Mándoki - Állatorvostudományi Doktori Iskola - Szent István ...
Mándoki - Állatorvostudományi Doktori Iskola - Szent István ...
Mándoki - Állatorvostudományi Doktori Iskola - Szent István ...
Create successful ePaper yourself
Turn your PDF publications into a flip-book with our unique Google optimized e-Paper software.
A „Fa” primer-párral vizsgált 607bp hosszúságú termékbıl a direkt nukleotid sorrend<br />
meghatározás után 465bp hosszúságú szekvenciát tudtunk valamennyi vizsgált törzs esetében<br />
összeilleszteni. Ezért ezeknek szakaszoknak a filogenetikai vizsgálatát végeztük el. A<br />
filogenetikai fa alapjául szolgáló 465bp hosszúságú DNS szekvenciák hivatkozási számai a<br />
következık: DQ327608 - DQ327618 (9. táblázat).<br />
9. táblázat: Az ANV magyarországi törzseinek 465bp hosszúságú szekvenciái<br />
Szám Név Jelölés<br />
56<br />
Iktatási<br />
szám<br />
Életkor<br />
(nap)<br />
1. DQ327608 Sza1 114 8 Bél<br />
2. DQ327609 Sza2 136 13 Bél<br />
3. DQ327610 Zal1 262 18 Bél<br />
Szerv<br />
4. DQ327611 Laj1 844 11 Vese<br />
5. DQ327612 Imr1 865 12 Bél<br />
6. DQ327613 Imr2 876 14 Vese<br />
7. DQ327614 Hos1 947 10 Bél<br />
8. DQ327615 Boc1 1045 7 Bél<br />
9. DQ327616 Beb2 2827 15 Vese<br />
10. DQ327617 Kec1 4239 11 Vese<br />
11. DQ327618 Sze1 11156 10 Vese<br />
6.7. Filogenetikai elemzés<br />
A PCR termékek nukleotid szekvenciáját meghatároztuk és elhelyeztük a génbankban<br />
(NCBI) (táblázat DQ327608-DQ327618). Minden általunk kapott szekvencia a génbankban<br />
(NCBI) közölt japán referencia törzs (NC_003790, Imada és mtsai, 2000) ORF1 régiójával<br />
mutatta a legnagyobb hasonlóságot a BLAST homológiakeresés során. A szekvenciákat<br />
egymáshoz és a referencia törzshöz illesztettük, amely alapján 76 és 86% között változott a<br />
hasonlóság mértéke. Az ismert nukleotid sorrendő szekvenciákat az aminosavakat kódoló<br />
tripletek ismeretében polipeptid lánccá alakítottuk, az így kapott 154 aminosav hosszúságú<br />
polipeptidek, amelyek a vírus nem strukturális fehérjéjének egy részét képezték, 88 és 93%