UFR Chimie UFR Physique, Pharmacie, ECPM. - Faculté de Chimie ...

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M-S3 UE TYPE D'UE Savoirs fondamentaux FINALITE (Recherche/ Professionnelle) Mixte Ecologie microbienne RESPONSABLE Discipline Adresse Nadalig Thierry Biologie des populations et écologie Vuilleumier Stephane Biologie cellulaire DESCRIPTION DES ENSEIGNEMENTS Institut de Botanique 28, rue Goethe 67083 Strasbourg CEDEX Institut de Botanique 28, rue Goethe 67083 Strasbourg CEDEX INTITULE DE l'UE Cette UE est constituée d'une part, de cours et de travaux dirigés présentant les techniques de biologie moléculaire les plus récentes utilisées dans le cadre de l'écologie microbienne et d'autre part de travaux pratiques permettant de mettre en oeuvre ces techniques. Le programme des cours et TD est le suivant : - La méthylotrophie - Cultiver ou ne pas cultiver - Les sondes fluorescentes d'oligonucléotides (FISH) - l'ADN en écologie microbienne (extraction, dosage, amplification) - Caractérisation moléculaire des communautés microbiennes (TTGE, T-RFLP, RISA, HPLC) - Les isotopes stables en écologie microbienne (SIP) - Exposés sur la base d'articles de recherche et sur une technique - Conception d'expériences pour répondre à une question scientifique. Les travaux pratiques ont pour sujet l'étude des bactéries méthylotrophes de la phyllosphère. Dans ce cadre, les étudiants proposent eux-mêmes les objectifs du travail, la démarche scientifique à utiliser et les techniques à mettre en oeuvre. COMPETENCES VISEES Connaitre les techniques d'étude de la diversité microbienne, leurs avantages et leurs limites. Concevoir et mettre en oeuvre une démarche expérimentale en utilisant les méthodologies les plus adaptées et en identifiant les sources d'erreur. ENSEIGNEMENTS MUTUALISATION Matières enseignées CM TD TP Autres Travail personnel étudiant Charge horaire totale étudiant Université de Strasbourg (Strasbourg 1, 2 et 3) – Habilitations 2009-2012 – Master – CHIMIE - Version 1 – Page 262/276 Coef Crédits ECTS Ecologie microbienne 4 12 38 74 3 3 UE obligatoire pour le(s) parcours : Peut constituer une UE Peut constituer optionnelle pour d'autres une UE libre : parcours : M : Biologie des micro-organismes : Microbiologie OUI OUI
SEMESTRE 4 Equipe pédagogique du semestre o Enseignants-chercheurs, enseignants, chercheurs EPST Porteur de la spécialité et maîtres de stage NOM, Prénom Qualité Section CNU LE NY MC 32 PALE Patrick Pr 32 o Autres intervenants Tél. Fax, Courriel Tél : 03 90 24 15 17 Fax : 03 90 24 15 17 ppale@chimie.u-strasbg.fr Equipe de recherche/Laboratoire Synthèse et Réactivité Organiques, UMR 7177 NOM, Prénom Qualité Domaine d’expertise Tél. Fax, Courriel SEMESTRE 4 : STAGE : 30 CREDITS CARACTERISTIQUES DU STAGE : Ce stage d’un semestre est basé sur une véritable immersion en laboratoires universitaires ou industriels, et focalisé sur un véritable travail encadré par des chercheurs ou ingénieurs confirmés. Il s’agit d’un projet concret répondant à une problématique scientifique et industrielle définies par les équipes d’accueil. L’étudiant sera ainsi amené à rechercher et organiser diverses informations autour d’un projet, à gérer ce projet sur les plans individuel et collectif et enfin, à rédiger un mémoire et présenter un travail. Université de Strasbourg (Strasbourg 1, 2 et 3) – Habilitations 2009-2012 – Master – CHIMIE - Version 1 – Page 263/276
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