an efficient method for generation of multiple mutations at defined sites, Gene 34:315-<br />

323 (<strong>19</strong>85)]; [Kramer et al., The gapped duplex DNA approach to oligonucleotide-directed mutation<br />

construction, Nucl Acids Res <strong>12</strong>: 9441-9456 (<strong>19</strong>84)]; [Kramer et al., Point Mismatch Repair, Cell<br />

38:879-887 (<strong>19</strong>84)]; [Nambiar et al., Total synthesis and cloning of a gene coding for the ribonuclease<br />

S protein, Science 223:<strong>12</strong>99-1301 (<strong>19</strong>84)]; [Zoller & Smith, Oligonucleotide-directed mutagenesis of DNA<br />

fragments cloned into M13 vectors, Methods in Enzymol 100:468-500 (<strong>19</strong>83)]; 및 [Zoller & Smith,<br />

Oligonucleotide-directed mutagenesis using M13-derived vectors: an efficient and general procedure for<br />

the production of point mutations in any DNA fragment, Nucl Acids Res 10:6487-6500 (<strong>19</strong>82)]). 상기 방법<br />

들 다수에 관한 상세한 설명은 [Methods in Enzymol Volume 154]에서 찾아볼 수 있는데, 상기 문헌은 또한 상기<br />

방법들 중 다수의 방법에 대한 추가적인 상세 내용을, 다양한 돌연변이유발, 유전자 단리, 발현, 및 기타 방법<br />

을 이용한 타결 문제점에 대한 유용한 조절을 또한 기재하고 있는 [Methods in Enzymol Volume 154]에서 찾아볼<br />

수 있다.<br />

예컨대, 본 발명의 HA 및/또는 NA 분자의 라이브러리를 돌연변이화하거나, 상기를 변경시키는 것과 같은 본 발<br />

명의 돌연변이유발에 사용하기 위한 올리고뉴클레오티드는 전형적으로 예컨대, [Needham-VanDevanter et al.,<br />

Nucleic Acids Res. <strong>12</strong>:6159-6168 (<strong>19</strong>84)]에 기재된 바와 같은 자동화 합성장치를 이용하여 [Beaucage and<br />

Caruthers, Tetrahedron Letts. 22(20):1859-1862 (<strong>19</strong>81)]에 기재된 고체상 포스포르아미다이트 트리에스테르<br />

방법에 따라 화학적으로 합성된다.<br />

또한, 본질적으로 임의의 핵산을 다양한 상업적 공급원, 예를 들어, 더 미들랜드 써티파이드 리에이전트 컴퍼니<br />

(The Midland Certified Reagent Company)(mcrc@oligos.com), 더 그레이트 어메리칸 진 컴퍼니(The Great<br />

American Gene Company)(www.genco.com), 익스프레스젠 인코포레이티드(ExpressGen<br />

Inc.)(www.expressgen.com), 오페론 테크놀로지스 인코포레이티드(Operon Technologies Inc.)(미국 캘리포니아<br />

주 알라메다 소재) 및 기타 다수의 회사들 중 임의의 회사로부터 맞춤 제작하거나 표준 주문할 수 있다. 유사하<br />

게, 펩티드 및 항체는 다양한 공급원, 예를 들어, 펩티도제닌(PeptidoGenic)(pkim@ccnet.com에서 이용가능),<br />

HTI 바이오-프로덕트 인코포레이티드(HTI Bio-Product, Inc.)(www.htibio.com), BMA 바이오메티칼스 리미티드<br />

(BMA Biomedicals Ltd.)(영국 소재), 바이오. 신테시스 인코포레이티드(Bio. Synthesis Inc.), 및 기타 다수의<br />

회사들 중 임의의 회사로부터 맞춤 주문할 수 있다.<br />

본 발명은 또한 본 발명의 HA 및/또는 NA 분자 또는 기타 폴리펩티드 및/또는 핵산, 예로서, 서열 번호 1-45를<br />

포함하는 숙주 세포 및 유기체에 관한 것이다. 숙주 세포는 예를 들어, 클로닝 벡터 또는 발현 벡터일 수 있는<br />

본 발명의 벡터를 사용하여 유전공학처리(예로서, 형질전환, 형질도입 또는 형질감염)된다. 벡터는 예를 들어,<br />

플라스미드, 세균, 바이러스, 나형 폴리뉴클레오티드 또는 접합된 폴리뉴클레오티드의 형태일 수 있다. 전기천<br />

공법[From et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 82, 5824 (<strong>19</strong>85)], 바이러스 벡터에 의한 감염, 작은 비드 또<br />

는 입자의 매트릭스내 또는 표면 상에서 핵산을 사용하여 작은 입자에 의한 고속 탄동 침투[Klein et al.,<br />

Nature 327, 70-73 (<strong>19</strong>87)] 등을 비롯한 표준 방법에 의해 벡터를 세포 및/또는 미생물에 도입시킨다.<br />

(Berger, Sambrook, 및 Ausubel)은 각종의 적절한 형질전환 방법을 제공한다. 상기를 참조한다.<br />

표적 핵산을 세포에 도입시키는 수개의 공지된 방법이 이용가능하며, 이들 중 임의의 방법이 본 발명에 사용될<br />

수 있다. 이들은 수혜 세포와 DNA를 함유하는 세균 원형질체의 융합, 전기천공법, 추진체 포격(projectile<br />

bombardment), 및 바이러스 벡터를 사용한 감염 등을 포함한다. 세균 세포를 본 발명의 DNA 작제물을 함유하는<br />

다수의 플라스미드를 증폭시키는데 사용할 수 있다. 세균은 로그 상태(log phase)로 성장하고, 세균내 플라스미<br />

드는 당업계에 공지된 다양한 방법 (예컨대, [Sambrook]을 참조할 수 있다)에 의해 단리될 수 있다. 또한, 세균<br />

으로부터 플라스미드를 정제하기 위한 다수의 키트가 상업적으로 구입가능하다. (예컨대, 양자 모두 파마시아<br />

바이오테크(Pharmacia Biotech)로부터 각기 입수되는 이지프렙(EasyPrep), 플렉시프렙(FlexiPrep); 스트라<br />

타진(Stratagene)으로부터 입수되는 스트라타클린(StrataClean); 및 퀴아겐(Qiagen)으로부터 입수되는 퀴아프<br />

렙(QIAprep) 참조). 이어서, 단리되고 정제된 플라스미드를 추가 조작하여, 세포 형질 감염에 사용되거나 관<br />

련된 벡터에 혼입시켜 유기체를 감염시키는 다른 플라스미드를 제조한다. 전형적인 벡터는 전사 및 번역<br />

종결자, 전사 및 번역 개시 서열, 및 특정 표적 핵산의 발현의 조절에 유용한 프로모터를 함유한다. 벡터는 임<br />

의적으로 적어도 하나의 독립적인 종결자 서열, 진핵생물 또는 원핵생물 또는 양자 모두 중에서 카세트의 복제<br />

를 허용하는 서열(셔틀 벡터를 포함), 및 원핵생물 및 진핵생물 시스템 양자 모두에 대한 선별 마커를 함유하는<br />

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<br />

<br />

<br />

일반 발현 카세트를 포함한다. 벡터는 원핵생물, 진핵생물 또는 양자 모두에서 복제 및/또는 통합에 적합하다.<br />

[Giliman & Smith, Gene 8:81 (<strong>19</strong>79)]; [Roberts, et al., Nature, 328:731 (<strong>19</strong>87)]; [Schneider, B., et<br />

al., Protein Expr. Purif. 6(1)10:14 (<strong>19</strong>95)]; [Ausubel, Sambrook, Berger(모두 상기 문헌)]을 참조할 수 있<br />

다. 클로닝에 유용한 세균 및 박테리오파지의 카탈로그는 예를 들어, ATCC에 의해 예를 들어, ATCC에 의해 공개<br />

된 [The ATCC Catalogue of Bacteria and Bacteriophage (<strong>19</strong>92) Gherna et al. (eds)]에 제공되어 있다.<br />

또한, 분자 생물학 및 기초적인 이론적 고려사항의 서열 분석, 클로닝 및 다른 측면에 대한 추가적인 기본 절차<br />

는 [Watson et al. (<strong>19</strong>92) Recombinant DNA Second Edition Scientific American Books, NY]에 나와 있다. 상<br />

기를 참조한다. 본원 서열과 함께 유용한 추가의 벡터는 백신용 인플루엔자 바이러스 생산에 관한 상기의 섹션<br />

과 그 안에 인용되어 있는 참고 문헌에 설명되어 있다.<br />

폴리펩티드 제조 및 회수<br />

적합한 숙주 세포주 또는 균주의 형질도입 및 적절한 세포 밀도로의 숙주 세포 성장 이후, 적절한 수단(예로서,<br />

온도 변이 또는 화학적 유도)에 의해 선택된 프로모터를 유도시키고, 세포를 추가 기간 동안 배양한다. 몇몇 실<br />

시태양에서, 이어서 분비된 폴리펩티드 생성물, 예로서, 분비된 융합 단백질 형태의 HA 및/또는 NA 폴리펩티드<br />

등을 배양 배지로부터 회수한다. 다른 실시태양에서, 본 발명의 HA 및/또는 NA 폴리펩티드를 함유하는 바이러스<br />

입자를 세포로부터 제조한다. 별법으로, 세포를 원심분리에 의해 수거하고, 물리적 또는 화학적 수단에 의해 파<br />

괴시키고, 생성된 조 추출물은 추가로 정제하기 위해 보유할 수 있다. 단백질 발현에 사용되는 진핵생물 세포<br />

또는 미생물 세포는 동결-해동 순환, 초음파 처리, 기계적 파괴, 또는 세포 용해제 사용, 또는 당업자에게 잘<br />

알려져 있는 기타 다른 방법을 비롯한 임의의 종래 방법에 의해 파괴시킬 수 있다. 추가로, 본 발명의 HA 및/또<br />

는 NA 폴리펩티드 생성물을 발현하는 세포는 세포로부터 폴리펩티드를 분리시키지 않고 사용될 수 있다. 그러한<br />

상황하에서 본 발명의 폴리펩티드는 임의로 세포 표면상에서 발현되고, 이로써(예로서, 세포 표면상에서 항체에<br />

결합하는 HA 및/또는 NA 분자(또는 그이 단편, 예로서, 융합 단백질 등을 포함하는 것)를 가짐으로써)<br />

검사된다. 그러한 세포 또한 본 발명의 특징이 된다.<br />

황산암모늄 또는 에탄올 침전, 산 추출, 음이온 또는 양이온 교환 크로마토그래피, 포스포셀룰로스 크로마토그<br />

래피, 소수성 상호작용 크로마토그래피, 친화성 크로마토그래피(예로서, 당업자에게 알려져 있는 태깅 시스템<br />

중 임의의 것 사용), 수산화인회석 크로마토그래피, 및 렉틴 크로마토그래피를 비롯한, 당업계에 잘 알려져 있<br />

는 다수의 방법들 중 임의의 것에 의해 재조합 세포 배양물로부터 발현된 폴리펩티드를 회수하고 정제할 수 있<br />

다. 단백질 리폴딩 단계는 성숙한 단백질의 입체형상 완성시 원하는 바에 따라 사용될 수 있다. 또한, 고성능<br />

액체 크로마토그래피(HPLC: high performance liquid chromatography)가 최종 정제 단계에서 사용될 수 있다.<br />

본원에서 언급된 참고 문헌이외에도 예로서, ([Sandana (<strong>19</strong>97) Bioseparation of Proteins, Academic Press,<br />

Inc.]; 및 [Bollag et al. (<strong>19</strong>96) Protein Methods. 2 nd<br />

Edition Wiley-Liss, NY]; [Walker (<strong>19</strong>96) The<br />

Protein Protocols Handbook Humana Press, NJ, Harris] 및 [Angal (<strong>19</strong>90) Protein Purification<br />

Applications: A Practical Approach IRL Press at 0xford, 0xford, England]; [Harris and Angal Protein<br />

Purification Methods: A Practical Approach IRL Press at 0xford, 0xford, England]; [Scopes (<strong>19</strong>93)<br />

Protein Purification: Principles and Practice 3 rd<br />

Edition Springer Verlag, NY]; [Janson and Ryden<br />

(<strong>19</strong>98) Protein Purification: Principles, High Resolution Methods and Applications, Second Edition<br />

Wiley-VCH, NY]; 및 [Walker (<strong>19</strong>98) Protein Protocols on CD-ROM Humana Press, NJ])에 기재되어 있는 것을<br />

비롯한, 다양한 정제 방법이 당업계에 잘 알려져 있다.<br />

본 발명의 발현된 폴리펩티드가 바이러스에서 생산될 때, 바이러스는 전형적으로 감염된(형질감염된) 세포가 성<br />

장한 배양 배지로부터 회수된다. 전형적으로, 인플루엔자 바이러스를 농축시키기 이전에 조배지를 정화시킨다.<br />

통상의 방법으로는 한외여과, 황산바륨 상에서의 흡착 및 용리, 및 원심분리를 포함한다. 예를 들어, 먼저 예로<br />

서, 세포 파편 및 다른 큰 입상 물질을 제거하기에 충분한 시간, 예로서, 10 내지 30분 사이 동안 1000-<br />

2000xg에서 원심분리하여 감염된 배양물로부터 조배지를 정화시킬 수 있다. 임의로, 이어서 예로서, 대략 3-5시<br />

간 동안 15,000xg에서 정화된 배지 상등액을 원심분리하여 인플루엔자 바이러스를 펠릿화시킨다. 적절한 완충액<br />

, 예를 들면, STE(0.01 M 트리스-HCl; 0.15 M NaCl; 0.0001 M EDTA) 또는 포스페이트 완충처리된 염(PBS:<br />

phosphate buffered saline)(pH 7.4)중 바이러스 펠릿을 재현탁시킨 후, 수크로스(60%-<strong>12</strong>%) 또는 주석산칼륨<br />

(50%-10%) 상에서 밀도 구배 원심분리에 의해 바이러스를 농축시킨다. 연속 구배 또는 단계식 구배든, 예로서,<br />

<strong>12</strong>% 내지 60% 사이에서 <strong>12</strong>%씩 4단계로 이루어진 수크로스 구배가 적합할 수 있다. 회수를 위해 바이러스를 가시<br />

대역으로 농축시키기에 충분한 시간 동안, 그리고 그러한 속도로 구배를 원심분리한다. 별법으로, 및 대부분의<br />

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대규모의 상업적 적용에 있어서, 연속 방식으로 작동하는 대역-원심회전자를 사용하여 밀도 구배로부터 바이러<br />

스를 현탁 분리한다. 조직 배양물로부터 인플루엔자 바이러스를 제조하는 것까지 당업자를 가이드하는데 충분한<br />

추가의 설명은 ([Furminger. Vaccine Production, in Nicholson et al. (eds.) Textbook of Influenza pp.<br />

324-332]; [Merten et al. (<strong>19</strong>96) Production of influenza virus in cell cultures for vaccine<br />

preparation, in Cohen & Shafferman (eds.) Novel Strategies in Design and Production of Vaccines pp.<br />

141-151], 및 미국 특허 번호 제5,690,937호)에 제공되어 있다. 원하는 경우, 안정화제로서 수크로스-포스페이<br />

트-글루타메이트(SPG: sucrose-phosphate-glutamate)의 존재하에 회수한 바이러스를 -8O℃에서 저장할 수<br />

있다.<br />

별법으로, 예로서, 본원에서 제공된 서열과 같은 본 발명의 아미노산 서열 또는 하위서열, 예를 들면, 서열 번<br />

호 11-20 또는 27-32 또는 39-44를 포함하는 폴리펩티드, 또는, 본 발명의 폴리뉴클레오티드 서열, 예로서, 서<br />

열 번호 1-10 또는 21-26 또는 33-38 또는 45에 의해 코딩되는 폴리펩티드를 생산하기 위해 무세포 전사/번역<br />

시스템이 사용될 수 있다. 다수의 적합한 시험관내 전사 및 번역 시스템이 상업적으로 이용가능하다. 시험관내<br />

전사 및 번역 프로토콜에 대한 일반 가이드는 [Tymms (<strong>19</strong>95) In vitro Transcription and Translation<br />

Protocols: Methods in Molecular Biology Volume 37, Garland Publishing, NY]에 나와 있다.<br />

또한, 폴리펩티드, 또는 그의 하위서열, 예로서, 항원성 펩티드를 포함하는 하위서열은 수동으로, 또는 자동 시<br />

스템을 사용함으로써, 고체상 기법([Stewart et al. (<strong>19</strong>69) Solid-Phase Peptide Synthesis, WH Freeman Co,<br />

San Francisco]; [Merrifield J (<strong>19</strong>63) J Am Chem Soc 85:2149-2154])을 사용하는 직접적인 펩티드 합성에 의<br />

해 제조할 수 있다. 예시적인 자동 시스템으로는 어플라이드 바이오시스템스 431A 펩티드 합성기(Applied<br />

Biosystems 431A Peptide Synthesizer)(캘리포니아주 포스터 시티 소재의 퍼킨 엘머(Perkin Elmer))를 포함한<br />

다. 원하는 경우, 하위서열은 별도로 화학적으로 합성될 수 있거나, 화학적 방법을 사용하여 조합함으로써 전길<br />

이의 폴리펩티드로 제공할 수 있다.<br />

변형된 아미노산<br />

본 발명의 발현된 폴리펩티드는 하나 이상의 변형된 아미노산을 함유할 수 있다. 변형된 아미노산이 존재하는<br />

것은 예를 들면, (a) 폴리펩티드 혈청 반감기 증가, (b) 폴리펩티드 항원성 감소/증가, (c) 폴리펩티드 저장 안<br />

정성 증가라는 점 등에서 이로울 수 있다. 아미노산(들)은 예를 들어, 재조합 생산시 번역과 동시에 또는 번역<br />

후에 변형되거나(예로서, 포유동물 세포에서 발현하는 동안 N-X-S/T 모티프에서의 N-연결 당화), 합성 수단(예<br />

로서, 페길화)에 의해 변형된다.<br />

변형된 아미노산의 비제한적 예로는 당화된 아미노산, 황화된 아미노산, 프레닐화된(예로서, 파르네실화된, 제<br />

라닐제라닐화된) 아미노산, 아세틸화된 아미노산, 아실화된 아미노산, 페길화된(PEG-ylated) 아미노산, 비오틴<br />

화된 아미노산, 카르복실화된 아미노산, 인산화된 아미노산 등 뿐만 아니라, 예로서, 지질 부분 또는 기타 유기<br />

유도체화제와의 접합체 의해 변형된 아미노산을 포함한다. 아미노산 변형에 대하여 당업자를 가이드하기에 적절<br />

한 참고문헌은 문헌을 통해 충분히 제공받을 수 있다. 실시예 프로토콜은 [Walker (<strong>19</strong>98) Protein Protocols<br />

on CD-ROM Human Press, Towata, NJ]에 나와 있다.<br />

융합 단백질<br />

본 발명은 또한 본 발명의 서열(예로서, 서열 번호 11-20, 27-32, 및 39-44로 예시되는 HA 및/또는 NA 폴리펩티<br />

드를 코딩하는 것) 또는 그의 단편과, 예로서, 면역글로불린(또는 그의 일부), 예로서, GFP(녹색 형광 단백질:<br />

green fluorescent protein)를 코딩하는 서열, 기타 유사 마커 등과의 융합물을 포함하는 융합 단백질을 제공한<br />

다. 상기 융합 단백질을 코딩하는 뉴클레오티드 서열이 본 발명의 또다른 측면이다. 본 발명의 융합 단백질은<br />

임의로, 예를 들면, 본 발명의 비융합 단백질과 유사한 적용(예로서, 본원에 기술된 바와 같은 치료학적, 예방<br />

학적, 진단학적, 실험상의 적용 등을 포함)을 위해 사용된다. 면역글로불린 서열 및 마커 서열과의 융합<br />

이외에, 본 발명의 단백질은 또한 임의로 예로서, 융합 단백질을 선별할 수 있도록 하고/거나 특이적이 세포 유<br />

형, 영역 등에 융합 단백질을 표적화할 수 있도록 하는 서열과 융합된다.<br />

항체<br />

본 발명의 폴리펩티드는 본원에서 제공된 폴리펩티드 및/또는 본 발명의 폴리뉴클레오티드에 의해 코딩된 폴리<br />

펩티드, 예로서, 본원에서 제시된 것, 및 그의 보존적 변이체에 특이적인 항체를 제조하는데 사용될 수 있다.<br />

상기 언급된 폴리펩티드에 대해 특이적인 항체는 예로서, 표적 폴리펩티드의 활성, 분포, 및 발현과 관련하여<br />

진단학적, 및 치료학적 목적으로 유용하다.<br />

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본 발명의 폴리펩티드에 대해 특이적인 항체는 당업계에 잘 알려져 있는 방법에 의해 생성될 수 있다. 그러한<br />

항체로는 폴리클로날, 모노클로날, 키메라, 인간화된, 단일 쇄, Fab 단편 및 Fab 발현 라이브러리에 의해 생산<br />

된 단편을 포함하나, 이에 한정되지 않는다.<br />

폴리펩티드는 항체 생산을 위한 생물학적 활성을 필요로 하지 않는다(예로서, 전길이의 기능성 헤마글루티닌 또<br />

는 뉴라미니다제는 필요없다). 그러나, 폴리펩티드 또는 올리고펩티드는 항원성이어야 한다. 특이적인 항체를<br />

유도하는데 사용되는 펩티드는 적어도 약 4개의 아미노산, 및 종종 적어도 5개 또는 10개의 아미노산으로 이루<br />

어진 아미노산 서열을 갖는다. 짧은 폴리펩티드 스트레치는 또다른 단백질, 예를 들면, 키홀 림펫 헤모시아닌,<br />

및 키메라 분자에 대해 생산된 항체와 함께 융합될 수 있다.<br />

폴리클로날 및 모노클로날 항체를 생산하는 여러 방법들이 당업자에게 알려져 있으며, 이는 본 발명의 폴리펩티<br />

드, 및/또는 본 발명의 폴리뉴클레오티드 서열에 의해 코딩된 폴리펩티드 등에 특이적인 항체를 생산하도록 적<br />

합화될 수 있다. 예로서, ([Coligan (<strong>19</strong>91) Current Protocols in Immunology Wiley/Greene, NY]; [Paul<br />

(ed.) (<strong>19</strong>98) Fundamental Immunology, Fourth Edition, Lippincott-Raven, Lippincott Williams & Wilkins];<br />

[Harlow and Lane (<strong>19</strong>89) Antibodies: A Laboratory Manual Cold Spring Harbor Press, NY]; [Stites et al.<br />

(eds.) Basic and Clinical Immunology (4th ed.) Lange Medical Publications, Los Altos, CA] 및 상기 문헌<br />

에서 인용된 참고문헌; [Goding (<strong>19</strong>86) Monoclonal Antibodies: Principles and Practice (2d ed.) Academic<br />

Press, New York, NY]; 및 [Kohler and Milstein (<strong>19</strong>75) Nature 256:495-497])를 참조한다. 항제를 제조하는<br />

다른 적합한 기법은 파지 또는 유사 벡터에서 재조합 항체 라이브러리를 선별하는 것을 포함한다. ([Huse et<br />

al. (<strong>19</strong>89) Science 246:<strong>12</strong>75-<strong>12</strong>81]; 및 [Ward, et al. (<strong>19</strong>89) Nature 341:544-546])를 참조한다. 특이적인 모<br />

노클로날 및 폴리클로날 항체 및 항혈청은 보통 예로서, 적어도 약 0.1 μM, 적어도 약 0.01 μM 이상, 및 전형<br />

적으로 및 적어도 약 0.001 μM 이상의 KD로 결합할 것이다.<br />

특정의 치료학적 적용에 있어서, 인간화된 항체가 바람직할 수 있다. 키메라 (인간화된) 항체를 제조하는 것에<br />

관한 상세한 방법은 미국 특허 5,482,856에서 찾아볼 수 있다. 인간화 및 기타 항체 생산 및 공학처리 기법에<br />

관한 추가 설명은 ([Borrebaeck (ed.) (<strong>19</strong>95) Antibody Engineering, 2 nd<br />

Edition Freeman and Company, NY<br />

(Borrebaeck)]; [McCafferty et al. (<strong>19</strong>96) Antibody Engineering, Practical Approach IRL at 0xford Press,<br />

0xford, England (McCafferty)], 및 [Paul (<strong>19</strong>95) Antibody Engineering Protocols Humana Press, Towata, NJ<br />

(Paul)])에서 찾아볼 수 있다. 구체적인 방법에 관한 추가 설명은 예로서, [Ostberg et al. (<strong>19</strong>83), Hybridoma<br />

2: 361-367], 미국 특허 번호 제4,634,664호(Ostberg) 및 미국 특허 번호 제4,634,666호(Engelman et al.)에서<br />

찾아볼 수 있다.<br />

면역반응성에 의한 폴리펩티드 정의<br />

본 발명의 폴리펩티드는 다양한 새로운 폴리펩티드 서열(예로서, HA 및 NA 분자 포함)을 제공하기 때문에 폴리<br />

펩티드는 또한 예로서, 면역학적 분석법에 의해 인지될 수 있는 새로운 구조적 특징을 제공한다. 본 발명의 폴<br />

리펩티드 뿐만 아니라, 항혈청이 결합하는 폴리펩티드에 특이적으로 결합하는 항혈청을 생성하는 것이 본 발명<br />

의 특징이 된다.<br />

예를 들어, 본 발명은 서열 본원에서 제공된 서열(예로서, 서열 번호 11-20, 27-32, 및 39-44) 등의 하나 이상<br />

으로부터 선택된 아미노산 서열을 포함하는 면역원에 대해 생성된 항체 또는 항혈청에 특이적으로 결합하거나,<br />

특이적으로 면역반응성인 폴리펩티드(예로서, HA 및 NA 분자)를 제공한다. 다른 상동체와의 교차 반응성을 제거<br />

하기 위해 파일링시 공개 데이터베이스에서 찾아볼 수 있는 HA 및/또는 NA 분자, 예로서, "대조군" 폴리펩티드<br />

(들)로 항체 또는 항혈청을 공제한다. 기타 대조군 서열이 핵산 서열에 상응하는 경우, 상기 핵산에 의해 코딩<br />

되는 폴리펩티드가 생산되고 항체/항혈청 공제 목적을 위해 사용된다.<br />

하나의 전형적인 형식으로 면역분석법은 본원의 서열(예로서, 서열 번호 11-20, 27-32, 및 39-44) 등 또는 그의<br />

실질적인 하위서열(즉, 제공된 전길이의 서열의 적어도 약 30%)에 상응하는 서열을 하나 이상 포함하는 하나 이<br />

상의 폴리펩티드에 대해 유발된 폴리클로날 항혈청을 사용한다. 본 서열로부터 유래된 잠재적 폴리펩티드 면역<br />

원의 세트는 이하 "면역원성 폴리펩티드"로 집합적으로 지칭된다. 생성된 항혈청은 임의로 대조군 헤마글루티닌<br />

및/또는 뉴라미니다제 동족체에 대한 낮은 교차 반응성을 가지도록 선택되고, 임의의 그러한 교차 반응성은 면<br />

역분석법에 폴리클로날 항혈청을 사용하기 이전에, 대조군 헤마글루티닌 및/또는 뉴라미니다제 동족체들 중 하<br />

나 이상을 사용하여, 예컨대, 면역흡착에 의해 제거된다.<br />

면역분석법에 사용하기 위한 항혈청을 생산하기 위해, 본원에 기술된 바와 같이 면역원성 폴리펩티드들 중 하나<br />

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이상을 생산하고 정제한다. 예를 들어, 재조합 단백질은 재조합 세포에서 생산된다. (마우스의 실제 유전적 동<br />

일성으로 인해 결과가 더욱 재현가능하기 때문에 본 분석법에 사용되는) 마우스의 교배 균주를, 표준 애주번트,<br />

예컨대, 프로인트 애주번트, 및 표준 마우스 면역화 프로토콜과 조합하여 면역원성 단백질(들)로 면역화한다(예<br />

로서, 특이적 면역반응성을 측정하기 위해 사용될 수 있는 항체 생산, 면역분석법 포맷 및 조건에 관한 표준 기<br />

재에 대해, [Harlow and Lane (<strong>19</strong>88) Antibodies, Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Publications, New<br />

York]을 참조한다). 항체에 대한 추가의 참고 및 논의가 또한 본원에 나와 있고, 이는 면역반응성에 의해 폴리<br />

펩티드를 한정하기 위해 여기에 적용될 수 있다. 별법으로, 본원에 개시된 서열로부터 유래된 하나 이상의 합성<br />

또는 재조합 폴리펩티드는 운반체 단백질에 접합되어, 면역원으로 사용된다.<br />

폴리클로날 혈청을 수집하여, 면역분석법, 예를 들어, 고체 지지체 상에 고정화된 면역원성 단백질 중 하나 이<br />

상을 이용한 고체상 면역분석에 대해 적정한다. 10 6<br />

이상의 역가를 갖는 폴리클로날 항혈청을 선택하고, 풀링하<br />

여, 대조군 헤마글루티닌 및/또는 뉴라미니다제 폴리펩티드(들)를 차감함으로써, 차감되고 풀링되며 적정된 폴<br />

리클로날 항혈청을 생산한다.<br />

차감되고 풀링되며 적정된 폴리클로날 항혈청을 비교 면역분석법에서 대조군 동족체에 대한 교차 반응성에 대해<br />

시험한다. 이러한 비교 분석법에서, 대조군 동족체에 대한 결합에 비해, 면역원성 폴리펩티드에 대한 적정된 폴<br />

리클로날 항혈청의 결합에 대해 적어도 약 5-10배 더 높은 신호 대 잡음비를 초래하는, 차감되고 적정된 폴리클<br />

로날 항혈청에 대한 차별적 결합 조건을 결정한다. 즉, 결합 반응의 엄격성은 알부민 또는 탈지분유와 같은 비<br />

특이적 경쟁자의 첨가, 및/또는 염 조건, 온도 등의 조정에 의해 조정될 수 있다. 이러한 결합 조건은, 시험 폴<br />

리펩티드(폴리펩티드는 면역원성 폴리펩티드 및/또는 대조군 폴리펩티드와 비교됨)가, 풀링되고 차감된 폴리클<br />

로날 항혈청에 의해 특이적으로 결합되는지의 여부를 결정하기 위한 후속 분석법에 사용된다. 특히, 차별적 결<br />

합 조건하에서 대조군 수용체 동족체보다 적어도 2-5x 더 높은 신호 대 잡음비를 나타내고, 면역원성 폴리펩티<br />

드(들)에 비해 적어도 약 ½의 신호 대 잡음비를 나타내는 시험 폴리펩티드는 공지된 수용체 등과 비교하여 면<br />

역원성 폴리펩티드와 실질적으로 구조상에 있어 유사성을 공유하며, 이로써 이는 본 발명의 폴리펩티드가 된다.<br />

또다른 일례로, 경쟁적 결합 포맷으로 면역분석법을 사용하여 시험 폴리펩티드를 검출한다. 예를 들어, 언급한<br />

바와 같이, 대조군 폴리펩티드를 이용한 면역흡착에 의해, 교차 반응 항체를 풀링된 항혈청 혼합물로부터 제거<br />

한다. 이어서, 면역원성 폴리펩티드(들)를, 차감되고 풀링된 항혈청에 노출된 고체 지지체에 고정화시킨다. 시<br />

험 단백질을 차감되고 풀링된 항혈청에 결합하기 위해 경쟁하도록 분석에 가한다. 고정화된 단백질(들) 대비,<br />

차감되고 풀링된 항혈청에 대해 경쟁하는 시험 단백질(들)의 능력을, 결합을 위해 경쟁하도록 분석에 첨가된 면<br />

역원성 폴리펩티드(들)(면역원성 폴리펩티드는 풀링된 항혈청에 결합하기 위해 고정화된 면역원성 폴리펩티드와<br />

효과적으로 경쟁함)의 능력과 비교한다. 표준 계산법을 이용하여, 시험 단백질에 대한 교차 반응도(%)를 계산한<br />

다.<br />

병행 분석법에서, 풀링되고 차감된 항혈청에 결합하기 위해 경쟁하는 대조군 단백질의 능력을, 임의적으로 항혈<br />

청에 결합하기 위해 경쟁하는 면역원성 폴리펩티드(들)의 능력과 비교하여 결정한다. 이에 다시, 표준 계산법을<br />

이용하여, 대조군 폴리펩티드(들)에 대한 교차 반응도(%)를 계산한다. 교차 반응도(%)가 대조군 폴리펩티드에<br />

비해 시험 폴리펩티드의 교차 반응도(%)의 적어도 5-10x인 경우, 및/또는 시험 폴리펩티드의 결합이 면역원성<br />

폴리펩티드의 결합 범위 내인 경우, 시험 폴리펩티드는 풀링되고 차감된 항혈청에 특이적으로 결합하는 것으로<br />

일컬어진다.<br />

일반적으로, 면역흡착되고 풀링된 항혈청을 본원에 기재된 경쟁적 결합 면역분석에 사용하여, 임의의 시험 폴리<br />

펩티드를 면역원성 및/또는 대조군 폴리펩티드(들)와 비교한다. 이러한 비교를 행하기 위해, 면역원성, 시험 폴<br />

리펩티드 및 대조군 폴리펩티드는 광범위한 농도 범위에서 각기 분석되고, 예컨대, 고정된된 대조군, 시험 또는<br />

면역원성 단백질에 대한 차감된 항혈청의 결합을 50% 억제시키는데 필요한 각 폴리펩티드의 양은 표준 기법을<br />

이용하여 결정된다. 경쟁 분석에서 결합을 위해 필요한 시험 폴리펩티드의 양이, 필요한 면역원성 폴리펩티드의<br />

양의 2배 미만인 경우, 시험 폴리펩티드는 면역원성 단백질에 대해 발생된 항체에 특이적으로 결합하는 것으로<br />

일컬어지는데, 단, 그 양은 대조군 폴리펩티드에서의 양의 약 5-10x로 높다.<br />

하나의 추가의 특이성 결정으로서, 풀링된 항혈청은, 면역흡착에 사용되는 면역원성 폴리펩티드(들)에 대한 생<br />

산된 면역원성 폴리펩티드 차감의 풀링된 항혈청의 결합이 검출가능하지 않거나 거의 검출가능하지 않을<br />

때까지, (대조군 폴리펩티드보다는) 면역원성 폴리펩티드(들)로 임의적으로 완전히 면역흡착된다. 이어서, 상기<br />

완전히 면역흡착된 항혈청을 시험 폴리펩티드와의 반응성에 대해 시험한다. 반응성이 관찰되지 않거나 거의 관<br />

찰되지 않을 경우(즉, 면역원성 폴리펩티드에 대한 완전히 면역흡착된 항혈청의 결합에 대해 관찰되는 신호 대<br />

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잡음비의 2x 이하인 경우), 시험 폴리펩티드는 면역원성 단백질에 의해 도출되는 항혈청에 의해 특이적으로 결<br />

합된다.<br />

핵산 및 폴리펩티드 서열 변이체<br />

본원에 기술되어 있는 바, 본 발명은 핵산 폴리뉴클레오티드 서열 및 폴리펩티드 아미노산 서열, 예로서, 헤마<br />

글루티닌 및 뉴라미니다제 서열, 및 예로서, 상기 서열을 포함하는 조성물 및 방법을 제공한다. 상기 서열의 예<br />

는 본원에 개시되어 있다(예로서, 서열 번호 1-45). 그러나, 당업자는 본 발명이 반드시 본원에 개시된 서열만<br />

으로 제한되는 것은 아니며, 본 발명은 또한 예로서, HA 및/또는 NA 분자를 코딩하는 것과 같이, 본원에 개시된<br />

기능을 갖는 다수의 관련 및 비관련 서열을 제공한다는 것을 이해할 것이다.<br />

당업자는 또한 개시된 서열의 변이체 다수가 본 발명에 포함된다는 것을 이해할 것이다. 예를 들어, 기능적으로<br />

동일한 서열을 제공하는 개시된 서열의 보존적 변이는 본 발명에 포함된다. 적어도 하나의 개시된 서열에 하이<br />

브리드화하는, 핵산 폴리뉴클레오티드 서열의 변이체는 본 발명에 포함되는 것으로 간주된다. 예로서, 표준 서<br />

열 비교 기법에 의해 측정된 바, 본원에 개시된 서열의 독특한 하위서열 또한 본 발명에 포함된다.<br />

침묵 변이<br />

유전 코드의 축퇴에 기인하여 본 발명의 폴리펩티드를 코딩하는 임의의 각종 핵산 서열 및/또는 본 발명의 바이<br />

러스가 임의로 생산되는데, 이중 일부는 본원의 HA 및 NA 핵산 및 폴리펩티드 서열과 낮은 수준의 서열 동일성<br />

을 가질 수 있다. 하기는 다수의 생물학 및 생화학 교재에서 찾아볼 수 있는, 유전 코드를 열거한 전형적인 코<br />

돈 표를 제공한다.<br />

표 1<br />

코돈표는 다수의 아미노산이 1개 초과의 코돈에 의해 코딩된다는 것을 보여준다. 예를 들어, 코돈 AGA,GG, CGA,<br />

CGC, CGG, 및 CGU 모두 아미노산 아르기닌을 코딩한다. 따라서, 코돈에 의해 아르기닌으로 명시되는 본 발명의<br />

핵산 중 모든 위치의 코돈은 코딩되는 폴리펩티드는 바꾸지 않으면서 상기 기술된 상응하는 코돈들 중 어느 것<br />

으로 변경될 수 있다. RNA 서열에서 U는 DNA 서열에서 T에 상응하는 것으로 이해된다 .<br />

상기 "침묵 변이"는 하기 논의되는 "보존적으로 변형된 변이" 중 한가지 종류에 속한다. 당업자는 핵산 중 각<br />

코돈(단, 통상 메티오닌에 대해 유일한 코돈인 ATG, 및 통상 트립토판에 대해 유일한 코돈인 TTG는 제외)은 표<br />

준 기법에 의해 기능적으로 동일한 폴리펩티드를 코딩하도록 변형될 수 있다는 것을 이해할 것이다. 따라서, 폴<br />

리펩티드를 코딩하는 핵산의 각각의 침묵 변이는 임의의 기술되 서열에 내재되어 있다. 그러므로, 본 발명은 가<br />

능한 코돈 선택에 기초한 조합을 선택함으로써 이루어질 수 있는 본 발명의 폴리펩티드를 코딩하는 핵산 서열<br />

각각의 모든 가능한 변이를 명백히 제공한다. 이러한 조합은 본 발명의 헤마글루티닌 또는 뉴라미니다제 폴리펩<br />

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티드를 코딩하는 핵산 서열에 적용되는 것과 같이 표준 트리플렛 유전 코드(예로서, 표 1에 기재되어 있는 것,<br />

또는 당업계에서 통상 이용되는 것)에 따라 이루어진다. 본원의 모든 핵산의 상기와 같은 모든 변이를 구체적으<br />

로 제공하며, 유전 코드와 함께 서열을 참작하여 기술된다. 당업자는 전체적으로 본원에 기술된 방법을 사용하<br />

여 이들 침묵 치환을 이룰 수 있다.<br />

보존적 변이<br />

유전 코드의 축퇴에 기인하여 "침묵 치환"(즉, 코딩된 폴리펩티드를 바꾸지 않는 핵산 서열내 치환)이 아미노산<br />

을 코딩하는 본 발명의 모든 핵산 서열의 내포된 특징이 된다. 유사하게, 아미노산 서열에 있어서 하나 또는 수<br />

개의 아미노산의 "보존적 아미노산 치환"은 성질이 고도로 유사한 다른 아미노산으로 치환된 것이며, 이는 또한<br />

개시된 작제물, 예를 들면, 본원의 것과 고도로 유사한 것으로서 용이하게 동정되어 진다. 각각의 개시된 서열<br />

의 상기와 같은 보존적 변이가 본 발명의 특징이 된다.<br />

특정 핵산 서열의 "보존적 변이"란 동일하거나 본질적으로 동일한 아미노산을 코딩하는 핵산을 지칭하거나, 핵<br />

산이 아미노산 서열을 코딩하지 않을 경우, 본질적으로 동일한 서열을 지칭하는 것이며, 하기 표 2를 참조한다.<br />

코딩 서열에 있어서 단일의 아미노산 또는 작은 비율의 아미노산 (전형적으로 5% 미만, 더욱 전형적으로 4%,<br />

3%, 2%, 또는 1% 미만)을 변경, 부가 또는 결실시키는 개개의 치환, 결실 또는 부가는 변경을 통해 아미노산을<br />

결실시키거나, 아미노산을 부가하거나, 아미노산을 화학적으로 유사한 아미노산으로 치환시키는 "보존적으로 변<br />

형된 변이"라는 것을 당업자는 이해할 것이다. 따라서, 본 발명의 열거된 폴리펩티드 서열의 "보존적 변이"는<br />

작은 비율의, 전형적으로 5% 미만, 더욱 전형적으로 4%, 3%, 2%, 또는 1% 미만의, 폴리펩티드 서열의 아미노산<br />

이 동일한 보존적 치환기를 갖는 보존적으로 선택된 아미노산으로 치환된 것을 포함한다. 마지막으로, 핵산 분<br />

자의 코딩된 활성을 변경시키지 않는 서열 첨가, 예를 들면, 비기능성 서열의 첨가가 기본 핵산의 보존적 변이<br />

이다.<br />

표 2<br />

보존적 치환군<br />

1 알라닌(A) 세린(S) 트레오닌(T)<br />

2 아스파르트산(D) 글루탐산(E)<br />

3 아스파라긴(N) 글루타민(Q)<br />

4 아르기닌(R) 리신(K)<br />

5 이소류신(I) 류신(L) 메티오닌(M) 발린(V)<br />

6 페닐알라닌(F) 티로신(Y) 트립토판(W)<br />

독특한 폴리펩티드 및 폴리뉴클레오티드 하위서열<br />

하나의 측면에서, 본 발명은 본원에 개시된 HA 및 NA 분자의 서열, 예로서, 서열 번호 1-10, 21-26, 33-38, 및<br />

45로부터 선택되는 핵산 중 독특한 하위서열을 포함하는 핵산을 제공한다. 독특한 하위서열은 파일링시 진뱅크<br />

또는 기타 유사 공용 데이타베이스에서 발견되는 것과 같은 핵산에 상응하는 핵산과 비교할 때 독특한 것이다.<br />

예로서, 디폴트 매개 변수에 대한 BLAST 세트를 사용하여 정렬시킬 수 있다. 임의의 독특한 하위서열은 예를 들<br />

면, 본 발명의 핵산을 동정하기 위한 프로브로서 유용하다. 상기를 참조한다.<br />

유사하게, 본 발명은 본원에 개시된 HA 및 NA 분자의 서열, 예로서, 서열 번호 11-20, 27-32, 및 39-44로부터<br />

선택되는 폴리펩티드 중 독특한 하위서열을 포함하는 폴리펩티드를 제공한다. 여기서, 독특한 하위서열은 파일<br />

링시 진뱅크 또는 기타 유사 공용 데이타베이스에서 발견되는 폴리뉴클레오티드 서열에 상응하는 아미노산과 같<br />

은 것에 상응하는 폴리펩티드와 비교할 때 독특한 것이다.<br />

본 발명은 또한 엄격한 조건하에서 본 발명의 HA 및 NA 분자의 서열로부터 선택되는 폴리펩티드 중 독특한 하위<br />

서열을 코딩하는 독특한 코딩 올리고뉴클레오티드에 하이브리드화하는 표적 핵산을 제공하는데, 여기서, 독특한<br />

하위서열은 대조군 폴리펩티드(예로서, 파일링시 진뱅크 또는 기타 유사 공용 데이타베이스에서 발견되는 것에<br />

상응하는 핵산과 같은 서열)중 임의의것에 상응하는 폴리펩티드와 비교하여 독특한 것이다. 독특한 서열은 상기<br />

언급한 바와 같이 결정된다.<br />

서열 비교, 동일성, 및 상동성<br />

2개 이상의 핵산 또는 폴리펩티드 서열과 관련하여 사용될 때 "동일성(%)" 또는 "~%가 동일"이라는 용어는 최대<br />

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로 일치하도록 비교 및 정렬된 경우, 하기 기술하는 서열 비교 알고리즘(또는 당업자가 사용 가능한 기타 알고<br />

리즘)들 중 하나를 사용하여 측정하거나, 시각적 관찰에 의하여 측정하였을 때, 동일한 2개 이상의 서열 또는<br />

하위서열, 또는 동일한 아미노산 잔기 또는 뉴클레오티드를 특정 비율로 갖는 2개 이상의 서열 또는 하위서열을<br />

지칭한다.<br />

2개의 핵산 또는 폴리펩티드(예로서, HA 또는 NA 분자를 코딩하는 DNAs, 또는 HA 또는 NA 분자의 아미노산<br />

서열)와 관련하여 "실질적으로 동일하다"라는 표현은 최대로 일치하도록 비교 및 정렬된 경우, 서열 비교 알고<br />

리즘을 사용하여 측정하거나, 시각적 관찰에 의하여 측정하였을 때, 적어도 약 90%, 바람직하게 91%, 가장 바람<br />

직하게 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 98.5%, 99%, 99.1%, 99.2%, 99.3%, 99.4%, 99.5%, 99.6%, 99.7%,<br />

99.8%, 99.9% 이상의 뉴클레오티드 또는 아미노산 잔기 동일성을 갖는 2개 이상의 서열 또는 하위서열을 지칭한<br />

다. 상기와 같이 "실질적으로 동일한" 서열은 전형적으로 실제 그 유래와는 상관없이 "상동성"인 것으로 간주된<br />

다. 바람직하게, "실질적인 동일성"은 길이가 적어도 약 200 잔기인, 적어도 약 250 잔기인, 적어도 약 300 잔<br />

기, 350 잔기, 400 잔기, 425 잔기, 450 잔기, 475 잔기, 480 잔기, 490 잔기, 495 잔기, 499 잔기, 500 잔기,<br />

502 잔기, 559 잔기, 565 잔기, 또는 566 잔기인 아미노산 서열 영역, 또는 비교되는 두 서열 전체 길이에 걸쳐<br />

존재한다.<br />

서열 비교 및 상동성 측정에 있어서, 전형적으로 하나의 서열은 시험 서열이 비교되는 참고 서열로서의 기능을<br />

한다. 서열 비교 알고리즘을 사용할 때, 시험 및 참고 서열은 컴퓨터에 입력되며, 하위서열 좌표는 필요할 경우<br />

지정되고, 서열 알고리즘 프로그램의 매개 변수는 지정된다. 이어서, 서열 비교 알고리즘은 참고 서열에 대한<br />

시험 서열(들)의 서열 동일성(%)을 프로그램 매개 변수에 입각하여 계산한다.<br />

비교를 위한 서열의 최적 정렬은 예를 들어, 국소 상동성 알고리즘[Smith & Waterman, Adv Appl Math 2:482<br />

(<strong>19</strong>81)], 상동성 정렬 알고리즘[Needleman & Wunsch, J Mol Biol 48:443 (<strong>19</strong>70)], 유사성 검색 방법[Pearson &<br />

Lipman, Proc Natl Acad Sci USA 85:2444 (<strong>19</strong>88)], 알고리즘, 예를 들면, GAP, BESTFIT, FASTA, 및<br />

TFASTA(Wisconsin Genetics Software Package, Genetics Computer Group, 575 Science Dr., Madison, WI)의<br />

컴퓨터에 의한 실행, 또는 시각에 의한 관찰(예를 들어, 일반적으로 [Ausubel et al, 상기 분헌])에 의해 수행<br />

될 수 있다.<br />

서열 동일성(%)과 서열 유사성(%)을 측정하는데에 적합한 알고리즘의 일례로서는 BLAST 알고리즘이 있으며, 이<br />

알고리즘에 관하여는 [Altschul et al., J Mol Biol 215:403-410 (<strong>19</strong>90)]에 기재되어 있다. BLAST 분석법을 수<br />

행하기 위한 소프트웨어는 국립 생명 공학 정보 센터(National Center for Biotechnology 정<br />

보)(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/)을 통해 공개적으로 이용가능하다. 상기 BLAST 알고리즘에는 첫번째로 의문<br />

서열 중의 길이 W의 짧은 단어를 확인하여 높은 점수 서열 쌍(HSP: high scoring sequence pair)을 확인하는<br />

것이 포함되며, 이것은 데이터베이스 서열에서 동일한 길이의 단어를 갖도록 정렬되는 경우 일부 양성-값 역치<br />

점수 T를 매치 또는 만족시킨다. T는 이웃 단어 점수 역치로서 언급된다[Altschul et al., 상기 문헌]. 상기 초<br />

기 이웃 단어 적중은 이를 함유하는 더 긴 HSP를 찾기 위해 검색을 시작하기 위한 근원으로서 작용한다.<br />

이어서, 단어 적중은 누적 정렬 점수가 증가될 수 있는 한, 각 서열에 따라 양 방향으로 확장된다. 누적 점수는<br />

뉴클레오티드 서열에 대해, 매개변수 M(매치 잔기의 쌍에 대한 보상 점수; 항상 > 0) 및 N(미스매치 잔기에 대<br />

한 패널티 점수; 항상 < 0)을 사용하여 계산한다. 아미노산 서열에 대해, 점수 매트릭스는 누적 점수를 계산하<br />

기 위해 사용된다. 각 방향으로의 단어 적중의 확장은, 누적 정렬 점수가 최대 달성 값으로부터의 수량 X에 의<br />

해 떨어지고; 하나 이상의 음성-점수 잔기 정렬의 축적으로 인해 누적 점수가 0 또는 미만이 되거나; 어느 한쪽<br />

의 서열의 말단이 도달한 경우 중단된다. BLAST 알고리즘 파라미터 W, T, 및 X는 정렬의 민감성 및 속도를 측정<br />

한다. BLASTN 프로그램(뉴클레오티드 서열에 대해)은 디폴트로서 단어 길이(W) 11, 기대값(E) 10, 컷오프 100,<br />

M=5, N=-4 및 두 가닥의 비교를 사용한다. 아미노산 서열에 대해, BLASTP 프로그램은 디폴트로서 단어 길이(W)<br />

3, 및 기대값(E) 10 을 사용하고, BLOSUM62 점수 매트릭스([Henikoff & Henikoff (<strong>19</strong>89) Proc Natl Acad Sci<br />

USA 89:10915] 참조)를 사용한다.<br />

서열 동일성(%)을 계산하는 것 이외에도, BLAST 알고리즘은 또한 2개의 서열 사이의 유사성을 통계학적으로 분<br />

석하기도 한다(예를 들어, [Karlin & Altschul. Proc Natl Acad Sci USA 90:5873-5787 (<strong>19</strong>93)] 참조). BLAST<br />

알고리즘에 의해 제공되는 유사성에 관한 한가지 척도는, 2개의 뉴클레오티드 또는 아미노산 서열이 우연히 매<br />

치될 확률에 대한 지표를 제공하는 최소 총 확률(P(N))이다. 예를 들어, 시험 핵산과 참고 핵산 비교시 최소 총<br />

확률이 약 0.1 미만, 더욱 바람직하게 약 0.01 미만 및 가장 바람직하게 약 0.001 미만이면, 이 핵산은 참고 서<br />

열과 유사한 것으로 간주된다.<br />

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유용한 서열 정렬 알고리즘의 또다른 예는 PILEUP 이다. PILEUP는 진행적, 쌍 방식(pairwise) 정렬을 사용하여<br />

관련 서열의 군으로부터 복합 서열 정렬을 만든다. 이것은 또한 정렬을 만들기 위해 사용되는 클러스터링 관계<br />

를 보여주는 트리(tree)를 플롯화할 수 있다. PILEUP는 [Feng & Doolittle (<strong>19</strong>87) J. Mol Evol. 35:351-360]의<br />

진행적 정렬 방법의 간소화를 사용한다. 사용되는 방법은 [Higgins & Sharp (<strong>19</strong>89) CABIOS5:51-153]에 의해 기<br />

재된 방법과 유사하다. 프로그램은 5,000개의 최대 길이로 300개까지의 서열을 정렬시킬 수 있다. 복합 정렬 절<br />

차는 2개의 가장 유사한 서열의 쌍 방식 정렬로 시작하여, 2개의 정렬된 서열의 클러스터를 생성한다. 이어서,<br />

상기 클러스터를 다음을 가장 관련된 서열 또는 정렬된 서열의 클러스터에 정렬시킬 수 있다. 서열의 2개의 클<br />

러스터를 2개의 개별 서열의 쌍 방식 정렬의 단순 확장에 의해 정렬시킨다. 최종 정렬은 일련의 진행적, 쌍 방<br />

식 정렬에 의해 달성된다. 프로그램을 사용하여 또한 클러스터링 관계를 보여주는 수지상도 또는 수형도를 플롯<br />

화할 수 있다. 프로그램은 서열 비교의 영역에 대등한 특정 서열 및 그의 아미노산 또는 뉴클레오티드를 지정함<br />

으로써 실행된다.<br />

복합 DNA 및 아미노산 서열 정렬에 적합한 알고리즘에 관한 추가의 예는 CLUSTALW 프로그램이다[Thompson, J.<br />

D. et al. (<strong>19</strong>94) Nucl. Acids. Res. 22: 4673-4680]. CLUSTALW는 서열 군 간의 복합 쌍 방식 비교를<br />

수행하고, 이들을 상동성에 기초하여 복합 정렬로 조립한다. 갭 오픈 및 갭 확장 패널티는 각각 10 및 0.05일<br />

수 있다. 아미노산 정렬을 위해, BLOSUM 알고리즘을 단백질 중량 매트릭스로서 사용할 수 있다. 예로서,<br />

[Henikoff and Henikoff (<strong>19</strong>92) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 89: 10915-109<strong>19</strong>]를 참조한다.<br />

디지털 시스템<br />

본 발명은 예로서, 본원에 제시된 서열, 및 그의 다양한 침묵 치환 및 보존적 치환을 비롯한, 본원의 핵산 및<br />

단리된 또는 재조합 폴리펩티드에 대한 본원의 서열 정보에 상응하는 문자열을 포함하는 디지털 시스템,<br />

예로서, 컴퓨터, 컴퓨터 판독 매체 및 통합 시스템을 제공한다. 통합 시스템은 추가로 문자열에 상응하는 유전<br />

자를 만들기 위한 유전자 합성 장치와 같은 것을 포함할 수 있다.<br />

당업계에 공지되어 있는 다양한 방법들을 사용하여 상이한 문자열 사이의 상동성 또는 유사성을 검출할 수 있거<br />

나(상기 참조), 상기를 사용하여 예를 들면, 출력 파일을 제어하는 것과 같이, 서열 등을 포함하는 정보를 제시<br />

하는 원리를 제공하는 기타 바람직한 기능을 실행할 수 있다. 예로는 상기 논의된 바 있는 BLAST를 포함한다.<br />

본 발명의 컴퓨터 시스템은 예로서, 본원에서 언급된 것과 같은 서열을 포함하는 하나 이상의 데이타 파일 또는<br />

데이타 베이스와 함께, 상기와 같은 프로그램을 포함할 수 있다.<br />

따라서, 다양한 HA 또는 NA 서열 또는 단편 등간의 다양한 엄격성과 길이에서의 다양한 유형의 상동성 및 유사<br />

성이 검출될 수 있으며, 본원의 통합 시스템에서 인지할 수 있다. 예를 들어, 생체중합체 서열의 비교 분석을<br />

위해, 워드 프로세싱에서의 스펠 체크를 위해, 및 다양한 데이타베이스로부터의 데이타 검색을 위해 많은 상동<br />

성 측정 방법이 디자인되었다. 천연 폴리뉴클레오티드에서 4개의 주 뉴클레오염기간의 이중 나선 쌍방식의 상보<br />

적 상호작용을 이해하면서, 상보적인 상동성 폴리뉴클레오티드 열의 어닐링을 모의하는 모델 또한 전형적으로<br />

본원의 서열에 상응하는 문자열에서 실시되는 서열 정렬 또는 기타 실행에 대한 기초로서 사용될 수 있다(예로<br />

서, 워드 프로세싱 조작, 서열 또는 하위서열 문자열을 포함하는 도면 제작, 출력 표 등).<br />

따라서, 표준 데스트탑 응용법, 예를 들면, 워드 프로세싱(예로서, 마이크로소프트 워드 또는 코렐 워드 퍼펙<br />

트) 및 데이타베이스 소프트웨어(예로서, 스프레드시트 소프트웨어, 예를 들면, 마이크로소프트 Excel, 코<br />

렐 콰트로 프로, 또는 데이타베이스 프로그램, 예를 들면, 마이크로소프트 액세스, 패러독스, 유전자 워<br />

크스, 또는 마크로벡터 또는 기타 유사 프로그램)은 본 발명의 하나 이상의 폴리뉴클레오티드 및 폴리펩티<br />

드(핵산 또는 단백질, 또는 그 둘 모두)에 상응하는 문자열을 입력함으로써 본 발명에 적합화될 수 있다. 예를<br />

들어, 본 발명의 시스템은 본원 서열에 상응하는 문자열을 조작하기 위해 사용자 인터페이스(예로서, 표준 작동<br />

시스템에서 GUI, 예를 들면, 윈도우스, 매킨토시, 또는 리눅스 시스템)과 함께 사용되는 것과 같은, 적절한 문<br />

자열 정보를 갖는 상기의 소프트웨어를 포함할 수 있다. 언급한 바와 같이, 전문 정렬 프로그램, 예를 들면,<br />

BLAST 또한 핵산 또는 단백질(상응하는 문자열)의 정렬을 위해 본 발명의 시스템내로 혼입될 수 있다.<br />

본 발명에서 시스템은 전형적으로 본원 서열 중 어느 것을 포함하는 소프트웨어 시스템으로 입력되는 데이타 세<br />

트를 갖는 디지털 컴퓨터를 포함한다. 컴퓨터는 예로서, PC(인텔 x86 또는 펜티움 칩-호환 DOS, OS2 윈도스<br />

윈도우스NT, 윈도우스95, 윈도우스2000, 윈도우스98, 리눅스 기반 기계, 매킨토시, 파워 PC, 또는<br />

유닉스 기반(예로서, SUN 워크 스테이션) 기계) 또는 당업자에게 알려져 있는 다른 상업적으로 이용가능한 컴<br />

퓨터일 수 있다. 서열을 정렬하거나, 그외 조작하기 위한 소프트웨어가 이용가능하며, 예를 들면,<br />

비주얼베이직, PERL, 포트란, 베이직, 자바 등과 같은 표준 프로그래밍 언어를 사용함으로써 당업자에 의해 쉽<br />

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게 제작될 수 있다.<br />

임의의 제어 장치 또는 컴퓨터는 임의로 대개 음극선관("CRT: cathode ray tube") 디스플레이, 평판 디스플레이<br />

(예로서, 능동 매트릭스형 액정 표시 장치, 액정 표시 장치) 등인 모니터를 포함한다. 컴퓨터 회로는 대개 다수<br />

의 집적 회로 칩, 예를 들면, 마이크로프로세서, 메모리, 인터페이스 회로 등을 포함하는 박스내 위치한다. 박<br />

스는 또한 임의로 하드 디스크 장치, 플로피 디스크 장치, 고용량 이동식 드라이브 예를 들면, 기록가능 CD-<br />

ROM, 및 기타의 일반적인 주변 소자를 포함한다. 입력 장치, 예를 들면, 키보드 또는 마우스는 임의로 관련 컴<br />

퓨터 시스템에서 비교되거나, 그밖에 조작되는 서열을 사용자가 입력하고, 사용자가 선택할 수 있도록<br />

제공된다.<br />

컴퓨터는 전형적으로 예를 들면, GUI와 같이, 세트 파라미터 영역으로의 사용자 입력 형태로, 또는 사전에 프로<br />

그래밍된 명령 형태로, 예를 들면, 각종의 상이한 특정 연산에 대해 사전에 프로그래밍되는 것과 같은 형태로<br />

사용자 명령을 받아들이는 적절한 소프트웨어를 포함한다. 이어서, 소프트웨어는 이들 명령을 원하는 연산을 수<br />

행할 수 있도록 예로서, 적절한 메카니즘 또는 전송 제어 장치의 연산을 명령하기 위한 적절한 언어로 전환시킨<br />

다. 소프트웨어는 또한 핵산 합성(예로서, 본원의 서열 또는 서열 정렬에 기초한 핵산 합성), 차별적인 유전자<br />

발현에 대한 샘플 비교, 또는 기타 연산을 제어하는 출력 소자를 포함할 수 있다.<br />

키트 및 시약<br />

본 발명은 임의로 키트로서 사용자에게 제공된다. 예를 들어, 본 발명의 키트는 본원에 기술된(예로서, 본 발명<br />

의 HA 및/또는 NA 분자를 포함하거나 갖는) 하나 이상의 핵산, 폴리펩티드, 항체, 또는 세포주를 포함한다. 키<br />

트는 진단용 핵산 또는 폴리펩티드, 예로서, 항체, 프로브 세트, 예로서, 적합한 용기내 패킹된 cDNA 마이크로<br />

어레이, 또는 기타 핵산, 예를 들면, 하나 이상의 발현 벡터를 포함할 수 있다. 키트는 또한 발현 생성물을 표<br />

지하기 위한 하나 이상의 추가 시약, 예로서, 기질, 표지, 프라이머, 튜브 및/또는 기타 부속물, 샘플 수집을<br />

위한 시약, 완충액, 하이브리드화 챔버, 커버 슬립 등을 추가로 포함한다. 키트는 임의로 진단용 세트 등의 발<br />

견 또는 적용을 위한 키트 성분의 바람직한 사용 방법을 설명하는 설명서 세트 또는 사용자 매뉴얼을 추가로 포<br />

함한다.<br />

설명서에 따라 사용할 때, 키트는 예로서 질환 상태 또는 증상을 평가하기 위해, 약제학적 제제 또는 기타 치료<br />

중재가 세포 또는 유기체의 질환 상태 또는 증상의 진행에 미치는 효과를 평가하기 위해, 또는 백신으로서의 사<br />

용을 위해 또는 기타의 것을 위해 키트가 사용될 수 있다.<br />

추가의 측면에서, 본 발명은 본원의 방법, 조성물, 시스템 및 장치를 구현하는 시스템 키트를 제공한다. 본 발<br />

명의 시스템 키트은 임의로 하기의 (1) 장치, 시스템, 시스템 성분 또는 장치 성분; (2) 본원에 기술된 방법 실<br />

시 설명서 및/또는 본원의 장치 또는 장치 성분 작동 설명서 및/또는 본원의 조성물 사용 설명서 중 하나 이상<br />

을 포함한다. 추가의 측면에서, 본 발명은 본원의 임의의 장치, 장치 성분, 조성물 또는 키트의 용도, 본원의<br />

임의의 방법 또는 분석법의 실시, 및/또는 본원의 임의의 분석법 또는 방법을 실시하기 위한 임의의 장치 또는<br />

키트의 용도를 제공한다.<br />

추가로, 키트는 적절한 포장재, 키트 성분을 담고 있는 용기, 본원의 방법 실시 설명서 등을 함께 상기 언급한<br />

하나 이상의 번역 시스템(예로서, 세포)을 포함할 수 있다. 유사하게, 번역 시스템의 생성물(예로서, 단백질 예<br />

를 들면, HA 및/또는 NA 분자)은 예로서, 키트 성분을 담고 있는 용기, 본원의 방법 실시 설명서 등과 함께 키<br />

트 형태로 제공될 수 있다.<br />

본 발명의 방법 및 조성물의 사용을 촉진시키기 위하여 임의의 백신 성분 및/또는 조성물, 예로서, 요막액 중<br />

재배열된 바이러스 등, 및 실험 목적용 또는 치료학적 백신 목적용의 인플루엔자 바이러스의 패킹 및 감염에 유<br />

용한, 예를 들면, 완충액, 세포, 배양 배지와 같은 추가 성분이 키트 형태로 패킹될 수 있다. 전형적으로, 키트<br />

는 상기 성분들 이외에도 예로서, 본 발명의 방법 실시 설명서, 포장재 및 용기를 포함할 수 있는 추가의 물질<br />

을 포함한다.<br />

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도면<br />

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도면2<br />

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도면4<br />

- 73 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


도면5<br />

- 74 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


도면6<br />

도면7<br />

- 75 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


도면8<br />

도면9<br />

- 76 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


도면10<br />

도면11<br />

- 77 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


도면<strong>12</strong><br />

- 78 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


도면13<br />

도면14<br />

- 79 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


도면15<br />

도면16<br />

- 80 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


도면17<br />

- 81 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


도면18<br />

- 82 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


도면<strong>19</strong><br />

- 83 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


도면20<br />

도면21a<br />

- 84 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


도면21b<br />

도면21c<br />

도면21d<br />

- 85 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


도면21e<br />

도면21f<br />

도면21g<br />

- 86 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


도면21h<br />

도면21i<br />

- 87 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


도면22a<br />

- 88 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


도면22b<br />

- 89 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


도면23<br />

- 90 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


도면24<br />

- 91 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


도면25<br />

도면26<br />

- 92 -<br />

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도면27<br />

도면28<br />

서 열 목 록<br />

- 93 -<br />

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SEQUENCE LISTING<br />

MedImmune, Vaccines Inc.<br />

MedImmune, Vaccines Inc./ National Institutes of Health<br />

Yang, Chin-Fen<br />

Kemble, George<br />

Subbarao, Kanta<br />

Murphy, Brian<br />

INFLUENZA HEMAGGLUTININ AND NEURAMINIDASE VARIANTS<br />

FL260PCT<br />

60/942,804<br />

2007-06-08<br />

60/821,832<br />

2006-08-09<br />

45<br />

PatentIn version 3.3<br />

1<br />

1767<br />

DNA<br />

Influenza A virus<br />

1<br />

agcaaaagca ggggttcaat ctgtcaaaat ggagaaaata gtgcttcttt ttgcaatagt 60<br />

cagtcttgtt aaaagtgatc agatttgcat tggttaccat gcaaacaact cgacagagca <strong>12</strong>0<br />

ggttgacaca ataatggaaa agaacgttac tgttacacat gcccaagaca tactggaaaa 180<br />

gaaacacaac gggaagctct gcgatctaga tggagtgaag cctctaattt tgagagattg 240<br />

tagcgtagct ggatggctcc tcggaaaccc aatgtgtgac gaattcatca atgtgccgga 300<br />

atggtcttac atagtggaga aggccaatcc agtcaatgac ctctgttacc caggggattt 360<br />

caatgactat gaagaattga aacacctatt gagcagaata aaccattttg agaaaattca 420<br />

- 94 -<br />

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gatcatcccc aaaagttctt ggtccagtca tgaagcctca ttaggggtga gctcagcatg 480<br />

tccataccag ggaaagtcct cctttttcag aaatgtggta tggcttatca aaaagaacag 540<br />

tacataccca acaataaaga ggagctacaa taataccaac caagaagatc ttttggtact 600<br />

gtgggggatt caccatccta atgatgcggc agagcagaca aagctctatc aaaacccaac 660<br />

cacctatatt tccgttggga catcaacact aaaccagaga ttggtaccaa gaatagctac 720<br />

tagatccaaa gtaaacgggc aaagtggaag gatggagttc ttctggacaa ttttaaagcc 780<br />

gaatgatgca atcaacttcg agagtaatgg aaatttcatt gctccagaat atgcatacaa 840<br />

aattgtcaag aaaggggact caacaattat gaaaagtgaa ttggaatatg gtaactgcaa 900<br />

caccaagtgt caaactccaa tgggggcgat aaactctagc atgccattcc acaatataca 960<br />

ccctctcacc attggggaat gccccaaata tgtgaaatca aacagattag tccttgcgac 1020<br />

tgggctcaga aatagccctc aaagagagac tcgaggatta tttggagcta tagcaggttt 1080<br />

tatagaggga ggatggcagg gaatggtaga tggttggtat gggtaccacc atagcaatga 1140<br />

gcaggggagt gggtacgctg cagacaaaga atccactcaa aaggcaatag atggagtcac <strong>12</strong>00<br />

caataaggtc aactcgatca ttgacaaaat gaacactcag tttgaggccg ttggaaggga <strong>12</strong>60<br />

atttaacaac ttagaaagga gaatagagaa tttaaacaag aagatggaag acgggttcct 1320<br />

agatgtctgg acttataatg ctgaacttct ggttctcatg gaaaatgaga gaactctaga 1380<br />

ctttcatgac tcaaatgtca agaaccttta cgacaaggtc cgactacagc ttagggataa 1440<br />

tgcaaaggag ctgggtaacg gttgtttcga gttctatcat aaatgtgata atgaatgtat 1500<br />

ggaaagtgta agaaatggaa cgtatgacta cccgcagtat tcagaagaag cgagactaaa 1560<br />

aagagaggaa ataagtggag taaaattgga atcaatagga atttaccaaa tactgtcaat 1620<br />

- 95 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


ttattctaca gtggcgagtt ccctagcact ggcaatcatg gtagctggtc tatccttatg 1680<br />

gatgtgctcc aatgggtcgt tacaatgcag aatttgcatt taaatttgtg agttcagatt 1740<br />

gtagttaaaa acacccttgt ttctact 1767<br />

2<br />

1398<br />

DNA<br />

Influenza A virus<br />

2<br />

agcaaaagca ggagttcaaa atgaatccaa atcagaagat aataaccatc gggtcaatct 60<br />

gtatggtaac tggaatagtt agcttaatgt tacaaattgg gaacatgatc tcaatatggg <strong>12</strong>0<br />

tcagtcattc aattcacaca gggaatcaac accaatctga accaatcagc aatactaatt 180<br />

ttcttactga gaaagctgtg gcttcagtaa aattagcggg caattcatct ctttgcccca 240<br />

ttaacggatg ggctgtatac agtaaggaca acagtataag gatcggttcc aagggggatg 300<br />

tgtttgttat aagagagccg ttcatctcat gctcccactt ggaatgcaga actttctttt 360<br />

tgactcaggg agccttgctg aatgacaagc actccaatgg gactgtcaaa gacagaagcc 420<br />

ctcacagaac attaatgagt tgtcctgtgg gtgaggctcc ctccccatat aactcaaggt 480<br />

ttgagtctgt tgcttggtca gcaagtgctt gccatgatgg caccagttgg ttgacgattg 540<br />

gaatttctgg cccagacaat ggggctgtgg ctgtattgaa atacaatggc ataataacag 600<br />

acactatcaa gagttggagg aacaacatac tgagaactca agagtctgaa tgtgcatgtg 660<br />

taaatggctc ttgctttact gtaatgactg acggaccaag taatggtcag gcatcacata 720<br />

agatcttcaa aatggaaaaa gggaaagtgg ttaaatcagt cgaattggat gctcctaatt 780<br />

- 96 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


atcactatga ggaatgctcc tgttatccta atgccggaga aatcacatgt gtgtgcaggg 840<br />

ataattggca tggctcaaat cggccatggg tatctttcaa tcaaaatttg gagtatcaaa 900<br />

taggatatat atgcagtgga gttttcggag acaatccacg ccccaatgat ggaacaggta 960<br />

gttgtggtcc ggtgtcctct aacggggcat atggggtaaa agggttttca tttaaatacg 1020<br />

gcaatggtgt ctggatcggg agaaccaaaa gcactaattc caggagcggc tttgaaatga 1080<br />

tttgggatcc aaatgggtgg actgaaacgg acagtagctt ttcagtgaaa caagatatcg 1140<br />

tagcaataac tgattggtca ggatatagcg ggagttttgt ccagcatcca gaactgacag <strong>12</strong>00<br />

gactagattg cataagacct tgtttctggg ttgagttgat cagagggcgg cccaaagaga <strong>12</strong>60<br />

gcacaatttg gactagtggg agcagcatat ctttttgtgg tgtaaatagt gacactgtgg 1320<br />

gttggtcttg gccagacggt gctgagttgc cattcaccat tgacaagtag tttgttcaaa 1380<br />

aaactccttg tttctact 1398<br />

3<br />

1767<br />

DNA<br />

Influenza A virus<br />

3<br />

agcaaaagca ggggttcaat ctgtcaaaat ggagaaaata gtgcttcttt ttgcaatagt 60<br />

cagtcttgtt aaaagtgatc agatttgcat tggttaccat gcaaacaact cgacagagca <strong>12</strong>0<br />

ggttgacaca ataatggaaa agaacgttac tgttacacat gcccaagaca tactggaaaa 180<br />

gacacacaac gggaagctct gcgatctaga tggagtgaag cctctaattt tgagagattg 240<br />

tagtgtagct ggatggctcc tcggaaaccc aatgtgtgac gaattcatca atgtgccgga 300<br />

atggtcttac atagtggaga aggccaatcc agccaatgac ctctgttacc caggggattt 360<br />

- 97 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


caacgactat gaagaattga aacacctatt gagcagaata aaccattttg agaaaattca 420<br />

gatcatcccc aaaaattctt ggtccagtca tgaagcctca ttaggggtga gctcagcatg 480<br />

tccataccaa ggaaagtcct cctttttcag gaatgtggta tggcttatca aaaagaacaa 540<br />

tgcataccca acaataaaga ggagctacaa taataccaac caagaagatc ttttggtatt 600<br />

gtgggggatt caccatccta atgatgcggc agagcagact aggctctatc aaaacccaac 660<br />

cacctacatt tccgttggga catcaacact aaaccagaga ttggtaccaa aaatagctac 720<br />

tagatccaaa gtaaacgggc aaaatggaag gatggagttc ttctggacaa ttttaaaacc 780<br />

gaatgatgca atcaacttcg agagcaatgg aaatttcatt gctccagaat atgcatacaa 840<br />

aattgtcaag aaaggggact cagcaattat gaaaagtgaa ttggaatatg gtaactgcaa 900<br />

caccaagtgt caaactccaa tgggggcgat aaactctagt atgccattcc acaatataca 960<br />

ccctctcacc atcggggaat gccccaaata tgtgaaatca aacagattag tccttgcgac 1020<br />

tgggctcaga aatagccctc aaagagagac tcgaggatta tttggagcta tagcaggttt 1080<br />

tatagaggga ggatggcagg gaatggtaga tggttggtat gggtaccacc atagcaatga 1140<br />

gcaggggagt gggtacgctg cagacaaaga atccactcaa aaggcaatag atggagtcac <strong>12</strong>00<br />

caataaggtc aactcgatca ttgacaaaat gaacactcag tttgaggccg ttggaaggga <strong>12</strong>60<br />

atttaataac ttagaaagga gaatagagaa tttaaacaag aagatggaag acggattcct 1320<br />

agatgtctgg acttataatg ctgaacttct ggttctcatg gaaaatgaga gaactctaga 1380<br />

ctttcatgac tcaaatgtca agaaccttta cgacaaggtc cgactacagc ttagggataa 1440<br />

tgcaaaggag ctgggtaacg gttgtttcga gttctatcac aaatgtgata atgaatgtat 1500<br />

- 98 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


ggaaagtgta agaaacggaa cgtatgacta cccgcagtat tcagaagaag caagactaaa 1560<br />

aagagaggaa ataagtggag taaaattgga gtcaatagga acttaccaaa tactgtcaat 1620<br />

ttattctaca gtggcgagtt ccctagcact ggcaatcatg gtagctggtc tatctttatg 1680<br />

gatgtgctcc aatgggtcgt tacaatgcag aatttgcatt taaatttgtg agttcagatt 1740<br />

gtagttaaaa acacccttgt ttctact 1767<br />

4<br />

1458<br />

DNA<br />

Influenza A virus<br />

4<br />

agcaaaagca ggagttcaaa atgaatccaa atcagaagat aacaaccatt ggatcaatct 60<br />

gtatggtaat tggaatagtt agcttgatgt tacaaattgg gaacataatc tcaatatggg <strong>12</strong>0<br />

ttagtcattc aattcaaaca gggaatcaac accaggctga accatgcaat caaagcatta 180<br />

ttacttatga aaacaacacc tgggtaaacc agacatatgt caacatcagc aataccaatt 240<br />

ttcttactga gaaagctgtg gcttcagtaa cattagcggg caattcatct ctttgcccca 300<br />

ttagtggatg ggctgtatac agtaaggaca acggtataag aatcggttcc aagggggatg 360<br />

tgtttgttat aagagagccg ttcatctcat gctcccactt ggaatgcaga actttctttt 420<br />

tgactcaggg agccttgctg aatgacaagc attctaatgg gaccgtcaaa gacagaagcc 480<br />

ctcacagaac attaatgagt tgtcccgtgg gtgaggctcc ttccccatac aactcgaggt 540<br />

ttgagtctgt tgcttggtcg gcaagtgctt gtcatgatgg cactagttgg ttgacaattg 600<br />

gaatttctgg cccagacaat ggggctgtgg ctgtattgaa atacaatggc ataataacag 660<br />

acactatcaa gagttggagg aacaacataa tgagaactca agagtctgaa tgtgcatgtg 720<br />

- 99 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


taaatggctc ttgctttact gttatgactg atggaccaag taatgggcag gcttcataca 780<br />

aaatcttcag aatagaaaaa gggaaagtag ttaaatcagc cgaattaaat gcccctaatt 840<br />

atcactatga ggagtgctcc tgttatcctg atgctggaga aatcacatgt gtgtgcaggg 900<br />

ataactggca tggctcaaat cggccatggg tatctttcaa tcaaaatttg gagtatcgaa 960<br />

taggatatat atgcagtgga gttttcggag acaatccacg ccccaatgat gggacaggca 1020<br />

gttgtggtcc ggtgtcccct aaaggggcat atggaataaa agggttctca tttaaatacg 1080<br />

gcaatggtgt ttggatcggg agaaccaaaa gcactaattc caggagcggc tttgaaatga 1140<br />

tttgggatcc aaatggatgg actggtacgg acagtaattt ttcagtaaag caagatattg <strong>12</strong>00<br />

tagctataac cgattggtca ggatatagcg ggagttttgt ccagcatcca gaactgacag <strong>12</strong>60<br />

gattagattg cataagacct tgtttctggg ttgagctaat cagagggcgg cccaaagaga 1320<br />

gcacaatttg gactagtggg agcagcatat ccttttgtgg tgtaaatagt gacactgtgg 1380<br />

gttggtcttg gccagacggt gctgagttgc cattcaccat tgacaagtag tttgttcaaa 1440<br />

aaactccttg tttctact 1458<br />

5<br />

1767<br />

DNA<br />

Influenza A virus<br />

5<br />

agcaaaagca ggggtataat ctgtcaaaat ggagaaaata gtgcttcttc ttgcaacagt 60<br />

cagccttgtt aaaagtgacc agatttgcat tggttaccat gcaaacaact cgacagagca <strong>12</strong>0<br />

agttgacaca ataatggaaa agaatgttac tgttacacat gcccaagaca tactggaaag 180<br />

- 100 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


gacacacaac gggaagctct gcgatctaaa tggagtgaag cctctgattt tgagggattg 240<br />

tagtgtagct ggatggctcc tcggaaaccc tatgtgtgac gaattcatca atgtgccgga 300<br />

atggtcttac atagtggaga aggccagtcc agccaatgac ctctgttatc cagggaattt 360<br />

caacgactat gaagaactga aacacctatt gagcagaata aaccattttg agaaaattca 420<br />

gataatcccc aaaagttctt ggtccaatca tgatgcctca tcaggggtga gctcagcatg 480<br />

tccatacctt gggaggtcct cctttttcag aaatgtggta tggcttatca aaaagaacag 540<br />

tagctaccca acaataaaga ggagctacaa taataccaac caagaagatc ttttggtact 600<br />

gtgggggatt caccatccta atgatgcggc agagcagaca aggctctatc aaaacccaac 660<br />

cacctacatt tccgttggaa catcaacact gaaccagaga ttggttccag aaatagctac 720<br />

tagacccaaa gtaaacgggc aaagtggaag aatggagttc ttctggacaa ttttaaagcc 780<br />

gaatgatgcc atcaatttcg agagtaatgg aaatttcatt gctccagaat atgcatacaa 840<br />

aattgtcaag aaaggggact caacaattat gaaaagtgaa ttggaatatg gtaactgcaa 900<br />

caccaagtgt caaactccaa tgggggcaat aaactctagt atgccattcc acaacataca 960<br />

ccccctcacc atcggggaat gccccaaata tgtgaaatca aacagattag tccttgcaac 1020<br />

tggactcaga aatacccctc aacgagagac gcgaggacta tttggagcta tagcaggttt 1080<br />

tatagaggga ggatggcagg gaatggtaga tggttggtat gggtaccacc atagcaatga 1140<br />

gcaggggagt ggatacgctg cagaccaaga atccacacaa aaggcaatag atggagtcac <strong>12</strong>00<br />

caataaggtc aactcgatca ttaacaaaat gaacactcag tttgaggccg ttggaaggga <strong>12</strong>60<br />

atttaataac ttggaaagga ggatagagaa tttaaacaag aaaatggaag acggattcct 1320<br />

agatgtctgg acttacaatg ccgaacttct ggttctcatg gaaaatgaga gaactctaga 1380<br />

- 101 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


ctttcatgac tcaaatgtca agaaccttta cgacaaggtc cgactacagc ttagggataa 1440<br />

tgcaaaggag ctgggtaatg gttgtttcga attctatcac aaatgtgata acgaatgtat 1500<br />

ggaaagtgta aaaaacggaa cgtatgacta cccgcagtat tcagaagaag caagactaaa 1560<br />

cagagaggaa ataagtggag taaaattgga atcaatggga acttaccaaa tactgtcaat 1620<br />

ttattcaaca gtggcgagtt ccctagcact ggcaatcatg gtagctggtc tatctttatg 1680<br />

gatgtgctcc aatggatcgt tacaatgcag aatttgcatt taaatttgtg agttcagatt 1740<br />

gtagttaaaa acacccttgt ttctact 1767<br />

6<br />

1401<br />

DNA<br />

Influenza A virus<br />

6<br />

agcaaaagca ggagtttaaa atgaatccaa atcagaagat aataaccatt ggatcaatct 60<br />

gcatggtagt tgggataatc agcttgatgt tacaaattgg aaacacaata tcagtatggg <strong>12</strong>0<br />

tcagccacat aattaaaact tggcacccaa accagcctga accatgcaac caaagcatca 180<br />

atttttacac tgagcaggct gcagcttcag tgacattagc gggcaattcc tctctctgcc 240<br />

ctattagtgg atgggctata tacagcaagg acaatagtat aagaattggt tccaaagggg 300<br />

atgtgtttgt tataagagaa ccattcatct catgctccca tttggaatgc agaacctttt 360<br />

tcttgaccca aggagcccta ttgaatgaca agcattctaa tgggaccgtc aaagacagga 420<br />

gcccctatag aactttaatg agctgtcctg ttggtgaggc cccttcccca tacaactcaa 480<br />

ggtttgagtc tgttgcttgg tcagcaagtg cttgccatga tggcattagt tggctaacaa 540<br />

- 102 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


ttggaatttc cggtccggat aatggggctg tggctgtgtt gaaatacaat ggcataataa 600<br />

cagacaccat caagagttgg aggaacaaca cactgaggac gcaagagtct gaatgtgcat 660<br />

gtgtgaatgg ttcttgtttt actgtaatga cagatggacc gagtaatgaa caggcctcat 720<br />

acaagatttt caagatagaa aaggggaggg tagtcaaatc agttgagttg aacgccccta 780<br />

attatcatta cgaggaatgc tcctgttatc ctgatgctgg cgaaatcaca tgtgtgtgca 840<br />

gggataattg gcatggctcg aaccgaccat gggtgtcttt caatcagaat ctggagtatc 900<br />

aaataggata tatatgcagt ggggttttcg gagacagtcc acgccccaat gatgggacag 960<br />

gcagttgtgg tccagtgtct cttaacggag cgtatggagt aaaagggttt tcatttaaat 1020<br />

acggcaatgg tgtttggatc gggagaacca aaagcactag ttccaggagc ggttttgaaa 1080<br />

tgatttggga tccaaatggg tggaccgaaa cagacagtag cttctcgttg aagcaagaca 1140<br />

tcatagcgat aactgattgg tcaggataca gcgggagttt tattcaacat ccagaactga <strong>12</strong>00<br />

caggattaaa ttgcatgaga ccttgcttct gggttgaact aatcagaggg aggcccaaag <strong>12</strong>60<br />

agaaaacaat ctggactagt gggagcagta tatctttctg tggtgtaaat agtgacactg 1320<br />

tgggttggtc ttggccagac ggtgctgagt tgccatacac cattgacaag tagtttgttc 1380<br />

aaaaaactcc ttgtttctac t 1401<br />

7<br />

1767<br />

DNA<br />

Influenza A virus<br />

7<br />

agcaaaagca ggggtataat ctgtcaaaat ggagaaaata gtgcttcttc ttgcaacagt 60<br />

cagccttgtt aaaagtgacc agatttgcat tggttaccat gcaaacaact cgacagagca <strong>12</strong>0<br />

- 103 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


agttgacaca ataatggaaa agaatgttac tgttacacat gcccaagaca tactggaaag 180<br />

gacacacaac gggaagctct gcgatctaaa tggagtgaag cctctgattt tgagggattg 240<br />

tagtgtagct ggatggctcc tcggaaaccc tatgtgtgac gaattcatca atgtgccgga 300<br />

atggtcttac atagtggaga aggccagtcc agccaatgac ctctgttatc cagggaattt 360<br />

caacgactat gaagaactga aacacctatt gagcagaata aaccattttg agaaaattca 420<br />

gataatcccc aaaagttctt ggtccaatca tgatgcctca tcaggggtga gctcagcatg 480<br />

tccatacctt gggaggtcct cctttttcag aaatgtggta tggcttatca aaaagaacag 540<br />

tagctaccca acaataaaga ggagctacaa taataccaac caagaagatc ttttggtact 600<br />

gtgggggatt caccatccta atgatgcggc agagcagaca aggctctatc aaaacccaac 660<br />

cacctacatt tccgttggaa catcaacact gaaccagaga ttggtttcag aaatagctac 720<br />

tagacccaaa gtaaacgggc aaagtggaag aatggagttc ttctggacaa ttttaaagcc 780<br />

gaatgatgcc atcaatttcg agagtaatgg aaatttcatt gctccagaat atgcatacaa 840<br />

aattgtcaag aaaggggact caacaattat gaaaagtgaa ttggaatatg gtaactgcaa 900<br />

caccaagtgt caaactccaa tgggggcaat aaactctagt atgccattcc acaacataca 960<br />

ccccctcacc atcggggaat gccccaaata tgtgaaatca aacagattag tccttgcaac 1020<br />

tggactcaga aatacccctc aacgagagac gcgaggacta tttggagcta tagcaggttt 1080<br />

tatagaggga ggatggcagg gaatggtaga tggttggtat gggtaccacc atagcaatga 1140<br />

gcaggggagt ggatacgctg cagaccaaga atccacacaa aaggcaatag atggagtcac <strong>12</strong>00<br />

caataaggtc aactcgatca ttaacaaaat gaacactcag tttgaggccg ttggaaggga <strong>12</strong>60<br />

- 104 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


atttaataac ttggaaagga ggatagagaa tttaaacaag aaaatggaag acggattcct 1320<br />

agatgtctgg acttacaatg ccgaacttct ggttctcatg gaaaatgaga gaactctaga 1380<br />

ctttcatgac tcaaatgtca agaaccttta cgacaaggtc cgactacagc ttagggataa 1440<br />

tgcaaaggag ctgggtaatg gttgtttcga attctatcac aaatgtgata acgaatgtat 1500<br />

ggaaagtgta aaaaacggaa cgtatgacta cccgcagtat tcagaagaag caagactaaa 1560<br />

cagagaggaa ataagtggag taaaattgga atcaatggga acttaccaaa tactgtcaat 1620<br />

ttattcaaca gtggcgagtt ccctagcact ggcaatcatg gtagctggtc tatctttatg 1680<br />

gatgtgctcc aatggatcgt tacaatgcag aatttgcatt taaatttgtg agttcagatt 1740<br />

gtagttaaaa acacccttgt ttctact 1767<br />

8<br />

1401<br />

DNA<br />

Influenza A virus<br />

8<br />

agcaaaagca ggagtttaaa atgaatccaa atcagaagat aataaccatt ggatcaatct 60<br />

gcatggtagt tgggataatc agcttgatgt tacaaattgg aaacacaata tcagtatggg <strong>12</strong>0<br />

tcagccacat aattaaaact tggcacccaa accagcctga accatgcaac caaagcatca 180<br />

atttttacac tgagcaggct gcagcttcag tgacattagc gggcaattcc tctctctgcc 240<br />

ctattagtgg atgggctata tacagcaagg acaatagtat aagaattggt tccaaagggg 300<br />

atgtgtttgt tataagagaa ccattcatct catgctccca tttggaatgc agaacctttt 360<br />

tcttgaccca aggagcccta ttgaatgaca agcattctaa tgggaccgtc aaagacagga 420<br />

gcccctatag aactttaatg agctgtcctg ttggtgaggc cccttcccca tacaactcaa 480<br />

- 105 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


ggtttgagtc tgttgcttgg tcagcaagtg cttgccatga tggcattagt tggctaacaa 540<br />

ttggaatttc cggtccggat aatggggctg tggctgtgtt gaaatacaat ggcataataa 600<br />

cagacaccat caagagttgg aggaacaaca cactgaggac gcaagagtct gaatgtgcat 660<br />

gtgtgaatgg ttcttgtttt actgtaatga cagatggacc gagtaatgaa caggcctcat 720<br />

acaagatttt caagatagaa aaggggaggg tagtcaaatc agttgagttg aacgccccta 780<br />

attatcatta cgaggaatgc tcctgttatc ctgatgctgg cgaaatcaca tgtgtgtgca 840<br />

gggataattg gcatggctcg aaccgaccat gggtgtcttt caatcagaat ctggagtatc 900<br />

aaataggata tatatgcagt ggggttttcg gagacagtcc acgccccaat gatgggacag 960<br />

gcagttgtgg tccagtgtct cttaacggag cgtatggagt aaaagggttt tcatttaaat 1020<br />

acggcaatgg tgtttggatc gggagaacca aaagcactag ttccaggagc ggttttgaaa 1080<br />

tgatttggga tccaaatggg tggaccgaaa cagacagtag cttctcgttg aagcaagaca 1140<br />

tcatagcgat aactgattgg tcaggataca gcgggagttt tattcaacat ccagaactga <strong>12</strong>00<br />

caggattaaa ttgcatgaga ccttgcttct gggttgaact aatcagaggg aggcccaaag <strong>12</strong>60<br />

agaaaacaat ctggactagt gggagcagta tatctttctg tggtgtaaat agtgacactg 1320<br />

tgggttggtc ttggccagac ggtgctgagt tgccatacac cattgacaag tagtttgttc 1380<br />

aaaaaactcc ttgtttctac t 1401<br />

9<br />

1690<br />

DNA<br />

Influenza A virus<br />

9<br />

- 106 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


ttaaccactc aagatggaag caataccact aataactata ctactagtag taacagcaag 60<br />

caatgcagac aaaatctgca tcggctacca atcaacaaac tccacagaaa ccgtagacac <strong>12</strong>0<br />

gctaacagaa aacaatgttc ctgtgacaca tgccaaagaa ttgctccaca cagagcacaa 180<br />

tgggatgctg tgtgcaacaa atctgggacg tcctcttatt ctagacactt gcaccattga 240<br />

aggactgatc tatggcaacc cttcttgtga tctactgttg ggaggaagag aatggtccta 300<br />

catcgtcgaa agaccatcgg ctgttaatgg aatgtgttac cccgggaatg tagaaaacct 360<br />

agaggaacta aggtcatttt ttagttctgc tagttcctac caaagaatcc agatctttcc 420<br />

agacacaatc tggaatgtgt cttacagtgg aacaagcaaa gcatgttcag attcattcta 480<br />

caggagcatg agatggttga ctcaaaagaa caacgcttac cctattcaag acgcccaata 540<br />

cacaaataat agaggaaaga gcattctttt catgtggggc ataaatcacc cacctaccga 600<br />

tactgcacag acaaatctgt acacaaggac tgacacaaca acaagtgtgg caacagaaga 660<br />

tataaatagg accttcaaac cagtgatagg gccaaggccc cttgtcaatg gtctgcaggg 720<br />

aagaattgat tattattggt cggtattgaa accaggtcag acattgcgag taagatccaa 780<br />

tgggaatcta atcgctccat ggtatgggca cattctttca ggagagagcc acggaagaat 840<br />

cctgaagact gatttaaaca gtggtagctg tgtagtgcaa tgtcaaacag aaagaggtgg 900<br />

cttaaatact actttgccat tccacaatgt cagtaaatat gcatttggaa actgcccaaa 960<br />

atatgttgga gtaaagagtc tcaaactggc agttggtctg aggaatgtgc ctgctagatc 1020<br />

aagtagagga ctatttgggg ccatagctgg attcatagag ggaggttggt cagggctggt 1080<br />

cgctggttgg tatgggttcc agcattcaaa tgatcaaggg gttggtatag ctgcagatag 1140<br />

agactcaact caaagggcaa ttgacaaaat aacgtccaaa gtgaataata tagtcgataa <strong>12</strong>00<br />

- 107 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


aatgaacaag caatatgaaa ttattgatca tgaattcagc gaggttgaaa atagactcaa <strong>12</strong>60<br />

tatgatcaat aataagattg atgaccagat acaagacata tgggcatata acgctgaatt 1320<br />

gctagtgctg cttgaaaacc agaaaacact cgatgagcat gatgcgaatg taaacaatct 1380<br />

atataacaaa gtgaagaggg cactgggttc caatgcaatg gaagatggga aaggatgttt 1440<br />

cgagctatac cataaatgtg atgatcagtg catggagaca attcggaacg ggacctataa 1500<br />

caggaggaag tataaagagg aatcaagact agaaagacag aaaatagaag gggtcaagct 1560<br />

ggaatctgaa ggaacttaca aaatcctcac catttattcg actgtcgcct catctcttgt 1620<br />

gattgcaatg gggtttgctg ccttcttgtt ctgggccatg tccaatggat cttgcagatg 1680<br />

caacatttga 1690<br />

10<br />

1428<br />

DNA<br />

Influenza A virus<br />

10<br />

aaatgaatcc aaatcagaag ataatagcaa ttggctctgt ttctctaact attgcgacaa 60<br />

tatgcctcct catgcagatt gctatcttag caacgactat gacactacat ttcaagcaga <strong>12</strong>0<br />

atgaatgcat caactcctcg aataatcaag tagtgccatg tgaaccaatc ataatagaaa 180<br />

ggaacataac agagatagtg catttgaata gtactacctt agagaaggaa atttgtccta 240<br />

aagtagcaga ctacaggaat tggtcaaaac cacaatgtca aatcacaggg ttcgctcctt 300<br />

tctccaagga caattcaatt aggctctccg caggtggaga tatttgggtg acaagagaac 360<br />

cttatgtatc gtgcggtctt ggtaaatgtt atcaatttgc acttgggcag ggaaccactt 420<br />

- 108 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


tggagaacaa acactcaaac ggcacagcac atgatagaac tcctcataga acccttttaa 480<br />

tgaatgagtt gggtgttccg tttcatttgg caaccaaaca agtgtgcata gcatggtcca 540<br />

gctcaagctg ccatgatggg aaagcatggt tacatgtttg tgtcactggg gatgatagaa 600<br />

atgcaacggc tagcatcatt tatgatggga tacttgttga cagtattggt tcatggtcta 660<br />

aaaacatcct cagaactcag gagtcagaat gcgtttgcat caatggaacc tgtgcagtag 720<br />

taatgactga tggaagtgca tcaggaaggg ctgacactag aatactattt attagagagg 780<br />

ggaaaattgc acacattagc ccattgtcag gaagtgctca gcatgtggag gaatgctcct 840<br />

gttacccccg atatccagaa gttagatgtg tttgcagaga caattggaag ggatccaata 900<br />

ggcccgttct atatataaat atggcaaatt atagtattga ttccagttat gtgtgctcag 960<br />

gacttgttgg cgacacacca agaaatgatg ataggtctag cagcagcaac tgcagagatc 1020<br />

ctaataacga gagaggggcc ccaggagtaa aagggtgggc ctttgacaat ggaaatgaca 1080<br />

tttggatggg aagaacaatc aaaaaggatt cgcgctcagg ttatgagact ttcagggtca 1140<br />

ttggtggttg gaccactgct aattccaagt cacagataaa tagacaagtc atagttgaca <strong>12</strong>00<br />

gtgataactc gtctgggtat tctggtatct tctctgttga aggcaaaagc tgcatcaaca <strong>12</strong>60<br />

ggtgttttta cgtggagttg ataagaggaa gaccaaagga gactagggtg tggtggactt 1320<br />

caaatagcat cattgtattt tgtggaactt caggtaccta tggaacaggc tcatggcctg 1380<br />

atggggcgaa tatcaatttc atgcctatat aagctttcgc aattttag 1428<br />

11<br />

564<br />

PRT<br />

Influenza A virus<br />

- 109 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


11<br />

Met Glu Lys Ile Val Leu Leu Phe Ala Ile Val Ser Leu Val Lys Ser<br />

1 5 10 15<br />

Asp Gln Ile Cys Ile Gly Tyr His Ala Asn Asn Ser Thr Glu Gln Val<br />

20 25 30<br />

Asp Thr Ile Met Glu Lys Asn Val Thr Val Thr His Ala Gln Asp Ile<br />

35 40 45<br />

Leu Glu Lys Lys His Asn Gly Lys Leu Cys Asp Leu Asp Gly Val Lys<br />

50 55 60<br />

Pro Leu Ile Leu Arg Asp Cys Ser Val Ala Gly Trp Leu Leu Gly Asn<br />

65 70 75 80<br />

Pro Met Cys Asp Glu Phe Ile Asn Val Pro Glu Trp Ser Tyr Ile Val<br />

85 90 95<br />

Glu Lys Ala Asn Pro Val Asn Asp Leu Cys Tyr Pro Gly Asp Phe Asn<br />

100 105 110<br />

Asp Tyr Glu Glu Leu Lys His Leu Leu Ser Arg Ile Asn His Phe Glu<br />

115 <strong>12</strong>0 <strong>12</strong>5<br />

Lys Ile Gln Ile Ile Pro Lys Ser Ser Trp Ser Ser His Glu Ala Ser<br />

130 135 140<br />

Leu Gly Val Ser Ser Ala Cys Pro Tyr Gln Gly Lys Ser Ser Phe Phe<br />

145 150 155 160<br />

Arg Asn Val Val Trp Leu Ile Lys Lys Asn Ser Thr Tyr Pro Thr Ile<br />

165 170 175<br />

Lys Arg Ser Tyr Asn Asn Thr Asn Gln Glu Asp Leu Leu Val Leu Trp<br />

- 110 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


180 185 <strong>19</strong>0<br />

Gly Ile His His Pro Asn Asp Ala Ala Glu Gln Thr Lys Leu Tyr Gln<br />

<strong>19</strong>5 200 205<br />

Asn Pro Thr Thr Tyr Ile Ser Val Gly Thr Ser Thr Leu Asn Gln Arg<br />

210 215 220<br />

Leu Val Pro Arg Ile Ala Thr Arg Ser Lys Val Asn Gly Gln Ser Gly<br />

225 230 235 240<br />

Arg Met Glu Phe Phe Trp Thr Ile Leu Lys Pro Asn Asp Ala Ile Asn<br />

245 250 255<br />

Phe Glu Ser Asn Gly Asn Phe Ile Ala Pro Glu Tyr Ala Tyr Lys Ile<br />

260 265 270<br />

Val Lys Lys Gly Asp Ser Thr Ile Met Lys Ser Glu Leu Glu Tyr Gly<br />

275 280 285<br />

Asn Cys Asn Thr Lys Cys Gln Thr Pro Met Gly Ala Ile Asn Ser Ser<br />

290 295 300<br />

Met Pro Phe His Asn Ile His Pro Leu Thr Ile Gly Glu Cys Pro Lys<br />

305 310 315 320<br />

Tyr Val Lys Ser Asn Arg Leu Val Leu Ala Thr Gly Leu Arg Asn Ser<br />

325 330 335<br />

Pro Gln Arg Glu Thr Arg Gly Leu Phe Gly Ala Ile Ala Gly Phe Ile<br />

340 345 350<br />

Glu Gly Gly Trp Gln Gly Met Val Asp Gly Trp Tyr Gly Tyr His His<br />

355 360 365<br />

Ser Asn Glu Gln Gly Ser Gly Tyr Ala Ala Asp Lys Glu Ser Thr Gln<br />

- 111 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


370 375 380<br />

Lys Ala Ile Asp Gly Val Thr Asn Lys Val Asn Ser Ile Ile Asp Lys<br />

385 390 395 400<br />

Met Asn Thr Gln Phe Glu Ala Val Gly Arg Glu Phe Asn Asn Leu Glu<br />

405 410 415<br />

Arg Arg Ile Glu Asn Leu Asn Lys Lys Met Glu Asp Gly Phe Leu Asp<br />

420 425 430<br />

Val Trp Thr Tyr Asn Ala Glu Leu Leu Val Leu Met Glu Asn Glu Arg<br />

435 440 445<br />

Thr Leu Asp Phe His Asp Ser Asn Val Lys Asn Leu Tyr Asp Lys Val<br />

450 455 460<br />

Arg Leu Gln Leu Arg Asp Asn Ala Lys Glu Leu Gly Asn Gly Cys Phe<br />

465 470 475 480<br />

Glu Phe Tyr His Lys Cys Asp Asn Glu Cys Met Glu Ser Val Arg Asn<br />

485 490 495<br />

Gly Thr Tyr Asp Tyr Pro Gln Tyr Ser Glu Glu Ala Arg Leu Lys Arg<br />

500 505 510<br />

Glu Glu Ile Ser Gly Val Lys Leu Glu Ser Ile Gly Ile Tyr Gln Ile<br />

515 520 525<br />

Leu Ser Ile Tyr Ser Thr Val Ala Ser Ser Leu Ala Leu Ala Ile Met<br />

530 535 540<br />

Val Ala Gly Leu Ser Leu Trp Met Cys Ser Asn Gly Ser Leu Gln Cys<br />

545 550 555 560<br />

Arg Ile Cys Ile<br />

- 1<strong>12</strong> -<br />

공개특허 10-2009-0053794


<strong>12</strong><br />

449<br />

PRT<br />

Influenza A virus<br />

<strong>12</strong><br />

Met Asn Pro Asn Gln Lys Ile Ile Thr Ile Gly Ser Ile Cys Met Val<br />

1 5 10 15<br />

Thr Gly Ile Val Ser Leu Met Leu Gln Ile Gly Asn Met Ile Ser Ile<br />

20 25 30<br />

Trp Val Ser His Ser Ile His Thr Gly Asn Gln His Gln Ser Glu Pro<br />

35 40 45<br />

Ile Ser Asn Thr Asn Phe Leu Thr Glu Lys Ala Val Ala Ser Val Lys<br />

50 55 60<br />

Leu Ala Gly Asn Ser Ser Leu Cys Pro Ile Asn Gly Trp Ala Val Tyr<br />

65 70 75 80<br />

Ser Lys Asp Asn Ser Ile Arg Ile Gly Ser Lys Gly Asp Val Phe Val<br />

85 90 95<br />

Ile Arg Glu Pro Phe Ile Ser Cys Ser His Leu Glu Cys Arg Thr Phe<br />

100 105 110<br />

Phe Leu Thr Gln Gly Ala Leu Leu Asn Asp Lys His Ser Asn Gly Thr<br />

115 <strong>12</strong>0 <strong>12</strong>5<br />

Val Lys Asp Arg Ser Pro His Arg Thr Leu Met Ser Cys Pro Val Gly<br />

130 135 140<br />

Glu Ala Pro Ser Pro Tyr Asn Ser Arg Phe Glu Ser Val Ala Trp Ser<br />

- 113 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


145 150 155 160<br />

Ala Ser Ala Cys His Asp Gly Thr Ser Trp Leu Thr Ile Gly Ile Ser<br />

165 170 175<br />

Gly Pro Asp Asn Gly Ala Val Ala Val Leu Lys Tyr Asn Gly Ile Ile<br />

180 185 <strong>19</strong>0<br />

Thr Asp Thr Ile Lys Ser Trp Arg Asn Asn Ile Leu Arg Thr Gln Glu<br />

<strong>19</strong>5 200 205<br />

Ser Glu Cys Ala Cys Val Asn Gly Ser Cys Phe Thr Val Met Thr Asp<br />

210 215 220<br />

Gly Pro Ser Asn Gly Gln Ala Ser His Lys Ile Phe Lys Met Glu Lys<br />

225 230 235 240<br />

Gly Lys Val Val Lys Ser Val Glu Leu Asp Ala Pro Asn Tyr His Tyr<br />

245 250 255<br />

Glu Glu Cys Ser Cys Tyr Pro Asn Ala Gly Glu Ile Thr Cys Val Cys<br />

260 265 270<br />

Arg Asp Asn Trp His Gly Ser Asn Arg Pro Trp Val Ser Phe Asn Gln<br />

275 280 285<br />

Asn Leu Glu Tyr Gln Ile Gly Tyr Ile Cys Ser Gly Val Phe Gly Asp<br />

290 295 300<br />

Asn Pro Arg Pro Asn Asp Gly Thr Gly Ser Cys Gly Pro Val Ser Ser<br />

305 310 315 320<br />

Asn Gly Ala Tyr Gly Val Lys Gly Phe Ser Phe Lys Tyr Gly Asn Gly<br />

325 330 335<br />

Val Trp Ile Gly Arg Thr Lys Ser Thr Asn Ser Arg Ser Gly Phe Glu<br />

340 345 350<br />

- 114 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


Met Ile Trp Asp Pro Asn Gly Trp Thr Glu Thr Asp Ser Ser Phe Ser<br />

355 360 365<br />

Val Lys Gln Asp Ile Val Ala Ile Thr Asp Trp Ser Gly Tyr Ser Gly<br />

370 375 380<br />

Ser Phe Val Gln His Pro Glu Leu Thr Gly Leu Asp Cys Ile Arg Pro<br />

385 390 395 400<br />

Cys Phe Trp Val Glu Leu Ile Arg Gly Arg Pro Lys Glu Ser Thr Ile<br />

405 410 415<br />

Trp Thr Ser Gly Ser Ser Ile Ser Phe Cys Gly Val Asn Ser Asp Thr<br />

420 425 430<br />

Val Gly Trp Ser Trp Pro Asp Gly Ala Glu Leu Pro Phe Thr Ile Asp<br />

435 440 445<br />

Lys<br />

13<br />

564<br />

PRT<br />

Influenza A virus<br />

13<br />

Met Glu Lys Ile Val Leu Leu Phe Ala Ile Val Ser Leu Val Lys Ser<br />

1 5 10 15<br />

Asp Gln Ile Cys Ile Gly Tyr His Ala Asn Asn Ser Thr Glu Gln Val<br />

20 25 30<br />

Asp Thr Ile Met Glu Lys Asn Val Thr Val Thr His Ala Gln Asp Ile<br />

35 40 45<br />

- 115 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


Leu Glu Lys Thr His Asn Gly Lys Leu Cys Asp Leu Asp Gly Val Lys<br />

50 55 60<br />

Pro Leu Ile Leu Arg Asp Cys Ser Val Ala Gly Trp Leu Leu Gly Asn<br />

65 70 75 80<br />

Pro Met Cys Asp Glu Phe Ile Asn Val Pro Glu Trp Ser Tyr Ile Val<br />

85 90 95<br />

Glu Lys Ala Asn Pro Ala Asn Asp Leu Cys Tyr Pro Gly Asp Phe Asn<br />

100 105 110<br />

Asp Tyr Glu Glu Leu Lys His Leu Leu Ser Arg Ile Asn His Phe Glu<br />

115 <strong>12</strong>0 <strong>12</strong>5<br />

Lys Ile Gln Ile Ile Pro Lys Asn Ser Trp Ser Ser His Glu Ala Ser<br />

130 135 140<br />

Leu Gly Val Ser Ser Ala Cys Pro Tyr Gln Gly Lys Ser Ser Phe Phe<br />

145 150 155 160<br />

Arg Asn Val Val Trp Leu Ile Lys Lys Asn Asn Ala Tyr Pro Thr Ile<br />

165 170 175<br />

Lys Arg Ser Tyr Asn Asn Thr Asn Gln Glu Asp Leu Leu Val Leu Trp<br />

180 185 <strong>19</strong>0<br />

Gly Ile His His Pro Asn Asp Ala Ala Glu Gln Thr Arg Leu Tyr Gln<br />

<strong>19</strong>5 200 205<br />

Asn Pro Thr Thr Tyr Ile Ser Val Gly Thr Ser Thr Leu Asn Gln Arg<br />

210 215 220<br />

Leu Val Pro Lys Ile Ala Thr Arg Ser Lys Val Asn Gly Gln Asn Gly<br />

- 116 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


225 230 235 240<br />

Arg Met Glu Phe Phe Trp Thr Ile Leu Lys Pro Asn Asp Ala Ile Asn<br />

245 250 255<br />

Phe Glu Ser Asn Gly Asn Phe Ile Ala Pro Glu Tyr Ala Tyr Lys Ile<br />

260 265 270<br />

Val Lys Lys Gly Asp Ser Ala Ile Met Lys Ser Glu Leu Glu Tyr Gly<br />

275 280 285<br />

Asn Cys Asn Thr Lys Cys Gln Thr Pro Met Gly Ala Ile Asn Ser Ser<br />

290 295 300<br />

Met Pro Phe His Asn Ile His Pro Leu Thr Ile Gly Glu Cys Pro Lys<br />

305 310 315 320<br />

Tyr Val Lys Ser Asn Arg Leu Val Leu Ala Thr Gly Leu Arg Asn Ser<br />

325 330 335<br />

Pro Gln Arg Glu Thr Arg Gly Leu Phe Gly Ala Ile Ala Gly Phe Ile<br />

340 345 350<br />

Glu Gly Gly Trp Gln Gly Met Val Asp Gly Trp Tyr Gly Tyr His His<br />

355 360 365<br />

Ser Asn Glu Gln Gly Ser Gly Tyr Ala Ala Asp Lys Glu Ser Thr Gln<br />

370 375 380<br />

Lys Ala Ile Asp Gly Val Thr Asn Lys Val Asn Ser Ile Ile Asp Lys<br />

385 390 395 400<br />

Met Asn Thr Gln Phe Glu Ala Val Gly Arg Glu Phe Asn Asn Leu Glu<br />

405 410 415<br />

Arg Arg Ile Glu Asn Leu Asn Lys Lys Met Glu Asp Gly Phe Leu Asp<br />

420 425 430<br />

- 117 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


Val Trp Thr Tyr Asn Ala Glu Leu Leu Val Leu Met Glu Asn Glu Arg<br />

435 440 445<br />

Thr Leu Asp Phe His Asp Ser Asn Val Lys Asn Leu Tyr Asp Lys Val<br />

450 455 460<br />

Arg Leu Gln Leu Arg Asp Asn Ala Lys Glu Leu Gly Asn Gly Cys Phe<br />

465 470 475 480<br />

Glu Phe Tyr His Lys Cys Asp Asn Glu Cys Met Glu Ser Val Arg Asn<br />

485 490 495<br />

Gly Thr Tyr Asp Tyr Pro Gln Tyr Ser Glu Glu Ala Arg Leu Lys Arg<br />

500 505 510<br />

Glu Glu Ile Ser Gly Val Lys Leu Glu Ser Ile Gly Thr Tyr Gln Ile<br />

515 520 525<br />

Leu Ser Ile Tyr Ser Thr Val Ala Ser Ser Leu Ala Leu Ala Ile Met<br />

530 535 540<br />

Val Ala Gly Leu Ser Leu Trp Met Cys Ser Asn Gly Ser Leu Gln Cys<br />

545 550 555 560<br />

Arg Ile Cys Ile<br />

14<br />

469<br />

PRT<br />

Influenza A virus<br />

14<br />

Met Asn Pro Asn Gln Lys Ile Thr Thr Ile Gly Ser Ile Cys Met Val<br />

1 5 10 15<br />

- 118 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


Ile Gly Ile Val Ser Leu Met Leu Gln Ile Gly Asn Ile Ile Ser Ile<br />

20 25 30<br />

Trp Val Ser His Ser Ile Gln Thr Gly Asn Gln His Gln Ala Glu Pro<br />

35 40 45<br />

Cys Asn Gln Ser Ile Ile Thr Tyr Glu Asn Asn Thr Trp Val Asn Gln<br />

50 55 60<br />

Thr Tyr Val Asn Ile Ser Asn Thr Asn Phe Leu Thr Glu Lys Ala Val<br />

65 70 75 80<br />

Ala Ser Val Thr Leu Ala Gly Asn Ser Ser Leu Cys Pro Ile Ser Gly<br />

85 90 95<br />

Trp Ala Val Tyr Ser Lys Asp Asn Gly Ile Arg Ile Gly Ser Lys Gly<br />

100 105 110<br />

Asp Val Phe Val Ile Arg Glu Pro Phe Ile Ser Cys Ser His Leu Glu<br />

115 <strong>12</strong>0 <strong>12</strong>5<br />

Cys Arg Thr Phe Phe Leu Thr Gln Gly Ala Leu Leu Asn Asp Lys His<br />

130 135 140<br />

Ser Asn Gly Thr Val Lys Asp Arg Ser Pro His Arg Thr Leu Met Ser<br />

145 150 155 160<br />

Cys Pro Val Gly Glu Ala Pro Ser Pro Tyr Asn Ser Arg Phe Glu Ser<br />

165 170 175<br />

Val Ala Trp Ser Ala Ser Ala Cys His Asp Gly Thr Ser Trp Leu Thr<br />

180 185 <strong>19</strong>0<br />

Ile Gly Ile Ser Gly Pro Asp Asn Gly Ala Val Ala Val Leu Lys Tyr<br />

<strong>19</strong>5 200 205<br />

- 1<strong>19</strong> -<br />

공개특허 10-2009-0053794


Asn Gly Ile Ile Thr Asp Thr Ile Lys Ser Trp Arg Asn Asn Ile Met<br />

210 215 220<br />

Arg Thr Gln Glu Ser Glu Cys Ala Cys Val Asn Gly Ser Cys Phe Thr<br />

225 230 235 240<br />

Val Met Thr Asp Gly Pro Ser Asn Gly Gln Ala Ser Tyr Lys Ile Phe<br />

245 250 255<br />

Arg Ile Glu Lys Gly Lys Val Val Lys Ser Ala Glu Leu Asn Ala Pro<br />

260 265 270<br />

Asn Tyr His Tyr Glu Glu Cys Ser Cys Tyr Pro Asp Ala Gly Glu Ile<br />

275 280 285<br />

Thr Cys Val Cys Arg Asp Asn Trp His Gly Ser Asn Arg Pro Trp Val<br />

290 295 300<br />

Ser Phe Asn Gln Asn Leu Glu Tyr Arg Ile Gly Tyr Ile Cys Ser Gly<br />

305 310 315 320<br />

Val Phe Gly Asp Asn Pro Arg Pro Asn Asp Gly Thr Gly Ser Cys Gly<br />

325 330 335<br />

Pro Val Ser Pro Lys Gly Ala Tyr Gly Ile Lys Gly Phe Ser Phe Lys<br />

340 345 350<br />

Tyr Gly Asn Gly Val Trp Ile Gly Arg Thr Lys Ser Thr Asn Ser Arg<br />

355 360 365<br />

Ser Gly Phe Glu Met Ile Trp Asp Pro Asn Gly Trp Thr Gly Thr Asp<br />

370 375 380<br />

Ser Asn Phe Ser Val Lys Gln Asp Ile Val Ala Ile Thr Asp Trp Ser<br />

385 390 395 400<br />

- <strong>12</strong>0 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


Gly Tyr Ser Gly Ser Phe Val Gln His Pro Glu Leu Thr Gly Leu Asp<br />

405 410 415<br />

Cys Ile Arg Pro Cys Phe Trp Val Glu Leu Ile Arg Gly Arg Pro Lys<br />

420 425 430<br />

Glu Ser Thr Ile Trp Thr Ser Gly Ser Ser Ile Ser Phe Cys Gly Val<br />

435 440 445<br />

Asn Ser Asp Thr Val Gly Trp Ser Trp Pro Asp Gly Ala Glu Leu Pro<br />

450 455 460<br />

Phe Thr Ile Asp Lys<br />

465<br />

15<br />

564<br />

PRT<br />

Influenza A virus<br />

15<br />

Met Glu Lys Ile Val Leu Leu Leu Ala Thr Val Ser Leu Val Lys Ser<br />

1 5 10 15<br />

Asp Gln Ile Cys Ile Gly Tyr His Ala Asn Asn Ser Thr Glu Gln Val<br />

20 25 30<br />

Asp Thr Ile Met Glu Lys Asn Val Thr Val Thr His Ala Gln Asp Ile<br />

35 40 45<br />

Leu Glu Arg Thr His Asn Gly Lys Leu Cys Asp Leu Asn Gly Val Lys<br />

50 55 60<br />

Pro Leu Ile Leu Arg Asp Cys Ser Val Ala Gly Trp Leu Leu Gly Asn<br />

65 70 75 80<br />

- <strong>12</strong>1 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


Pro Met Cys Asp Glu Phe Ile Asn Val Pro Glu Trp Ser Tyr Ile Val<br />

85 90 95<br />

Glu Lys Ala Ser Pro Ala Asn Asp Leu Cys Tyr Pro Gly Asn Phe Asn<br />

100 105 110<br />

Asp Tyr Glu Glu Leu Lys His Leu Leu Ser Arg Ile Asn His Phe Glu<br />

115 <strong>12</strong>0 <strong>12</strong>5<br />

Lys Ile Gln Ile Ile Pro Lys Ser Ser Trp Ser Asn His Asp Ala Ser<br />

130 135 140<br />

Ser Gly Val Ser Ser Ala Cys Pro Tyr Leu Gly Arg Ser Ser Phe Phe<br />

145 150 155 160<br />

Arg Asn Val Val Trp Leu Ile Lys Lys Asn Ser Ser Tyr Pro Thr Ile<br />

165 170 175<br />

Lys Arg Ser Tyr Asn Asn Thr Asn Gln Glu Asp Leu Leu Val Leu Trp<br />

180 185 <strong>19</strong>0<br />

Gly Ile His His Pro Asn Asp Ala Ala Glu Gln Thr Arg Leu Tyr Gln<br />

<strong>19</strong>5 200 205<br />

Asn Pro Thr Thr Tyr Ile Ser Val Gly Thr Ser Thr Leu Asn Gln Arg<br />

210 215 220<br />

Leu Val Pro Glu Ile Ala Thr Arg Pro Lys Val Asn Gly Gln Ser Gly<br />

225 230 235 240<br />

Arg Met Glu Phe Phe Trp Thr Ile Leu Lys Pro Asn Asp Ala Ile Asn<br />

245 250 255<br />

Phe Glu Ser Asn Gly Asn Phe Ile Ala Pro Glu Tyr Ala Tyr Lys Ile<br />

260 265 270<br />

- <strong>12</strong>2 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


Val Lys Lys Gly Asp Ser Thr Ile Met Lys Ser Glu Leu Glu Tyr Gly<br />

275 280 285<br />

Asn Cys Asn Thr Lys Cys Gln Thr Pro Met Gly Ala Ile Asn Ser Ser<br />

290 295 300<br />

Met Pro Phe His Asn Ile His Pro Leu Thr Ile Gly Glu Cys Pro Lys<br />

305 310 315 320<br />

Tyr Val Lys Ser Asn Arg Leu Val Leu Ala Thr Gly Leu Arg Asn Thr<br />

325 330 335<br />

Pro Gln Arg Glu Thr Arg Gly Leu Phe Gly Ala Ile Ala Gly Phe Ile<br />

340 345 350<br />

Glu Gly Gly Trp Gln Gly Met Val Asp Gly Trp Tyr Gly Tyr His His<br />

355 360 365<br />

Ser Asn Glu Gln Gly Ser Gly Tyr Ala Ala Asp Gln Glu Ser Thr Gln<br />

370 375 380<br />

Lys Ala Ile Asp Gly Val Thr Asn Lys Val Asn Ser Ile Ile Asn Lys<br />

385 390 395 400<br />

Met Asn Thr Gln Phe Glu Ala Val Gly Arg Glu Phe Asn Asn Leu Glu<br />

405 410 415<br />

Arg Arg Ile Glu Asn Leu Asn Lys Lys Met Glu Asp Gly Phe Leu Asp<br />

420 425 430<br />

Val Trp Thr Tyr Asn Ala Glu Leu Leu Val Leu Met Glu Asn Glu Arg<br />

435 440 445<br />

Thr Leu Asp Phe His Asp Ser Asn Val Lys Asn Leu Tyr Asp Lys Val<br />

450 455 460<br />

- <strong>12</strong>3 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


Arg Leu Gln Leu Arg Asp Asn Ala Lys Glu Leu Gly Asn Gly Cys Phe<br />

465 470 475 480<br />

Glu Phe Tyr His Lys Cys Asp Asn Glu Cys Met Glu Ser Val Lys Asn<br />

485 490 495<br />

Gly Thr Tyr Asp Tyr Pro Gln Tyr Ser Glu Glu Ala Arg Leu Asn Arg<br />

500 505 510<br />

Glu Glu Ile Ser Gly Val Lys Leu Glu Ser Met Gly Thr Tyr Gln Ile<br />

515 520 525<br />

Leu Ser Ile Tyr Ser Thr Val Ala Ser Ser Leu Ala Leu Ala Ile Met<br />

530 535 540<br />

Val Ala Gly Leu Ser Leu Trp Met Cys Ser Asn Gly Ser Leu Gln Cys<br />

545 550 555 560<br />

Arg Ile Cys Ile<br />

16<br />

450<br />

PRT<br />

Influenza A virus<br />

16<br />

Met Asn Pro Asn Gln Lys Ile Ile Thr Ile Gly Ser Ile Cys Met Val<br />

1 5 10 15<br />

Val Gly Ile Ile Ser Leu Met Leu Gln Ile Gly Asn Thr Ile Ser Val<br />

20 25 30<br />

Trp Val Ser His Ile Ile Lys Thr Trp His Pro Asn Gln Pro Glu Pro<br />

35 40 45<br />

- <strong>12</strong>4 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


Cys Asn Gln Ser Ile Asn Phe Tyr Thr Glu Gln Ala Ala Ala Ser Val<br />

50 55 60<br />

Thr Leu Ala Gly Asn Ser Ser Leu Cys Pro Ile Ser Gly Trp Ala Ile<br />

65 70 75 80<br />

Tyr Ser Lys Asp Asn Ser Ile Arg Ile Gly Ser Lys Gly Asp Val Phe<br />

85 90 95<br />

Val Ile Arg Glu Pro Phe Ile Ser Cys Ser His Leu Glu Cys Arg Thr<br />

100 105 110<br />

Phe Phe Leu Thr Gln Gly Ala Leu Leu Asn Asp Lys His Ser Asn Gly<br />

115 <strong>12</strong>0 <strong>12</strong>5<br />

Thr Val Lys Asp Arg Ser Pro Tyr Arg Thr Leu Met Ser Cys Pro Val<br />

130 135 140<br />

Gly Glu Ala Pro Ser Pro Tyr Asn Ser Arg Phe Glu Ser Val Ala Trp<br />

145 150 155 160<br />

Ser Ala Ser Ala Cys His Asp Gly Ile Ser Trp Leu Thr Ile Gly Ile<br />

165 170 175<br />

Ser Gly Pro Asp Asn Gly Ala Val Ala Val Leu Lys Tyr Asn Gly Ile<br />

180 185 <strong>19</strong>0<br />

Ile Thr Asp Thr Ile Lys Ser Trp Arg Asn Asn Thr Leu Arg Thr Gln<br />

<strong>19</strong>5 200 205<br />

Glu Ser Glu Cys Ala Cys Val Asn Gly Ser Cys Phe Thr Val Met Thr<br />

210 215 220<br />

Asp Gly Pro Ser Asn Glu Gln Ala Ser Tyr Lys Ile Phe Lys Ile Glu<br />

225 230 235 240<br />

- <strong>12</strong>5 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


Lys Gly Arg Val Val Lys Ser Val Glu Leu Asn Ala Pro Asn Tyr His<br />

245 250 255<br />

Tyr Glu Glu Cys Ser Cys Tyr Pro Asp Ala Gly Glu Ile Thr Cys Val<br />

260 265 270<br />

Cys Arg Asp Asn Trp His Gly Ser Asn Arg Pro Trp Val Ser Phe Asn<br />

275 280 285<br />

Gln Asn Leu Glu Tyr Gln Ile Gly Tyr Ile Cys Ser Gly Val Phe Gly<br />

290 295 300<br />

Asp Ser Pro Arg Pro Asn Asp Gly Thr Gly Ser Cys Gly Pro Val Ser<br />

305 310 315 320<br />

Leu Asn Gly Ala Tyr Gly Val Lys Gly Phe Ser Phe Lys Tyr Gly Asn<br />

325 330 335<br />

Gly Val Trp Ile Gly Arg Thr Lys Ser Thr Ser Ser Arg Ser Gly Phe<br />

340 345 350<br />

Glu Met Ile Trp Asp Pro Asn Gly Trp Thr Glu Thr Asp Ser Ser Phe<br />

355 360 365<br />

Ser Leu Lys Gln Asp Ile Ile Ala Ile Thr Asp Trp Ser Gly Tyr Ser<br />

370 375 380<br />

Gly Ser Phe Ile Gln His Pro Glu Leu Thr Gly Leu Asn Cys Met Arg<br />

385 390 395 400<br />

Pro Cys Phe Trp Val Glu Leu Ile Arg Gly Arg Pro Lys Glu Lys Thr<br />

405 410 415<br />

Ile Trp Thr Ser Gly Ser Ser Ile Ser Phe Cys Gly Val Asn Ser Asp<br />

420 425 430<br />

- <strong>12</strong>6 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


Thr Val Gly Trp Ser Trp Pro Asp Gly Ala Glu Leu Pro Tyr Thr Ile<br />

435 440 445<br />

Asp Lys<br />

450<br />

17<br />

564<br />

PRT<br />

Influenza A virus<br />

17<br />

Met Glu Lys Ile Val Leu Leu Leu Ala Thr Val Ser Leu Val Lys Ser<br />

1 5 10 15<br />

Asp Gln Ile Cys Ile Gly Tyr His Ala Asn Asn Ser Thr Glu Gln Val<br />

20 25 30<br />

Asp Thr Ile Met Glu Lys Asn Val Thr Val Thr His Ala Gln Asp Ile<br />

35 40 45<br />

Leu Glu Arg Thr His Asn Gly Lys Leu Cys Asp Leu Asn Gly Val Lys<br />

50 55 60<br />

Pro Leu Ile Leu Arg Asp Cys Ser Val Ala Gly Trp Leu Leu Gly Asn<br />

65 70 75 80<br />

Pro Met Cys Asp Glu Phe Ile Asn Val Pro Glu Trp Ser Tyr Ile Val<br />

85 90 95<br />

Glu Lys Ala Ser Pro Ala Asn Asp Leu Cys Tyr Pro Gly Asn Phe Asn<br />

100 105 110<br />

Asp Tyr Glu Glu Leu Lys His Leu Leu Ser Arg Ile Asn His Phe Glu<br />

115 <strong>12</strong>0 <strong>12</strong>5<br />

- <strong>12</strong>7 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


Lys Ile Gln Ile Ile Pro Lys Ser Ser Trp Ser Asn His Asp Ala Ser<br />

130 135 140<br />

Ser Gly Val Ser Ser Ala Cys Pro Tyr Leu Gly Arg Ser Ser Phe Phe<br />

145 150 155 160<br />

Arg Asn Val Val Trp Leu Ile Lys Lys Asn Ser Ser Tyr Pro Thr Ile<br />

165 170 175<br />

Lys Arg Ser Tyr Asn Asn Thr Asn Gln Glu Asp Leu Leu Val Leu Trp<br />

180 185 <strong>19</strong>0<br />

Gly Ile His His Pro Asn Asp Ala Ala Glu Gln Thr Arg Leu Tyr Gln<br />

<strong>19</strong>5 200 205<br />

Asn Pro Thr Thr Tyr Ile Ser Val Gly Thr Ser Thr Leu Asn Gln Arg<br />

210 215 220<br />

Leu Val Ser Glu Ile Ala Thr Arg Pro Lys Val Asn Gly Gln Ser Gly<br />

225 230 235 240<br />

Arg Met Glu Phe Phe Trp Thr Ile Leu Lys Pro Asn Asp Ala Ile Asn<br />

245 250 255<br />

Phe Glu Ser Asn Gly Asn Phe Ile Ala Pro Glu Tyr Ala Tyr Lys Ile<br />

260 265 270<br />

Val Lys Lys Gly Asp Ser Thr Ile Met Lys Ser Glu Leu Glu Tyr Gly<br />

275 280 285<br />

Asn Cys Asn Thr Lys Cys Gln Thr Pro Met Gly Ala Ile Asn Ser Ser<br />

290 295 300<br />

Met Pro Phe His Asn Ile His Pro Leu Thr Ile Gly Glu Cys Pro Lys<br />

305 310 315 320<br />

- <strong>12</strong>8 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


Tyr Val Lys Ser Asn Arg Leu Val Leu Ala Thr Gly Leu Arg Asn Thr<br />

325 330 335<br />

Pro Gln Arg Glu Thr Arg Gly Leu Phe Gly Ala Ile Ala Gly Phe Ile<br />

340 345 350<br />

Glu Gly Gly Trp Gln Gly Met Val Asp Gly Trp Tyr Gly Tyr His His<br />

355 360 365<br />

Ser Asn Glu Gln Gly Ser Gly Tyr Ala Ala Asp Gln Glu Ser Thr Gln<br />

370 375 380<br />

Lys Ala Ile Asp Gly Val Thr Asn Lys Val Asn Ser Ile Ile Asn Lys<br />

385 390 395 400<br />

Met Asn Thr Gln Phe Glu Ala Val Gly Arg Glu Phe Asn Asn Leu Glu<br />

405 410 415<br />

Arg Arg Ile Glu Asn Leu Asn Lys Lys Met Glu Asp Gly Phe Leu Asp<br />

420 425 430<br />

Val Trp Thr Tyr Asn Ala Glu Leu Leu Val Leu Met Glu Asn Glu Arg<br />

435 440 445<br />

Thr Leu Asp Phe His Asp Ser Asn Val Lys Asn Leu Tyr Asp Lys Val<br />

450 455 460<br />

Arg Leu Gln Leu Arg Asp Asn Ala Lys Glu Leu Gly Asn Gly Cys Phe<br />

465 470 475 480<br />

Glu Phe Tyr His Lys Cys Asp Asn Glu Cys Met Glu Ser Val Lys Asn<br />

485 490 495<br />

Gly Thr Tyr Asp Tyr Pro Gln Tyr Ser Glu Glu Ala Arg Leu Asn Arg<br />

500 505 510<br />

Glu Glu Ile Ser Gly Val Lys Leu Glu Ser Met Gly Thr Tyr Gln Ile<br />

- <strong>12</strong>9 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


515 520 525<br />

Leu Ser Ile Tyr Ser Thr Val Ala Ser Ser Leu Ala Leu Ala Ile Met<br />

530 535 540<br />

Val Ala Gly Leu Ser Leu Trp Met Cys Ser Asn Gly Ser Leu Gln Cys<br />

545 550 555 560<br />

Arg Ile Cys Ile<br />

18<br />

450<br />

PRT<br />

Influenza A virus<br />

18<br />

Met Asn Pro Asn Gln Lys Ile Ile Thr Ile Gly Ser Ile Cys Met Val<br />

1 5 10 15<br />

Val Gly Ile Ile Ser Leu Met Leu Gln Ile Gly Asn Thr Ile Ser Val<br />

20 25 30<br />

Trp Val Ser His Ile Ile Lys Thr Trp His Pro Asn Gln Pro Glu Pro<br />

35 40 45<br />

Cys Asn Gln Ser Ile Asn Phe Tyr Thr Glu Gln Ala Ala Ala Ser Val<br />

50 55 60<br />

Thr Leu Ala Gly Asn Ser Ser Leu Cys Pro Ile Ser Gly Trp Ala Ile<br />

65 70 75 80<br />

Tyr Ser Lys Asp Asn Ser Ile Arg Ile Gly Ser Lys Gly Asp Val Phe<br />

85 90 95<br />

Val Ile Arg Glu Pro Phe Ile Ser Cys Ser His Leu Glu Cys Arg Thr<br />

- 130 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


100 105 110<br />

Phe Phe Leu Thr Gln Gly Ala Leu Leu Asn Asp Lys His Ser Asn Gly<br />

115 <strong>12</strong>0 <strong>12</strong>5<br />

Thr Val Lys Asp Arg Ser Pro Tyr Arg Thr Leu Met Ser Cys Pro Val<br />

130 135 140<br />

Gly Glu Ala Pro Ser Pro Tyr Asn Ser Arg Phe Glu Ser Val Ala Trp<br />

145 150 155 160<br />

Ser Ala Ser Ala Cys His Asp Gly Ile Ser Trp Leu Thr Ile Gly Ile<br />

165 170 175<br />

Ser Gly Pro Asp Asn Gly Ala Val Ala Val Leu Lys Tyr Asn Gly Ile<br />

180 185 <strong>19</strong>0<br />

Ile Thr Asp Thr Ile Lys Ser Trp Arg Asn Asn Thr Leu Arg Thr Gln<br />

<strong>19</strong>5 200 205<br />

Glu Ser Glu Cys Ala Cys Val Asn Gly Ser Cys Phe Thr Val Met Thr<br />

210 215 220<br />

Asp Gly Pro Ser Asn Glu Gln Ala Ser Tyr Lys Ile Phe Lys Ile Glu<br />

225 230 235 240<br />

Lys Gly Arg Val Val Lys Ser Val Glu Leu Asn Ala Pro Asn Tyr His<br />

245 250 255<br />

Tyr Glu Glu Cys Ser Cys Tyr Pro Asp Ala Gly Glu Ile Thr Cys Val<br />

260 265 270<br />

Cys Arg Asp Asn Trp His Gly Ser Asn Arg Pro Trp Val Ser Phe Asn<br />

275 280 285<br />

Gln Asn Leu Glu Tyr Gln Ile Gly Tyr Ile Cys Ser Gly Val Phe Gly<br />

- 131 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


290 295 300<br />

Asp Ser Pro Arg Pro Asn Asp Gly Thr Gly Ser Cys Gly Pro Val Ser<br />

305 310 315 320<br />

Leu Asn Gly Ala Tyr Gly Val Lys Gly Phe Ser Phe Lys Tyr Gly Asn<br />

325 330 335<br />

Gly Val Trp Ile Gly Arg Thr Lys Ser Thr Ser Ser Arg Ser Gly Phe<br />

340 345 350<br />

Glu Met Ile Trp Asp Pro Asn Gly Trp Thr Glu Thr Asp Ser Ser Phe<br />

355 360 365<br />

Ser Leu Lys Gln Asp Ile Ile Ala Ile Thr Asp Trp Ser Gly Tyr Ser<br />

370 375 380<br />

Gly Ser Phe Ile Gln His Pro Glu Leu Thr Gly Leu Asn Cys Met Arg<br />

385 390 395 400<br />

Pro Cys Phe Trp Val Glu Leu Ile Arg Gly Arg Pro Lys Glu Lys Thr<br />

405 410 415<br />

Ile Trp Thr Ser Gly Ser Ser Ile Ser Phe Cys Gly Val Asn Ser Asp<br />

420 425 430<br />

Thr Val Gly Trp Ser Trp Pro Asp Gly Ala Glu Leu Pro Tyr Thr Ile<br />

435 440 445<br />

Asp Lys<br />

450<br />

<strong>19</strong><br />

558<br />

PRT<br />

Influenza A virus<br />

<strong>19</strong><br />

- 132 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


Met Glu Ala Ile Pro Leu Ile Thr Ile Leu Leu Val Val Thr Ala Ser<br />

1 5 10 15<br />

Asn Ala Asp Lys Ile Cys Ile Gly Tyr Gln Ser Thr Asn Ser Thr Glu<br />

20 25 30<br />

Thr Val Asp Thr Leu Thr Glu Asn Asn Val Pro Val Thr His Ala Lys<br />

35 40 45<br />

Glu Leu Leu His Thr Glu His Asn Gly Met Leu Cys Ala Thr Asn Leu<br />

50 55 60<br />

Gly Arg Pro Leu Ile Leu Asp Thr Cys Thr Ile Glu Gly Leu Ile Tyr<br />

65 70 75 80<br />

Gly Asn Pro Ser Cys Asp Leu Leu Leu Gly Gly Arg Glu Trp Ser Tyr<br />

85 90 95<br />

Ile Val Glu Arg Pro Ser Ala Val Asn Gly Met Cys Tyr Pro Gly Asn<br />

100 105 110<br />

Val Glu Asn Leu Glu Glu Leu Arg Ser Phe Phe Ser Ser Ala Ser Ser<br />

115 <strong>12</strong>0 <strong>12</strong>5<br />

Tyr Gln Arg Ile Gln Ile Phe Pro Asp Thr Ile Trp Asn Val Ser Tyr<br />

130 135 140<br />

Ser Gly Thr Ser Lys Ala Cys Ser Asp Ser Phe Tyr Arg Ser Met Arg<br />

145 150 155 160<br />

Trp Leu Thr Gln Lys Asn Asn Ala Tyr Pro Ile Gln Asp Ala Gln Tyr<br />

165 170 175<br />

Thr Asn Asn Arg Gly Lys Ser Ile Leu Phe Met Trp Gly Ile Asn His<br />

180 185 <strong>19</strong>0<br />

- 133 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


Pro Pro Thr Asp Thr Ala Gln Thr Asn Leu Tyr Thr Arg Thr Asp Thr<br />

<strong>19</strong>5 200 205<br />

Thr Thr Ser Val Ala Thr Glu Asp Ile Asn Arg Thr Phe Lys Pro Val<br />

210 215 220<br />

Ile Gly Pro Arg Pro Leu Val Asn Gly Leu Gln Gly Arg Ile Asp Tyr<br />

225 230 235 240<br />

Tyr Trp Ser Val Leu Lys Pro Gly Gln Thr Leu Arg Val Arg Ser Asn<br />

245 250 255<br />

Gly Asn Leu Ile Ala Pro Trp Tyr Gly His Ile Leu Ser Gly Glu Ser<br />

260 265 270<br />

His Gly Arg Ile Leu Lys Thr Asp Leu Asn Ser Gly Ser Cys Val Val<br />

275 280 285<br />

Gln Cys Gln Thr Glu Arg Gly Gly Leu Asn Thr Thr Leu Pro Phe His<br />

290 295 300<br />

Asn Val Ser Lys Tyr Ala Phe Gly Asn Cys Pro Lys Tyr Val Gly Val<br />

305 310 315 320<br />

Lys Ser Leu Lys Leu Ala Val Gly Leu Arg Asn Val Pro Ala Arg Ser<br />

325 330 335<br />

Ser Arg Gly Leu Phe Gly Ala Ile Ala Gly Phe Ile Glu Gly Gly Trp<br />

340 345 350<br />

Ser Gly Leu Val Ala Gly Trp Tyr Gly Phe Gln His Ser Asn Asp Gln<br />

355 360 365<br />

Gly Val Gly Ile Ala Ala Asp Arg Asp Ser Thr Gln Arg Ala Ile Asp<br />

370 375 380<br />

- 134 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


Lys Ile Thr Ser Lys Val Asn Asn Ile Val Asp Lys Met Asn Lys Gln<br />

385 390 395 400<br />

Tyr Glu Ile Ile Asp His Glu Phe Ser Glu Val Glu Asn Arg Leu Asn<br />

405 410 415<br />

Met Ile Asn Asn Lys Ile Asp Asp Gln Ile Gln Asp Ile Trp Ala Tyr<br />

420 425 430<br />

Asn Ala Glu Leu Leu Val Leu Leu Glu Asn Gln Lys Thr Leu Asp Glu<br />

435 440 445<br />

His Asp Ala Asn Val Asn Asn Leu Tyr Asn Lys Val Lys Arg Ala Leu<br />

450 455 460<br />

Gly Ser Asn Ala Met Glu Asp Gly Lys Gly Cys Phe Glu Leu Tyr His<br />

465 470 475 480<br />

Lys Cys Asp Asp Gln Cys Met Glu Thr Ile Arg Asn Gly Thr Tyr Asn<br />

485 490 495<br />

Arg Arg Lys Tyr Lys Glu Glu Ser Arg Leu Glu Arg Gln Lys Ile Glu<br />

500 505 510<br />

Gly Val Lys Leu Glu Ser Glu Gly Thr Tyr Lys Ile Leu Thr Ile Tyr<br />

515 520 525<br />

Ser Thr Val Ala Ser Ser Leu Val Ile Ala Met Gly Phe Ala Ala Phe<br />

530 535 540<br />

Leu Phe Trp Ala Met Ser Asn Gly Ser Cys Arg Cys Asn Ile<br />

545 550 555<br />

20<br />

469<br />

PRT<br />

- 135 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


Influenza A virus<br />

20<br />

Met Asn Pro Asn Gln Lys Ile Ile Ala Ile Gly Ser Val Ser Leu Thr<br />

1 5 10 15<br />

Ile Ala Thr Ile Cys Leu Leu Met Gln Ile Ala Ile Leu Ala Thr Thr<br />

20 25 30<br />

Met Thr Leu His Phe Lys Gln Asn Glu Cys Ile Asn Ser Ser Asn Asn<br />

35 40 45<br />

Gln Val Val Pro Cys Glu Pro Ile Ile Ile Glu Arg Asn Ile Thr Glu<br />

50 55 60<br />

Ile Val His Leu Asn Ser Thr Thr Leu Glu Lys Glu Ile Cys Pro Lys<br />

65 70 75 80<br />

Val Ala Asp Tyr Arg Asn Trp Ser Lys Pro Gln Cys Gln Ile Thr Gly<br />

85 90 95<br />

Phe Ala Pro Phe Ser Lys Asp Asn Ser Ile Arg Leu Ser Ala Gly Gly<br />

100 105 110<br />

Asp Ile Trp Val Thr Arg Glu Pro Tyr Val Ser Cys Gly Leu Gly Lys<br />

115 <strong>12</strong>0 <strong>12</strong>5<br />

Cys Tyr Gln Phe Ala Leu Gly Gln Gly Thr Thr Leu Glu Asn Lys His<br />

130 135 140<br />

Ser Asn Gly Thr Ala His Asp Arg Thr Pro His Arg Thr Leu Leu Met<br />

145 150 155 160<br />

Asn Glu Leu Gly Val Pro Phe His Leu Ala Thr Lys Gln Val Cys Ile<br />

165 170 175<br />

- 136 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


Ala Trp Ser Ser Ser Ser Cys His Asp Gly Lys Ala Trp Leu His Val<br />

180 185 <strong>19</strong>0<br />

Cys Val Thr Gly Asp Asp Arg Asn Ala Thr Ala Ser Ile Ile Tyr Asp<br />

<strong>19</strong>5 200 205<br />

Gly Ile Leu Val Asp Ser Ile Gly Ser Trp Ser Lys Asn Ile Leu Arg<br />

210 215 220<br />

Thr Gln Glu Ser Glu Cys Val Cys Ile Asn Gly Thr Cys Ala Val Val<br />

225 230 235 240<br />

Met Thr Asp Gly Ser Ala Ser Gly Arg Ala Asp Thr Arg Ile Leu Phe<br />

245 250 255<br />

Ile Arg Glu Gly Lys Ile Ala His Ile Ser Pro Leu Ser Gly Ser Ala<br />

260 265 270<br />

Gln His Val Glu Glu Cys Ser Cys Tyr Pro Arg Tyr Pro Glu Val Arg<br />

275 280 285<br />

Cys Val Cys Arg Asp Asn Trp Lys Gly Ser Asn Arg Pro Val Leu Tyr<br />

290 295 300<br />

Ile Asn Met Ala Asn Tyr Ser Ile Asp Ser Ser Tyr Val Cys Ser Gly<br />

305 310 315 320<br />

Leu Val Gly Asp Thr Pro Arg Asn Asp Asp Arg Ser Ser Ser Ser Asn<br />

325 330 335<br />

Cys Arg Asp Pro Asn Asn Glu Arg Gly Ala Pro Gly Val Lys Gly Trp<br />

340 345 350<br />

Ala Phe Asp Asn Gly Asn Asp Ile Trp Met Gly Arg Thr Ile Lys Lys<br />

355 360 365<br />

- 137 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


Asp Ser Arg Ser Gly Tyr Glu Thr Phe Arg Val Ile Gly Gly Trp Thr<br />

370 375 380<br />

Thr Ala Asn Ser Lys Ser Gln Ile Asn Arg Gln Val Ile Val Asp Ser<br />

385 390 395 400<br />

Asp Asn Ser Ser Gly Tyr Ser Gly Ile Phe Ser Val Glu Gly Lys Ser<br />

405 410 415<br />

Cys Ile Asn Arg Cys Phe Tyr Val Glu Leu Ile Arg Gly Arg Pro Lys<br />

420 425 430<br />

Glu Thr Arg Val Trp Trp Thr Ser Asn Ser Ile Ile Val Phe Cys Gly<br />

435 440 445<br />

Thr Ser Gly Thr Tyr Gly Thr Gly Ser Trp Pro Asp Gly Ala Asn Ile<br />

450 455 460<br />

Asn Phe Met Pro Ile<br />

465<br />

21<br />

1737<br />

DNA<br />

Influenza A virus<br />

21<br />

agcaaaagca ggggatacaa aatgaacact caaatcctgg tattcgctct ggtggcgagc 60<br />

attccgacaa atgcagacaa gatctgcctt gggcatcatg ccgtgtcaaa cgggactaaa <strong>12</strong>0<br />

gtaaacacat taactgagag aggagtggaa gtcgttaatg caactgaaac ggtggaacga 180<br />

acaaacgttc ccaggatctg ctcaaaaggg aaaaggacag ttgacctcgg tcaatgtgga 240<br />

cttctgggaa caatcactgg gccaccccaa tgtgaccaat tcctagaatt ttcggccgac 300<br />

- 138 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


ttaattattg agaggcgaga aggaagtgat gtctgttatc ctgggaaatt cgtgaatgaa 360<br />

gaagctctga ggcaaattct cagagagtca ggcggaattg acaaggagac aatgggattc 420<br />

acctacagcg gaataagaac taatggaaca accagtgcat gtaggagatc aggatcttca 480<br />

ttctatgcag agatgaaatg gctcctgtca aacacagaca atgctgcttt cccgcaaatg 540<br />

actaagtcat acaagaacac aaggaaagac ccagctctga taatatgggg gatccaccat 600<br />

tccggatcaa ctacagaaca gaccaagcta tatgggagtg gaaacaaact gataacagtt 660<br />

gggagttcta attaccaaca gtcctttgta ccgagtccag gagcgagacc acaagtgaat 720<br />

ggccaatctg gaagaattga ctttcattgg ctgatactaa accctaatga cacggtcact 780<br />

ttcagtttca atggggcctt catagctcca gaccgtgcaa gctttctgag agggaagtcc 840<br />

atgggaattc agagtgaagt acaggttgat gccaattgtg aaggagattg ctatcatagt 900<br />

ggagggacaa taataagtaa tttgcccttt cagaacataa atagcagggc agtaggaaaa 960<br />

tgtccgagat atgttaagca agagagtctg ctgttggcaa caggaatgaa gaatgttccc 1020<br />

gaaatcccaa agaggaggag gagaggccta tttggtgcta tagcgggttt cattgaaaat 1080<br />

ggatgggaag gtttgattga tgggtggtat ggcttcaggc atcaaaatgc acaaggggag 1140<br />

ggaactgctg cagattacaa aagcacccaa tcagcaattg atcaaataac agggaaatta <strong>12</strong>00<br />

aatcggctta tagaaaaaac taaccaacag tttgagttaa tagacaacga attcactgag <strong>12</strong>60<br />

gttgaaaggc aaattggcaa tgtgataaac tggaccagag attccatgac agaagtgtgg 1320<br />

tcctataacg ctgaactctt agtagcaatg gagaatcagc acacaattga tctggccgac 1380<br />

tcagaaatga acaaactgta cgaacgagtg aagagacaac tgagagagaa tgccgaagaa 1440<br />

gatggcactg gttgcttcga aatatttcac aagtgtgatg acgactgcat ggccagtatt 1500<br />

- 139 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


agaaacaaca cctatgatca cagcaagtac agggaagaag caatacaaaa tagaatacag 1560<br />

attgacccag tcaaactaag cagcggctac aaagatgtga tactttggtt tagcttcggg 1620<br />

gcatcatgtt tcatacttct ggccattgca atgggccttg tcttcatatg tgtgaagaat 1680<br />

ggaaacatgc ggtgcactat ttgtatataa gtttggaaaa acacccttgt ttctact 1737<br />

22<br />

1465<br />

DNA<br />

Influenza A virus<br />

22<br />

agcaaaagca gggtgatcga gaatgaatcc aaatcagaaa ctatttgcat tatctggagt 60<br />

ggcaatagca cttagtgtac tgaacttatt gataggaatc tcaaacgtcg gattgaacgt <strong>12</strong>0<br />

atctctacat ctaaaggaaa aaggacccaa acaggaggag aatttaacat gcacgaccat 180<br />

taatcaaaac aacactactg tagtagaaaa cacatatgta aataatacaa caataattac 240<br />

caagggaact gatttgaaaa caccaagcta tctgctgttg aacaagagcc tgtgcaatgt 300<br />

tgaagggtgg gtcgtgatag caaaagacaa tgcagtaaga tttggggaaa gtgaacaaat 360<br />

cattgttacc agggagccat atgtatcatg cgacccaaca ggatgcaaaa tgtatgcctt 420<br />

gcaccaaggg actaccatta ggaacaaaca ttcaaatgga acgattcatg acagaacagc 480<br />

tttcagaggt ctcatctcca ctccattggg cactccacca accgtaagta acagtgactt 540<br />

tatgtgtgtt ggatggtcaa gcacaacttg ccatgatggg attgctagga tgactatctg 600<br />

tatacaagga aataatgaca atgctacagc aacggtttat tacaacagaa ggctgaccac 660<br />

taccattaag acctgggcca gaaacattct gaggactcaa gaatcagaat gtgtgtgcca 720<br />

- 140 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


caatggcaca tgtgcagttg taatgaccga cggatcggct agtagtcaag cctatacaaa 780<br />

agtaatgtat ttccacaagg gattagtagt taaggaggag gagttaaggg gatcagccag 840<br />

acatattgag gaatgctcct gttatggaca caatcaaaag gtgacctgtg tgtgcagaga 900<br />

taactggcag ggagcaaaca ggcctattat agaaattgat atgagcacat tggagcacac 960<br />

aagtagatac gtgtgcactg gaattctcac agacaccagc agacctgggg acaaatctag 1020<br />

tggtgattgt tccaatccaa taactgggag tcccggcgtt ccgggagtga agggattcgg 1080<br />

gtttctaaat ggggataaca catggcttgg taggaccatc agccccagat caagaagtgg 1140<br />

attcgaaatg ttgaaaatac ctaatgcagg tactgatccc aattctagaa tagcagaacg <strong>12</strong>00<br />

acaggaaatt gtcgacaata acaattggtc aggctattcc ggaagcttta ttgactattg <strong>12</strong>60<br />

gaatgataac agtgaatgct acaatccatg cttttacgta gagttaatta gaggaagacc 1320<br />

cgaagaggct aaatacgtat ggtgggcaag taacagtcta attgccctat gtggaagccc 1380<br />

attcccagtt gggtctggtt ccttccccga tggggcacaa atccaatact tttcgtaaaa 1440<br />

tgcaaaaaaa ctccttgttt ctact 1465<br />

23<br />

1754<br />

DNA<br />

Influenza A virus<br />

23<br />

agcaaaagca ggggatacaa aatgaatact caaattttgg cattcattgc ttgtatgctg 60<br />

attggaacta aaggagacaa aatatgtctt gggcaccatg ctgtggcaaa tgggacaaaa <strong>12</strong>0<br />

gtgaacacac taacagagag gggaattgaa gtagtcaatg ccacggagac ggtggaaact 180<br />

gtaaatatta aaaaaatatg cactcaagga aaaaggccaa cagatctggg acaatgtgga 240<br />

- 141 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


cttctaggaa ccctaatagg acctccccaa tgcgatcaat ttctggagtt tgacgctaat 300<br />

ttgataattg aacgaagaga aggaaccgat gtgtgctatc ccgggaagtt cacaaatgaa 360<br />

gaatcactga ggcagatcct tcgagggtca ggaggaattg ataaagagtc aatgggtttc 420<br />

acctatagtg gaataagaac caatggggcg acgagtgcct gcagaagatc aggttcttct 480<br />

ttctatgcgg agatgaagtg gttactgtcg aattcagaca atgcggcatt tccccaaatg 540<br />

actaagtcgt ataggaatcc caggaacaaa ccagctctga taatctgggg agtgcatcac 600<br />

tctggatcag ctactgagca gaccaaactc tatggaagtg gaaacaagtt gataacagta 660<br />

ggaagctcga aataccagca atcattcact ccaagtccgg gagcacggcc acaagtgaat 720<br />

ggacaatcag gaaggattga ttttcattgg ctactccttg accccaatga cacagtgacc 780<br />

ttcactttca atggggcatt catagcccct gacagggcaa gtttctttag aggagaatcg 840<br />

ctaggagtcc agagtgatgt tcctttggat tctggttgtg aaggggattg cttccacagt 900<br />

gggggtacga tagtcagttc cctgccattc caaaacatca accctagaac agtggggaaa 960<br />

tgccctcgat atgtcaaaca gacaagcctc cttttggcta caggaatgag aaacgtccca 1020<br />

gagaacccca agcaggccta ccggaaacgg atgaccagag gcctttttgg agcgattgct 1080<br />

ggattcatag agaatggatg ggaaggtctc atcgatggat ggtatggttt cagacatcaa 1140<br />

aatgcacaag gagaaggaac tgcagctgac tacaaaagca cccaatctgc aatagatcag <strong>12</strong>00<br />

atcacaggca aattgaatcg tctgattgac aaaacaaacc agcagtttga actgatagac <strong>12</strong>60<br />

aatgaattca gtgagataga acaacaaatc gggaatgtca ttaactggac acgagactca 1320<br />

atgactgagg tatggtcgta taatgctgag ctgttggtgg caatggagaa tcagcataca 1380<br />

- 142 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


atagatcttg cagactcaga aatgaacaaa ctttacgaac gcgtcagaaa acaactaagg 1440<br />

gaaaatgctg aagaagatgg aactggatgc tttgagatat tccataagtg tgatgatcag 1500<br />

tgtatggaga gcataaggaa caacacttat gaccataccc aatacaggac agagtcattg 1560<br />

cagaatagaa tacagataga cccagtgaaa ttgagtagtg gatacaaaga cataatctta 1620<br />

tggtttagct tcggggcatc atgttttctt cttctagcca ttgcaatggg attggttttc 1680<br />

atttgcataa agaatggaaa catgcggtgc actatttgta tatagtttga gaaaaaaaca 1740<br />

cccttgtttc tact 1754<br />

24<br />

1453<br />

DNA<br />

Influenza A virus<br />

24<br />

agcaaaagca ggtgcgagat gaatccgaat cagaagataa taacaatcgg ggtagtgaat 60<br />

accactctgt caacaatagc ccttctcatt ggagtgggaa acttagtttt caacacagtc <strong>12</strong>0<br />

atacatgaga aaataggaga ccatcaaata gtgacccatc caacaataat gacccctgaa 180<br />

gtaccgaact gcagtgacac tataataaca tacaataaca ctgttataaa caacataaca 240<br />

acaacaataa taactgaagc agaaaggcct ttcaagtctc cactaccgct gtgccccttc 300<br />

agaggattct tcccttttca caaggacaat gcaatacgac tgggtgaaaa caaagacgtc 360<br />

atagtcacaa gggagcctta tgttagctgc gataatgaca actgctggtc ctttgctctc 420<br />

gcacaaggag cattgctagg gactaaacat agcaatggga ccattaaaga cagaacacca 480<br />

tataggtctc taattcgttt cccaatagga acagctccag tactaggaaa ttacaaagag 540<br />

atatgcattg cttggtcgag cagcagttgc tttgacggga aagagtggat gcatgtgtgc 600<br />

- 143 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


atgacaggga atgataatga tgcaagtgcc cagataatat atggaggaag aatgacagac 660<br />

tccattaaat catggaggaa ggacatacta agaacccagg agtctgaatg tcaatgcatt 720<br />

gacgggactt gtgttgttgc tgtcacagat ggccctgctg ctaatagtgc agatcacagg 780<br />

gtttactgga tacgggaggg aagaataata aagtatgaaa atgttcccaa aacaaagata 840<br />

caacacttag aagaatgttc ctgctatgtg gacattgatg tttactgtat atgtagggac 900<br />

aattggaagg gctctaacag accttggatg agaatcaaca acgagactat actggaaaca 960<br />

ggatatgtat gtagtaaatt tcactcagac acccccaggc cagctgaccc ttcaataatg 1020<br />

tcatgtgact ccccaagcaa tgtcaatgga ggacccggag tgaaggggtt tggtttcaaa 1080<br />

gctggcaatg atgtatggtt aggtagaaca gtgtcaacta gtggtagatc gggctttgaa 1140<br />

attatcaaag ttacagaagg gtggatcaac tctcctaacc atgtcaaatc aattacacaa <strong>12</strong>00<br />

acactagtgt ccaacaatga ctggtcaggc tattcaggta gcttcattgt caaagccaag <strong>12</strong>60<br />

gactgttttc agccctgttt ttatgttgag cttatacgag ggaggcccaa caagaatgat 1320<br />

gacgtctctt ggacaagtaa tagtatagtt actttctgtg gactagacaa tgaacctgga 1380<br />

tcgggaaatt ggccagatgg ttctaacatt gggtttatgc ccaagtaata gaaaaaagca 1440<br />

ccttgtttct act 1453<br />

25<br />

1733<br />

DNA<br />

Influenza A virus<br />

25<br />

agcgaaagca ggggatacaa aatgaatact caaattttgg cattcattgc ttgtatgctg 60<br />

- 144 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


attggaacta aaggagacaa aatatgtctt gggcaccatg ctgtggcaaa tgggacaaaa <strong>12</strong>0<br />

gtgaacacac taacagagag gggaattgaa gtagtcaatg ccacggagac ggtggaaact 180<br />

gtaaatatta agaaaatatg cactcaagga aaaaggccaa cagatctggg acaatgtgga 240<br />

cttctaggaa ccctaatagg acctccccaa tgcgatcaat ttctggagtt tgacgctaat 300<br />

ttgataattg aacgaagaga aggaaccgat gtgtgctatc ccgggaagtt cacaaatgaa 360<br />

gaatcactga ggcagatcct tcgagggtca ggaggaattg ataaagagtc aatgggtttc 420<br />

acctatagtg gaataagaac caatggggcg acgagtgcct gcagaagatc aggttcttct 480<br />

ttctatgcgg agatgaagtg gttactgtcg aattcagaca atgcggcatt tccccaaatg 540<br />

actaagtcgt ataggaatcc caggaacaaa ccagctctga taatctgggg agtgcatcac 600<br />

tctggatcag ctactgagca gaccaaactc tatggaagtg gaaacaagtt gataacagta 660<br />

ggaagctcga aataccagca atcattcact ccaagtccgg gagcacggcc acaagtgaat 720<br />

ggacaatcag gaaggattga ttttcattgg ctactccttg accccaatga cacagtgacc 780<br />

ttcactttca atggggcatt catagcccct gacagggcaa gtttctttag aggagaatcg 840<br />

ctaggagtcc agagtgatgt tcctttggat tctggttgtg aaggggattg cttccacagt 900<br />

gggggtacga tagtcagttc cctgccattc caaaacatca accctagaac agtggggaaa 960<br />

tgccctcgat atgtcaaaca gacaagcctc cttttggcta caggaatgag aaacgtccca 1020<br />

gagaacccca agaccagagg cctttttgga gcgattgctg gattcataga gaatggatgg 1080<br />

gaaggtctca tcgatggatg gtatggtttc agacatcaaa atgcacaagg agaaggaact 1140<br />

gcagctgact acaaaagcac ccaatctgca atagatcaga tcacaggcaa attgaatcgt <strong>12</strong>00<br />

ctgattgaca aaacaaacca gcagtttgaa ctgatagaca atgaattcag tgagatagaa <strong>12</strong>60<br />

- 145 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


caacaaatcg ggaatgtcat taactggaca cgagactcaa tgactgaggt atggtcgtat 1320<br />

aatgctgagc tgttggtggc aatggagaat cagcatacaa tagatcttgc agactcagaa 1380<br />

atgaacaaac tttacgaacg cgtcagaaaa caactaaggg aaaatgctga agaagatgga 1440<br />

actggatgct ttgagatatt ccataagtgt gatgatcagt gtatggagag cataaggaac 1500<br />

aacacttatg accataccca atacaggaca gagtcattgc agaatagaat acagatagac 1560<br />

ccagtgaaat tgagtagtgg atacaaagac ataatcttat ggtttagctt cggggcatca 1620<br />

tgttttcttc ttctagccat tgcaatggga ttggttttca tttgcataaa gaatggaaac 1680<br />

atgcggtgca ctatttgtat atagtttgag aaaaaaacac ccttgtttct act 1733<br />

26<br />

1453<br />

DNA<br />

Influenza A virus<br />

26<br />

agcaaaagca ggtgcgagat gaatccgaat cagaagataa taacaatcgg ggtagtgaat 60<br />

accactctgt caacaatagc ccttctcatt ggagtgggaa acttagtttt caacacagtc <strong>12</strong>0<br />

atacatgaga aaataggaga ccatcaaata gtgacccatc caacaataat gacccctgaa 180<br />

gtaccgaact gcagtgacac tataataaca tacaataaca ctgttataaa caacataaca 240<br />

acaacaataa taactgaagc agaaaggcct ttcaagtctc cactaccgct gtgccccttc 300<br />

agaggattct tcccttttca caaggacaat gcaatacgac tgggtgaaaa caaagacgtc 360<br />

atagtcacaa gggagcctta tgttagctgc gataatgaca actgctggtc ctttgctctc 420<br />

gcacaaggag cattgctagg gactaaacat agcaatggga ccattaaaga cagaacacca 480<br />

- 146 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


tataggtctc taattcgttt cccaatagga acagctccag tactaggaaa ttacaaagag 540<br />

atatgcattg cttggtcgag cagcagttgc tttgacggga aagagtggat gcatgtgtgc 600<br />

atgacaggga atgataatga tgcaagtgcc cagataatat atggaggaag aatgacagac 660<br />

tccattaaat catggaggaa ggacatacta agaacccagg agtctgaatg tcaatgcatt 720<br />

gacgggactt gtgttgttgc tgtcacagat ggccctgctg ctaatagtgc agatcacagg 780<br />

gtttactgga tacgggaggg aagaataata aagtatgaaa atgttcccaa aacaaagata 840<br />

caacacttag aagaatgttc ctgctatgtg gacattgatg tttactgtat atgtagggac 900<br />

aattggaagg gctctaacag accttggatg agaatcaaca acgagactat actggaaaca 960<br />

ggatatgtat gtagtaaatt tcactcagac acccccaggc cagctgaccc ttcaataatg 1020<br />

tcatgtgact ccccaagcaa tgtcaatgga ggacccggag tgaaggggtt tggtttcaaa 1080<br />

gctggcaatg atgtatggtt aggtagaaca gtgtcaacta gtggtagatc gggctttgaa 1140<br />

attatcaaag ttacagaagg gtggatcaac tctcctaacc atgtcaaatc aattacacaa <strong>12</strong>00<br />

acactagtgt ccaacaatga ctggtcaggc tattcaggta gcttcattgt caaagccaag <strong>12</strong>60<br />

gactgttttc agccctgttt ttatgttgag cttatacgag ggaggcccaa caagaatgat 1320<br />

gacgtctctt ggacaagtaa tagtatagtt actttctgtg gactagacaa tgaacctgga 1380<br />

tcgggaaatt ggccagatgg ttctaacatt gggtttatgc ccaagtaata gaaaaaagca 1440<br />

ccttgtttct act 1453<br />

27<br />

562<br />

PRT<br />

Influenza A virus<br />

- 147 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


27<br />

Met Asn Thr Gln Ile Leu Val Phe Ala Leu Val Ala Ser Ile Pro Thr<br />

1 5 10 15<br />

Asn Ala Asp Lys Ile Cys Leu Gly His His Ala Val Ser Asn Gly Thr<br />

20 25 30<br />

Lys Val Asn Thr Leu Thr Glu Arg Gly Val Glu Val Val Asn Ala Thr<br />

35 40 45<br />

Glu Thr Val Glu Arg Thr Asn Val Pro Arg Ile Cys Ser Lys Gly Lys<br />

50 55 60<br />

Arg Thr Val Asp Leu Gly Gln Cys Gly Leu Leu Gly Thr Ile Thr Gly<br />

65 70 75 80<br />

Pro Pro Gln Cys Asp Gln Phe Leu Glu Phe Ser Ala Asp Leu Ile Ile<br />

85 90 95<br />

Glu Arg Arg Glu Gly Ser Asp Val Cys Tyr Pro Gly Lys Phe Val Asn<br />

100 105 110<br />

Glu Glu Ala Leu Arg Gln Ile Leu Arg Glu Ser Gly Gly Ile Asp Lys<br />

115 <strong>12</strong>0 <strong>12</strong>5<br />

Glu Thr Met Gly Phe Thr Tyr Ser Gly Ile Arg Thr Asn Gly Thr Thr<br />

130 135 140<br />

Ser Ala Cys Arg Arg Ser Gly Ser Ser Phe Tyr Ala Glu Met Lys Trp<br />

145 150 155 160<br />

Leu Leu Ser Asn Thr Asp Asn Ala Ala Phe Pro Gln Met Thr Lys Ser<br />

165 170 175<br />

Tyr Lys Asn Thr Arg Lys Asp Pro Ala Leu Ile Ile Trp Gly Ile His<br />

- 148 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


180 185 <strong>19</strong>0<br />

His Ser Gly Ser Thr Thr Glu Gln Thr Lys Leu Tyr Gly Ser Gly Asn<br />

<strong>19</strong>5 200 205<br />

Lys Leu Ile Thr Val Gly Ser Ser Asn Tyr Gln Gln Ser Phe Val Pro<br />

210 215 220<br />

Ser Pro Gly Ala Arg Pro Gln Val Asn Gly Gln Ser Gly Arg Ile Asp<br />

225 230 235 240<br />

Phe His Trp Leu Ile Leu Asn Pro Asn Asp Thr Val Thr Phe Ser Phe<br />

245 250 255<br />

Asn Gly Ala Phe Ile Ala Pro Asp Arg Ala Ser Phe Leu Arg Gly Lys<br />

260 265 270<br />

Ser Met Gly Ile Gln Ser Glu Val Gln Val Asp Ala Asn Cys Glu Gly<br />

275 280 285<br />

Asp Cys Tyr His Ser Gly Gly Thr Ile Ile Ser Asn Leu Pro Phe Gln<br />

290 295 300<br />

Asn Ile Asn Ser Arg Ala Val Gly Lys Cys Pro Arg Tyr Val Lys Gln<br />

305 310 315 320<br />

Glu Ser Leu Leu Leu Ala Thr Gly Met Lys Asn Val Pro Glu Ile Pro<br />

325 330 335<br />

Lys Arg Arg Arg Arg Gly Leu Phe Gly Ala Ile Ala Gly Phe Ile Glu<br />

340 345 350<br />

Asn Gly Trp Glu Gly Leu Ile Asp Gly Trp Tyr Gly Phe Arg His Gln<br />

355 360 365<br />

Asn Ala Gln Gly Glu Gly Thr Ala Ala Asp Tyr Lys Ser Thr Gln Ser<br />

- 149 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


370 375 380<br />

Ala Ile Asp Gln Ile Thr Gly Lys Leu Asn Arg Leu Ile Glu Lys Thr<br />

385 390 395 400<br />

Asn Gln Gln Phe Glu Leu Ile Asp Asn Glu Phe Thr Glu Val Glu Arg<br />

405 410 415<br />

Gln Ile Gly Asn Val Ile Asn Trp Thr Arg Asp Ser Met Thr Glu Val<br />

420 425 430<br />

Trp Ser Tyr Asn Ala Glu Leu Leu Val Ala Met Glu Asn Gln His Thr<br />

435 440 445<br />

Ile Asp Leu Ala Asp Ser Glu Met Asn Lys Leu Tyr Glu Arg Val Lys<br />

450 455 460<br />

Arg Gln Leu Arg Glu Asn Ala Glu Glu Asp Gly Thr Gly Cys Phe Glu<br />

465 470 475 480<br />

Ile Phe His Lys Cys Asp Asp Asp Cys Met Ala Ser Ile Arg Asn Asn<br />

485 490 495<br />

Thr Tyr Asp His Ser Lys Tyr Arg Glu Glu Ala Ile Gln Asn Arg Ile<br />

500 505 510<br />

Gln Ile Asp Pro Val Lys Leu Ser Ser Gly Tyr Lys Asp Val Ile Leu<br />

515 520 525<br />

Trp Phe Ser Phe Gly Ala Ser Cys Phe Ile Leu Leu Ala Ile Ala Met<br />

530 535 540<br />

Gly Leu Val Phe Ile Cys Val Lys Asn Gly Asn Met Arg Cys Thr Ile<br />

545 550 555 560<br />

Cys Ile<br />

- 150 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


28<br />

471<br />

PRT<br />

Influenza A virus<br />

28<br />

Met Asn Pro Asn Gln Lys Leu Phe Ala Leu Ser Gly Val Ala Ile Ala<br />

1 5 10 15<br />

Leu Ser Val Leu Asn Leu Leu Ile Gly Ile Ser Asn Val Gly Leu Asn<br />

20 25 30<br />

Val Ser Leu His Leu Lys Glu Lys Gly Pro Lys Gln Glu Glu Asn Leu<br />

35 40 45<br />

Thr Cys Thr Thr Ile Asn Gln Asn Asn Thr Thr Val Val Glu Asn Thr<br />

50 55 60<br />

Tyr Val Asn Asn Thr Thr Ile Ile Thr Lys Gly Thr Asp Leu Lys Thr<br />

65 70 75 80<br />

Pro Ser Tyr Leu Leu Leu Asn Lys Ser Leu Cys Asn Val Glu Gly Trp<br />

85 90 95<br />

Val Val Ile Ala Lys Asp Asn Ala Val Arg Phe Gly Glu Ser Glu Gln<br />

100 105 110<br />

Ile Ile Val Thr Arg Glu Pro Tyr Val Ser Cys Asp Pro Thr Gly Cys<br />

115 <strong>12</strong>0 <strong>12</strong>5<br />

Lys Met Tyr Ala Leu His Gln Gly Thr Thr Ile Arg Asn Lys His Ser<br />

130 135 140<br />

Asn Gly Thr Ile His Asp Arg Thr Ala Phe Arg Gly Leu Ile Ser Thr<br />

- 151 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


145 150 155 160<br />

Pro Leu Gly Thr Pro Pro Thr Val Ser Asn Ser Asp Phe Met Cys Val<br />

165 170 175<br />

Gly Trp Ser Ser Thr Thr Cys His Asp Gly Ile Ala Arg Met Thr Ile<br />

180 185 <strong>19</strong>0<br />

Cys Ile Gln Gly Asn Asn Asp Asn Ala Thr Ala Thr Val Tyr Tyr Asn<br />

<strong>19</strong>5 200 205<br />

Arg Arg Leu Thr Thr Thr Ile Lys Thr Trp Ala Arg Asn Ile Leu Arg<br />

210 215 220<br />

Thr Gln Glu Ser Glu Cys Val Cys His Asn Gly Thr Cys Ala Val Val<br />

225 230 235 240<br />

Met Thr Asp Gly Ser Ala Ser Ser Gln Ala Tyr Thr Lys Val Met Tyr<br />

245 250 255<br />

Phe His Lys Gly Leu Val Val Lys Glu Glu Glu Leu Arg Gly Ser Ala<br />

260 265 270<br />

Arg His Ile Glu Glu Cys Ser Cys Tyr Gly His Asn Gln Lys Val Thr<br />

275 280 285<br />

Cys Val Cys Arg Asp Asn Trp Gln Gly Ala Asn Arg Pro Ile Ile Glu<br />

290 295 300<br />

Ile Asp Met Ser Thr Leu Glu His Thr Ser Arg Tyr Val Cys Thr Gly<br />

305 310 315 320<br />

Ile Leu Thr Asp Thr Ser Arg Pro Gly Asp Lys Ser Ser Gly Asp Cys<br />

325 330 335<br />

Ser Asn Pro Ile Thr Gly Ser Pro Gly Val Pro Gly Val Lys Gly Phe<br />

340 345 350<br />

- 152 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


Gly Phe Leu Asn Gly Asp Asn Thr Trp Leu Gly Arg Thr Ile Ser Pro<br />

355 360 365<br />

Arg Ser Arg Ser Gly Phe Glu Met Leu Lys Ile Pro Asn Ala Gly Thr<br />

370 375 380<br />

Asp Pro Asn Ser Arg Ile Ala Glu Arg Gln Glu Ile Val Asp Asn Asn<br />

385 390 395 400<br />

Asn Trp Ser Gly Tyr Ser Gly Ser Phe Ile Asp Tyr Trp Asn Asp Asn<br />

405 410 415<br />

Ser Glu Cys Tyr Asn Pro Cys Phe Tyr Val Glu Leu Ile Arg Gly Arg<br />

420 425 430<br />

Pro Glu Glu Ala Lys Tyr Val Trp Trp Ala Ser Asn Ser Leu Ile Ala<br />

435 440 445<br />

Leu Cys Gly Ser Pro Phe Pro Val Gly Ser Gly Ser Phe Pro Asp Gly<br />

450 455 460<br />

Ala Gln Ile Gln Tyr Phe Ser<br />

465 470<br />

29<br />

567<br />

PRT<br />

Influenza A virus<br />

29<br />

Met Asn Thr Gln Ile Leu Ala Phe Ile Ala Cys Met Leu Ile Gly Thr<br />

1 5 10 15<br />

Lys Gly Asp Lys Ile Cys Leu Gly His His Ala Val Ala Asn Gly Thr<br />

20 25 30<br />

- 153 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


Lys Val Asn Thr Leu Thr Glu Arg Gly Ile Glu Val Val Asn Ala Thr<br />

35 40 45<br />

Glu Thr Val Glu Thr Val Asn Ile Lys Lys Ile Cys Thr Gln Gly Lys<br />

50 55 60<br />

Arg Pro Thr Asp Leu Gly Gln Cys Gly Leu Leu Gly Thr Leu Ile Gly<br />

65 70 75 80<br />

Pro Pro Gln Cys Asp Gln Phe Leu Glu Phe Asp Ala Asn Leu Ile Ile<br />

85 90 95<br />

Glu Arg Arg Glu Gly Thr Asp Val Cys Tyr Pro Gly Lys Phe Thr Asn<br />

100 105 110<br />

Glu Glu Ser Leu Arg Gln Ile Leu Arg Gly Ser Gly Gly Ile Asp Lys<br />

115 <strong>12</strong>0 <strong>12</strong>5<br />

Glu Ser Met Gly Phe Thr Tyr Ser Gly Ile Arg Thr Asn Gly Ala Thr<br />

130 135 140<br />

Ser Ala Cys Arg Arg Ser Gly Ser Ser Phe Tyr Ala Glu Met Lys Trp<br />

145 150 155 160<br />

Leu Leu Ser Asn Ser Asp Asn Ala Ala Phe Pro Gln Met Thr Lys Ser<br />

165 170 175<br />

Tyr Arg Asn Pro Arg Asn Lys Pro Ala Leu Ile Ile Trp Gly Val His<br />

180 185 <strong>19</strong>0<br />

His Ser Gly Ser Ala Thr Glu Gln Thr Lys Leu Tyr Gly Ser Gly Asn<br />

<strong>19</strong>5 200 205<br />

Lys Leu Ile Thr Val Gly Ser Ser Lys Tyr Gln Gln Ser Phe Thr Pro<br />

- 154 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


210 215 220<br />

Ser Pro Gly Ala Arg Pro Gln Val Asn Gly Gln Ser Gly Arg Ile Asp<br />

225 230 235 240<br />

Phe His Trp Leu Leu Leu Asp Pro Asn Asp Thr Val Thr Phe Thr Phe<br />

245 250 255<br />

Asn Gly Ala Phe Ile Ala Pro Asp Arg Ala Ser Phe Phe Arg Gly Glu<br />

260 265 270<br />

Ser Leu Gly Val Gln Ser Asp Val Pro Leu Asp Ser Gly Cys Glu Gly<br />

275 280 285<br />

Asp Cys Phe His Ser Gly Gly Thr Ile Val Ser Ser Leu Pro Phe Gln<br />

290 295 300<br />

Asn Ile Asn Pro Arg Thr Val Gly Lys Cys Pro Arg Tyr Val Lys Gln<br />

305 310 315 320<br />

Thr Ser Leu Leu Leu Ala Thr Gly Met Arg Asn Val Pro Glu Asn Pro<br />

325 330 335<br />

Lys Gln Ala Tyr Arg Lys Arg Met Thr Arg Gly Leu Phe Gly Ala Ile<br />

340 345 350<br />

Ala Gly Phe Ile Glu Asn Gly Trp Glu Gly Leu Ile Asp Gly Trp Tyr<br />

355 360 365<br />

Gly Phe Arg His Gln Asn Ala Gln Gly Glu Gly Thr Ala Ala Asp Tyr<br />

370 375 380<br />

Lys Ser Thr Gln Ser Ala Ile Asp Gln Ile Thr Gly Lys Leu Asn Arg<br />

385 390 395 400<br />

Leu Ile Asp Lys Thr Asn Gln Gln Phe Glu Leu Ile Asp Asn Glu Phe<br />

405 410 415<br />

- 155 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


Ser Glu Ile Glu Gln Gln Ile Gly Asn Val Ile Asn Trp Thr Arg Asp<br />

420 425 430<br />

Ser Met Thr Glu Val Trp Ser Tyr Asn Ala Glu Leu Leu Val Ala Met<br />

435 440 445<br />

Glu Asn Gln His Thr Ile Asp Leu Ala Asp Ser Glu Met Asn Lys Leu<br />

450 455 460<br />

Tyr Glu Arg Val Arg Lys Gln Leu Arg Glu Asn Ala Glu Glu Asp Gly<br />

465 470 475 480<br />

Thr Gly Cys Phe Glu Ile Phe His Lys Cys Asp Asp Gln Cys Met Glu<br />

485 490 495<br />

Ser Ile Arg Asn Asn Thr Tyr Asp His Thr Gln Tyr Arg Thr Glu Ser<br />

500 505 510<br />

Leu Gln Asn Arg Ile Gln Ile Asp Pro Val Lys Leu Ser Ser Gly Tyr<br />

515 520 525<br />

Lys Asp Ile Ile Leu Trp Phe Ser Phe Gly Ala Ser Cys Phe Leu Leu<br />

530 535 540<br />

Leu Ala Ile Ala Met Gly Leu Val Phe Ile Cys Ile Lys Asn Gly Asn<br />

545 550 555 560<br />

Met Arg Cys Thr Ile Cys Ile<br />

565<br />

30<br />

469<br />

PRT<br />

Influenza A virus<br />

30<br />

- 156 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


Met Asn Pro Asn Gln Lys Ile Ile Thr Ile Gly Val Val Asn Thr Thr<br />

1 5 10 15<br />

Leu Ser Thr Ile Ala Leu Leu Ile Gly Val Gly Asn Leu Val Phe Asn<br />

20 25 30<br />

Thr Val Ile His Glu Lys Ile Gly Asp His Gln Ile Val Thr His Pro<br />

35 40 45<br />

Thr Ile Met Thr Pro Glu Val Pro Asn Cys Ser Asp Thr Ile Ile Thr<br />

50 55 60<br />

Tyr Asn Asn Thr Val Ile Asn Asn Ile Thr Thr Thr Ile Ile Thr Glu<br />

65 70 75 80<br />

Ala Glu Arg Pro Phe Lys Ser Pro Leu Pro Leu Cys Pro Phe Arg Gly<br />

85 90 95<br />

Phe Phe Pro Phe His Lys Asp Asn Ala Ile Arg Leu Gly Glu Asn Lys<br />

100 105 110<br />

Asp Val Ile Val Thr Arg Glu Pro Tyr Val Ser Cys Asp Asn Asp Asn<br />

115 <strong>12</strong>0 <strong>12</strong>5<br />

Cys Trp Ser Phe Ala Leu Ala Gln Gly Ala Leu Leu Gly Thr Lys His<br />

130 135 140<br />

Ser Asn Gly Thr Ile Lys Asp Arg Thr Pro Tyr Arg Ser Leu Ile Arg<br />

145 150 155 160<br />

Phe Pro Ile Gly Thr Ala Pro Val Leu Gly Asn Tyr Lys Glu Ile Cys<br />

165 170 175<br />

Ile Ala Trp Ser Ser Ser Ser Cys Phe Asp Gly Lys Glu Trp Met His<br />

180 185 <strong>19</strong>0<br />

- 157 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


Val Cys Met Thr Gly Asn Asp Asn Asp Ala Ser Ala Gln Ile Ile Tyr<br />

<strong>19</strong>5 200 205<br />

Gly Gly Arg Met Thr Asp Ser Ile Lys Ser Trp Arg Lys Asp Ile Leu<br />

210 215 220<br />

Arg Thr Gln Glu Ser Glu Cys Gln Cys Ile Asp Gly Thr Cys Val Val<br />

225 230 235 240<br />

Ala Val Thr Asp Gly Pro Ala Ala Asn Ser Ala Asp His Arg Val Tyr<br />

245 250 255<br />

Trp Ile Arg Glu Gly Arg Ile Ile Lys Tyr Glu Asn Val Pro Lys Thr<br />

260 265 270<br />

Lys Ile Gln His Leu Glu Glu Cys Ser Cys Tyr Val Asp Ile Asp Val<br />

275 280 285<br />

Tyr Cys Ile Cys Arg Asp Asn Trp Lys Gly Ser Asn Arg Pro Trp Met<br />

290 295 300<br />

Arg Ile Asn Asn Glu Thr Ile Leu Glu Thr Gly Tyr Val Cys Ser Lys<br />

305 310 315 320<br />

Phe His Ser Asp Thr Pro Arg Pro Ala Asp Pro Ser Ile Met Ser Cys<br />

325 330 335<br />

Asp Ser Pro Ser Asn Val Asn Gly Gly Pro Gly Val Lys Gly Phe Gly<br />

340 345 350<br />

Phe Lys Ala Gly Asn Asp Val Trp Leu Gly Arg Thr Val Ser Thr Ser<br />

355 360 365<br />

Gly Arg Ser Gly Phe Glu Ile Ile Lys Val Thr Glu Gly Trp Ile Asn<br />

370 375 380<br />

- 158 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


Ser Pro Asn His Val Lys Ser Ile Thr Gln Thr Leu Val Ser Asn Asn<br />

385 390 395 400<br />

Asp Trp Ser Gly Tyr Ser Gly Ser Phe Ile Val Lys Ala Lys Asp Cys<br />

405 410 415<br />

Phe Gln Pro Cys Phe Tyr Val Glu Leu Ile Arg Gly Arg Pro Asn Lys<br />

420 425 430<br />

Asn Asp Asp Val Ser Trp Thr Ser Asn Ser Ile Val Thr Phe Cys Gly<br />

435 440 445<br />

Leu Asp Asn Glu Pro Gly Ser Gly Asn Trp Pro Asp Gly Ser Asn Ile<br />

450 455 460<br />

Gly Phe Met Pro Lys<br />

465<br />

31<br />

560<br />

PRT<br />

Influenza A virus<br />

31<br />

Met Asn Thr Gln Ile Leu Ala Phe Ile Ala Cys Met Leu Ile Gly Thr<br />

1 5 10 15<br />

Lys Gly Asp Lys Ile Cys Leu Gly His His Ala Val Ala Asn Gly Thr<br />

20 25 30<br />

Lys Val Asn Thr Leu Thr Glu Arg Gly Ile Glu Val Val Asn Ala Thr<br />

35 40 45<br />

Glu Thr Val Glu Thr Val Asn Ile Lys Lys Ile Cys Thr Gln Gly Lys<br />

50 55 60<br />

- 159 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


Arg Pro Thr Asp Leu Gly Gln Cys Gly Leu Leu Gly Thr Leu Ile Gly<br />

65 70 75 80<br />

Pro Pro Gln Cys Asp Gln Phe Leu Glu Phe Asp Ala Asn Leu Ile Ile<br />

85 90 95<br />

Glu Arg Arg Glu Gly Thr Asp Val Cys Tyr Pro Gly Lys Phe Thr Asn<br />

100 105 110<br />

Glu Glu Ser Leu Arg Gln Ile Leu Arg Gly Ser Gly Gly Ile Asp Lys<br />

115 <strong>12</strong>0 <strong>12</strong>5<br />

Glu Ser Met Gly Phe Thr Tyr Ser Gly Ile Arg Thr Asn Gly Ala Thr<br />

130 135 140<br />

Ser Ala Cys Arg Arg Ser Gly Ser Ser Phe Tyr Ala Glu Met Lys Trp<br />

145 150 155 160<br />

Leu Leu Ser Asn Ser Asp Asn Ala Ala Phe Pro Gln Met Thr Lys Ser<br />

165 170 175<br />

Tyr Arg Asn Pro Arg Asn Lys Pro Ala Leu Ile Ile Trp Gly Val His<br />

180 185 <strong>19</strong>0<br />

His Ser Gly Ser Ala Thr Glu Gln Thr Lys Leu Tyr Gly Ser Gly Asn<br />

<strong>19</strong>5 200 205<br />

Lys Leu Ile Thr Val Gly Ser Ser Lys Tyr Gln Gln Ser Phe Thr Pro<br />

210 215 220<br />

Ser Pro Gly Ala Arg Pro Gln Val Asn Gly Gln Ser Gly Arg Ile Asp<br />

225 230 235 240<br />

Phe His Trp Leu Leu Leu Asp Pro Asn Asp Thr Val Thr Phe Thr Phe<br />

245 250 255<br />

- 160 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


Asn Gly Ala Phe Ile Ala Pro Asp Arg Ala Ser Phe Phe Arg Gly Glu<br />

260 265 270<br />

Ser Leu Gly Val Gln Ser Asp Val Pro Leu Asp Ser Gly Cys Glu Gly<br />

275 280 285<br />

Asp Cys Phe His Ser Gly Gly Thr Ile Val Ser Ser Leu Pro Phe Gln<br />

290 295 300<br />

Asn Ile Asn Pro Arg Thr Val Gly Lys Cys Pro Arg Tyr Val Lys Gln<br />

305 310 315 320<br />

Thr Ser Leu Leu Leu Ala Thr Gly Met Arg Asn Val Pro Glu Asn Pro<br />

325 330 335<br />

Lys Thr Arg Gly Leu Phe Gly Ala Ile Ala Gly Phe Ile Glu Asn Gly<br />

340 345 350<br />

Trp Glu Gly Leu Ile Asp Gly Trp Tyr Gly Phe Arg His Gln Asn Ala<br />

355 360 365<br />

Gln Gly Glu Gly Thr Ala Ala Asp Tyr Lys Ser Thr Gln Ser Ala Ile<br />

370 375 380<br />

Asp Gln Ile Thr Gly Lys Leu Asn Arg Leu Ile Asp Lys Thr Asn Gln<br />

385 390 395 400<br />

Gln Phe Glu Leu Ile Asp Asn Glu Phe Ser Glu Ile Glu Gln Gln Ile<br />

405 410 415<br />

Gly Asn Val Ile Asn Trp Thr Arg Asp Ser Met Thr Glu Val Trp Ser<br />

420 425 430<br />

Tyr Asn Ala Glu Leu Leu Val Ala Met Glu Asn Gln His Thr Ile Asp<br />

435 440 445<br />

- 161 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


Leu Ala Asp Ser Glu Met Asn Lys Leu Tyr Glu Arg Val Arg Lys Gln<br />

450 455 460<br />

Leu Arg Glu Asn Ala Glu Glu Asp Gly Thr Gly Cys Phe Glu Ile Phe<br />

465 470 475 480<br />

His Lys Cys Asp Asp Gln Cys Met Glu Ser Ile Arg Asn Asn Thr Tyr<br />

485 490 495<br />

Asp His Thr Gln Tyr Arg Thr Glu Ser Leu Gln Asn Arg Ile Gln Ile<br />

500 505 510<br />

Asp Pro Val Lys Leu Ser Ser Gly Tyr Lys Asp Ile Ile Leu Trp Phe<br />

515 520 525<br />

Ser Phe Gly Ala Ser Cys Phe Leu Leu Leu Ala Ile Ala Met Gly Leu<br />

530 535 540<br />

Val Phe Ile Cys Ile Lys Asn Gly Asn Met Arg Cys Thr Ile Cys Ile<br />

545 550 555 560<br />

32<br />

469<br />

PRT<br />

Influenza A virus<br />

32<br />

Met Asn Pro Asn Gln Lys Ile Ile Thr Ile Gly Val Val Asn Thr Thr<br />

1 5 10 15<br />

Leu Ser Thr Ile Ala Leu Leu Ile Gly Val Gly Asn Leu Val Phe Asn<br />

20 25 30<br />

Thr Val Ile His Glu Lys Ile Gly Asp His Gln Ile Val Thr His Pro<br />

35 40 45<br />

- 162 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


Thr Ile Met Thr Pro Glu Val Pro Asn Cys Ser Asp Thr Ile Ile Thr<br />

50 55 60<br />

Tyr Asn Asn Thr Val Ile Asn Asn Ile Thr Thr Thr Ile Ile Thr Glu<br />

65 70 75 80<br />

Ala Glu Arg Pro Phe Lys Ser Pro Leu Pro Leu Cys Pro Phe Arg Gly<br />

85 90 95<br />

Phe Phe Pro Phe His Lys Asp Asn Ala Ile Arg Leu Gly Glu Asn Lys<br />

100 105 110<br />

Asp Val Ile Val Thr Arg Glu Pro Tyr Val Ser Cys Asp Asn Asp Asn<br />

115 <strong>12</strong>0 <strong>12</strong>5<br />

Cys Trp Ser Phe Ala Leu Ala Gln Gly Ala Leu Leu Gly Thr Lys His<br />

130 135 140<br />

Ser Asn Gly Thr Ile Lys Asp Arg Thr Pro Tyr Arg Ser Leu Ile Arg<br />

145 150 155 160<br />

Phe Pro Ile Gly Thr Ala Pro Val Leu Gly Asn Tyr Lys Glu Ile Cys<br />

165 170 175<br />

Ile Ala Trp Ser Ser Ser Ser Cys Phe Asp Gly Lys Glu Trp Met His<br />

180 185 <strong>19</strong>0<br />

Val Cys Met Thr Gly Asn Asp Asn Asp Ala Ser Ala Gln Ile Ile Tyr<br />

<strong>19</strong>5 200 205<br />

Gly Gly Arg Met Thr Asp Ser Ile Lys Ser Trp Arg Lys Asp Ile Leu<br />

210 215 220<br />

Arg Thr Gln Glu Ser Glu Cys Gln Cys Ile Asp Gly Thr Cys Val Val<br />

225 230 235 240<br />

- 163 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


Ala Val Thr Asp Gly Pro Ala Ala Asn Ser Ala Asp His Arg Val Tyr<br />

245 250 255<br />

Trp Ile Arg Glu Gly Arg Ile Ile Lys Tyr Glu Asn Val Pro Lys Thr<br />

260 265 270<br />

Lys Ile Gln His Leu Glu Glu Cys Ser Cys Tyr Val Asp Ile Asp Val<br />

275 280 285<br />

Tyr Cys Ile Cys Arg Asp Asn Trp Lys Gly Ser Asn Arg Pro Trp Met<br />

290 295 300<br />

Arg Ile Asn Asn Glu Thr Ile Leu Glu Thr Gly Tyr Val Cys Ser Lys<br />

305 310 315 320<br />

Phe His Ser Asp Thr Pro Arg Pro Ala Asp Pro Ser Ile Met Ser Cys<br />

325 330 335<br />

Asp Ser Pro Ser Asn Val Asn Gly Gly Pro Gly Val Lys Gly Phe Gly<br />

340 345 350<br />

Phe Lys Ala Gly Asn Asp Val Trp Leu Gly Arg Thr Val Ser Thr Ser<br />

355 360 365<br />

Gly Arg Ser Gly Phe Glu Ile Ile Lys Val Thr Glu Gly Trp Ile Asn<br />

370 375 380<br />

Ser Pro Asn His Val Lys Ser Ile Thr Gln Thr Leu Val Ser Asn Asn<br />

385 390 395 400<br />

Asp Trp Ser Gly Tyr Ser Gly Ser Phe Ile Val Lys Ala Lys Asp Cys<br />

405 410 415<br />

Phe Gln Pro Cys Phe Tyr Val Glu Leu Ile Arg Gly Arg Pro Asn Lys<br />

420 425 430<br />

- 164 -<br />

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Asn Asp Asp Val Ser Trp Thr Ser Asn Ser Ile Val Thr Phe Cys Gly<br />

435 440 445<br />

Leu Asp Asn Glu Pro Gly Ser Gly Asn Trp Pro Asp Gly Ser Asn Ile<br />

450 455 460<br />

Gly Phe Met Pro Lys<br />

465<br />

33<br />

1743<br />

DNA<br />

Influenza A virus<br />

33<br />

agcaaaagca ggggaaaatg attgcagtca ttataatagc ggtactggca acggccggaa 60<br />

aatcagacaa gatctgcatt gggtatcatg ccaacaattc aacaacacaa gtggatacga <strong>12</strong>0<br />

tacttgagaa gaatgtaacc gtcacacact cagttgaatt gctggagaac caaaaagaag 180<br />

aaagattctg caagatcttg aacaaggccc ctctcgattt aagaggatgt accatagagg 240<br />

gttggatctt ggggaatccc caatgcgacc tattgcttgg tgatcaaagc tggtcatata 300<br />

tagtggaaag acctacagct caaaatggga tctgctaccc aggaattttg aatgaagtag 360<br />

aagaactgaa ggcacttatt ggatcaggag aaagagtgga gagatttgaa atgtttccca 420<br />

aaagtacatg ggcaggagta gacaccagca gtggggtaac aaaggcttgc ccttatacta 480<br />

gtggttcgtc tttctacaga aacctcctat ggataataaa aaccaagtcc gcagcatatc 540<br />

cagtaattaa gggaacctac aataacactg gaagccagcc aatcctctat ttctggggtg 600<br />

tgcaccatcc tcctgacacc aatgagcaaa acactttgta tggctctggt gatcgatatg 660<br />

- 165 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


tcaggatggg aactgaaagc atgaattttg ccaagagccc agaaattgcg gcaaggcctg 720<br />

ctgtgaatgg tcaaagaggc agaattgatt attactggtc tgttttaaag ccgggggaaa 780<br />

ccttgaatgt ggaatctaat ggaaatctaa tcgccccttg gtatgcatac aaatttgtca 840<br />

gcaccaatag taaaggagcc gtcttcaagt caaatttacc aatcgagaac tgtgatgcca 900<br />

catgccagac tattgcagga gtcttaagaa ccaataaaac atttcagaat gtaagccctc 960<br />

tgtggatagg agaatgcccc aaatatgtga aaagtgaaag tttgaggctt gcaactggac 1020<br />

taagaaatat tccacagatt gagactagag gacttttcgg agctatcgca gggtttattg 1080<br />

aaggaggatg gactggaatg atagatgggt ggtatggcta tcaccatgaa aattctcaag 1140<br />

gctcagggta tgcggcagac agagaaagca ctcaaagggc tatagacgga attacaaata <strong>12</strong>00<br />

aggtcaattc cattatagac aaaatgaaca cacaattcga agctatagac cacgaattct <strong>12</strong>60<br />

caaatttgga gagaagaatt gacagtctga acaaaagaat ggaagatgga tttctggacg 1320<br />

tttggacata caatgctgaa ctgttggttc ttcttgaaaa cgaaaggaca ctagacctac 1380<br />

atgacgcgaa tgtgaagaac ctgtatgaaa aggtcaaatc acaactacgg gacaatgcta 1440<br />

atgatctagg aaatggatgc tttgaatttt ggcataagtg tgacaatgaa tgcatagagt 1500<br />

ctgtcaaaaa tggtacctat gactatccca aatatcagga tgaaagcaaa ttgaacaggc 1560<br />

aggaaataga atcggtgaag ctggagaacc ttggtgtgta tcaaatcctc gccatttata 1620<br />

gtacggtatc gagcagtcta gtcttggtag ggctgattat agcaatgggt ctttggatgt 1680<br />

gttcaaatgg ttcaatgcaa tgcaggatat gtatataatt aagaaaaaca cccttgttct 1740<br />

act 1743<br />

34<br />

- 166 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


1460<br />

DNA<br />

Influenza A virus<br />

34<br />

agcaaaagca gggtcaagat gaatccaaat cagaagattc tatgcacatc tgctactgcc 60<br />

attgcaatag gcacaattgc tgtattaata ggaatagcaa acctgggttt gaacatagga <strong>12</strong>0<br />

ctacacctga aaccgagctg caactgctcc aaccctcctc ctgaaacaac aaatgtaagc 180<br />

caaacaataa taaacaatta ctacaatgaa acaaatgtta cccaaataag taacacaaac 240<br />

attcaacata tggggggaac cgaaaaggac ttcaacaatc tgactaaagg gctctgcaca 300<br />

ataaattcat ggcatatatt cggaaaggac aatgctataa gaatagggga gaactctgat 360<br />

gttttagtca caagagagcc atatgtttct tgtgatccag atgaatgcag attctatgct 420<br />

ctcagccaag gaacaacaat acggggaaag cactcaaatg gaacaataca cgatagatcc 480<br />

caataccgtg ctttagtgag ctggccttta tcatcaccac ccactgtgta caataccaga 540<br />

gtagaatgca ttggatggtc cagtacaagc tgccatgatg ggaaagcacg aatgtctata 600<br />

tgtgtctcag gtcccaacaa caatgcatca gcagtgattt ggtacaaagg gcggcctatc 660<br />

acggaaatca atacgtgggc ccgaaacata ttgagaaccc aagaatctga gtgtgtatgc 720<br />

cacaatggaa tatgtccagt agtgttcact gacggttctg ccaccggtcc agcagaaact 780<br />

aggatatact atttcaaaga ggggaaaatc ctcaaatggg agccactaac tggaaccgcc 840<br />

aagcacattg aagaatgctc ttgctatggg aaagactcag aaataacgtg cacatgtaga 900<br />

gacaattggc aaggctcgaa tagaccagta atacaaataa accccacaat gatgactcac 960<br />

actagtcaat acatatgcag ccctgtcctc acagacaatc cacgccccaa tgaccccacg 1020<br />

- 167 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


gtaggcaagt gtaatgatcc ttatccagga aacaacaata atggagtcaa aggattctca 1080<br />

tatttagatg gtgacaatac atggctagga agaacgataa gcacagcctc taggtctggg 1140<br />

tatgaaatgc tgaaagtgcc taatgcattg acagatgata gatcaaaacc tactcaaggt <strong>12</strong>00<br />

cagacaattg tattaaacac agactggagt ggttacagtg ggtctttcat tgattactgg <strong>12</strong>60<br />

gcaaaagggg agtgctatag agcatgcttc tacgttgagc tgatccgtgg aaggccaaaa 1320<br />

gaggacaaag tgtggtggac cagtaatagt atagtgtcga tgtgttccag cacagagttc 1380<br />

cttggacaat ggaactggcc agatggggct aaaatagagt acttcctcta agatgtagaa 1440<br />

aaaagaccct tgtttctact 1460<br />

35<br />

1747<br />

DNA<br />

Influenza A virus<br />

35<br />

agcaaaagca ggggaaaatg attgcaatca ttgtaatagc aatactggca gcagccggaa 60<br />

aatcagacaa gatctgcatt gggtatcatg ccaacaattc aacaacacag gtagatacga <strong>12</strong>0<br />

tacttgagaa gaatgtgact gtcacacact caattgaatt gctggaaaat cagaaggaag 180<br />

aaagattctg caagatattg aacaaggccc ctctcgactt aagggaatgt accatagagg 240<br />

gttggatctt ggggaatccc caatgcgacc tattgcttgg tgatcaaagc tggtcataca 300<br />

ttgtggaaag acctactgct caaaacggga tctgctaccc aggaacctta aatgaggtag 360<br />

aagaactgag ggcacttatt ggatcaggag aaagggtaga gagatttgag atgtttcccc 420<br />

aaagcacctg gcaaggagtt gacaccaaca gtggaacaac aagatcctgc ccttattcta 480<br />

ctggtgatcc gtctttctac agaaacctcc tatggataat aaaaaccaag acagcagaat 540<br />

- 168 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


atccagtaat taagggaatt tacaacaaca ctggaaccca gccaatcctc tatttctggg 600<br />

gtgtgcatca tcctcctaac accgacgagc aagatactct gtatggctct ggtgatcgat 660<br />

acgttagaat gggaactgaa agcatgaatt ttgccaagag tccggaaatt gcggcaaggc 720<br />

ctgctgtgaa tggacaaaga ggcagaattg attattattg gtcggtttta aaaccagggg 780<br />

aaaccttgaa tgtggaatct aatggaaatc taatcgcccc ttggtatgca tacaaatttg 840<br />

tcaacacaaa tagtaaagga gccgtcttca ggtcagattt accaatcgag aactgcgatg 900<br />

ccacatgcca gactattgca ggggttctaa ggaccaataa aacatttcag aatgtgagtc 960<br />

ccctgtggat aggagaatgt cccaaatacg tgaaaagtga aagtctgagg cttgcaactg 1020<br />

gactaagaaa tgttccacag attgaaacta gaggactctt cggagctatt gcagggttta 1080<br />

ttgaaggagg atggactggg atgatagatg ggtggtatgg ctatcaccat gaaaattctc 1140<br />

aagggtcagg atatgcagcg gacagagaaa gcactcaaaa ggctgtaaac agaattacaa <strong>12</strong>00<br />

ataaggtcaa ttccatcatc aacaaaatga acacacaatt tgaagctgtc gatcacgaat <strong>12</strong>60<br />

tttcaaatct ggagaggaga atcgacaatc tgaacaaaag aatgcaagat ggatttctgg 1320<br />

atgtttggac atacaatgct gaactgttgg ttcttcttga aaacgaaaga acactagaca 1380<br />

tgcatgacgc aaatgtgaag aacctacatg aaaaggtcaa atcacaacta agggacaatg 1440<br />

ctaacgatct agggaatggt tgctttgaat tttggcataa gtgtgacaat gaatgcatag 1500<br />

agtctgtcaa aaatggtaca tatgactatc ccaaatacca gactgaaagc aaattaaaca 1560<br />

ggctaaaaat agaatcagta aagctagaga accttggtgt gtatcaaatt cttgccattt 1620<br />

atagtacggt atcgagcagc ctagtgttgg tagggctgat catggcaatg ggtctttgga 1680<br />

- 169 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


tgtgttcaaa tggttcaatg cagtgcaatg tgtgtatatg attaagaaaa acacccttgt 1740<br />

ttctact 1747<br />

36<br />

1401<br />

DNA<br />

Influenza A virus<br />

36<br />

agcaaaagca ggagtttaac atgaatccaa atcagaagat aataaccatt gggtcaatct 60<br />

gtatggtagt tggaataatc agcttgatgt tacaaattgg aaacataata tcaatatggg <strong>12</strong>0<br />

ttagccacat aattcagact gggcatccaa accagcctgg gccatgcaat caaagcatca 180<br />

atttttacac tgagcaggct gcagcttcag tgacattagc gggtaattcc tctctctgcc 240<br />

ctattagtgg atgggctata tacagtaaag acaatagtat aagaattggt tccaaagggg 300<br />

atgtgtttgt tatgagagaa ccattcgttt catgctccca tttggaatgc agaacctttt 360<br />

tcttgactca aggagcccta ttgaatgaca agcattctaa tgggaccgtt aaagacagaa 420<br />

gcccctatag aactttaatg agctgtcctg ttggtgaggc tccttcccca tacaactcaa 480<br />

ggtttgagtc tgttgcttgg tcagcaagtg cttgccatga tggcattagt tggctaacaa 540<br />

ttggaatttc cggtccggat aatggggctg tggctgtgtt gaaatacaat ggcataataa 600<br />

cagacaccat caagagttgg aggaacaaca tactgaggac acaagagtct gaatgtgcat 660<br />

gtgtgaatgg ttcttgtttt actgtaatga cagatggacc gagtaatgaa caggcctcat 720<br />

acaagatttt caagatagag aaggggaaag tagtcaaatc agttgagttg aacgccccta 780<br />

attatcatta cgaggaatgc tcctgttatc ctgatgctgg cgaaatcaca tgtgtgtgca 840<br />

gggataattg gcatggctcg aaccgaccgt gggtgtcttt caatcagaat ctggagtatc 900<br />

- 170 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


aaataggata tatatgcagt ggggttttcg gagacagtcc acgccccaat gatggaacag 960<br />

gcagttgcgg tccagtgtct cttaacggag agtatggagt aaaagggttt tcatttaagt 1020<br />

acggtgatgg tgtttggatc gggagaacca aaagcactag ttccaggagc gggtttgaaa 1080<br />

tgatttggga tccaaatggg tggaccgaaa cagatagtaa cttctcattg aagcaagaca 1140<br />

tcatagcaat aactgattgg tcaggataca gcgggagttt tgtccaacat ccagaactga <strong>12</strong>00<br />

caggattaaa ttgcatgagg ccttgcttct gggttgaact aatcagaggg aggcccaaag <strong>12</strong>60<br />

agaaaacaat ctggactagt gggagcagta tatctttctg tggtgtaaat agtgacactg 1320<br />

tgggttggtc ttggccagac ggtgctgagg tgccattcac cattgacaag tagtttgttc 1380<br />

aaaaaactcc ttgtttctac t 1401<br />

37<br />

1745<br />

DNA<br />

Influenza A virus<br />

37<br />

agcaaaagca ggggaaaatg attgcaatca taatacttgc aatagtggtc tctaccagca 60<br />

agtcagacag gatctgcatt ggttaccatg caaacaactc gacaacacaa gtggacacaa <strong>12</strong>0<br />

tattagagaa gaatgtgaca gtgacacact cagtggagct cctagaaaac cagaaggaga 180<br />

atagattctg cagagtcttg aataaagcgc cactggatct aatggactgc accactgagg 240<br />

gttggatcct tggaaacccc cgatgtgata acttactcgg tgatcaaagt tggtcataca 300<br />

tagtagagag gcctgatgcc caaaatggga tatgttaccc aggggtattg aaggagacgg 360<br />

aagagctgaa agcactcatt gggtctatag atagcataca aagatttgaa atgtttccca 420<br />

- 171 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


agagcacgtg gaccggggta gatactaata gcggagttac gagcgcttgc ccctacaatg 480<br />

gtgaatcttc cttttacagg aatctgttgt ggataataaa aataagatct gatccgtact 540<br />

cattgatcaa ggggacatat accaatacag gctctcagcc aatcttatat ttctggggtg 600<br />

tgcaccatcc tccagatgaa gttgagcaag ctaacttgta tggaattggt acccggtatg 660<br />

ttaggatggg aactgaaagt atgaattttg ccaaaggtcc tgaaatagca ggcagaccac 720<br />

ctgcgaatgg gcaacgagga agaattgatt attattggtc tgtgttgaag ccaggagaaa 780<br />

ccttgaatgt ggaatccaat ggaaatttaa tagctccttg gtatgcttac aagttcacta 840<br />

gttccagaaa caagggagct attttcaaat cagaccttcc aattgagaat tgtgatgctg 900<br />

tctgtcaaac tttagctgga gcaataaata caaacaaaac cttccaaaat attagtccag 960<br />

tctggattgg agaatgcccc aaatatgtta aaagtaagag cctaaaacta gcaactggtc 1020<br />

tgagaaatgt tccacaggca gaaacaagag gattgtttgg agcaatagct gggtttatag 1080<br />

aaggaggatg gacaggtatg gtagacggat ggtacggata ccaccatgaa aattcacagg 1140<br />

ggtctggtta tgcagcagat aaagaaagca ctcagaaagc aatagacggg atcaccaata <strong>12</strong>00<br />

aagtcaattc aatcattgac aaaatgaaca cacaatttga ggcagtagag catgagttct <strong>12</strong>60<br />

caagtctcga aaggagaata ggcaatctga acaaaagaat ggaagatgga tttttagacg 1320<br />

tgtggacata caatgctgaa cttctggttc tactggaaaa tgagaggact ttggacatgc 1380<br />

atgatgctaa tgtaaagaat ctacatgaaa aggtgaaatc acaattaagg gataatgcaa 1440<br />

aggatttggg taatgggtgt tttgaatttt ggcacaaatg cgacaatgaa tgcatcaact 1500<br />

cagttaaaaa tggcacatat gactacccaa agtaccagga agagagcaga cttaataggc 1560<br />

aggaaataaa atcagtgatg ctggaaaatc tgggagtata ccaaatcctt gctatttata 1620<br />

- 172 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


gtacggtatc gagcagtctg gttttggtgg gactgatcat tgccatgggt ctttggatgt 1680<br />

gctcaaatgg ctcaatgcaa tgcaagatat gtatataatt agaaaaaaac acccttgttt 1740<br />

ctact 1745<br />

38<br />

1467<br />

DNA<br />

Influenza A virus<br />

38<br />

agcaaaagca ggagtgaaaa tgaatccaaa tcagaggata ataacaattg gatccgtctc 60<br />

tctaactatt gcaacagtgt gtttcctcat gcagattgcc atcctagcaa cgactgtgac <strong>12</strong>0<br />

actgcatttc aaacaaaatg aatgcagcat tcccgcaaac aaccaagtaa cgccatgtga 180<br />

accaatagta atagagagga acataacaga gatagtgtat ttgaataata ctaccataga 240<br />

aaaagagatt tgtcctgaag tagtagaata caggaattgg tcaaaaccgc aatgtcaaat 300<br />

tacagggttt gctcctttct ccaaggacaa ctcaattcgg ctttctgctg gtggggacat 360<br />

ttggataaca agagaacctt atgtgtcatg cgaccccagt aaatgttatc aatttgcact 420<br />

cgggcagggg accacgctgg acaacaaaca ctcaaatggc acaatacatg atagaatccc 480<br />

tcatcggacc cttttgatga atgaattggg tgttccgttt catttgggaa ccaaacaagt 540<br />

gtgcatagca tggtccagct caagctgtca tgatgggaaa gcatggttgc acgtttgtgt 600<br />

cactggggat gatagaaatg caactgctag tttcatttat gatgggatgc ttattgacag 660<br />

tattggttcc tggtctcaaa atatcctcag gactcaggag tcagaatgcg tttgtatcag 720<br />

tggaacttgt acagtagtaa tgactgatgg aagtgcatca ggaagggcag acactagaat 780<br />

- 173 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


actattcatt agagagggga aaattgtcca cattagtcca ttgtcaggaa gtgctcagca 840<br />

tgtagaggaa tgttcttgtt atccccggta cccaaacgtc agatgtgtct gcagagacaa 900<br />

ctggaagggc tctaataggc ccgttataga tataaatatg gcagattata gcattgactc 960<br />

aagttatgtg tgctcaggac ttgttggaga cacaccaagg aacgatgata gctctagcag 1020<br />

cagcaactgc agggatccta ataatgagag agggaaccca ggagtgaaag ggtgggcctt 1080<br />

tgataatgga aatgatgtgt ggatgggaag aacaatcagt aaagattcgc gctcaggcta 1140<br />

tgagaccttc aaggtcattg gtggttgggc cattgctaat tccaagtcac agaccaatag <strong>12</strong>00<br />

acaagtcata gttgataata acaactggtc tggttattct ggtattttct ctgttgaaag <strong>12</strong>60<br />

caaaggctgc atcaataggt gtttttatgt ggagttgata agaggaaggc cacaggagac 1320<br />

tagagtatgg tggacctcaa acagtattgt cgtattttgt ggcacttcag ggacatatgg 1380<br />

aacaggctca tggcctgatg gggcgaatat cgatttcatg cctatataag ctttcgcaat 1440<br />

tttagaaaaa aactccttgt ttctact 1467<br />

39<br />

566<br />

PRT<br />

Influenza A virus<br />

39<br />

Met Ile Ala Val Ile Ile Ile Ala Val Leu Ala Thr Ala Gly Lys Ser<br />

1 5 10 15<br />

Asp Lys Ile Cys Ile Gly Tyr His Ala Asn Asn Ser Thr Thr Gln Val<br />

20 25 30<br />

Asp Thr Ile Leu Glu Lys Asn Val Thr Val Thr His Ser Val Glu Leu<br />

35 40 45<br />

- 174 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


Leu Glu Asn Gln Lys Glu Glu Arg Phe Cys Lys Ile Leu Asn Lys Ala<br />

50 55 60<br />

Pro Leu Asp Leu Arg Gly Cys Thr Ile Glu Gly Trp Ile Leu Gly Asn<br />

65 70 75 80<br />

Pro Gln Cys Asp Leu Leu Leu Gly Asp Gln Ser Trp Ser Tyr Ile Val<br />

85 90 95<br />

Glu Arg Pro Thr Ala Gln Asn Gly Ile Cys Tyr Pro Gly Ile Leu Asn<br />

100 105 110<br />

Glu Val Glu Glu Leu Lys Ala Leu Ile Gly Ser Gly Glu Arg Val Glu<br />

115 <strong>12</strong>0 <strong>12</strong>5<br />

Arg Phe Glu Met Phe Pro Lys Ser Thr Trp Ala Gly Val Asp Thr Ser<br />

130 135 140<br />

Ser Gly Val Thr Lys Ala Cys Pro Tyr Thr Ser Gly Ser Ser Phe Tyr<br />

145 150 155 160<br />

Arg Asn Leu Leu Trp Ile Ile Lys Thr Lys Ser Ala Ala Tyr Pro Val<br />

165 170 175<br />

Ile Lys Gly Thr Tyr Asn Asn Thr Gly Ser Gln Pro Ile Leu Tyr Phe<br />

180 185 <strong>19</strong>0<br />

Trp Gly Val His His Pro Pro Asp Thr Asn Glu Gln Asn Thr Leu Tyr<br />

<strong>19</strong>5 200 205<br />

Gly Ser Gly Asp Arg Tyr Val Arg Met Gly Thr Glu Ser Met Asn Phe<br />

210 215 220<br />

Ala Lys Ser Pro Glu Ile Ala Ala Arg Pro Ala Val Asn Gly Gln Arg<br />

- 175 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


225 230 235 240<br />

Gly Arg Ile Asp Tyr Tyr Trp Ser Val Leu Lys Pro Gly Glu Thr Leu<br />

245 250 255<br />

Asn Val Glu Ser Asn Gly Asn Leu Ile Ala Pro Trp Tyr Ala Tyr Lys<br />

260 265 270<br />

Phe Val Ser Thr Asn Ser Lys Gly Ala Val Phe Lys Ser Asn Leu Pro<br />

275 280 285<br />

Ile Glu Asn Cys Asp Ala Thr Cys Gln Thr Ile Ala Gly Val Leu Arg<br />

290 295 300<br />

Thr Asn Lys Thr Phe Gln Asn Val Ser Pro Leu Trp Ile Gly Glu Cys<br />

305 310 315 320<br />

Pro Lys Tyr Val Lys Ser Glu Ser Leu Arg Leu Ala Thr Gly Leu Arg<br />

325 330 335<br />

Asn Ile Pro Gln Ile Glu Thr Arg Gly Leu Phe Gly Ala Ile Ala Gly<br />

340 345 350<br />

Phe Ile Glu Gly Gly Trp Thr Gly Met Ile Asp Gly Trp Tyr Gly Tyr<br />

355 360 365<br />

His His Glu Asn Ser Gln Gly Ser Gly Tyr Ala Ala Asp Arg Glu Ser<br />

370 375 380<br />

Thr Gln Arg Ala Ile Asp Gly Ile Thr Asn Lys Val Asn Ser Ile Ile<br />

385 390 395 400<br />

Asp Lys Met Asn Thr Gln Phe Glu Ala Ile Asp His Glu Phe Ser Asn<br />

405 410 415<br />

Leu Glu Arg Arg Ile Asp Ser Leu Asn Lys Arg Met Glu Asp Gly Phe<br />

420 425 430<br />

- 176 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


Leu Asp Val Trp Thr Tyr Asn Ala Glu Leu Leu Val Leu Leu Glu Asn<br />

435 440 445<br />

Glu Arg Thr Leu Asp Leu His Asp Ala Asn Val Lys Asn Leu Tyr Glu<br />

450 455 460<br />

Lys Val Lys Ser Gln Leu Arg Asp Asn Ala Asn Asp Leu Gly Asn Gly<br />

465 470 475 480<br />

Cys Phe Glu Phe Trp His Lys Cys Asp Asn Glu Cys Ile Glu Ser Val<br />

485 490 495<br />

Lys Asn Gly Thr Tyr Asp Tyr Pro Lys Tyr Gln Asp Glu Ser Lys Leu<br />

500 505 510<br />

Asn Arg Gln Glu Ile Glu Ser Val Lys Leu Glu Asn Leu Gly Val Tyr<br />

515 520 525<br />

Gln Ile Leu Ala Ile Tyr Ser Thr Val Ser Ser Ser Leu Val Leu Val<br />

530 535 540<br />

Gly Leu Ile Ile Ala Met Gly Leu Trp Met Cys Ser Asn Gly Ser Met<br />

545 550 555 560<br />

Gln Cys Arg Ile Cys Ile<br />

565<br />

40<br />

470<br />

PRT<br />

Influenza A virus<br />

40<br />

Met Asn Pro Asn Gln Lys Ile Leu Cys Thr Ser Ala Thr Ala Ile Ala<br />

1 5 10 15<br />

- 177 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


Ile Gly Thr Ile Ala Val Leu Ile Gly Ile Ala Asn Leu Gly Leu Asn<br />

20 25 30<br />

Ile Gly Leu His Leu Lys Pro Ser Cys Asn Cys Ser Asn Pro Pro Pro<br />

35 40 45<br />

Glu Thr Thr Asn Val Ser Gln Thr Ile Ile Asn Asn Tyr Tyr Asn Glu<br />

50 55 60<br />

Thr Asn Val Thr Gln Ile Ser Asn Thr Asn Ile Gln His Met Gly Gly<br />

65 70 75 80<br />

Thr Glu Lys Asp Phe Asn Asn Leu Thr Lys Gly Leu Cys Thr Ile Asn<br />

85 90 95<br />

Ser Trp His Ile Phe Gly Lys Asp Asn Ala Ile Arg Ile Gly Glu Asn<br />

100 105 110<br />

Ser Asp Val Leu Val Thr Arg Glu Pro Tyr Val Ser Cys Asp Pro Asp<br />

115 <strong>12</strong>0 <strong>12</strong>5<br />

Glu Cys Arg Phe Tyr Ala Leu Ser Gln Gly Thr Thr Ile Arg Gly Lys<br />

130 135 140<br />

His Ser Asn Gly Thr Ile His Asp Arg Ser Gln Tyr Arg Ala Leu Val<br />

145 150 155 160<br />

Ser Trp Pro Leu Ser Ser Pro Pro Thr Val Tyr Asn Thr Arg Val Glu<br />

165 170 175<br />

Cys Ile Gly Trp Ser Ser Thr Ser Cys His Asp Gly Lys Ala Arg Met<br />

180 185 <strong>19</strong>0<br />

Ser Ile Cys Val Ser Gly Pro Asn Asn Asn Ala Ser Ala Val Ile Trp<br />

<strong>19</strong>5 200 205<br />

- 178 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


Tyr Lys Gly Arg Pro Ile Thr Glu Ile Asn Thr Trp Ala Arg Asn Ile<br />

210 215 220<br />

Leu Arg Thr Gln Glu Ser Glu Cys Val Cys His Asn Gly Ile Cys Pro<br />

225 230 235 240<br />

Val Val Phe Thr Asp Gly Ser Ala Thr Gly Pro Ala Glu Thr Arg Ile<br />

245 250 255<br />

Tyr Tyr Phe Lys Glu Gly Lys Ile Leu Lys Trp Glu Pro Leu Thr Gly<br />

260 265 270<br />

Thr Ala Lys His Ile Glu Glu Cys Ser Cys Tyr Gly Lys Asp Ser Glu<br />

275 280 285<br />

Ile Thr Cys Thr Cys Arg Asp Asn Trp Gln Gly Ser Asn Arg Pro Val<br />

290 295 300<br />

Ile Gln Ile Asn Pro Thr Met Met Thr His Thr Ser Gln Tyr Ile Cys<br />

305 310 315 320<br />

Ser Pro Val Leu Thr Asp Asn Pro Arg Pro Asn Asp Pro Thr Val Gly<br />

325 330 335<br />

Lys Cys Asn Asp Pro Tyr Pro Gly Asn Asn Asn Asn Gly Val Lys Gly<br />

340 345 350<br />

Phe Ser Tyr Leu Asp Gly Asp Asn Thr Trp Leu Gly Arg Thr Ile Ser<br />

355 360 365<br />

Thr Ala Ser Arg Ser Gly Tyr Glu Met Leu Lys Val Pro Asn Ala Leu<br />

370 375 380<br />

Thr Asp Asp Arg Ser Lys Pro Thr Gln Gly Gln Thr Ile Val Leu Asn<br />

385 390 395 400<br />

- 179 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


Thr Asp Trp Ser Gly Tyr Ser Gly Ser Phe Ile Asp Tyr Trp Ala Lys<br />

405 410 415<br />

Gly Glu Cys Tyr Arg Ala Cys Phe Tyr Val Glu Leu Ile Arg Gly Arg<br />

420 425 430<br />

Pro Lys Glu Asp Lys Val Trp Trp Thr Ser Asn Ser Ile Val Ser Met<br />

435 440 445<br />

Cys Ser Ser Thr Glu Phe Leu Gly Gln Trp Asn Trp Pro Asp Gly Ala<br />

450 455 460<br />

Lys Ile Glu Tyr Phe Leu<br />

465 470<br />

41<br />

567<br />

PRT<br />

Influenza A virus<br />

41<br />

Met Ile Ala Ile Ile Val Ile Ala Ile Leu Ala Ala Ala Gly Lys Ser<br />

1 5 10 15<br />

Asp Lys Ile Cys Ile Gly Tyr His Ala Asn Asn Ser Thr Thr Gln Val<br />

20 25 30<br />

Asp Thr Ile Leu Glu Lys Asn Val Thr Val Thr His Ser Ile Glu Leu<br />

35 40 45<br />

Leu Glu Asn Gln Lys Glu Glu Arg Phe Cys Lys Ile Leu Asn Lys Ala<br />

50 55 60<br />

Pro Leu Asp Leu Arg Glu Cys Thr Ile Glu Gly Trp Ile Leu Gly Asn<br />

65 70 75 80<br />

- 180 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


Pro Gln Cys Asp Leu Leu Leu Gly Asp Gln Ser Trp Ser Tyr Ile Val<br />

85 90 95<br />

Glu Arg Pro Thr Ala Gln Asn Gly Ile Cys Tyr Pro Gly Thr Leu Asn<br />

100 105 110<br />

Glu Val Glu Glu Leu Arg Ala Leu Ile Gly Ser Gly Glu Arg Val Glu<br />

115 <strong>12</strong>0 <strong>12</strong>5<br />

Arg Phe Glu Met Phe Pro Gln Ser Thr Trp Gln Gly Val Asp Thr Asn<br />

130 135 140<br />

Ser Gly Thr Thr Arg Ser Cys Pro Tyr Ser Thr Gly Asp Pro Ser Phe<br />

145 150 155 160<br />

Tyr Arg Asn Leu Leu Trp Ile Ile Lys Thr Lys Thr Ala Glu Tyr Pro<br />

165 170 175<br />

Val Ile Lys Gly Ile Tyr Asn Asn Thr Gly Thr Gln Pro Ile Leu Tyr<br />

180 185 <strong>19</strong>0<br />

Phe Trp Gly Val His His Pro Pro Asn Thr Asp Glu Gln Asp Thr Leu<br />

<strong>19</strong>5 200 205<br />

Tyr Gly Ser Gly Asp Arg Tyr Val Arg Met Gly Thr Glu Ser Met Asn<br />

210 215 220<br />

Phe Ala Lys Ser Pro Glu Ile Ala Ala Arg Pro Ala Val Asn Gly Gln<br />

225 230 235 240<br />

Arg Gly Arg Ile Asp Tyr Tyr Trp Ser Val Leu Lys Pro Gly Glu Thr<br />

245 250 255<br />

Leu Asn Val Glu Ser Asn Gly Asn Leu Ile Ala Pro Trp Tyr Ala Tyr<br />

260 265 270<br />

- 181 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


Lys Phe Val Asn Thr Asn Ser Lys Gly Ala Val Phe Arg Ser Asp Leu<br />

275 280 285<br />

Pro Ile Glu Asn Cys Asp Ala Thr Cys Gln Thr Ile Ala Gly Val Leu<br />

290 295 300<br />

Arg Thr Asn Lys Thr Phe Gln Asn Val Ser Pro Leu Trp Ile Gly Glu<br />

305 310 315 320<br />

Cys Pro Lys Tyr Val Lys Ser Glu Ser Leu Arg Leu Ala Thr Gly Leu<br />

325 330 335<br />

Arg Asn Val Pro Gln Ile Glu Thr Arg Gly Leu Phe Gly Ala Ile Ala<br />

340 345 350<br />

Gly Phe Ile Glu Gly Gly Trp Thr Gly Met Ile Asp Gly Trp Tyr Gly<br />

355 360 365<br />

Tyr His His Glu Asn Ser Gln Gly Ser Gly Tyr Ala Ala Asp Arg Glu<br />

370 375 380<br />

Ser Thr Gln Lys Ala Val Asn Arg Ile Thr Asn Lys Val Asn Ser Ile<br />

385 390 395 400<br />

Ile Asn Lys Met Asn Thr Gln Phe Glu Ala Val Asp His Glu Phe Ser<br />

405 410 415<br />

Asn Leu Glu Arg Arg Ile Asp Asn Leu Asn Lys Arg Met Gln Asp Gly<br />

420 425 430<br />

Phe Leu Asp Val Trp Thr Tyr Asn Ala Glu Leu Leu Val Leu Leu Glu<br />

435 440 445<br />

Asn Glu Arg Thr Leu Asp Met His Asp Ala Asn Val Lys Asn Leu His<br />

450 455 460<br />

- 182 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


Glu Lys Val Lys Ser Gln Leu Arg Asp Asn Ala Asn Asp Leu Gly Asn<br />

465 470 475 480<br />

Gly Cys Phe Glu Phe Trp His Lys Cys Asp Asn Glu Cys Ile Glu Ser<br />

485 490 495<br />

Val Lys Asn Gly Thr Tyr Asp Tyr Pro Lys Tyr Gln Thr Glu Ser Lys<br />

500 505 510<br />

Leu Asn Arg Leu Lys Ile Glu Ser Val Lys Leu Glu Asn Leu Gly Val<br />

515 520 525<br />

Tyr Gln Ile Leu Ala Ile Tyr Ser Thr Val Ser Ser Ser Leu Val Leu<br />

530 535 540<br />

Val Gly Leu Ile Met Ala Met Gly Leu Trp Met Cys Ser Asn Gly Ser<br />

545 550 555 560<br />

Met Gln Cys Asn Val Cys Ile<br />

565<br />

42<br />

450<br />

PRT<br />

Influenza A virus<br />

42<br />

Met Asn Pro Asn Gln Lys Ile Ile Thr Ile Gly Ser Ile Cys Met Val<br />

1 5 10 15<br />

Val Gly Ile Ile Ser Leu Met Leu Gln Ile Gly Asn Ile Ile Ser Ile<br />

20 25 30<br />

Trp Val Ser His Ile Ile Gln Thr Gly His Pro Asn Gln Pro Gly Pro<br />

35 40 45<br />

- 183 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


Cys Asn Gln Ser Ile Asn Phe Tyr Thr Glu Gln Ala Ala Ala Ser Val<br />

50 55 60<br />

Thr Leu Ala Gly Asn Ser Ser Leu Cys Pro Ile Ser Gly Trp Ala Ile<br />

65 70 75 80<br />

Tyr Ser Lys Asp Asn Ser Ile Arg Ile Gly Ser Lys Gly Asp Val Phe<br />

85 90 95<br />

Val Met Arg Glu Pro Phe Val Ser Cys Ser His Leu Glu Cys Arg Thr<br />

100 105 110<br />

Phe Phe Leu Thr Gln Gly Ala Leu Leu Asn Asp Lys His Ser Asn Gly<br />

115 <strong>12</strong>0 <strong>12</strong>5<br />

Thr Val Lys Asp Arg Ser Pro Tyr Arg Thr Leu Met Ser Cys Pro Val<br />

130 135 140<br />

Gly Glu Ala Pro Ser Pro Tyr Asn Ser Arg Phe Glu Ser Val Ala Trp<br />

145 150 155 160<br />

Ser Ala Ser Ala Cys His Asp Gly Ile Ser Trp Leu Thr Ile Gly Ile<br />

165 170 175<br />

Ser Gly Pro Asp Asn Gly Ala Val Ala Val Leu Lys Tyr Asn Gly Ile<br />

180 185 <strong>19</strong>0<br />

Ile Thr Asp Thr Ile Lys Ser Trp Arg Asn Asn Ile Leu Arg Thr Gln<br />

<strong>19</strong>5 200 205<br />

Glu Ser Glu Cys Ala Cys Val Asn Gly Ser Cys Phe Thr Val Met Thr<br />

210 215 220<br />

Asp Gly Pro Ser Asn Glu Gln Ala Ser Tyr Lys Ile Phe Lys Ile Glu<br />

225 230 235 240<br />

Lys Gly Lys Val Val Lys Ser Val Glu Leu Asn Ala Pro Asn Tyr His<br />

- 184 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


245 250 255<br />

Tyr Glu Glu Cys Ser Cys Tyr Pro Asp Ala Gly Glu Ile Thr Cys Val<br />

260 265 270<br />

Cys Arg Asp Asn Trp His Gly Ser Asn Arg Pro Trp Val Ser Phe Asn<br />

275 280 285<br />

Gln Asn Leu Glu Tyr Gln Ile Gly Tyr Ile Cys Ser Gly Val Phe Gly<br />

290 295 300<br />

Asp Ser Pro Arg Pro Asn Asp Gly Thr Gly Ser Cys Gly Pro Val Ser<br />

305 310 315 320<br />

Leu Asn Gly Glu Tyr Gly Val Lys Gly Phe Ser Phe Lys Tyr Gly Asp<br />

325 330 335<br />

Gly Val Trp Ile Gly Arg Thr Lys Ser Thr Ser Ser Arg Ser Gly Phe<br />

340 345 350<br />

Glu Met Ile Trp Asp Pro Asn Gly Trp Thr Glu Thr Asp Ser Asn Phe<br />

355 360 365<br />

Ser Leu Lys Gln Asp Ile Ile Ala Ile Thr Asp Trp Ser Gly Tyr Ser<br />

370 375 380<br />

Gly Ser Phe Val Gln His Pro Glu Leu Thr Gly Leu Asn Cys Met Arg<br />

385 390 395 400<br />

Pro Cys Phe Trp Val Glu Leu Ile Arg Gly Arg Pro Lys Glu Lys Thr<br />

405 410 415<br />

Ile Trp Thr Ser Gly Ser Ser Ile Ser Phe Cys Gly Val Asn Ser Asp<br />

420 425 430<br />

Thr Val Gly Trp Ser Trp Pro Asp Gly Ala Glu Val Pro Phe Thr Ile<br />

- 185 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


Asp Lys<br />

450<br />

435 440 445<br />

43<br />

566<br />

PRT<br />

Influenza A virus<br />

43<br />

Met Ile Ala Ile Ile Ile Leu Ala Ile Val Val Ser Thr Ser Lys Ser<br />

1 5 10 15<br />

Asp Arg Ile Cys Ile Gly Tyr His Ala Asn Asn Ser Thr Thr Gln Val<br />

20 25 30<br />

Asp Thr Ile Leu Glu Lys Asn Val Thr Val Thr His Ser Val Glu Leu<br />

35 40 45<br />

Leu Glu Asn Gln Lys Glu Asn Arg Phe Cys Arg Val Leu Asn Lys Ala<br />

50 55 60<br />

Pro Leu Asp Leu Met Asp Cys Thr Thr Glu Gly Trp Ile Leu Gly Asn<br />

65 70 75 80<br />

Pro Arg Cys Asp Asn Leu Leu Gly Asp Gln Ser Trp Ser Tyr Ile Val<br />

85 90 95<br />

Glu Arg Pro Asp Ala Gln Asn Gly Ile Cys Tyr Pro Gly Val Leu Lys<br />

100 105 110<br />

Glu Thr Glu Glu Leu Lys Ala Leu Ile Gly Ser Ile Asp Ser Ile Gln<br />

115 <strong>12</strong>0 <strong>12</strong>5<br />

Arg Phe Glu Met Phe Pro Lys Ser Thr Trp Thr Gly Val Asp Thr Asn<br />

- 186 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


130 135 140<br />

Ser Gly Val Thr Ser Ala Cys Pro Tyr Asn Gly Glu Ser Ser Phe Tyr<br />

145 150 155 160<br />

Arg Asn Leu Leu Trp Ile Ile Lys Ile Arg Ser Asp Pro Tyr Ser Leu<br />

165 170 175<br />

Ile Lys Gly Thr Tyr Thr Asn Thr Gly Ser Gln Pro Ile Leu Tyr Phe<br />

180 185 <strong>19</strong>0<br />

Trp Gly Val His His Pro Pro Asp Glu Val Glu Gln Ala Asn Leu Tyr<br />

<strong>19</strong>5 200 205<br />

Gly Ile Gly Thr Arg Tyr Val Arg Met Gly Thr Glu Ser Met Asn Phe<br />

210 215 220<br />

Ala Lys Gly Pro Glu Ile Ala Gly Arg Pro Pro Ala Asn Gly Gln Arg<br />

225 230 235 240<br />

Gly Arg Ile Asp Tyr Tyr Trp Ser Val Leu Lys Pro Gly Glu Thr Leu<br />

245 250 255<br />

Asn Val Glu Ser Asn Gly Asn Leu Ile Ala Pro Trp Tyr Ala Tyr Lys<br />

260 265 270<br />

Phe Thr Ser Ser Arg Asn Lys Gly Ala Ile Phe Lys Ser Asp Leu Pro<br />

275 280 285<br />

Ile Glu Asn Cys Asp Ala Val Cys Gln Thr Leu Ala Gly Ala Ile Asn<br />

290 295 300<br />

Thr Asn Lys Thr Phe Gln Asn Ile Ser Pro Val Trp Ile Gly Glu Cys<br />

305 310 315 320<br />

Pro Lys Tyr Val Lys Ser Lys Ser Leu Lys Leu Ala Thr Gly Leu Arg<br />

325 330 335<br />

- 187 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


Asn Val Pro Gln Ala Glu Thr Arg Gly Leu Phe Gly Ala Ile Ala Gly<br />

340 345 350<br />

Phe Ile Glu Gly Gly Trp Thr Gly Met Val Asp Gly Trp Tyr Gly Tyr<br />

355 360 365<br />

His His Glu Asn Ser Gln Gly Ser Gly Tyr Ala Ala Asp Lys Glu Ser<br />

370 375 380<br />

Thr Gln Lys Ala Ile Asp Gly Ile Thr Asn Lys Val Asn Ser Ile Ile<br />

385 390 395 400<br />

Asp Lys Met Asn Thr Gln Phe Glu Ala Val Glu His Glu Phe Ser Ser<br />

405 410 415<br />

Leu Glu Arg Arg Ile Gly Asn Leu Asn Lys Arg Met Glu Asp Gly Phe<br />

420 425 430<br />

Leu Asp Val Trp Thr Tyr Asn Ala Glu Leu Leu Val Leu Leu Glu Asn<br />

435 440 445<br />

Glu Arg Thr Leu Asp Met His Asp Ala Asn Val Lys Asn Leu His Glu<br />

450 455 460<br />

Lys Val Lys Ser Gln Leu Arg Asp Asn Ala Lys Asp Leu Gly Asn Gly<br />

465 470 475 480<br />

Cys Phe Glu Phe Trp His Lys Cys Asp Asn Glu Cys Ile Asn Ser Val<br />

485 490 495<br />

Lys Asn Gly Thr Tyr Asp Tyr Pro Lys Tyr Gln Glu Glu Ser Arg Leu<br />

500 505 510<br />

Asn Arg Gln Glu Ile Lys Ser Val Met Leu Glu Asn Leu Gly Val Tyr<br />

515 520 525<br />

- 188 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


Gln Ile Leu Ala Ile Tyr Ser Thr Val Ser Ser Ser Leu Val Leu Val<br />

530 535 540<br />

Gly Leu Ile Ile Ala Met Gly Leu Trp Met Cys Ser Asn Gly Ser Met<br />

545 550 555 560<br />

Gln Cys Lys Ile Cys Ile<br />

565<br />

44<br />

469<br />

PRT<br />

Influenza A virus<br />

44<br />

Met Asn Pro Asn Gln Arg Ile Ile Thr Ile Gly Ser Val Ser Leu Thr<br />

1 5 10 15<br />

Ile Ala Thr Val Cys Phe Leu Met Gln Ile Ala Ile Leu Ala Thr Thr<br />

20 25 30<br />

Val Thr Leu His Phe Lys Gln Asn Glu Cys Ser Ile Pro Ala Asn Asn<br />

35 40 45<br />

Gln Val Thr Pro Cys Glu Pro Ile Val Ile Glu Arg Asn Ile Thr Glu<br />

50 55 60<br />

Ile Val Tyr Leu Asn Asn Thr Thr Ile Glu Lys Glu Ile Cys Pro Glu<br />

65 70 75 80<br />

Val Val Glu Tyr Arg Asn Trp Ser Lys Pro Gln Cys Gln Ile Thr Gly<br />

85 90 95<br />

Phe Ala Pro Phe Ser Lys Asp Asn Ser Ile Arg Leu Ser Ala Gly Gly<br />

100 105 110<br />

- 189 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


Asp Ile Trp Ile Thr Arg Glu Pro Tyr Val Ser Cys Asp Pro Ser Lys<br />

115 <strong>12</strong>0 <strong>12</strong>5<br />

Cys Tyr Gln Phe Ala Leu Gly Gln Gly Thr Thr Leu Asp Asn Lys His<br />

130 135 140<br />

Ser Asn Gly Thr Ile His Asp Arg Ile Pro His Arg Thr Leu Leu Met<br />

145 150 155 160<br />

Asn Glu Leu Gly Val Pro Phe His Leu Gly Thr Lys Gln Val Cys Ile<br />

165 170 175<br />

Ala Trp Ser Ser Ser Ser Cys His Asp Gly Lys Ala Trp Leu His Val<br />

180 185 <strong>19</strong>0<br />

Cys Val Thr Gly Asp Asp Arg Asn Ala Thr Ala Ser Phe Ile Tyr Asp<br />

<strong>19</strong>5 200 205<br />

Gly Met Leu Ile Asp Ser Ile Gly Ser Trp Ser Gln Asn Ile Leu Arg<br />

210 215 220<br />

Thr Gln Glu Ser Glu Cys Val Cys Ile Ser Gly Thr Cys Thr Val Val<br />

225 230 235 240<br />

Met Thr Asp Gly Ser Ala Ser Gly Arg Ala Asp Thr Arg Ile Leu Phe<br />

245 250 255<br />

Ile Arg Glu Gly Lys Ile Val His Ile Ser Pro Leu Ser Gly Ser Ala<br />

260 265 270<br />

Gln His Val Glu Glu Cys Ser Cys Tyr Pro Arg Tyr Pro Asn Val Arg<br />

275 280 285<br />

Cys Val Cys Arg Asp Asn Trp Lys Gly Ser Asn Arg Pro Val Ile Asp<br />

290 295 300<br />

- <strong>19</strong>0 -<br />

공개특허 10-2009-0053794


Ile Asn Met Ala Asp Tyr Ser Ile Asp Ser Ser Tyr Val Cys Ser Gly<br />

305 310 315 320<br />

Leu Val Gly Asp Thr Pro Arg Asn Asp Asp Ser Ser Ser Ser Ser Asn<br />

325 330 335<br />

Cys Arg Asp Pro Asn Asn Glu Arg Gly Asn Pro Gly Val Lys Gly Trp<br />

340 345 350<br />

Ala Phe Asp Asn Gly Asn Asp Val Trp Met Gly Arg Thr Ile Ser Lys<br />

355 360 365<br />

Asp Ser Arg Ser Gly Tyr Glu Thr Phe Lys Val Ile Gly Gly Trp Ala<br />

370 375 380<br />

Ile Ala Asn Ser Lys Ser Gln Thr Asn Arg Gln Val Ile Val Asp Asn<br />

385 390 395 400<br />

Asn Asn Trp Ser Gly Tyr Ser Gly Ile Phe Ser Val Glu Ser Lys Gly<br />

405 410 415<br />

Cys Ile Asn Arg Cys Phe Tyr Val Glu Leu Ile Arg Gly Arg Pro Gln<br />

420 425 430<br />

Glu Thr Arg Val Trp Trp Thr Ser Asn Ser Ile Val Val Phe Cys Gly<br />

435 440 445<br />

Thr Ser Gly Thr Tyr Gly Thr Gly Ser Trp Pro Asp Gly Ala Asn Ile<br />

450 455 460<br />

Asp Phe Met Pro Ile<br />

465<br />

45<br />

1464<br />

DNA<br />

- <strong>19</strong>1 -<br />

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Influenza A virus<br />

45<br />

agcaaaagca gggtgatcga gaatgaatcc aaatcagaaa ctatttgcat tatctggagt 60<br />

ggcaatagca cttagtgtac tgaacttatt gataggaatc tcaaacgtcg gattgaacgt <strong>12</strong>0<br />

atctctacat ctaaaggaaa aaggacccaa acaggaggag aatttaacat gcacgaccat 180<br />

taatcaaaac aacactactg tagtagaaaa cacatatgta aataatacaa caataattac 240<br />

caagggaact gatttgaaaa caccaagcta tctgctgttg aacaagagcc tgtgcaatgt 300<br />

tgaagggtgg gtcgtgatag caaaagacaa tgcagtaaga tttggggaaa gtgaacaaat 360<br />

cattgttacc agggagccat atgtatcatg cgacccaaca ggatgcaaaa tgtatgcctt 420<br />

gcaccaaggg actaccatta ggaacaaaca ttcaaatgga acgattcatg acagaacagc 480<br />

tttcagaggt ctcatctcca ctccattggg cactccacca accgtaagta acagtgactt 540<br />

tatgtgtgtt ggatggtcaa gcacaacttg ccatgatggg attgctagga tgactatctg 600<br />

tatacaagga aataatgaca atgctacagc aacggtttat tacaacagaa ggctgaccac 660<br />

taccattaag acctgggcca gaaacattct gaggactcaa gaatcagaat gtgtgtgcca 720<br />

caatggcaca tgtgcagttg taatgaccga cggatcggct agtagtcaag cctatacaaa 780<br />

agtaatgtat ttccacaagg gattagtagt taaggaggag gagttaaggg gatcagccag 840<br />

acatattgag gaatgctcct gttatggaca caatcaaaag gtgacctgtg tgtgcagaga 900<br />

taactggcag ggagcaaaca ggcctattat agaaattgat atgagcacat tggagcacac 960<br />

aagtagatac gtgtgcactg gaattctcac agacaccagc agacctgggg acaaatctag 1020<br />

tggtgattgt tccaatccaa taactgggag tcccggcgtt ccgggagtga agggattcgg 1080<br />

- <strong>19</strong>2 -<br />

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gtttctaaat ggggataaca catggcttgg taggaccatc agccccagat caagaagtgg 1140<br />

attcgaaatg ttgaaaatac ctaatgcagg tactgatccc aattctagaa tagcagaacg <strong>12</strong>00<br />

acaggaaatt gtcgacaata acaattggtc aggctattcc ggaagcttta ttgactattg <strong>12</strong>60<br />

gaatgataac agtgaatgct acaatccatg cttttacgta gagttaatta gaggaagacc 1320<br />

cgaagaggct aaatacgtat ggtgggcaag taacagtcta attgccctat gtggaagccc 1380<br />

attcccagtt gggtctggtt ccttccccga tggggcacaa atccaatact tttcgtaaaa 1440<br />

tgcaaaaaca cccttgtttc tact 1464<br />

- <strong>19</strong>3 -<br />

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