Virologie humaine - Dunod

Chapitre 1 • Notions de base sur les virusLe nombre de protéines nécessaires à l’assemblage d’une capside icosaédriqueest un multiple de 60 (60 x T, où T est le nombre de triangulation).Les capsomères les plus simples sont en général constitués de 3 sous-unitésprotéiques identiques formant une capside de 60 sous-unités (60 x 1). Pourdes capsides de taille supérieure, T peut prendre des valeurs différentes et estproportionnel au nombre de capsomères par face. T est défini par la formuleT = h 2 + hk + k 2 . Les paramètres h et k sont les coordonnées définissant, àpartir du sommet d’un pentamère, la position des sommets des autres pentamèresdans le réseau d’assemblage des capsomères.k(0,5)(0,3)(0,4)A(0,2)T = 13(0,1)(3,1)(0,0)(1,0) (2,0) (3,0)(4,0)hFigure 1.8 – Détermination d’un nombre de triangulation.Dans la figure ci-dessus, chaque point d’intersection est le centre d’un hexamèrecomposé de 6 capsomères (schématisé ici par des triangles équilatéraux).Lorsque l’on supprime un des capsomères de l’hexamère A on obtient, si l’onrapproche les deux faces libres, un pentamère. À partir du centre de ce pentamèreon définit les axes h et k, ce qui permet de déterminer la position dusommet du pentamère le plus proche et donc la taille et la position de la facede l’icosaèdre. Ce sommet est localisé sur le réseau grâce aux coordonnées(h, k) permettant de calculer T. T peut donc servir d’unité de mesure de la tailled’une capside virale et conditionne sa géométrie. Dans l’exemple donné (3,1), T= 3 2 + (3x1) + 1 2 = 13. Pour (2,0), T = 4 ; pour (3, 2), T = 3 2 + (3x2) + 2 2 = 19.Toutes les possibilités ne sont pas retrouvées dans les capsides virales, carcertaines sont moins stables que d’autres (notamment lorsque k > 2).On peut ainsi définir 3 classes de capsides virales dépendant de h et k : lesicosaèdres vrais (h > k, k = 0) correspondant à T = 4, 9, 16 ; les icosaèdres àgrand nombre de facettes (h > k > 0) correspondant à T = 7, 13, 19 et les pentakidodécaèdres(h = k) correspondant à T = 3, 12, 27.14