Microbiologie 1 : Virologie-Bactériologie-Parasitologie - Université ...

CONTENU ET ORGANISATIONModule 1 "de la clinique au fondamental".Ce module est axé sur le lien existant entre microbiologie clinique, microbiologie moléculaire,interactions hôtes-pathogènes, éléments génétiques. Chaque session traitera d'uneproblèmatique clinique actuelle et l'analysera à travers les aspects moléculaires et l'apport de larecherche fondamentale. Ce module est organisé en 3 sessions dans chacune des disciplines(Bactériologie, Virologie et Parasitologie-Mycologie de chacune 3 jours). Ces sessions sontorganisées en ED. 50h d’enseignement présentiel sous forme d'ED thématique sur une journéede 5 heures plus 10h de travail personnel. Volume horaire : 2 semaines à temps plein.Bactériologie1. Physiopathologie des infections à partir de quelques exemples. Rôle des bactéries dansles diarrhées (le modèle Clostridium difficile), les méningites (L. monocytogenes) et le cancer(H. pylori). Facteurs de virulence associées aux infections graves à Escherichia coli (1 journée).2. Tuberculose : épidémiologie clinique, épidémiologie de la résistance, bases génétiques de larésistance de Mycobacterium tuberculosis, bases moléculaires des nouvelles techniquesdiagnostiques, développement de nouveaux antibiotiques et de nouvelles stratégiesthérapeutiques (infection expérimentale) (1 journée).3. Multirésistance aux antibiotiques : aspects cliniques et thérapeutiques, épidémiologie enville et à l’hôpital, contrôle, diffusion, origine des gènes, mécanismes de mobilisation de cesgènes à partir de l’environnement et éléments génétiques impliqués dans cette mobilisation etcette diffusion (séquences d’insertion, transposons, intégrons, plasmides) (1 journée).VirologieDifférents modèles d’infection virale seront abordées (VIH, Herpes , Hépatites , Grippe …)au travers de trois thématiques transversales :1 - Mécanismes et conséquences de la variabilité génétique des virus (1 journée).2 - Relation Virus et système immunitaire (1 journée).3 - Stratégies antivirales et mécanismes de résistance (1 journée).Parasitologie Mycologie1. Paludisme : A partir des signes cliniques et biologiques de patients atteints de paludismegrave, on déduira les mécanismes potentiellement responsables des complications (pathogénèse).Des démarches de recherche explorant chacun de ces mécanismes seront ensuite présentées. Onanalysera enfin les avantages et inconvénients des modèles d’études utilisés, et les applicationspossibles des résultats : nouveaux médicaments ou vaccins. (1 journée).2. Aspergillus : Les Aspergillus occupent aujourd'hui une place essentielle au seindes microorganismes responsables d'infections opportunistes (incidence croissante, mortalitéimportante). La taxonomie moléculaire bouleverse les classifications basées sur le phénotype ettrouve son intérêt dans l'adaptation thérapeutique. Les interactions entre le champignon et lemacrophage alvéolaire sont au centre des études de physiopathologie. De nouvelles moléculesexercent une activité anti-aspergillaire fongicide et des drogues ciblant la paroifongique pourraient trouver leur intérêt dans des associations. (1 journée).3. Toxoplasmose : L’infection humaine à Toxoplasma gondii est le plus souventasymptomatique. La mise en évidence récente d’atteintes oculaires et de formes graves chezl’immunocompétent a permis la mise en évidence d’une diversité génétique chez ce parasite dontla signification diagnostique, clinique et thérapeutique n’est pas encore claire. Les manifestationscliniques et les méthodes diagnostiques sont très dépendantes de l’hôte et du parasite etreprésentent un modèle didactique d’interaction hôte-parasite. L’évaluation de nouvellesmolécules passe par des études in vitro. (1 journée).