maturazione dell'rna
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Dott. Paolo Cascio<br />
LEZIONE VIII<br />
MATURAZIONE DELL’RNA
L’RNA PRESENTE NELLE CELLULE DI MAMMIFERO E’ COSI’ SUDDIVISO:<br />
80% rRNA<br />
15% tRNA<br />
5% mRNA<br />
L’RNA SINTETIZZATO DALLE RNA-POLIMERASI VIENE DEFINITO<br />
TRASCRITTO PRIMARIO. LA MAGGIOR PARTE DEI TRASCRITTI PRIMARI<br />
VANNO POI INCONTRO ALLE SEGUENTI MODIFICAZIONI:<br />
1) RIMOZIONE DI CERTE SEQUENZE DI NUCLEOTIDI;<br />
2) AGGIUNTA DI SEQUENZE DI NUCLEOTIDI NON CODIFICATE<br />
DAI GENI CORRISPONDENTI;<br />
3) MODIFICAZIONI COVALENTI DI CERTE BASI;<br />
L’INSIEME DEI PROCESSI CHE TRASFORMANO UN RNA TRASCRITTO<br />
PRIMARIO IN UNA MOLECOLA DI RNA DEFINITIVO PRENDONO IL NOME<br />
DI MATURAZIONE DELL’RNA.
VANNO INCONTRO A PROCESSI DI MATURAZIONE DELL’RNA TUTTI I<br />
tRNA E GLI rRNA DEI PROCARIOTI E TUTTE LE MOLECOLE DI RNA DEGLI<br />
EUCARIOTI.<br />
LA MATURAZIONE DELL’mRNA DEI PROCARIOTI CONSISTE<br />
ESCLUSIVAMENTE NELLA RIMOZIONE DEGLI INTRONI.<br />
ALCUNE MOLECOLE DI mRNA DEI PROCARIOTI VENGONO PERO’<br />
DIRETTAMENTE PRODOTTE COME TRASCRITTI PRIMARI<br />
COMPLETAMENTE MATURI.<br />
IL GRADO DI RIELABORAZIONE DELL’RNA E’ DIRETTAMENTE<br />
PROPORZIONALE ALLA SUA STABILITA’ POICHE’ NE AUMENTA LA<br />
RESISTENZA NEI CONFRONTI DI ENZIMI IDROLITICI (RNAsi).<br />
I tRNA E GLI rRNA VENGONO NOTEVOLMENTE RIELABORATI E HANNO<br />
UN TEMPO DI DIMEZZAMENTO NELL’ORDINE DI GIORNI.<br />
GLI mRNA DEGLI EUCARIOTI SUBISCONO PROCESSI DI<br />
RIELABORAZIONE MENO ESTESI E HANNO TEMPO DI DIMEZZAMENTO<br />
DI ORE.<br />
GLI mRNA DEI PROCARIOTI SPESSO NON SUBISCONO ALCUNA<br />
MODIFICAZIONE E HANNO TEMPI DI DIMEZZAMENTO NELL’ORDINE DI<br />
MINUTI.
MATURAZIONE DEGLI mRNA NEGLI EUCARIOTI<br />
NEGLI EUCARIOTI I LUNGHI TRASCRITTI PRIMARI DI mRNA (PRE-mRNA)<br />
SI TROVANO NEL NUCLEO DOVE COSTITUISCONO L’RNA NUCLEARE<br />
ETEROGENEO (hn-RNA). LA MATURAZIONE DELL’hn-RNA AVVIENE NEL<br />
NUCLEO ED E’ SEGUITA DAL TRASPORTO DELL’mRNA MATURO NEL<br />
CITOPLASMA (DOVE AVVIENE LA TRADUZIONE) ATTRAVERSO I PORI<br />
DELL’INVOLUCRO NUCLEARE.<br />
NEL NUCLEO L’hn-RNA SI ASSOCIA CON DELLE PROTEINE A FORMARE<br />
LE RIBONUCLEOPROTEINE ETEROGENEE (hnRNP).<br />
LE PROTEINE hnRNP FACILITANO I SUCCESSIVI PROCESSI DI<br />
MATURAZIONE DEL PRE-mRNA E INOLTRE PARTECIPANO AL<br />
TRASPORTO DELL’mRNA AL DI FUORI DEL NUCLEO.<br />
ANCORA PRIMA CHE L’hnRNA SIA COMPLETAMENTE TRASCRITTO LA<br />
SUA ESTREMITA’ 5’ SUBISCE UNA MODIFICAZIONE COVALENTE<br />
CONSISTENTE NELL’AGGIUNTA DI UN “CAPPUCCIO” DI 7-<br />
METILGUANOSINA.
UNA FOSFOIDROLASI RIMUOVE IL FOSFATO TERMINALE E IL GRUPPO 5’<br />
DIFOSFATO RISULTANTE REAGISCE CON IL FOSFORO IN α DI UNA<br />
MOLECOLA DI GTP.<br />
L’ENZIMA GUANILILTRANSFERASI TRASFERISCE IL GMP SUL GRUPPO 5’<br />
DIFOSFATO E ALLA GUANINA VIENE, POI, AGGIUNTO UN GRUPPO<br />
METILICO IN POSIZIONE N-7.
ULTERIORI METILAZIONI POSSO RIGUARDARE IL GRUPPO OSSIDRILICO<br />
2’ DELL’ULTIMO E DEL PENULTIMO NUCLEOTIDE DEL TRASCRITTO<br />
ORIGINALE
FUNZIONI DELLA STRUTTURA A “CAPPUCCIO” DI GTP:<br />
1) BLOCCA L’ESTREMITA’ 5’ DELL’mRNA E IN QUESTO MODO LO<br />
PROTEGGE DALL’AZIONE DELLE ESONUCLEASI 5’;<br />
2) RENDE L’mRNA SUSCETTIBILE AD ULTERIORI PROCESSI DI<br />
MATURAZIONE;<br />
3) SERVE COME SITO DI ATTACCO PER I RIBOSOMI DURANTE LA<br />
TRADUZIONE.<br />
I PRECURSORI DI TUTTI GLI mRNA EUCARIOTI AD ECCEZIONE DI<br />
QUELLI PER GLI ISTONI VENGONO MODIFICATI ANCHE A LIVELLO<br />
DELL’ESTREMITA’ 3’.<br />
UNA VOLTA CHE L’RNA-POLIMERASI II HA FINITO LA TRASCRIZIONE<br />
DEL GENE (CIOE’ DELLA SQUENZA CODIFICANTE), L’mRNA<br />
NEOSISNTETIZZATO VIENE SCISSO DA UNA ENDONUCLEASI VICINO AD<br />
UN SITO SPECIFICO CON SEQUENZA-CONSENSO AAUAAA.<br />
LA SCISSIONE AVVIENE A CIRCA 10-20 NUCLEOTIDI A VALLE DELLA<br />
SEQUENZA AAUAAA. L’ESTREMITA’ 3’ NEOFORMATA SERVE COME<br />
INNESCO PER L’AGGIUNTA DI RESIDUI MULTIPLI DI ADENOSINA,<br />
CATALIZZATA DA UN COMPLESSO MULTIENZIMATICO CHE UTILIZZA A
TALE SCOPO MOLECOLE DI ATP. IN QUESTO MODO POSSONO ESSERE<br />
AGGIUNTI FINO A 250 NUCLEOTIDI (CODA POLI-A).<br />
IL TAGLIO DELL’RNA E L’INIZIO DEL PROCESSO DI POLIADENILAZIONE<br />
AVVENGONO IN CONTEMPORANEA.<br />
IL TAGLIO E’ OPERATO DA 4 PROTEINE CHE SI ASSEMBLANO SULLA<br />
SEQUENZA CONSENSO AAUAAA:<br />
FATTORE SPECIFICO DI TAGLIO E POLIADENILAZIONE;<br />
FATTORE DI STIMOLAZIONE DEL TAGLIO;<br />
FATTORI DI TAGLIO I E II.<br />
LA POLIADENILAZIONE AVVIENE IN DUE FASI:<br />
1. FASE LENTA: VENGONO AGGIUNTI ca. 12 NUCLEOTIDI AD OPERA<br />
DELL’ENZIMA POLI(A)-POLIMERASI (PAP) CHE UTILIZZA A TALE<br />
SCOPO ATP;<br />
2. FASE VELOCE: VENGONO AGGIUNTI 200-250 NUCLEOTIDI AD<br />
OPERA DI PAP E DI UN’ALTRA PROTEINA CHIAMATA PABII.
CON UN MECCANISMO CHE NON CONOSCIAMO IL TAGLIO DELL’mRNA<br />
SEGNALA ALL’RNAPOLIMERASI II DI TERMINARE LA PROPRIA AZIONE.<br />
SI VENGONO COMUNQUE A ORIGINARE DELLE MOLECOLE DI RNA (TRA<br />
IL SITO DI TAGLIO E IL PUNTO IN CUI LA RNAPOLIMERASI II SI STACCA<br />
DAL DNA) LA CUI FUNZIONE E’ IGNOTA.<br />
5’<br />
pre-mRNA<br />
taglio<br />
3’<br />
INTANTO LE CODE POLI-A VENGONO PROGRESSIVAMENTE<br />
ACCORCIATE DA ESONUCLEASI 3’ (QUANDO L’mRNA RAGGIUNGE IL<br />
CITOPLASMA LA CODA POLI-A E’ INFATTI LUNGA CIRCA 50-100<br />
NUCLEOTIDI). PROBABILMENTE LA CODA PROTEGGE LA REGIONE<br />
CODIFICANTE DELL’mRNA DALL’AZIONE DI QUESTE ESONUCLEASI.<br />
QUESTE CODE, INOLTRE, SI ASSOCIANO AD UNA PROTEINA CHE<br />
STABILIZZA ULTERIORMENTE L’mRNA.<br />
5’<br />
?<br />
RNApol II<br />
DNA
IN MOLTI GENI EUCARIOTICI (A VOLTE ANCHE NEI PROCARIOTI E IN<br />
CERTI VIRUS) SONO PRESENTI DELLE SEQUENZE CHE NON APPAIONO<br />
NELL’mRNA MATURO. QUESTE SEQUENZE VENGONO DEFINITE<br />
SEQUENZE INTERCALARI O INTRONI E VENGONO ELIMINATE DAL<br />
TRASCRITTO PRIMARIO DI RNA MEDIANTE UN PROCESSO NOTO COME<br />
MONTAGGIO O SPLICING.<br />
GLI INTRONI SONO MOLTO RARI NEI GENI DEI PROCARIOTI E DEGLI<br />
EUCARIOTI PIU’ SEMPLICI (ES. LIEVITI E ALGHE) MA SONO MOLTO<br />
COMUNI NEI GENI DEGLI EUCARIOTI PIU’ COMPLESSI (PIANTE E<br />
MAMMIFERI).<br />
UN INTRONE SEPARANA DUE ESONI CIASCUNO DEI QUALI DI SOLITO<br />
CODIFICA PER UNA PICCOLA PARTE DELLA PROTEINA DOTATA DI UNA<br />
STRUTTURA SECONDARIA BEN DEFINITA E CHE SVOLGE UNA<br />
FUNZIONE SPECIFICA (QUESTE PICCOLE PORZIONI DI UNA PROTEINA<br />
VENGONO DEFINITI DOMINI).
ORGANIZZAZIONE DI UN GENE CONTENENTE INTRONI<br />
GLI ESONI SONO QUELLA PARTE DI GENE CHE DANNO ORIGINE ALLA<br />
SEQUENZA DI mRNA MATURO. ESSI CONTENGONO LE INFORMAZIONI<br />
PER LA SINTESI DELLE PROTEINE E COMPRENDONO ANCHE LE REGIONI<br />
5’ E 3’ CHE NON VENGONO TRADOTTE (5’ E 3’ UTR = UNTRANSLATED<br />
REGIONS).
OSSERVANDO AL MICROSCOPIO ELETTRONICO UNA MOLECOLA<br />
IBRIDA DI mRNA E DNA DEL RELATIVO GENE, IL DNA FORMA DELLE<br />
AMPIE ANSE A FILAMENTO SINGOLO (ANSE R). QUESTE ANSE<br />
CORRISPONDONO AGLI INTRONI (CHE NON HANNO UN FILAMENTO<br />
CORRISPONDENTE DI mRNA CON CUI APPAIARSI).<br />
SCHEMA DELL’IBRIDIZAZIONE TRA DNA CROMOSOMICO E mRNA. SE IL<br />
GENE PRESENTA DEGLI INTRONI SI FORMANO DELLE ANSE R.<br />
GLI INTRONI PRESENTI IN UN GENE VENGONO INDIVIDUATI MEDIANTE<br />
LA TECNICA DELLA MAPPATURA CON NUCLEASI S1. QUESTO ENZIMA<br />
DIGERISCE IL DNA A SINGOLA CATENA LIBERANDO COSI’ GLI ESONI<br />
CHE POSSONO ESSERE POI ANALIZZATI CON ELETTROFORESI SU GEL<br />
D’AGAROSO<br />
I SITI DI GIUNZIONE TRA ESONI ED INTRONI PRESENTANO DELLE<br />
SEQUENZE-CONSENSO INDISPENSABILI PER UNA CORRETTA<br />
RIMOZIONE DEGLI INTRONI.<br />
UN’ALTRA SEQUENZE-CONSENSO SI TROVA ALL’INTERNO<br />
DELL’INTRONE VICINO ALL’ESTREMITA’ 3’ (SITO DI RAMIFICAZIONE).
1) DOVE L’ESTREMITA’ 5’ DI UN INTRONE SI UNISCE ALL’ESONE 5’ SI<br />
TROVA LA SEQUENZA GU.<br />
2) DOVE L’ESTREMITA’ 3’ DI UN INTRONE SI UNISCE ALL’ESONE 3’ SI<br />
TROVA LA SEQUENZA AG.<br />
3) UN RESIDUO DI ADENOSINA FA PARTE DEL SITO DI RAMIFICAZIONE<br />
(E’ SITUATA A CIRCA 40 NUCLEOTIDI A MONTE DEL SITO DI GIUNZIONE<br />
3’).<br />
LA RIMOZIONE DEGLI INTRONI DELL’hn-RNA VIENE OPERATA DA UN<br />
COMPLESSO DI MONTAGGIO (O SPLICEOSOMA) FORMATO DA PROTEINE<br />
E RNA.<br />
L’INTRONE VIENE RIMOSSO CON DUE REAZIONI SUCCESSIVE DI<br />
TRANS-ESTERIFICAZIONE (CIOE’ ROTTURA DI UN LEGAME FOSFO-<br />
ESTERICO E FORMAZIONE DI UN ALTRO). IN ENTRAMBE LE REAZIONI<br />
VIENE QUINDI SCAMBIATO UN LEGAME FOSFOESTERICO CON UN<br />
ALTRO. POICHE’ LE DUE REAZIONI NON CAMBIANO IL MUMERO DI<br />
LEGAMI FOSFOESTERICI DELLA MOLECOLA, NON SI HA CONSUMO DI<br />
ENERGIA.
DURANTE LO SPLICING DELL’INTRONE VIENE COMUNQUE<br />
IDROLIZZATO DELL’ATP CHE FORNISCE L’ENERGIA NECESSARIA PER<br />
DELLE MODIFICAZIONI CONFORMAZIONALI DELLO SPLICESOMA<br />
INDISPENSABILI AFFINCHE’ POSSA SVOLGERE LA SUA FUNZIONE.<br />
LA PRIMA REAZIONE AVVIENE TRA IL FOSFATO PRESENTE<br />
ALL’ESTREMO 5’ DELL’INTRONE E L’OH (IN 2’) DELL’ADENOSINA NEL<br />
SITO DI RAMIFICAZIONE. LA SECONDA REAZIONE HA LUOGO TRA L’OH<br />
DELL’ESTREMO 3’ DI UN ESONE E IL FOSFATO DELL’ESTREMO 5’
DELL’ALTRO ESONE. L’INTRONE FORMA COSI’ UNA STRUTTURA A<br />
LACCIO (LARIAT) E VIENE ELIMINATO.<br />
STRUTTURA DEL LARIAT<br />
5’<br />
IL COMPLESSO DI MONTAGGIO (O SPLICEOSOMA) E’ COSTITUITO DA<br />
ALMENO UN CENTINAIO DI PROTEINE E MOLTE MOLECOLE DI RNA.<br />
QUESTO RNA E’ DETTO RNA NUCLEARE PICCOLO (snRNA, SMALL<br />
3’<br />
NUCLEAR) E NE ESISTONO 5 TIPI DIVERSI: U1, U2, U4, U5, U6.<br />
P<br />
A
L’RNA NUCLEARE PICCOLO SI ASSOCIA A DELLE PROTEINE E FORMA<br />
LE RIBONUCLEOPROTEINE NUCLEARI PICCOLE (snuRNPs, SMALL<br />
NUCLEAR RIBONUCLEOPROTEINS) LE QUALI SI ASSEMBLANO<br />
SEQUENZIALMENTE SULL’INTRONE E ORIGINANO COSI’ IL COMPLESSO<br />
DI MONTAGGIO.<br />
INIZIA LA snuRNP U1 CHE SI LEGA ALL’ESTREMO 5’ DELL’INTRONE<br />
POCO DOPO CHE QUESTO E’ STATO SINTETIZZATO. IL LEGAME<br />
RICHIEDE L’APPAIAMENTO TRA CIRCA 15-17 BASI DELL’INTRONE E DI<br />
U1.<br />
CON LO STESSO MECCANISMO (APPAIAMENTO DI BASI<br />
COMPLEMENTARI) snuRNP U2 SI LEGA AL SITO DI RAMIFICAZIONE PER<br />
CIRCA 40 NUCLEOTIDI.<br />
QUINDI snuRNP U5 SI ASSOCIA ALL’ESTREMITA’ 3’ DELL’INTRONE E A<br />
QUSTO PUNTO SI LEGANO ANCHE snuRNP U4 E U6 E SI FORMA IL<br />
COMPLESSO DI MONTAGGIO.<br />
LA LUNGHEZZA TOTALE DI RNA COPERTO DAL COMPLESSO DI<br />
MONTAGGIO E DI CIRCA 65 NUCLEOTIDI. QUESTA E’ LA LUNGHEZZA<br />
MINIMA DEGLI INTRONI, PERCHE’ INTRONI PIU’ PICCOLI NON<br />
PERMETTEREBBERO L’ASSEMBLAGGIO DI UN COMPLESSO DI<br />
MONTAGGIO.
LA FORMAZIONE DEL COMPLESSO DI MONTAGGIO RICHIEDE<br />
L’IDROLISI DI ATP PER PERMETTERE ALLE SUE VARIE COMPONENTI DI<br />
ASSEMBLARSI E DI ANDARE INCONTRO A DEI CAMBIAMENTI<br />
CONFORMAZIONALI INDISPENSABILI PERCHE’ LE DUE REAZIONI DI<br />
TRANS-ESTERIFICAZIONE ABBIANO LUOGO.<br />
IL LARIAT RIMANE PER UN BREVE PERIODO ASSOCIATO ALLO<br />
SPLICEOSOMA, POI VIENE RILASCIATO E VIENE VELOCEMENTE<br />
IDROLIZZATO DAPPRIMA DA UN ENZIMA DI DERAMIFICAZIONE (CHE<br />
IDROLIZZA IL LEGAME FOSFOESTERICO NEL SITO DI RAMIFICAZIONE) E<br />
POI DA VARIE RNAsi NUCLEARI.<br />
GLI INTRONI DI ALCUNE MOLECOLE DI hnRNA VENGONO RIMOSSI<br />
SECONDO L’ORDINE IN CUI SONO STATI TRASCRITTI (CIOE’ IN<br />
DIREZIONE 5’ → 3’). IN MOLTI ALTRI CASI, PERO’, VENGONO RIMOSSI<br />
PRIMA GLI INTRONI TRASCRITTI PIU’ TARDIVAMENTE (CIOE’ VERSO<br />
L’ESTREMO 3’ DELLA MOLECOLA DI RNA). QUESTO AVVIENE PERCHE’<br />
L’RNA NEOSINTETIZZATO SI ASSOCIA IMMEDIATAMENTE CON DELLE<br />
PROTEINE CHE CONFERISCONO ALLA MOLECOLA DI hnRNA DELLE<br />
STRUTTURE SECONDARIE E TERZIARIE PARTICOLARI CHE A LORO<br />
VOLTA DETERMINANO L’ORDINE CON CUI GLI INTRONI VENGONO<br />
RIMOSSI.
In vitro alcuni RNA, in certe condizioni non fisiologiche (elevate temperature ed<br />
elevata concentrazione di Mg++), in assenza di proteine eliminano lentamente gli<br />
introni. Alcuni introni sono quindi capaci di auto-splicing.<br />
Sono stati individuati due tipi di introni in grado di compiere auto-splicing:<br />
Introni di gruppo I presenti nei geni degli rRNA dei protozoi,<br />
Introni di gruppo II presenti nei geni codificanti per mRNA, tRNA, rRNA dei<br />
mitocondri e dei cloroplasti di piante e funghi.<br />
Introne del gruppo II snRNA U dello spliceosoma
Gli introni di gruppo II e gli snRNA U dello spliceosoma hanno struttura<br />
tridimensionale molto simile.<br />
Se sperimentalmente in vitro si rimuove un’ansa (es. ansa V) dell’introne del gruppo<br />
II l’auto-splicing non avviene più.<br />
Se però tale ansa viene aggiunta nella reazione (però separata, cioè non più unita con<br />
il resto dell’introne) la reazione di auto-splicing può avvenire nuovamente.<br />
Questo esperimento dimostra che i domini degli introni di gruppo II possono agire<br />
anche su molecole di RNA diverse da quelle che le contengono (cioè su introni di<br />
altri mRNA). Agiscono quindi in Trans.<br />
E’ ipotizzabile che gli introni attuali derivino da introni del gruppo II che nel corso<br />
dell’evoluzione hanno perso delle strutture interne, mentre contemporaneamente<br />
comparivano gli snRNA, che svolgevano le stesse funzioni ma per tutti gli mRNA<br />
della cellula.<br />
Questo fenomeno potrebbe aver reso più semplice e veloce l’evoluzione di nuove<br />
proteine a seguito dell’unione sul DNA di esoni appartenenti a geni diversi senza la<br />
necessità che tali esoni dovessero essere collegati dai grossi e complessi introni di<br />
gruppo II.<br />
Anche nello spliceosoma l’attività enzimatica che catalizza le due reazioni di trans-<br />
esterificazione è svolta dagli snRNAs mentre la componente proteica svolge solo una<br />
funzione di “impalcatura”.
L’RNA che è in grado di svolgere un’attività catalitica viene definito ribozima.<br />
Sono pertanto ribozimi gli RNA che intervengono nei processi di:<br />
• Auto-splicing degli introni di gruppo II;<br />
• Rimozione degli introni ad opera dello spliceosoma;<br />
• Formazione del legame peptidico ad opera del ribosoma.<br />
Il DNA può immagazzinare (sotto forma di una sequenza dei diversi nucleotidi) e<br />
trasmettere (alle cellule figlie) l’informazione genetica. Il DNA, però, non ha mai<br />
attività catalitica, quindi non può svolgere alcuna funzione in assenza delle proteine.<br />
Le proteine, invece, sono in grado di svolgere un’attività enzimatica. Non sono, però,<br />
adatte ad immagazzinare e trasmettere un’informazione genetica, quindi senza DNA<br />
mancano completamente le “istruzioni” per poterle correttamente sintetizzare.<br />
Nel corso dell’evoluzione quale di queste due classi di macromolecole è comparsa<br />
prima?
Secondo una teoria (nota come ipotesi del mondo a RNA) nessuna delle due.<br />
Per tale teoria una vita esclusivamente basata sull’RNA avrebbe preceduto l’odierna<br />
vita basata sul DNA. l’RNA, cioè, potrebbe esser stata originariamente l'unica<br />
molecola responsabile della vita cellulare o pre-cellulare.<br />
L'RNA è infatti in grado di immagazzinare, duplicare e trasmettere informazione<br />
genetica ma, rispetto al DNA, è in grado anche di catalizzare reazioni come gli<br />
enzimi proteici.<br />
La conservazione di grandi quantità di informazione nell'RNA non è però semplice. I<br />
lunghi filamenti di RNA sono, infatti, intrinsecamente fragili poiché l’OH in 2’ del<br />
ribosio può abbastanza facilmente attaccare il legame fosfoesterico adiacente<br />
portando quindi alla rottura della catena di RNA.<br />
L'ipotesi presuppone quindi che tale sistema basato sull'RNA si sarebbe poi evoluto<br />
nel corrente sistema comprendente anche DNA e proteine grazie alla maggiore<br />
stabilità chimica del DNA (necessario per la conservazione della preziosissima<br />
informazione genica) e alla superiore flessibilità catalitica che gli amminoacidi<br />
garantiscono.<br />
Secondo l'ipotesi del mondo ad RNA, dunque, l'RNA ancora presente nelle cellule<br />
sarebbe solo un residuo del mondo a RNA originale.
ALCUNI GENI POSSONO CODIFICARE PER PIU’ DI UNA PROTEINA<br />
DIVERSA E CIO’ DIPENDE DAL MODO IN CUI IL TRASCRITTO PRIMARIO<br />
VIENE ELABORATO IN mRNA MATURO.<br />
ALCUNI TRASCRITTI PRIMARI, INFATTI, CONTENGONO ESONI MULTIPLI<br />
CHE POSSONO ESSERE ABBINATI IN MODI DIFFERENTI A FORMARE<br />
mRNA (E QUINDI PROTEINE) DIVERSI (MONTAGGIO DIFFFERENZIALE O<br />
SLPICING ALTERNATIVO).<br />
IN PRATICA DURANTE LA RIMOZIONE DI 2 INTRONI ADIACENTI A<br />
VOLTE PUO’ VENIRE RIMOSSO ANCHE L’ESONE COMPRESO TRA DI ESSI.<br />
SI FORMANO COSI’ mRNA ALTERNATIVI CHE CODIFICANO PER FORME<br />
DIVERSE DELLA PROTEINA (ISOFORME).<br />
IN DROSOPHILA, AD ESEMPIO, UNO STESSO GENE CODIFICA PER DUE<br />
DIFFERENTI FORME DI TROPOMIOSINA I (PROTEINA MUSCOLARE):<br />
QUELLA EMBRIONALE E QUELLA DELL’ADULTO. DURANTE IL<br />
MONTAGGIO DELL’mRNA PER LA PROTEINA EMBRIONALE L’ESONE 3<br />
VIENE ELIMINATO INSIEME AI DUE INTRONI ADIACENTI E SI FORMA<br />
COSI’ UN mRNA CHE CODIFICA PER UNA PROTEINA PIU’ CORTA.
IL MECCANISMO GENERALE CHE PERMETTE LO SPLICING<br />
ALTERNATIVO SI BASA SULL’AZIONE DI SPECIFICHE PROTEINE CHE<br />
LEGANDOSI SUL PRE-mRNA MODULANO L’ATTIVITA’ DELLO<br />
SPLICESOMA IN MODO CHE NON VENGA RIMOSSO UN SINGOLO<br />
INTRONE MA UN SEGMENTIO DI RNA PIU’ LUNGO COMPRENDENTE DUE<br />
INTRONI E L’ESONE INTERCALATO.<br />
IN ALCUNI CASI IL GENE DI UNA DETERMINATA PROTEINA SI<br />
TROVANO ALL’INTERNO DI UN INTRONE DI UN’ALTRA PROTEINA (GENI<br />
INCASTONATI).<br />
AD ESEMPIO IN DROSOPHILA IL GENE PER LA PROTEINA GART (ENZIMA<br />
COINVOLTO NELLA SINTESI DELLE PURINE) CONTIENE 5 INTRONI NEL<br />
PRIMO DEI QUALI E’ PRESENTE UN GENE CHE CODIFICA PER UNA<br />
PROTEINA DELLA CUTICOLA.
MATURAZIONE DEI tRNA<br />
TUTTI I tRNA CITOPLASMATICI MATURI DERIVANO DA PRECURSORI<br />
NUCLEARI (PRE-tRNA).<br />
LA MATURAZIONE DEI tRNA AVVIENE NEL NUCLEO.<br />
LA MATURAZIONE DEI TRNA PREVEDE LE SEGUENTI MODIFICAZIONI:<br />
1<br />
2<br />
3
4<br />
4<br />
4<br />
1. RIMOZIONE DI UNA SEQUENZA DI LUNGHEZZA VARIABILE<br />
ALL’ESTREMITA’ 5’ AD OPERA DI UNA SPECIFICA ENDONUCLEASI;<br />
4
2. SOSTITUZIONE DI U PRESENTI ALL’ESTREMO 3’ CON LA<br />
SEQUENZA CCA ALLA QUALE POTRA’ POI LEGARSI<br />
L’AMINOACIDO;<br />
3. A VOLTE (NON PER TUTTI I tRNA) RIMOZIONE DI INTRONI CON UN<br />
MECCANISMO PERO’ DIVERSO DA QUELLI UTILIZZATI DALLO<br />
SPLICEOSOMA;<br />
4. MODIFICAZIONI COVALENTI DI SPECIFICI NUCLEOTIDI: ES.<br />
METILAZIONE DEL RIBOSIO O DELLE BASI (SE VIENE METILATO U<br />
SI TRASFORMA IN T) E DEAMINAZIONE DI CERTE BASI (NMOLTO<br />
IMPORTANTE LA DEAMINAZIONE DELL’ADENINA<br />
DELL’ANTICODONE IN POSIZIONE 1’ CHE LA CONVERTE IN<br />
INOSITOLO LA CUI PRESENZA RENDE POSSIBILE IL<br />
VACILLAMENTO DELLA TERZA BASE).
MATURAZIONE DEGLI rRNA ED ASSEMBLAGGIO DEI RIBOSOMI<br />
1. Gli rRNA 28S e 5,8S (della subunità ribosomiale maggiore) e l’rRNA 18S (di<br />
quella minore) sono trascritti come un unico pre-rRNA;<br />
2. I geni per questi pre-rRNA sono ripetuti centinaia di volte e sono localizzati<br />
nel nucleolo;<br />
3. Ciascun gene origina un unico pre-rRNA formato dagli rRNA 18S, 5,8S e 28S<br />
(5’ → 3’) uniti da segmenti di RNA di lunghezza variabile (RNA spaziatore<br />
trascritto);<br />
4. Il pre-rRNA si associa con proteine e RNA nucleolari brevi e si forma un<br />
complesso che catalizza la modificazione covalente di certi nucleotidi ma<br />
soprattutto la separazione dei 3 rRNA 18S, 5,8S e 28S. Tutti questi processi<br />
avvengono nel nucleolo;<br />
5. L’rRNA 5S viene sintetizzato in forma matura a partire da geni non localizzati<br />
nel nucleolo;<br />
6. Diffonde nel nucleolo e si associa con gli rRNA 28S, 5,8S e con le proteine<br />
ribosomiali a formare la subunità ribosomiale maggiore;
7. Le due subunità ribosomiali mjaggiore (60S) e minore (40S) si assemblano nel<br />
nucleolo, vengono trasportate attraverso i pori nucleari nel citoplasma e solo<br />
qui si forma il ribosoma maturo 80S.