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General Description DNA pdest12_2_verA Entire ... - Invitrogen

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<strong>General</strong> <strong>Description</strong><br />

<strong>DNA</strong> <strong>pdest12</strong>_2_<strong>verA</strong><br />

<strong>Entire</strong> molecule length: 7278 bp<br />

Restriction Map<br />

Enzyme # of cuts Positions<br />

AatI 2 672 4092<br />

AatII 6 80 133 216 402 2454<br />

5344<br />

Acc65I 2 720 3743<br />

AccI 2 1711 2306<br />

AccIII 2 606 1173<br />

AciI 79 41 53 67 234 325(c)<br />

358(c) 462 483(c)<br />

624 626(c) 856(c)<br />

860 1155 1519<br />

1613(c) 1685(c)<br />

1880(c) 2219 3080(c)<br />

3090(c) 3127 3189(c)<br />

3203(c) 3206(c) 3234<br />

3261 3641(c) 3667(c)<br />

3680 3688(c) 3756(c)<br />

3941 3953 3962<br />

3974 3984 3995<br />

4041 4196 4259<br />

4353(c) 4417(c)<br />

4518(c) 4521(c) 4761<br />

4801(c) 4806 4856(c)<br />

4872 4898 4954(c)<br />

5013 5085 5123<br />

5149 5159 5198<br />

5372(c) 5419 5518(c)<br />

5627(c) 5704(c) 5748<br />

5869(c) 5915 6106(c)<br />

6197(c) 6559 6568(c)<br />

6703 6813(c) 6934(c)<br />

6953(c) 7080(c)<br />

7108(c) 7199 7220<br />

7227 7270(c)<br />

AcsI 4 1177 2629 2967<br />

3601<br />

AcyI 10 77 130 213 399 553<br />

2451 4287 4989<br />

5341 5723<br />

AflII 1 4141<br />

AflIII 2 1624 7151<br />

AluI 35 521 658 685 749 949<br />

958 1077 1206 1780<br />

2143 2416 2459<br />

2489 2538 2612<br />

2659 2727 2932<br />

3320 3577 3769<br />

4057 4111 4393


4851 5212 5231<br />

5910 5973 6073<br />

6594 6851 6987<br />

7213 7278<br />

Alw44I 4 2077 5094 5591<br />

6837<br />

AlwI 24 591(c) 734 922(c)<br />

935 1625(c) 1638<br />

2057(c) 2551 3046(c)<br />

3055 3698 4466<br />

4531(c) 4712 5076(c)<br />

5089 5624 5628(c)<br />

5945 6408(c) 6409<br />

6505(c) 6507 6593<br />

AlwNI 2 1956 6742<br />

AosI 4 3155 3697 4389<br />

6040<br />

ApaLI 4 2077 5094 5591<br />

6837<br />

ApoI 4 1177 2629 2967<br />

3601<br />

AseI 2 3061 6088<br />

AsnI 2 3061 6088<br />

Asp700 1 5663<br />

Asp718 2 720 3743<br />

AspEI 1 6263<br />

AspHI 9 2 523 2081 4400<br />

4590 5098 5595<br />

5680 6841<br />

AspI 1 4405<br />

AsuII 1 4969<br />

AvaI 1 2046<br />

AvaII 4 592 4803 5899 6121<br />

AviII 4 3155 3697 4389<br />

6040<br />

AvrII 2 618 4093<br />

BamHI 3 927 1630 5081<br />

BanI 8 420 720 868 3366<br />

3743 4286 4321<br />

6310<br />

BanII 4 2 523 3336 4652<br />

BbsI 1 589<br />

BbvI 22 1760 2646(c) 2659(c)<br />

2941 3168 3237<br />

3710 4234(c) 4360<br />

4402 4418(c) 4511(c)<br />

4923 5218(c) 5829(c)<br />

6220 6523(c) 6729(c)<br />

6732(c) 6822 7241<br />

7259<br />

BcgI 1 5725(c)<br />

BclI 1 2810<br />

BfaI 13 614 619 2490 2535<br />

2656 2728 3002


3254 4094 4148<br />

6070 6405 6658<br />

BfrI 1 4141<br />

BglI 6 45 167 238 3165<br />

4046 6145<br />

BlnI 2 618 4093<br />

BmyI 13 2 523 2081 3336<br />

4233 4326 4400<br />

4590 4652 5098<br />

5595 5680 6841<br />

BpmI 3 568 1299 6194<br />

BpuAI 1 589<br />

BsaAI 3 295 3407 4591<br />

BsaBI 3 2061 2815 5080<br />

BsaHI 10 77 130 213 399 553<br />

2451 4287 4989<br />

5341 5723<br />

BsaI 2 2186 6197<br />

BsaJI 20 315 618 624 873<br />

1408 1409 1478<br />

2046 2068 2768<br />

3704 3805 3877<br />

4000 4035 4044<br />

4093 4450 4719<br />

6991<br />

BsaWI 8 606 723 1173 1817<br />

4318 5967 6798<br />

6945<br />

BseAI 2 606 1173<br />

BsiEI 7 860 3136 4196 5745<br />

5894 6817 7241<br />

BsiHKAI 9 2 523 2081 4400<br />

4590 5098 5595<br />

5680 6841<br />

BsiYI 17 606 630 1409 1872<br />

2053 2191 3079<br />

3188 3514 4001<br />

4268 4812 5225<br />

6673 6952 7118<br />

7136<br />

BslI 17 606 630 1409 1872<br />

2053 2191 3079<br />

3188 3514 4001<br />

4268 4812 5225<br />

6673 6952 7118<br />

7136<br />

BsmAI 10 389 544(c) 1401<br />

2105 2186 4138<br />

5226 5268(c) 5421(c)<br />

6197<br />

BsmFI 13 130 281 449 605 642<br />

1967 2750(c) 3188<br />

3787(c) 3859(c)<br />

3923(c) 4438 4970


BsmI 5 12 1170 1577 2904<br />

2997(c)<br />

Bsp1286I 13 2 523 2081 3336<br />

4233 4326 4400<br />

4590 4652 5098<br />

5595 5680 6841<br />

BspDI 2 3050 5068<br />

BspEI 2 606 1173<br />

BspHI 4 2807 5318 5423<br />

6431<br />

BspMI 5 708(c) 2292(c)<br />

4174(c) 4555 5005<br />

BspWI 39 45 167 199 238 331<br />

355 561 623 875 955<br />

1518 1907 2665<br />

3135 3165 3198<br />

3200 3242 3269<br />

3299 3838 3910<br />

3961 4040 4046<br />

4278 4362 4385<br />

4524 4530 4647<br />

4683 4730 4997<br />

5093 6145 6533<br />

7105 7219<br />

BsrBI 5 3263(c) 4900(c) 4954<br />

5421(c) 7222(c)<br />

BsrDI 4 1196 4520 6029<br />

6203(c)<br />

BsrFI 5 2177 3302 4606<br />

4787 6178<br />

BsrGI 3 738 2021 2423<br />

BsrI 23 250(c) 844(c) 984<br />

1424(c) 1961 2074(c)<br />

2170(c) 2294(c) 2323<br />

2501 2527 3496<br />

3978(c) 4231 4432<br />

5618 5788(c) 6057<br />

6100 6218 6624<br />

6736(c) 6749(c)<br />

BssHII 2 1671 4684<br />

Bst1107I 1 1712<br />

BstBI 1 4969<br />

BstNI 14 45 238 547 875 1354<br />

1410 2070 3807<br />

3862 3879 4674<br />

6992 7005 7126<br />

BstUI 25 4 626 1626 1673<br />

2221 2440 3078<br />

3080 3179 3203<br />

3223 3599 3688<br />

4353 4654 4686<br />

5087 5167 5270<br />

5272 5372 5704<br />

6197 6527 7108<br />

BstXI 2 2165 5008


BstYI 13 927 1630 2543 3690<br />

4458 4704 5081<br />

5616 5633 6401<br />

6413 6499 6510<br />

CfoI 32 1673 1675 2149<br />

3080 3156 3181<br />

3194 3203 3225<br />

3251 3259 3698<br />

4281 4289 4353<br />

4390 4656 4686<br />

4688 4916 5169<br />

5272 5372 5704<br />

6041 6134 6527<br />

6636 6810 6910<br />

6977 7247<br />

Cfr10I 5 2177 3302 4606<br />

4787 6178<br />

ClaI 2 3050 5068<br />

Csp45I 1 4969<br />

Csp6I 17 173 198 253 286 337<br />

494 709 721 739<br />

1055 1593 2022<br />

2424 3744 4592<br />

5105 5781<br />

DdeI 16 950 1398 1902 2211<br />

2615 2693 2788<br />

3751 4053 4950<br />

5101 5336 5762<br />

6302 6468 6877<br />

DpnI 33 542 598 728 929<br />

1632 2064 2209<br />

2437 2545 2812<br />

3049 3053 3135<br />

3692 4460 4538<br />

4619 4628 4706<br />

5083 5582 5618<br />

5635 5893 5939<br />

5957 6298 6403<br />

6415 6493 6501<br />

6512 6587<br />

DpnII 33 540 596 726 927<br />

1630 2062 2207<br />

2435 2543 2810<br />

3047 3051 3133<br />

3690 4458 4536<br />

4617 4626 4704<br />

5081 5580 5616<br />

5633 5891 5937<br />

5955 6296 6401<br />

6413 6491 6499<br />

6510 6585<br />

DraI 7 1097 1436 2608<br />

2855 5685 6377<br />

6396<br />

DraII 2 2783 5283


DraIII 1 3410<br />

DrdI 5 3454 4130 4314<br />

5180 7049<br />

DsaI 6 315 624 1478 3704<br />

4000 4719<br />

DsaV 26 43 236 545 588 873<br />

1352 1408 1910<br />

2045 2046 2068<br />

2116 3805 3860<br />

3877 4289 4449<br />

4672 5189 5224<br />

5725 6076 6772<br />

6990 7003 7124<br />

EaeI 12 857 1442 2071 2167<br />

2498 3070 4193<br />

4367 4758 4785<br />

5010 5870<br />

EagI 2 857 4193<br />

Eam1105I 1 6263<br />

EarI 5 3114(c) 4631(c)<br />

4841(c) 5464(c)<br />

7268(c)<br />

Ecl136II 2 521 7278<br />

EclXI 2 857 4193<br />

Eco57I 4 4433 4865 5597<br />

6609(c)<br />

EcoO109I 2 2783 5283<br />

EcoRI 1 1177<br />

EcoRII 14 43 236 545 873 1352<br />

1408 2068 3805<br />

3860 3877 4672<br />

6990 7003 7124<br />

Esp3I 4 544(c) 1401 5226<br />

5268(c)<br />

Fnu4HI 45 624 857 860 1519<br />

1749 2660 2673<br />

2930 3157 3190<br />

3204 3226 3699<br />

4041 4196 4248<br />

4259 4349 4354<br />

4391 4432 4519<br />

4522 4525 4761<br />

4857 4898 4912<br />

5013 5123 5232<br />

5519 5748 5843<br />

5870 6209 6537<br />

6743 6746 6811<br />

6954 7109 7227<br />

7230 7248<br />

FnuDII 25 4 626 1626 1673<br />

2221 2440 3078<br />

3080 3179 3203<br />

3223 3599 3688<br />

4353 4654 4686<br />

5087 5167 5270


5272 5372 5704<br />

6197 6527 7108<br />

FokI 13 543(c) 1157(c) 1909<br />

2031 2069 2148<br />

3944(c) 4611 4636<br />

5181(c) 5824 6111<br />

6292<br />

FspI 4 3155 3697 4389<br />

6040<br />

HaeII 4 3252 3260 4290<br />

6911<br />

HaeIII 35 39 232 623 672 859<br />

1090 1135 1357<br />

1444 2073 2169<br />

2500 2784 3072<br />

3125 3415 3557<br />

3709 4034 4040<br />

4049 4092 4195<br />

4369 4760 4787<br />

5012 5285 5872<br />

6139 6219 6677<br />

7111 7129 7140<br />

HgaI 8 481 561 3185 4997<br />

5173 5731 6461(c)<br />

7039(c)<br />

HgiAI 9 2 523 2081 4400<br />

4590 5098 5595<br />

5680 6841<br />

HhaI 32 1673 1675 2149<br />

3080 3156 3181<br />

3194 3203 3225<br />

3251 3259 3698<br />

4281 4289 4353<br />

4390 4656 4686<br />

4688 4916 5169<br />

5272 5372 5704<br />

6041 6134 6527<br />

6636 6810 6910<br />

6977 7247<br />

HinP1I 32 1671 1673 2147<br />

3078 3154 3179<br />

3192 3201 3223<br />

3249 3257 3696<br />

4279 4287 4351<br />

4388 4654 4684<br />

4686 4914 5167<br />

5270 5370 5702<br />

6039 6132 6525<br />

6634 6808 6908<br />

6975 7245<br />

HincII 3 1769 2307 2916<br />

HindII 3 1769 2307 2916<br />

HindIII 1 4109<br />

HinfI 18 365 610 1527 2475<br />

2733 2757 3066


3455 3477 4115<br />

4772 4906 4958<br />

5065 6264 6781<br />

7177 7252<br />

HpaI 1 2916<br />

HpaII 33 589 607 724 896<br />

1132 1174 1302<br />

1634 1818 1912<br />

2047 2118 2178<br />

3303 4192 4269<br />

4291 4319 4450<br />

4540 4607 4788<br />

5191 5225 5726<br />

5968 6078 6145<br />

6179 6583 6773<br />

6799 6946<br />

HphI 21 331 705 1213<br />

1219(c) 1221 1357<br />

1413(c) 1425 1467(c)<br />

1971 2072 2445<br />

3407 4465(c) 5243(c)<br />

5252(c) 5536(c) 5571<br />

5777(c) 6193 6420<br />

ItaI 45 624 857 860 1519<br />

1749 2660 2673<br />

2930 3157 3190<br />

3204 3226 3699<br />

4041 4196 4248<br />

4259 4349 4354<br />

4391 4432 4519<br />

4522 4525 4761<br />

4857 4898 4912<br />

5013 5123 5232<br />

5519 5748 5843<br />

5870 6209 6537<br />

6743 6746 6811<br />

6954 7109 7227<br />

7230 7248<br />

KasI 1 4286<br />

KpnI 2 724 3747<br />

Ksp632I 5 3114(c) 4631(c)<br />

4841(c) 5464(c)<br />

7268(c)<br />

KspI 1 627<br />

MaeI 13 614 619 2490 2535<br />

2656 2728 3002<br />

3254 4094 4148<br />

6070 6405 6658<br />

MaeII 24 77 89 130 213 294<br />

399 761 1264 1439<br />

2081 2402 2451<br />

2514 3296 3406<br />

3449 3461 3620<br />

4403 4590 5341<br />

5661 6034 6450


MaeIII 25 16 103 452 693 846<br />

1234 1339 1760<br />

2314 2518 2574<br />

2941 3217 3229<br />

4407 4713 5214<br />

5602 5790 5943<br />

6001 6332 6615<br />

6731 6794<br />

MamI 3 2061 2815 5080<br />

MboI 33 540 596 726 927<br />

1630 2062 2207<br />

2435 2543 2810<br />

3047 3051 3133<br />

3690 4458 4536<br />

4617 4626 4704<br />

5081 5580 5616<br />

5633 5891 5937<br />

5955 6296 6401<br />

6413 6491 6499<br />

6510 6585<br />

MboII 15 7 594 1452(c) 2208<br />

3131 3268(c) 4110(c)<br />

4648 4858 4938(c)<br />

5481 5590 5668<br />

6423 6494(c)<br />

McrI 7 860 3136 4196 5745<br />

5894 6817 7241<br />

MfeI 1 2903<br />

MluI 1 1624<br />

MluNI 4 1444 2073 2169<br />

4369<br />

MnlI 38 496(c) 584 614<br />

1023(c) 1726(c)<br />

1897(c) 2797 2804<br />

2832(c) 2872 2881<br />

3080(c) 3115(c) 3380<br />

3722(c) 3730 3746(c)<br />

4024(c) 4030(c) 4054<br />

4060 4067(c) 4070(c)<br />

4082(c) 4202(c)<br />

4338(c) 4695(c) 4888<br />

5237(c) 5296 5890(c)<br />

6096(c) 6243 6324<br />

6724 6974(c) 7048<br />

7257(c)<br />

MroI 2 606 1173<br />

MscI 4 1444 2073 2169<br />

4369<br />

MseI 31 788 1096 1435 1577<br />

1972 2245 2375<br />

2607 2635 2651<br />

2854 2915 3061<br />

3197 3468 3566<br />

3583 3594 3606<br />

3617 4142 5131


5312 5684 6049<br />

6088 6323 6376<br />

6390 6395 6447<br />

MslI 9 320 1835 2163 4724<br />

5006 5045 5492<br />

5851 6010<br />

MspA1I 9 626 1077 1521 3769<br />

4393 5161 5627<br />

6568 6813<br />

MspI 33 589 607 724 896<br />

1132 1174 1302<br />

1634 1818 1912<br />

2047 2118 2178<br />

3303 4192 4269<br />

4291 4319 4450<br />

4540 4607 4788<br />

5191 5225 5726<br />

5968 6078 6145<br />

6179 6583 6773<br />

6799 6946<br />

MunI 1 2903<br />

MvaI 14 45 238 547 875 1354<br />

1410 2070 3807<br />

3862 3879 4674<br />

6992 7005 7126<br />

MvnI 25 4 626 1626 1673<br />

2221 2440 3078<br />

3080 3179 3203<br />

3223 3599 3688<br />

4353 4654 4686<br />

5087 5167 5270<br />

5272 5372 5704<br />

6197 6527 7108<br />

MwoI 39 45 167 199 238 331<br />

355 561 623 875 955<br />

1518 1907 2665<br />

3135 3165 3198<br />

3200 3242 3269<br />

3299 3838 3910<br />

3961 4040 4046<br />

4278 4362 4385<br />

4524 4530 4647<br />

4683 4730 4997<br />

5093 6145 6533<br />

7105 7219<br />

NaeI 2 3304 4789<br />

NarI 1 4287<br />

NciI 12 590 1912 2047 2048<br />

2118 4291 4451<br />

5191 5226 5727<br />

6078 6774<br />

NcoI 5 315 1478 3704 4000<br />

4719<br />

NdeI 2 189 2664<br />

NdeII 33 540 596 726 927


1630 2062 2207<br />

2435 2543 2810<br />

3047 3051 3133<br />

3690 4458 4536<br />

4617 4626 4704<br />

5081 5580 5616<br />

5633 5891 5937<br />

5955 6296 6401<br />

6413 6491 6499<br />

6510 6585<br />

NgoMI 2 3302 4787<br />

NheI 1 2534<br />

NlaIII 30 14 259 319 1252<br />

1482 1543 1564<br />

1840 2153 2448<br />

2811 3043 3708<br />

3841 3913 4004<br />

4161 4506 4692<br />

4723 4749 5238<br />

5322 5427 5820<br />

5856 5934 5944<br />

6435 7155<br />

NlaIV 25 422 593 722 870 929<br />

1632 2279 2558<br />

2785 3335 3347<br />

3368 3745 3811<br />

3883 4288 4323<br />

5083 5376 5966<br />

6177 6218 6312<br />

7084 7123<br />

NotI 1 857<br />

NruI 1 4<br />

NsiI 3 12 3843 3915<br />

NspI 7 14 2448 3841 3913<br />

4692 5238 7155<br />

NspV 1 4969<br />

PflMI 1 1409<br />

PleI 9 359(c) 604(c) 2483<br />

3463 3471(c) 4952(c)<br />

6272 6775(c) 7260<br />

Ppu10I 3 8 3839 3911<br />

Psp1406I 4 1264 3620 5661<br />

6034<br />

PstI 3 719 2303 4340<br />

PvuI 2 3136 5894<br />

PvuII 3 1077 3769 4393<br />

RcaI 4 2807 5318 5423<br />

6431<br />

RsaI 17 174 199 254 287 338<br />

495 710 722 740<br />

1056 1594 2023<br />

2425 3745 4593<br />

5106 5782<br />

RsrII 1 4803


SacI 2 2 523<br />

SacII 1 627<br />

SalI 1 2305<br />

SapI 3 4631(c) 4841(c)<br />

7268(c)<br />

Sau3AI 33 540 596 726 927<br />

1630 2062 2207<br />

2435 2543 2810<br />

3047 3051 3133<br />

3690 4458 4536<br />

4617 4626 4704<br />

5081 5580 5616<br />

5633 5891 5937<br />

5955 6296 6401<br />

6413 6491 6499<br />

6510 6585<br />

Sau96I 12 38 231 592 2783<br />

3124 3413 4803<br />

5283 5899 6121<br />

6138 6217<br />

ScaI 2 1594 5782<br />

ScrFI 26 45 238 547 590 875<br />

1354 1410 1912<br />

2047 2048 2070<br />

2118 3807 3862<br />

3879 4291 4451<br />

4674 5191 5226<br />

5727 6078 6774<br />

6992 7005 7126<br />

SexAI 1 3860<br />

SfaNI 20 312(c) 1020 1505(c)<br />

2969 3628(c) 3668<br />

3850 3922 4245(c)<br />

4500(c) 4586 4650<br />

4716(c) 4925 5109(c)<br />

5203 5562(c) 5811<br />

6002(c) 7054(c)<br />

SfcI 10 700 715 2299 2468<br />

2597 3184 4336<br />

6017 6695 6886<br />

SfiI 1 4046<br />

SfuI 1 4969<br />

SmaI 1 2048<br />

SnaBI 1 295<br />

SnoI 4 2077 5094 5591<br />

6837<br />

SphI 4 2448 3841 3913<br />

4692<br />

SspBI 3 738 2021 2423<br />

SspI 5 1489 2713 3591<br />

3615 5458<br />

StuI 2 672 4092<br />

StyI 8 315 618 1478 2768<br />

3704 4000 4093


4719<br />

TaqI 14 934 2306 3050 3372<br />

4136 4400 4556<br />

4580 4616 4778<br />

4969 5068 5609<br />

7053<br />

TfiI 9 1527 2733 2757<br />

3066 4115 4772<br />

4906 5065 7177<br />

ThaI 25 4 626 1626 1673<br />

2221 2440 3078<br />

3080 3179 3203<br />

3223 3599 3688<br />

4353 4654 4686<br />

5087 5167 5270<br />

5272 5372 5704<br />

6197 6527 7108<br />

Tru9I 31 788 1096 1435 1577<br />

1972 2245 2375<br />

2607 2635 2651<br />

2854 2915 3061<br />

3197 3468 3566<br />

3583 3594 3606<br />

3617 4142 5131<br />

5312 5684 6049<br />

6088 6323 6376<br />

6390 6395 6447<br />

Tsp509I 18 639 790 1177 1582<br />

2371 2581 2629<br />

2738 2903 2967<br />

3601 3627 3847<br />

3919 4011 5830<br />

6085 6391<br />

Tth111I 1 4405<br />

Van91I 1 1409<br />

XhoII 13 927 1630 2543 3690<br />

4458 4704 5081<br />

5616 5633 6401<br />

6413 6499 6510<br />

XmaI 1 2046<br />

XmaIII 2 857 4193<br />

XmnI 1 5663<br />

No cuts: AgeI, ApaI, AscI, BbrPI, BglII, Bpu1102I, BsgI, BsiWI, Bsp120I, BstEII, Bsu36I, CelII, Eco47III,<br />

EcoNI, EcoRV, EspI, PacI, PaeR7I, PinAI, PmaCI, PmeI, PmlI, PpuMI, SgrAI, SpeI, SwaI, XbaI, XcmI, XhoI

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