Mándoki - Állatorvostudományi Doktori Iskola - Szent István ...
Mándoki - Állatorvostudományi Doktori Iskola - Szent István ...
Mándoki - Állatorvostudományi Doktori Iskola - Szent István ...
Create successful ePaper yourself
Turn your PDF publications into a flip-book with our unique Google optimized e-Paper software.
közötti hasonlóságot mutattak egymással és a referencia törzs (NP_620617) megfelelı<br />
adataival.<br />
A nukleinsav valamint az aminosav sorrendek alapján genetikai rokonságot mutató<br />
filogenetikai fákat készítettünk (20. ábra és 21. ábra). Az avian nephritis vírus nukleotid<br />
szekvenciája alapján készített filogenetikai fa jól szemlélteti, hogy a magyarországi<br />
genotípusok nagy eltéréseket mutatnak (20. ábra). Két fı csoportot lehetett<br />
megkülönböztetni; az egyik két, azonos állományból származó, 2005-ben győjtött<br />
szekvenciát tartalmazott, míg a másikba sorolható az összes többi Magyarországon izolált<br />
vírustörzs. Ez a második csoport további két részre osztható. Egy egyikbe kettı, 2003-ból<br />
származó, közeli rokonságot mutató genotípus tartozik, a másikba hét, 2002 és 2005 között<br />
ANV pozitívnak talált mintát sorolhattunk, amelyek további alcsoportokat alkotnak.<br />
Az aminosav sorrend filogenetikai vizsgálata a nukleotid szekvenciákétól kissé eltérı<br />
csoportosítást eredményezett (21. ábra). Ezen a filogenetikai fán 2005-bıl izolált, egy<br />
teleprıl származó minták és két, 2003-ból származó vírus formál egy, a többi szekvenciától<br />
eltérı, monofiletikus csoportot. Ennek érdekessége, hogy a nukleotid szekvenciákat vizsgálva<br />
ezek a törzsek más csoportba tartoztak. A többi vizsgált szekvencia eloszlása is változik a<br />
nukleotid sorrendnél megállapítotthoz képest. Három, különbözı évben talált (2003, 2004 és<br />
2005) vírustörzsben tanulmányozott genom részlet feltételezett aminosav sorrendje<br />
megegyezik, miközben más, ugyanarról a teleprıl, 2003 folyamán győjtött vírusminta<br />
elkülönül tılük. A „bootstrap” elemzés hasonló genomcsoportok kialakulását eredményezte<br />
mind a nukleotid, mind az aminosav szekvenciák alapján készült törzsfákon.<br />
57