du développement folliculaire ovarien précoce chez la brebis - GeT
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IV. Résultats RNA-seqAnalyse bio informatique:Bi<strong>la</strong>n assemb<strong>la</strong>ge36M de séquences pairées / échantillons (48M /MT)Taille médiane des fragments obtenus: 440pbPlusieurs fragments/gènes (8 en moyenne)stratégie génomestratégie assemb<strong>la</strong>ge de novonombre de contigs/fragments >20 lectures381 600 252 630nombre de gènes identifiés 18015 16310% de gènes en commun 80,5% 89%% de lectures annotées 42.1 33.71- Stratégie génome:Comparer des conditionsPlus de gènes identifiésPlus de lectures annotées2- Stratégie assemb<strong>la</strong>ge de novo :Rechercher les transcrits alternatifsMoins de contigsIdentification de gènes sans séquence deréférencejournées retours d'expériences <strong>GeT</strong>2 juillet 2012A G R I C U L T U R EA L I M E N T A T I O NE N V I R O N N E M E N T
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