tipizzazione e caratterizzazione di varietà precoci di patata ... - PbgLab

SIGILLO INdAGINE SuLLO STATO fITOSANITARIO dELLE PROduzIONI dI VARIETà PRECOCI dI PATATA dA CONSuMO
Il PVX è il responsabile del mosaico leggero della
patata, è facilmente trasmissibile (prevalentemente
per contatto) e causa sintomi la cui severità varia
in base alla cultivar colpita. La sintomatologia comprende
un mosaico internervale più o meno accentuato,
la riduzione delle dimensioni fogliari e l’increspatura
dei margini del lembo fino alla necrosi
dei tessuti; in alcuni casi il virus si può presentare in
forma latente 1.
Il PLRV è l’agente dell’accartocciamento fogliare
della patata. Le piante infette presentano clorosi
diffusa sulle foglie apicali che si ripiegano a doccia
verso l’alto, inoltre i tessuti fogliari si ispessiscono assumendo
consistenza vetrosa. L’evidenza dei sintomi
è fortemente condizionata dalla varietà e dall’epoca
di infezione 1.
Il virus più diffuso su patata è universalmente il
Potato virus Y (PVY), capostipite della famiglia dei
Potyvirus 5. Sia in America che in Europa la sua presenza
viene monitorata nei programmi di certificazione
della patata da seme e le normative sementiere
prevedono, per la commercializzazione, la presenza
dell’organismo solo entro determinate soglie di tolleranza
5.
Il PVY è agente del mosaico nervale della patata.
La malattia si manifesta comunemente come una
clorosi maculata del lembo fogliare che assume un
aspetto ruvido-rugoso. Le nervature vanno incontro a
processi necrotici talvolta seguiti anche da necrosi del
picciolo e dello stelo 1.
Il virus Y è distinto in tre tipologie principali: il
PVY O, PVY N e PVY C, caratterizzate dalla diversa sintomatologia
che inducono in Nicotiana tabacum 5.
Il primo ad essere stato descritto e ritrovato in tutto
il mondo è stato il PVY O (ceppo comune) ma successivamente,
prima in Europa e poi negli altri continenti,
è stato rilevato un nuovo gruppo: il PVY N
(ceppo necrotico) 6, 7. All’interno del gruppo PVY N
sono stati successivamente identificati ulteriori ceppi,
originati dalla ricombinazione genetica del PVY O
con il PVY N. La loro classificazione è in continua evoluzione
e diversi autori si sono occupati della loro
patogenesi 5. Nel nostro lavoro, faremo riferimento
alla classificazione utilizzata da Lorenzen 8 che riconosce,
oltre ai due gruppi principali (PVY N e PVY O), i
sottogruppi PVY N:O (Wilga-type) 9-11, PVY NTN (agente
della maculatura ad anelli dei tuberi di patata) 12, NA-
PVY N e NA-PVY NTN (isolati nordamericani del PVY N
e PVY NTN) 13. Questa classificazione è basata sulle sequenze
nucleotidiche e sui punti di ricombinazione
del genoma 11. Nel caso del PVY NTN sembrerebbe che
una ricombinazione a livello della coat protein 14 sia
responsabile della capacità di tali ceppi di determinare
la maculatura necrotica; ulteriori studi dimostrano
però che non tutti i ceppi NTN presentano tale ricombinazione
15.
diversa è la classificazione del PVY basata sul
comportamento sierologico. Mediante l’uso di antisieri
monoclonali, infatti, è possibile riconoscere solo
i tre sierotipi: PVYO, PVYN e PVYC 16. In base alla
reazione sierologica, i ceppi Wilga (PVYN:O), inoltre,
vengono riconosciuti come sierotipi O anche se si
comportano in vivo come ceppi necrotici e gli isolati
NTN non vengono distinti dagli N
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17, 18.
un altro importante potyvirus che infetta la patata è
il Potato virus V (PVV). Alcuni isolati europei di PVV
erano originariamente considerati varianti di isolati
di PVY C poiché causavano sintomi necrotici nelle varietà
contenenti il gene Nc, gene responsabile della
risposta di ipersensibilità di isolati di PVY C in patata.
Successivamente fu verificata la presenza, in queste
stesse cultivar, del gene Nv, responsabile di una reazione
di ipersensibilità specifica nei confronti degli
isolati di PVV. Il PVY C e il PVV sono inoltre sierologicamente
distinguibili 19.
In questo lavoro vengono presentati i risultati di
un’indagine eseguita dall’anno 2008 all’anno 2010
al fine di studiare lo stato fitosanitario di tuberi di
patata precoce da consumo prodotti nel Sud Italia.
La ricerca è stata condotta nell’ambito del progetto
“Tipicizzazione e caratterizzazione di varietà precoci
di patata con l’impiego di tecniche molecolari e spettroscopiche”
finanziato dal Ministero delle Politiche
Agricole, Alimentari e forestali.
Oggetto dello screening è stata la ricerca di R. solanacearum
e PSTVd. Oltre a questi due patogeni
da quarantena, sono stati ricercati i più importanti
patogeni di qualità presenti su territorio nazionale,
dedicando particolare interesse ai virus trasmissibili
per tubero-seme: virus X, V e Y della patata e il virus
dell’accartocciamento fogliare (PLRV) 5.
Nel caso del virus Y, inoltre, è stato eseguito uno
studio filogenetico delle varianti genetiche al fine di
ricercare anche una eventuale correlazione tra sequenze
nucleotidiche e l’origine geografica degli isolati.
Materiali e metodi
Le analisi sono state eseguite in tre anni successivi,
dal 2008 al 2010, su un totale di 119 campioni di