Marie-Christine LE PASLIER - Inra

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Les nouveaux outils de (re)séquençageNGS : Next Generation SequencingNTS : Nouvelles Technologies de SéquençageMPS : Massive Parallel Sequencing<strong>Marie</strong>-<strong>Christine</strong> Le Paslier…pour l’équipe EPGV_INRAE P G VEtude du Polymorphisme des Génomes VégétauxUnité 1279_DGAP12IG
Quels enjeux pourles espèces végétales cultivées• Nombre insuffisant de SNPs outils de génotypagehaut-débit non encore utilisablespar exemple• Illumina GoldenGate 1536 plex• Illumina Infinium : iSelect 3000 à 90 000 SNPs• Limite du séquençage allélique Sanger• Structure génomique : taille, polyploïdie• Large diversité génétiqueEPGV Unité 1279_GAP13
Page 1 and 2: Revue des méthodesde génotypage e
Page 3 and 4: Technologies de génotypage & séqu
Page 5 and 6: Génotypage SNPs: comparatifTaqMan
Page 7 and 8: • cf. présentation P.Mournet (GP
Page 9 and 10: Contexte 1L’équipe EPGVdirigée
Page 11: • cf. présentation A.Berard (Amp
Page 15 and 16: Les 3 technologies implantées454,
Page 17 and 18: NGSde nombreuses applications• qu
Page 19 and 20: Illumina-Genome Analyser (GA)techno
Page 21 and 22: Roche-Genome Sequenceur (GS)technol
Page 23 and 24: GAHiSeqEPGV Unité 1279_GAP23
Page 25 and 26: Illumina Sequencing -Librairie- fra
Page 27 and 28: Illumina sequencing : ADN dataEPGV
Page 29 and 30: PerspectivesE P G VEtude du Polymor
Page 31 and 32: De nouveaux formats surdes technolo
Page 33 and 34: De nouvelles technologies associée
Page 35 and 36: Multiple Shotgun Genotyping (MSG)EP
Page 37: Merci de votre attentiondiscussion

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