17.08.2013 Views

Mándoki - Állatorvostudományi Doktori Iskola - Szent István ...

Mándoki - Állatorvostudományi Doktori Iskola - Szent István ...

Mándoki - Állatorvostudományi Doktori Iskola - Szent István ...

SHOW MORE
SHOW LESS

You also want an ePaper? Increase the reach of your titles

YUMPU automatically turns print PDFs into web optimized ePapers that Google loves.

vizsgálati módszerré vált, és így elınyeit nem szabad figyelmen kívül hagyni. Ezek az<br />

elınyök a következık:<br />

- Rendkívül gyors, vagyis beállított, mőködı rendszerek mellett a minta-elıkészítés, a<br />

tényleges vizsgálat és a vizualizáció folyamata néhány órán belül eredményt ad. A<br />

módszertıl függıen a diagnosztikában elsıdleges „igen - nem” (fertızött - nem fertızött)<br />

válasz mellett a vizsgálat bizonyos kórokozók esetében még tipizálásra is képes.<br />

- Mindemellett érzékeny is, hiszen akár már 5-10 kópiát is képes kimutatni a keresett<br />

nukleinsavból. Tisztában kell lennünk emellett azzal is, hogy ez az érzékenység még hátrányt<br />

is jelenthet a pozitív eredmény megállapítása és a tényleges kórkép kialakulása közötti<br />

összefüggés mérlegelésekor. Ugyanis gyakran a PCR pozitivitás nem jelenti egyértelmően a<br />

tünetek kialakulásával kísért megbetegedés megjelenését, mivel ez utalhat akár rövid idıvel a<br />

mintavétel elıtt végzett állatorvosi preventív tevékenységre (vakcinázásra) is.<br />

A primertervezés, a PCR vizsgálatok, a klónozás és a többi molekuláris biológiai<br />

módszer, valamint az elımunkálatok és eredményértékelés elvégzéséhez egyre jobb<br />

szoftverek, vegyszerek, sıt kitek kaphatók megkönnyítve ezzel a kutató és a diagnoszta<br />

munkáját, nem is említve az interneten fellelhetı hatalmas adatmennyiséget.<br />

A feladat elvégzéséhez a kórokozó - szerencsés esetben a génbankban rendelkezésre<br />

álló - szekvenciája alapján olyan genomszakaszt kell keresni, amely specifikus a kórokozóra,<br />

ugyanakkor nincs jelen az adott állatfaj genomjában. A választás során mindenképpen<br />

figyelembe kell venni, hogy a kiválasztott szekvencia megfelelı konzervativitással<br />

rendelkezzen, hogy az esetleges mutációk ellenére az adott kórokozó genotípusainak széles<br />

skáláját ki tudja mutatni. Mindezek a munkálatok fıként irodalomkutatásra és számítógépes<br />

összehasonlító vizsgálatokra alapozódnak. Majd sor kerül a primerek szintetizáltatására és az<br />

optimális reakciókörülmények kidolgozására. A pozitív kontroll minta többféle módon<br />

elıállítható: természetes esetbıl, ha a kiválasztott régióból származó termék szekvenálásával<br />

igazolást nyer a genom nagymértékő hasonlósága vagy egyezése, a referencia törzs<br />

felhasználásával, illetve pl. szövettenyészeten izolált vírus pozitív kontrollként való<br />

alkalmazásával. A pozitív PCR termékeket agaróz-gél elektroforézissel mutatjuk ki. A pozitív<br />

kontrollal azonos mérettartományban futó DNS darabkákat például szekvenálással lehet<br />

félreérthetetlenül azonosítani a téves diagnózis elkerülése érdekében.<br />

A PCR alapú diagnosztikai módszerek felhasználását baromfiállományokban a kedvezı<br />

költség/haszon-elemzés is támogatja. Bár a polimeráz láncreakció kivitelezése fejlett<br />

10

Hooray! Your file is uploaded and ready to be published.

Saved successfully!

Ooh no, something went wrong!