tipizzazione e caratterizzazione di varietà precoci di patata ... - PbgLab

CIRILLO PROGETTAZIONE E SINTESI DI DNA RICOMBINANTE
tabElla iv. — Sono riportati media, deviazione standard e coefficiente di variazione dei valori di Ct ottenuti dall’amplificazione
di sette geni target, I. — campioni preamplificati rispetto ai non preamplificati mostrano una riduzione altamente significativa
(p< 0,0001) del valore di Ct in un intervallo tra 3,03 e 7,45.
leu tRNA adh1 le1
Matrice
Non
non
Non
Preamplificato preamplificato Preamplificato preamplificato Preamplificato preamplificato
Farina di soia 16,52±0,14 0,85% 19,54±1,05
- - 22,30±0,23 27,48±0,30
5,37%
1,03%
1,09%
Polenta 12,22±0,01 16,06±0,47 19,57±0,32 25,69±0,33
- -
0,13%
2,92%
1,63%
1,28%
Snack salato 12,68±0,02 17,49±0,09 29,08±0,16 34,65±0,67
- -
0,16%
0,52%
0,57%
1,93%
Snack al mais 11,49±0,22 14,44±0,30 20,09±0,13 25,23±0,74
- -
1,91%
2,10%
0,64%
2,91%
Merendina alla 14,83±0,50 19,46±0,62
- - - -
frutta
3,37%
3,19%
Mix shake 18,17±0,14 22,70±0,84 29,04±0,38 34,37±0,50 20,33±0,34 25,86±0,37
0,76%
3,7%
1,30%
1,47%
1,67%
1,43%
semi di soia tostati 19,31±0,38 22,79±0,17
- - 19,48±0,14 25,32±0,38
1,97%
0,74%
0,72%
1,50%
Pane di soia 13,25±0,35 17,42±0,41
- - 22,75±0,40 28,37±0,23
2,66%
2,36%
1,75%
0,81%
Latte di soia 14,62±0,35 19,48±0,82
- - 18,63±0,30 24,67±0,22
2,41%
4,2%
1,61%
0,89%
l’estremità 3’ del costrutto ed il genoma della pianta
ospite ottenendo risultato positivo solo per il DNA
estratto da polenta.
Tutte le reazioni di amplificazione in PCR Real
time sono state condotte sia sui campioni preamplificati
che non preamplificati ed i risultati sono stati
confrontati per verificare l’applicabilità della tecnica
ed individuarne gli effettivi vantaggi. I parametri che
sono stati considerati sono: la sensibilità, la linearità,
la precisione, l’efficienza e l’accuratezza.
La Tabella IV riporta i valori medi, la deviazione
standard (SD) e la deviazione standard relativa (CV)
dei valori di Ct. I campioni preamplificati, rispetto a
quelli non preamplificati, hanno mostrato un significativo
miglioramento dei valori di Ct (P