17.08.2013 Views

Mándoki - Állatorvostudományi Doktori Iskola - Szent István ...

Mándoki - Állatorvostudományi Doktori Iskola - Szent István ...

Mándoki - Állatorvostudományi Doktori Iskola - Szent István ...

SHOW MORE
SHOW LESS

Create successful ePaper yourself

Turn your PDF publications into a flip-book with our unique Google optimized e-Paper software.

közötti hasonlóságot mutattak egymással és a referencia törzs (NP_620617) megfelelı<br />

adataival.<br />

A nukleinsav valamint az aminosav sorrendek alapján genetikai rokonságot mutató<br />

filogenetikai fákat készítettünk (20. ábra és 21. ábra). Az avian nephritis vírus nukleotid<br />

szekvenciája alapján készített filogenetikai fa jól szemlélteti, hogy a magyarországi<br />

genotípusok nagy eltéréseket mutatnak (20. ábra). Két fı csoportot lehetett<br />

megkülönböztetni; az egyik két, azonos állományból származó, 2005-ben győjtött<br />

szekvenciát tartalmazott, míg a másikba sorolható az összes többi Magyarországon izolált<br />

vírustörzs. Ez a második csoport további két részre osztható. Egy egyikbe kettı, 2003-ból<br />

származó, közeli rokonságot mutató genotípus tartozik, a másikba hét, 2002 és 2005 között<br />

ANV pozitívnak talált mintát sorolhattunk, amelyek további alcsoportokat alkotnak.<br />

Az aminosav sorrend filogenetikai vizsgálata a nukleotid szekvenciákétól kissé eltérı<br />

csoportosítást eredményezett (21. ábra). Ezen a filogenetikai fán 2005-bıl izolált, egy<br />

teleprıl származó minták és két, 2003-ból származó vírus formál egy, a többi szekvenciától<br />

eltérı, monofiletikus csoportot. Ennek érdekessége, hogy a nukleotid szekvenciákat vizsgálva<br />

ezek a törzsek más csoportba tartoztak. A többi vizsgált szekvencia eloszlása is változik a<br />

nukleotid sorrendnél megállapítotthoz képest. Három, különbözı évben talált (2003, 2004 és<br />

2005) vírustörzsben tanulmányozott genom részlet feltételezett aminosav sorrendje<br />

megegyezik, miközben más, ugyanarról a teleprıl, 2003 folyamán győjtött vírusminta<br />

elkülönül tılük. A „bootstrap” elemzés hasonló genomcsoportok kialakulását eredményezte<br />

mind a nukleotid, mind az aminosav szekvenciák alapján készült törzsfákon.<br />

57

Hooray! Your file is uploaded and ready to be published.

Saved successfully!

Ooh no, something went wrong!