UFR Chimie UFR Physique, Pharmacie, ECPM. - Faculté de Chimie ...

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Annexe descriptive du Master Chemoinformatique Systèmes d’exploitation et Réseaux : Maîtrise des éléments matériels et logiciels d’un PC. Connaissances de l’environnement graphique et des systèmes d’exploitation . Notion de sécurité et de droit. Rudiments de programmation et de shell Connaissances basiques du fonctionnement et de l'utilisation d'un ordinateur. Utilisation courante d'Internet Méthodes mathématiques appliquées à la chimie : Connaître et savoir utiliser les opérateurs, outils et équations de base en mathématiques. Utilisation interactive et programmation en calcul formel (MAPLE). Application à des problèmes spécifiques de la chimie. Traitement Statistique : Calculs statistiques élémentaires. Choix et mise en œuvre des tests statistiques. Analyse de variance. Linéarité et tests statistiques relatifs à la linéarité. Notions sur l'analyse en composantes principales. Utilisation des logiciels EXCEL et MINITAB pour l'analyse statistique Modélisation Moléculaire : Définition d'une stratégie de modélisation et d'analyse d'un problème. Choix d'un logiciel de modélisation et utilisation critique. Simulation et analyse de résultats: aspects statiques, dynamiques et effets de solvatation. Lecture critique d'articles de modélisation. Calculs Quantiques : Connaître les performances et les limites des méthodes standard de la chimie quantique. Mettre en œuvre (notamment en milieu industriel) des calculs simples sur des molécules organiques et en déduire les propriétés recherchées. Conceptualiser les problèmes de chimie en utilisant les méthodes théoriques Spectroscopies : Connaître et savoir interpréter les spectres RMN, IR et UV. Mettre en œuvre une démarche expérimentale en analysant des données expérimentales et envisageant leur modélisation. Programmation en C : Etre capable de lire/écrire un programme en C Génie Logiciel : Maîtrise des outils de gestion de projets, gestion de projets d'envergure. Développement logiciel sous Unix : utilisation des capacités des outils mis à disposition du programmeur. Bases de données relationnelles : Etre capable d’utiliser une base de données relationnelle et de concevoir et d’implanter une base de données relationnelle à partir d’une situation réelle. Technologie Internet I : Etre capable de concevoir un site web structuré, intégrant texte, graphisme et multimédia, avec une mise en page précise (aspect design), à l'aide de CSS essentiellement. Bioinformatique : Recherche dans les banques de données structurales et les banques de données de séquences des protéines et acides nucléiques. Modélisations des biomolécules par mécanique moléculaire. Interactions dans les systèmes complexes : Comprendre les interactions moléculaires au sein de systèmes biologiques et chimiques. Savoir adapter les stratégies de modélisation aux systèmes étudiés. Chemoinformatique I Etre capable de créer et/ou de gérer une base de données chimiques en utilisant les logiciels commerciaux. Acquérir des notions sur les principales méthodes de traitement et de création de données chimiques (recherche par structure/sous-structure et/ou par similarité, clustering, génération de bibliothèques combinatoires Chemoinformatique II Etre capable de sélectionner des descripteurs pertinents, d’obtenir de modèles QSAR et d’utiliser ces modèles pour un criblage virtuel Langages orientés objet : Université de Strasbourg (Strasbourg 1, 2 et 3) – Habilitations 2009-2012 – Master – CHIMIE - Version 1 – Page 218/276
Syntaxe du langage Java. Utilisation des outils de base de développement en Java. Notion d’interfaces graphiques. Utilisation des principaux paquetages Java. Méthodes de fouilles de données : Compréhension de l'apprentissage automatique. Connaissance des algorithmes pour agréger, classer, découvrir des règles d'association et modéliser les données. Mise en œuvre des méthodes au travers du logiciel WEKA Technologie Internet II : Réalisation de pages web dynamique en relation avec une base de données MySQL, en programmation PHP. Université de Strasbourg (Strasbourg 1, 2 et 3) – Habilitations 2009-2012 – Master – CHIMIE - Version 1 – Page 219/276
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