Indice Appunti

Acetilazione degli istoni 20
Acetilazioni 21
ACP, Acccessory mem.-span. Protein 276
Adenilato ciclasi 171
Adenilato ciclasi, attiv. da forscolina 171
Adenilato ciclasi, CAM indipendente 173
Adenilato ciclasi, in membrana 171
Adenilato ciclasi, legame a forscolina 177
Adenilato ciclasi, sequenza putativa 172
Adenilato ciclasi, tossine 176
ADPribosilazioni 193
AMPciclico e Dictyostelium discoideum 173
AMPciclico, analoghi stabili 78
AMPciclico, enzimi produttori di 171
Ancoraggio di proteine 23
Anfinsen, gabbia 16
Antigelo, proteine 27
Antigeni T 203
AP1, element 242
Apoptosi 46
Arf, subfamiglia 299
Aspartico Trascarbamilasi e PALA 225
Ataxia Telangiectasia 219
ATM 219
ATM, interazioni 221
Attivatore tissutale del plasminogeno 55
Autofosforilazione tirosine 116
Autoinibitorio, sito della PKG 90
bHLHZ 251
Bip, induzione 14
Bombesina 200
Bordetella pertussis 176
BOSS, in Drosophila 264
bZIP, modificazione covalente 246
bZIP, sequenze 245
Caderine 73
Caderine, Tyr-cinasi e Tyr-fosfatasi 168
CAK-MO15 133
Calcineurina e attivazione di cellule T 161
Calcio-ATPasi plasmatica 96
Calmodulina, azione su AC e PDE 174
Calmodulina, struttura 45
Calnexina 15
Calsequestrina 231
CAM, molecole di adesione cellulare 73
CAP 88
Carbossilazione-γ del glutammico 54
Casein cinasi I 124
Casein cinasi II 124
Casein cinasi II, substrati della 125
Caspasi 47
Caspasi, attivazione in vivo 49
Caspasi, substrati delle 49
Caspasi, proprietà enzimatiche 48
Caspasi, struttura quaternaria 49
Cdc2 127
Cdc2, ciclo di attivazione 132
Cdc2, confronto con MAPcinasi 151
INDICE ANALITICO
(aggiornato per ediz. 2002-2003)
I
Cdc2, defosforilazione da Cdc25 132
Cdc2, riepilogo fosforilazioni 133
Cdc2, struttura primaria 131
Cdc2, subdomi HQH 120
Cdc2, substrati 130
Cdc42 e WASP 262
Cdc-cicline 134
Cdc-Cicline, inibitori di 144
Cdk4, Cdk6, interazioni con p16 222
Cdk-cicline 134
Ceck point G1-S 137
220
Cerniere di leucina 242
Chaperon molecolari 8
Chaperonine (altre) 12
Chaperonine, quadro di insieme 13
Cheratansolfato 60
Cicline, distruzione 135
Cicline, induzione 137
Cicline, struttura terziaria 143
Ciclo cellulare, contr. in liev. e mamm. 134
Ciclofiline 7
Ciclosporina ed immunosoppressione 161
Ciclosporine 7
Citochine 265
Citochine, classificazione 268
Citochine, gruppi strutturali 269
c-myc 46
248
250
Coagulazione del sangue 51
Colera, tossina 193
Condroitinsolfato 60
CR element (CRE) 242
CREB 155
CREB, struttura 243
CRIB 263
CSF-1, Colony Stimulating Factor 1 286
Csk 208
cyc - , cellule 288
Cyclin fold 143
Degradazione endocellulare di
36
proteine
Dermatansolfato 60
Destinazione delle proteine, generalità 6
25
Destinazione, sequenza in PDI 5
Destruction box in cicline 135
Dicumarolo, anticoagulante 54
Digliceride 196
Dita di zinco, fattori di trascrizione con 239
DNA-PK 219
DNA-PK e fosforilazione di p53 229
DNA-PK, substrato delle caspasi 49
Docking Proteins 234
Dolicolo fosfato 29
Drosophila, NFκB, IL-1 257
E box 252

EF-hand, dominio 45
EF-Tu, fattore di allungamento Tu 291
EGF 282
EGF, attivazione della fosfolipasi C 232
EGF, recettore e arruolamento SH2 117
EGFR 119
282
EGFR, subdomini HQH 120
Emopoiesi, riferimenti all’Alberts 265
Eparansolfato 60
Eparina come anticoagulante 54
Eritropoietina 237
ERK 255
Esotossine batteriche 175
Estrinseca, via di coagulaz. del sangue 56
Ets, fattori di trascrizione 157
FACS 226
Fattori di trascrizione, generalità 239
Fertilizzazione 184
FGF, Fibroblast Growth Factor 286
Fibrina 51
Fibrina, degradazione del coagulo 55
Fibronectina, struttura del dominio III 67
Fibronectina 64
Fibrosi cistica 92
Filamenti intermedi 129
Forscolina, attivatore dell’Adenilato 171
ciclasi
Fos, struttura 243
Fosfatidilinositolo 3 cinasi (PI3K) 201
Fosfo e de-fosforilazioni 18
Fosfoinosidi, ciclo, schema 199
Fosfoinositidi, ciclo 194
Fosfolambano 98
Fosfolipasi C e IP3
197
Fosfolipasi C, attivazione da EGF 232
Fosfolipasi-C, calcio dipendenza 101
Fototrasduzione, biochimica della 292
FRK, Fos Regulating Kinase 255
G-CSF 273
G-proteine 288
G-proteine monomeriche, generalità 297
G-proteine monom., struttura primaria 294
G-proteine, scoperta 288
G-proteine, superfamiglia 290
GAP 297
GCN4 244
GDI, GDP Dissociation Inibitor 297
GEP 297
GEP, domini PH in 205
Gerarchiche, fosforilazioni 126
GH, ormone della crescita 272
Glicocalice 26
Glicogeno fosforilasi cinasi 121
Glicogeno fosforilasi cinasi, autoinibiz. 124
Glicogeno fosforilasi cinasi, regolaz. 123
Glicogeno fosforilasi cinasi, struttura 121
Glicogeno, ciclo con GFK e PP1 159
Glicosilazioni nel citosol 27
Glicosilazioni nel RE 28
Glucocorticoidi, recettore per 240
Glucosamminoglicani 59
GM-CSF, interazioni 267
GMP ciclico 178
II
GMP ciclico, enzimi produttori di 171
Granzyme B 50
Grb-2 233
Gruppi sanguigni nell’uomo 32
GTP, analoghi non idrolizzabili 295
Guanilato ciclasi 178
Guanilato ciclasi in protozoi 184
Guanilato ciclasi solubile 184
Hanks-Quinn ed Hunter,
83
classificazione
HAV, sequenza legante in caderine 168
HDAC 141
HLH, fattori di trascrizione con motivo 248
Hsp10 ed hsp60 11
Hsp10 ed hsp60, ciclo 16
Hsp70 8
Hsp90 e virus oncogeni 12
HTH, fattori di trascrizione con domini 239
Ialuronico, acido 59
IFN-α, IFN-β, IFN-γ, recettori, inserto 259
IκB 256
IκB, degradazione 276
IL-1, in Drosophila 257
IL-1, interazioni 267
IL-1, recettori per 274
IL-2, interazioni 267
Immunoiglobulina, domini tipo 67
Inibitori di Cdc-Cicline 144
Inibitori della glicosilazione 31
Insulina, recettore 116
Insulina, recettore, domini HQH 120
Integrine 70
Integrine-citoscheletro, interazione 71
Interferoni 270
Intrinseca, via della coagul. del sangue 56
IP3 196
IP3, metabolismo 197
IRS-1, Insulin Receptor Substrate 234
236
ISRE (Interferon Stim. Resp. Elem.) 258
Istoni, acetilazione 20
Jak e STAT 258
Jak-cinasi 237
Jak-cinasi, subdomini 238
JNK/SAPK 255
Jun, struttura 243
KFERQ, sequenza 35
KID, in bZIP 246
Lamina basale 68
Lamine nucleari, fosforilazione 129
LC-4α, proprietà biologiche 270
Lectina, modulo tipo 26
Leucine Zipper 242
Lipide A 175
MAPcinasi 147
MAPcinasi, attivazione 149
MAPcinasi, confronto con Cdc2 151
MAPcinasi, schema 150
MAPcinasi, sequenza consenso 149
MAPcinasi, substrati delle 148
MAPK 147
MAPK e induzione trascriz. via TCF 156
MAPK, Ser e Thr fosforilate da MAPKK 154
MAPKK, serine fosforilate in 154

Matrice extracellulare 59
Max 248
Max-E box, interazioni dettagliate 253
Mdm2 e legame a p53 227
Mdm2 e legame a p53, schema 228
MEK, Mapk and Erk Kinase 153
Memoria e PKA 155
Metilazioni e demetilazioni 18
Microfilamenti 129
Microsomi, rilascio di calcio da parte di 196
Microtubuli 129
Miristoilazione di Ras 24
Miristoilazioni e palmitoilazioni di prot. 23
MLCK 93
MLCK, sito autoinibitorio 95
Moduli “in line” e “plug in” 2
Moduli strutturali delle proteine 1
MPF 127
Myc, proprietà generali 248
N-terminale, regola dell’ 38
Natriuretici, fattori 179
Nck 262
Neurotrofine 278
NF-AT e ciclofilina-ciclosporina 161
NFκB 256
NFκB, attivazione da IL-1 e TNF 275
NGF, TNF, recettori per 278
NIK, NFκB Inducing Kinase 275
NO sintasi 186
NO sintasi di entotelio 190
NO sintasi di epatociti 191
NO sintasi neuronale 189
NO sintasi, reazione catalizzata da 188
Nuceloplasmina 12
OCRL (Oculo cerebro renale,
sindrome di Lowe)
217
Okadaico, acido inibitore della defosf. 132
di Cdc25
Okadaico, acido, e. fattori natriuretici 182
Okadaico, acido, inibitore di PP2A 159
Oligosaccaridi legati all’N, esempi 33
Oncogeni 113
Ormone della crescita - GH 272
Ossido di azoto 186
p16, inibitore di Cdc-Cicline 144
p21, induzione da p53, Mdm2,
224
correlazioni da northern blot
p21-cip1 220
p21Cip1, inibitore di Cdc-Cicline 144
p27, inibitore di Cdc-Cicline 144
p53 e check point G1-S 220
p53, domini della 46
p85 (sub. di PI3K), domini SH3 213
PALA 225
Paracrinia 267
PARP, substrato delle caspasi 49
PARS 193
PDGF 284
PDGF e PI3K 214
PDGF e SSV 110
PDGF, recettore e arruolamento SH2 117
PDGF, recettore per 284
PDGF, recettore, legame a PI3K 202
PDGFR, struttura primaria 285
III
PDI (Proteina Disolfuro Isomerasi) 5
Pelle, in Drosophila 257
Perforina 50
PEST, sequenze 39
PI3 cinasi 201
PI3K, legame al recettore 202
PIC, complesso di preiniziazione 20
PKA e Memoria 155
PKA 76
PKA tipo I e II 77
PKA, siti di fosforilazione 78
PKA, subdomini HQH 108
120
PKA, substrati della 122
PKA, inibitori 77
PKA, struttura primaria 82
PKB, legame a PIP3
206
PKB, sequenza consenso 206
PKC 101
PKC, analogie con Raf 107
PKC, struttura 104
PKC, subdomini 108
PKC, subdominio di riconoscimento 106
del substrato
PKG 89
Plasminogeno 55
Plekstrina, domini in PKB 205
PMA 109
Polioma, virus 203
PP1 158
PP2 159
PP2A, aggiornamento da Curr. Opin.in 160
Cell. Biol.
Protein cinasi CaM-dip. multifunzionale 100
Proteina C 54
Proteina cinasi B e AKT 205
Proteina cinasi C 101
Proteina cinasi CaM dip., substrati 122
Proteina cinasi GMP ciclico-dip. 89
Proteina disolfuro isomerasi 5
Proteina fosfatasi 2B 160
Proteina fosfatasi 2C 161
Proteine adattatrici 262
Proteine cinasi cAMP dipendenti 76
Proteine cinasi, classificazione 75
Proteine da stress 8
Proteine di ades. cell. e tirosin fasfat. 165
Proteine fosfatasi 158
Proteine fosfatasi 1 158
Proteine fosfatasi 2 159
Proteine fosfatasi a funzione mista 170
Proteine fosfatasi e ciclo del glicogeno 159
Proteine glicosilate 26
Proteine, modifiche post-sintentiche 18
Proteoglicani 61
Proteoglicani, aggregati 62
Proteolisi acida 44
Proteolisi ATP-ed ubiquitina dip. 36
Proteolisi calcio-dipendente 44
Proteolisi lisosomiale 35
Proteosoma, struttura 40
prp 73 35
Pseudosubstrato 118
Pseudosubstrato, sequenza in PKA 77

PSTAIRE in Cdk2-ciclina At-ATP 143
PSTAIRE, sequenza di Cdc2 131
PTB 260
PTP 162
Rab, fosforilazione da Cdc2 145
Rab, subfamiglia 299
Ran, subfamiglia 299
Rapporto struttura-funzione 3
Ras, attivazione 233
Ras regolazione da GEF e GAP 218
Ras, mutante in Drosophila 264
Ras, struttura terziaria 300
Ras, subfamiglia 298
Rb, fosforilazione 222
Rb, proteine che legano Rb, LxCxE 140
Rb, substrato delle caspasi 49
Rb, legame a E2F e T grande 138
Recettori per fattori natriuretici 180
Recettori per fattori natriuretici,
183
subdomini e legame ad ATP
Recoverina 178
Resact 184
Restriction point in eucarioti 137
Retinoblastoma, proteina,
139
fosforilazione
Retinoblastoma, sequenza LxCxE 140
Retinule ed R7, R8 264
RGD, sequenze 65
Rho, subfamiglia 298
RIP, Receptor Interacting Protein 275
Ripiegamento delle proteine 10
Riserve endocellulari di calcio 231
RNA polimerasi di Eucarioti 19
Rodopsina, miristoilazione 24
Rossmann motiv 79
Rossmann motiv in adenilato ciclasi 171
Rous Sarcoma Virus 110
RSV 110
RSV, ciclo 111
RTK, schema 283
Ruota, struttura a, GCN4 244
SAPK 255
SC-4α, proprietà biologiche 270
SD-100, domini in recettori tipo
259
emopoietica (inserto)
Sequenza consenso PKC 105
SERCA 97
Sev, in Drosophila 264
SH2, domini in Src 211
SH2, domini, struttura 212
SH3, domini in Src 211
SH3, domini, struttura 213
Shc 260
Shc, legame ad EGFR 117
Sialoadesina 74
Smistamento delle proteine 25
IV
SOS 233
Speract 184
Spettrina, domini SH3 della 213
Src cellulare, introni ed esoni 112
Src, proteine cinasi della famiglia 209
Src, struttura terziaria 210
Src, subdomini HQH 120
SSV 110
Start, lievito 137
STAT 258
Superavvolgimento 4
Syk/Zap 208
Syp, legame a PDGFR 117
T grande, legame a Rb 138
T medio 204
T medio e PI3K 203
T piccolo e PP2A 159
TAF-II 250 20
Tapsigargina 196
TBP, Tata box Binding Protein 19
TCF, Ternary Complex Factor 156
TEY, sequenza in MAPK 154
TFIIB 20
TFIID 19
TGF 287
Tirosin cinasi, cenni storici 110
Tirosin cinasi non recettoriali 208
Tirosin cinasi, sequenze consenso 119
Tirosin fosfatasi (PTP) 162
Tirosin fosfatasi (PTP), sito attivo 165
Tirosin fosfatasi (PTP), strutt. primarie 162
Tirosine, autofosforilazione 116
TNF, recettore e caspasi 50
Toll 257
Tossine batteriche 175
Tossine batteriche ADP-ribosilanti 296
TPA 109
TRADD, TNFR Associat. Death Dom. 275
TRAF2, TNFR Associated Factor 2 275
Transglutaminasi 44
Transglutaminasi della coagulazione 52
Trascrittasi inversa 110
Trasducina 292
Trombina, dalla protrombina 52
Tub, in Drosophila 257
Tubuline 291
Tunicamicina 31
Turnover delle proteine 34
Ubiquitina 36
WASP 262
Wee1/Mik1 131
Wiskott Aldrich sindrome 262
Wortmannina 214
Yersinia pestis 163
ZIP-code, in PDI 6
ZIP-code, in proteine tirosin fosfatasi 167