tipizzazione e caratterizzazione di varietà precoci di patata ... - PbgLab

LA PROTEOMICA SCELZA
tato da Delaplace et al. 3, ha permesso di estrarre
una maggior quantità di proteine e di ottenere gel
di migliore qualità. La concentrazione di proteine
riscontrata nelle cv siciliane oggetto di studio (Antea,
Arinda e Spunta) è risultata maggiore rispetto a
quelle campane e pugliesi, probabilmente a causa
di fattori ambientali. Infatti la temperatura durante
la crescita della pianta, le origini geografiche, la
data di raccolta ed il tempo di conservazione possono
influenzare le proprietà della patata 11-14. La
quantità di proteine misurata nei tuberi oggetto di
studio è stata comunque maggiore rispetto a quella
riportata in letteratura, pari a 1,55 g per 100 g
di patata liofilizzata 15. Questo risultato potrebbe
essere spiegato dalla non preventiva eliminazione
del periderma (o buccia) dai tuberi analizzati, dal
momento che la buccia è la frazione che contiene
la maggior concentrazione di proteine 16.
Le frazioni proteiche estratte dai tuberi provenienti
dalle diverse regioni oggetto di studio sono
state analizzate mediante elettroforesi 2D per meglio
evidenziare il profilo proteico dei tuberi e
per individuare eventuali marcatori molecolari. Le
proteine del tubero di patata possono essere classificate
in tre gruppi: le patatine, gli inibitori delle
proteasi e altre proteine 17. I primi due gruppi
rappresentano la frazione principale delle proteine
della patata. Le varie isoforme sono legate ad attività
enzimatiche e di inibizione che potrebbero
avere rilevanza fisiologica 10. Le patatine, in particolare,
considerate il principale gruppo di proteine di
conservazione e difesa della patata, rappresentano
un gruppo di glicoproteine con peso molecolare
nell’intervallo di 40-45 kDa e il 40% di tutte le proteine
solubili presenti nei tuberi di patata 18. Da
quanto riportato in letteratura le patatine sembrano
essere coinvolte nelle attività di alcuni enzimi, quali
esterasi degli acidi grassi, aciltransferasi e acil idrolasi
lipidica 19-21.
Nei proteomi delle diverse cv analizzate il gruppo
delle patatine è risultato essere sempre presente
e sempre molto espresso rispetto al totale delle
proteine rilevate. Proteine a più basso peso molecolare
(72 kD) che, in accordo con quanto riportato da
Lehesranta et al. 7, sarebbero proteine coinvolte nel
metabolismo dei fenoli e nel loro deposito nei tuberi.
Conclusioni
Alla luce dei risultati ottenuti l’analisi proteomica
dei tuberi di patata può essere considerata un
buono strumento per individuare marker molecolari
che possano essere utili all’identificazione e alla
tipizzazione dei tuberi di patata. Ciò nonostante il
contributo di una successiva analisi di spettrometria
di massa che permette l’identificazione delle
proteine presenti nei gel elettroforetici 2D si rende
necessario e può rafforzare la validità e l’applicabilità
delle tecniche proteomiche.
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