UFR Chimie UFR Physique, Pharmacie, ECPM. - Faculté de Chimie ...
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Annexe <strong>de</strong>scriptive du Master Chemoinformatique<br />
Systèmes d’exploitation et Réseaux :<br />
Maîtrise <strong>de</strong>s éléments matériels et logiciels d’un PC. Connaissances <strong>de</strong> l’environnement graphique et <strong>de</strong>s<br />
systèmes d’exploitation . Notion <strong>de</strong> sécurité et <strong>de</strong> droit. Rudiments <strong>de</strong> programmation et <strong>de</strong> shell Connaissances<br />
basiques du fonctionnement et <strong>de</strong> l'utilisation d'un ordinateur. Utilisation courante d'Internet<br />
Métho<strong>de</strong>s mathématiques appliquées à la chimie :<br />
Connaître et savoir utiliser les opérateurs, outils et équations <strong>de</strong> base en mathématiques. Utilisation interactive<br />
et programmation en calcul formel (MAPLE). Application à <strong>de</strong>s problèmes spécifiques <strong>de</strong> la chimie.<br />
Traitement Statistique :<br />
Calculs statistiques élémentaires. Choix et mise en œuvre <strong>de</strong>s tests statistiques. Analyse <strong>de</strong> variance.<br />
Linéarité et tests statistiques relatifs à la linéarité. Notions sur l'analyse en composantes principales.<br />
Utilisation <strong>de</strong>s logiciels EXCEL et MINITAB pour l'analyse statistique<br />
Modélisation Moléculaire :<br />
Définition d'une stratégie <strong>de</strong> modélisation et d'analyse d'un problème. Choix d'un logiciel <strong>de</strong> modélisation et<br />
utilisation critique. Simulation et analyse <strong>de</strong> résultats: aspects statiques, dynamiques et effets <strong>de</strong> solvatation.<br />
Lecture critique d'articles <strong>de</strong> modélisation.<br />
Calculs Quantiques :<br />
Connaître les performances et les limites <strong>de</strong>s métho<strong>de</strong>s standard <strong>de</strong> la chimie quantique. Mettre en œuvre<br />
(notamment en milieu industriel) <strong>de</strong>s calculs simples sur <strong>de</strong>s molécules organiques et en déduire les propriétés<br />
recherchées. Conceptualiser les problèmes <strong>de</strong> chimie en utilisant les métho<strong>de</strong>s théoriques<br />
Spectroscopies :<br />
Connaître et savoir interpréter les spectres RMN, IR et UV. Mettre en œuvre une démarche expérimentale en<br />
analysant <strong>de</strong>s données expérimentales et envisageant leur modélisation.<br />
Programmation en C :<br />
Etre capable <strong>de</strong> lire/écrire un programme en C<br />
Génie Logiciel :<br />
Maîtrise <strong>de</strong>s outils <strong>de</strong> gestion <strong>de</strong> projets, gestion <strong>de</strong> projets d'envergure. Développement logiciel sous Unix :<br />
utilisation <strong>de</strong>s capacités <strong>de</strong>s outils mis à disposition du programmeur.<br />
Bases <strong>de</strong> données relationnelles :<br />
Etre capable d’utiliser une base <strong>de</strong> données relationnelle et <strong>de</strong> concevoir et d’implanter une base <strong>de</strong> données<br />
relationnelle à partir d’une situation réelle.<br />
Technologie Internet I :<br />
Etre capable <strong>de</strong> concevoir un site web structuré, intégrant texte, graphisme et multimédia, avec une mise en<br />
page précise (aspect <strong>de</strong>sign), à l'ai<strong>de</strong> <strong>de</strong> CSS essentiellement.<br />
Bioinformatique :<br />
Recherche dans les banques <strong>de</strong> données structurales et les banques <strong>de</strong> données <strong>de</strong> séquences <strong>de</strong>s protéines<br />
et aci<strong>de</strong>s nucléiques. Modélisations <strong>de</strong>s biomolécules par mécanique moléculaire.<br />
Interactions dans les systèmes complexes :<br />
Comprendre les interactions moléculaires au sein <strong>de</strong> systèmes biologiques et chimiques. Savoir adapter les<br />
stratégies <strong>de</strong> modélisation aux systèmes étudiés.<br />
Chemoinformatique I<br />
Etre capable <strong>de</strong> créer et/ou <strong>de</strong> gérer une base <strong>de</strong> données chimiques en utilisant les logiciels commerciaux.<br />
Acquérir <strong>de</strong>s notions sur les principales métho<strong>de</strong>s <strong>de</strong> traitement et <strong>de</strong> création <strong>de</strong> données chimiques (recherche<br />
par structure/sous-structure et/ou par similarité, clustering, génération <strong>de</strong> bibliothèques combinatoires<br />
Chemoinformatique II<br />
Etre capable <strong>de</strong> sélectionner <strong>de</strong>s <strong>de</strong>scripteurs pertinents, d’obtenir <strong>de</strong> modèles QSAR et d’utiliser ces modèles<br />
pour un criblage virtuel<br />
Langages orientés objet :<br />
Université <strong>de</strong> Strasbourg (Strasbourg 1, 2 et 3) – Habilitations 2009-2012 – Master – CHIMIE - Version 1 – Page 218/276