SCELZA LA PROTEOMICA Tabella I.
LA PROTEOMICA SCELZA tato da Delaplace et al. 3, ha permesso <strong>di</strong> estrarre una maggior quantità <strong>di</strong> proteine e <strong>di</strong> ottenere gel <strong>di</strong> migliore qualità. La concentrazione <strong>di</strong> proteine riscontrata nelle cv siciliane oggetto <strong>di</strong> stu<strong>di</strong>o (Antea, Arinda e Spunta) è risultata maggiore rispetto a quelle campane e pugliesi, probabilmente a causa <strong>di</strong> fattori ambientali. Infatti la temperatura durante la crescita della pianta, le origini geografiche, la data <strong>di</strong> raccolta ed il tempo <strong>di</strong> conservazione possono influenzare le proprietà della <strong>patata</strong> 11-14. La quantità <strong>di</strong> proteine misurata nei tuberi oggetto <strong>di</strong> stu<strong>di</strong>o è stata comunque maggiore rispetto a quella riportata in letteratura, pari a 1,55 g per 100 g <strong>di</strong> <strong>patata</strong> liofilizzata 15. Questo risultato potrebbe essere spiegato dalla non preventiva eliminazione del periderma (o buccia) dai tuberi analizzati, dal momento che la buccia è la frazione che contiene la maggior concentrazione <strong>di</strong> proteine 16. Le frazioni proteiche estratte dai tuberi provenienti dalle <strong>di</strong>verse regioni oggetto <strong>di</strong> stu<strong>di</strong>o sono state analizzate me<strong>di</strong>ante elettroforesi 2D per meglio evidenziare il profilo proteico dei tuberi e per in<strong>di</strong>viduare eventuali marcatori molecolari. Le proteine del tubero <strong>di</strong> <strong>patata</strong> possono essere classificate in tre gruppi: le patatine, gli inibitori delle proteasi e altre proteine 17. I primi due gruppi rappresentano la frazione principale delle proteine della <strong>patata</strong>. Le varie isoforme sono legate ad attività enzimatiche e <strong>di</strong> inibizione che potrebbero avere rilevanza fisiologica 10. Le patatine, in particolare, considerate il principale gruppo <strong>di</strong> proteine <strong>di</strong> conservazione e <strong>di</strong>fesa della <strong>patata</strong>, rappresentano un gruppo <strong>di</strong> glicoproteine con peso molecolare nell’intervallo <strong>di</strong> 40-45 kDa e il 40% <strong>di</strong> tutte le proteine solubili presenti nei tuberi <strong>di</strong> <strong>patata</strong> 18. Da quanto riportato in letteratura le patatine sembrano essere coinvolte nelle attività <strong>di</strong> alcuni enzimi, quali esterasi degli aci<strong>di</strong> grassi, aciltransferasi e acil idrolasi lipi<strong>di</strong>ca 19-21. Nei proteomi delle <strong>di</strong>verse cv analizzate il gruppo delle patatine è risultato essere sempre presente e sempre molto espresso rispetto al totale delle proteine rilevate. Proteine a più basso peso molecolare (72 kD) che, in accordo con quanto riportato da Lehesranta et al. 7, sarebbero proteine coinvolte nel metabolismo dei fenoli e nel loro deposito nei tuberi. Conclusioni Alla luce dei risultati ottenuti l’analisi proteomica dei tuberi <strong>di</strong> <strong>patata</strong> può essere considerata un buono strumento per in<strong>di</strong>viduare marker molecolari che possano essere utili all’identificazione e alla <strong>tipizzazione</strong> dei tuberi <strong>di</strong> <strong>patata</strong>. Ciò nonostante il contributo <strong>di</strong> una successiva analisi <strong>di</strong> spettrometria <strong>di</strong> massa che permette l’identificazione delle proteine presenti nei gel elettroforetici 2D si rende necessario e può rafforzare la vali<strong>di</strong>tà e l’applicabilità delle tecniche proteomiche. Bibliografia 1. Ogunseitan OA. Soil proteomics: extraction and analysis of proteins from soils. In: Nannipieri P and Smalla K, e<strong>di</strong>tors. Nucleic acids and proteins in soil. Soil Biology. Berlin, Heidelberg: Springer-Verlag; 2006. p. 95-115. 2. Matassino D, Occidente M. La proteomica al servizio della sicurezza alimentare e della tracciabilità <strong>di</strong> un prodotto. Atti del Convegno ‘Sicurezza alimentare e proteomica’, Benevento, 17 marzo 2003. ARS. 3. Delaplace P, van der Wal F, Dierick J-F, Cordewener JHG, Fauconnier M-L, du Jar<strong>di</strong>n P et al. Potato tuber proteomics: comparison of two complementary extraction methods designed for 2-DE of aci<strong>di</strong>c proteins. Proteomics 2006;6:6494-7. 4. Ierna A, Mauromicale G. Physiological and growth response to moderate water deficit of off-season potatoes in a Me<strong>di</strong>terranean environment. Agric Water Manag 2006;82:193-209. 5. Ierna A. Influence of harvest date on nitrate contents of three potato varieties for off-season production. J Food Compos Anal 2009;22:551-5. 6. Foti S. Early potatoes in Italy with particular reference to Sicily. Potato Res 1999;42:229-40. 7. Lehesranta SJ, Koistinen KM, Massat N, Davies HV, Shepherd LVT, McNicol JW et al. Effects of agricultural production systems and their components on protein profiles of potato tubers. Proteomics 2007;7:597-604. Vol. 24 - Suppl. 1 al N. 1 MINERVA BIOTECNOLOGICA 41