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M-S3 TYPE D’UE FINALITE (Recherche/Professionnelle) INTITULE DE l’UE UE 2 Obligatoire Recherche et Professionnelle Chemoinformatique II (extraction et exploitation des connaissances) NOM, Prénom Discipline Adresse RESPONSABLE VARNEK, Alexandre Chimie 4, rue B. Pascal 67070 Strasbourg DESCRIPTION DES ENSEIGNEMENTS Concept de descripteurs. • Descripteurs 1D, 2D et 3D: fragments moléculaires, fingerprints, indices topologiques, propriétés physico-chimiques, paramètres d’iso-surfaces moléculaires et énergétiques, pharmacophores et autres.. Méthodes structure-activité (QSAR/QSPR). • Approches de Hansch et de Free-Wilson. Normalisation de descripteurs. Sélection de descripteurs pertinents. Techniques mathématiques de développement de modèles : l les régressions multilinéaires, Machines à Vecteurs Supports, Arbres de classification et de Régression, les Réseaux de Neurones, méthodes probabilistes et autres.. Validation de modèles. • QSAR en 3D : analyse comparative de champs moléculaires ("CoMFA "). • Exemples d’application de méthodes QSAR pour le développement de nouveaux composés d’interet chimique ou pharmaceutique. Criblage virtuel et design « in silico » de nouveaux composés. • Filtres (les règles de Liminski et autres). • Docking d’un ligand dans une protéine. Fonctions de score. Chimiothèques et cibliothèques. • Utilisation de modèles QSAR pour un criblage virtuel. Optimisation d’un « lead ». Travaux pratiques avec les logiciels ISIDA, DRAGON et CODESSA-PRO (QSAR/QSPR) COMPETENCES VISEES Etre capable de sélectionner des descripteurs pertinents, d’obtenir de modèles QSAR et d’utiliser ces modèles pour un criblage virtuel ENSEIGNEMENTS Matières enseignées CM TD TP Autres (spécifier) Travail personnel étudiant Charge horaire totale étudiant Coef Crédits ECTS Chemoinformatique II 20 15 65 h 90 h 1 3 MUTUALISATION UE obligatoire pour le master : Chemoinformatique Peut constituer une UE optionnelle pour d’autres masters : Peut constituer une UE libre : OUI OUI Université de Strasbourg (Strasbourg 1, 2 et 3) – Habilitations 2009-2012 – Master – CHIMIE - Version 1 – Page 210/276
FINALITE M-S3 TYPE D’UE INTITULE DE l’UE (Recherche/Professionnelle) UE 3 Obligatoire Recherche et Professionnelle Langages Orientés Objet RESPONSABLE NOM, Prénom Discipline Adresse MICHEL, Laurent Informatique Observatoire Astronomique 1 Rue de l’Université 67000 Strasbourg DESCRIPTION DES ENSEIGNEMENTS Enseignement des fondements de la programmation par objets. Acquisition d’un savoir-faire en Java COMPETENCES VISEES Syntaxe du langage Java. Utilisation des outils de base de développement en Java. Notion d’interfaces graphiques. Utilisation des principaux paquetages Java. ENSEIGNEMENTS Matières enseignées CM TD TP Langages orientés objet MUTUALISATION UE obligatoire pour le master : Chemoinformatique Autres (spécifier) Travail personnel étudiant Charge horaire totale étudiant Coef Crédits ECTS 10 15 55 h 80 h 1 3 Peut constituer une UE optionnelle pour d’autres masters : Peut constituer une UE libre : OUI OUI Université de Strasbourg (Strasbourg 1, 2 et 3) – Habilitations 2009-2012 – Master – CHIMIE - Version 1 – Page 211/276
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