SZTA Évkönyv 2017/18

SZENT-GYÖRGYI MENTOROK
PUSKÁS LÁSZLÓ
MTA Szegedi Biológiai Kutatóközpont,
Genetika Intézet,
Funkcionális Genomika Laboratórium
Cím: 6726 Szeged, Temesvári krt. 62.
E: puskas.szbk@gmail.com
T: +36 62/599-782
KUTATÁSI TERÜLET BEMUTATÁSA
A huszadik század második feléig a gének funkcójának és
szabályozásának tanulmányozása egyedi gének lépésről
lépésre történő vizsgálatán alapult. Tekintve, hogy egyre
több élőlény génállományának szekvenciája vált és válik
teljesen vagy részlegesen ismerté, számos új technika fejlődött
ki, melyek a génműködés szisztematikus analízisét
teszik lehetővé.
Csoportunk a funkcionális genomikai módszereket alkalmazza
olyan kérdések megválaszolására, amelyek közelebb
vihetnek a különböző élőlények tulajdonságainak molekuláris
szintű megismeréséhez, a betegségek jobb megértéséhez.
Laborunkban számos olyan Magyarországon
egyedülálló, nagy áteresztőképességű genomikai vizsgálatra
alkalmas eszköz található, amelyek lehetővé teszik a
különböző biológiai minták (baktériumok, növények, állati
szövetek, klinikai minták) átfogó (teljes genomot érintő) és
fókuszált (pld. adott biokémiai útvonalhoz tartozó) mRNS
és miRNS kifejeződésének tanulmányozását.
Az általunk kifejlesztett egy-sejt molekuláris genomikai
módszerek segítségével egyedi sejtek izolálhatóak és önállóan
vizsgálhatóak. Az egyedi sejtek molekuláris átvilágítása
többek között az idegtudományi kutatásokban, és számos
más betegség, illetve gyógyszer hatásmechanizmus vizsgálatához
alapot adhatnak. Ezek közül kiemelkedik a digitális
PCR módszer, mellyel ritka mutációkat és egyedi genetikai
eltéréseket kívánunk tanulmányozni központi idegrendszert
érintő betegségekben és tumor mintákban.
VÁLOGATOTT KÖZLEMÉNYEK
Faragó, N., Kocsis, Á.K., Lovas, S., Molnár, G., Boldog, E.,
Rózsa, M., Szemenyei, V., Vámos, E., Nagy, L.I., Tamás, G.,
Puskás, L.G. (2013) Digital PCR to determine the number
of transcripts from single neurons after patch-clamp recording.
Biotechniques 54: 327-36.
Kitajka, K., Sinclair, A.J., Weisinger, R.S., Weisinger, H.S., Mathai,
M., Jayasooriya, A.P., Halver, J.E., Puskás, L.G. (2004)
Effects of dietary omega-3 polyunsaturated fatty acids on
brain gene expression. Proc Natl Acad Sci USA 101: 10931-
6.
Puskás, L.G., Kitajka, K., Nyakas, C., Barcelo-Coblijn, G.,
Farkas, T. (2003) Short-term administration of omega 3
fatty acids from fish oil results in increased transthyretin
transcription in old rat hippocampus. Proc Natl Acad Sci
USA 100: 1580-5.
Kitajka, K., Puskás, L.G., Zvara, A., Hackler, L. Jr., Barceló-Coblijn,
G., Yeo, Y.K., Farkas, T. (2002) The role of n-3 polyunsaturated
fatty acids in brain: modulation of rat brain gene
expression by dietary n-3 fatty acids. Proc Natl Acad Sci
USA 99: 2619-24.
Onody, A., Zvara, A., Hackler, L. Jr., Vígh, L., Ferdinandy, P.,
Puskás, L.G. (2003) Effect of classic preconditioning on the
gene expression pattern of rat hearts: a DNA microarray
study. FEBS Lett 536: 35-40.
ELSAJÁTÍTHATÓ TECHNIKÁK
DNS microarray technológia átfogó génaktivitási mintázat
megfejtésére; fókuszált valós-idejű PCR kísérletek DNS,
mRNS, mikroRNS mennyiségi és minőségi vizsgálatra; digitális
PCR módszerek; nukleinsavak, fehérjék tisztítása és
elemzése.
66